Chy9G170000 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy9G170000
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH09: 14839258 .. 14843458 (-)
RNA-Seq ExpressionChy9G170000
SyntenyChy9G170000
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAATGCAGATTACGCTTCTTTTGTAGCAACTTGGGTGGTTCCCAATCAAATGAGCTTGCAGAAGTAAGTGAAGAGGCGAAACAGAAACTAAAAATGACCCATTAATGATTGAGAGAGAGGATACAGAGTGAAAGAAGGAAGCGTCACCCAGTTGAGGAAAATCAATATATTAATTCGCTAATAATTTTGTGTTCGAGTAATCAAATCATAAACATAATAAATAGTAGGAATAAAGAAATGAGGATTTTAAATACAACTACAAATGGAAGGCAAGTAAATTAATACCAGTGGTTAAGACTGTCCTATCTTCCAAACTGATTTGGCGAAAAGGTCCAAATCTCTCCGGGAATGGTGAAGACTTTTTCCGGGAGTCGGTGGCTTCGCCTCACTTCATCTCAAAATTTTCTGAATTTTATTTTAATTTTCGAAAAATAAAATTACTTAAATGTTTTTTTTTTACTTTTTATTATTTATAGAAATTATTTTAATTTCGACAAATATTACTTTTACATTAATTTCAATTTTAACGTTACATTTATCTTTTTTTTAAGTGTAATAATATTTTTAAATATATCAAAATAAAATATAATAAAATTATAGACATCGATAGATGTTTATGAGTTATACCGAAAAGATAATATAACTTTTTTTAAATTTCATTTGATAATTATTTAATAGCTTTTTAAATTTCTAAATTTATTGTTTTGGTATCTGGTTTTTATCAATATCTTTAAAAACTAAGATAAGTTTTATCCGAGTACTATACTTTTACTCTTTTAATTAATAAATATGTAAAACGTCGTAAAAATTGAAGGAAAGTAGACTTCATTTCATCAAAAATAATTTTCTTATCCTTATGAGGTGTTATAAATTTTTTACATCTTAAAATTAAGTCTCAATGAATTCGCTCTTCCCGCACTTAGAATAATAATTTTCTATAAATAAACTTTTAGTATATTAGTATATGATGAGTAAGGAGGTGTCATTTTTTCAAAAGTAAAAGATTCCAATTATCATTTTATAAAAAAAAAACTGTATGTTAAATAGTGATGATAATTAGGTTAAAGTATTGTTATAATCAAACACTCACCTAGCTCAATAATTGAGTACTTGTTGAATGAAAAATTCTTTATGCGAGAAAACCAAATTATGCTATATAGCTATAATTTAAAAGCTAATTCTTTATATGATGCGAGAAGACTAAGTTATGCGATATAGCTATGTTTTCAACATTATGTGAATGAAAACTTGAGAATCTTTCGTGTTTTAGTTTTTAACTATATAATATTGATAATGACTATGTGATAATAGGAGCTATTCGAAAGGTTATAACAAATCACCGCATATGTTGATATTTTAGGCCAAATGGAAATTTTAAAATGTTATTTTATCCTAAAGACGATGAGGCTATAAATTTTATTAAGTGTTGAGATTCCAATTGATTAATGGTAGAAAATAGTGTGCGACTTTAAATCATGCAATTGTGAGTTTTATACTCACAAACAATAACAAGTTTTAGATTTGATTTTATAGGGAAAAAATTGAAGAAAAGAATGCTGGCTATGGGGTTCGAACCCATGCGCACTTATGTGCAGAAGATCTTAAGTCTTCCCCCTTAACCTCTCGGGCAAACCAGCTGATGAATCCCAAAAACTCATTCTTACTATATATACTAAGTCTATATATAAATTAATTAATTCCCCAAGCTTTGGATGATTTGAGAATTAAATTATACTAAGAACAAGTTTAAAGTGTTTAACCAAAAAATTTAAAAAGTACATGACTAAAAAAAATTAATTTCGGACTCACAAATTCACAAGCTTTAGATGTTTGATAGAAAACCATCTACATTAGACTTACAAATGAGATCCTTCAAAATTTGAGACAAAATCACTCGTAAGCAATTAGATTTGATGATGATTGAATACTTTGTGAACCACGATCAACTCCAATCCAAAGTTAGAAAATGAGTTTGACATTAATTAATTAGCAACTTGTGCACATCCAAAATGGCACGATGATCTTGTAGCACATAGTCAAGGCCCCACAGTCTTCCCTTTCACTCCACAATGCAATCACAACCAAGAACAGTGGATATTATTGAAACACACGTGACATAGTTCAAATATGTGGTATATGTATTTGTAAAGCTAAATAACACAACCCAAAATAAGGATGCACATTCACACTTAAGTGTGTTAATAGATAAATACATTTATTTTTTGTTTATCGTTTTTTATATTTTAAGAGAAAATTTTGATTTAAAAATTTTATGAGATCTTATATTTCAACTTTAGTCTTTAGTTGGTTGTTAAGAAAACTAGTGTAAAAATTAAACAAATATGAGAAAAGCGTGATGAAATTTAAAGGAGAAAAAACGACGTCAACACAATTTATTACAAAATTGCTTATATTTTAACATAAGAAAATTTCAAACAAATTGATCACCATAATTACCCAAACATTTTTAAACGTTGAAAATAGAATTATTTTTTTAACAAACATTTTTTAGAAGTTTAAAAGGCATTGTTTAAACTTTCAATCTAAAACTATATAATTTAAAATTATTTTAAAATTTTTTAGGAAGTGTTCGTGACAAGGGTCAAGGTATTGATTATTATTATAATATATGTTATAATAATTTGTATTTGAAGTGTAGATTGAAACTATTTTGATTTGAAAATAAAATATAATAAAGAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAGGATGATGTAAAAGAAATTATTGCATACGAAAAAGGAAAAATAGTGAAGGACCATACCCTGCTATAATCAAAACCATTGATTGACCGAAACGTGGTCGTTTCAGTTTCCTTCTCAAATGTAAGCCGCTTCGTTGAGTTGGCCGCGTCTCCCACGGGCTCCACCTTGTCCCCCTGACGTGGCATCACCACCACCTATCGTTAAAATCTCCTGAACCCCAAAAGCTGTATTTTTTTAATTATTATTACTTCAAACTTTATTATTCTTTTCTTACAATATAGTTTTTTCAATATACTTCGGGAAGTGTAACAATGTAAACCCAAATCCATAACATCAACCCAAAAAACTATTTTCATTATTATTTCTTACCCATAAAAAGAAAAAACATTATCGTTACATTAATATTAATTAATCAAGGCACGTGAGAGAAACCTGATCCCTTTGAAATATATACAAATTCACAACCAAAAATTATTTTTCTAAAAGAAAGAAAATTATCTATTTTTATTTTTATTATTTTATTTAATTTTTATTTAGTTGAGGATGAGAAAGCGAGGCAAAAAAGATATTTTGTTTTTCTGCTTTCTATTAATCTATTGTGTCACACGTATTTTTTTTTCTCTATTTTCTTTTTCTTCTGCTTCTTTCTCCTTCTTCTCACTGCTTTCTAGGGTTTTTGCTCTCCTTAATTTCTTGTTTATTTTCTCTTCTTTTGTAATTTTGGTCTGCTTCTCACTTCATCGGTTGCTTTCTGATATTTATTCATAATTGGATATTTATATTTTTTTTTTTTTCAAATTTTCTGGTGGGGAATTCATTACTGTTTGGCAACTGAGAAAGTGAAGATGATTTGTGGATGGGGGTGGCAGTTTTCATATTGCTGTTTTTCTGTCTATTTTTTTGACAGATGTAGGGAATTTGTGCTCGGTGCGGTTTAGAGGTGAGTTCTTATGCTTATTTATTTAAGGATAAGGATGTGCTTTTGAATGATAATTTCTTTATTGCCATTAAATTCTGTTGATTATCGTTTGAATCCAATCCTTGTAATGAATTTAATGAATTTGAGTGTTCGTTGAATTTTTTTTTTTATATATATTTTTTATTTTTATGTTTGGTGTTCCTTTTCGTAATGATTGGAGTTAGGAAGTTTTTTAGTTTAAACCCTATTTTCGACTGATATATAGATGTCATTGGGAAGTGTTTTAGTTGAATTGTATTAAAAAGTGAGTCAATTGCATTATTTTTTCATTTTTCTACATTTAACTTGAGTTTTATGCTTTTGCTGCTCAACCATTTTGAATGGCCTATGTTTCAGGATTGTGTGATTTTGTAGTATCTGTCTACGGTTCTTTTCTTAAAGAGGAATATTGCTGTTCTGATGGTTTTCAAGAATTGAAAATAATTGGTTCCTAGATTTGGTATTCTATTCATGGTATTTGACTTGGCAACTTGTGTTGTGCTTGCAGGGCAATCAAGTATGTGA

