Chy9G166250 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy9G166250
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH09: 11879751 .. 11884227 (-)
RNA-Seq ExpressionChy9G166250
SyntenyChy9G166250
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTGTTGAAGTTGGAGGCTAGTTTCCTTGTGTTTCCCTGCCCTAACATGTGAAGAGTATTTTGTTTTTTATTCAAAGAATTGACCAAGAAAATTTCCTAGTTTTCGCCATTTTCTTAATTAATTAATTAATTTCATGGTAATATATATTTTGGTGTGTTCGTAGCCTTAAATATTCATCTTCCTTGAAATATAGTAAGGAGGTGGAGGAATAACAATGAACCCTACACCGCGCATCGTCGGACATATTTTGAAACAAAGTATGTAAATTTCTAACTGCAACCAACCATTTTTCTTTGATCTCTTTCTCCTCTCTGTGGGCATGCGGTTCAGCTCGGTTAACCTTTAACCAAAACTGAACCATGAACTCCTCCATCTCGTCCTCGTTGTTGTTGTTATTGTTACTATTTTTTAAAAGTCTTTCCTTTTGAAACCAATCCAGTGGATTATTTGGTTTCAACAGGGCTTAGTTCGAACTTAAATCCATTATTGCTTTGTTTTTTTAAGCTCAATCTACAACATGATATTAATTTTACGAGGAAAAGAAAACTGGGAAAATTGTTAGAAATACTTTCATTTCATCTTGTTTTCAATTTCAAAACTACTATGTTCTTGAAAAAAAACCCTTTTTAAAATATATTAATTTTTTCAAAAAAAGAATTGTTCCTTATGATCAATATATAGCCAATTTTATAACTTTTTCAAAAATTTAAACGTGAATGTATCAAATTTTATATATATATTTTTTAAATGGTTCCAATGTATATATATCAAATCTATTAATTTTTTTTAGAAAATTAAACGTGAGTTTATCAGTTTTGTTTTTTTAAATTTTTTGTTCCCTATATATATATATATATATATTTGTTGCCTGCATATATATATATACATATATCAATTTTTTTTAAAAGTTGGTTAATATACCAAAATCTATATAAAAAAAAAAGTTTAAAAAAATTTAAAGAGGAGTGGTCATAAATAGAAAAAAAAATCGAACCTACTTACAAAATATAGTTTTTTTTAAAAAAAAACAACTCAAATGAACTACATAAAAATTGATGATTTTATAGTTGTAAATAGTTTCAATTTTTTTTTTTCTGAAAATGTCCCAAAATTAAACGTGAATATATCAAATTTGTTTTTAAATTTTTTTAGTTTCCTGTATATATTTTTTTTTTAAAAATTAAATGTGAATATGTCAAAATCTATTAAAAAAATTAAATACGAACTTAGGTGGTATACAATATAGATCTATATTTCTATGGATGGTTTATAAAATCAAACCAAAATTTGAAAATTGTTAAAAAGTTATTTTGTTTTTTAAATTTGACTAAAAGAATTTAATCATTTTACCTAAGAAAGATACAAATGAGAAAATAATAATTTTTAAAAATAAAATGGTTATCCTGCGTTAAGAATTAATTTAGCCTTTTCTATGTTATCGGTGGTTTTTTCTTTCTCGATGAAATATCGGGAAGTACTAAGATTAATTAGATTTTATGATTTTCTCAAATAGTATATATATTTCCAAAATTTATATCAAATCTTATATGATGATGAAACGTAAAAGTGGTCTATATATAAAAAATGTTTGAATTGATCTATTTTAGTGATAAACTATCAAAATATATAGTCTTTATCTATGATAAAATCCTATTACATATGAGAGATGATATGAATTTTTATTAATTAGGGGAAAGAAAAGAAAATCTTGAAAAAAGGATTAATCTGTATCGAACTGCACTTGAGGGTAATTGGGATAATGCTTTATGTATTTTGGACCATAATCCATCATTGTCAAGTGCTTCAATAACGAGAGACAAGGAGACAGCTCTTCATATTGCTGCTGGAGCCAAGCACACTCATTTTGTGGAAGAGCTTCTAAAAAAAATGAGCAAAGAGGAAGTTGGTAAGAAAAATAGACATGGAAATACTGCCTTGTGCTTTGCTGCTGCTTCTGGAGTAGTAAGAATTGATGAGCTGATGGTGGAGAAGGACAAGGATCTTCCACTTATTCGTGGCTTTGGGAATGTTACTCCTCTTTTCATGGCAGTTTCTTACAAATGTAAACCCATGGCTTTGTATCTCTTGTCTGTCACTAAACTCACTGAGGTAACCTCCCAAGAAAAGATCGAGCTTCTTATTGCCACCATACATAGTGATTTTTTTGGTAAATATGATCAACTTCTTCATGCATTATCATACATATATACACACAAAAAACCAATCACATCACACATGTGGTTAATTATCAAAATTGATGAGATATTAACAGATTTATTTTTAACTTGTTTTCTTTACAGATATAAGTATAGAAATCTTGGAACATGACACAACTTTGGCTACTAAGAATGACACAAAAAATAACAACGAGACAGCATTGCATGTCATGGCTAGAAAACCATCAGCAATCGATAGGGGAAATCAGCTAAACTTTTGGAAAAACTGCATCAATTGTTAGTTTATACGTTTATCCTTTTAAATTCTTCATTTTGTCAATTAATGGCATATAGAACCTTTATTTTGCTTCATCTTTGATTGCACAGCAGTAAAAAAAATCTCCGATAATGAAGAAGAAGAGATGAAGACATTAGCCCGTGAGTTAGTTGAATCATTATGGAAACATGTTGTATATGAGTTGCCACAAAAACAAATGCTGAGCTTCATAAGGCATCCTTCACGATTGCTTCATGATGCTGCCAGTGTAGGAAATGTTGAGTTTTTGGTTTTGCTCATTCGTAGATATCCAGATATTGTATGGGAAGAAGATGATGATGGTAAAAGTATATTTCACGTAGCGGTTGAGAATCGACTCGAGGATGTGTTCAATCTAATATATGAGATTGGTTGCCTTAAGGACTTTTCTGCAAAATATAGAACAACTGTCAGAGGAAAATATAACATTCTACATTTGGCTGCAAAACTAGCTGCTCCTATCCACCTTAATAAGGTCTCGGGAGCAGCCCTTCAAATGCAACGTGAATTACTTTGGTATAAGGTAACATAATTACCAATTCATACACTTCAAACTATTTACATGAGTACTATTGTCAGCGTTTGTGTCAGCTTCAACTTAAACTTTTGAGACGGTTAATTTAGTAAAAATTTTTGTTTTCTTATCCGCATTCAAATTGAATAATGAAGGAAGTGGAAAAGATAGTTCTGCCATCCCAACTAGAGGCCAAATGTGATGATCCTCTTAAGTTGACACCACGAGAGTTATTCACTATAGAGCATAAAGATCTCCGTAAAGATGGCGAAGCATGGATGAGAAACACAGCAAACTCTTGCATGCTTGTTTCAACTTTAATTGCCACAGTCATATTTGCAGCAGCCTTCACAATTCCTGGTGGTGATGATATTAAAGGCACTCCTATATTTCGAAGGAAGTTTTGGTTCACTATATTTGTTATATCAGATGCAATTGGTTTGATCTCTTCATCATCCTCTATTTTGGTGTTTTTGTCAATCCTAACTTCACGGTACGCCGAATACGATTTCTTGCACTCCTTGCCCTCTCGATTGCTTATTGGATTTACATCGTTGTTTGTCTCCATTGTGTGCATGGTGGTGGCGTTTAGTGCAACCTTCTTCATTCACTACCACAATAATGCAAATATATGGGTTCCTACAATAGTGGCCACAATGACGATTGTTCCAGTTTGCTGCTTTTGCATGCTTCAGTTTAAACTATGGATGGATATATATTATAACACCTATTTGTCTAAATTTCTTTTTAGGTCTCGTCAACCTAAATTGTCCTCATCATCTCCCACTACTGTTTTTTTCTCATCTACGACCATTACTAGCTCTTCCACTTTACCCTTGGTCGAGGCTATTGATAATGAGTCGTCAGAACGTACAGATATTGAGCATTCCCACTTTACCCCTCGCTGAGTGCATAGCATGCTACAATGTTATCATCTACTCAACCTTCAACACAGATAGATAGTGATATAGACTATCATTAATAACTTAAGTATTCTTTATTATTATTACCACTTATAGTTAGTGATAATCTTCTAATTTTCATGTGTAAAGTGATAAAAAGTAATATATCCTTCTATCATTAGTAGTAAGAGTGATAGTTTCTACAATTATCTGTTAGTTCTCCATAATTATCTATAGGTGATAAAAAGTTGTGTGTTTCTATTATAATTAATAATCAATGATAGTCTTTGAACATTGTCTATTCAAATATGCTTGAAAAATGTACTTCTTGTCAACTTTTTTTCTTTTTAAATGGATAACTTCAACAAACCAAATCTTCTATTGATAGAAGATAGTCATTGATAACTATGATGTTGGATTATATGAATAATTTGTTAAAAGGTACCATTGATGTTGGATTATATCAATAATGTAAATAACACATTATCAAACTATTAGGTTGGATTCAATTTCTTCCCACTTTTCAAGCTTATATATTTGTTTTTGTTTCTCTTCTCAATTTGATTCTCTTCGTCATTATCATCATC

mRNA sequence

ATGTGTTGAAGTTGGAGGCTAGTTTCCTTCCTTAAATATTCATCTTCCTTGAAATATAGTAAGGAGGTGGAGGAATAACAATGAACCCTACACCGCGCATCGTCGGACATATTTTGAAACAAAGGGAAAGAAAAGAAAATCTTGAAAAAAGGATTAATCTGTATCGAACTGCACTTGAGGGTAATTGGGATAATGCTTTATGTATTTTGGACCATAATCCATCATTGTCAAGTGCTTCAATAACGAGAGACAAGGAGACAGCTCTTCATATTGCTGCTGGAGCCAAGCACACTCATTTTGTGGAAGAGCTTCTAAAAAAAATGAGCAAAGAGGAAGTTGGTAAGAAAAATAGACATGGAAATACTGCCTTGTGCTTTGCTGCTGCTTCTGGAGTAGTAAGAATTGATGAGCTGATGGTGGAGAAGGACAAGGATCTTCCACTTATTCGTGGCTTTGGGAATGTTACTCCTCTTTTCATGGCAGTTTCTTACAAATGTAAACCCATGGCTTTGTATCTCTTGTCTGTCACTAAACTCACTGAGGTAACCTCCCAAGAAAAGATCGAGCTTCTTATTGCCACCATACATAGTGATTTTTTTGATATAAGTATAGAAATCTTGGAACATGACACAACTTTGGCTACTAAGAATGACACAAAAAATAACAACGAGACAGCATTGCATGTCATGGCTAGAAAACCATCAGCAATCGATAGGGGAAATCAGCTAAACTTTTGGAAAAACTGCATCAATTCAGTAAAAAAAATCTCCGATAATGAAGAAGAAGAGATGAAGACATTAGCCCGTGAGTTAGTTGAATCATTATGGAAACATGTTGTATATGAGTTGCCACAAAAACAAATGCTGAGCTTCATAAGGCATCCTTCACGATTGCTTCATGATGCTGCCAGTGTAGGAAATGTTGAGTTTTTGGTTTTGCTCATTCGTAGATATCCAGATATTGTATGGGAAGAAGATGATGATGGTAAAAGTATATTTCACGTAGCGGTTGAGAATCGACTCGAGGATGTGTTCAATCTAATATATGAGATTGGTTGCCTTAAGGACTTTTCTGCAAAATATAGAACAACTGTCAGAGGAAAATATAACATTCTACATTTGGCTGCAAAACTAGCTGCTCCTATCCACCTTAATAAGGTCTCGGGAGCAGCCCTTCAAATGCAACGTGAATTACTTTGGTATAAGGAAGTGGAAAAGATAGTTCTGCCATCCCAACTAGAGGCCAAATGTGATGATCCTCTTAAGTTGACACCACGAGAGTTATTCACTATAGAGCATAAAGATCTCCGTAAAGATGGCGAAGCATGGATGAGAAACACAGCAAACTCTTGCATGCTTGTTTCAACTTTAATTGCCACAGTCATATTTGCAGCAGCCTTCACAATTCCTGGTGGTGATGATATTAAAGGCACTCCTATATTTCGAAGGAAGTTTTGGTTCACTATATTTGTTATATCAGATGCAATTGGTTTGATCTCTTCATCATCCTCTATTTTGGTGTTTTTGTCAATCCTAACTTCACGGTACGCCGAATACGATTTCTTGCACTCCTTGCCCTCTCGATTGCTTATTGGATTTACATCGTTGTTTGTCTCCATTGTGTGCATGGTGGTGGCGTTTAGTGCAACCTTCTTCATTCACTACCACAATAATGCAAATATATGGGTTCCTACAATAGTGGCCACAATGACGATTGTTCCAGTTTGCTGCTTTTGCATGCTTCAGTTTAAACTATGGATGGATATATATTATAACACCTATTTGTCTAAATTTCTTTTTAGGTCTCGTCAACCTAAATTGTCCTCATCATCTCCCACTACTGTTTTTTTCTCATCTACGACCATTACTAGCTCTTCCACTTTACCCTTGGTCGAGGCTATTGATAATGAGTCGTCAGAACGTACAGATATTGAGCATTCCCACTTTACCCCTCGCTGAGTGCATAGCATGCTACAATGTTATCATCTACTCAACCTTCAACACAGATAGATATATTCTTTATTATTATTACCACTTATAGTTAGTGATAATCTTCTAATTTTCATGTGTAAAGTGATAAAAAGTAATATATCCTTCTATCATTAGTAGTAAGAGTGATAGTTTCTACAATTATCTGTTAGTTCTCCATAATTATCTATAGGTGATAAAAAGTTGTGTGTTTCTATTATAATTAATAATCAATGATAGTCTTTGAACATTGTCTATTCAAATATGCTTGAAAAATGTACTTCTTGTCAACTTTTTTTCTTTTTAAATGGATAACTTCAACAAACCAAATCTTCTATTGATAGAAGATAGTCATTGATAACTATGATGTTGGATTATATGAATAATTTGTTAAAAGGTACCATTGATGTTGGATTATATCAATAATGTAAATAACACATTATCAAACTATTAGGTTGGATTCAATTTCTTCCCACTTTTCAAGCTTATATATTTGTTTTTGTTTCTCTTCTCAATTTGATTCTCTTCGTCATTATCATCATC

Coding sequence (CDS)

ATGTGTTGAAGTTGGAGGCTAGTTTCCTTCCTTAAATATTCATCTTCCTTGAAATATAGTAAGGAGGTGGAGGAATAACAATGAACCCTACACCGCGCATCGTCGGACATATTTTGAAACAAAGGGAAAGAAAAGAAAATCTTGAAAAAAGGATTAATCTGTATCGAACTGCACTTGAGGGTAATTGGGATAATGCTTTATGTATTTTGGACCATAATCCATCATTGTCAAGTGCTTCAATAACGAGAGACAAGGAGACAGCTCTTCATATTGCTGCTGGAGCCAAGCACACTCATTTTGTGGAAGAGCTTCTAAAAAAAATGAGCAAAGAGGAAGTTGGTAAGAAAAATAGACATGGAAATACTGCCTTGTGCTTTGCTGCTGCTTCTGGAGTAGTAAGAATTGATGAGCTGATGGTGGAGAAGGACAAGGATCTTCCACTTATTCGTGGCTTTGGGAATGTTACTCCTCTTTTCATGGCAGTTTCTTACAAATGTAAACCCATGGCTTTGTATCTCTTGTCTGTCACTAAACTCACTGAGGTAACCTCCCAAGAAAAGATCGAGCTTCTTATTGCCACCATACATAGTGATTTTTTTGATATAAGTATAGAAATCTTGGAACATGACACAACTTTGGCTACTAAGAATGACACAAAAAATAACAACGAGACAGCATTGCATGTCATGGCTAGAAAACCATCAGCAATCGATAGGGGAAATCAGCTAAACTTTTGGAAAAACTGCATCAATTCAGTAAAAAAAATCTCCGATAATGAAGAAGAAGAGATGAAGACATTAGCCCGTGAGTTAGTTGAATCATTATGGAAACATGTTGTATATGAGTTGCCACAAAAACAAATGCTGAGCTTCATAAGGCATCCTTCACGATTGCTTCATGATGCTGCCAGTGTAGGAAATGTTGAGTTTTTGGTTTTGCTCATTCGTAGATATCCAGATATTGTATGGGAAGAAGATGATGATGGTAAAAGTATATTTCACGTAGCGGTTGAGAATCGACTCGAGGATGTGTTCAATCTAATATATGAGATTGGTTGCCTTAAGGACTTTTCTGCAAAATATAGAACAACTGTCAGAGGAAAATATAACATTCTACATTTGGCTGCAAAACTAGCTGCTCCTATCCACCTTAATAAGGTCTCGGGAGCAGCCCTTCAAATGCAACGTGAATTACTTTGGTATAAGGAAGTGGAAAAGATAGTTCTGCCATCCCAACTAGAGGCCAAATGTGATGATCCTCTTAAGTTGACACCACGAGAGTTATTCACTATAGAGCATAAAGATCTCCGTAAAGATGGCGAAGCATGGATGAGAAACACAGCAAACTCTTGCATGCTTGTTTCAACTTTAATTGCCACAGTCATATTTGCAGCAGCCTTCACAATTCCTGGTGGTGATGATATTAAAGGCACTCCTATATTTCGAAGGAAGTTTTGGTTCACTATATTTGTTATATCAGATGCAATTGGTTTGATCTCTTCATCATCCTCTATTTTGGTGTTTTTGTCAATCCTAACTTCACGGTACGCCGAATACGATTTCTTGCACTCCTTGCCCTCTCGATTGCTTATTGGATTTACATCGTTGTTTGTCTCCATTGTGTGCATGGTGGTGGCGTTTAGTGCAACCTTCTTCATTCACTACCACAATAATGCAAATATATGGGTTCCTACAATAGTGGCCACAATGACGATTGTTCCAGTTTGCTGCTTTTGCATGCTTCAGTTTAAACTATGGATGGATATATATTATAACACCTATTTGTCTAAATTTCTTTTTAGGTCTCGTCAACCTAAATTGTCCTCATCATCTCCCACTACTGTTTTTTTCTCATCTACGACCATTACTAGCTCTTCCACTTTACCCTTGGTCGAGGCTATTGATAATGAGTCGTCAGAACGTACAGATATTGAGCATTCCCACTTTACCCCTCGCTGAGTGCATAGCATGCTACAATGTTATCATCTACTCAACCTTCAACACAGATAGATATATTCTTTATTATTATTACCACTTATAGTTAGTGATAATCTTCTAATTTTCATGTGTAAAGTGATAAAAAGTAATATATCCTTCTATCATTAGTAGTAAGAGTGATAGTTTCTACAATTATCTGTTAGTTCTCCATAATTATCTATAGGTGATAAAAAGTTGTGTGTTTCTATTATAATTAATAATCAATGATAGTCTTTGAACATTGTCTATTCAAATATGCTTGAAAAATGTACTTCTTGTCAACTTTTTTTCTTTTTAAATGGATAACTTCAACAAACCAAATCTTCTATTGATAGAAGATAGTCATTGATAACTATGATGTTGGATTATATGAATAATTTGTTAAAAGGTACCATTGATGTTGGATTATATCAATAATGTAAATAACACATTATCAAACTATTAGGTTGGATTCAATTTCTTCCCACTTTTCAAGCTTATATATTTGTTTTTGTTTCTCTTCTCAATTTGATTCTCTTCGTCATTATCATCATC

Protein sequence

MC*SWRLVSFLKYSSSLKYSKEVEE*Q*TLHRASSDIF*NKGKEKKILKKGLICIELHLRVIGIMLYVFWTIIHHCQVLQ*RETRRQLFILLLEPSTLILWKSF*KK*AKRKLVRKIDMEILPCALLLLLE**ELMS*WWRRTRIFHLFVALGMLLLFSWQFLTNVNPWLCISCLSLNSLR*PPKKRSSFLLPPYIVIFLI*V*KSWNMTQLWLLRMTQKITTRQHCMSWLENHQQSIGEIS*TFGKTASIQ*KKSPIMKKKR*RH*PVS*LNHYGNMLYMSCHKNKC*AS*GILHDCFMMLPV*EMLSFWFCSFVDIQILYGKKMMMVKVYFT*RLRIDSRMCSI*YMRLVALRTFLQNIEQLSEENITFYIWLQN*LLLSTLIRSREQPFKCNVNYFGIRKWKR*FCHPN*RPNVMILLS*HHESYSL*SIKISVKMAKHG*ETQQTLACLFQL*LPQSYLQQPSQFLVVMILKALLYFEGSFGSLYLLYQMQLV*SLHHPLFWCFCQS*LHGTPNTISCTPCPLDCLLDLHRCLSPLCAWWWRLVQPSSFTTTIMQIYGFLQ*WPQ*RLFQFAAFACFSLNYGWIYIITPICLNFFLGLVNLNCPHHLPLLFFSHLRPLLALPLYPWSRLLIMSRQNVQILSIPTLPLAECIACYNVIIYSTFNTDRYILYYYYHL*LVIIF*FSCVK**KVIYPSIISSKSDSFYNYLLVLHNYL*VIKSCVFLL*LIINDSL*TLSIQICLKNVLLVNFFSF*MDNFNKPNLLLIEDSH**L*CWII*IIC*KVPLMLDYINNVNNTLSNY*VGFNFFPLFKLIYLFLFLFSI*FSSSLSSX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy9G166250.1Chy9G166250.1mRNA