Chy6G126510 (gene) Cucumber (hystrix) v1
|
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGTTTGGGGTTTTGAAGAGATTGAATAATTTGTATTATGCATTGAAATTAGGGAAGAAATGGGATGAACTTCCTCCTGGTGATCTATCTTGGCCAATTATTGGTTCTACTCTATCCTTTCTCAAATATTTCACTTTTGGTCCACCAGAAGGTTTCATTGGTGACTTCTCAAGAAGGTATATCTCACTGATCTCTTGCATCCATCCAAATTCTACACATATATGTGAGACAAATAATGATTTTCAAATAAGTTTCCCCACTCTAACTTATTTGAAAACTTTCTTTTACATTATTTTATCTTCCTCAAATTCTTGAATTCATATGTGTGTATATTATACTTTAGCTTGATATCAAGTATACGCGCAATAACTGGTTTCGAGGTATATTATACTACTCAATTACTACAACAAAACACTCTGGGGTGTTTAGAGCACTAAATTGACTATTATAGTAAGTGAGTTTAACAATAATCAACTTGAAAACTTGCTTTTCTTAAACATGTCAGTTAACAATTTTGTTTTTTAGTTTTCAATTCTTGAAATATATGTGTTTTCCCGGTAGTTCTCACCATTCTTTTGAGAAACACTTGAATTTATAGCTAAATTCCAAAAAACAATGTTATTTATTTATTTTTAATTTCTGAAACCATGAAAAAAAATAAGATAATAAAATAATAAATAAATGTATTCTTTATAGATACAAGTTAAGCCAAAATTTGAGATGTTTCCGTGTGTATAATGTCATAAGTTTAGTAGAGAGATATGAATGAACTGATATCATGTCTGAATGAGAGGAAACCTGAGGACACATAAGTAAGGTTAAAAAATACTTAAAAAATGAATTAAAAGTTACTATTTATATCAATAAGGTGCATCTTCCTTTTTGATGACTCGATTGTAGAAACTTCAAAATTAAACGTACTAGAATTTTTTCTAAGACGAATTCCAAATCCTCGTCTGAATTCTATGCCTAGACCATTACACGGTGTCAACCTTTTTCTTATATCAATGCATTTTTGGATCGAGATATGATGAAGGAGCTTAAGAGTTGTGTTAACTGTCAATTTAGTTGAAATGTCCAAATACACTATTGATCTTTCGATTTTAGTAACTCTTTTAAAAATAAAGTTTAAACTCAAATTTGAAAACTAAAATCCAATTAGCTTAATTTTTTCAAAACCAAATAATTATCTAAAGAACATTCATGAGTCGAGAACGCGGATTCACTATAAATACGTCATGATTGAAAAATTGAAATAGTTAGTCAACCCGTTGGCAACAGTTATATTTTTGTTTTGGAGATTTGAAATTTTTGTTTATGTTTTCTCACAATTCTCCTTTTGTCAATGATAGTTTCATCTTTCTCAAGAATATTCTTTGTCATATTTTAATAGCCAAATTCCCAACTAATAGTTTATATTTTCTTTAGTAATTTTCAGTTCTCGAAACATGATTTTGATTTGGAGAACATCCTAAAAAAGAAATAGATCGAAAAGCAACTCACACCCAAATTGATGGTAATTATCATGATAGTAAATAATAAAAAAGTATTTTGATGGACTATTTTATAAAAAAGAAAAATTATTTTTTCTTTCTCTATTTTTTAAGCATTTAATACGATGTTCATTTTAAATAATAATTTACTAATAATGATAATCATGTTTGAATATAAAAAAAAAAACATTGAAATTAAACATGGGATCGTTTGGGGAAAGGGTTGATTTATAGAGGGTTAATATTATGATAATTATAATATTATCATAAAATTAGTGTTATGACTTAATGTATTTAAGGCAAGGGTTATTATAGGTAGTTTTATGATAATAGTGTTTGGGGGAATGACTATGATCATAATTAGTGTTATGATAATATGCATTTGGGAAAAGATTATGATAGTAGTGTTATGATTTTTTTAATGTAAATTATGTTCGTATTCTCAGGCATAAAAAATCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTTCTTCTGGGTCTTTTAGTAGTTTTCTTGTGCCAAAAAAAACAGTCTTCATTCAGTAACTTTTCGTTTTCATTTTTTATTAAAATTATTTTTACAATTTCTTTTATAGTATTTATTAATTTTAATGCTTATTTTCCTTCCAAACTTTCAACACTAAATAAAATTGAACTTTTTAGTTAAATTCTAATTCTAATAATGAAAACAAACCCTTTGATTTATTTTTGTGGCAGTATCTCAAATTTTGATTCAGTAAAATAATAGGAAAAAATAATAACAAATTATCGAAACCTGTGTATGCAAATAATGTTTATTAACTTAATTTTAATTTTAAAAGATAAACAAAAAAATCTTAGTTGATTAATCATTTTGTTATTTTTTAAATTAAGTAATGTTTCTTAACTACGAGAATGAAATTAATAACCAAAATTTAAAAATAATAATAATAACAAATTCTTAAAAACTATATTTTTCTTCAAATTTCAACTTAATTTTTTTGAAATATTTGTAAAGTGGGTAACTAGTTAATAAAAAAATGTTCATAAGCTAAATATTTATAAAAGAAACAAAAATAAAAAACCAAATGATTATTTGTATGAAAGGGTCTAAATCTTTTACTTTTTATTTTTTTCACAAAGATAATTTTATAAAATTAATTTTCTTAACTCTCTTCTTTTAAAATTTTAATGTCCACACATTAGTATAATAGAGTTGTAAAAAATTAAAAATAAAGACAAAGGTGAGTCATGGAGGAAGGTTAGGGGTTGAAATGGGATTAGGATAACCCTAATCCCCCTCTTATGCTGACACTCACCCAAAACAAGGAGTGGACTATAAAACCCACTCTAATACTTCACAAACCCCCTCCCAAAGAGTCCCTAATAAGATTTTATAAACACATTTATATAATGAATCGGATAAAAGTATCAATATCTATCTCTAATAAATTATAACATTTTAAGGAGTTTTGTCATTTACAATAATTTTTTTATATGTGTTTTCTTTTAAATATAATTTTCAAACACTCCAACCCATGTAATATGGAAAAAAATATTCATATTCTTATATTGTCCTCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTAAAATTTGTTATTCTTTTATGTATGAGAGTTATTAACGTGTGAAAACATTATTAGGACATTTCGTTACCAAATGTTAAAAACATTTACTAGAATATTAATATATTAATGACCATTATAATCTTTTACTTTCTACCATGTATAGATTTTTTTTATGAAAATACTTACTGAAATAAAAACTCTTACACTATAAAATAAAACTATAGAATATTGATTAGATGTTGAAAATATTGTATGTTTTAGTTCTTTTAAGTTAAAACTACGAGATTTCATCTGTTTTTGAGTAGTTACTTACCGAAGTTATTAATCTTCTTTTTCCTTTTCTCTTCTTTGATTAGATATGGGAAAGTTGGTATGTACAAAACTCACATATTTGGAAAACCAACTATAATTGTCTGCAAACCTGAATTATGTCGTCAAGTATTAACGGATGAAACTAAGTTCATTCCTGGTTATCCCACAACCATGAAAACCTTATTTGGTAAAAAATCACTGCATGCAGTCACGAAGGAGGAGCATCGGAAGCTCCGACGGCTAATAACGACACCGATCAGCAGCCACGCCGCACTCGAGATGTACATTGATCATATTGAACACACAGTGATTAGTGGGTTGGAGGAATGGTCAAGCATGGAGAAGCCATTGGAGTTGTTAACAACGATAAAGCAACTTACCTTCAAAGTTATTTGGAACATTTTTATGGGTTCAACTCCAATAAAAAGCACTTCTATAAGAGAAATGGAGACTTCCAATGATGATATTGTACTTGGGTTCTTCACTATGCCAATCAACTTTCCTGGCTTCTCCTTCCATAAAGCACTCATGGTAAGAACAAAAATCATTTCTAATACAAATGTGACATAGTCTCACTTTTAATATATATGTGACATATATTTTCAATCAATCTACTTTACGATAATATTGTACAATATCGTCATATGATATAATGAAAAGAAATGTATAAATTATATATAGGCTAGAAAAAGATTGCAAGAAACACTTCAATCAATTCTGGAAGAGAAGAGAACGGTGAAGAAAAGCAAAGGGGAAAATTGGGAAGCAAAAGATATGATGGATTTGTTGATGGAAGTGAGAGATGAAGATGGTGAAGGATTTGATGATGAGACCATTACAGAGATGATTTTTAGTATGCTATTTGGAGGCCAAGAGACTTCAGCTTTCACTTCAATGTGGGCAATTTTGTTTCTTACAGATAATCCACATATATTCCAAAAGGCCAAGGTTAGACTCTTTAATTTCTTAACTTATACGTTTAAATTGTGCAATAATGTTTATGAGATATAAATGAAACTTATTTAAGATATATATGATCAAGGTTTAGACTATAGATATCGACAATCTAAAGGTATGCTATTTTGATTTTGAGATACATGAATAAAGATGTCATGGATATGTCAATCTAGTTGAGATATCCTAGTGTATCTACCGTTTCTCATTCCTGGTGTTTTTTTCAATAAAAGAAAAAAAAGAAGAAGAAAAGCATAGTTGTTTTGGTTGTTTGAAAAACTATATTGACAGAAATATTGAACGTTGCTTTTATAAAAATATGAATGAAAGTGTATCATTAAAATGTTGATGCCGATGGACGTTCCTTAATAAATTATAAAAGTAAAAGAATAAAAAATAAATTTAAATTTGTAAATAAACATATTATGATATTTAAACCAGACCAATAAGTATGTTTATTATTATTTATATTATATTTAACATAAGTGACATGTTAATGTTTATTTTCTTAAGTTCTAGGTATCATTCTACAATATTATTCACTTCTCATTTTTATTGAAATGTAAAAATAACAATAGGTCCATGGAACGGAAAAAAATTTAATACTATGAACATATGATCACAAAGTGGATAGCAATAGTAATCTAGTGTTTTTTTTTATTAATTTTATTATTATGAAATAAATTATTATTTTGATGGTTAAGTTTAAGAATTGATTTTAGGAAGAACAAGAAGATATCATTAGAAGAAGAGCCTCAACACAAAAGGGTGTAAGTCTCTCGGAGATTAAACAAATGAAATTTCTTGCTCAGGTATTTTTATTTTATTATTAATTTCCCTTTGCATGCTTTTATTTGATCCTTTTTAGGCACAAAATCATATATTAGCTTTCGGAATCGAATATAGTATATATGTTCTAAATCTCTTTTAATTTTGAAGATTAATTTTGGTTGGTTATGAATTTTGATTTCATAATGTCTTTAAATCCTTTAACATAAAAAAGAATTACACTACAAGGATTTGGTAAACTCCTGACGCCATAAATCGTCGTCCATGTATAAAAACGCGTCGGGACAACCTCTCCCAACGTCAACGTTCCGTCGGGCGTATTACGTTGGGAGAGCAATTTTTGACGGGCAAACGGGACAACTTCGAGAATGCCTTATCCCTAACGTTGTCAAGGTCGACAAGTGACCTACGTCGTCTCCTCTATGTGTCTGGCGTAACTTTCTTCTGACGTGAAGTCGGGAGAAGCTTTCCCAGACAGATTTTTCATGACGTCGGAGAATCACTTATTCCTGATGAACAAGCAATGTCAGGAGACCCCCCCATTTCTCGACATTGGCTGCATGATGTCGGGGAATAGGAAATAATTATTTAATTGTTTTTTTTTCCGACATGGTCAATGTTGACGTCGAAAATGAGGACCACATGTTCGACGTTTGTGTGCATTGGGTCGGGGAAAATACAAAGAATTAAATATTAATTTCTCTTTTTTTTTTTCCGATGTGGCCAACATAACGTCGAGAATAGAAACCACATTCCTGACGTTTGTGTGTATTACATCGGAGAAAATGTAAAATTTAAATATTAATTTCTCCTTTCCCAACTTCTTAAATCGTGACGTCGGGACTAGCCATCTAGGCTGCCAATGTGTAATTTACGGCATTGGGGGAGTCTCTTTATTTCAATTCCTCTTTTGCTAACGCCTTTTTCTGCTTTGGGAGAACCCCAAATTCTCGTAGTGTTAGTGTTAAAGTTTTACATGATTAATTGTTGGGTTTTTTTACGGGTGATCCGTTCACATGTGCCTTTTATTATTAAGACTTGCCCTTGTCACAAGTTCATGAAATATATTTTTTTTATCAAGTAAGAGCAGGCCACCACATTTTTGTTAAGGATAACCATTTGTATCGTAGTGGTAATTAGTTAGCGATGACTATCTATTGCAATTATACACGGCATAAAAATTGTGTTTTCCTCACCCTATTTTCACGTAACCATATCCCTAATGCCATAAAAACTGATTTTCATGAATGTTTTACCCTATATTTATGGAATATTCTAACAAACTATGATAAACATAAATTCCATAGAGATGGTCAACCTTAACACAATAAGAAGAAAGTTAGAATACTTAAAAAATTGGGAAGGGTTGGGTCATTAATTATAAATGCTCTTGTGAAAACTAGTTCTAACACAACTAGTTCTAACACAACTAGTTCTTACAAATAATCATAACAAATAAATTTTCAATAAACACCGTCAACAAGTATCTAAATATAGTAACTAGCATTGCTACTGTATCGCTCAACTAGAAAGCGTTTTGTAATCTCTCTTATATACTCTTTTGATCAACTTCTCTCTAGTTTGTTTTGTACCTTTCCATAGATCAATGATATTGCTTTTGGTCTTTGGGACGTAATGAGGGTGCTATAGAGATGTCAACCTAGATGAGATGTCTCGATGCACCCCCGATCCTCTCTTACCTTGTATATATTTTCAAAATCGAACTAGTAATAGTGAATTTATATAACTTTTAATTCTATATATATTTTGTATATTATCCAGGTTATAGATGAGACGCTTCGTCTAAGTAGTATTGCATTTGCTACTTTTCGTGAGACAACAGTAGATGCCAAAATTAACGGTTAGTCAACAAATAAAAGAATTTATCTCGATCGCTATATTTTTCTCATTCATCCCAAATTAATATTTTTCCTATATATTGAGTAATTGTAATAACGACCTTGTATTATGTTTTTAGGTAAAATAATACCAAAGGGATGGAAAGTCATACTTTGGCTTCGAGAGCTTTACATGGACGAAAAACTACATCCTTCCCCTCAACACTTCGATCCTTCAAGATGGGATGTATGCAATTATTAAACTCTACTTAATTATTTGCATATTCTTTTATTTTCTATTTGTGTTTTTAATTTTTTTCAGCCACTAATCTTTGATTTAGATGCAAAATATAAATGGACTAAATTTAGCATGTCTTCTAGAAATGATATATATATATATATTAGTCCTAAGTTTTGAATGTAATTTTATTGGGAGTCTTTTTTTATATTTATTTACTGTCACCATGATAGAAAGAATTTGAACTGAGGCTTTTTGTCCTCGAAAACATACAGATGTCAGTTAAACTAAGCTTATGTTTGGAAATACTATCAATTTCATTGATAAATAATAACATTTTGTTATATTAATAAATATATATTTTTGATTCATTTTGCTATATTTGAAAACATTTTTCTTACTTATATTTTTCAACAGAATTTTATAGGAAGTCCAGGTGCTTTTACTCCCTTTGGATTAGGAGTTAGGATGTGCCCGGGACGTGATCTAGCAAGAATCGAGATCTCAATTTTCCTTCATTATTTTGTCCTCAACTACAAGTGAGGTTTGGGGTTTTGAAGAGATTGAATAATTTGTATTATGCATTGAAATTAGGGAAGAAATGGGATGAACTTCCTCCTGGTGATCTATCTTGGCCAATTATTGGTTCTACTCTATCCTTTCTCAAATATTTCACTTTTGGTCCACCAGAAGGTTTCATTGGTGACTTCTCAAGAAGATATGGGAAAGTTGGTATGTACAAAACTCACATATTTGGAAAACCAACTATAATTGTCTGCAAACCTGAATTATGTCGTCAAGTATTAACGGATGAAACTAAGTTCATTCCTGGTTATCCCACAACCATGAAAACCTTATTTGGTAAAAAATCACTGCATGCAGTCACGAAGGAGGAGCATCGGAAGCTCCGACGGCTAATAACGACACCGATCAGCAGCCACGCCGCACTCGAGATGTACATTGATCATATTGAACACACAGTGATTAGTGGGTTGGAGGAATGGTCAAGCATGGAGAAGCCATTGGAGTTGTTAACAACGATAAAGCAACTTACCTTCAAAGTTATTTGGAACATTTTTATGGGTTCAACTCCAATAAAAAGCACTTCTATAAGAGAAATGGAGACTTCCAATGATGATATTGTACTTGGGTTCTTCACTATGCCAATCAACTTTCCTGGCTTCTCCTTCCATAAAGCACTCATGGCTAGAAAAAGATTGCAAGAAACACTTCAATCAATTCTGGAAGAGAAGAGAACGGTGAAGAAAAGCAAAGGGGAAAATTGGGAAGCAAAAGATATGATGGATTTGTTGATGGAAGTGAGAGATGAAGATGGTGAAGGATTTGATGATGAGACCATTACAGAGATGATTTTTAGTATGCTATTTGGAGGCCAAGAGACTTCAGCTTTCACTTCAATGTGGGCAATTTTGTTTCTTACAGATAATCCACATATATTCCAAAAGGCCAAGGAAGAACAAGAAGATATCATTAGAAGAAGAGCCTCAACACAAAAGGGTGTAAGTCTCTCGGAGATTAAACAAATGAAATTTCTTGCTCAGGTTATAGATGAGACGCTTCGTCTAAGTAGTATTGCATTTGCTACTTTTCGTGAGACAACAGTAGATGCCAAAATTAACGGTAAAATAATACCAAAGGGATGGAAAGTCATACTTTGGCTTCGAGAGCTTTACATGGACGAAAAACTACATCCTTCCCCTCAACACTTCGATCCTTCAAGATGGGATAATTTTATAGGAAGTCCAGGTGCTTTTACTCCCTTTGGATTAGGAGTTAGGATGTGCCCGGGACGTGATCTAGCAAGAATCGAGATCTCAATTTTCCTTCATTATTTTGTCCTCAACTACAAGTGA GGTTTGGGGTTTTGAAGAGATTGAATAATTTGTATTATGCATTGAAATTAGGGAAGAAATGGGATGAACTTCCTCCTGGTGATCTATCTTGGCCAATTATTGGTTCTACTCTATCCTTTCTCAAATATTTCACTTTTGGTCCACCAGAAGGTTTCATTGGTGACTTCTCAAGAAGATATGGGAAAGTTGGTATGTACAAAACTCACATATTTGGAAAACCAACTATAATTGTCTGCAAACCTGAATTATGTCGTCAAGTATTAACGGATGAAACTAAGTTCATTCCTGGTTATCCCACAACCATGAAAACCTTATTTGGTAAAAAATCACTGCATGCAGTCACGAAGGAGGAGCATCGGAAGCTCCGACGGCTAATAACGACACCGATCAGCAGCCACGCCGCACTCGAGATGTACATTGATCATATTGAACACACAGTGATTAGTGGGTTGGAGGAATGGTCAAGCATGGAGAAGCCATTGGAGTTGTTAACAACGATAAAGCAACTTACCTTCAAAGTTATTTGGAACATTTTTATGGGTTCAACTCCAATAAAAAGCACTTCTATAAGAGAAATGGAGACTTCCAATGATGATATTGTACTTGGGTTCTTCACTATGCCAATCAACTTTCCTGGCTTCTCCTTCCATAAAGCACTCATGGCTAGAAAAAGATTGCAAGAAACACTTCAATCAATTCTGGAAGAGAAGAGAACGGTGAAGAAAAGCAAAGGGGAAAATTGGGAAGCAAAAGATATGATGGATTTGTTGATGGAAGTGAGAGATGAAGATGGTGAAGGATTTGATGATGAGACCATTACAGAGATGATTTTTAGTATGCTATTTGGAGGCCAAGAGACTTCAGCTTTCACTTCAATGTGGGCAATTTTGTTTCTTACAGATAATCCACATATATTCCAAAAGGCCAAGGAAGAACAAGAAGATATCATTAGAAGAAGAGCCTCAACACAAAAGGGTGTAAGTCTCTCGGAGATTAAACAAATGAAATTTCTTGCTCAGGTTATAGATGAGACGCTTCGTCTAAGTAGTATTGCATTTGCTACTTTTCGTGAGACAACAGTAGATGCCAAAATTAACGGTAAAATAATACCAAAGGGATGGAAAGTCATACTTTGGCTTCGAGAGCTTTACATGGACGAAAAACTACATCCTTCCCCTCAACACTTCGATCCTTCAAGATGGGATAATTTTATAGGAAGTCCAGGTGCTTTTACTCCCTTTGGATTAGGAGTTAGGATGTGCCCGGGACGTGATCTAGCAAGAATCGAGATCTCAATTTTCCTTCATTATTTTGTCCTCAACTACAAGTGA GLGF*RD*IICIMH*N*GRNGMNFLLVIYLGQLLVLLYPFSNISLLVHQKVSLVTSQEDMGKLVCTKLTYLENQL*LSANLNYVVKY*RMKLSSFLVIPQP*KPYLVKNHCMQSRRRSIGSSDG**RHRSAATPHSRCTLIILNTQ*LVGWRNGQAWRSHWSC*QR*SNLPSKLFGTFLWVQLQ*KALL*EKWRLPMMILYLGSSLCQSTFLASPSIKHSWLEKDCKKHFNQFWKRRER*RKAKGKIGKQKI*WIC*WK*EMKMVKDLMMRPLQR*FLVCYLEAKRLQLSLQCGQFCFLQIIHIYSKRPRKNKKISLEEEPQHKRV*VSRRLNK*NFLLRL*MRRFV*VVLHLLLFVRQQ*MPKLTVK*YQRDGKSYFGFESFTWTKNYILPLNTSILQDGIIL*EVQVLLLPLD*ELGCARDVI*QESRSQFSFIILSSTTSX Homology
BLAST of Chy6G126510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BL88 (beta-amyrin 11-oxidase-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490804 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 3.6e-05 Identity = 32/37 (86.49%), Postives = 35/37 (94.59%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G126510 vs. NCBI nr
Match: XP_008448718.1 (PREDICTED: beta-amyrin 11-oxidase-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 1.59e-05 Identity = 32/37 (86.49%), Postives = 35/37 (94.59%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G126510 vs. NCBI nr
Match: XP_040933010.1 (beta-amyrin 11-oxidase isoform X1 [Gossypium hirsutum]) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 3.09e-04 Identity = 30/74 (40.54%), Postives = 40/74 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G126510 vs. NCBI nr
Match: KAG4184887.1 (hypothetical protein ERO13_A09G198700v2 [Gossypium hirsutum]) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 3.10e-04 Identity = 30/74 (40.54%), Postives = 40/74 (54.05%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
|