Chy6G114260 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAAAGGATAGAAAATGCAACAAGTAGACAAGTAACATTCTCAAAGCGTAGAAATGGAGTATTGAAGAAAGCTTATGAACTATCTGTGCTGTGTGATGCTGAAGTTGCCGTCATTATTTTCTCACAGAAAGGCCGTCTCTATGAATTTGCAAGCTCTGAGTATGTTTTTCTTTTCTAATTTTTTTTTTCCAGTTTATTAATAAATAAATGGTTTGGTTGGTAGGTTTGAAGCTATTCTATATCCACTTTCCACTTCTTTCTGAATTAAACCTACTTTCTTTGCAATAGTTTATTAAATTATTTGTACTTTTTTTTGGTGATCTTTGAAGATTTTCCGGAAATTTTAATGTTCAGTAGAGTTAATTATTTGGTAAACTTTAGGTAGTGATTGACTGATTGGTGCCCAAGTTCGAAACTTGAAGCTTGGGGGTAGATTTGTGAGAGTTATGTAACCTGTATTTTGTGTGTTATTTATTTATTTATTTTCTAAGAAGATCGATATTGAGGAATACTCGGATATCTTAACCAGGTTGACAGATGTTTAGCACCCTCATCCCATCTGAATATTCTGAGTTTTGGAAATTTTTTGTTTTTGTGATAGAAACAACTTTGTTCATCCATATTTAACAATCTGGCTCAAAACAGCAACTATGATTAATGTTGATGGTATTAATTGACTGAAGTAGTTAATGAGAAAATAAAAATTAGGAGAAACTAAATTAATTACTTTGACCAAATTTACTTGGCTCATCCACAGCACTCTCTTCATACCCGTAGTCTAAAAGTAGATGTTATTGATAACTAAAAAGGATTTACATAGGCGTTAAAGGGAGAGATAGATGAAAGCTCCAATTCAGGGTAATGGTGGAAGTATCGCAATAACAAAAAAAAAAAAAAGATTAGATTTCAGGCACCTATTAGTATTGGCAAGAGAGAGCTTCGAGATCAGGAGAATATAGTTGTCTTTGGGTTAACAACGTTGAGAATATCTTCTAATTATTTCTTTAGTTAGGATTAATATATTTTCTAAGAATGATGTCTCAATCTCTTGCTTCTTGTTTCTCTTAAAAAATTGGGTGGCTATCTATTCTTGAAAGGGTTTAAGGATTTCTTCGCTTGCTTAAAAAAATCGATCATTTATGTACTATTGTTTTCTTGTATGATTTGAGAAGTAAATGATCCTTTCCCTAGGCTAATTAACAATGAAATACAATTTATTTTTATCACTTAAAATATTATTGTGAATTTAACATGAATATAAGCTTTTTTTAGTTAGACGGTAGAATGCAAGACTGAATCATAAGCTTTTTGGATTGTAAGTGATGCCTTAGTTGTCAGAGATGAATTGATATAGCAAAAGCTATATTGTTAGTAGATACAGATATGTTTTATTTAAGAGATCAAATATTCAAACCAACACGTTTTTTTAAAAGTTCTTGGGTTATATATATATATTTATTTATTTTGAATTGTTGAGAAAATATAAGCATGATCATAGGGTTAAATTTATAGGTAAGTGAATTTATGTCAATATATAAAGGCAGTAAAACAAAGAAATAAAAGGAGTGAATAGTGAAGTTGGTACTACTATTAACTATACACATTAGGAGTGTATTGGAGTAAAGGGAGGAATACATAAACCTTTTATTTGTTTAGTGACCTTTTTCAAGTACTTGTGATGTCTAATAATGAGTGGACAGAGTGAATGGCGCAGTGCAATAAGGATAAGTATTACGAAAATGAAGAAAATAACTTTATGTTAAAAGTAAGTTGGTTCGATTTACAGCTTTAAAACTTATTCCCAAGTACACATTTTAATTAGTTGTGCCTTTCGATTATTATTATTGTGGTTTCAGGATGCCAAAGATTATGGACCGCTATCGCAAATGTACTAGAGATGCCAAAAATAATGACACTAAATTTGATAGACAGCTCCACTTACAGGTCTGTTTGGTTTCTCAATTTTAAAAATATATATTTTTAGTACTATGGTAAATAAAATAGATTCATTTAATTCACGATTTTGAAAATGTATATTTTCAATCCTTTGAGATTTTATAAGCTTAAACATATGTTTAAAAACTTTCACTTTAGTGCTATGATTTTTCTTTCAAAACTTTTGTTTATTAAAAATAAAAATCATATGTTTGGTACTTTTCTTCTTTAAAATTAAAAGAAAATATTTTTTTAAAGTTTTTTTCTTCATTTTTATTCTTTTAAAATTTTAATTTTACCAAACGTATTTGCTTTTTAAAAATTAATTTAAAAAGAAAAGAGAAAATAAATGGATTAGAAATAAACCCTAGGCATTCAATATCTTGAGTAATGTCTGTTAAATGAAAATATAATGTATGACACAGATTTTTACTTCTCACTTCTTAGTTTAGACAATAACGTGGGTTCCTTGAATTCATGGTTCATTGATCTCCATTTTTATTTAGCAATTAAGGCTTGAGGTTGAAAGCATTAATAAGCAGATGGAGTTGATGCAACTTTCTCACAGGTAATTTTTTATTCATTTCATTTCCTTTCTTTACCAATATGGAATAATGTGTGTTTATAATTATATATATAGGAAGCTGTTGGGTTATGGACTGGATAATTGTTCCCTTGATGAACTTCAATTACTTGATGCTCAGCTTCAACGGAGCCTCTTCCAAATTAGGGCTAGAAAGGTACATATGTAAACAAATTTATAGGCTTTAAATTAATTATAAATTCACTCTCCCTAACTTTCTAAATTACAAAAAGGATATATACACACATAATTTTCTTATATGTCTTTCAATTTCAATTGAATGTACTAGATAGTATTGAAAGGTAGAGACTTGTTTAAGAGATGTATTAGACACTAAAGTTGAAATAACTAACTAAATAAATATTATAATTTTCAAGACTTAATATGGATTGTAATTTAATCATATATAAATTATTTACTCAAACTTTATTTTTGTTCTAGATTTCAATTTTTTTTTCTTCATTATTGGAAAACATAATATTAAGCTTGAAATTGGGGTGTTTTGTAGGCTCAATTATACAATGAGCAGATACAACAACTACAAGAAAAGGTAATTGATTCAGTCTAAAATGATTAAAAAAAAAAATAATAATAATAATAGAAACGTCTTTAATAATTTTATTATATTTGGTTTTACTTTAATTATTATAACACTTAATTTTTGTGCAATTCAGGAAAAACTCCTTTTGGAAGAAAACAGGATTTTGTCTTTAAAGGTGAATACGTTTTAACTCCTCGACTTCGTTTTATTTATTTGAGGAAAAAAAAAATACCCTTTTATCTTTTAAGTTATACATATAGTTTGCTGTGCTTTACAACCTCACATCTCAATAATAATGCTTAATTTTAACACTGAAAAAATAAATTATATAAATAAAAATAAAACAAAAGCAAAAGTCAGATTCGGTTAATCTTTCTTAGTCCACTCATGGTTGATTTCCGGCGAAGATCCCTCTGTTTCGCCCTCTACTTCCTCGGCAGTTATTTGCTCTCAAAACAAAATGGTTATAAAATATATATCTAACCAAGAACTCAACCAACATTTTTGTATTCACAAATATTTATATTCTCAAACACTAAATAATAACAAGATTGCACCACCATAAGTATCTTAAGCTTGAGACAAAAGACACACCGTAGTTATGGTACAGGTCTATTGACCACTTTTGGCATTCAGTAGAAAGTAGGCGGCGGCCAGTTGATTTTTGGGGGAAAATTTTCTTCAAACAGGGTGGGATTCTTTCCTAAGATGCCCCGACCGTCGATGAGACGGTGGCGGAGGGAGTGAGTTTGTGGTGGGTCTCCGTCGTCCGCCGGTATCCTGTTTTGGTCGATGAGTGGGCTAAGAAGATGAACGGAATATGTTGGGTTATTTATTTATTTATTTTTAAAAATAATTAATATTTCTCCTATAAATATTAAAATTACCACATCATCAATATATTTTTGTTCAAAACTAATTAAATCATCATCTTAGTCAACCTTCTATTAGGTCATTAATGGTTTGATTTTCTTATTTAAGTACTAATATTAAGCATTATTAAGATCTTAGAAACAAATGTTAAAATAATTTAAAAGCTAAGCACCAAATAGATAAAGACCAAACAGGTACTTTTTCTTATTTTATTTTATTTATTTTTGTTTTTACATGTTTTGATATGTTTTCTTTAAATGTTGAGTTAATTATCTGCATTTTCCAAATCAGTTATTATAAAAATTAAGTTGGATTTCGAAAAAAATCACAAAGGAAAAAAAAAAAACGTTTTTAATTTGGAAACCTATGTTCGGAATATTGTGGTTAGTGAAATGAAATTTTACTAAATTTTAATACATTTGTGATTATAATATATGAAAAAGGAAGCTTTCAATTTTTACTTAGAAGAAGTTCTAAGTATAGCAAATAAGTACGATACCGATTTTGCACTAAATAAGTAAAGATGTGTTGTCTTAGATAAGCCTAGGTTAATTGTCCGAATTAAATGCACAATGCTTTGACATTTGGGGTGATGAAAAAGTATAGCTGATTCAAAAATATATAGAAAAATGATGTTAAGTTCCTATTCGTCCTTCACAAATAAAATATCATTACAACACACCAACCTCTTCTCTTTCGTTGTATTTTGGGTAATTATATTTGATACAATTTTTGGAATAATAAATTAAATATATAACAATATTTTAAATAAATTGTTAATATAGTAAAATGTAATAGTGATAGACTTCTATTATTATAAATTCTTATGGTTTATTAACGATAGACCAATTTTTACAATAAGGTGTATTAGTTATAAACTTTAATAGTTGATAGATTTTAACCGATTTTGTTATATTTATAAATTTTTAAAAATGTTATTATATACTTAGTTATTTTAAATATTATTTATTTTGAATCTAATTATTATTTTTACACTTTTATATTATAAGTTCAAAAAGAGGTGATTAAGGTAAAAAAAATATTGTAGATATAACAAAAA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ATGAAAAGGATAGAAAATGCAACAAGTAGACAAGTAACATTCTCAAAGCGTAGAAATGGAGTATTGAAGAAAGCTTATGAACTATCTGTGCTGTGTGATGCTGAAGTTGCCGTCATTATTTTCTCACAGAAAGGCCGTCTCTATGAATTTGCAAGCTCTGAGATGCCAAAGATTATGGACCGCTATCGCAAATGTACTAGAGATGCCAAAAATAATGACACTAAATTTGATAGACAGCTCCACTTACAGCAATTAAGGCTTGAGGTTGAAAGCATTAATAAGCAGATGGAGTTGATGCAACTTTCTCACAGGAAGCTGTTGGGTTATGGACTGGATAATTGTTCCCTTGATGAACTTCAATTACTTGATGCTCAGCTTCAACGGAGCCTCTTCCAAATTAGGGCTAGAAAGGCTCAATTATACAATGAGCAGATACAACAACTACAAGAAAAGGAAAAACTCCTTTTGGAAGAAAACAGGATTTTGTCTTTAAAGGCAGCAGCTAAAGGTGGTGACGCCACGCACGGTGTCCGGAGTAGCTCAAGTACTGAAGCACCACGGAACAGTTTGGAATCGGAGGAAGAATTACATGTTTCTGATCCATTACCAAGTAAGACTCAAAAGCAGAAAGAAAATCAAGATGCTCTACATTTTCCAAAGGGTATTGTTCAAATCAAAACCAAAAGTAATGGAATGAACAATAATTTGTCAACCGGGAATGACTCTCCAAGCACCAAGACACCAACTTTAGTAGCGAGATTAATGGGTTTGGATATTCTTCCAGAATCCAACTCTAGTCCTTATTCTTCAACCACACCCAGAAGTTCAAAAATGACCACACAATTAAAAAGTGTGTCTCGTTCTTTACCAGAAACTCCAAGATCATCCTGTGAAAGGAAATCAAATGTGGATAATTATCACCACCGTTTCTCACTTCAAATCCCCAATAATTATGACCATAAAGAGAACAATGCAATTCCAAATCCAAATCCAAATCCAAGTAGTACTACTCCAACCCATTCTGCTAAAGAGATAGTAAAGCAAATGAAAGAAAGTGTGAGTAGAAGAAAAGAAGCTGCTCTCATTGATATCACCAATCTTAATTACAATAATACAAGAAGAGATCAAGATATGATCATTAATTACCAAACCAAACCCAAAAACCAAACAAGACAGAGAGTAGTGTTGGAGCCAAAAGTTGAAGCCATTAAAGAAGCTGTGGATTTAGAGACGACGATGAAGGTAAAGAAGCCAAAGGGTGTGAAGACGACGAAGACGACGAAGACGACAAAGGTGGCGGTGTCGAAGAAGGGTAATAAGAAAGAGGAGACATTTGTAGTTTCATCAAGAATCACAAAAGCAGCCATTGATGCTCCTCTTAAGAAAACTCCATTGTCTAATCAGCTTTTGAACTTCGGTTCTGTTCCCACTACCATTCTCATCAACAAAAATCTTCCATTTTCCTCATCCATTAAACCAACTCAAATCCAGGCACCGTGCAAACGGAATCAAGGTACGGATCAGACAAGCGATAAAGAATCAAAACGATACTTCCAATCACCTAACCACCAACACTCCCTCATCCAATTACCACCCAAAAAAGACGGCAACAACCCCAAACATCACATCATAACCACCGTCGCCGCCGCCGCAAATTGTAATGACAGCCATGAGATCACGGCAGAGGTAGATTACGTCAGACAAATACTCCTCCGCCGTAGTACTACTTCCTCTTCAATATACTCCTCCGTTTTCCTCGAAAATTTAAATTACAAAAATGCCCACAATTACAAAATTTCAATTCCCCATAGAAAATTACTGAGCCAGTTGGTGGAGGAGTTATTGAAGCCATATCTGGAACTTGGGGCAGACTACCGGGAGGCAGGGTCGGGGTGGGCGGAGGTGGGGGAGAAATTGTGTGAGAAAGTGAGGAAAATGCCACGTGCGAAGTGTGAGGTGTTGGAGGACATAGATGGAATAATAGAAAAGGATATGGGTATTGTGGGAATTGGATATGAGGAGGAGGGTGAGGGGATAGTGAAAGAGATCGAGGAGTGGATGGTGGAGGAACTTTTGAATGAAACGGTGCGTTTTGTAGAGACAGAGATGGCAGGAGAATCACGTGGGAGATGCCACATGGAAGTATTGGGACCCACATAG MKRIENATSRQVTFSKRRNGVLKKAYELSVLCDAEVAVIIFSQKGRLYEFASSEMPKIMDRYRKCTRDAKNNDTKFDRQLHLQQLRLEVESINKQMELMQLSHRKLLGYGLDNCSLDELQLLDAQLQRSLFQIRARKAQLYNEQIQQLQEKEKLLLEENRILSLKAAAKGGDATHGVRSSSSTEAPRNSLESEEELHVSDPLPSKTQKQKENQDALHFPKGIVQIKTKSNGMNNNLSTGNDSPSTKTPTLVARLMGLDILPESNSSPYSSTTPRSSKMTTQLKSVSRSLPETPRSSCERKSNVDNYHHRFSLQIPNNYDHKENNAIPNPNPNPSSTTPTHSAKEIVKQMKESVSRRKEAALIDITNLNYNNTRRDQDMIINYQTKPKNQTRQRVVLEPKVEAIKEAVDLETTMKVKKPKGVKTTKTTKTTKVAVSKKGNKKEETFVVSSRITKAAIDAPLKKTPLSNQLLNFGSVPTTILINKNLPFSSSIKPTQIQAPCKRNQGTDQTSDKESKRYFQSPNHQHSLIQLPPKKDGNNPKHHIITTVAAAANCNDSHEITAEVDYVRQILLRRSTTSSSIYSSVFLENLNYKNAHNYKISIPHRKLLSQLVEELLKPYLELGADYREAGSGWAEVGEKLCEKVRKMPRAKCEVLEDIDGIIEKDMGIVGIGYEEEGEGIVKEIEEWMVEELLNETVRFVETEMAGESRGRCHMEVLGPT* Homology
