
Chy8G146980 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCATCAGAGGGATCTGATTCAAAGGTACGCTTTCTTTTAACCCCTCGTCCCAGATAAAACGTTTCAGGGTATTATGAGATTTTCGTGTAAATAAAGTGTTTAGAAACTAGTGGATTGTAAAGATGACTACGTGCAGTGAGGGCACAGTTGTTTAAAGGAGAAGATAGATCAATGGGGCCATGTTTGTGAGGTCGGCATAGGTGGAGTCCATTTCTTATATTAAGCTAAAAAATGTATTTTTTTTGCCATGTAACTCTGTTCCATTTTCTTTCATTTTTCTTTGAATCAACAAGAGGAGAGAGGTTGCAGTTTCTCAAGTGATTGTGTGAAGACTCTAGGTCTTACTTACGACAGCATTGATTCAAACTACAATTGGCAAGCAAACAGCTAACTGGCCGTATTCGAGAGCACCGGACCTCTCCCTATATAACTATTGTTCGATTGCAAAATATAAAAAAAAACATAAAGCAAACACAAGAGACGAACGTACCAATAGTCTCCGCCACATGCAAGCCCAACCAAACACAATTCAAATAAACCTCCAGCCCATTAACGGCGGGGCCCACTCCCATTTCTCTTTCTACCCCTTCTATAACGAGTTGTCGAGTAAGGTGATTTATAGGGTGGAGTAAAAAACCTATAGGGGTATTGTGAAAGTAGTTTGTTGGTGTAAACGAGACAATACATGGCGGTAAACGAGAAAAGTTTTGGTGTAGCTGACAAAGAGCATAGAGGGTAGGAGAAAGAAAGGGGCGTTTAGGTAGTTATTGAATGGTTCGGCAGTTGAACAAGGGTGACCCAACACTCAAAACACATGGAAGTACATATGCGTGAGTAGAGGAAGGAGGTAGTGAGATCCTGATATTTGGTGGGAGTGAATAGGATAGTTGAAATTTTCTGACCATTTTAGACCATGAAGATTCTTCCTAGCTAATAAGGAGTTTGCTGTAACTTGTTATGTTTAGTACTACTCCAATTGGAATTATGGTTGTCCATGTTCAAGTTTCAATATAACTAAATATACTGTAACCCATTAACTTATGCTTTTGGATTTTTTTGGTGATTTAACATGGTATTAGACTAGGAGGCCATTATTCCTGTAATGTCATTTCGTCTCCAATTAATATTGATTTCTGCTTGCTGGGTCTTCTATACAATTTCAATCCCACAAGTTAGGGAGAGTGTTAAAGTATTTGTTTCTAGAACCGAAGTCCCTTGAACTGTTAATCACGGTCTAGTGACACGGTAGTGGTTCATCCACCGGACTTGGGTTCTTGTCTCCTTAGAACTCAAGGACACAAATGTACAACCTATAGAATAGATCCTGTTCAAGTAAGGTCATGAAGAATGTTCAAGTATTGATACCATAACCCATTAACTCAAGCTTTTCCATTAACTCAAGCTTTGGAGTTTATTGGTGATTTACACTCCACCTGATTTATTATGTATTGTAGAACCCTTAATTTTTGTGGTATTCTAACAAATCAAGAGTTTCAAGGGAAAGTAAGAGCATTCTTCAAACAAAATTCAATTCTACTAGATAATAATTCATTTTACAACGCTTCGGTATTTCCCCTTTGAGAATTTATGATTAAGGTTAAAATATTTGGTAAGTTTATATAACATTATCTCTCCATTTCTTTTTGCAGTTATCTTTCTAAGCATTTAATGTCGATTGGAGTCGTTTTTATGAGTCCTAGGATCGCTTTTCTTTTTAAATTTGTCTTGACTATAGTGAAGAATAAGTTGTATATATACTAAAATTGGGAGAGATCATTGCACTTGAAACGGCATAAGACCAAACAAATTTGAAGGTAAAACAGAGTACACTAACCAGTTTGAAGAGAAAAGCTACAAGTACGTTGAGAGATGCTCAAGAAAACAGCTTTACTTTTCAAAAAGAGTGCCAGTAAGTTCTGATATTTTAGCTACAACTTGGTCATAGTCAGCCTTGAGTTTCTATTCTTTAGTTCATCCAAGCTTCCCTTTGTTTGGCTTAGTTTGTATTAGCACACAACATGTTGGCCTCTTAGTCTTCATCCACCTGACACTGGCAAGATCTTTCTTGGAGGGAACATATATCTGTTTCTTCACATAAGATTGGAACATGAGTGATCACATCGGTGGGGGAAATGTTTCTAGCTATTATACAAAATCCTTTTTGGCCGCGCCTTATGCTTTTGACTACCTCCTTTACCCCTCGCCTCAAGCACTTGTACCAAGTAGCTTTGCGAACAAGCTTGAGGGTGTGCTTGCTGAGCTTTTTGCCGACAAGGGTTTTGGCAATCGGAGCAAGAGCCAACAACTTCTTCTTCTTCTTCTTTTCTTTGTCCTTTTGATGCAAGTTCCCTGCCTTGCTATCACTGCCCGTTGCTCATGGTTGACTAAGGATTGTTGTTGGATTGTCAATTATCCTTGATGATTTAGGTTTTAGCTATGCTTTATTTGATGGGTGTGCTTTGGTTGTCATCAATTTCCTCTTGATGGTTGGGGGCTTTTGTTGCAACTCTGGGAGAAGGAATGACTGTGTCTAGGATCCTAGTCCTTCTAAAGGGTTCTCACATAAATCTTGTTTTTCTTGCCTTGTAGACCCTTTTCCTCTAAGAAAGGATTAGAGTATCGATGTCGATATCAATATTAGAATTTTAGGTATCCGAATATATTGATACAATGTCAATTTTGACGAATATTTCTATAAATAAAAAAAATAAAAAAATTAGTTTAATTAATATTTGAGTTCCTTTTACTTCCAAACTACAAGTTTAAGACCTTGTTATTAATATTCATATTCATATGAAGGTTTAAGGATGGTATATATATATGTACACACACATATATTAATGTTTTATGAGTATTTATAAAAAATATCAGAAATATTGATCAATCCTTGATATTGATCCCTAATTTTACGAGAACAAATATATCATCATAGTCATGGATATATCGACATACCAATGAATATTTCAATCCTCACCCTTCAGTGAATTGGTCTTTTTCTAATCGTGGAAGGTGAAAATTTTGAAGAAGGTTAAATTTTCTCTAGCAGGTTCTCCATAGAAGAATTAATATCATTGGTAGGGGTTTGAGGAGGGTTTCCAACTTGGTGGTGCCTTTGTGTTGCATCCTCTCTGCAGGAGGGTGGTGTAGGACCTAGACTATATTCTCTGGTCATGCAGTTATGCACTTGCACATTGGAGCATGTTTTATTTTTGGTGCGAGTTTGGCCAGACATAGAGGTTTTAAAGATATGATTGATGAGTTTTTTCTTCACCACACATTTCATGAGAAGGGAAGGTTTTCTGCGGCATGTTGGAGTGTGCATTATTTCAGTAGAATTTTTAGAGGGGTTGGGAGGCTCTGAGTGAGGTGTGGTTATGTGTTAGGTTCAATGTTTCTTTATGGGCTTTTGGGACTAATTTTTTTAAAAGTATATCCTCTAGGTTTTATTTTGTTAGATTCGAGGTCACTTATGTAGGTTGACTCCTTTTTTTGTGCCCATATATTTTTTCATTTTTTCATAGAAAAAAGGATTGTTGTTGGGTTGATGCCTTTGGTAAAAAAAAAAAGGAAGAAGAGAGTCAACGATCTCTTTCCTTTGTCTTTCAGTGTGTACATTATGTGTTTAAGCTATTTATGCATGTAACTTCCATGTTCAGGATAAAACAACTAGCAATAAGCTTCTGGATGGTTTGAAGTACAATGTTGAAGTGGCAGAAAGTGTTGCTAATGAGGCGCAGGTGTAATATCATCTTTAGTTTTCACTTCATCTCTCATCCTTCTCCCTCTCTCAGTTAAGTTTAAATTTGAGTTTCCTCTTTGATGTAACTCTGAATCCAATTATTTCATGTAGCGTTTGCCAATATTGGAGGCAACACCATTATATGAGCAACTACTGACTGTGTATCCCACTGCTGTGAGTTTCTTACATATTTCAATATTTTTCTTTGTCTACCTTCACTTAGAGTAGCTGCATTTTGAAATGTGAACCTTGCTTATTGCTGGGTTTGTGAGCAGAAACGAGTAACTATTTCATGGGCTCAGCCCATGCTGGTTGGTAGTTCTTATGTTTTTAGCGTATCATATGATGATTATTCTTTTGACTGTCTGCATTCCTTTAAAAATTTAGGTGAAAACCAAGTTTTGAAAATTAGATAGATTTTAGATTTGTCAATTTCAATATCACTAGACGCAACTTAGAAAAAACCCCAATAACTAATATTGCTTCTACCAGAAATGGAATAATTATTTATGGAACATAGAATGGTGTACGGTGTACACTGTACACGGCAGACGGGCAAGGTTAGGTATCCTCTCCCTCTAAGAATCTATTATAATAATTTTTTCCAACTGGTTTGAATCAGGAAAGGGAAATGAATAGAGAAGGATCTGGACAAGGATTGCCATGTAGCAGGAATGAAATACGCTAATTCTTTAATTTATTTCTGCCTGCGTAGTCACTCAGCACGTTAGCATTTTTTCCATTGTGCTTGGTATGGTTGCATTTTGCTAGGTTGTAATTGCACAGAGAAGTTTAAGGATCATTGCATGATGATAGATGACAGAGAACGTTTCTTTGCAAATTCCACAGTCTGAGATAGAATTAACAATTAAGGATTGGTTCAAGAGGTTGTAGTTGCTTAAGGATATTTATAAACTTTACGAACTGGATAGAATCATGGAGTGGCGTTAATTTTACTAGTGTTGCCTGTTTGTCTCTAAGCTTGAATTGCAGAGGTGAGTATTATGGCTTAAAATTAAGAGGCTGCTTGGGAGAGGAAAGCTGCCCAGTTGAGATAAACATTGAATAAAGTAAGCTTGAACTCCTTGTTTAAGGAAACTCAAGCTGCTGCACTTCTTTCTGTAGAGAGAAGGACTTATGAACACGGCTTGTCTTTGTCATGGAATATCCTCCGATTTCTTTCAAACCACAGTTTGAAAAGGATAGCTTTTAGCAAATTTAACCATAACAGTCTTGGCTTCTTGGAGAGTAG