Chy8G146150 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCACCGCCTTCAAGAAAATCACAGGATGGCTCAAAGTTCAACAAGCATTCCAAAAAGCCATTCAATTCGAAGAAGAAAACTAGTGAAACACCGAAACCCGAAACTGTATCGCTGCAGATTGAAGACGACGTTCCCGACTTTCCTAGAGGTGGGCTCTGACTCTGTCCTTTTGTTTGGTCTTTTAGAAAGTTGTTTTGTGTGAATATGAAATGTCCATTGTCATGCCTTTGGGGTTCTATTGGAAGCATGGTGAGTTTGGAAGTTAACTAAAATGAATATGAATTGTCCATTTGGTTGTGTTCAACCACGGATGCAATTTGAAGGAAATCCAACGAGTACAAAGTATGTAACTTGTTCACAATGATATTTAGGCCCTTAAATTTAACGGGTTTTATGTTTAGTACTTTTCTAATGTCTTTCACTAAGTTTCTTATCTAATACAAATGTTTCTCACCAAGTTACTTCCATTTACAGGGGGAGGAGGTTATATGAGCCAAAACAAAGGGGAAAAAGTACGTGCCGAAGGAGATAAGGAGTTTCAGAATGATGATCTGAAGATGACAACAAAAAGGGGAAAGAAGACAAGAAAGCATCCGTCAAATGGGGATGATTTGGAATCCTTGTTGAACAATGGTGTGGTGGGAAACCTTCCTAAATATGCAAATAAGATAACTTTAAAGGTATGGCCTGTAACAGTTCAGTTAGCTAAAGTCTTTATACACCATAGATTATCATAAGTTATAATTTGTGAGCTGATAACTTTGGTTTATTATTGCTTTTATCCTTATTTGTTTTTTCCTTTAATTATAGAACCACTAACTTATAGTTTTTAATAACTCTTGTCTATATGCATTTTGTAGTTGATATTATCTCTTTATGTTCAAACTTCAAAGAGGAGAATGTTCGTTAACCTCAATAATATTTTGAAAGTCTTTCCTTTTATTGCCAGTCTTAGAACGAATGAGTGAGAGCAATCAGCGAAGCAGTAATTTTGATCTCCATTGGTGCATGTTTAATGTTCATTCTTGATTATTTATTTTCAGAATATAAATCCAAGAATGAAATTTTGGGGAGTTGTTGCTGAAGTTAATAAGAAGGATCTTGTTATTAGTCTACCAGGGGGCTTACGCGGATTAGTGTCGGCTGCTGAAGCTTTTGATCCAATTTTGGAAAAAGAAGTTGAGGTAGGATTTGCACACATTTGTTGAGGAGTTGTATTGCATTAAAATGTTATTGTATGTTATGGTGTTGGACTGGATACTCAGCCATTCAAACCTTTTCTAACTAGGATACAGAGCATGATTTACTTCCTGTCATGTTCCATGTTGGGCAACTGGTTCCATGTGTTGTGCTACAAGTGGATGATGACAAGAAAGAATCGGGGAAGAGAAAGATCTGGCTTTCGTTACGTTTGTCTATATTGTACAAAGATTTCACATTGGACCTTCTTCAAGAAGGAATGGTATGTAAATTTTTTGATCCTTTTACTCGCATTTGCAGTATTTATATTTTCTAATTTTTAGCATGACAATATTGGTTACATGCCATGTGTTATGTATTTTAGTGCTTCAGAAATCACTTATGGTCTAAACTGAATCATGTTCATTGATATCGGATAGATCTCATCCTTTTCGTTTTCTATTCTATGATATCCATTAATGATATTGAATCATTCAATTGCTGGGCTTTTTTTCTGGTTTTAATCCTTTAGTGAATATGATTTTGTTATTGGTACATATAAATGAATCCTCTTTCAGGTTCTGACATCATATGTGAAAAGCATTGAAGATCATGGCTACATCCTTCATTTTGGTTTGACTTCCTTCACTGGGTTTTTGCCAAAGACCAAGCAATATGGTAAGAAGTCCTTGTGTGTGTGTGTTTTTGTTTTTTGAAGAAAAAGAGTCATTTTGTTGGTAAGATGATGCCTCAAAAGTGATTTGTTCATTATTATAGTAATACTGATCTCCCTATAGTTTTATGGAAAATACTTAATTATGTATTTGGGTGCTAACATAAGTAAATAACTCTATCCCATACTTTCATGATTCCAACCATCTACAGTGTGGTTAGCTCCTATTACATCGCCATCTTCTAGGTTCTCTAGAGCGTGAATGATAAGACGATAATAATTTTTGTGATAAAGAAACAAATATGTACCCGGTGTGAGAAAATGGGTTCTCCAGTTCACGAGGTAGAAGTGGTTATAATATAAGCAAGGAAGCAAGCAAAAAAAGGGCTAAATCCTATCCAAGAAATAAAAAGACTAGCAAGGGTACGTGGATAACATCACTATTGCTGGAAAACAATTCAGTCATCAAGATCATCCTTTTCCTAGTTGCCAAAAACCTAAGAAAATAGCTGGCATTTTCATCTGGAGATCTCGACAAGTCAAGCCTACATTTTTAATCAGGTTGCTTTCTTTTGAAGTACACAGATTCAAAATCTCTCCTTTATTTGCAATACTGATATCAAGCTCAAGGGAAGATAATGAGTCAGGCATGAAAAACTTTCAGCTTAGATAAAAGAATCTTTTCCAGCCTTCTCCATTATTCTTTAAGCAAACCAAGATTTAAGGACTGATTTCCATTTTCTGAGTTTGGAACTCATTAGAAAGCCAACCCATCCATAACGTCTAAAATGCATTAGCCAGAGAATTCTTAATTGAAAGACGATAATCCAAGTGATTTAGCTGACTATTACAACAACGGAATGAAGGTCCCAAAAGATCGCACTAGCTTCAAATAACAAAGTTCGTTTGAGGAGAGGACGAAGAGATTTTCCCCAACTGCAGCTAGAAGAGAACTTGGATGAAATTTTGTGAAGGAGAAATAGCAAAATTACTCATCTCCTGAGTTTGAGTACTCTGCTGATCCACCTTGCCTTGAAATAAAATATTGTAAGCTTTGCCAAAATAATCCTCTGTAGAAGGCTCCTCATCAAGTTGTAAAGACGATAAAAATGGAAAATCTTCTGCTTATGAGGCGTGTCCTTGAAGATAAAACCATTATCTTCATGCCAATTACAATAATCTGTATTATGAATACAACTGCTAAATTCCATTTGAACTAAGAATAGGAGCAGGATGAACTAAATGATGGAAAGTGTCTGGTTGAGAAGTTGAAAGATGACTAATTGGAGTGGGGCGAGGAAGGAAGAGGAGGGAGGAGAGAGGAGAGAGCATTACCTTTCTGTTTCAGATCTTGACCACTATTTAAGAAAAAGAAGTTTGAGATAAAAATTGAGTGTAATAGCTTAAAAGTGAATAATGAAAGTTTCACAATAAATTATCACATAGGTATAACTATCATGTTTTATATTTTAAGTTTCAGTATTGCATTTTTCATATGTATTTTTAACTATTATCAGCAGTCAGCACAGGTACTTTTTACAAATTGTCATTGTATTTTGCAGATCAATCTGAGAATGAAGTGCATGTTGGACAACTTCTTCACTGTGTTGTTAGAAGCATTGATAAAACTCGTAAAGTGGTTTATTTTAGTTCTGATCAAGATATTGTATCCAGGAGTGTGGTAATATCCATGTGTCCTTAGTTTTCAATTTTTAAAGAAAATATCCGTGTGCCTTTCATTTAACGTGATACTGGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTTTTACATTTTCAATTGTTTTTTTTTTTTTATTTTCTTCTGGTATTCTTTATCTAGGGGAGTTCCCCTTCCATCAAATGTTATGGCTCATCATTATTATGATTTTAATTCATAAATGTTACAGGCGAAGGATCTAAAAGGTATTTCAATTGACCTTCTCATCCCTGGCATGATGGTTAGCGCACGAGTACAATCAACCCTTGAAAATGGGATTTTGCTATCCTTTCTCACTTATTTTAATGGAACTGTGAGTTTTTATTCATCTACCTTACCATGTTTAAACATATCAATACTTTTAGGATCCTGTAGGAGGTTCTTTTGATTCATCCTTTAGAGAGAAATGATACAGTTTTTAGAGGGATCGACATATTGGGTGATGAAATTTGGGGGTGGCTAGGAAAGTTCTCTCTCTCCCTTTCTCTCCTCTTTTCTCTCTCCTCCTCCTCCTTCCCTTCAACTTCATTGCCGATTAGCCTCTTCTGTAGACACTGCTAGACGTCGTCAAGTACTTTGGCATCTCCCTAGCAACCATTCTTAACTCACAAAGATGGAAGTAAAAAGCTGCAAAATCGACAATTTTTTTTTTCTGCATTTGGCATGAAGATGAAGCTTTTCACATTGAAGATGTTGAAGCTAAAATTACTATGACTTTATCAATCTTTCAACTTAGATGGTTAATTGAAATGGTGAAAGATTTGAATAAGAAATCTGAAGAAGAGTATTTCTATAAGAAAGAAAAAGTTGAGTGTGGAAGGGTTGAAAGTTCCAAATTCAGAACCAAAAGTGGGTGGATTCTGAGATGCATTGCATGGCCTAGTATAGGAGGGAGATCTTTTATTCATATCCCCATTGGTGAAGATAAACAGGGATGGAAAAACTTTGGAAAAATGTTGGAAAACTTCAAGGACATCCATGAATACAAAATCTGGTTCTCCTCCCAAACCAAGTTCAACACCATTATGAAGCAGCCAATTAAAAGTATGAAAGGAAGCTATACGGAGAAAGCAGAATCAAATGAGGCATCCGAGATCTCCTTCTCCGATTCTGTATCACATAGTTCAAGCAAATATTGGGTGATTAAGAATTTGATAGTCTTCAAAGCAGATTTTGATAATCTTTGGGTTGTTTCAAAACTTTTCGAATTTGATGGTCCGGTAAAAATTAATGAAGCATTAGAACTCTTTTTCGATTCAAAAGTTATCATCAACCCTTTATTTGCAGACAATGCTCTGATTGAATTGGAACGTGGTTTGAAGGCATTCATTGAAAGTCCAGGCGAATGGCAATATTTTGGTGCTTTTCATTTTAAGTTTGAAACTGGAACAGTCTCAT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ATGGCACCGCCTTCAAGAAAATCACAGGATGGCTCAAAGTTCAACAAGCATTCCAAAAAGCCATTCAATTCGAAGAAGAAAACTAGTGAAACACCGAAACCCGAAACTGTATCGCTGCAGATTGAAGACGACGTTCCCGACTTTCCTAGAGGGGGAGGAGGTTATATGAGCCAAAACAAAGGGGAAAAAGTACGTGCCGAAGGAGATAAGGAGTTTCAGAATGATGATCTGAAGATGACAACAAAAAGGGGAAAGAAGACAAGAAAGCATCCGTCAAATGGGGATGATTTGGAATCCTTGTTGAACAATGGTGTGGTGGGAAACCTTCCTAAATATGCAAATAAGATAACTTTAAAGAATATAAATCCAAGAATGAAATTTTGGGGAGTTGTTGCTGAAGTTAATAAGAAGGATCTTGTTATTAGTCTACCAGGGGGCTTACGCGGATTAGTGTCGGCTGCTGAAGCTTTTGATCCAATTTTGGAAAAAGAAGTTGAGGATACAGAGCATGATTTACTTCCTGTCATGTTCCATGTTGGGCAACTGGTTCCATGTGTTGTGCTACAAGTGGATGATGACAAGAAAGAATCGGGGAAGAGAAAGATCTGGCTTTCGTTACGTTTGTCTATATTGTACAAAGATTTCACATTGGACCTTCTTCAAGAAGGAATGGTTCTGACATCATATGTGAAAAGCATTGAAGATCATGGCTACATCCTTCATTTTGGTTTGACTTCCTTCACTGGGTTTTTGCCAAAGACCAAGCAATATGATCAATCTGAGAATGAAGTGCATGTTGGACAACTTCTTCACTGTGTTGTTAGAAGCATTGATAAAACTCGTAAAGTGGTTTATTTTAGTTCTGATCAAGATATTGTATCCAGGAGTGTGGCGAAGGATCTAAAAGGTATTTCAATTGACCTTCTCATCCCTGGCATGATGGTTAGCGCACGAGTACAATCAACCCTTGAAAATGGGATTTTGCTATCCTTTCTCACTTATTTTAATGGAACTGTTGATATGTTTCACTTGCAAAATAGTTTTCATTCTTCAAATTGGAAAAATTTTTACAACCAGAACATGAAGATGAATGCTCGGATATTATTTATTGATCCTTCAACTAGAGCTGTGGGGTTGACATTGATTCCACATCTCGTTCGTAACAAGGCTGCACCTCCACACGTGAGAATTGGTGATATCTATGATTCTGCAAAAGTTGTTAGGGTTGATAGAGGTTCCGGCTTGCTTCTTGAAGTAGCTTCTTCTCCGGAGTCAACTCCAACATTTGTTAGTGTATCGGATATGGCTGAAGAGGTCGTGAAAAAGATTGGAAAGAAGTTTAAAGAGGGGAGTCGTGTTCGTGTTCGTATACTTGGCTTTAGACATTTGGAAGGACTTGCAATTGGGACTTTGAAGGCCAGTGCCTTTGAGGGTCCAGTGTTTTCCTACTCAGATGTGAAGCCCGGGACGTTGATACATGCTAAAGTTATAGTTGTTGATGATTTTGGTGCTATTGTGCAATTTCCTGGCGGTCTTAAAGCTCTGTGTCCACTTAGTCACATGTCTGAGTTTGAAATTGCTAAACCTCGAAAAAAATTCAAGGTTGGAGCTGAATTAATTTTCCGTGTGCTTGGTTGCAAGTCCAAGAGAATAACTGTTACACACAAGAAGACACTCGTAAAATCAAAATTGGAGGTTCTTAGTTCATATGCTGATGCTACTGCAGGGTTAGTGACCCATGGCTGGATAACGAAGATTGAAAAACATGGTTGCTTTGTCAGGTTTTACAATGGGGTTCAAGGTTTTGCTCCTAGATTTGAGCTTGGAATAGAACCTGGTTCTGATCCAAGTTCAACATATCATATTGGGCAAGTCATCAAATGTAGAATAACAAGCTCTACTCCCTCCTCCAAGCGAATTAACCTTAGTTTTGTAATGAAGCCTGCAAGGGTTTCTGAAGACACAAAGGTTGAGTTGGGTTGTATTGTAACGGGTGTGGTTGATGAAATAACTGAGACCCATGTAACATTGTATATAAATAGAACCGGTTACTCAAGGGGAAGAATATCCTCAGAACATCTGTCAGATCATCAGGCACACGCTTCTTCGATCAAGTCTGTATTGAAGCCTGGATATCAATTTGATCAACTCCTTGTACTAGATATTGAAGGTGAAAGTTTAATCCTATCTGCAAAACAATCTCTAATCAAATTGGCTCATATGCTTCCATCTGATTCGAGCCATGTAAATCCATATTCTATTATCCATGGATTCATTTGTAATATAATAGAAGCAGGTTGTTTTGTTCGCTTCCTAGGACGTTTAACTGGCTTTTCTCCACGAAATAAGGCTATGGACGACCAAAAATTGGATCTACGTGAAGCATATTACATTGGACAATCTGTTCGCAGTAATGTAGTTGATGTTAGTGGTGAAACTGGTAGAATCACACTTTCTTTGAAGCAGTCTACTTGCTTTTCAACCGATGCTTCCTTTATTCAGGAATTCTTTTCTACAGAAGAGAAGATTGCAAAGCTTCAATCATTGGATGAATCAAACTGGGCAGAAGAATTTGCAATTGGTAGCGTGGTTGAGGGAGAAGTTCAGGAGGTCAAGGATATTGGAGTTACTATTAGCTTTGAAAAATACCATGATGTTTTTGGTTTTATTGCACTCCATGGATTGAGTGGGTCCATAGTGGAAACAGGTTCCACCATTCAGGCTGCCGTTCTTGATGTCTCTAAAACTGAACGGCTTGTTGATTTATCCTTAAAACCTGAATTAGTTGATAAATGGAAGGGGAAGAGTTCTAGCCGACAAACTAATAGGAAGAAACGAAAGGCAGAGGCACTTAAGGACTTGGAGATGAATCAAACTGTGCATACTGTAGTGGAAGCTGTGAAGGAGAACTATCTGGTCCTTTCACTGCCAGAATTTGGTCATGCTATTGGTTATGCATCTACGTATGATTACAATACCCAAAGGCTTCATCAGAAGCACTTTACCGTTGGACAAAGTGTCGTTGCCACGGTTGTGGCTCTTCCATGTCCTTCAACTTTTGGGAGGCTGCTACTGCTTCTGAAGTCAATAAGTGAGGCCATTGTTACACCTGGTTCAAAACGGTCTAGGAAGAACTCTTCATGTGAAGTGGGATCTCTGGTTCATGCAGAGATCATTGATGTTCAACCCCTTGAAATGAGATTGAAATTTGGAGTTGGATTACGTGGACGAATTCATGTGACAGAGGTTAGCAATACGCCTGATGAAGCTTCAGAAGCTCCCTTTAGTTACTTCAGGGTTGGGCAAACAGTAGTTGCAAGGATTGTTGCAGAGGCTAACCATTCAGCTAATAAAGGGAAGGGCTATCTATGGGAGTTGTCTGTAAAACCTGAAGTTCTTAAAGATTTCAGTGGCGTGGGAGGTGAGATTGTAAATGAAGATTTGGGGTTTTCAATTGGACAACGTGTCACTGCGTATGTAAGCAATGTAAATGGTGACTGGGCATGGTTAGCTGTTACTCGGCAAGTGAGTGCCCAGCTATTTATTCTTGACAGTTCTTCAGAGCCTAGTGAGCTTCAAGAGTTCTCCAAGCACTTCCATGTTGGAAAGGCTGTTTCTGGATACATATCTAACATTATTGGCGAGAAAAAAATCTTACGGTTGGTTTTGCATCATTTATCTGCCATCTCATCTGGAAAAAGTGATCAAGAAAACTCGAAGATTAGTAATTTGCCAACTGATGTTTGTAAGAAAGTTATATGTCATTTAAATGAAGGAGATATTGTTGGGGGAAGAATATCAAAAATACTTCCGGGCGTTGGTGGACTGCTCGTGCAAATCGGTCCCCATTTGTTTGGCAGGGTTCATTATACAGAACTTACAGATTGTTTGGTGCCTGATCCATTATCTGGATATAAAGAAGGACAATTTGTCAAGTGCAAGGTTATAGAAATTACCCATGCAGTCAAAGGTACAACACACATCGATTTGTCACTGCGGTCTTCAGCTGGCATCCTCTGTCAGAAAAATATTGAATGCAGCAACCATGAAAACATTGCTTCTGGACGAGTGAAGATAGAAGATATTCATGCTCATATGGAGGTCCAGGGTTATGTGAAAAATATGTCGCCCAAAGGATGCTTCATTTTGCTGTCACGGGGATTGGAGGCAAAAATTCTCCTATCTAATCTATCGGATGGATATATTGTTAATCCTGAAAAAGAGTTCCCCACTGGGAAACTTGTTTGTGGAAGGATATTATCCGTCGAGCCCTTATCAAAGAGAGTTGAAGTCACCCTGAAGTCTGTGACTGAAACTGGTGCATTGAGAGGAAGTAATAATGATTTAAGAAGTTTTTCTGCTGGAGATATAATATCCGGACGGATTAAGCGGGTGGAGTCATTTGGTCTATTCATCAGCATTGATAATACGGATGTGGTTGGGCTGTGTCATGTATCAGAAGTTTCCGACGATCCTGTTGAAAACCTAGAATTCAGATACCATGCTGGGGACACGGTGAAAGCAAAAGTATTAAAGGTGGACGAAAAAAGGCATCGTATTGCTCTGGGAATGAAGAGGTCCTACATTGGAGAAAGAAGTGAACTTTGTACAAATATGGAAGAAGAGCATGAAGATGCGGCTGATGGTGACGGTTTCATTGGTGAGACTAGGTTGTCAATGTATCCAGATAGCAGTTCAACCAAGTTCAAGGATATGGATGATGACTTCGACAATATTGAACCTGAACAGCCACTTGGACTGGCAGAATCAAGAGCTTTGGTTCCCTCACTTGAGGTCACTCTTGATGATATAGATGAAACTGACATGGTTACTTTACAGTCTGAAAATAAAGAGCTGACGAGTGGCACAGACTCTAAGGAAAAGAATGATAGACGAGAGAAGAAAAAGGCTAAAGAAGAAAGGGAAAAGGAAGTAAGGGCCGCTGAGGAAAGATTATTGCAGAATAATTCACCAACTACTGTGGATGAATTTGAAAAATTGGTTCGAAGCTCTCCTAATAGTAGTTTTGTTTGGATTAAGTATATGGATTTCTTTAAGGCGAACGTAGAGAAAGCCCGCTTAATAGCTGAGAGGGCTTTGAGGACAATCAATATTCGGGAAGAGAATGAAAAGCTCAATGTTTGGTTGGCTTACTTCAATCTTGAAAATGAATATGGAAATCCTAAAGAGGATGCTGTGACTAAAATCTTTCAACGAGCGTTGCAGTGCAATGATCCCAAGAAGGTTCATTTAGCATTGCTAGGTATGTATGAGAGGACAAATCAAGATAATTTGGCTGATGAGCTCCTGGACAAAATGATAAAGAGGTTCAAGCATTCCTGCAAGGTTTGGTTGAGGCGGATGGAGAGTTTGCTAAAGAAGAAACAAGTTGAAATTCAATCAATTGTGAACCGTGCCCTACTTTGCCTTCCAAAGCGTAAGCACATTAAATATATCTCACAAACAGCTATCCTTGAATTCAAATGTGGGGTGGCAGATCGAGGTCGGTCAATGTTTGAAGGAATTCTTCGAGAGTATCCAAAGAGAACGGACCTGTGGAGCATCTATCTTGATCAAGAAATTCGTCTTGGTGATAAAGATATGATTCGTGCCCTTTTTGAAAGGGCCATTAGTTTATCTCTTGCTCCCAAGAAGATGAAGTTCTTATTTAAAAAATATTTGGAATATGAAAAGTCTGTTGGCGATGAAGAACGAATTGAATCAGTGAAACAGAAGGCATTGGAGTACGTCGAGAATATGTTAGCTTAA