mRNA sequence

ATGAATGCAGATTACGCTTCTTTTGTAGCAACTTGGGTGGTTCCCAATCAAATGAGCTTGCAGAAGGAAAAAATTGAAGAAAAGAATGCTGGCTATGGGGTTCGAACCCATGCGCACTTATGTGCAGAAGATCTTAAGTCTTCCCCCTTAACCTCTCGGGCAAACCAGCTGATGAATCCCAAAAACTCTTGAGGATGAGAAAGCGAGGCAAAAAAGATATTTTGTTTTTCTGCTTTCTATTAATCTATTGTGTCACACATGTAGGGAATTTGTGCTCGGTGCGGTTTAGAGGGCAATCAAGTATGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAATGCAGATTACGCTTCTTTTGTAGCAACTTGGGTGGTTCCCAATCAAATGAGCTTGCAGAAGGAAAAAATTGAAGAAAAGAATGCTGGCTATGGGGTTCGAACCCATGCGCACTTATGTGCAGAAGATCTTAAGTCTTCCCCCTTAACCTCTCGGGCAAACCAGCTGATGAATCCCAAAAACTCTTGAGGATGAGAAAGCGAGGCAAAAAAGATATTTTGTTTTTCTGCTTTCTATTAATCTATTGTGTCACACATGTAGGGAATTTGTGCTCGGTGCGGTTTAGAGGGCAATCAAGTATGTGA

Protein sequence

MNADYASFVATWVVPNQMSLQKEKIEEKNAGYGVRTHAHLCAEDLKSSPLTSRANQLMNPKNS*G*ESEAKKIFCFSAFY*SIVSHM*GICARCGLEGNQVCX
Homology
[Close]
BLAST of Chy9G170000 vs. NCBI nr
Match: KAE8647839.1 (hypothetical protein Csa_000521 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 124 bits (312), Expect = 1.28e-34
Identity = 67/98 (68.37%), Postives = 76/98 (77.55%), Query Frame = 0 

Query: 1  MNADYASFVATWVVPNQMSLQKEKIEE-KNAGYGVRTHAHLCAEDLKSSPLTSRANQLMN 60
          MNADYASFVATWVVPNQMSLQKEK+EE KNAGYGVRTHAHLCAEDLKSSPLTSRANQLM 
Sbjct: 1  MNADYASFVATWVVPNQMSLQKEKMEEGKNAGYGVRTHAHLCAEDLKSSPLTSRANQLMK 60

Query: 61 PKNS*G*ESEAKK----IFCFSAFY*SIVSHM*GICAR 93
          PK     + +A++     FCF   Y   V+H+  +C+ 
Sbjct: 61 PKIE---DEKARQKDISFFCFLLIY--CVTHVGNLCSE 93

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy9G170000 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy9G170000 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy9G170000 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8647839.11.28e-3468.37hypothetical protein Csa_000521 [Cucumis sativus][more]
BLAST of Chy9G170000 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy9G170000.1Chy9G170000.1mRNA