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ATGGCATCAGAGGGATCTGATTCAAAGGATAAAACAACTAGCAATAAGCTTCTGGATGGTTTGAAGTACAATGTTGAAGTGGCAGAAAGTGTTGCTAATGAGGCGCAGCGTTTGCCAATATTGGAGGCAACACCATTATATGAGCAACTACTGACTGTGTATCCCACTGCTGCTAAGTATTGGAAGCAATATGTCGAGGCACACATGGTTGTAAATAATGACGATGCTACAAGACAAATATTTAGTCGGTGCTTATTGAACTGTCTACACATCCCTCTTTGGCGTTGCTATATCCGATTCATTAAGAAGGTGAATGAAAGGAAAGGAATGGAAGGCCAGGAGGAAACCAGAAAAGCTTTTGATTTTATGCTTAGCTATCTTGGTGTTGACATATCTTCTGGCCCTGTGTGGATGGAATACATTGCCTTCTTAAAGTCACTGCCGGCTCTTAGCTCGCAGGAGGAGTCACATCGAATGACTGCAGTGCGGAAGGTCTACCAGAAAGCTATTATCACTCCTACCCATCACATTGAGCAACTATGGAGGGACTATGAAAATTTTGAGAATTCTGTCAGCCGTCAACTGGCCAAGGGACTAGTATCTGAATATCAACCAAAATTTAATAGTGCTCGAGCTGTCTACAGAGAGAGGAAGAAATACGTTGATGAGATTGATTGCAACATGCTTGCTGTACCACCAACTGGCTCCCCAAAGGAAGAGCTGCAATGGATGTCATGGAGGAGGTTAATAGCGTTTGAGAAAGGAAATCCCCAGAGGATAGACAGTGCATCATCCAACAAACGAATTATATTCACATATGAACAGTGTCTTATGTACCTGTACCATTATCCTGATGTATGGTATGATTATGCTATGTGGCATGCAAGTAATGGATCAATAGATGCTGCAATTAAAGTATTTCAGCGAGCTTTGAAGGCTCTTCCTGACTCGGATATGCTAAAATATGCTTATGCCGAATTAGAAGAATCTCGTGGATCACTTCAGTCCGCAAAGAAAATATATGAAAGCCTTTTGAGCGATGGTGTTAATGCGACCGCACTAGCTCATATTCAATTTATCCGTTTTCTTAGAAGAAATGAAGGAGTTGAGGCTGCTCGCAAGCATTTCTTGGATGCTCGCAAATCCCCGAATTGCACGTATCATGTTTATGTTGCTTATGCTATGATGGCCTTTTGTCTCGACAAGGATCCCAAGATTGCACATAATGTTTTTGAAGATGGAATGAAACGGTTTATGAATGAACCCACGTATATTCTTGAATATGCAGATTTCCTTGCTCGCTTGAATGATGACAGAAATATTCGAGCTTTATTTGAGCGTGCTTTGAGTACCTTGCTTCTAGAGGAGTCTGCTGAG MASEGSDSKDKTTSNKLLDGLKYNVEVAESVANEAQRLPILEATPLYEQLLTVYPTAAKYWKQYVEAHMVVNNDDATRQIFSRCLLNCLHIPLWRCYIRFIKKVNERKGMEGQEETRKAFDFMLSYLGVDISSGPVWMEYIAFLKSLPALSSQEESHRMTAVRKVYQKAIITPTHHIEQLWRDYENFENSVSRQLAKGLVSEYQPKFNSARAVYRERKKYVDEIDCNMLAVPPTGSPKEELQWMSWRRLIAFEKGNPQRIDSASSNKRIIFTYEQCLMYLYHYPDVWYDYAMWHASNGSIDAAIKVFQRALKALPDSDMLKYAYAELEESRGSLQSAKKIYESLLSDGVNATALAHIQFIRFLRRNEGVEAARKHFLDARKSPNCTYHVYVAYAMMAFCLDKDPKIAHNVFEDGMKRFMNEPTYILEYADFLARLNDDRNIRALFERALSTLLLEESAE Homology
BLAST of Chy8G146980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUP1 (Cleavage stimulation factor subunit 77 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSTF77 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 703.7 bits (1815), Expect = 1.3e-201 Identity = 324/438 (73.97%), Postives = 394/438 (89.