Chy6G123410 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCAAGGTCTCAACTAACGATTGCAAGAGTGAAAATATCTCCAGGCATTCACTTTTAGTTCTAACCTCTTTTTCTCTTGTATTTTCTTTATTTTTGTTTGTTCACAGATTACAATGTACAAGGACAAATAAATTATATATATATATATCAAAAAAAGGTTAAGAAAGAAAACGGATTGGAGTGCACAGCTTTGGCTTTTCATGTTTTGGTAGTAGTTTCAGTGACTTGATTTTGGTTGCTATGCAGGAAGCGAAAACTTGCAGAACATAGAAAGTCACTTCCAGTAGCTTCCGGTATAAAGCTAAACTCTTTTTCACTTCGTTTCTAAGTTAGTTTTTTTTTTTCCCAAGTTCCTGAGGTTTGTTCTTTACTATTATGTGCTCAGTTGAAAGTTCGCTCATACAAGAGGTGCTTAGAAACGATACATTGATTATCGTTGGTGAAACTGGGAGTGGAAAAACGACGCGTGAGATTTTATCCTCTGTTTATAAATGTTATAACCATATTTTATTACCTTATTTATTATGCTAAATAATTTGTTTTCGATATATTTTAGAAATACCACAGTTCCTGTTTAATGCTGGATTTTGTCGAGATGGCAAAGCTATAGGGGTGACCCAACCTCGGCGTGTTGCTGCTGTAACTGTGGCCAAAAGAGTCGCCGAGGAATGTGGTGTTGAAGTGGGGCAAAAGGTTGGGTATTCTATCAGATTTGAGGATGTAACTTCTAGTTCCACAAGAATCAAGTACATGACAGATGGTCTACTGCTAAGGTACAATATTGAAACACTGCCTTAGTTTTCAAAATGTCATTTCAGTGGATGCGAAGACAAGGATTATTTCTATCTTTTTTTGTTATTATTATTTTTCATTTGATCCTATATTTCTTTCTCGTCTTTCTGTATTCTTATGTTGAAGGTGATACTTGATTTTGAATTTATGTTGTTTCCCTTCTCTTGTTCCATGTAATATATTTTTTTCCCCATATAACTTAGTACAGATAGGGATAGGTGATAAATAAGTTTGTTTGGTTATTATTCATGAAGTGGATTTCTTTATTAGCATACTAATTGTGGCTCTTTGAGATTTAGATATCTTAAGGTAAATGAGGACCTTTTGTAATTTTCTAAATTAGTTATCATGTTGCTTTCATAAATTTTCAGGGAGGCATTGTTGGACCCTTATCTTTCAAGATATTCAGTCATCATTGTTGATGAAGCTCATGAGAGAACGGTTAATACTGATGTATTGCTAGGATTTTTGAAAAAAGTGCAGAAAACAAGATCTAGGTCTTTGAATGACTCTTTTAATACAGAGAATATGAATACTAATGGCCCAGTGTTAGAAAAGGGAAATAATGGCAAATATGTAAGTTCCCTCAGGCAACATCGAGGAAGGAAACTGCCTCCATTGAAGTTAATTATCATGTCTGCCAGCTTAGATGCACGACTTTTTTCTGAGTACTTTAGTGGTGCAAAGGCTTTTCGTGTCCAAGGCCGTCAATATCCAGTAGCTATATCTTATACTCGTAAGCATGTATTAGATTATACGGAGGCCACTCTTATTACTATATTTCAGGTAGAGTGATTAAATTCTCACCTTGGATCTCCATATGCAATTGAGTTTAAGATTTTTTTTTAGTATAGCGATGCGTTTTTTAATTATTATTATTGAAAGCAATAAACACGAAACCAAGGCTTACGTGGAAACCCGAAAACCGGAAGAAAAACCACGATGTTTTTAGTTTTATTATTTTTCTGATAATTAACAATGGTACAAATGAGGGAACTTAAATAGGATGTAAAGAGCAAAGAAGAAAAGGAAAAGAAATATTTATGGTAAGTTTTCCATAAATATTTTTTTCCATATATAGAAATTCTAACACTCCCCCTCAAGTTGGGACGTAAATATCAATGAGGCCCAACTTGCTAACACAAAAATCAAAGTTTGGTCTGAGAAGCCCCTTGGTGAGAACATCAGCAACCTGTTGGCTAGAAGGGATGTACGGAATGCATATGCTCCCACTGTCAAGTATTTCTTTGATGAAATGTCGATCAATCTCAACATGTTTAGTTCTATCATGTTGAACTGGGTTGTTAGCAATACTAATAACGACTTTATTATCACAAAAGAGCTTTAATGGAGTCTCGCATTCCTGATGAAGATCATATAGGACTTTTTGGAGCCAAATTTTCTCACATATTCCCAAACTCATAGCTCTGTATTCGGCCTCAGCACTGCTCCTGGCCACAACACTTTGTTTCTTACTCCTCCAAGTAACAAGATTGCCCCAAACAAAGGTACAATAACCGGAGGTAGACTTTCAATCCGAGTCGGTATATGCCTCAATGGTCTTTCTGCTTGTTTTTCTAAACATCAGCCCTTTACCAGGTGTTGTTTTCAAGTATCTCATAATTCTATTGACAGCTTCCATGTGTTTCTCATAAGGATCTTGCATAAACTGGCTGACAACACTCACAGCAAAGAAAATATCAAGACGAGTATGGGATAAGTAAATCAATTTACCCACACGACACTGATATTGTTCTTCATCAACTGGAACTTGATCATCAGAGTTTCCAAGTTTACAATTGAACTTAATAGGAGTATCAGCAGGATGACATCCCAACATACCTGTCTCGGTTAGCAAATCAATGGTGTATTTTCTATGAGAACGGAGATACCTTCTTTAGATCTGGCCACCTCCATTCCAAGGAAATATTTTAGATTTCCCAAATCCTTGATTTCAAATTCATCACCCATTCTCTGCTTTAGTTGACTGATTTTTACCCCATCATCTCCAGTTAAAACAATGTCATCCACATAAACTATTAGAACAACAATCTTCCCTGTCTTGGAAACCTTTGTAAATAGAGTATGATCAGAGTGCCCTTGACTGTATCCTTGGGACTTGACAAAAATAGTGAATCTGTCGAACCATGCTCTGGGAGACTGTTTCAGACCATATAGGGATTTCTGGAGTTTACACACCTGTTGACCAAACTGGGCTTCAAATCCAGGCGGGTTAACATCCAGCTGGTAGAGAGGCCAATCTTTGTTCACAGCAACAGATAGCAGGACTCTAACAGTATTCAACTTAGCAACTGGAGAAAAAGTTTCTGAATAGTCAATTCCATAGGTTTGAGTAAATCCCTTTGCAACTAACCTTGCTTTGTGTCTGTCAAGAGTACCATCTGCTTTGTATTTCAGAGAGGACACCCATTTGCATCCCATAGTTTTGTGTCCCTTGGGTAGAGCACAAATTTTCCAAGTTCTATTCTTTTCAAGAGCCTTCATTTCTTCCATGACTGCATTCTTCCATTCAAGACACTCTAAAGCAGTGTAGATGTTTTTCGATATTATGGTAGAGTCAAGGCTTGCTGTAAAAGCTCTGAACTGTGGAGAGAGATTATCATAGGAAACATAGTTGCAAATTGGATGTTTAGTACAAGACCTGGTACCTTTTCTCAGAGCAATGGGAATGTCAAGAGAGGGATCATACTCATCAAGTTTCCCTGTATGACCCTGTTCAGCTTCATTATTATCGGTTTTTGACTCAATTTCATCACCACTGTTCATTTCTTCCGCATTTTCAAGAACAGCAACATCAGATTTGTCATTCTCACTTATCGTATTATTAGTACAAGGTTTAGTAGGGTTTTCCATACCTTGATCTCGAGGAGGTTCAGAGTCTTGAACTGGAGCCGGCGGCTGACTAGTAGGGGACCTGACTTCCTTTCTGAGATTCCTCCTATAATACGTTTTCCAAGGAACTTGGTTTGTGGGTAGGACTATGGGATGAGGATCGATGTCAGACACAATATTAGGAGTAGGTTCGATAAATTTAAAGGTGTTGTTAGACTCTTCACTCACACTCTCCCCCTGAAGATGGCTAATGGGAAAGTAAGGTCAGTCCTCACAAAAAGTAACATCCATAGTGACAAAGTATTTCCTAGACGGCGGGTGAAAATATTTATAACCACGCTGGTGAAGCGGATACCCAACAAACACACATGCCTGAGCCCGAGGGGTAAATTTGGTCTGATTAGGGCCAAAATTATGGACATAAGCGGTACACCCAAACACACGAAGAGGAACCTCAGAAACAAGACGAGTAGAGGGGTAGGACTCTTTAAGACAATCTAAGGGAGTCTGAAGGTGGAGAATACGAGAAGGCATTCTATTGATTAAATGAGTTGCTGTAAGAATATCATCTCCCTACAAGTATGAAGGAAGGGACGTGGATAGCATAAGTGAACTGGCTACTTCCAGAAGGTGATGGTTTTTTCGCTCAACCACTCCATTTTGTTGAGGAGTGTAGGCGCATGAGTTTTGGTGAACAATCCCGTTAGAGGTTAGAAATTCACTAAGGCTATGGTTTTGGAATTCTCGACCATTATCACTCCGAAGAATAGCAATTTTTTGATGGAATTGGGTTTCAATGGTGTGATAGAAGTTTTGAAAAATAGAAGAAACCTCCGATTTATCGGTGATAAGGTAGGCCCAGGTAAGACGGGTATGATCATCAATGAAAGTTACAAACCACCGTTTCCCAGATGAGGTGGTGACCTTGGAGGGACCCCAAACATCACTATGGATAAGGGTAAACGGTTGTGAGGGTTTATATGGTTGTGAGGGAAAAGAAACTCGATGTTGTTTTGCCCGAATGCACACATCACAAGATAACGAGGAGACATCGATTTTAGGAAAAAGATGGGGAAACAAATATTGTATAAGTAAAGTTCGGGTGACCCAACCGAAAATGCCATAACATAAAGTCATGTTCAGAAGTGCTAAAATAGGAAGATAGTAAACCAGTCCTAGATATACTACTACCGGAGGTATCATCATCAAGGATGTGAAGTCCCCTACTATGCCGGGCAGTGCCAATCGTCCTCCCCGAGCTCAAGTTCTGAAAACAGACAGATTCAGGTAAGAAAGTAGCTTTACAATGCAGCTCACGTGTGATCTTACTGATAGATAACAAATTGT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ATGCCAAGGAAGCGAAAACTTGCAGAACATAGAAAGTCACTTCCAGTAGCTTCCGTTGAAAGTTCGCTCATACAAGAGGTGCTTAGAAACGATACATTGATTATCGTTGGTGAAACTGGGAGTGGAAAAACGACGCAAATACCACAGTTCCTGTTTAATGCTGGATTTTGTCGAGATGGCAAAGCTATAGGGGTGACCCAACCTCGGCGTGTTGCTGCTGTAACTGTGGCCAAAAGAGTCGCCGAGGAATGTGGTGTTGAAGTGGGGCAAAAGGTTGGGTATTCTATCAGATTTGAGGATGTAACTTCTAGTTCCACAAGAATCAAGTACATGACAGATGGTCTACTGCTAAGGGAGGCATTGTTGGACCCTTATCTTTCAAGATATTCAGTCATCATTGTTGATGAAGCTCATGAGAGAACGGTTAATACTGATGTATTGCTAGGATTTTTGAAAAAAGTGCAGAAAACAAGATCTAGGTCTTTGAATGACTCTTTTAATACAGAGAATATGAATACTAATGGCCCAGTGTTAGAAAAGGGAAATAATGGCAAATATGTAAGTTCCCTCAGGCAACATCGAGGAAGGAAACTGCCTCCATTGAAGTTAATTATCATGTCTGCCAGCTTAGATGCACGACTTTTTTCTGAGTACTTTAGTGGTGCAAAGGCTTTTCGTGTCCAAGGCCGTCAATATCCAGTAGCTATATCTTATACTCGTAAGCATGTATTAGATTATACGGAGGCCACTCTTATTACTATATTTCAGATTCATTTGGAAGAGAGTCCTGGTGACATACTTGCCTTTTTGACTGGGCAAGATGAGATAGAATCTATTGAAACTCTTGCTAAGGAGACAATTCAAAAGTTACCTGAAAGCAAACGGAATTTAGTAGTTATACCTATATATTCGGCACTTCCATCGGAGCAACAATTGCGAGTTTTTGCCCCAACTCCACCTGGAGTTCGTAAGGTGATATTAGCGACAAATATTGCTGAAACATCTGTGACAATACCTGGAATCAAGTATGTTATTGATCCTGGATTTGTAAAAGCGCGCACTTATGATCCAAATAAAGGGATGGAGTCGTTGATTGTTTTTCCAACCTCAAAAGCACAAGCACTACAAAGGAGTGGGCGTGCAGGCCGTGAAGGACCTGGAAAATGCTTCCGTCAATATCCTGAGGATATGTTTTATAAACTTGAGGATTCAACAAAGCCGGAGATCAAGAGATGCAACCTTTCTAATGTCATCTTACAGTTGACGGCTTTAGGTGTTGATAATGTCACGGAATTTGATTTCTTGGAAGCACCACCAAGGCAAGCTATTTTCAAGTCGTTGGAGCAGTTGTTTCTGCTTGGGGCTATTACCAATGACGGCAAACTAAAACTATCTGATCCAGTTGGACATCAGATGGCTCGTATTCCGTTAGATCCAATATACTCTAAAGCTCTGATTGTTGCCAGTCAGTTCAACTGTTTGGAAGAAATGTTGATAACTGTGTCAATGCTGTCAGTGGAATCCATTTTTTACCATCCTCGTGAAAAGCAAGAAGAGGCAAGAGCTAAAATGAAATGTTTTTCAAGTCCAGAAGGTGATCATCTCACTCTAATCAATGTTTATCGATCTGCTGTGGACTTTTTGAATAAGAAAAAGTTGGAACTTAACAAAGAAAAATTGGAGAAAAGCTTGAGAAAGTGGTGCAAAGAAAATTTTATCAATAGTAGATCTTTGAGACACGCACGTGACATTCACAGTCAAATTAGACGACATGTTGAACAAATGGGCCTTCCTCTTAACTCTTGTGGAGATGACATGCTTCAGTTTTGTAGATGCCTTGCTGTTTGGTGGCATACAACATTGGACTGCTCCACTCCAGAAGGAATGAGATCATCCCAGTGGACATTCAAATCGCTTTTTCCACCACCTTCTCCATCTTTTGGAATCAAAATTGAAATCAGAGATGGGATCGGAGCCAATAGAGAATTCCTGTGCCCACATAGTGAAAGTTCTTCATTTTGTATTCTGGGACTGTTTGGCAGCTGCAATCGTTATTTAACATTCAAAAGGATTCACCCCACAGAAAAACTAGAAGGTTCTTTAGAAACAATCCCAACTGGGGGTTTTGCCATAGAGAGCATGGAGAATTTTGGAGCTGCTTCTTTGAGGAGTAGAAGGTTAGAGAGCTACTTCAATACAAGTTCTGAACCAAATAAGAGAGAAGTCCCAAAATATTCCGTTGATGAACAGATACCAAAGAGGGAGAAGACTTATATATATGTGGATGATAATGGGTGGAGTTCTGTTTTGATATCCTGTTTCAGAATTGTCTTTTGCTTTCTGACTATGATGGTTACTACTTTCGTTTGGGCTCTGATTATGCTTCTGCTCCTGCCATGGCCATACCAAAGGATTAGACAGGGCAATATATATGGCCATGTGACTGGCAGATTACTGATGTGGATCCTTGGGAATCCAATTAAGATTGAAGGTTCTGAGTTTTCAAATGAAAGGGCCATTTACATTTGCAATCATGCATCACCTTTGGATATTTTTCTCATAATGTGGCTGACACCCACAGGTTCTGTTGGCATTGCAAAAACGGAGATCATATGGTACCCTCTATTTGGACAACTGTACATTCTCGCTAACCATCTTCGCATTGATCGTTCAAATCCAGTTGCAGCAGTTGAGTCCATGAAACAGGTAGCTCGAGCAGTTGCGAAAAATAACTTGTCCTTGATCATATTCCCTGAGGGTACTCGGTCTAAGGATGGAAGGCTGCTTCCCTTCAAAAAGGGCTTTGTCCATTTGGCATTGCAAACACAGCTGCCAATAGTTCCTATTGTCTTCACTGGCACTCATCGGGCATGGAGAAAGGGCAGCTTACGTGTACGACCAGCTCCTCTAACTGTGAAGTATCTTCCTCCAATACAAACCAACAATTGGACAGTGGAAAAGATCGACGAATACGTGAAAACAGTACACGAAACTTATGCCAAACACCTACCAGAGTCGCAAAGACCTCATCAGTAA MPRKRKLAEHRKSLPVASVESSLIQEVLRNDTLIIVGETGSGKTTQIPQFLFNAGFCRDGKAIGVTQPRRVAAVTVAKRVAEECGVEVGQKVGYSIRFEDVTSSSTRIKYMTDGLLLREALLDPYLSRYSVIIVDEAHERTVNTDVLLGFLKKVQKTRSRSLNDSFNTENMNTNGPVLEKGNNGKYVSSLRQHRGRKLPPLKLIIMSASLDARLFSEYFSGAKAFRVQGRQYPVAISYTRKHVLDYTEATLITIFQIHLEESPGDILAFLTGQDEIESIETLAKETIQKLPESKRNLVVIPIYSALPSEQQLRVFAPTPPGVRKVILATNIAETSVTIPGIKYVIDPGFVKARTYDPNKGMESLIVFPTSKAQALQRSGRAGREGPGKCFRQYPEDMFYKLEDSTKPEIKRCNLSNVILQLTALGVDNVTEFDFLEAPPRQAIFKSLEQLFLLGAITNDGKLKLSDPVGHQMARIPLDPIYSKALIVASQFNCLEEMLITVSMLSVESIFYHPREKQEEARAKMKCFSSPEGDHLTLINVYRSAVDFLNKKKLELNKEKLEKSLRKWCKENFINSRSLRHARDIHSQIRRHVEQMGLPLNSCGDDMLQFCRCLAVWWHTTLDCSTPEGMRSSQWTFKSLFPPPSPSFGIKIEIRDGIGANREFLCPHSESSSFCILGLFGSCNRYLTFKRIHPTEKLEGSLETIPTGGFAIESMENFGAASLRSRRLESYFNTSSEPNKREVPKYSVDEQIPKREKTYIYVDDNGWSSVLISCFRIVFCFLTMMVTTFVWALIMLLLLPWPYQRIRQGNIYGHVTGRLLMWILGNPIKIEGSEFSNERAIYICNHASPLDIFLIMWLTPTGSVGIAKTEIIWYPLFGQLYILANHLRIDRSNPVAAVESMKQVARAVAKNNLSLIIFPEGTRSKDGRLLPFKKGFVHLALQTQLPIVPIVFTGTHRAWRKGSLRVRPAPLTVKYLPPIQTNNWTVEKIDEYVKTVHETYAKHLPESQRPHQ* Homology
BLAST of Chy6G123410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IE66 (Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RID1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 833.2 bits (2151), Expect = 3.2e-240 Identity = 417/612 (68.14%), Postives = 509/612 (83.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O42643 (Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase prp22 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=prp22 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 537.0 bits (1382), Expect = 4.7e-151 Identity = 293/616 (47.56%), Postives = 389/616 (63.15%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54F05 (ATP-dependent RNA helicase