Chy7G136540 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy7G136540
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionULP_PROTEASE domain-containing protein
LocationchrH07: 10413290 .. 10418747 (+)
RNA-Seq ExpressionChy7G136540
SyntenyChy7G136540
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AGCACTAGACTGTGACTGTGCAGGGTACACCATAGGATACTAATAATTTATTTTTCCCCGAACGGGACAAGTAGTGGGTCCCTTACTGAGTATATTAATACTCATCCTTTTTTTTGTTTAACTTTTCAGGCAAAGGTAACACGAGGGGCAGACCGACGAGGGACAAGAAGGACTCGTGAATTTGCCATAGGGGACTGTCTTTAAACTGCTTCCGCTGACGGTTTGAAAAATATTTTGATTTAACTAAGTCTACAATAGTTAAATTTTTTGTAAACAGCACATTGTAAATTTTGTATTTTGGAAATAGGGCCCGATTAAATTTTCCTTCGTTTTCGTACGGTTTCAACTGAAAATTTTTATGTCTTTTGTCGACAAACGATTTTGGGTCAAATTGACGACTGAGACGGTCAGTCCGAAAAGTCCGGGTCGTCACATCTTGAGCGGAAGAACACATGGATATTCTATTAAATTCATCTTTACTCAAGGCACAATACAAACAATTAATAGCCTTAGTATTAAAAGAACACTTTTTCATTTCATTTTCATCATACTCTTCTTCTAATTTAGGCTTATCAACATTATCAACCTTTTTCATGGGTACATAAGGACCTTTAGCAACAATTAACCACAAATTATAGTCAATAAATTGCAAATAAATTGTCATTCTAGCTTTCCAATATGCATAATTTGAACCATCAAAATAAGGAGGTCTAGAAGTAGATTGACCTTCAACAATCCCATTTGCCAATAGGTTTGCCATGATGCTCTAACAATAAAGTTTATCAAGAAATTAAAATTTCAAGATGAGCAACCTTGCTCTGATACCAATTGTTGGATCGGTATGGCAACCCTAGAGGCGGGTGAATAGAGTTTAATTAAAGTTTTTAACAAATAAAAAGTAAATTCAACTAATTATATATTTTTTTAAAAAAATTAAATAAAGAACTTTGTAAAATTTGTTAAATAACAAGATTGATAAAAAGATATGAATGGAAGTATGCAATCAAACTCAACCAATAAGAATATGTAACAAAAATTAAATTAAAAAATAATTAGAAAAGAGTTAGCGAAGAAGACACTATAATTTTATAGTGGTTCGGTTAAACTCAACCTACGTCCACTTTCCCAAGCACCTCTTAGGATTTTGATTGAAAATCTTCTTTTGACTTTTTCCATGGATTTGAGCCGAACCGATTCTTGCTCCTTTTTTGGGTTCAAGAGCAAACCCGATCCTTTCCACGGGTTAGGATCCAACCGTTACAATATGTTGAAGTTTTAAATCACACAAAAGAAAACTCTCTAAAAGAGTGAATATACAATTTGAAGCTCAAAAATTTAATCTTCACAATACAATAAGAATTCTCACAAGAATAAGATGAAAAGAATAAAAATTGGAAGCTTTAGAGAGAATAACAATGTTGGCTTTTCACTTTTTGAGAATTGTAAAGTTTTAATAATCTTATCTTTTAAAATTTGGGAAAAGCGAAGTATTTAAAAAGAGAGGAAAGATAAATTCAAAATCATTTTGGGTCATTAGATGTAAGTGAAAGAAAAATGAATGGTTGAGATTTAAACTCAAATAGCCGTTAGACACAATACAAATAATAATATAATAATTTGTCTTTTCAAAAGTCTTTGTTTAAAAACCAATAAAGCAACTTCACAATCTTTTAAAAAAAAACTAGCCGTTAGACACAAGAAAAAATAATAATATTAAAGTTATTTTCTTTTTAAACTCATTTTCTTTATAAAAGCCAATAAAACATAACCAAAAGCCACATTTGTTACTCCTCCATTGCTCCAAGTGGCTTTCTCTAATTGGTTCAAATTGAATGTTTGGCCGCCACATCAACATCTCGGGTATTTTTCCGTTAAGCTTCTTTTAGCAATATTTTCTTCGTTTGAACTTCGATTTGGGTGATTCAAGAGGCGTTAGAATCATCTTTCCAAGCTCTACGTTATGAACTATTCAAATTAATAAAATTGTCAAAAAAAAAAATCAGATTTTTTATCATCAAACATAAATAAATTAGTTATATAAAATAAATTAATTTGAGATTAAAGGCAAAAAAGCCAACAAAAGATGTCTTGGGTCCAGGGGTAAGAAAATTAGATCAAACGAATATAATCCAATCATTATCGATGATGCTGAGGTATATTTAATATTAACTGTTATAAGATGTTACCGTATTGATGTTTCATATGTATATTAATTGTTCCATAGGTATATATATATTAATTATATTGTATTCGTGTATATCATAGGATGAAAAGATAACGAGTTCTCAAGACTTATGAAGATAACCAAATGGAATACAAACCTATACAAACAGTGTTCCCATGTGAGGATGAATATGATATAACAGGACCAAATGACACTCAAATAGTTCTCTATGATGAGAACTTAACTATAAAAAGAAACATAGTGCTAGAAACTCTTGGTCAGAAAATGGATGCACAAGCAAGAGAGGTCAGTTAATCTGTATATATATAAACATTGTTCACTACTACAAAATCTACTTTACTTGACACTAGGTACTTTTACATACTTGACCATTTTAAAGGAAAAATGTAAAGTATAGTTTCAAAAACGCGAAGTTTTCACGAAATTTTTCAAACTATTTTAAATTAGCTTTTACTTGATGTTTTTTTTGCATCAAGTATAAGGGAGATTTTACTTGACGTTTTATTCGCATCAAGTATAAGGGAGATTTTACTTGACGTTTTATTCGCATCAAGTATAAGGGAGATTTTACTTGACGTTTTATTTGTATCAAGTATAGAGAACTTTTACTTGACTTGAGTAAAACGTCAAGAATAGTTTAAAGAAAGCAAAATTTTCACAATTTTTTTAATTATTTTACGTTAGCTTTTACTTGACATTTTTTCAACGTCAAGTAGAGTCCAAATTTTGCTTGACATTTTTTTAATGTCAAGTATAGTAAACATTTTTATTTTGATAAGTATAAAAATATAAAAATACATTTTATTTTCCTCCTTTAATTAAATAAAATTATTAAAATAAAATTATTAAAATAAACTTATTAAAATAATTATTTTAATAAAATAAACAAACATTTTCCTCCCTCCTCTTCTCTTTTTATTTCCCCTTTTTCTCTCCAAACCCTCCCCACAATTTTCTCTCCATCTCCACCTTCACCTCCACCTCCACCGGTGGCCAACTCACAACTCTCCATCTCTCCACCGGTTGTCGTCCTACAGCCACCCACAACCCATAACCCACATTCTCCGATGACCCGCCGCTGCTCGCACGACCTATGACAGCCCGCCGCTCCCATGACCCATGGCAGTCTGCCATTTCAGTGTGTAGAAGTAAAATCAACCCACTTTGTTGTTTGCATCCTTTTAGTCCATAATGTTGGGAGTTGCATGTCACAACTTTTCAATAATAGCAATAGTGGATTTGACATGACCAATTCAGCATAGTGTTAGGAAAGAAATCACACAATTCAACACACTTTTTTACATAATGTTGGGAACCTACAACTTATATAATTTGTTGATTTTTTAACCTAAAAAGTTCAAACGAATTGACCTTAATGTGTTTCAGCATTTTTGTTAGCTTAAAGTGTTGTTATGTATGCGTTTTTTTTAGCTGAAATTATATTTTTTTAGTAGTTTGATGAATACCATGAGTTCATTTAGTCATCTTGCTACTAGATTCTTTCTTCGATTGTTCGTGCATGTTAATTTGATGAAGAGTAAATTGCTTCTTAATTTGAGCTTTAATTTCGATGTAAATGATCTTAATACTAGAACACTTAGGCCAGATTGAAATTTGTTTGTTGATAGGATAGACTATTTTGTATAAATTTTAATGTTTTGTTTGACTAGGAAGAGAAATTAATTTTTTTTATAAGAATGACATTTGATTATGAATGTCGTGTAGATTATTTTTATTATTATTGATATGTTGAAGTTGTTGTACATTCTCATGCAAATAAAGTCCTTATAGTATACACAATAATACAATAATGGTGTGTAGTAGTTAGCAAATAGGAGTTGAAGAAAAGGACATAGGAAGTCAATTTTTGTGTGTATGTATAAACGTAATGTATAATATAAATAATGTATGTTTGTATGCTTTGATTAAGACATTGATAAATAATGTCTGTTTGTATGCTTTCAAACATATTTATCCATTATAAATGTGTGATTTGATTCAATTCATAAATTTTATATAAAAACAACTTCAAATTATATTTTTATTTAAAAAAAAAAAAAGAATTATTTGAGAAATAAAGTTTCCACCATGTGTGTTTGATAGTAGAGTAAGCTTTTTAGGAAGAAGATGAACTTATTTGATGAATAGTTGTTATAAGGCCGGTCCTTGAAGGTGATTTCTCATTTAATGAAGTCAAATAAAACCAATTTTGCATCCATATTGTGGTTCCCTATTTCATAATCTATATCGAGCTAACCTATTTAGAGTTTATCCTCATTATATTGTACACCATCTTTTGAACTTTTTGTGATTCTTGGTCCAAAATAACTCATAACATATGGTATAAAATTTTTGTGGGTCTATTTGTTATATTTTGAGACATTTATCACATTGTTTAATTTTGTTATTCAACCCAAGAAAAATGAAAAAAGAAATTGATGTATGTATGTATATGTAATGTTTATAATTGAGAGAGGGTCCCTTCTTTCCAAAAGTCAAGAAATTTAATGATGGATTACTTTGCATGTTTACATTTTTTGTAGCTCCAAGATTAGAATATTATAAGCATGGATAAATCATGGATGTCAAAGAGTCGATTATCTAAAGAGTTTGAGTTGGGTGTAGAGAACTTCATCAAATTTGGACTTTCCAATACAAAAAATACTTGCACATATGTTTCATTTAGTGGTCACTGGTCATTAGTAGTCATTAATGCATATGATGATGTGGTGTACCATCTTGATTCGTTGAGACAAGCTCTCGAGAGGACATCAAATATATAACGAATATGTAAGCTAACTCTGTTTGTGTTTTTTTTTTTTTTTATCGCTAACAAAATTAGTTCATTTTGATTTATACTATACTTTGGAAAATGTAGAGCATTGACGATTTTTCAATCTCAAAAGAATTTAAAAAAAAAAACAGAAAAACAACATTTTGGAAAGCGGTAAAGGTAAATATATTTATAAATAGCTTACAATTTCATTTAGCACATAATATAATATACATTATTATTGGTTTTGTGTTGTAGTGTCCTCTACAAGTAGGCACTGTTGAATGTGAATATTATTGTATGAGATACATGCGCGAAATCATGAGTAAAGACACAAGTATTATTACTGATTCGGTATGTTTTTAAGTTTCGACCCGACTTTTTATGTTTTATAGATTGATACGAGAAGTTCGTACTCACAGCTTGAATTGGATGAACTACGAGCGGAGTGGGCTGAATTTTTAGCTCGGTACATATGATAAACACACCTAGATATGATT

