Chy9G163320 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy9G163320
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH09: 7589707 .. 7604992 (+)
RNA-Seq ExpressionChy9G163320
SyntenyChy9G163320
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

GCATTTCTTACCACATTGATTGCGGTGGACTAATCAACTCCACCGACCCTTTTGGCATTACCTGGCTTTCCGACCGATTCTACACCGGCGGCACCACTGCTATCGTCTCCGAGCCCCTTATTTTCCGACACCCACAAGAAAAGAATCTCAGATTCTTCCCTCTATCCTCCGGCAAGAAAAATTGCTACATTATTCCCAATTTGCCCACTGGCCGTTACTACTTTCGAACATTCACTGTCTATGACAATTACGATGGTAAATCTCACCCTCCTTCCTTTGATGCCTCCATTGAAGGTACCCTTGTCTTCAGCTGGCGTTCTCCTTGGTCAGAGGACCTCGCTCGCCATGGCGCCTACTCTGATCTCTTCGCCTTCATTGGCGACGGGGAGGCTGATTTCTGCTTCTACAGCCTTTCCACCGATTCGCCAGTCATTGGATCATTTCAGCTCGTTCAGGTCGATCCCATGTCATATAACTCAACCGCCATTGGAGAGAACTTCATTCTTGTTAACTACGGGAGGCTTACTTGCGGGTCTGAGCAATGGGGCCCTGGGTTTAGCAATGATACCGATGTTTTCGGTCGCTCGTGGCAGTCGGATTCGATTTTTATAATCCCCAGTTTGAAACAATCAGTTAGAGTTTTGTCGACGGCGAAATCCGTAAGTGGGACCGATCAGCAGCCGAATTATTTTCCGATGAAATTGTATCAGAAGGCGGTGACAGTTGGGGGAACTGGGGTTCTCGAGTACGAATTGCCGGTGGACGCCAAATTGGATTATTTAGTTTGGTTGCATTTTGCGGAGATTGATTCGAGTGTGAAGAAGGCAGGGCAGAGAGTGTTCGATGTGGTTATTAATGGGAATAATGCGACTAGAATAGATATCTTCGCGAAAGTTGGAAGTTTTGCAGCTTATTCATGGTCTTATACTATGAAGAATTTGAGTAGCTCGGCTTTGAGTGTGAAGCTTGTGGGGGTGGTTGGTTCGCCGCTAATCAGTGGGCTTGAGAATTACGCTTTGGTTCCAAGAGATCTTTCCACCGCGCCAGAGCAAGTATCTGCAATGAGAGCATTGAAAGAGTCCCTTCGAGTGCCTGATAGAATGGGTTGGAATGGCGATCCTTGTGCTCCTACAAATTGGGATGCCTGGGAGGGAATTACATGTCGTCCCAACAAGAATGCAACTGCCCTCGTCATATTTCAAATTGATCTGGGAAGCCAAGGCTTGAAAGGGTATATCAGCAACCAAATTGTTCTTTTGACAAACTTGGTAAGCCTAAATCTTAGTTCCAACTCATTGGGGGGCACAATACCGCCTGGGCTAGGTGAACATTCTCTCACACGGCTGGATTTGTCAAAGAATCAGTTAACAGGATCCATACCAGATAGTTTAGCATCTCGAAATTTGCAGCTTGTGCTATTAAATGACAACTTATTGGAAGGACGGGTGCTCGAAGAACTTTATTCTATTGGTGTGCATGGTGGAGCCATTGACCTATCTAGCAACAAGGGTTTATGTGGTGTGCCTTCCTTGCCAACATGCCCTCTATTTTGGGAACATGGGCGGTTGTCTAAAACTGGTAAAATTGCAATAGCTGTATCATCCACGTTTCTTTTCTGTGCACTGCTGGCAGTTATCTACATATGCTGTATCAGAAGACACAGAAACGATTACGATTTCAGCTTGCCTAGTGAATTAATGT

Protein sequence

AFLTTLIAVD*STPPTLLALPGFPTDSTPAAPLLSSPSPLFSDTHKKRISDSSLYPPARKIATLFPICPLAVTTFEHSLSMTITMVNLTLLPLMPPLKVPLSSAGVLLGQRTSLAMAPTLISSPSLATGRLISASTAFPPIRQSLDHFSSFRSIPCHITQPPLERTSFLLTTGGLLAGLSNGALGLAMIPMFSVARGSRIRFL*SPV*NNQLEFCRRRNP*VGPISSRIIFR*NCIRRR*QLGELGFSSTNCRWTPNWII*FGCILRRLIRV*RRQGRECSMWLLMGIMRLE*ISSRKLEVLQLIHGLIL*RI*VARL*V*SLWGWLVRR*SVGLRITLWFQEIFPPRQSKYLQ*EH*KSPFECLIEWVGMAILVLLQIGMPGRELHVVPTRMQLPSSYFKLIWEAKA*KGISATKLFF*QTW*A*ILVPTHWGAQYRLG*VNILSHGWICQRIS*QDPYQIV*HLEICSLCY*MTTYWKDGCSKNFILLVCMVEPLTYLATRVYVVCLPCQHALYFGNMGGCLKLVKLQ*LYHPRFFSVHCWQLSTYAVSEDTETITISACLVN*C
Homology
[Close]
BLAST of Chy9G163320 vs. NCBI nr
Match: XP_031741461.1 (receptor-like protein 4 isoform X2 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 72.8 bits (177), Expect = 2.48e-09
Identity = 32/32 (100.00%), Postives = 32/32 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 499 YLATRVYVVCLPCQHALYFGNMGGCLKLVKLQ 530
           YLATRVYVVCLPCQHALYFGNMGGCLKLVKLQ
Sbjct: 542 YLATRVYVVCLPCQHALYFGNMGGCLKLVKLQ 573

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy9G163320 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy9G163320 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy9G163320 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_031741461.12.48e-09100.00receptor-like protein 4 isoform X2 [Cucumis sativus][more]
BLAST of Chy9G163320 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy9G163320.1Chy9G163320.1mRNA