dhx8 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=dhx8 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 530.4 bits (1365), Expect = 4.4e-149 Identity = 285/600 (47.50%), Postives = 387/600 (64.50%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q14562 (ATP-dependent RNA helicase DHX8 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DHX8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 4.9e-148 Identity = 284/598 (47.49%), Postives = 386/598 (64.55%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2A4P0 (ATP-dependent RNA helicase DHX8 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Dhx8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 4.9e-148 Identity = 284/598 (47.49%), Postives = 386/598 (64.55%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L7N3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G077650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1179.5 bits (3050), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/626 (96.96%), Postives = 612/626 (97.76%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CJ82 (pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501587 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1153.7 bits (2983), Expect = 0.0e+00 Identity = 592/626 (94.57%), Postives = 604/626 (96.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EVL1 (pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111438478 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1095.5 bits (2832), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/626 (89.30%), Postives = 586/626 (93.61%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BSZ3 (Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold925G00290 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1090.9 bits (2820), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/585 (95.90%), Postives = 572/585 (97.78%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JAN7 (pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483262 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1089.7 bits (2817), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/630 (88.73%), Postives = 586/630 (93.02%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. NCBI nr
Match: XP_004152927.1 (pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 [Cucumis sativus] >KAE8650135.1 hypothetical protein Csa_011662 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1177 bits (3044), Expect = 0.0 Identity = 607/626 (96.96%), Postives = 612/626 (97.76%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. NCBI nr
Match: XP_008463416.1 (PREDICTED: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 [Cucumis melo] >XP_008463417.1 PREDICTED: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 [Cucumis melo] >XP_016903035.1 PREDICTED: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1151 bits (2977), Expect = 0.0 Identity = 592/626 (94.57%), Postives = 604/626 (96.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. NCBI nr
Match: XP_038904722.1 (pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1113 bits (2880), Expect = 0.0 Identity = 573/626 (91.53%), Postives = 595/626 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. NCBI nr
Match: XP_038904721.1 (pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1107 bits (2863), Expect = 0.0 Identity = 572/627 (91.23%), Postives = 594/627 (94.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. NCBI nr
Match: XP_022932160.1 (pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 [Cucurbita moschata] >XP_022932161.1 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1093 bits (2826), Expect = 0.0 Identity = 559/626 (89.30%), Postives = 586/626 (93.61%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. TAIR 10
Match: AT1G26370.1 (RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 833.2 bits (2151), Expect = 2.3e-241 Identity = 417/612 (68.14%), Postives = 509/612 (83.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. TAIR 10
Match: AT2G35340.1 (helicase domain-containing protein ) HSP 1 Score: 510.4 bits (1313), Expect = 3.4e-144 Identity = 279/603 (46.27%), Postives = 379/603 (62.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. TAIR 10
Match: AT1G32490.1 (RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 509.2 bits (1310), Expect = 7.5e-144 Identity = 276/599 (46.08%), Postives = 382/599 (63.77%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. TAIR 10
Match: AT1G32490.2 (RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 509.2 bits (1310), Expect = 7.5e-144 Identity = 276/599 (46.08%), Postives = 382/599 (63.77%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G123410 vs. TAIR 10
Match: AT3G26560.1 (ATP-dependent RNA helicase, putative ) HSP 1 Score: 508.4 bits (1308), Expect = 1.3e-143 Identity = 275/611 (45.01%), Postives = 379/611 (62.03%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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