ChyUNG229080 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTGCGAAGGCCGCCCCTCTCGGTGTACCCAAGTCCGGTGCAATTTCTAAGGGCTACAATTTTGCTTCTACCTGGGAGCAGGTACCTTCATCTTTTCCATTTTACTCCTTAATTCTTTCCCTTTTCCAATTTGAATCCTGAAATTTGCTTCTATCTGTTCGATCTCGCTTTCGATGTGATTTTCTGCGATGAGATCTGTTTGCGCCACTTCTTCATTCTCGATGCTTACAGTTTTGTTTTGTTTTCTGGAATTTTGTTATCTCCTAATCCTCCAGAATGCTCCTCTAACGGAGCAACAGCAAGCGGCTATTGCCACACTCGGTCATGCCGTTGCTGAGCGACCTTTTCCCGTTGATTTGGTGAGATTTTTGTTCTGCTCTTCATTCATTTTCAACTCGTTTCTTCTTCGTGTTCTCTAATTCTTCATTTGAATTCAACTGGTGCTGACTGCCACTTCGTACGTTTGTTTTAGAGACGAAATGTTTCATAACTGCAGCTTCATGTTAAATATTATTTTAGGCACAGGACAGGATAGGAGGTAAAGAAAATGCATTGTCTATTTCGGTTAAGAATACCACCAACGATGATTCCGATGCTGTTGAAGCCGTTTTGGTCAATACCAATCAGGTAGCCTATACTGTACGGTGGTTCAATGTCTTCAGCCTTCTTCGTTATTTTTAATTTTTTTATTACAGTATTTGTGTGGTAACAATCATAATCTTCAAGATTTTAACTCTGGTACATGATTTAATTTGTTGATGTCCTGCCTTGTGATAGACCACCAATTGTAATACAATATAGGAGAAGAAAGACAAGTGGATCTGCACGTGCACAGGTGATGGAAGTGGAGGAAGTGGAAACCACCTTAGTGGGTACCAGAGTTAGTTAAATGGGAGAGGTTAAAAGGGAGAGATGGAAGGAAAGATGGGGTGGTTAATCAGTTTCTGGAAGTGGAGGGGCTGTAGTTTATGGAGAGCAAAATTACACTAGTTGTTCAATTACTTAAATCTTAGAAAGTGTTTTCCATTATCGTAAATTACTTTTGGTGTTTGAATGTTTTATTTTGAACTTGGTTATTGTCTGTAATAGTACTTGTTTGTTCTGTGTTTTCAAGACTGGTTTGAGTATTGTATTCTGTAATAGTTTGGTTGCTTAATGAACAAATAGAACCATTACTTGGTGTTCTATCATTTTGGTATCAGAGACATTCGAATCTGTGCAGTGTTTTCGCCATGGCTCAAAAGAGAATTGAGGAAATGTTGGAAATGGTTGATCAAGAGATATCTGGCGTTTAGGCAGAGTTACATGGATTACCATCTATTAAGGAAGATATTTTATTGTTGGCAAAGAGCATTGAAAGGCTGGGTGTGCAGGCTGAACAGCAGCAACAACAAAAATATATTGAAGGAATGATTAAGGGAAAGACAACATTGGAAGCAGTTCCATAAGGTTTGTCCAGCAAGAAAGAAACTATGATTGATGTCAGTGATTCATTTGTGATGGGAGGAAAATTTGAAGAAAAACACACCAAGTTGGAAGGAGAAGAATCTGCAGGGGACCGAAGCAAATTCAAGAAAATTGACATGCCAGTTTTTGCGGGTATTGATCCGGATTCTTGGTTATTTAGAGCAGAACGTTATTTTCAGACACACAAACTTACTGAATCAGAGAAGATGACGGTGTCAATCATTAGTTTTGATGGAGCAGCCTTGGATTGGTATAGATCTCATGAAGATCGTGAATCGTTTGTTAATTGGGAAAATTTAAAGAGAAGACTTATTATTCGATTTCGATCAGGCCGTGAGGGATCAATCTTGGGCATATTTTTAACGATAAAACAAGACACTACAATGGATGAATACAAAAATTTATTTGATAAATTGGTGGCACCTTTGCCTTTTCTGCAGAAGACAGTCATAGAAGAGACATTTATGAATGGTTTGAAACCTTGGATTAAGGCAGAATTGGAATGTTGGGAACTTGTTGGGCTTGCTCAAATGATGAAATTGGCCCAAAAAATTGAGAACCGAGAGGTGATAAGGGGTGAATCAGACTTCAAATGTGCAGGGATGATAAAACCCAAGTTTCTACTTTAAATACTCAATTTCCTGTAGTTTCCAATGACAATAAGTCAGGAGGTACTGTTCCAGTGAGGACTATCATACTTTGAGGAGTGGCTGTGCAAACTAATTGACGGGAAGGACCATCAAGACAACTTTTTGATTCGGAGTTTCAAGCTAGACGTGAGAAAGGACTCTGTTTTCGTTGTGATGAAAATTTTTATGCAGGCCATAGATGTAAGGTGAAGGATCAGAAGGAACTAAGAGTGTTAGTTGTTCAAGCAAATGGGGAGGAATTGGAAGTAGTGGAAGAGGATGACTATACGGAGGAACCTGAGGTAAAAGCTATTGAACTTGATATTAAAAAAAAGAACTAGGGATAGAATTGTCATTAAATTTGGTGGTGGGATTAACAAATCCGGGCACGATAAAATAAAAGGAGTAATTCAAGGGATGTCAGTGGTGGTTTTGATAGATTGCGGTGCAATGCATAACTTTATTTTTGAAAAACTAGTGGTTCAGTTGAAATTACCCTTGGAGGAAACTTCTCACTATGGGGTCATTTTGGGGTCGGGTACTGCTGTGAAAGGTAAGGGCATATGTAGTCAAGTGGAAATAACATTTGGTGATTGGAAACTTGTTGATAATTTCCAACCATTAGAGTTGGGAGGAGTGGATATCATCCTTGGAATGCAATGGCTGCACACGTTGGGGGTAACTGAAGTGGATTGGCGGAAACTCACTTTAACTTTCATGCAAAATGAAAAGAATGTTGTTATAAGGGGTGACCCGAGTTTGACAAAGACTAGAGTGAGTTTGAAACACATGATGAAGACATGGATACCATCTGTCAAGGTTTCTTGATAGAATGTCGAGCTTTGGAGGGAGGAATGACATTTACCGAATTATATGGGATTGATGATGTTCCTACGATTCAAGAGTTACTACCAGCAGACATTTTTGGCTATCCTAAAAATCCAGCAACAAAGGAGTTGGAAGCTTATTACTTGGAAAGGAATACCACCTCATGAGACTACATGGGAGAATTGTGATGATTTTGCACAAAAGCTTCCTCATTTCCACCTTGAGGACAAGGTGTCTTTGGAGAGGGAGAGTAATGATAGATCACCAATTGTAATACAATATAGGAGAAGAAAGACAAGTGGAATGTTAGGCCCCCTATACTCCTCACGTATAGTAGAAAGAATAGGAAAAACAGAATTACACGTGGAGCAGGAGGAGAGAAAGAAGGGCAGGACCACCATGTAGTGGGCCCAACAGTTAGTTAGTATAAATAGAAGGGGAAGGAAAGAGAGTAGTTATCGAAGAAAAATTCTGGAGAGGAGGAGACGGCTTCATCCTTGCGGGGAAGAAGACGGGAGGGTCCAGGTTTACTATTCTGTTTTGTTATTAGTTATCTGAAACTATATTGTAATCTCTTTAAGAATATCAATACAAGGATACAGATAGAGTGTTCTTACATATTGGTATCAGAGCTTACTACCTGGGCAGAAGATCAATAATGGCAAGGAAAATGGAAGAAAGAATTGAAGCAGTGGAACAAGGACTCCAACGATTACCGTTAATGGAAGAGAACCTGTCCTTGATATCGAAAAGCATCCAAGAAATGAATAAGCAGATAGATCAACAGCAACAACAACAACAACTGGTTATGAAGTACATTGAAGGCATCGTACGTGAAGAAATAGCGACGGGAAAGAAAATGGAAGACCCAGGGAGTCAAAAGAAAGATGCCGTAACGATTATCGCGGGAACTTCCGATGGATCGAAGAGTGAAGGGAAGAACGATGAGGAAAAAACGGCCGATCGGAGTAAGTTTAAGAAAGTCGAGATGCCGGTTTTCAATGGAACAGACCCGGATTCCTGGCTATTCCGAGCAGATCGCTACTTCAAAATCCATGAATTATCAGGTATGGAAAAACTAACAGTAGCAGTGATAAGCTTCGATGGACCAGCGCTGGATTGGTATAGATCGAGCGACGAGTTGGAGAAGTTTAAAAGTTGGGAAGATTTGAAGCAGAGGCTGTTGGTTCGGTTTCGGACCATCCGCGATGGATCTCTGGTCGGACGATTCTTAACAATCAAACAGGAGACGACGGTGGAGGAATACCGGAATCGGTTCGATAAGTATTTGGCCCCGGTAGCTTTTCTTCAAACTATCGTGTTGGAGGAGACCTTCATGAATGGGCTAAGCCCATGGTTGAAATCAGAAGTGGATGCGTTGGAGCCCGTAGGATTGGCCCATATGATGAAATTGGCACTGAAAATCGAAAATAGAGAAATGGTTCGGAAGGAGTGTGGGTTAAGTAGCGTGTTCGGCGGGAACCATCCATTTAAACATATCAATGGGAAACCAACAAACCCAACCACGACAATCACGAATGCAACCGGAAATAATTGGCCGATGAGAACAATCACTCTGAAAGGAGTTACGGCAGAGGAAAGAAATAAAGAGGGTCCCACCAAACGACTCTCAGACGCGGAATTCCAGTCACGGAGGGAGAAGGGGTTGTGTTTCCGGTGTAATGAGAAATATCACGCGGGACATCGATGCCGAGCGAGGGAGCAGAAAGAATTACGAATGCTGGTGGTACTGGAGAACGGGGAGGAATTAGAAATTATTGAGGAAGAATTTGTTGATGATGAATCAGAGGAGAAAGCTGTCGCGGTGGAGAAGGTAGAGAATCGGAACATTGAATTATCCATCAACTCGGTTGTAGGATTATCAAACCCAGGGACAATGAAGATAAAAGGGAAAATACTAGACACTGACGTGGTGGTGCTCATTGACTGTGGAGCCACCCACAACTTCATAGCAGATAACCTGGTAACATCTCTCAAATTACCATTGACTGAAACCTCCAACTATGGAGTTATTCTGGGGTCCGGTTCTGCAGTGAAAGGAAAGGG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ATGGCTGCGAAGGCCGCCCCTCTCGGTGTACCCAAGTCCGGTGCAATTTCTAAGGGCTACAATTTTGCTTCTACCTGGGAGCAGAATGCTCCTCTAACGGAGCAACAGCAAGCGGCTATTGCCACACTCGGTCATGCCGTTGCTGAGCGACCTTTTCCCGTTGATTTGGCACAGGACAGGATAGGAGGTAAAGAAAATGCATTGTCTATTTCGGTTAAGAATACCACCAACGATGATTCCGATGCTGTTGAAGCCGTTTTGGTCAATACCAATCAGTTCTACAAATGGTTTTCTGATCTAGAATCAGCCATGAAATCTGAGACAGAGGAGAAATACCACCACTACTTGAATTCTTTAACAGATCGCATAAGAACATGTGATGTTATACTTCGTCAGGTAGATGATACACTGGGCTTATTTAACGAACTTCAATTGCAACATCAGGCTGTAGCAACAAAGACTAGAACGCTTCATGATGCATGTGATAGACTGGTAATGGAGAAGCAAAGGCTAATTGAATTTGCCGAAGCACTTCGCACTAAGCTTAACTACTTCGATGAGTTGGAGAATATTACTACCATTTTTTATTCCCCCAACATGAGTGTTGGAAACGAGAACTTTCTTCCCATGCTGAAAAGGCTTGATGATTGCATATTATTTTCTGAAAGTAATCCCCAATATGCTGAATCCAGCGTCTATTTGCTCAAATTTCGACAACTTCAGTCTCGGGCACTTGGTATGATTCGGTTTCATGTTGTATCTGTTCTCAAAAGTGCTTCTTCTCAGGTTCAGGCAGCTATGCGTAGTAGTAGTGGCAGCAATTCTGCTGTTTCTGAGGGTGTAGAAGCATCTTTTATCTATGTGCGATTTGAGGCAGCTGCAGATGAGCTGAAACCTGTGCTGGAAGAAATTGAGAGCAGATCAACAAGGAAAGAATATACTGAGATCCTTGCAGAATGCCATAGACTCTACTGTGAGCAACGACTTTCCCTGATAAAAAACATAGTGCATCAACGGATATCTGAGTTTTCCAAGAAGGAGGCTCTCCCATCATTGACTAGATCTGGATGTGGGTATCTGATGCAG MAAKAAPLGVPKSGAISKGYNFASTWEQNAPLTEQQQAAIATLGHAVAERPFPVDLAQDRIGGKENALSISVKNTTNDDSDAVEAVLVNTNQFYKWFSDLESAMKSETEEKYHHYLNSLTDRIRTCDVILRQVDDTLGLFNELQLQHQAVATKTRTLHDACDRLVMEKQRLIEFAEALRTKLNYFDELENITTIFYSPNMSVGNENFLPMLKRLDDCILFSESNPQYAESSVYLLKFRQLQSRALGMIRFHVVSVLKSASSQVQAAMRSSSGSNSAVSEGVEASFIYVRFEAAADELKPVLEEIESRSTRKEYTEILAECHRLYCEQRLSLIKNIVHQRISEFSKKEALPSLTRSGCGYLMQ Homology
BLAST of ChyUNG229080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HQ84 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=COG3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 547.4 bits (1409), Expect = 1.3e-154 Identity = 276/363 (76.03%), Postives = 322/363 (88.71%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96JB2 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COG3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 182.2 bits (461), Expect = 1.1e-44 Identity = 115/378 (30.42%), Postives = 204/378 (53.97%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CI04 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cog3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 179.5 bits (454), Expect = 6.9e-44 Identity = 111/347 (31.99%), Postives = 188/347 (54.18%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q16ZN9 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Aedes aegypti OX=7159 GN=Cog3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 151.8 bits (382), Expect = 1.5e-35 Identity = 102/345 (29.57%), Postives = 183/345 (53.04%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q29N70 (Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 OS=Drosophila pseudoobscura pseudoobscura OX=46245 GN=Cog3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 144.4 bits (363), Expect = 2.4e-33 Identity = 86/291 (29.55%), Postives = 165/291 (56.70%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCR3 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499355 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 689.9 bits (1779), Expect = 5.8e-195 Identity = 359/362 (99.17%), Postives = 360/362 (99.45%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZ07 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025573 