Chy9G166260 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy9G166260
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH09: 11880332 .. 11885963 (-)
RNA-Seq ExpressionChy9G166260
SyntenyChy9G166260
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGGGAGGCGTGTGAATGAGAAACACAACCAACTCTTGCACGTTTGTTTCAACTTTAATTGCCACATTCATTTTTGCAGCAGCTTTCACATCCTGGTGGTGATAAAAGAGACAGGCACCCATACTTGACATGACCTTTGAGCAAGAAGTAGGAGGAGTTAGATCTCATTCCTTACTATTGTTATACTAAAAAACAAATAGTTTCGAGACTTGTTTTTAGTACAATTGTGTTATGAAAGTTGGAACATTTCATATCAAAAATGAAAAGTTATGCTAATTATCCACCAAGCTAAGTTTCCTTTGATAGGCAGGTGGACAATTAGCTTTTTAAAAAGATTATTATAAGGTCATGAGTTCAATCCATGGTAGTCATCAATTTAGAGTTATGTTAAGATAGCCCATTCATTCAAGTCCATTTACTATTTGTTTTCTTTATTTCATATATGCCTTTCTTGACTCAATGTATTAATACCCATATGTGTGTTATAAATTCGGGTTGTTACAGGAGAAATGATTTGAAGTGTGAGTGTAGTGCAAAGTTTTCTTCTCCTTAAATATTTGAAGATTCGTAGAATATCATATATGAAATGAGAAGCCATAGCACTTTTTCTTGCACAAAATTCATTCTCTCCAACCTTTTCATATTTTATCTAGTTAATTTTCTACTCGTTTTTTTGACATAAAAGTCAGGCGGTTTAAGTTGACTCGAACATTCATCGACGTAAAAAGAGGGGGAGAGACAATTGCAATAATATAGTTTTAAAAAATACATTTACAAAATAAACTTGAAAAAAAAATGTTGTTAATATATATGTTTTGAAACTAAAAATATGTAAAACAAAAAAAACTACAAAATTGGGGTGTTGTGTTATTATATTCCGAAGTCAATGCCTCAAAGGCTATAGTCATTAGTCACAAGTTGGCCACTAATTTTGAGTTGGAAAATTTGAAAATGGTTTACCCTACAAATTTGATTTTCACTTAAATGGATGATTTATTAAGATGATATAAAGTATGTGTTTTAATGGTGTTTTGTAAATCTAAACCAAATTTATTGTGACTTAACTATTATTGAGTATCATTTAGGGTTTTTTTTTCCAGAATAATAAAAAAGATACAAATTATTTACACTTTTAAAAAAAACCACTAAAACACAACAAAACTCATTACTTATTTTTGCTAGTTTGTGAATATTACCATTTTTTTACAATTCCCCTATTACTATTTATACATTTTTTTAATATTAAATTGAAATTAGTTATTGTTTAGAATTTGTATAATTTAAATTACAAACTGCATTTTCAATATGTAAATTATAAAGATCTTATATGACAAAATATAGAAAATCTCACAAGTCAAAGATGAACAAAATTTTCAGGCTATTTAATTAAAGCAATTGGCAATATAATTAAAGCAATATCCCTAATTTGATAAAAACTCTAAATAAATAATACTACAAATATATTTAACATAAAATTATATAAAAAGAAAAATCACCCAATGAAAAACGAGAGAAAAGAAAAAAAAAACGACAATTGGAGAAAAATCCTGAATTTCTATTGATCTACAATTTGTATATCTTACTAAATGGTTTAAAGAGAAAATTAAAAGGTTTCAAGTGATTTTACAAAGATTTGTCACAAAACCAACTTACTAAACCTATAATTAATTACCCAATTGCAATAACTAAAACATATATATGTATATTATAGCAAAAAATTCATAATATCAATTATATGTGTTGAAGTTGGAGGCTAGTTTCCTTGTGTTTCCCTGCCCTAACATGTGAAGAGTATTTTGTTTTTTATTCAAAGAATTGACCAAGAAAATTTCCTAGTTTTCGCCATTTTCTTAATTAATTAATTAATTTCATGGTAATATATATTTTGGTGTGTTCGTAGCCTTAAATATTCATCTTCCTTGAAATATAGTAAGGAGGTGGAGGAATAACAATGAACCCTACACCGCGCATCGTCGGACATATTTTGAAACAAAGTATGTAAATTTCTAACTGCAACCAACCATTTTTCTTTGATCTCTTTCTCCTCTCTGTGGGCATGCGGTTCAGCTCGGTTAACCTTTAACCAAAACTGAACCATGAACTCCTCCATCTCGTCCTCGTTGTTGTTGTTATTGTTACTATTTTTTAAAAGTCTTTCCTTTTGAAACCAATCCAGTGGATTATTTGGTTTCAACAGGGCTTAGTTCGAACTTAAATCCATTATTGCTTTGTTTTTTTAAGCTCAATCTACAACATGATATTAATTTTACGAGGAAAAGAAAACTGGGAAAATTGTTAGAAATACTTTCATTTCATCTTGTTTTCAATTTCAAAACTACTATGTTCTTGAAAAAAAACCCTTTTTAAAATATATTAATTTTTTCAAAAAAAGAATTGTTCCTTATGATCAATATATAGCCAATTTTATAACTTTTTCAAAAATTTAAACGTGAATGTATCAAATTTTATATATATATTTTTTAAATGGTTCCAATGTATATATATCAAATCTATTAATTTTTTTTAGAAAATTAAACGTGAGTTTATCAGTTTTGTTTTTTTAAATTTTTTGTTCCCTATATATATATATATATATATTTGTTGCCTGCATATATATATATACATATATCAATTTTTTTTAAAAGTTGGTTAATATACCAAAATCTATATAAAAAAAAAAGTTTAAAAAAATTTAAAGAGGAGTGGTCATAAATAGAAAAAAAAATCGAACCTACTTACAAAATATAGTTTTTTTTAAAAAAAAACAACTCAAATGAACTACATAAAAATTGATGATTTTATAGTTGTAAATAGTTTCAATTTTTTTTTTTCTGAAAATGTCCCAAAATTAAACGTGAATATATCAAATTTGTTTTTAAATTTTTTTAGTTTCCTGTATATATTTTTTTTTTAAAAATTAAATGTGAATATGTCAAAATCTATTAAAAAAATTAAATACGAACTTAGGTGGTATACAATATAGATCTATATTTCTATGGATGGTTTATAAAATCAAACCAAAATTTGAAAATTGTTAAAAAGTTATTTTGTTTTTTAAATTTGACTAAAAGAATTTAATCATTTTACCTAAGAAAGATACAAATGAGAAAATAATAATTTTTAAAAATAAAATGGTTATCCTGCGTTAAGAATTAATTTAGCCTTTTCTATGTTATCGGTGGTTTTTTCTTTCTCGATGAAATATCGGGAAGTACTAAGATTAATTAGATTTTATGATTTTCTCAAATAGTATATATATTTCCAAAATTTATATCAAATCTTATATGATGATGAAACGTAAAAGTGGTCTATATATAAAAAATGTTTGAATTGATCTATTTTAGTGATAAACTATCAAAATATATAGTCTTTATCTATGATAAAATCCTATTACATATGAGAGATGATATGAATTTTTATTAATTAGGGGAAAGAAAAGAAAATCTTGAAAAAAGGATTAATCTGTATCGAACTGCACTTGAGGGTAATTGGGATAATGCTTTATGTATTTTGGACCATAATCCATCATTGTCAAGTGCTTCAATAACGAGAGACAAGGAGACAGCTCTTCATATTGCTGCTGGAGCCAAGCACACTCATTTTGTGGAAGAGCTTCTAAAAAAAATGAGCAAAGAGGAAGTTGGTAAGAAAAATAGACATGGAAATACTGCCTTGTGCTTTGCTGCTGCTTCTGGAGTAGTAAGAATTGATGAGCTGATGGTGGAGAAGGACAAGGATCTTCCACTTATTCGTGGCTTTGGGAATGTTACTCCTCTTTTCATGGCAGTTTCTTACAAATGTAAACCCATGGCTTTGTATCTCTTGTCTGTCACTAAACTCACTGAGGTAACCTCCCAAGAAAAGATCGAGCTTCTTATTGCCACCATACATAGTGATTTTTTTGGTAAATATGATCAACTTCTTCATGCATTATCATACATATATACACACAAAAAACCAATCACATCACACATGTGGTTAATTATCAAAATTGATGAGATATTAACAGATTTATTTTTAACTTGTTTTCTTTACAGATATAAGTATAGAAATCTTGGAACATGACACAACTTTGGCTACTAAGAATGACACAAAAAATAACAACGAGACAGCATTGCATGTCATGGCTAGAAAACCATCAGCAATCGATAGGGGAAATCAGCTAAACTTTTGGAAAAACTGCATCAATTGTTAGTTTATACGTTTATCCTTTTAAATTCTTCATTTTGTCAATTAATGGCATATAGAACCTTTATTTTGCTTCATCTTTGATTGCACAGCAGTAAAAAAAATCTCCGATAATGAAGAAGAAGAGATGAAGACATTAGCCCGTGAGTTAGTTGAATCATTATGGAAACATGTTGTATATGAGTTGCCACAAAAACAAATGCTGAGCTTCATAAGGCATCCTTCACGATTGCTTCATGATGCTGCCAGTGTAGGAAATGTTGAGTTTTTGGTTTTGCTCATTCGTAGATATCCAGATATTGTATGGGAAGAAGATGATGATGGTAAAAGTATATTTCACGTAGCGGTTGAGAATCGACTCGAGGATGTGTTCAATCTAATATATGAGATTGGTTGCCTTAAGGACTTTTCTGCAAAATATAGAACAACTGTCAGAGGAAAATATAACATTCTACATTTGGCTGCAAAACTAGCTGCTCCTATCCACCTTAATAAGGTCTCGGGAGCAGCCCTTCAAATGCAACGTGAATTACTTTGGTATAAGGTAACATAATTACCAATTCATACACTTCAAACTATTTACATGAGTACTATTGTCAGCGTTTGTGTCAGCTTCAACTTAAACTTTTGAGACGGTTAATTTAGTAAAAATTTTTGTTTTCTTATCCGCATTCAAATTGAATAATGAAGGAAGTGGAAAAGATAGTTCTGCCATCCCAACTAGAGGCCAAATGTGATGATCCTCTTAAGTTGACACCACGAGAGTTATTCACTATAGAGCATAAAGATCTCCGTAAAGATGGCGAAGCAT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mRNA sequence

ATGGGGAGGCGTGTGAATGAGAAACACAACCAACTCTTGCACGGGAAAGAAAAGAAAATCTTGAAAAAAGGATTAATCTGTATCGAACTGCACTTGAGGGTAATTGGGATAATGCTTTATGTATTTTGGACCATAATCCATCATTGTCAAGTGCTTCAATAACGAGAGACAAGGAGACAGCTCTTCATATTGCTGCTGGAGCCAAGCACACTCATTTTGTGGAAGAGCTTCTAAAAAAAATGAGCAAAGAGGAAGTTGGTAAGAAAAATAGACATGGAAATACTGCCTTGTGCTTTGCTGCTGCTTCTGGAGTAGTAAGAATTGATGAGCTGATGGTGGAGAAGGACAAGGATCTTCCACTTATTCGTGGCTTTGGGAATGTTACTCCTCTTTTCATGGCAGTTTCTTACAAATGTAAACCCATGGCTTTGTATCTCTTGTCTGTCACTAAACTCACTGAGGTAACCTCCCAAGAAAAGATCGAGCTTCTTATTGCCACCATACATAGTGATTTTTTTGATATAAGTATAGAAATCTTGGAACATGACACAACTTTGGCTACTAAGAATGACACAAAAAATAACAACGAGACAGCATTGCATGTCATGGCTAGAAAACCATCAGCAATCGATAGGGGAAATCAGCTAAACTTTTGGAAAAACTGCATCAATTCAGTAAAAAAAATCTCCGATAATGAAGAAGAAGAGATGAAGACATTAGCCCGTGAGTTAGTTGAATCATTATGGAAACATGTTGTATATGAGTTGCCACAAAAACAAATGCTGAGCTTCATAAGGCATCCTTCACGATTGCTTCATGATGCTGCCAGTGTAGGAAATGTTGAGTTTTTGGTTTTGCTCATTCGTAGATATCCAGATATTGTATGGGAAGAAGATGATGATGGTAAAAGTATATTTCACGTAGCGGTTGAGAATCGACTCGAGGATGTGTTCAATCTAATATATGAGATTGGTTGCCTTAAGGACTTTTCTGCAAAATATAGAACAACTGTCAGAGGAAAATATAACATTCTACATTTGGCTGCAAAACTAGCTGCTCCTATCCACCTTAATAAGGTCTCGGGAGCAGCCCTTCAAATGCAACGTGAATTACTTTGGTATAAGGAAGTGGAAAAGATAGTTCTGCCATCCCAACTAGAGGCCAAATGTGATGATCCTCTTAAGTTGACACCACGAGAGTTATTCACTATAGAGCATAAAGATCTCCGTAAAGATGGCGAAGCATGGATGAGAAACACAGCAAACTCTTGCATGCTTGTTTCAACTTTAATTGCCACAGTCATATTTGCAGCAGCCTTCACAATTCCTGGTGGTGATGATATTAAAGGCACTCCTATATTTCGAAGGAAGTTTTGGTTCACTATATTTGTTATATCAGATGCAATTGGTTTGATCTCTTCATCATCCTCTATTTTGGTGTTTTTGTCAATCCTAACTTCACGGTACGCCGAATACGATTTCTTGCACTCCTTGCCCTCTCGATTGCTTATTGGATTTACATCGTTGTTTGTCTCCATTGTGTGCATGGTGGTGGCGTTTAGTGCAACCTTCTTCATTCACTACCACAATAATGCAAATATATGGGTTCCTACAATAGTGGCCACAATGACGATTGTTCCAGTTTGCTGCTTTTGCATGCTTCAGTTTAAACTATGGATGGATATATATTATAACACCTATTTGTCTAAATTTCTTTTTAGGTCTCGTCAACCTAAATTGTCCTCATCATCTCCCACTACTGTTTTTTTCTCATCTACGACCATTACTAGCTCTTCCACTTTACCCTTGGTCGAGGCTATTGATAATGAGTCGTCAGAACGTACAGATATTGAGCATTCCCACTTTACCCCTCGCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGGAGGCGTGTGAATGAGAAACACAACCAACTCTTGCACGGGAAAGAAAAGAAAATCTTGAAAAAAGGATTAATCTGTATCGAACTGCACTTGAGGGTAATTGGGATAATGCTTTATGTATTTTGGACCATAATCCATCATTGTCAAGTGCTTCAATAACGAGAGACAAGGAGACAGCTCTTCATATTGCTGCTGGAGCCAAGCACACTCATTTTGTGGAAGAGCTTCTAAAAAAAATGAGCAAAGAGGAAGTTGGTAAGAAAAATAGACATGGAAATACTGCCTTGTGCTTTGCTGCTGCTTCTGGAGTAGTAAGAATTGATGAGCTGATGGTGGAGAAGGACAAGGATCTTCCACTTATTCGTGGCTTTGGGAATGTTACTCCTCTTTTCATGGCAGTTTCTTACAAATGTAAACCCATGGCTTTGTATCTCTTGTCTGTCACTAAACTCACTGAGGTAACCTCCCAAGAAAAGATCGAGCTTCTTATTGCCACCATACATAGTGATTTTTTTGATATAAGTATAGAAATCTTGGAACATGACACAACTTTGGCTACTAAGAATGACACAAAAAATAACAACGAGACAGCATTGCATGTCATGGCTAGAAAACCATCAGCAATCGATAGGGGAAATCAGCTAAACTTTTGGAAAAACTGCATCAATTCAGTAAAAAAAATCTCCGATAATGAAGAAGAAGAGATGAAGACATTAGCCCGTGAGTTAGTTGAATCATTATGGAAACATGTTGTATATGAGTTGCCACAAAAACAAATGCTGAGCTTCATAAGGCATCCTTCACGATTGCTTCATGATGCTGCCAGTGTAGGAAATGTTGAGTTTTTGGTTTTGCTCATTCGTAGATATCCAGATATTGTATGGGAAGAAGATGATGATGGTAAAAGTATATTTCACGTAGCGGTTGAGAATCGACTCGAGGATGTGTTCAATCTAATATATGAGATTGGTTGCCTTAAGGACTTTTCTGCAAAATATAGAACAACTGTCAGAGGAAAATATAACATTCTACATTTGGCTGCAAAACTAGCTGCTCCTATCCACCTTAATAAGGTCTCGGGAGCAGCCCTTCAAATGCAACGTGAATTACTTTGGTATAAGGAAGTGGAAAAGATAGTTCTGCCATCCCAACTAGAGGCCAAATGTGATGATCCTCTTAAGTTGACACCACGAGAGTTATTCACTATAGAGCATAAAGATCTCCGTAAAGATGGCGAAGCATGGATGAGAAACACAGCAAACTCTTGCATGCTTGTTTCAACTTTAATTGCCACAGTCATATTTGCAGCAGCCTTCACAATTCCTGGTGGTGATGATATTAAAGGCACTCCTATATTTCGAAGGAAGTTTTGGTTCACTATATTTGTTATATCAGATGCAATTGGTTTGATCTCTTCATCATCCTCTATTTTGGTGTTTTTGTCAATCCTAACTTCACGGTACGCCGAATACGATTTCTTGCACTCCTTGCCCTCTCGATTGCTTATTGGATTTACATCGTTGTTTGTCTCCATTGTGTGCATGGTGGTGGCGTTTAGTGCAACCTTCTTCATTCACTACCACAATAATGCAAATATATGGGTTCCTACAATAGTGGCCACAATGACGATTGTTCCAGTTTGCTGCTTTTGCATGCTTCAGTTTAAACTATGGATGGATATATATTATAACACCTATTTGTCTAAATTTCTTTTTAGGTCTCGTCAACCTAAATTGTCCTCATCATCTCCCACTACTGTTTTTTTCTCATCTACGACCATTACTAGCTCTTCCACTTTACCCTTGGTCGAGGCTATTGATAATGAGTCGTCAGAACGTACAGATATTGAGCATTCCCACTTTACCCCTCGCTGA

Protein sequence

MGRRVNEKHNQLLHGKEKKILKKGLICIELHLRVIGIMLYVFWTIIHHCQVLQ*RETRRQLFILLLEPSTLILWKSF*KK*AKRKLVRKIDMEILPCALLLLLE**ELMS*WWRRTRIFHLFVALGMLLLFSWQFLTNVNPWLCISCLSLNSLR*PPKKRSSFLLPPYIVIFLI*V*KSWNMTQLWLLRMTQKITTRQHCMSWLENHQQSIGEIS*TFGKTASIQ*KKSPIMKKKR*RH*PVS*LNHYGNMLYMSCHKNKC*AS*GILHDCFMMLPV*EMLSFWFCSFVDIQILYGKKMMMVKVYFT*RLRIDSRMCSI*YMRLVALRTFLQNIEQLSEENITFYIWLQN*LLLSTLIRSREQPFKCNVNYFGIRKWKR*FCHPN*RPNVMILLS*HHESYSL*SIKISVKMAKHG*ETQQTLACLFQL*LPQSYLQQPSQFLVVMILKALLYFEGSFGSLYLLYQMQLV*SLHHPLFWCFCQS*LHGTPNTISCTPCPLDCLLDLHRCLSPLCAWWWRLVQPSSFTTTIMQIYGFLQ*WPQ*RLFQFAAFACFSLNYGWIYIITPICLNFFLGLVNLNCPHHLPLLFFSHLRPLLALPLYPWSRLLIMSRQNVQILSIPTLPLAX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy9G166260.1Chy9G166260.1mRNA