Chy7G136210 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview


Name	Chy7G136210
Type	gene
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	Cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8
Location	chrH07: 9370459 .. 9405218 (-)
RNA-Seq Expression	Chy7G136210
Synteny	Chy7G136210

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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CCATAATGTGATGGTTGTGAATTATTAGAAACAACTACTCTACAAGTGTTTATAAGAGGATTTTATCTTTTTCTATGATTTTAAAAACTTCCCTTTAAAGAAAAGGAGTTTTTCATTTTTTTTCTATGATTTTCAAAACTTGAGATCATCATTGAGCTCACATTTTGATTGATATACTCAGTAGGGTGGCCGACACATAGCTCACGAATCGTCGCTTACCTGAACCGTCAGCGTCATTATCCTTAAAAGCTAAACTTAAACTAGCCATAATAGTAAACTTATGAGTCCAAATGCCCGAGAGAGTTTTTCGTTACACGTCTGCTCACAATTTTCATCACCACGAGGGCAGATCAGACTCTAGTGCCATTAGATGCAATTTCATAGGCTATGATCCTAATTGAAAAGTGACAAATCTACTCAAAACGTCCATAGTTCCACGTTGATCCAATGAAAAGAACTTAGCAAACAAAATTTATAAATTTTTATCATAAAACCAAATATTCAATGTGAAATTTCAAATTATCAGGCAACGGACTCTGAAATGGAAGTGAAGAGTTGCAAAATCATAGATTCATACTACGGCATTTGGTTCGAAACGGGGCTGTTTCACATCGAAGATGTAGATTTCCAGAAAATTCTCAGTTTATGCAAGCACCAACTAGAATGGTTTGTTGATTCAATTTCGGGTCTAGTCCAAGAACCCGATGGGAAGTTCAAAAAAAAAAGAAACAGATATGATGGAGAGGAAGCTACAAGCCTGACAAAACTCTAAACCCCATCAGGTTGGTTCCTAAGGTGTGTCGCTCGAAGTGCCTCTGGAATCCAATCATTTATTCACATCTTTTCAGAGACTCAAAGCAAGGATGGTTTTGTTTCCTGAATATGATAAAGACTTTTTTGAAGATTTATGACTACACATTATGGCAATCCACACTACACTCCGATTCTGATCAGTTAGGGTCGCGAACATCCCATCTTCCAAAACCAGGTTCATGTTTGCGAATAAACTTAAGTTATCCAGAAAAGAAATACACATTGTTTTTAGTGATGGAAAACAGAGTATAGATATTGTCTCAAAAAATCTGAATCAATCTCCAAGTGGAAGACCAAAACAGAGCACAGGAACATTTCCTATTTCTACTGGCCATGATCAAGAGCAAGAATACTGGGTTTGGAAGTCAGAAGACTTCACCAATCTTTGGATACTTACAAGATTATTTGCATTTGACGAGTGGAAGGATATTAGAGTTCATTTGGAGGAATCGTTTCATCTAAAAATAAGCATCAATCCATTATTTGCAGACCAACCCGTTTCCAAAGTAACTCGAGGAAAGATTGAAGATTTGATTATCACTCTAGGAAAGTGGTTCGATTACAGGAAATACCATCTCTTTGAAAAATGTGATGAAAATAAGCACTGTACACCAACTCTCATAGCAGGTTTCGGAAAGTGGTGAGCATCAATAAGTAACCTACCTCTCAACCTTTGGCGAAAAGAGATTTTTGAAGTTACTGGTGCATGAGATTATTGGGAAAAGACATGAATCTGGAGGACTTTATAGTTTTGATCACCAAGTATCGATGTCAACAACCATTGCTTGTTCTGGAATTGTTTCTCCTTTTGATGCCCATTGTCATCTTAGTCATCCATCCCTCTCATGCTTTAGAAAGCTTTATCCTCAGTTTTATAACCTGTCTTCATTGAATTGTGACTCATGTTAGCTTGCCAAATTTCATGTCTTAGCTCCAGTCCTAGAGTTGACAAACGGGCAAATTCTCCCTTGAGTTGGTTCATTCTGATATTTGGCGTCCATGTTTATTTGTGTCCAAAATTGGATTTAGATATTTTGTTACCTTTGTTGATGATCACCCTCACACAACTTGATTATAAATATGAAAAATTGTTTTGAGTTACTTTCTCATTTCAGCAATTTTCATGTTGAAATTCAAACAAAGTTTGGTGTATGCCTTGGAACCTTGAGAAGTGACAATGTTGGTGAGTATTTTTCAGAAGCACTAAGTTCAACCTGTGTACACATGAAATCATTCACCAATCATCATGTGTTGATACTCCATCCCAAAATGGAGTTTTGGAACGAAAGAATGGGCATCTTCTTGAAACTGCACGAGCATTATTCTTTCAAATGCATGTTCCAAAGCATTATAGGGTTGACGCAATTTCCACAACTTGTTTTGTTATAAACAGCATGCCTTCGTCTGTTCTTCAAGGTCAAATTCCTTATCATGTTCTCTTTCCAACAAAACCATTGTTTCCTATTGAGCCTAAAATATTTGGTTGCACGTGTTTTGTTCTAGATGTTCATCCTAATTTAACATAATTAGAGCCCAAGTCTTTGAAGTGCATTTTCTTAGCATATTCTCCTGTTCAAAAAGGATACAGATGTTATTGTCCAAGTTTGAATAGATATTTTGCCTATCCAGATGTTACTTTCTTTGAGATAAGCCTTTCACTACCCCTTTGCCTAGTATGAGTCAAGGGAGGAGGATGATCTTTTTCTTTATACTCTCACATCTCCAACTCCCTCCCCTGCTTTACTTCCCGCATCTGCCCCCTAATCATCCACCAATACCTAAAGTCTACTCTTGTCGATAACAACCTCCAGGTGAATGTTCTGTCCCAAAAGACTCTATGGTAACAAATTTAGGACCAAGTGATGACCTTTCCATTGCTCTTCTTAAAGGTAAACGTTCTTGCACTTATCCTATTGTGTCTTACGCATCTTATAACAAATAATCATCTCCTACATGTTTGTTTGTTAAATTTCGACTTTGTCTCGATACCTAAGACCGTTCATGAAGCTTTGTTTCATTTTGGGTGGCGTAGTGCAATGATTGAAGAGGTGAATGCCTAAGAAGATAATGGTACTTGGGATTTAGTGTCACTTTCTGCAGGAAAGAAGACTATTAGGTGCAAATGGGTATTTGCAATTAAAGTTAATCCTGATGGATCAATAGCTCGTTTAAAGGCACGCCTTATGGCTAAAGATTATGCTCAGACCTATGAGGTTGACTATTTTGATATATTCTCTCCTGTTTAGCTTACTTCGGTCAGATTATTCATTTCTATGGCAGCATCTCAAGATTGGCCTTCGGTGATCTCCAAAAAGAAGTCTACATGCAGCAACCATCTGAGTTTGTTGCTCAGTGGGAAAATGATAAAGTGTGTCACCTAAGGTTGAAGTAGAGTCCACATGCATGGTTTGGAAAATTATTCTATATGCAGTAACACACTTGAGCAGTTTGGAATGAAGAAAGGAAAATTGGATCACTCGGTTTTCTACCGAAGATCTATTAGTTGAATTATTCTACTTGTTGTATATGTTGATGATATTGTTATAACCGTCAATGATACATCAAATATATTGTCTCTCAAATCTTTCCTCCAAAGTCAATTTCACACTAAAAATTCGGGACTGTTGAAGTACTTTTTGGGTACCGAAGTAATGAGAAGCAAGAAGAGTATTTTTAAGTCACAAACAAAATATGTGCTTGATTTGCTATCTGAGACGGGAAAATTGGGATCCAAGTCGTACAGTACTTCGATGATATGTGGTCTACAACTGTTGAAAGATGGAGAACCATTTGAGGATCTTGAGAGATATAGAAGATTGGTTAGGAAGTTAAATTACCTCACAGTAACACGTCCAGACATAGCTTATTCAGTAAGCATTGTGAGTCAATTTATGACCTCACCCACAATGGAACAATGAGATGCAGTACAACAAATTCTATGTTACCTTAAGGTTGTACCTGGATGTGGGATTCTATATAAAGATAATGGCCATATGAAACATTGAATGTTTTTCAGATGTTGATTGAGTAAGATCAAAAGAAGACAGAAGATCGACTTCTGGGTATTGTGTTTTTGTTGGAGGCAATTTGGTTTCATGGAAGAGTAAGAAGCAAAACGTAGTTTCACGATCAAGTGTTGAATCAGAATACAGAGCGATGACACAAGCAGTGTGTGAAATAATGTGGTTACATCAACTCTTGATTAAGATGGGTTTTAATACTACAATTCCGACTAAGTTGTGGTGTGACAATCAAGTTGCTCTCCATATTGCATCTAACTCAATATTTCATGAGCATACAAAACACATTGAAATTGATTCATTTTATTCAAGAAAAAATACAAGGTTTGATGTCTACTGGATATGTGTCTACTGGAGAACAATTAAGGGATATCTTCAAAAAAGCTTTGAATGGAGTTCGAATAGAGTACCTATGTAACAAGTTGGGCATGATCAATATATATGCTCCAACTTGAGGGGGGAGTGTTATAATATATATACATAGGAGCTTATTAGTCGTTTATCCACTATTGTAATTGACTAGTCTTTAGATGGGTTTCCATGTATGCCGATATATATTGAACTCTATTGTATAGAATAAATCGAGTGAGTTATTTCATATTTTCCTCTAACTTCAGCATTTCAGACTTGAATTTCCATCAATCTCATTTAAAATTTCAGGCTCAGACATTAACTTTAACTTTATGCAAGGAACTGTCAGAAGATGAAGCATCAATAATCAGTGCAAGCAGCAAAGAGCTAGAGATTGAGAATTTAGAGAAGTTGGAGTAACATCAAACAGAATAAGAGAAGGCCGAGAGTCTTGATACATGGGGGCCAAACTTTTCCAAGTTGTTTCTTTCTCCAGAATCCAAACCAGCTTGCAAAGAAGGCAGCTGCAAGCTTCTCTCAAGATTTGGTTCCTTTCTTAACAGCATGTGAGATTGA