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RDW9 (Cleavage stimulation factor subunit 3 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=CSTF3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 326.2 bits (835), Expect = 5.8e-88 Identity = 169/466 (36.27%), Postives = 272/466 (58.37%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q12996 (Cleavage stimulation factor subunit 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CSTF3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 325.1 bits (832), Expect = 1.3e-87 Identity = 169/466 (36.27%), Postives = 271/466 (58.15%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q99LI7 (Cleavage stimulation factor subunit 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cstf3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 325.1 bits (832), Expect = 1.3e-87 Identity = 169/466 (36.27%), Postives = 271/466 (58.15%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P25991 (Protein suppressor of forked OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=su(f) PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 294.3 bits (752), Expect = 2.4e-78 Identity = 162/478 (33.89%), Postives = 261/478 (54.60%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUB4 (cleavage stimulation factor subunit 77 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486027 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 916.8 bits (2368), Expect = 3.7e-263 Identity = 454/459 (98.91%), Postives = 456/459 (99.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B5G2 (cleavage stimulation factor subunit 77 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486027 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 916.8 bits (2368), Expect = 3.7e-263 Identity = 454/459 (98.91%), Postives = 456/459 (99.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C0Q9 (Cleavage stimulation factor subunit 77 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold83G00370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 901.4 bits (2328), Expect = 1.6e-258 Identity = 445/450 (98.89%), Postives = 447/450 (99.33%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLS0 (cleavage stimulation factor subunit 77 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021740 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 892.1 bits (2304), Expect = 9.7e-256 Identity = 435/459 (94.77%), Postives = 451/459 (98.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DNS9 (cleavage stimulation factor subunit 77 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021740 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 892.1 bits (2304), Expect = 9.7e-256 Identity = 435/459 (94.77%), Postives = 451/459 (98.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. NCBI nr
