Chy8G147010 (gene) Cucumber (hystrix) v1
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Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAACCAGTCTGCGCCAGTGAGTTCCCCAGTACCAGCAGCTCCACTTGCGTTTGTAGACCCCTCTGTGCAGGGATCGGTCGTACAGTCGCCACAGATATTACCAAATCAGCTGTCTGCAGAGGCGAAACACTTGAGGGACTTTAGGAAATACGACCCTCAGACTTTTGATGGATCACTGGAAGATCCTACCAAGGCGGAGTTGTGGTTGTCCTCTGTGGAGACCATTTTTAGTTATATGAGATGCCCAGAAGAGCACAAGGTTCAGTGTGCGGTCTTTCTCCTTAGGGATAGAGGTATTATCCGGTGGAGGTCCACACTGCGTATGTTGGGTGGAAAGTTAGACCAGATCACGTGGGACCAGTTTAGAGATTGCTTCTATACCAAGTTTTTCTCGACTAACCTTAGGGATGTTAAAAGCCAGGAATTTTTGGAATTGAAGCAAGGACACATGACAGTTGAGGAGTACGATCAGGAGTTCGACATGTTGTCGTGCTTCGCTCCTGAGCTTGTTGGTAATGAGCAGGCCAGAGCTGAGAGGTTTGTTAGAGGATTGAGAGATGAGATCAGAGGCTTTGTGCGAGCACTAAAGCCTTCCACTCAGGCTAAAGCACTGCGTCTGGCAGTGGATGTGAGTATTGGAAAGGACGAGGTTCAGCCAAAGAGTGTTGACAAGGGAACCTCATTTAGTCAGAAGAGAAAGGTGGAGCAGAAGTTCATCGAAGTTCCTCAGAGGAACATGAGGTCAGGTGGTAATTTCCGCCGTTTCCAGCAGAGTCCCTTTGGGGCAGGTGAAACTGCCAGAGAGAAACCGTCGTGCAACACTTGTGGGAAGCGCCACCTGGGTCGCTGTTTATTTGGGACAAGGATTTGCTTCAAGTGTAGGCAAGAGGGGCATACGGCTGATCGTTGTCCTTTGAAGCCTACTGAGTTGGGGCAGAGCAGTCAGGGAGCGAGAGCGCCACAGCAGGGCAGAGTTTTTGCTACTAACAGATCTGAGGCTGAAAGGGCTGGCACAGTTGTTACAGGTACGCTACCAGTGTTGGGGCACTTTGCCTTAACTTTGTTCGATTCTGGTTCCTCTCACTCTTTTATATCGTCGATATTTGTAACTCATGCATGTTTAGAAGTGGAGCCCCTGGATTATGTTTTATCAGTGTCTACACCATCTGAGGAAATTATGTTGTCAAAGGAAAAGATTAAAGCAAGCCAAATTGAGTTAGCTGGTCGTGTGTTGGGTGTAACCTTGTTAGTATTGGATATGCATGATTTCGACGTAATTTTAGGCATGGATTGGTTGGCTGCCAATCATGCCAGTATTGATTGTTCTCGTAAGGAGGTAGTGTTTAGACCTCCTACCGAACCTATTTTTAAGTTTAAAGGGGTAGGGACCGTAGTCATACCTAAAGTAATTTTGGCTATGAAGGCCAGTAAATTACTCAACCAGGGTACCTGAAGTATCTTGGCCAGTGTGGTGGATACTAGGGAAGTTGAGATTTCTTTGACCTCAGAACCGGTAGTAAGAGAATATCCTGATGTATTTCCAGAAGAGCTTCCAGGACTTTCGCCTCACAGGGAGATTGATTTTGCTATTGAGTTGGAGCCAGATACCGCTCCCATCTCTAGAGCCCCTTACAGGATGGCTCCTGCTGAATTGAAAGAATTGAAGGTACAGTTACAAGAATTGCTTGACAAAGGTTTTATTCGACCTAGCGTATCGCCTTGGGGTGCACCCGTACTGTTTGTGAAGAAGAAGGATGGATTGATGCGTCTTTGTATAGATTACAGAGAACTTAATAAGGTGACAGTCAAGAATAGGTATCCACTGCCCAGAATTGATGATTTGTTTGATCAGTTGCAAGGAGCCACTGTATTCTCTAAGATTGATTTACGCTCGGGTTACCATCAGTTGAGGATTAAAGACGGTGATATTCCTAAGACTGCTTTTCGTTCGAGGTATGGACATTATGAATTCATTGTAATGTCTTTTGGATTGACAAATGCACCTGCTGTATTTATGGACCTGATGAACAGAGTGTTTAAGGATTTCTTAGACACTTTTGTAATAGTCTTCATTGATGACATTTTAGTTTATTCCAAGACCGAGGCTGAACATGAGGAACATTTGCATAGAGTTTTAGAGACCCTCCGAGCGAATAAACTTTATGCTAAGTTCTCAAAGTGTGAATTCTGGTTGAAGCAGGTGGCTTTCCTTGGTCACGTGGTTTCTAGTGAGGGAGTTTCTGTGGATCCTGCAAAGATTGAGGCTGTTACCAGTTGGTCTCGACCCTCTACTGTCAGGGAGATTCGTAGTTTTCTGGGCTTAGCAGGTTATTACTGAAGGTTCGTTGCAAATTTTTCTCGTATAGCTACTCCCTTGACCCAGTTGACCAGGAAGGGGACTCCTTTTGTTTGGAGCCCAGCTTGTGAGGATAGTTTTCAGAACCTTAAGCAGAGGTTAGTTACTGCACCGGTCCTCACAATACCAGATGGATATGGAAATTTTGTGATTTACAGTGATGCTTCTAAGAAAGGGTTGGGATGTGTTTTGATGCAGCAGGGTAAGGTGGTTGCATATGCCTCTCGTCAGTTGAAAAGTCATGAGCAGAACTACCCTACACATGATTTAGAGTTGGCAGCAGTAGTGTTTGCACTGAAATCTGGAGACATTATTTGTACGGTGAAAAGATACAAATCTTTACTGACCATAAGAGCCTGAAATACTTCTTCACCCAGAAGGAGTTAAATATGAGACAGCGAAGGTGGCTCGAGTTAGTAAAAGATTATGACTGTGAGATATTATATCATCCAGGTAAAGAGAATGTGGTAGCTGATGCTCTTAGTAGGAAAGTATCACATTCAGCAGGGCTTATTACTAGTCAGGTACCGATACATCGAGACCTTGAGAGAGCTGAGATTGCAGTATCTGTAGGGGCAATTGCCTCACAGTTAGCTCAGTTAACAGTGCAACCAACTCTGAGGCAGAAGATTATTGATGCTCAGAATAGTGATCCCTATTTGGAGGAGAGACGTCGCCTCGTAGGGACAGGACAGACTGATGAGTTCTCCATATCCTCTGATGGTGGACTGTTGTTTGAGAGACGTCTGTGTGTGCCAGCAGACACTGCAGTCAAGACCGATTTACTTAATGAGGCCCATAGTTCTCCATTTTCCATGCATCCTGGTAGTACGAAAATGTATCAGGATTTGAGGCGAGTGTATTGGTGGCGTAATATGAAGAGGGAAGTGGCCGAGTTTGTTAGTAGGTGCTTGGTGTGCCAACAGGTTAAGGCACCTAGACAGAAACCAGCAGGTTTGTTGCAACCTTTGAGTGTGCCAGAGTGGAAGTGGGAGAACGTGTCGATGGACTTTATTACAGGACTGCCTAGAACCCTGAAGGGTTACACAGTGATTTGGGTTGTTGTAGACAGACTTACGAAGTCGGCACATTTTGTTCCAGGAAAGTCCACTTATACTGCTAGTAAGTGAGCACAGTTATATTTAATTGAGATTGTAAGACTGCATGGAGTGCCTGTGTCTATTGTTTCTGATAGGGATGCACGTTTTACTTCCAAGTTTTGGAAGGGACTTCAGACTGCCATGGGCACGAGGTTAGATTTCAGTACGGCTTTTCATCCACAGACTGATGGTCAAACTGAACGTTTGAACCAAATTTTAGAGGATATGCTACGAGCTTGTGTTCTAGAGTTTCCAGGTAGTTGGGACTCTCACTTGCATTTGATGGAGTTTGCTTATAATAACAGTTTTCAGGCTACCATCGGCATGGCACCGTTTGAAGCTTTGTATGGTAAATGTTGTAGGACCCCTGTTTGTTGGAATGAGGTTGGTGAACAGCGATTGATGGGTCCTGAGTTGGTTCAGTCTACTAATGAGGCTATTCAGAAGATTAGAGCACGTATGCAAACAGCGCAGAGTAGACAGAAAACCTATGCTGATGTGAGACGAAAAGATCTTGAGTTTGATGTGGGAGATAAGGTGTTCTTGAAGGTAGCACCTATGAAGGGTGTTATGCGTTTTGAAAAGAAGGGGAAGTTAAGTCCTCGTTTTGTGGGACCGTTTGAGATTTTAGAGAGAATTGGTATTGTGGCGTATCGTTTGGCATTGCCACCATCTCTCTCTGCAGTTCATAATGTTTTTCATGTTTCGATGTTGAGGAAGTACGTGGCAAATCCATCTCATGTGGTGGACTATGAACCACTAGAGATTGACGAGAATTTGAGTTATGTGGAGCAACCAGTTGAGATTCTGGCTAGAGATGTGAAGATGCTTCGTAATAGAGGAATTTCTTTAGTGAAGGTGTTGTGGCGCAATCACCGAGTTGAAGAGGCAACCTGGGAGAAAGAAGATGATATGAGGGCTAGTTACCCAGAATTATTCCGGGATTAGAACTTTCGAGGACGAAAGTTTATTAAGGAGGGAAGAATGTAACACCCTTAAAAAAAAATATATATTATTAATTATTAAATATTATTATTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAATAAAACAAAAAAAAGAAAAGGGGCAACCCCCACTCTCTCACGCGACAGCCCCCCTCATCTCTTTTTCTTCTCTTCCTCTTTCGTTTGCCCTAGCAGCCGCCATCCCCTCTCCTTTTCCGACGAAGCTCGAGCCGCGTCACCACACCTCCGCCGTCCTTTCCAGCCGCACGCCGACGCCCAGTTTTCCGTCGTACTGAGGTCGGAACCGAACAGCGTCGTGGATCTGGGCTCGCCGTCTTTCGGGTTCGCGAAGCCGCACCACCTAGATCTTCACGTCCTGCCGCCTGCAGCAGTCGCGTCTCTGCTTCAAGCGTTGAGGGACGCTGCTGACCGAGCTGTTTCCTTGTCCTAGCCGCCGCCGCCAACTCCCTTCCACGACCGCCGGCGCGTTCGTCTCCCTTAGCGGACGCCGACCGCCTAAACTACACTCCGACCGCGTCTGTCTCAAGTCC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GAACCATTCTCAAATAAAAGATTATGACTGTGAGATATTATATCATCCAGGTAAAGAGAATGTGAAATTAACAATGACCAAATTTCAAATTGAAGGATATGTACTGAAGTAAAAATTAGTAAGTACAAACGAGGTGATCCTGAATCGTTCATTGGGACTTAAGGAGCAAGATGTAGATTAACTTACTGATTATGATACACTAACTAGGAAATCCATGTCGGGATCAGTGTTCACCCTAAATGGGGGAGTTGTGGTATGGCGTAGCATCAAGCAAAAATGCATTGTAGACTCTACTATGGAGGCTGAGTATGTCGCTGCTTGTGAAGCAGCAAAAGAAGCAATTTGGTTTAGGAAGTTTCTGCATGATTTAGAAGTTGTTCCAAACATGAACATGTCCATCACTTTATATTGTGACAACAGTAAGGCAGTAGAAAATTTTAAGGAGCCTCGTAGCCAAAAACGAGGAAAACACATAGAAAGGAAGTATCATCTGATACGGAGGATTGGGCAACGAGGTGATGTGATCATCACTAAGATCGCTTCGGAGCACAACATTGTTGATCCATTTAGAAAGACTCTACGACTAAAGTGTTCGAGGGTCATCTAGAAAGTCTAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTAACACCATTGATACGGCTCACTTTGTATTTGGTACAAACGCAATGATCCAACGCGTTCGTGTAGTTGACATGCAAGACCATAAACAAGTTACTCGTGAAGGACTAAGTTACTGTTATTGCTTTTATCCCTTCAGCACCATCACATTGAAAATTTCTTTCCTTCTTCT EPFSNKRL*L*DIISSR*RECEINNDQISN*RICTEVKISKYKRGDPESFIGT*GARCRLTY*L*YTN*EIHVGISVHPKWGSCGMA*HQAKMHCRLYYGG*VCRCL*SSKRSNLV*EVSA*FRSCSKHEHVHHFIL*QQ*GSRKF*GAS*PKTRKTHRKEVSSDTEDWATR*CDHH*DRFGAQHC*SI*KDSTTKVFEGHLESLGWVPYPGNTIDTAHFVFGTNAMIQRVRVVDMQDHKQVTREGLSYCYCFYPFSTITLKISFLLX Homology
BLAST of Chy8G147010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DQQ9 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1567G00160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 5.7e-06 Identity = 26/35 (74.29%), Postives = 29/35 (82.86%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G147010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7THP4 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold108G00850 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 1.8e-04 Identity = 24/35 (68.57%), Postives = 28/35 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G147010 vs. NCBI nr
Match: KAA0067161.1 (gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK26011.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 4.43e-07 Identity = 26/35 (74.29%), Postives = 29/35 (82.86%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G147010 vs. NCBI nr
Match: KAA0042864.1 (gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK05269.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 3.75e-05 Identity = 26/45 (57.78%), Postives = 31/45 (68.89%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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