mRNA sequence

ACATTGACGATTTTTCAATCTCAAAAGAATTTAAAAAAAAAAACAGAAAAACAACATTTTGGAAAGCGGTAAAGATTGATACGAGAAGTTCGTACTCACAGCTTGAATTGGATGAACTACGAGCGGAGTGGGCTGAATTTTTAGCTCGGTACATATGATAAACACACCTAGATATGATT

Coding sequence (CDS)

ACATTGACGATTTTTCAATCTCAAAAGAATTTAAAAAAAAAAACAGAAAAACAACATTTTGGAAAGCGGTAAAGATTGATACGAGAAGTTCGTACTCACAGCTTGAATTGGATGAACTACGAGCGGAGTGGGCTGAATTTTTAGCTCGGTACATATGATAAACACACCTAGATATGATT

Protein sequence

TLTIFQSQKNLKKKTEKQHFGKR*RLIREVRTHSLNWMNYERSGLNF*LGTYDKHT*I*X
Homology
[Close]
BLAST of Chy7G136540 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SXG8 (ULP_PROTEASE domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold43059G00700 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 5.9e-04
Identity = 35/68 (51.47%), Postives = 36/68 (52.94%), Query Frame = 0 

Query: 2   LTIFQSQKNLKKKTEKQHFGKR----------------------*RLIREVRTHSLNWMN 48
           LTIFQSQKNL KKT K  F K                        RLI+E RTHSLNWM 
Sbjct: 310 LTIFQSQKNL-KKTRKTIFWKAVGTIEGRYMREIMSKDISIITVMRLIQETRTHSLNWMK 369

[Close]
BLAST of Chy7G136540 vs. NCBI nr
Match: KAA0033885.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold43059G00700 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 52.0 bits (123), Expect = 9.81e-06
Identity = 35/68 (51.47%), Postives = 36/68 (52.94%), Query Frame = 0 

Query: 2   LTIFQSQKNLKKKTEKQHFGKR*----------------------RLIREVRTHSLNWMN 47
           LTIFQSQKNLKK T K  F K                        RLI+E RTHSLNWM 
Sbjct: 310 LTIFQSQKNLKK-TRKTIFWKAVGTIEGRYMREIMSKDISIITVMRLIQETRTHSLNWMK 369

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy7G136540 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy7G136540 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7SXG85.9e-0451.47ULP_PROTEASE domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN... [more]
BLAST of Chy7G136540 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0033885.19.81e-0651.47uncharacterized protein E6C27_scaffold43059G00700 [Cucumis melo var. makuwa][more]
BLAST of Chy7G136540 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy7G136540.1Chy7G136540.1mRNA