Chy9G170750 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGACGCCGTCATCGTCTTCATCATCTTCAGTAAGGTCATGGAGGACGGCGTTTCTGACTCTGAGAGACGAATCCATCTCTTCTTCAACCTCAATTTCCCAACTTCTTTACGACACCATCTTCTCGCACTCCGACTCCTTAATCGCCGCCGCACGCTACCTTCCTCCACCAGAAGTACGATTTTCTTATTTCTTCTATTTATCTTATTGGAGGTTATTCGGAAAATGCATACTCATCGCTTTGTTGCTCCTTCTCTGTGTGCATAGGTTTCATCAGATCTGCTGTTTCTCTTAGAATTGGCTACTTCTGCTGCTGACTCCGTGCAAGACATTGCCCTTATCTTCGCAGATATCATACATCTGGTGCAGTTCACATTTTCGATTTCTATCGGTCATTTTTTATTCTTTCGGACCAATTTCATTGGGTTAGAGCTAGAACGATGGAATTGGGAAGTTCGTTCTGTTAGTTCATCTTCGGGCATTTGTTAAGATGATCGCCTCAATTTAATCATGATCTATTTTCCGTATGAAAATGGATTCTGTGTGGTGTTTAGAAACTAGAAGAAATTGTTTCCGATTTAAGTTTTGGAAATGAAAATTACCATAGTTATCAGAGAGGCCCTAAAGTTTATTGGTTTAAATCATATGAAAACTTCAGTTTTATTGCATCAGGTGGGTTTAGGATTTTATTGGAACAATGATAGTCTCAATAACTAACCAAGAGGTCATGAGTTTAATCTATGTTGACTGTCTACCTAGAAATTAATCTCCTACAAGTTTCTTTACACCAAAATGTTATAGGGTCACGTTGGTTGTCTTGTGAGATTAGTTGAGGTGTGCGCATAAGTTGGCTTGGAGAAGATCTTCCATTTTATTTGTGAATGTTTATCCTTGATATATATTAATTAGAAAAACGAAAGAATGCAAGCATAACAAAGGAGAAACCCACAAAAGAGAGGAGGCTACGTGAAAGAAAGGCCTCCAAACAAAATGTAGTTTGGAGAATAATACAATTTTTTTTAACCGAAGCTGACATGAAATCTAGAGGACCAAACATGATATAATGCAATTTCACCATCATATTCCAAAATCCGATTTAAGACATGCAGAGTTCCATTTTTCCTCATAATAATTACGTATGTAAAAGTTCATTACTTAGTGGAATCCATCTTGCCTGACTTCGAACAGGTTGAGTATAGTGGAAAACTTCATTGTATATGGAGATAATTTTGCATATAATGTCAATGAGAAAAGTTTGTAACGTATATTTGACATATTTCATAAACATAGGAACTGCTAGATATAGGTTAAGGTTTAAATTACTGCACTCCAGTAATATTGTATTTGTTAAAAGAAATACGTTTCTGTATGACAAGGAACTTTTGTAGCGCATATTTTTTATACATAAATGTTTTTCAATGGGGATAACCTTGCTATCTTATTGTGTTTCTGGCCCTCTCTATGCTCTTCTGAATTCTCAGTTTTCTCTAATTATTTATATTCTTTCACCCAATGCAGATTCACGGTATTTCTTATCAAGTTTCTCTTGAATTCAGTTCTTCCTCATGGAATCTGCTCCTTAGGTATTTTGGAGATTTGACCCAAATCCTACTTGGAAAGCTTAATTTTCCAGAAAATTATGCTCTAATCAGGCCTGTCTTGGAATCTTTGGAGATTGTAAGGTTAGCTTCTATTTTCTCCTCTGATAGCTTGGGGAAATACTACTCTTTCTTGCTGCTTTCACTGCTGTACACTGGGTCAGTATTTTGTCATTTGGGCCCAAGCAATGTTTGCTCATCTGAGTTAATTTATAAGATCTGTATAGTATTAGTTGCTAGTTTGGTTACTCAAAGTATCCTTAGGTTTTCATTATAGAGAGAGAGTTCCTAAAACTGAATAAGGGGAAAAAATAAAATTCACTGTGGTTTTCGTTATCATCATTTTGGTGCATAGGAAGGGAGAAACAACGTAATTTTTGAACTTAGAAGGGAAAGCTTTGCTGCTATTTGGTTAAATCCTAAATGTGATCTTCATAGATTCTCTTGAAATTTCTTGTACTAAAGAGTTTCAAAGTAGATTTGGTCATGATTTCATGTTTATATCTTGGACCTTGTTTTCCCTTTTATGGACATGATTAATTATCTATTGTTTTTTTGCAGACACGTTGTCTCTATACAGCAGCGGAAGTTCTTACCAGCAGAAGATATTCAGCTCTCAAAGTTCTTGCTTTCTGTGATTTCTGACTCTCAATCGGCAATATTCCCCTTGTCAAATTCAATCATTAGACATGGTTGTACTGCTGAAGTTGTGAAAAGTGTACCCAAATGCAATAGTTTATGGGATGTTCAGGCTGTTGCCTTTGATCTACTTAGTCAGGCCATCACAAGTCTGGGTTCATATTTTCCAGTTGATGTTTGGAAGTCAACAATTCAGGTAGAAACAATTCTGTTACATTTGTGGTTTTTCACGAATGCATTTGTAGGATAATCGGGGTTACATTCAATTGGAATGTTTTGCAAGCAATATATAGTCGGTTAGCCAATAAGGAAATAGTGCATTATTATTATTACTTGGATGAAAATTGATGGACTTTTTGGAATCTACTAATGTACCCAAAAAAAAAAGGTAGAATATCATACAAAGTTTTCTCAAGCCACTAAAAATTCTACCATTTCTGTCTCTAAAGACCCTGCAAAACAACACACCTCGATTCATGCTAATGTAAAATATTTTCAGCTAGCATGGTAACCTTCAACACTGCAGATAACCTGTTGAGCTTGATTCTTTTGTTCATAGGTCATTCGAAAATTGATGGACTTTTTGGCATCTACGAATGTACTTGTTGAAGACAAGATGATGTCCAGGTATACAGCTTCAACAATATTTTAATGTCATACAGTGCTCGTTATTTTTAAAGGGATCGTTACTTTTGATTTACCAGTGAGTACCAGCCATCCTATTGGGTTTAGTATAGTTTCTGTATTTTATTGGTTTTCTTTTGATTGTTACTAGACTTGATTTTTATTTAAGAAGTTTCAGATTATATCATGTGTAAGATGGACTATTGGGGACTTAATAAAAATTTCTCAAGGTTACATCATTTACCCAGACAACAGGCATTTCATTGGCTTTATTGGAGATTTTGTGTTTTGCATTCTATTTTACTTTTACTTTATTGAAGAGTTTCAAACTGCTTGAAACGTGCATTTACTTGCCCCATTATCCATCTTTCCTAACGAGAAATTGTAATCCCTTATCTTGGCCAATTTTCAAATCAGTGAAACAAGGCCTCGTTCCCCTAAACCCCTTTTTCGTATTTCGGTGGGAGGTGGTTTTTTTTCAGGGTTCTTTTTTGTTTTCCTTGTATCCTAAGCTTGGTTTCTTATAAAAAAAGGGAAGAGTCATCCTTTTCTTGCTTTTGTGTTTTCTGTTCTGCAGGTACTATCTGTCTCTTCTTAGATGTCTTCATTTGGTTATAGCAGAACCCAAATGCTCCCTTTCTGATCATGTAAGGAATCGAACTACACTTCGAAACCTAAATTGAGAATGCTTACTTATTGAAGCATCTTTTTCAATATTTTTTTTCAGGTGTCAGCTTTTGTAGCAGCATTGCGCATGTTCTTTGCCTATGGGTTTTCTAATAGGCCCCTACTTACTTGTTCAGTTGGTAATCAAGGGAAAGAACCTAGTTTGACCAGTACCAAGTCCAGTTTGGAGGAGCCGAAAAAGGATAATTATAGTCCATATAGGCCCCCACACATGCGTAGAAGAGAAAATTTAACTAAGAAGCAGGCCGGTGTTCAAAATCCTCAGAGTTCAATGGCTGTAGAGTATCTTAACTGTGATTCTATATCTTCAGATTCTGATCATGACAGTGATGGGCCGGGCAGAGATGCTGACATCATTCAGAATGGCAAAGTTCGGGTTGCTGCTATTCTTTGTATACAGGTAAGTTGGTAACTCAGAAAGAGATGATCTTACTTAAATCTATCTCGACAGTCGAACCTAAGTTATTTACATGTTTGTCATCTTTATCTTATTTACAGTTTTTTACCCTAGAGTCTAGAGAAGTGTGCTATATAAGCTCTTTAACCCTAAAGGCACATCTATTCAGTATTCTGAATAATTCTCCCTATTCTCTAATAAAATTATTCTTTCTTAGTCTCGTGGAAGCTAACACACTATTTTTGAACCACGTAAATTTGTGTGTTGATTATTTACTGTTTAAGCTTTTCTATTTATCTTTATTTATCGATTTTGTAACAGAGTGAAACGTTGACATATTTGGAGTTCAAACTTCAAAGATATTTCTTGATTAAGAAAATCAATTGTTGTGAAGTTCATAGTTCTCGAGTGTTAGAAAATTTTCAGTGGTTTATTCATGTCAACCATAGTTGGAATTGTTAGGTGTTGGGATTTTCCATATTTCATTCATTCAATAAAATGTTTCTTTATAAAAAAAACATGAAATTATTCTTGTTTTTTTAAGAACTTAAAATTTTTATGTGTCTTACTTTTGGTTGATAGGATCTTTGCCAAGCTGACCCCAAAGCATTCACCAGCCAATGGACACTTCTTTTGCCAACTCGGGATGTGCTGATGCCAAGGTAGGTCTTATTTTATTTTCTCTGTTCATTTATTGTTATCTGCGTACTTATTTTTTCTGTGTCCTTAATTATGTTCTTGTAGGAAATTTGACGCAACTTTAATGACATGTCTTCTATTTGATCCTTCTCTTAAGGTACATATACTGTTTCCTGTAATTGTTTAACCAAAAATTCAGTTTTTTGACTGAAAATAGGGTGAAAGTGTGGTTCGTTCTTCTTTTTTTTTTCAAATATTTTTTTTATCTGTTTTTGTTAATATATTCATTCAGTGATTCTAAGTGCTCTATCTATTAAATACTGTTTTGGCTTGTCCAGGTTCAGATAGCGTCTGCTGCAGCCCTGGTGGTTATGTTGGATAGGACTACTTCCATTTCCTTGCAGATTG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MATPSSSSSSSVRSWRTAFLTLRDESISSSTSISQLLYDTIFSHSDSLIAAARYLPPPEVSSDLLFLLELATSAADSVQDIALIFADIIHLIHGISYQVSLEFSSSSWNLLLRYFGDLTQILLGKLNFPENYALIRPVLESLEIVRHVVSIQQRKFLPAEDIQLSKFLLSVISDSQSAIFPLSNSIIRHGCTAEVVKSVPKCNSLWDVQAVAFDLLSQAITSLGSYFPVDVWKSTIQVIRKLMDFLASTNVLVEDKMMSRYYLSLLRCLHLVIAEPKCSLSDHVSAFVAALRMFFAYGFSNRPLLTCSVGNQGKEPSLTSTKSSLEEPKKDNYSPYRPPHMRRRENLTKKQAGVQNPQSSMAVEYLNCDSISSDSDHDSDGPGRDADIIQNGKVRVAAILCIQDLCQADPKAFTSQWTLLLPTRDVLMPRKFDATLMTCLLFDPSLKVQIASAAALVVMLDRTTSISLQIAEYRDPAKCGSFMPLSISLGQILMQLHTGVLYLIQRSTHGRLLTILFKILLHLISSTPYPRMPEELLPNMVKALQATIEEGFPFRSDQTDLLAASIGCLNVALSTSQSSPYVKEMLSKQISTAQKGNSVLVILLQYSEQLTNPTICIEALQALKAVSHNYPHIMFAFWDQVSSVVSNFLHEAAPEVSTGQWRVQSRNSVGIIGEKVITAAVKVLDECLRAISGFKGTEDLLDDNLLDSPFTLDCIRMKKVSSAPSYELKNLDETIDSPEDVCAGMNQWCEVIEKHLPRSLVHSSAMVRAASVTCFAGITSSVFSSLSKEKEDYILSSVVNAAVHDEVPSVRSAACRAIGVISCFPQVSQSAEILDKFIHAVEINTHDSLVSVRVTASWALANICESIRRFFEDSPSGQPTDSVEPSHILTLLIESSLSLANDGDKIKSNAVRALGNLSRLIKFSCLLSPCERPRSNSGLSSVANNSEDLFSNDDSKVHLGCTSKNLNDTNSFYSSSFLERIVQAFISGITTGNVKVQWNVCHALSNLFLNETLRLQDLDRVSSLFNILLLLLRDSSNFKVRIQAAAALSVPASVYGYGKSFPDVVQGLEHTIENLESNHILAPSFKYKVALEKQLISTMLHVLSLAASTDHQPLKDFLVKKATFLEEWFKALCSSVGERSNWRGEGEDNSTNNQKREMILKALRSLIEVYTSSNQGAISQRFENLVKGIH* Homology
BLAST of Chy9G170750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R5R2 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=HEATR6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 151.8 bits (382), Expect = 5.0e-35 Identity = 197/836 (23.56%), Postives = 350/836 (41.87%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZY56 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=heatr6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 149.4 bits (376), Expect = 2.5e-34 Identity = 187/842 (22.21%), Postives = 352/842 (41.81%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AI08 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEATR6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 9.5e-34 Identity = 195/824 (23.67%), Postives = 345/824 (41.87%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A1EC95 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Heatr6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 146.0 bits (367), Expect = 2.8e-33 Identity = 196/840 (23.33%), Postives = 357/840 (42.50%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6P1G0 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Heatr6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 145.6 bits (366), Expect = 3.6e-33 Identity = 205/874 (23.46%), Postives = 358/874 (40.96%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KQH7 (DUF4042 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G146250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2236.1 bits (5793), Expect = 0.0e+00 Identity = 1168/1190 (98.15%), Postives = 1178/1190 (98.99%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AUR0 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103482890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2191.4 bits (5677), Expect = 0.0e+00 Identity = 1148/1190 (96.47%), Postives = 1164/1190 (97.82%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TH89 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold44G001190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2130.1 bits (5518), Expect = 0.0e+00 Identity = 1122/1186 (94.60%), Postives = 1139/1186 (96.04%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E0A2 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025972 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1945.2 bits (5038), Expect = 0.0e+00 Identity = 1022/1190 (85.88%), Postives = 1091/1190 (91.68%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AU95 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103482890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1935.6 bits (5013), Expect = 0.0e+00 Identity = 1018/1055 (96.49%), Postives = 1033/1055 (97.91%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. NCBI nr
Match: XP_004145966.1 (uncharacterized protein LOC101212003 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN49951.1 hypothetical protein Csa_000577 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2224 bits (5764), Expect = 0.0 Identity = 1168/1190 (98.15%), Postives = 1178/1190 (98.99%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. NCBI nr
Match: XP_008437482.1 (PREDICTED: HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2180 bits (5648), Expect = 0.0 Identity = 1148/1190 (96.47%), Postives = 1164/1190 (97.82%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. NCBI nr
Match: KAA0042623.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2120 bits (5492), Expect = 0.0 Identity = 1122/1186 (94.60%), Postives = 1139/1186 (96.04%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. NCBI nr
Match: XP_031741422.1 (uncharacterized protein LOC101212003 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2117 bits (5486), Expect = 0.0 Identity = 1122/1190 (94.29%), Postives = 1132/1190 (95.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. NCBI nr
Match: XP_038875588.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2086 bits (5406), Expect = 0.0 Identity = 1098/1190 (92.27%), Postives = 1139/1190 (95.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. TAIR 10
Match: AT4G38120.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 959.5 bits (2479), Expect = 2.5e-279 Identity = 575/1203 (47.80%), Postives = 777/1203 (64.59%), Query Frame = 0
BLAST of Chy9G170750 vs. TAIR 10
Match: AT4G38120.2 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 288.1 bits (736), Expect = 3.2e-77 Identity = 190/453 (41.94%), Postives = 268/453 (59.16%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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