MAPPSRKSQDGSKFNKHSKKPFNSKKKTSETPKPETVSLQIEDDVPDFPRGGGGYMSQNKGEKVRAEGDKEFQNDDLKMTTKRGKKTRKHPSNGDDLESLLNNGVVGNLPKYANKITLKNINPRMKFWGVVAEVNKKDLVISLPGGLRGLVSAAEAFDPILEKEVEDTEHDLLPVMFHVGQLVPCVVLQVDDDKKESGKRKIWLSLRLSILYKDFTLDLLQEGMVLTSYVKSIEDHGYILHFGLTSFTGFLPKTKQYDQSENEVHVGQLLHCVVRSIDKTRKVVYFSSDQDIVSRSVAKDLKGISIDLLIPGMMVSARVQSTLENGILLSFLTYFNGTVDMFHLQNSFHSSNWKNFYNQNMKMNARILFIDPSTRAVGLTLIPHLVRNKAAPPHVRIGDIYDSAKVVRVDRGSGLLLEVASSPESTPTFVSVSDMAEEVVKKIGKKFKEGSRVRVRILGFRHLEGLAIGTLKASAFEGPVFSYSDVKPGTLIHAKVIVVDDFGAIVQFPGGLKALCPLSHMSEFEIAKPRKKFKVGAELIFRVLGCKSKRITVTHKKTLVKSKLEVLSSYADATAGLVTHGWITKIEKHGCFVRFYNGVQGFAPRFELGIEPGSDPSSTYHIGQVIKCRITSSTPSSKRINLSFVMKPARVSEDTKVELGCIVTGVVDEITETHVTLYINRTGYSRGRISSEHLSDHQAHASSIKSVLKPGYQFDQLLVLDIEGESLILSAKQSLIKLAHMLPSDSSHVNPYSIIHGFICNIIEAGCFVRFLGRLTGFSPRNKAMDDQKLDLREAYYIGQSVRSNVVDVSGETGRITLSLKQSTCFSTDASFIQEFFSTEEKIAKLQSLDESNWAEEFAIGSVVEGEVQEVKDIGVTISFEKYHDVFGFIALHGLSGSIVETGSTIQAAVLDVSKTERLVDLSLKPELVDKWKGKSSSRQTNRKKRKAEALKDLEMNQTVHTVVEAVKENYLVLSLPEFGHAIGYASTYDYNTQRLHQKHFTVGQSVVATVVALPCPSTFGRLLLLLKSISEAIVTPGSKRSRKNSSCEVGSLVHAEIIDVQPLEMRLKFGVGLRGRIHVTEVSNTPDEASEAPFSYFRVGQTVVARIVAEANHSANKGKGYLWELSVKPEVLKDFSGVGGEIVNEDLGFSIGQRVTAYVSNVNGDWAWLAVTRQVSAQLFILDSSSEPSELQEFSKHFHVGKAVSGYISNIIGEKKILRLVLHHLSAISSGKSDQENSKISNLPTDVCKKVICHLNEGDIVGGRISKILPGVGGLLVQIGPHLFGRVHYTELTDCLVPDPLSGYKEGQFVKCKVIEITHAVKGTTHIDLSLRSSAGILCQKNIECSNHENIASGRVKIEDIHAHMEVQGYVKNMSPKGCFILLSRGLEAKILLSNLSDGYIVNPEKEFPTGKLVCGRILSVEPLSKRVEVTLKSVTETGALRGSNNDLRSFSAGDIISGRIKRVESFGLFISIDNTDVVGLCHVSEVSDDPVENLEFRYHAGDTVKAKVLKVDEKRHRIALGMKRSYIGERSELCTNMEEEHEDAADGDGFIGETRLSMYPDSSSTKFKDMDDDFDNIEPEQPLGLAESRALVPSLEVTLDDIDETDMVTLQSENKELTSGTDSKEKNDRREKKKAKEEREKEVRAAEERLLQNNSPTTVDEFEKLVRSSPNSSFVWIKYMDFFKANVEKARLIAERALRTINIREENEKLNVWLAYFNLENEYGNPKEDAVTKIFQRALQCNDPKKVHLALLGMYERTNQDNLADELLDKMIKRFKHSCKVWLRRMESLLKKKQVEIQSIVNRALLCLPKRKHIKYISQTAILEFKCGVADRGRSMFEGILREYPKRTDLWSIYLDQEIRLGDKDMIRALFERAISLSLAPKKMKFLFKKYLEYEKSVGDEERIESVKQKALEYVENMLA* Homology
BLAST of Chy8G146150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4J8K6 (rRNA biogenesis protein RRP5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RRP5 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 2149.4 bits (5568), Expect = 0.0e+00 Identity = 1136/1935 (58.71%), Postives = 1454/1935 (75.