BLAST of Chy6G114260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FIS1 (MADS-box protein AGL42 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL42 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 183.3 bits (464), Expect = 9.5e-45 Identity = 106/201 (52.74%), Postives = 145/201 (72.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O64645 (MADS-box protein SOC1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SOC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 1.2e-39 Identity = 103/209 (49.28%), Postives = 141/209 (67.46%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38838 (Agamous-like MADS-box protein AGL14 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL14 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 4.5e-39 Identity = 101/205 (49.27%), Postives = 143/205 (69.76%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LT93 (MADS-box protein AGL71 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL71 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 1.0e-38 Identity = 92/189 (48.68%), Postives = 143/189 (75.66%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82743 (Agamous-like MADS-box protein AGL19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL19 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 161.0 bits (406), Expect = 5.0e-38 Identity = 100/213 (46.95%), Postives = 145/213 (68.08%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L5R3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G179150 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 979.5 bits (2531), Expect = 7.3e-282 Identity = 520/561 (92.69%), Postives = 532/561 (94.83%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SWG9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold440G00150 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 851.7 bits (2199), Expect = 2.3e-243 Identity = 473/537 (88.08%), Postives = 491/537 (91.43%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AYQ5 (uncharacterized protein LOC103484030 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103484030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 849.4 bits (2193), Expect = 1.1e-242 Identity = 472/537 (87.90%), Postives = 490/537 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J8L6 (uncharacterized protein LOC111482735 isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482735 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 503.8 bits (1296), Expect = 1.2e-138 Identity = 340/569 (59.75%), Postives = 392/569 (68.89%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JAG9 (uncharacterized protein LOC111482735 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482735 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 503.1 bits (1294), Expect = 2.0e-138 Identity = 340/575 (59.13%), Postives = 395/575 (68.70%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. NCBI nr
