Chy8G153560 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy8G153560
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH08: 15228073 .. 15244901 (+)
RNA-Seq ExpressionChy8G153560
SyntenyChy8G153560
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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mRNA sequence

TCAATTCTTGGTAATCGATGATCATAGTCATTAGATGGAAGAAGAAACAATGATGGTGGATAAAGCTTGAGTGTGGAGGAGATCAGGAGTGGCAGCGACGGTAGAGAGGGTGAGGAAGGTCAGATTGGAAGAGAAGGGAAGGGTTTTGGAGAGGGTAACATTTGTTTGGAAGAATTGAGATGTAGTAAGGGGAGAGGTAATGAGGATTCCTTATGGGCATATGTATCATGAATCCAT

Coding sequence (CDS)

TCAATTCTTGGTAATCGATGATCATAGTCATTAGATGGAAGAAGAAACAATGATGGTGGATAAAGCTTGAGTGTGGAGGAGATCAGGAGTGGCAGCGACGGTAGAGAGGGTGAGGAAGGTCAGATTGGAAGAGAAGGGAAGGGTTTTGGAGAGGGTAACATTTGTTTGGAAGAATTGAGATGTAGTAAGGGGAGAGGTAATGAGGATTCCTTATGGGCATATGTATCATGAATCCAT

Protein sequence

SILGNR*S*SLDGRRNNDGG*SLSVEEIRSGSDGREGEEGQIGREGKGFGEGNICLEELRCSKGRGNEDSLWAYVS*IH
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..47
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..15
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 26..42

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy8G153560.1Chy8G153560.1mRNA