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NS46 (Protein RRP5 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pdcd11 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 668.7 bits (1724), Expect = 2.0e-190 Identity = 582/1985 (29.32%), Postives = 928/1985 (46.75%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7MB10 (Protein RRP5 homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=PDCD11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 656.8 bits (1693), Expect = 7.8e-187 Identity = 570/1965 (29.01%), Postives = 937/1965 (47.68%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q14690 (Protein RRP5 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD11 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 645.6 bits (1664), Expect = 1.8e-183 Identity = 553/1960 (28.21%), Postives = 928/1960 (47.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O74835 (rRNA biogenesis protein rrp5 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=rrp5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 512.3 bits (1318), Expect = 2.4e-143 Identity = 499/1972 (25.30%), Postives = 859/1972 (43.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L3Z5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G553660 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3667.5 bits (9509), Expect = 0.0e+00 Identity = 1882/1922 (97.92%), Postives = 1895/1922 (98.60%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B5U4 (LOW QUALITY PROTEIN: rRNA biogenesis protein RRP5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3555.4 bits (9218), Expect = 0.0e+00 Identity = 1825/1922 (94.95%), Postives = 1862/1922 (96.88%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EE30 (rRNA biogenesis protein RRP5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432393 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3200.2 bits (8296), Expect = 0.0e+00 Identity = 1652/1936 (85.33%), Postives = 1753/1936 (90.55%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HM63 (rRNA biogenesis protein RRP5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465903 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3188.7 bits (8266), Expect = 0.0e+00 Identity = 1648/1936 (85.12%), Postives = 1750/1936 (90.39%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DS33 (rRNA biogenesis protein RRP5 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023013 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3148.2 bits (8161), Expect = 0.0e+00 Identity = 1621/1926 (84.16%), Postives = 1747/1926 (90.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. NCBI nr