mRNA sequence

TATCAAGATGAAGCATCAATAATCAGTGCAAGCAGCAAAGAGCTAGAGATTGAGAATTTAGAGAAGTTGGAGTAACATCAAACAGAATAAGAGAAGGCCGAGAGTCTTGATACATGGGGGCCAAACTTTTCCAAGTTGTTTCTTTCTCCAGAATCCAAACCAGCTTGCAAAGAAGGCAGCTGCAAGCTTCTCTCAAGATTTGGTTCCTTTCTTAACAGCATGTGAGATTGA

Coding sequence (CDS)

TATCAAGATGAAGCATCAATAATCAGTGCAAGCAGCAAAGAGCTAGAGATTGAGAATTTAGAGAAGTTGGAGTAACATCAAACAGAATAAGAGAAGGCCGAGAGTCTTGATACATGGGGGCCAAACTTTTCCAAGTTGTTTCTTTCTCCAGAATCCAAACCAGCTTGCAAAGAAGGCAGCTGCAAGCTTCTCTCAAGATTTGGTTCCTTTCTTAACAGCATGTGAGATTGA

Protein sequence

YQDEASIISASSKELEIENLEKLE*HQTE*EKAESLDTWGPNFSKLFLSPESKPACKEGSCKLLSRFGSFLNSM*D*

Homology

[Close]

BLAST of Chy7G136210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BIN0 (Putative mitochondrial protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold562G00720 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 79.3 bits (194), Expect = 7.6e-12
Identity = 41/59 (69.49%), Postives = 50/59 (84.75%), Query Frame = 0


