Chy8G148690 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview


Name	Chy8G148690
Type	gene
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	Unknown protein
Location	chrH08: 6123291 .. 6146617 (-)
RNA-Seq Expression	Chy8G148690
Synteny	Chy8G148690

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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ATTTGAAAATAATATACGAGAATTACGCTGAAACCACCCTTACCACGCCGACCGTCCAGCAGCCGACCACCAAACGTCACCGTCGCGCGCACCGGGCTGTCAGCATTAGTTCGGAGCCGCGTCAATCACTCTCTGAACTAACGCGATCTTGTCGTCGGAAGTTGGATCTTGGAGTTTTTGAGTAATAATTCCTCAATCCATTCCTAAAGCTCAGATCAAGCACTTGTTAGAGCTTTAAAAAATTGATCGAAAAGTATGCCGCACCGAACACGACCTATGACCGCGCTTCTTGTATTTACTGGTCTCAATGTTGTGCTGGTATCAACCATCACCCCGGTCTATGATTTTGTGTGCTTTCATCCATACTGGGAAAGAAGGAGAGACCGACGTCGGCAACAACGTGAGGCTGCTTTAGGGAAAGAGCTTTTAGCAGACAGATAAACATATGCAGTACCTTTGAGAATTGTACATTGCATCTAAGTTCCCCATACTCATCTTTTTAGGATTTATTGTCCACCGATTGCAGATTGTTGGAAAAGACATAGAACTGGACCATTGAATTCACAAGCTATCCTGATTGATATGTCATAATCAAACTACCTTCTGTTCTGTACACTCTTTTTGTTAATATCTGCTTTGCTTGAGCACCCTGCTTTCCAATGATACAGATAGTTTACACTAAGTTCATAAGTCTTTCACATGACATTTTGACAAAATAGGGCTGAGAATTGATGATTTTAATTGTGTATAATCACTACATTACGAATTCTCATTCCCTTCCATGAGAATTGATGTATTGGAACAAAGTAGCTGATTGTTTTAATCTTGTTTTTGTTGTGACAATTGAAGGTGGGGATTAAATCTACCTCAAGGTTATCATACTCGTTTTTTC

Coding sequence (CDS)

ATTTGAAAATAATATACGAGAATTACGCTGAAACCACCCTTACCACGCCGACCGTCCAGCAGCCGACCACCAAACGTCACCGTCGCGCGCACCGGGCTGTCAGCATTAGTTCGGAGCCGCGTCAATCACTCTCTGAACTAACGCGATCTTGTCGTCGGAAGTTGGATCTTGGAGTTTTTGAGTAATAATTCCTCAATCCATTCCTAAAGCTCAGATCAAGCACTTGTTAGAGCTTTAAAAAATTGATCGAAAAGTATGCCGCACCGAACACGACCTATGACCGCGCTTCTTGTATTTACTGGTCTCAATGTTGTGCTGGTATCAACCATCACCCCGGTCTATGATTTTGTGTGCTTTCATCCATACTGGGAAAGAAGGAGAGACCGACGTCGGCAACAACGTGAGGCTGCTTTAGGGAAAGAGCTTTTAGCAGACAGATAAACATATGCAGTACCTTTGAGAATTGTACATTGCATCTAAGTTCCCCATACTCATCTTTTTAGGATTTATTGTCCACCGATTGCAGATTGTTGGAAAAGACATAGAACTGGACCATTGAATTCACAAGCTATCCTGATTGATATGTCATAATCAAACTACCTTCTGTTCTGTACACTCTTTTTGTTAATATCTGCTTTGCTTGAGCACCCTGCTTTCCAATGATACAGATAGTTTACACTAAGTTCATAAGTCTTTCACATGACATTTTGACAAAATAGGGCTGAGAATTGATGATTTTAATTGTGTATAATCACTACATTACGAATTCTCATTCCCTTCCATGAGAATTGATGTATTGGAACAAAGTAGCTGATTGTTTTAATCTTGTTTTTGTTGTGACAATTGAAGGTGGGGATTAAATCTACCTCAAGGTTATCATACTCGTTTTTTC

Protein sequence

I*K*YTRITLKPPLPRRPSSSRPPNVTVARTGLSALVRSRVNHSLN*RDLVVGSWILEFLSNNSSIHS*SSDQALVRALKN*SKSMPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGKELLADR*TYAVPLRIVHCI*VPHTHLFRIYCPPIADCWKRHRTGPLNSQAILIDMS*SNYLLFCTLFLLISALLEHPAFQ*YR*FTLSS*VFHMTF*QNRAEN**F*LCIITTLRILIPFHEN*CIGTK*LIVLILFLL*QLKVGIKSTSRLSYSFFX

Homology

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1N0 (uncharacterized protein LOC103495817 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495817 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 123.2 bits (308), Expect = 1.8e-24
Identity = 58/61 (95.08%), Postives = 60/61 (98.36%), Query Frame = 0


Query: 86  MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGKELLAD 145
           MPHRTRPM ALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRR+RR+QQREAALGKELLAD
Sbjct: 1   MPHRTRPMAALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRERRQQQREAALGKELLAD 60

Query: 146 R 147
           R
Sbjct: 61  R 61

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DM83 (uncharacterized protein LOC111021335 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021335 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 113.2 bits (282), Expect = 1.8e-21
Identity = 52/55 (94.55%), Postives = 55/55 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 86  MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGK 141
           MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRR+RR+QQREAA+GK
Sbjct: 1   MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRERRQQQREAAMGK 55

