Chy8G149680 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGAATGAGGGAGGAAGAGATCGAAAAACTCCGAGGTGTTGTAAGGGATTGTTTGAGCAAGCATCTCTACTCGTCCGCCATTTTCTTTGCTGACAAAGTCACTGCTTTCACTGAGGACCCTGCCGACATTTACATGCAAGCCCAAGCCCTCTTTCTTGGACGCCATTTTCGTCGTGCGTTTCACCTCCTCAATGCCTCTAAGATTGTCCTCCGTGACCCTCGGTTTCGCTACCTTGCTGCTAAATGCCTTGTGAGCTACTTGAAGCTTCACGGTTTATCTGTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAAATTTTTGTGCTGATTCTGAACCTATGTTCCTTTTTTGTGTGTGCGTTTGGATTTGAGGAGTTGGTAATTATTCTTGTGAATTTCGTTTATGTTGTGTGGGTCTCATAATGGAACTTTCTTTTTGTTGGAAAATTTAAATGCTGGGAATTCAGTTTCTTCAAAGATGAGAAACACAGACAGCGGGACGAAAGAGCAATCTGTGGTTACTTATCTTATGGCATCTATTTAATCTTCGCACATGCTTATAAATAAGGGAAATAAAGAAATAATTCAACCATTTACATGTATTCACTTGACAAGAAAAACTTCACTCAAATATTACAGCGGGGTAAAACCAAAAACTTGGAGATTAGGTAAAACAAATAAATGATCAAACATGGTGGTGGAACTACCTCAGTAGTGAAACTGCGATGCCTAAAAATTGGAGTATATTTGATGTGTAGAAATTACTGAGTTTCTTTTCAGGTGAGAAAGCAAACGTTTGGATATTATTTTGTAAATGGAAATTGAATTTCCTGCTTCTCTGGTCTGTGTTTGCATTTTGTCACAAAGTCTTAGGGGTTCAAGTGACAGGAATAATACATCTTTTTTTGTGTAGAAAAATTTTCTATTCTTAATGTCTGTTTTTAAATCTTTGATGGACTAGGAGGAATTGAAGGAGTGGGACCAATGCCTCGCAATGCTTGGGGATGCCAACGTGGATGAGCATGGCAATGTGCTTGATAATAAGGATCACAGTGGCATGTACCTTGACAAAGATTGTGAGGATCGTGAGATTAATGTACTGTTCAATTACATCATGCCAATTTATTTTAAATGAACATTATAGTTGATTGAATCATTAGGATCCTCTGTTTTCCTTCCTTATGACAGATAGTTGCGGCAACATGCTTTTTAAGAGGCAAAGCATACGAAGCTCTTGAAAACCGTACTCAGGCACGACTTTGGTTAGTTTATGATGGCATTTTTACCTTCATGGGCGTTCTTTCATTCCCCCCCCAAAACCTATATAGTTGTTAAATCTTGCAACCTCAAGTTAATGAATGATGTCATTTATTATTCTATTTTTTTATAATGACGTTTAGGTATAAAGCTGCTATCAAAGCTGACCCTCTATGTTATGAGGTAAATATGTTCTTTTTTTTTTTGTTGAGTTTTGGTATTTCTTGCTCAATATAGTGTACTCTTCTATTACCATTTTTTTTTCATGAGAAACTATACTTTCAATGAAATAGATTAAAGCATGTACAAGGTGGAACTATAGAAAAGAGAATACAAGGTTTACATGGAAAACCCTACAACAGGGAGAAAAAACTACGATAGAGAGACTCTTTTATTATTTTCACAAACAATGAAAGTTACGACAACTTTATAGGCTCTAGCAAGCCCTAATACAAAAAAGGATATAAATTTAGGGTAAAGTAAAGTACTAAAATACCCTTGAGGCTATAAACTATCAAGACAACCCCTTATTTCCAACACTTCTTCTCAAGTTGGGGTGTAGATGTCAATCAAACGTAGCTTGGTAACACATGAGTCAAGATTTGGTCTAAGTAACCCTTGGGTGAGAACATCAACAACTTGGTGACAAAATGAAATATATAGAGTGCAGATATTGCCATTGGCCCATTGTCTAGTTTCTCTTATATAAAGTGTGTCAATCTCTATATGTTTCGTTTTGTCATGTTGTACATGATTATTGACTATGCTTATAGCCGCTTTATTATCACAATAGAGCTTCATAGGTAAAACTCAGTCTTGGTGATGATCAGACAAAACTTTCTTGAACCAGATTTCTTCACAAATTTCCAAACTCATAGTTTCGTATTCGGCTTCAGAACTGCTTCTAGCAACAACACTTTGCTTCTTACTTTTCCAAGTTACTAGGTTACCCTACCCAAAGGTAGATTTTTGTCAATAACTGATCTTGGCCAATTAGAGTTCTATTTGATTTATACTTCAGAGTGAACACCCACTTGCACCCAACTCTTTTATGCCTTTTAGGAAAAGCACAAAGACCCCATGTGTTAGTCTTTTCAAAAGCTCCCATTTCTTCCATGATGACAATCTTCCACTCAAGAATTTCCATAGCCATATGTATGTTTTCGGTATTGTTGTTGTATCAAGGTTGACAGTGAATGCCCTGAACTCAGAAGACAGATTACTGTAAGACAGAAAGCTATGCATGTAGGACCTGATGCATTTTCTCAATGTAATGGACATGTCAAAGAGAGATATCATAATCCCTTGATTCGTCTGATTCTTCATTTGTAGTGGTTTTTTATTACCTTTTTCAGGTTGAGGAAGAGTCTCACCCTTTTGTGTTTTTGTCGAAGTTTCATCACTGCTTTTGTTTTTGTCAAAGTTTCCATCTTATATAAGAAAGAATAAGGATAAGGAAGAAAGAATTCCAAGTAAGAAAGAATAAGGAAGAAAGAATTCCATCTTCTTTTTCTATGCAATAAATGAGATAAGTTCCACGCAATATTCAAAGCTCCTAACTATAGGGTGAAGGAGACGGGAAAGGGAGAATAAAAAACCACAAGGAGGCTCAACTTCCTCAATAAAAGAGATTAATGAATCAATGAATAAAGTCTTACTACAACATGCTTACCTAGCCAACATTTAGATCCTAAGGAAAGGTCACACCTTGCCTTTGTTTCTTATCTCACGTTTTATAAAACCAATCTCTCAAAACGTGAAGGGAGGCTACATTGTACCACGAGTTTATTCGCGATTTTCGGGTTTCATATGGCTGACTTGTTCATCGAGCTAGAACAAGTGTCGCATAATCGTCCGTCCTGTGCTTGAAAAGTTGTGATTGTGACACTAGGCGCGCGCCTAGGCCCAAGTCACATGGCTTGGGCTTCTCCTTGAACAGGCGAGGCGATCTGCCTAAGTCGCGGCTTAGGCGCGTGCCTTCCTTGAGGCGTGAAGGAGCAATAAAATGTCCAAGCGTGGGCTCTCTGTGGGCTAGGCTTTCTTAATTTAAAAAATATTAAAATGTATTATATCCTTTATTTAAATCTAATTGCGTGGCTTCAAAGTTAAGTAAAGAAAAGATTGTCGTTTTTGTTCTCTTCTCTGCCGTTTAAACCAAGTGTGACTGTGAGCGTCTACCAGTCTCTACCCTTTAGTGGAGCTCTGTCACCGGCGTCGGCCAGGGCCGACCTTCTTCACACAAATCACGATCACAACACTTGGATTCTTCTTTTTCCATTTGGCCTCCCTTCTTCTTTTTCAATTTGATCTCCTAGAAGATGAGAAGCTTCCTGTATTTTTTTCAACATTAATCCTTGCAAAATCATTACCGGTTAGCCAAACATCATACTTGCAACCACCCATGAACACTTTCAATTTTGTAGATACATACATATACATATATATTTGTATTTTTTATATATAGTGCGCCTCATGAAAAAAATCCCCGCCTTTTTTAGCGCCTTGCACCTAGGCTCTAGAGGGCCATTGCGCCTTAGTGCCCATTGAGCCTTTTAAAACACTGGTGACTAAGAAGAGCCACAACATACAATATTTTTTTGAAGTTTAAAAATAAGAAGACAACAAACTAGTCCTATAATAATTTTTAGTGGGAGCCTCATCATCGAGGAGATAGAGTTCCCTATTTTGTCATGGTGAGAAGGCAACTTGACAATTTAGATCTTTAGTTATCTTACTAATAAATAGTACATTGTAAGATATTTTGGGTACATGCAACATATTTTGTTTTTTTGAATTGCACCCCAGCTAAAAGTTGCTGGATATGTCCTCAAAAGTTAGCACCAAACGTGCAAGATAGGTTAAAGAAAGAGAATAGCTTCTCCCAACACCGAACCTAAAGAGCAAATGGAAGGAGAAAGACAACTAGTAGGAAGTTTATGCTGCATGACATGATACATTATGATGAACATATATCATAATCTAAATAAGAATGTTAACCCTCCTTGGGCTGTTAAACTTCCATAGTGCCGAACACTTGTCCATTGGGGAAGGAGGGGATAAGTGAGTTGTGAGGGACTTTACTGAGAAAACCCCATTTCCTATCAATGACCACGTTCTTTTATAAAAAGCATATGAAATTTCTCTTTCTGCAATTCTACCGAGCAACTCTTGGAACTCAAGTATTTCTCTCTTTTAACAAACGCCGAAAGATAATGGACCAAGAGGCAAAGGAGCTGTTCCAATGATCGGCTACTGACCCTTTTAATGCAACTCTGTATAGTCTTGGGAACATAATGTTGAAACCTCACCCTCCCTAGTGTCCAACCATGAAAGATTCTGACGGCCATTTCCCAACTTGTATTGAGCCAAAGCATCCATTTTCAGCCATGTTCTAGATATACTGGCCCGAGGACTTCTCAAGCTCTTTCCATCTTTTCCAGCTGTGTGCTAATTGAAGGAATCTTTTCCCCATACACTTCTAACCATCTTACACCTTAGTGAATCCTCTTCCTCAATGTATCTCCTATCCCATTTGGCTAAAAGAGCCAATTTTTTTACCTTTAAAACTCCTTGGCCGAGACCTCCATCTGATGAAGATTTATTGACTGTTTTCCACTTCACTAGATGGTTAATATTACTACCTTTATGACCCTCCCAAAAGAAATTTCGTAGTATTCCTTCCAATTTTGAAATCGATCCTTCAAGCATTAGAAAGGTTGACATGTAATATGACGGAAGATTTGA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ATGAGAATGAGGGAGGAAGAGATCGAAAAACTCCGAGGTGTTGTAAGGGATTGTTTGAGCAAGCATCTCTACTCGTCCGCCATTTTCTTTGCTGACAAAGTCACTGCTTTCACTGAGGACCCTGCCGACATTTACATGCAAGCCCAAGCCCTCTTTCTTGGACGCCATTTTCGTCGTGCGTTTCACCTCCTCAATGCCTCTAAGATTGTCCTCCGTGACCCTCGGTTTCGCTACCTTGCTGCTAAATGCCTTGAGGAATTGAAGGAGTGGGACCAATGCCTCGCAATGCTTGGGGATGCCAACGTGGATGAGCATGGCAATGTGCTTGATAATAAGGATCACAGTGGCATGTACCTTGACAAAGATTGTGAGGATCGTGAGATTAATATAGTTGCGGCAACATGCTTTTTAAGAGGCAAAGCATACGAAGCTCTTGAAAACCGTACTCAGGCACGACTTTGGTATAAAGCTGCTATCAAAGCTGACCCTCTATGTTATGAGGCTTTGGAGTGCCTCATAGAGAGTCACATGCTAACATGCGATGAAGAATCAAGCTTACTTTCATCACTGCAATTTGGTTGTGAAGATGGATGGCTCCCATCATTTTATGCGTGCTTAATAAAGAAGTATGATAAAGAAAATATCATTGAAGCGAGATTCAAAGAACTTGAAACGGAAACATTTAACTCTAAAAGTTCTGATACATCGTTTATGCATACTCTGAAAACTAACATCGATCTTTTAGCTTGCAAAGCTGAATACTACCATCAATGTGGTGAATATCAAAAATGCTTTGAACTTACCTCCGTCTTGCTTGAAAAAGATCCCTTCCATTTGAAAAGTACACTGGTACATTTAGCTGCTGCAATGGAGCTTGGACATTCAAATGAACTTTATCTAATGGCGTGCAACCTGGTTAAGGACTACCCTCAAAAAGCTTTGTCATGGTTTGCTGTCGGCTGCTATTACTACTGTATAAAAAAGTATGATCAATCACGTCGCTATTTCAGCAAAGCTACAACTCTGGATGGAACATTTGCACCTGCTTGGATAGGTTACGGTAACGCTTATGCTGCTCAAGAAGAGGGTGATCAAGCTATGTCGGCCTATCGCACTGGTGCTCGATTGTTTCCGGGGTGTCATTTACCAACATTATACATTGGGATGGAATACATGAGAACGCACAGTTTCAAGCTTGCTGAGCAGTTTTTTGTGCAGGCAAAGACAATTTGTCCATCGGATCCTCTTGTTTATAATGAGCTTGGAGTTGTTGCTTATGACATGAAGGAGTACAATAAAGCAGCATGGTGGTTTGAGAAAACTTTGGCATGCATTCCATCTCCTTTGAGTGAAATGTGGGAGCCTACTGTGGTTAATCTTGCCCATTCGTACCGAAAATTAAAGATGTACCGTGAAGCAATTAAATACTATGAGAAAGCACTTGCGTTATCGACTAGAAGTCTTAGCACTTATGCTGGTCTTGCATATACTTGTCATTTGCAGGATCACTTTACTGCAGCCATCACATATTACCACAAGGCTTTGTGGCTGAAACCGGACGATCAATTCTGCACTGAAATGTTGAGTTTAGCTCTTATGGACGAATGCCAAAATGGGATGGATCCTAAGGTAGAGGTTTGTTGA MRMREEEIEKLRGVVRDCLSKHLYSSAIFFADKVTAFTEDPADIYMQAQALFLGRHFRRAFHLLNASKIVLRDPRFRYLAAKCLEELKEWDQCLAMLGDANVDEHGNVLDNKDHSGMYLDKDCEDREINIVAATCFLRGKAYEALENRTQARLWYKAAIKADPLCYEALECLIESHMLTCDEESSLLSSLQFGCEDGWLPSFYACLIKKYDKENIIEARFKELETETFNSKSSDTSFMHTLKTNIDLLACKAEYYHQCGEYQKCFELTSVLLEKDPFHLKSTLVHLAAAMELGHSNELYLMACNLVKDYPQKALSWFAVGCYYYCIKKYDQSRRYFSKATTLDGTFAPAWIGYGNAYAAQEEGDQAMSAYRTGARLFPGCHLPTLYIGMEYMRTHSFKLAEQFFVQAKTICPSDPLVYNELGVVAYDMKEYNKAAWWFEKTLACIPSPLSEMWEPTVVNLAHSYRKLKMYREAIKYYEKALALSTRSLSTYAGLAYTCHLQDHFTAAITYYHKALWLKPDDQFCTEMLSLALMDECQNGMDPKVEVC* Homology
