Chy6G122440 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAAAATCTTGGTAAACAATTTGAAACGTAATTAAGAGGGTCCTACTTTGGTAATTACGTTATATCTTCTGTGAACATGACTCAAATTCATAAAAAACTCCAAAACTACCATGGTTTGACGAAAGTAACATTTATTATGGTACATGCATTATTGGTTAAATCAATTCATCCACGAACTTTAGTTGAATTATCCTTAACTCCAAACTTTAGTTTAATTATCCTTTAACTTTATTTAAGACTAAACTATAGTTGAATTATCCTTCTACTTTATTTAAGATTGAACGGCTAAACATATACTATATTTTTTATTACAATAGAATAATCTAATTCACACAAACACTATGTTATTAGTGCATTCGAATGTCAATAATCTGAAAGTAGAATAATCTAATTCACAAACATCATGTTATTAGTACATTCAAATGTCAATTGAGCTAAACTCTTGTTTATTGTAAAATAGATAATATTATTATACAAAACATTGTAATTTTTTTTTATTTGAAAAAGTCTTTTTTAAGTATAACTTGTGGATGAGAAGATTTGAACTTGGGACCTTAAAAAACAAACAGAAACAAACAGATATTAGTTAAGCTAAGCTTATGTTGATAAAATATTGTAATTTAAACATACAAATTTACAAAATTTTAGAAATTTGAAAAGTAAGTTGATACAATATGAAAAAACAGGAATGGAAGTGGAGACTAATTAAAATTTATGTATTAGGATTGAAAATAAGACCAAATATTTATTTTAAATCACAAAGGTCGTCATGAATTAGTTGGAAGAATGAATTTTTCCAAATTGTAATAAATGGATTTTAGACCATAGGGAAAACACGTCTCCATCAAAGATATGTTCCCTATCAACTCAATCAAATGTCTTTCTAACAAAGAGTATATTCTATCAAATTAGGTATATATATGTACCTTAATGTGTTAAATTAAACAAGTTCGATTGTACTCCTTCTTTTAACTATATTTAAACATCAATCCAACAATATCCTCAACTTTTGTTTTACTTCATAATGTCTCTGTTGTATCTTAAAAAAAAAAAAAACAATTAATACCTATGGTTAGACATTTTGATTTAGTTCATCTTCTCCTAAATCTAAAAGAATATTAAAAAAAATGTTAAAGCGATGCTTCTATTCTAAAATTGTTGTTAATTCACTAATGAGTTAGATTAGTAAATTTATTGTCATCCAATTTTAACCTTTCACACAATGGAAAACTACAATTAAAGATGTCAATATGCATAATTAAGTGAATTAAAAATTTATGAATTCGGAAGGAGTAGGTGTAAAAGTAGTAGAATTCTAAAAGTAGTAGAATATGAATTGAATGAAGAGGGCGATGAATAGAAAAATTGACAAGTTATCTTTGAAGGAGAAATTTGAAAATTTTCTTAGTCCTTAAGTCATATTGGGGTTTATTTCTTAGCCAATAAAAGCTCTTTTGTTGCAGTTTAATTGAAATAATTGTGACAGAAAGCACTCTGTGCTATGGACACATTTATTGTTAGTGATTGTGAAGCTAATTAAATTTTAATATGTTCACATTAAATATTTAACAAATTTATATTTATTATTTAGCTTTATATGAAGAGCGCCTAAATTACCTGTATAATCTTTATAAATTAAACGTTTAGGTTTGGATCGAATAGGTTTTCTTACAGAAAATTTTAGATACAAATGACTAATTGACATTAATCAAAATTGATCAGAAATTGCACCCTAACATCAAGATGAGTTTGAGAGAGAGAAAGTGGTTAGGCAAAGGTGAACACACACGCTCGACTTTGTCCAAGGTTAGTGTGACGACCCGGACTTTTCTGACTGACCGTCTAAGTCGTCAATTTGACACAAAACCGTTTGTTGACGAAAAACATAGTAACTTTTAATTGAAACCATATGAAATCGAACGAAAACATTTAATCGGGCCCTATTTCAAAATATGAACTTTTAAGGTACTGGTTACAAAACTTTAACTATTTGTAAATTCAGTTCAACAAAACGTTTATATAAAAAAAATCGTCAGCGGAAGCAGTTTAAAGGACAATCTTCTATGGCCATTCACGAGTCCTTCTTGTCCCTCGTCGGTCTGCCCCTTGTATTACCTTTGCCTGAAAAGTTAAACATAAAAAGGGGTGAGTATTAATATACTCAGTAAGGGACCCACTACTGGTCCCGTTCGGGGAAAAATAAATTATTAGTATCCTATGGTGTACCCTGCACAGTCACAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATAGGGGATAATCCCGAAGGACACCCGCAGGGTAACTATCCACTAGGAAAACTAATAATTTATCCCCTCAGTCCATTCTATACTTCTTAACAGTCACTTTACAACTAAATCAAACGTCCTCATCACGTGAACTTTCCCCTTAACCTCAAACAACCATTTTTATTCCAATTCAACCCGAGGACAGTCGACACATATCGCTACATCAGTCAGCCACATAAATAGCCCAGCAATCACGACATACGTTAGACAACAAGTTCGCATCAATCCAACATTTATATAAAATTGTATTCAGTCAACACAATATACATTAACCTTCAGTCCACATCCAAACACGTAACATAAACATCATCCAAATTCAGTCAGCACAATATACATAAACTTCCAGTCCACATTCAAACATATACCTCATGATCGTTATTCCTCCTCAGTATATCAGTACAAATCATACAGCCAATACATCCAAATAATATTTATTGAGTCCAGTAGAAAGTCCCTTACCTCACTCTTATGCGACTTCTTCGATCGAACTAAGTCCAATAAACCAAATCCCAAGTCGATGGAAAATCGAACTCCACTTCAATCCTCTGGAAACATCAAGGATTCATTCCTTGATTCAATATGTACCTTCCAAAAATTTTAGCACATTAAGCTCAACGGTTAACATTTAACGATAGGTACAACGGAACCCACACTTTATCCTTACCCAAATCTATCACCCAAAGGTCCACGGCTGGGCGGAGAGAGACGGCGGCGCGTGGGTCACGGCGGCGCGTGGAGTCACGGCGGCGCGTGGAGTCACGGCGGCGCGTGGAGGGCAGCGGGCGGCAGAACGTGCAGATCCGGCGTCGGCGTGCGGCTGGGGAACGGCGGGACGTGTAGATCTGGCGTCGGCGTGCGGCTGGGGAACGGTTTCGCCGGTCGGACGAAAGGAAGGGCAGATCTGGCGGCTGGCTTCGCGGCTGCGTGTGGTGGGGATTCGCGGACAGAGGCGGGGCGCAGACGAAGGCAGACGGCGTCTGCGTGAGGTTCGTCGGACGGTGATGCGGCGCAAGGCTTCGCGAACCGGACGGGTGGCGCGAGGAAGGAACGGATCTGGGCAGACGGCTACGGCTGTGTGCGGTGGGACTTCGCGAACAGAGGCGCGGCGCGGCGCGGCTGCTGCGGGCGACGACGTGGGAGGGGAGGCAGTGCGGCGTGCTACGCCGGCGGGGCTTCGAGGGCAGAGACCGAACGGCGGCGGCTAGGGCTGGAGAAGAAGGAGAAAAGGAAAGAAAATGGAGGGGGGGGGGCCTGCACGCGGGGAAGAAGAAGGGAAAAAGAGAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAGGGAAAATAATTATTAAATTTTAATAATAAAATAATATTATTTTATTATTAACCTTTTTTTTTTTTTTTCAAGGGCGTTACAGTTAGTCTAGCAAAATGTCACATCAACATAGTTTGATTGGAAGATGATTTTGATTTGAGTTCACGTTTACCCTATGTGAAATGGATATTCAATAATGATAATCTAAAACGTAGAGTCAAATATATTTGATTATGTTTGTTATTGATTATCTATGTCCCCGTAAACATAATAGTGGAACTATGATGCATGCCTCCAAATATGTAATCAAAACATGCACTCTAAATTGAGGAACAACACAATCTAATCTAATCATGCTTGAAAATTATGTAGAACCTATCACCTTTTTCATTATCGATACAAGTATTGTTCTTGCAACCGTATGAGAATTGTGAATTTGTTGCATTTCTCTATAACTTTACCTTTACCAATATCATTATAATTATTATTTATTGAAAAAACGGTAGTGCAAAGGTAAAAGTAAATGTGATAGATTTATAATATTAAGTAAATGTGATTAAAATCAATCCAATCATGTTTGCTAAAATCATGTATAATTTAATAGAATATATTTATAGTCTTAAATTTTCATCGACATGTCAACATCTTTATCAATATCTTTATGTTTTCATGAATTTATTAATGATACTTCTACTATATAGTAGAAAAATATAAAAAACATATGGTCCCATGGACTAGTGGTTACACGTATATACGATTGATTTTTTCTGTTATCATAGTGGGCTTTTGGCCTACCCCTTTTCTTATAGGATGACTTTCAATTTTCGTTTTTATTTGTAAAATTACAAATCTGGTTGATTTAGAGTCTGTTTGGAATGATTTAAAGAAAATGTTTTCTAAAAAATGCATTTTCATTTAAACATATTTTCTAAAAACTCTTGGAAAGAAAAACACATGTATGTTTGGCAACTTTTTTCTCAAAAGTGTTCTTAGATAAAATTTTGTTTGATTTGTATTAGAGTAAAAGATATATATATATATATATACATATAGAATTTATCCGTGGAGATTTTGATAGAAGTTCGACAATGATCATCAAAGATGGTGACGTGGTCGAAGACAGTCACTGTAAAACGATAATCAGAGGTTGACGACAGTGGTCATTGGAAGTCAAACGAGGATAATGACAAAAAAAAATAGTTGTTAGTAGTTGGTCGAAAACAGTCATAGAAAAACGATTGACAAAAGTTGACTGATAACGATTACCATAA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ATGCAAAATCTTGGTAAACAATTTGAAACACCGTTTGTGGTAACTTGGCAGGATTTTCCCTCGGACTTTAAGAAAAAACTTTTGGAGTTTGAGATAAGCTTTCCTTCTACGGATGAGGAGCGCCAAAGGCCTCTGTGGAGCTACCAACTTCCTTTCATGGCGTTCCCTTTGTCTTCCCCCGTCGTCTCTCGCCGCTTTTCTCTCTCATCTCCCCTTCACATTACCAAACACAGATTTCTTCATTCCAATTCCATTTTTCGATTTACCCATTCCTCCGGAACCTCGGTTCTCCCCAAACTCTCTTCCAACTCCCATGATAACTCTTCACTGGGACTAGAGGACCAGCATAACTTTCTCGAACAGTTATGCATTTCACCTTTTGAACTTGGAAAGAGGGAAATTAGGAAATTGATTGCTGTGATCCTTGTATGTATTCAAATTTCTTCCCCACTGCCCCTGCTGGATTGGGACCTTCAATCTATTCACCCTGCAATGGCAGTACTCTACTCGCCTGACACCAAGGTTCCAAGGACAGGAGAACTTGCATTAAGGAGAGCAATTCCTGCAAACACAAGCATGAAGGCAATACAGGACTCTTTAGAAGAGATATCATATTTGCTAAGGATTCCACAAAGAAAACCTTATGGAACCATGGAGGGTAATGTGAAGAAAGCTCTCAAGCTGGCAGTTGATGAGAAGGACTTGATTTTAGGAAGTATACCATCAGAGTCGAAGGAAAAAGGTTTAGCAATATACACAACTCTAATTGAAGGCAAGGGTGGACTGCAAACTCTCCTCCAAAGCATTAAGGATAATGACCCTGATAAAGTGTCTGTAGGACTTGCATCATCACTTGATACTGTTGCAGAGTTGGAATTGTTACAGGCTCCTGGATTGTCATTTTTATTGCCCGCTCAATACTTGAAGTATCCAAGGTTGACAGGGAGAGGAACCGTTGAATTTACCATTCAGAAAGGAGATGGTTCATCTTTTTCCCCACAAGCAGGTGGTGAATCTAGCAGTACAGCCACAATTCAGGTTGTTGTGGATGGATACTCAGCACCACTCACTGCAGGGAATTTTGCAAAACTGGTAATTGATGGAGCTTATGATGGATCAAAACTCAGCTCTACTAGTCAAGCTATTCTTTCTGAAAATAGTCAGGATAAGAATAAAGGCTATAACATTCCCTTGGAAATAAAGCCATCAGGACAATTCGAACCCTTGTACCGAACAACCCTCAGTGTGCAGGATGGAGAATTGCCGGTTTTACCTCTGTCTGTGTATGGAGCAGTTGCAATGGCACATAACGAAGATTCAGAGGAATATTCTTCACCACATCAATTCTTCTTCTATCTGTATGATAAAAGAAATTCTGGCTTGGGAGGACTATCCTTTGATGAAGGGCAATTTTCAGTTTTTGGATACACAACCGTTGGAAGAGACATACTTCCTCAGATCAAATCTGGAGACATAATTCGATCTGCAAAACTTGTCGAAGGTCGAGATCGCCTCGTTCTACCAAATGAGAATTGA MQNLGKQFETPFVVTWQDFPSDFKKKLLEFEISFPSTDEERQRPLWSYQLPFMAFPLSSPVVSRRFSLSSPLHITKHRFLHSNSIFRFTHSSGTSVLPKLSSNSHDNSSLGLEDQHNFLEQLCISPFELGKREIRKLIAVILVCIQISSPLPLLDWDLQSIHPAMAVLYSPDTKVPRTGELALRRAIPANTSMKAIQDSLEEISYLLRIPQRKPYGTMEGNVKKALKLAVDEKDLILGSIPSESKEKGLAIYTTLIEGKGGLQTLLQSIKDNDPDKVSVGLASSLDTVAELELLQAPGLSFLLPAQYLKYPRLTGRGTVEFTIQKGDGSSFSPQAGGESSSTATIQVVVDGYSAPLTAGNFAKLVIDGAYDGSKLSSTSQAILSENSQDKNKGYNIPLEIKPSGQFEPLYRTTLSVQDGELPVLPLSVYGAVAMAHNEDSEEYSSPHQFFFYLYDKRNSGLGGLSFDEGQFSVFGYTTVGRDILPQIKSGDIIRSAKLVEGRDRLVLPNEN* Homology
BLAST of Chy6G122440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P82869 (Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CYP37 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 577.0 bits (1486), Expect = 2.1e-163 Identity = 302/460 (65.65%), Postives = 358/460 (77.83%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55118 (Putative thylakoid lumen peptidyl-prolyl cis-trans isomerase sll0408 OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=sll0408 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 150.6 bits (379), Expect = 4.8e-35 Identity = 114/387 (29.46%), Postives = 186/387 (48.06%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O49939 (Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplastic OS=Spinacia oleracea OX=3562 GN=TLP40 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 145.2 bits (365), Expect = 2.0e-33 Identity = 118/412 (28.64%), Postives = 192/412 (46.60%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SSA5 (Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP38, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CYP38 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 2.1e-30 Identity = 103/362 (28.45%), Postives = 173/362 (47.79%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P72704 (Probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase sll0227 OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=sll0227 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 2.4e-18 Identity = 72/212 (33.96%), Postives = 100/212 (47.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TZN8 (Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold298G001240 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 899.4 bits (2323), Expect = 6.8e-258 Identity = 463/511 (90.61%), Postives = 480/511 (93.93%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L367 (PPIase cyclophilin-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G100780 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 872.5 bits (2253), Expect = 8.9e-250 Identity = 446/459 (97.17%), Postives = 454/459 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BSV9 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493349 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 858.6 bits (2217), Expect = 1.3e-245 Identity = 436/459 (94.99%), Postives = 454/459 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EMF0 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435926 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 780.4 bits (2014), Expect = 4.6e-222 Identity = 400/459 (87.15%), Postives = 425/459 (92.59%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JCX3 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483278 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 778.9 bits (2010), Expect = 1.3e-221 Identity = 398/459 (86.71%), Postives = 425/459 (92.59%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. NCBI nr
Match: KAA0046855.1 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK03290.1 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 892 bits (2306), Expect = 0.0 Identity = 463/511 (90.61%), Postives = 480/511 (93.93%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. NCBI nr
Match: XP_004149289.1 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN56218.1 hypothetical protein Csa_010891 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 865 bits (2236), Expect = 3.35e-315 Identity = 446/459 (97.17%), Postives = 454/459 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. NCBI nr
Match: XP_008452278.1 (PREDICTED: peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 852 bits (2200), Expect = 1.27e-309 Identity = 436/459 (94.99%), Postives = 454/459 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. NCBI nr
Match: XP_038903061.1 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37, chloroplastic isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 810 bits (2093), Expect = 2.62e-293 Identity = 417/460 (90.65%), Postives = 441/460 (95.87%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. NCBI nr
Match: XP_038903060.1 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP37, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 798 bits (2062), Expect = 2.91e-288 Identity = 417/480 (86.88%), Postives = 441/480 (91.88%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. TAIR 10
Match: AT3G15520.1 (Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein ) HSP 1 Score: 577.0 bits (1486), Expect = 1.5e-164 Identity = 302/460 (65.65%), Postives = 358/460 (77.83%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. TAIR 10
Match: AT3G01480.1 (cyclophilin 38 ) HSP 1 Score: 135.2 bits (339), Expect = 1.5e-31 Identity = 103/362 (28.45%), Postives = 173/362 (47.79%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G122440 vs. TAIR 10
Match: AT3G01480.2 (cyclophilin 38 ) HSP 1 Score: 95.9 bits (237), Expect = 1.0e-19 Identity = 74/266 (27.82%), Postives = 124/266 (46.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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