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EUP9 (uncharacterized protein LOC111438118 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111438118 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 111.7 bits (278), Expect = 5.3e-21
Identity = 51/55 (92.73%), Postives = 54/55 (98.18%), Query Frame = 0


Query: 86  MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGK 141
           MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRR+ RR+QREAA+GK
Sbjct: 1   MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRREHRREQREAAIGK 55

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KYV7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G431930 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 110.5 bits (275), Expect = 1.2e-20
Identity = 53/54 (98.15%), Postives = 54/54 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 93  MTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGKELLADR 147
           MTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRR+RRRQQREAALGKELLADR
Sbjct: 1   MTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRERRRQQREAALGKELLADR 54

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HS71 (uncharacterized protein LOC111466268 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466268 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 108.6 bits (270), Expect = 4.5e-20
Identity = 50/55 (90.91%), Postives = 53/55 (96.36%), Query Frame = 0


Query: 86  MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGK 141
           MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRR+  R+QREAA+GK
Sbjct: 1   MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRREHCREQREAAIGK 55

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. NCBI nr
Match: XP_031740521.1 (uncharacterized protein LOC101220293 [Cucumis sativus] >XP_031740522.1 uncharacterized protein LOC101220293 [Cucumis sativus] >KAE8649679.1 hypothetical protein Csa_012121 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 127 bits (318), Expect = 2.69e-33
Identity = 60/61 (98.36%), Postives = 61/61 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 86  MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGKELLAD 145
           MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRR+RRRQQREAALGKELLAD
Sbjct: 1   MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRERRRQQREAALGKELLAD 60

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. NCBI nr
Match: XP_038882345.1 (uncharacterized protein LOC120073600 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 124 bits (310), Expect = 4.20e-32
Identity = 58/61 (95.08%), Postives = 60/61 (98.36%), Query Frame = 0


Query: 86  MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGKELLAD 145
           MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRR+RRRQQREAA GKELL+D
Sbjct: 1   MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRERRRQQREAATGKELLSD 60

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. NCBI nr
Match: XP_008455709.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495817 [Cucumis melo] >XP_008455710.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495817 [Cucumis melo] >XP_008455711.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495817 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 123 bits (309), Expect = 5.92e-32
Identity = 58/61 (95.08%), Postives = 60/61 (98.36%), Query Frame = 0


Query: 86  MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGKELLAD 145
           MPHRTRPM ALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRR+RR+QQREAALGKELLAD
Sbjct: 1   MPHRTRPMAALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRERRQQQREAALGKELLAD 60

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. NCBI nr
Match: XP_022153946.1 (uncharacterized protein LOC111021335 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 114 bits (284), Expect = 2.78e-28
Identity = 52/55 (94.55%), Postives = 55/55 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 86  MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGK 140
           MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRR+RR+QQREAA+GK
Sbjct: 1   MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRERRQQQREAAMGK 55

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. NCBI nr
Match: XP_022931821.1 (uncharacterized protein LOC111438118 [Cucurbita moschata] >XP_022931822.1 uncharacterized protein LOC111438118 [Cucurbita moschata] >XP_023517396.1 uncharacterized protein LOC111781173 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 112 bits (280), Expect = 1.06e-27
Identity = 51/55 (92.73%), Postives = 54/55 (98.18%), Query Frame = 0


Query: 86  MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAALGK 140
           MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRR+ RR+QREAA+GK
Sbjct: 1   MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRREHRREQREAAIGK 55

[Close]

BLAST of Chy8G148690 vs. TAIR 10
Match: AT5G09225.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 2.5e-18
Identity = 41/52 (78.85%), Postives = 46/52 (88.46%), Query Frame = 0


Query: 86  MPHRTRPMTALLVFTGLNVVLVSTITPVYDFVCFHPYWERRRDRRRQQREAA 138
           MPHRTRP+  LL+FTG+N VLV TITPVYDFVCF PYWERRR+R RQ+REAA
Sbjct: 1   MPHRTRPLKGLLLFTGINFVLVQTITPVYDFVCFLPYWERRRERIRQEREAA 52

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Chy8G148690 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Chy8G148690 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A1S3C1N0	1.8e-24	95.08	uncharacterized protein LOC103495817 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495817 PE=...	[more]
A0A6J1DM83	1.8e-21	94.55	uncharacterized protein LOC111021335 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021...	[more]
A0A6J1EUP9	5.3e-21	92.73	uncharacterized protein LOC111438118 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114381...	[more]
A0A0A0KYV7	1.2e-20	98.15	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G431930 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1HS71	4.5e-20	90.91	uncharacterized protein LOC111466268 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466268...	[more]

BLAST of Chy8G148690 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_031740521.1	2.69e-33	98.36	uncharacterized protein LOC101220293 [Cucumis sativus] >XP_031740522.1 uncharact...	[more]
XP_038882345.1	4.20e-32	95.08	uncharacterized protein LOC120073600 [Benincasa hispida]	[more]
XP_008455709.1	5.92e-32	95.08	PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495817 [Cucumis melo] >XP_008455710.1 P...	[more]
XP_022153946.1	2.78e-28	94.55	uncharacterized protein LOC111021335 [Momordica charantia]	[more]
XP_022931821.1	1.06e-27	92.73	uncharacterized protein LOC111438118 [Cucurbita moschata] >XP_022931822.1 unchar...	[more]

BLAST of Chy8G148690 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT5G09225.1	2.5e-18	78.85	unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biologic...	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36392	TRANSMEMBRANE PROTEIN	coord: 81..134

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy8G148690.1	Chy8G148690.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
cellular_component	GO:0016021	integral component of membrane