Match: XP_011653922.2 (rRNA biogenesis protein RRP5 [Cucumis sativus] >KAE8649759.1 hypothetical protein Csa_012499 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 3651 bits (9468), Expect = 0.0 Identity = 1881/1922 (97.87%), Postives = 1894/1922 (98.54%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. NCBI nr
Match: XP_008442208.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: rRNA biogenesis protein RRP5 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 3546 bits (9196), Expect = 0.0 Identity = 1825/1922 (94.95%), Postives = 1862/1922 (96.88%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. NCBI nr
Match: XP_038881067.1 (rRNA biogenesis protein RRP5 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 3420 bits (8869), Expect = 0.0 Identity = 1761/1924 (91.53%), Postives = 1829/1924 (95.06%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. NCBI nr
Match: XP_038881066.1 (rRNA biogenesis protein RRP5 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 3415 bits (8854), Expect = 0.0 Identity = 1761/1928 (91.34%), Postives = 1829/1928 (94.87%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. NCBI nr
Match: XP_038881068.1 (rRNA biogenesis protein RRP5 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 3384 bits (8774), Expect = 0.0 Identity = 1749/1928 (90.72%), Postives = 1817/1928 (94.24%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. TAIR 10
Match: AT3G11964.1 (RNA binding;RNA binding ) HSP 1 Score: 2108.2 bits (5461), Expect = 0.0e+00 Identity = 1122/1935 (57.98%), Postives = 1434/1935 (74.11%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. TAIR 10
Match: AT3G23700.1 (Nucleic acid-binding proteins superfamily ) HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 2.1e-06 Identity = 29/81 (35.80%), Postives = 48/81 (59.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy8G146150 vs. TAIR 10
Match: AT3G13210.1 (crooked neck protein, putative / cell cycle protein, putative ) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 3.7e-06 Identity = 62/286 (21.68%), Postives = 122/286 (42.66%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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