Query: 2   QDEASIISASSKELEIENLEKLE*HQTE*EKAESLDTWGPNFSKLFLSPESKPACKEGS 61
           +DE+SIISASSKE EIENLE+LE  QTE E+A+ LDT GP+FSKLFLS ESK +CK+ +
Sbjct: 298 EDESSIISASSKEFEIENLEELEEDQTEQEEAKILDTLGPDFSKLFLSSESKESCKKAA 356

[Close]

BLAST of Chy7G136210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UHY9 (Cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold437G00450 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 77.0 bits (188), Expect = 3.8e-11
Identity = 40/59 (67.80%), Postives = 49/59 (83.05%), Query Frame = 0


Query: 2   QDEASIISASSKELEIENLEKLE*HQTE*EKAESLDTWGPNFSKLFLSPESKPACKEGS 61
           +DE+SIISASSKE EIENLE+LE  QTE E+A+ LDT GP+ SKLFLS ESK +CK+ +
Sbjct: 514 EDESSIISASSKEFEIENLEELEEDQTEQEEAKILDTLGPDLSKLFLSSESKESCKKAA 572

[Close]

BLAST of Chy7G136210 vs. NCBI nr
Match: TYJ99680.1 (putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 1.18e-15
Identity = 45/76 (59.21%), Postives = 55/76 (72.37%), Query Frame = 0


Query: 2   QDEASIISASSKELEIENLEKLE*HQTE*EKAESLDTWGPNFSKLFLSPESKPACKEGSC 61
           +DE+SIISASSKE EIENLE+LE  QTE E+A+ LDT GP+FSKLFLS ESK +CK+ + 
Sbjct: 298 EDESSIISASSKEFEIENLEELEEDQTEQEEAKILDTLGPDFSKLFLSSESKESCKKAAA 357

Query: 62  KLLSRF-GSFLNSM*D 76
                  G  LN+  D
Sbjct: 358 SFPHDLEGKLLNTSSD 373

[Close]

BLAST of Chy7G136210 vs. NCBI nr
Match: KAA0054764.1 (Cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 78.6 bits (192), Expect = 8.73e-15
Identity = 44/76 (57.89%), Postives = 54/76 (71.05%), Query Frame = 0


Query: 2   QDEASIISASSKELEIENLEKLE*HQTE*EKAESLDTWGPNFSKLFLSPESKPACKEGSC 61
           +DE+SIISASSKE EIENLE+LE  QTE E+A+ LDT GP+ SKLFLS ESK +CK+ + 
Sbjct: 514 EDESSIISASSKEFEIENLEELEEDQTEQEEAKILDTLGPDLSKLFLSSESKESCKKAAA 573

Query: 62  KLLSRF-GSFLNSM*D 76
                  G  LN+  D
Sbjct: 574 SFPHDLEGKLLNTSSD 589

[Close]

BLAST of Chy7G136210 vs. NCBI nr
Match: KAE8652235.1 (hypothetical protein Csa_023977, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 7.63e-04
Identity = 25/56 (44.64%), Postives = 35/56 (62.50%), Query Frame = 0


Query: 3   DEASIISASSKELEIENLEKLE*HQTE*EKAESLDTWGPNFSKLFLSPESKPACKE 58
           DE SI+S SS+ELE+ +L++ +    E E     D+ G +  KLFL+PE K  CKE
Sbjct: 46  DEVSIVSTSSEELELVSLDERDDVLAEFEANNLDDSLGLDLPKLFLTPEPKACCKE 101

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Chy7G136210 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Chy7G136210 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5D3BIN0	7.6e-12	69.49	Putative mitochondrial protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_s...	[more]
A0A5A7UHY9	3.8e-11	67.80	Cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 OS=Cucumis melo var. makuwa O...	[more]

BLAST of Chy7G136210 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
TYJ99680.1	1.18e-15	59.21	putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
KAA0054764.1	8.73e-15	57.89	Cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
KAE8652235.1	7.63e-04	44.64	hypothetical protein Csa_023977, partial [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of Chy7G136210 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 10..30

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy7G136210.1	Chy7G136210.1	mRNA