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 654.8 bits (1688), Expect = 2.1e-184 Identity = 338/362 (93.37%), Postives = 349/362 (96.41%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FRH7 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446258 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 654.1 bits (1686), Expect = 3.5e-184 Identity = 338/362 (93.37%), Postives = 349/362 (96.41%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I362 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470121 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 652.9 bits (1683), Expect = 7.8e-184 Identity = 337/362 (93.09%), Postives = 348/362 (96.13%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KTV8 (Component of oligomeric Golgi complex 3 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G630720 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 617.1 bits (1590), Expect = 4.8e-173 Identity = 329/362 (90.88%), Postives = 330/362 (91.16%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. NCBI nr
Match: XP_004142363.1 (conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8648885.1 hypothetical protein Csa_008671 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 698 bits (1802), Expect = 1.09e-246 Identity = 361/362 (99.72%), Postives = 362/362 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. NCBI nr
Match: XP_008460560.1 (PREDICTED: conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 691 bits (1782), Expect = 1.14e-243 Identity = 359/362 (99.17%), Postives = 360/362 (99.45%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. NCBI nr
Match: XP_038892000.1 (conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 674 bits (1738), Expect = 5.57e-237 Identity = 347/362 (95.86%), Postives = 355/362 (98.07%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. NCBI nr
Match: XP_023539647.1 (conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 656 bits (1693), Expect = 3.95e-230 Identity = 338/362 (93.37%), Postives = 350/362 (96.69%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. NCBI nr
Match: XP_022159147.1 (conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 655 bits (1691), Expect = 7.44e-230 Identity = 338/362 (93.37%), Postives = 349/362 (96.41%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. TAIR 10
Match: AT1G73430.1 (sec34-like family protein ) HSP 1 Score: 547.4 bits (1409), Expect = 8.9e-156 Identity = 276/363 (76.03%), Postives = 322/363 (88.71%), Query Frame = 0
BLAST of ChyUNG229080 vs. TAIR 10
Match: AT1G73430.2 (sec34-like family protein ) HSP 1 Score: 547.4 bits (1409), Expect = 8.9e-156 Identity = 276/363 (76.03%), Postives = 322/363 (88.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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