BLAST of Chy8G149680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B3DNN5 (Anaphase-promoting complex subunit 6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=APC6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 909.1 bits (2348), Expect = 2.5e-263 Identity = 444/545 (81.47%), Postives = 485/545 (88.99%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q13042 (Cell division cycle protein 16 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CDC16 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 378.3 bits (970), Expect = 1.5e-103 Identity = 226/535 (42.24%), Postives = 310/535 (57.94%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8R349 (Cell division cycle protein 16 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cdc16 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 372.5 bits (955), Expect = 8.4e-102 Identity = 223/535 (41.68%), Postives = 308/535 (57.57%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P41889 (Anaphase-promoting complex subunit cut9 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=cut9 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 305.4 bits (781), Expect = 1.3e-81 Identity = 183/522 (35.06%), Postives = 279/522 (53.45%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P09798 (Anaphase-promoting complex subunit CDC16 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=CDC16 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 284.6 bits (727), Expect = 2.3e-75 Identity = 171/537 (31.84%), Postives = 279/537 (51.96%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Z0 (anaphase-promoting complex subunit 6 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486072 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1120.9 bits (2898), Expect = 0.0e+00 Identity = 541/547 (98.90%), Postives = 542/547 (99.09%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SUI9 (Anaphase-promoting complex subunit 6 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold103G00550 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1117.4 bits (2889), Expect = 0.0e+00 Identity = 539/545 (98.90%), Postives = 540/545 (99.08%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L2G5 (TPR_REGION domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G506830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1111.7 bits (2874), Expect = 0.0e+00 Identity = 539/547 (98.54%), Postives = 539/547 (98.54%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C2E8 (Anaphase-promoting complex subunit 6 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold83G001690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1104.0 bits (2854), Expect = 0.0e+00 Identity = 535/545 (98.17%), Postives = 536/545 (98.