Match: XP_011653953.1 (cleavage stimulation factor subunit 77 [Cucumis sativus] >KGN55377.2 hypothetical protein Csa_012110 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 919 bits (2376), Expect = 0.0 Identity = 455/459 (99.13%), Postives = 457/459 (99.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. NCBI nr
Match: XP_008442046.1 (PREDICTED: cleavage stimulation factor subunit 77 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 918 bits (2372), Expect = 0.0 Identity = 454/459 (98.91%), Postives = 456/459 (99.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. NCBI nr
Match: XP_016899569.1 (PREDICTED: cleavage stimulation factor subunit 77 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 918 bits (2372), Expect = 0.0 Identity = 454/459 (98.91%), Postives = 456/459 (99.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. NCBI nr
Match: XP_038881157.1 (cleavage stimulation factor subunit 77 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 905 bits (2338), Expect = 0.0 Identity = 450/459 (98.04%), Postives = 453/459 (98.69%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. NCBI nr
Match: TYK05367.1 (cleavage stimulation factor subunit 77 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 902 bits (2332), Expect = 0.0 Identity = 445/450 (98.89%), Postives = 447/450 (99.33%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. TAIR 10
Match: AT1G17760.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 703.7 bits (1815), Expect = 9.4e-203 Identity = 324/438 (73.97%), Postives = 394/438 (89.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. TAIR 10
Match: AT5G45990.1 (crooked neck protein, putative / cell cycle protein, putative ) HSP 1 Score: 50.8 bits (120), Expect = 3.3e-06 Identity = 47/205 (22.93%), Postives = 89/205 (43.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. TAIR 10
Match: AT3G51110.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 47.8 bits (112), Expect = 2.8e-05 Identity = 30/93 (32.26%), Postives = 47/93 (50.54%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. TAIR 10
Match: AT5G41770.1 (crooked neck protein, putative / cell cycle protein, putative ) HSP 1 Score: 46.6 bits (109), Expect = 6.3e-05 Identity = 31/113 (27.43%), Postives = 53/113 (46.90%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146980 vs. TAIR 10
Match: AT3G13210.1 (crooked neck protein, putative / cell cycle protein, putative ) HSP 1 Score: 45.1 bits (105), Expect = 1.8e-04 Identity = 28/88 (31.82%), Postives = 45/88 (51.14%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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