Chy8G147010 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy8G147010
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH08: 2199701 .. 2252948 (-)
RNA-Seq ExpressionChy8G147010
SyntenyChy8G147010
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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GAACCATTCTCAAATAAAAGATTATGACTGTGAGATATTATATCATCCAGGTAAAGAGAATGTGAAATTAACAATGACCAAATTTCAAATTGAAGGATATGTACTGAAGTAAAAATTAGTAAGTACAAACGAGGTGATCCTGAATCGTTCATTGGGACTTAAGGAGCAAGATGTAGATTAACTTACTGATTATGATACACTAACTAGGAAATCCATGTCGGGATCAGTGTTCACCCTAAATGGGGGAGTTGTGGTATGGCGTAGCATCAAGCAAAAATGCATTGTAGACTCTACTATGGAGGCTGAGTATGTCGCTGCTTGTGAAGCAGCAAAAGAAGCAATTTGGTTTAGGAAGTTTCTGCATGATTTAGAAGTTGTTCCAAACATGAACATGTCCATCACTTTATATTGTGACAACAGTAAGGCAGTAGAAAATTTTAAGGAGCCTCGTAGCCAAAAACGAGGAAAACACATAGAAAGGAAGTATCATCTGATACGGAGGATTGGGCAACGAGGTGATGTGATCATCACTAAGATCGCTTCGGAGCACAACATTGTTGATCCATTTAGAAAGACTCTACGACTAAAGTGTTCGAGGGTCATCTAGAAAGTCTAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTAACACCATTGATACGGCTCACTTTGTATTTGGTACAAACGCAATGATCCAACGCGTTCGTGTAGTTGACATGCAAGACCATAAACAAGTTACTCGTGAAGGACTAAGTTACTGTTATTGCTTTTATCCCTTCAGCACCATCACATTGAAAATTTCTTTCCTTCTTCT

Coding sequence (CDS)

GAACCATTCTCAAATAAAAGATTATGACTGTGAGATATTATATCATCCAGGTAAAGAGAATGTGAAATTAACAATGACCAAATTTCAAATTGAAGGATATGTACTGAAGTAAAAATTAGTAAGTACAAACGAGGTGATCCTGAATCGTTCATTGGGACTTAAGGAGCAAGATGTAGATTAACTTACTGATTATGATACACTAACTAGGAAATCCATGTCGGGATCAGTGTTCACCCTAAATGGGGGAGTTGTGGTATGGCGTAGCATCAAGCAAAAATGCATTGTAGACTCTACTATGGAGGCTGAGTATGTCGCTGCTTGTGAAGCAGCAAAAGAAGCAATTTGGTTTAGGAAGTTTCTGCATGATTTAGAAGTTGTTCCAAACATGAACATGTCCATCACTTTATATTGTGACAACAGTAAGGCAGTAGAAAATTTTAAGGAGCCTCGTAGCCAAAAACGAGGAAAACACATAGAAAGGAAGTATCATCTGATACGGAGGATTGGGCAACGAGGTGATGTGATCATCACTAAGATCGCTTCGGAGCACAACATTGTTGATCCATTTAGAAAGACTCTACGACTAAAGTGTTCGAGGGTCATCTAGAAAGTCTAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTAACACCATTGATACGGCTCACTTTGTATTTGGTACAAACGCAATGATCCAACGCGTTCGTGTAGTTGACATGCAAGACCATAAACAAGTTACTCGTGAAGGACTAAGTTACTGTTATTGCTTTTATCCCTTCAGCACCATCACATTGAAAATTTCTTTCCTTCTTCT

Protein sequence

EPFSNKRL*L*DIISSR*RECEINNDQISN*RICTEVKISKYKRGDPESFIGT*GARCRLTY*L*YTN*EIHVGISVHPKWGSCGMA*HQAKMHCRLYYGG*VCRCL*SSKRSNLV*EVSA*FRSCSKHEHVHHFIL*QQ*GSRKF*GAS*PKTRKTHRKEVSSDTEDWATR*CDHH*DRFGAQHC*SI*KDSTTKVFEGHLESLGWVPYPGNTIDTAHFVFGTNAMIQRVRVVDMQDHKQVTREGLSYCYCFYPFSTITLKISFLLX
Homology
[Close]
BLAST of Chy8G147010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DQQ9 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1567G00160 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 5.7e-06
Identity = 26/35 (74.29%), Postives = 29/35 (82.86%), Query Frame = 0 

Query: 152 PKTRKTHRKEVSSDTEDWATR*CDHH*DRFGAQHC 187
           P+TR+THR+EVS DT D A R CDHH DRFGAQHC
Sbjct: 189 PQTRETHREEVSPDTGDCAMRGCDHHQDRFGAQHC 223

[Close]
BLAST of Chy8G147010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7THP4 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold108G00850 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 1.8e-04
Identity = 24/35 (68.57%), Postives = 28/35 (80.00%), Query Frame = 0 

Query: 152 PKTRKTHRKEVSSDTEDWATR*CDHH*DRFGAQHC 187
           P+TR+THR+EVS +T D A R CD H DRFGAQHC
Sbjct: 307 PQTRETHREEVSPNTGDCAARGCDSHQDRFGAQHC 341

[Close]
BLAST of Chy8G147010 vs. NCBI nr
Match: KAA0067161.1 (gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK26011.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 4.43e-07
Identity = 26/35 (74.29%), Postives = 29/35 (82.86%), Query Frame = 0 

Query: 152 PKTRKTHRKEVSSDTEDWATR*CDHH*DRFGAQHC 186
           P+TR+THR+EVS DT D A R CDHH DRFGAQHC
Sbjct: 189 PQTRETHREEVSPDTGDCAMRGCDHHQDRFGAQHC 223

[Close]
BLAST of Chy8G147010 vs. NCBI nr
Match: KAA0042864.1 (gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK05269.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 3.75e-05
Identity = 26/45 (57.78%), Postives = 31/45 (68.89%), Query Frame = 0 

Query: 142 GSRKF*GAS*PKTRKTHRKEVSSDTEDWATR*CDHH*DRFGAQHC 186
            S +F     P+TR+THR+EVS +T D A R CD H DRFGAQHC
Sbjct: 297 SSSQFQRTLQPQTRETHREEVSPNTGDCAARGCDSHQDRFGAQHC 341

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy8G147010 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy8G147010 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3DQQ95.7e-0674.29Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1567G001... [more]
A0A5A7THP41.8e-0468.57Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold108G0085... [more]
BLAST of Chy8G147010 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0067161.14.43e-0774.29gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK26011.1 gag/pol protein [Cucumis ... [more]
KAA0042864.13.75e-0557.78gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK05269.1 gag/pol protein [Cucumis ... [more]
BLAST of Chy8G147010 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy8G147010.1Chy8G147010.1mRNA