Match: XP_011651128.1 (probable serine/threonine-protein kinase dyrk2 [Cucumis sativus] >KGN57325.1 hypothetical protein Csa_011185 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 981 bits (2536), Expect = 0.0 Identity = 520/561 (92.69%), Postives = 532/561 (94.83%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. NCBI nr
Match: KAA0033597.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold239G00300 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK22263.1 uncharacterized protein E5676_scaffold440G00150 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 853 bits (2205), Expect = 7.30e-305 Identity = 473/537 (88.08%), Postives = 491/537 (91.43%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. NCBI nr
Match: XP_008439147.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103484030 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 851 bits (2199), Expect = 1.80e-303 Identity = 472/537 (87.90%), Postives = 490/537 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. NCBI nr
Match: XP_038882171.1 (uncharacterized protein LOC120073400 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 641 bits (1654), Expect = 4.95e-221 Identity = 387/551 (70.24%), Postives = 427/551 (77.50%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. NCBI nr
Match: KAG6576756.1 (hypothetical protein SDJN03_24330, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 508 bits (1309), Expect = 8.33e-169 Identity = 339/570 (59.47%), Postives = 390/570 (68.42%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. TAIR 10
Match: AT5G62165.1 (AGAMOUS-like 42 ) HSP 1 Score: 183.3 bits (464), Expect = 6.7e-46 Identity = 106/201 (52.74%), Postives = 145/201 (72.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. TAIR 10
Match: AT5G62165.2 (AGAMOUS-like 42 ) HSP 1 Score: 183.3 bits (464), Expect = 6.7e-46 Identity = 106/201 (52.74%), Postives = 145/201 (72.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. TAIR 10
Match: AT5G62165.3 (AGAMOUS-like 42 ) HSP 1 Score: 183.3 bits (464), Expect = 6.7e-46 Identity = 106/201 (52.74%), Postives = 145/201 (72.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. TAIR 10
Match: AT2G45660.1 (AGAMOUS-like 20 ) HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 8.5e-41 Identity = 103/209 (49.28%), Postives = 141/209 (67.46%), Query Frame = 0
BLAST of Chy6G114260 vs. TAIR 10
Match: AT4G11880.1 (AGAMOUS-like 14 ) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 3.2e-40 Identity = 101/205 (49.27%), Postives = 143/205 (69.76%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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