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IQP6 (anaphase-promoting complex subunit 6-like isoform X4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479617 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1076.2 bits (2782), Expect = 0.0e+00 Identity = 518/544 (95.22%), Postives = 529/544 (97.24%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. NCBI nr
Match: XP_004146390.1 (anaphase-promoting complex subunit 6 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031740070.1 anaphase-promoting complex subunit 6 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN55084.2 hypothetical protein Csa_012360 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1123 bits (2904), Expect = 0.0 Identity = 542/547 (99.09%), Postives = 542/547 (99.09%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. NCBI nr
Match: XP_008442113.1 (PREDICTED: anaphase-promoting complex subunit 6 [Cucumis melo] >XP_008442115.1 PREDICTED: anaphase-promoting complex subunit 6 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1121 bits (2900), Expect = 0.0 Identity = 541/547 (98.90%), Postives = 542/547 (99.09%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. NCBI nr
Match: KAA0034924.1 (anaphase-promoting complex subunit 6 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1118 bits (2891), Expect = 0.0 Identity = 539/545 (98.90%), Postives = 540/545 (99.08%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. NCBI nr
Match: TYK05464.1 (anaphase-promoting complex subunit 6 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1104 bits (2855), Expect = 0.0 Identity = 535/545 (98.17%), Postives = 536/545 (98.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. NCBI nr
Match: XP_038894967.1 (anaphase-promoting complex subunit 6 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1098 bits (2839), Expect = 0.0 Identity = 534/548 (97.45%), Postives = 535/548 (97.63%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G149680 vs. TAIR 10
Match: AT1G78770.1 (anaphase promoting complex 6 ) HSP 1 Score: 909.1 bits (2348), Expect = 1.8e-264 Identity = 444/545 (81.47%), Postives = 485/545 (88.99%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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