Chy5G102430 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy5G102430
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Descriptionaldehyde dehydrogenase family 2 member B7, mitochondrial-like isoform X4
LocationchrH05: 16453077 .. 16461648 (+)
RNA-Seq ExpressionChy5G102430
SyntenyChy5G102430
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AGCACAAGTAGTGGGTTGGCCACCAGTACGATCATCTCGAAAGAATTTAGGAGTAGTGTCGTCAAGGAAGGGGGGAGATGAGGGCGGGGCCGGGGGGTCGTTCGTAAAAGTAAGCATGGACGGTGCTCCTTATTTACGGAAGGTGGACTTGAAGTTATACAGCAGCTATAAGGACCTCTCTCATGCTCTTGCTCAAATGTTTAGCTCCTTCACTATTGGTAATCAATTTTTTTCCCTTTTCTTTTTCTTTCATATGGACAATCAGAGTCAACATCTACACATGTTTTACTGCTTTTATGTACTTTTTTTTTATAAATTTAATAATAATCAAGCTTTTCATGTGCAAACTTTTGATATTATTTATTTCTGGCATAATAATTTGATTTCTTTTTCAAGTTTAGATTCTAAAAGATTTGGTTAAATATTGTATTCACACTTAGTTGCTTTCATGCGCAGGTTTTTATGAATCTTTTAACATTAAAGCTAAGTTATAATACATAAATTGGGAGTAGGAAAAAATCCAAATTAAAGCTTACTGTATATTTGATACAACATATTGTAGGGTTGACATTACATTACATTACATGCTTCTTTTTAAACATTTTGGCTTAATTCTTATGTTTCTTTTTTCTAATAGTTTAAACGGGTAAGGGATATATACCATCGATTATGAGGTTAGCTGTTTGAATATCTGGACATGTGTATTTTTACCCATGATGTAAAAATAAAACGTGGTATTTTGTCCATTGTTTGGAGTTTGATATTTGAAAGAAAAATGGAAGGGGTTTGATGAATTTTTTAAAAATTATTGTAAATGATGAACTTTTTTTTATAAAATATCTAAATTTTAGATTCTATAGTGTCTATCAATGGAAGTCTACCAAAAAATATATATATATATATATATATGAAATTGCACATAAATTATTTGAGTAATATATATTTTGAGATGGAAATTGACAGGAAAGTGTGAATCAGAAGGGATGAAGGATTTCATGAATGAAAGCAAATCGGTTGACCTTTTGAATGGGTCAGAATATGTACCCACTTATGAAGACAAAGATGGAGATTGGATGCTCGTTGGGGATGTCCCATGGGAGTAAGTATTATAATCAATGTTCATTCATTGTGCTTTACAAAGTATAACTAAATGTCATGTTAATTTGACATAGGATGTTTGTTGATTCATGCAAACGTTTGAGGATCATGAAAGAGTCTGATGCCATTGGATTAGGTAAGTCATCCTCTTCTACTATTTAAAATTAGGTAAACTATATCTCTCTCCTTTATATAAACGATATTTGTAAAAAACAATTGATTAAATGATAAATTTGATCCTATAATTTACACAAAGAAAAAGGAGTTAGATATTCAAATCGATTTATAATTAGAATTTAGTCCGTATATTATTTTTAAAATTTTATTAAATCATAAAAATTGAATTCTAACTTTAAGACTCTCACTTCCTTTCTACACTAAATATGTAATTTAATAAAAAGTAGCATTGATTTAAAAAAACAATACAATGGACTCAATATTTAATGTGATACATTAAAGAAAAAGAATAGATATATTGCATGGAAAAGATAAATAAAAGAATATAAAGTTATATATACATATACATATACATATGTGTTAATATGTACATATCTTCTTGATTTTTTAAATTAATTTACACATATTTTCTTTGGGATATATCTTCTGATTTTTTTTTTTTAATTATTTAAACATTGACAGCACCAAGATCAATGGATAAACAAAAGAACAACAGAAGCTGAGCTGTTTTGATCAATTTAACAAAATTTGTTTGATATGGTACCAATTTTCAATTTTTTCTTCTTCTAAATTAATATAATATATCTATATCTATCTATATCTATATCTATATATATAAGAACAATTGGTGTTGAATTTGTAGGGATGCTATATAAATTCAACATTAGCATAGAGTGGTTTTAATTTCTACTTCAAACTTTAATTTCTCCCATCTCTCTATTGCATTATTTTACGATTTTCCTGTGTTCTAATTTTTATGTATTCATATTAAAACAATTCGTTGGTATACGTACATATATAAGTAATATCCACATATCTATATATATATTATTAATAGACAAATTTCGTTCTTATATATACGTACACATATAGATAATAATATCGATAGAAACGAATAAAAAACAGCATGTTATCAACTTCAAGTTAAAATTTCTGTTTGCACTTTCACTTTTCAACCTTCATTTTAAGAACTTTTCAAGAAAAAAAAAAGAACTTTTTCTTAATGAAAGAATATTTAAATTCCGTCAACTCTTCTCTCTCTTCCGAATAAACATTGAAGATGCCATCTTGATTCTCTCACATGTGGTTACCACTTTTAGCTTTAAGCTTCACATGAAATATATATATTGAATGATATGACAATATTATATCAATAGTTGTGTTTGGAATAATTAAATTTAAGAAAAAAAAATGTATTTACTTCTTTTACAACATTTTAAATTGTGTTTACCATAATTTATTTTATATTGAGTAATTTTAAAGGATCAAATTGACAAATTATTTTAAATAAAAAAAACTTCCAAAAGCATTTACAAACATAACAAAAAAAAACTATGTAATATTTCATGATAGACTAATATATTGTGTCTATTTGGGTATTTTATAAATAATTTAGTTCATTTTTCTACATTTAAAAATAGCCGCATCAAAATTTATTTTATAACAATAATTTATAATAAATAAGTATTTACATTAGGGACACTTGCAAAAATGAACAAACAAGTTATAATAATTAAGCCCACAACACACATACATTATTATTTATGAAAATGGAAAAAACAAAGTTCAACTCACATATCAAGAGGTAAAATGTCACAAATGCCCTCGTTACTAATATGCATTTGATACATCTTATACACGTCTGATACAACTAATACATTTTGATACACTTGATACATTTGATAGATACACTTGATGCACCTAATACTATTTGATACACTAGATATTTTTTGATACACACTTGAAACATCTTGATACACATAGTACTCTTTGATACACTTGATACCCCTTAGGCCTTGATACACTTAAAGCTTCACTTATAAGTTTGATACACTTAATACACTGATAATAAACTTATATGCTTCATTTGTACACTCAACAAATTTGATACGTTACGTTTGATTTACATGATACGTTTGAACACCTGATGCACTTAGTATTCTTTACTTATACATTTGATTGATTAAATACACTTGATATGCTTGAAGTTCTACTTATAAACTTGATATACTATTGATATACTTGTAAACTTGATTTATATACTTTATAATGATTCACTTTATTTATATGATTTAACAATATATTGTTGATATATTTGATAATGGTACACTAAGTTATTACATTCCTATACTTAATAATACTATAATGAACTACATAAAATTTGAAAAAAAAATAAAAATTACATAGTAAGTATATCAACCAACTAATACATATAATATAAGTATATCACTGCACTGATATATAAAACTGAGACAAAACAAAATCAAAACAAAATCAATGTAAAAAAATAAAACAAAATTATTTGAAATTAGATTCAACTCAAAATACACATCGAAAAAGAAAAAAAAAATCATACGATATTAACGACTCTAAGATATTTTAGAATTGGATTTCATATAGTAACAAGTGGTCGATGTCGATGATGCTAATTGGTTAGCCGCACAGCAACTCCGCTTGTTGTTTTCTTTCATTTTCTTCAAATCTATAGTTTAGCCCTACAAGCCTCAGCTTTATTATATGTAGACCACAACTATATGCTTAACTTTTCATACATCAATACAAAATATTAAAGAGTTGACAATACATTTTTTTACAAAAAAGATGGAAAGAAAGAGAGAGAGAAGAAATGTATTCATTATACTTCAAAAGTTATATATCGAGAATAAATTTTATTTTCATTGACAACGTGGTATATCTAAATATATTATAATTCAACAAATACTTTTTGATAAACTCTATATATAAAAATTAAAATAAAATAAATTGAAAACATAAAAAGAAAATATTGTTTTGGAATTTGCATTCGTTTAGATATATAATCCAAAAAAAGAAATTAACCTGTCTACCAAAATTCATAAAACTAAATTTGAATTGGATAATAAATAAAATGGAATTTTCTAAAAAAGAAACATGAATTAGAACAATCTTAAAATACAATGGAAGAAAATGGTTGAAAAAAAAAAGAAGATGGAGTGATGGGTTGGCAGCGTCAATCATGGACCCTATCTTTGGAATATTCGCAAATCTTTGACTTTTTTTCTACTCCTTTAAATTCTTTATAATTTCATTTGAGGTCCTTTTTCATATAATATTTTGCACAAAACAGCCCCCCCCCCCTCGTCTTCTCCGACCATGTTGTCAATTTCCAAGTATTTGATTCTACATCTCCAACCTTTCTATTCATAGTGATTACTTAAGATCTATGGCATTGATTTTAGGTAACAATATCTCCATCATGAACATTGCCTCACCTTATTCTAGAATTGAGTTCTACATACCCAAACCTTATCATTCTAAGGTCATCTAATTAAGTAAATAGAGTCCCTTCCATAACAAACTCATTTATTTGTTTTCACACTATTTCAACTATCCCTTAGTGCATGCATACTACATCTACATTGATTATTATAGCTTACCAATGAAATTAAAAAAAGATAGGTATAGAGAGAGACAACAAAGTATTGCTTTTATTTGACAAAAACCAATCTTTGTAATTTATACGGAACAACAAAATACATAGATGCATCCTTGTTTTTCAAAATCACCATTGAGTTGACCCAAATCTTGTTCAGATTTGAAGAAACACTTCTTTGAAGGAAACCATTTTTTCCACTCCTATTTTCATACACGTCATCCCTCTGACTTAACTATTTCATACTACTTTTTTTTTTTCTTTTCACATATAGTATAAAATTTTAAATTGATTTTACATGTAATAAATATTA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mRNA sequence

AGCACAAGTAGTGGGTTGGCCACCAGTACGATCATCTCGAAAGAATTTAGGAGTAGTGTCGTCAAGGAAGGGGGGAGATGAGGGCGGGGCCGGGGGGTCGTTCGTAAAAGTAAGCATGGACGGTGCTCCTTATTTACGGAAGGTGGACTTGAAGTTATACAGCAGCTATAAGGACCTCTCTCATGCTCTTGCTCAAATGTTTAGCTCCTTCACTATTGGAAAGTGTGAATCAGAAGGGATGAAGGATTTCATGAATGAAAGCAAATCGGTTGACCTTTTGAATGGGTCAGAATATGTACCCACTTATGAAGACAAAGATGGAGATTGGATGCTCGTTGGGGATGTCCCATGGGAGATGTTTGTTGATTCATGCAAACGTTTGAGGATCATGAAAGAGTCTGATGCCATTGGATTAGGGAGAAGGGGTTTTAATGGAAGAACAATTGCTAAATATAGTACTGCATCTGCTGTTGAAGATCCTATCACTCCATCTGTGAAAGTGAATTATAACCAGTTATTGATTAATGGACAGTTTGTGGATTCAGTCTCAGGAAAAACGTTTCCTACTTTGGATCCAAGAACTGGGGAAGTCATTGCTGAAGTTGCTGAAGGTGATGCTAGAGATATTGATATTGCAGTTTCTGCTGCACGCAAGGCGTTTGATGAAGGGCCTTGGCCTAAAATGACTGCTTATGAAAGGTCAAAGATAATTTTGAGGTTTGCTGATTTGGTTGAAAAGCATGCTGAAGAAGTTGCAGCACTCGAAACATGGGATAATGGAAAAACATATGAACAATCGTTAAAAATTGAAATCCCGATGTTCGTACGTCTCTTTCGATACTATGGTGGATGGGCGGATAAGATCCACGGACTCACAGTTCCTGCCGATGGCCCGTATCATGTACAAACCTTGCACGAACCTATTGGCGTGGCAGGTCAGATCATTCCATGGAACTTTCCTCTGGTCATGTTTGCTTGGAAAGTCGGCCCGGCATTAGCATGCGGGAATACTATTGTTCTGAAGACAGCTGAGCAAACACCTTTGTCTGCTCTATTGGTGGCTAAGCTATTCCATGAGGCTGGACTTCCTGATGGCGTTTTGAATATTGTTTCTGGTTATGGACCTACTGCTGGTGCTGCTCTTGCTAGTCATATGGAAGTTGATAAACTTGCTTTTACTGGATCAACCGAAACAGGGAAGGTTGTACTTGAATTAGCATCAAAAAGCAATCTGAAGCCAGTAACGTTGGAGCTTGGTGGAAAATCCCCTTTCATTGTATGTGAGGATGCTGATGTAGACAAGGCTGTGGAAATGGCACATTTTGCTCTGTTCTTCAACCAGGGACAATGTTGCTGTGCTGGTTCTCGTACTTTCGTTCATGAAAAAGTACACGATGAGTTTGTAGAAAAAGCAAGAAACCGAGCTGCGAACCGTGTTGTTGGTGATCCTTTCTTAGGTGGAATCGAGCAAGGTCCTCAGGTTGATGCCGAACAATTCAAGAAGATATTGAAATATATAAAATATGGGATTGAAGGTGGAGCCACTCTTGAAGCAGGAGGAGATAGGTTTGGTTCCAAGGGTTACTATGTCCAACCAACAGTTTTCTCAAACGTCAAGGATGACATGAAAATTGCAGAGGATGAGATTTTTGGTCCAGTACAAACAATCCTAAAATACAAAGAGATTGATGAGGTGATAAGGAGGGCAAATGCTAGTCGTTATGGACTGGCTGCTGGTGTGTTTACTCAAAACATCAACACTGCCAATCGGTTGACACGCTCGCTGAGAGTCGGGTCAGTATGGATCAATTGCTTTGATATATTTGATGCTGCAGTTCCTTTTGGTGGGTACAAGATGAGTGGACATGGGAGAGAAAAGGGAATTTACAGCCTTAGCAATTACCTGCAAGTAAAGGCTGTGGTCACTTCTTTGGAAAACCCTGCTTGGCTTTGA

Coding sequence (CDS)

AGCACAAGTAGTGGGTTGGCCACCAGTACGATCATCTCGAAAGAATTTAGGAGTAGTGTCGTCAAGGAAGGGGGGAGATGAGGGCGGGGCCGGGGGGTCGTTCGTAAAAGTAAGCATGGACGGTGCTCCTTATTTACGGAAGGTGGACTTGAAGTTATACAGCAGCTATAAGGACCTCTCTCATGCTCTTGCTCAAATGTTTAGCTCCTTCACTATTGGAAAGTGTGAATCAGAAGGGATGAAGGATTTCATGAATGAAAGCAAATCGGTTGACCTTTTGAATGGGTCAGAATATGTACCCACTTATGAAGACAAAGATGGAGATTGGATGCTCGTTGGGGATGTCCCATGGGAGATGTTTGTTGATTCATGCAAACGTTTGAGGATCATGAAAGAGTCTGATGCCATTGGATTAGGGAGAAGGGGTTTTAATGGAAGAACAATTGCTAAATATAGTACTGCATCTGCTGTTGAAGATCCTATCACTCCATCTGTGAAAGTGAATTATAACCAGTTATTGATTAATGGACAGTTTGTGGATTCAGTCTCAGGAAAAACGTTTCCTACTTTGGATCCAAGAACTGGGGAAGTCATTGCTGAAGTTGCTGAAGGTGATGCTAGAGATATTGATATTGCAGTTTCTGCTGCACGCAAGGCGTTTGATGAAGGGCCTTGGCCTAAAATGACTGCTTATGAAAGGTCAAAGATAATTTTGAGGTTTGCTGATTTGGTTGAAAAGCATGCTGAAGAAGTTGCAGCACTCGAAACATGGGATAATGGAAAAACATATGAACAATCGTTAAAAATTGAAATCCCGATGTTCGTACGTCTCTTTCGATACTATGGTGGATGGGCGGATAAGATCCACGGACTCACAGTTCCTGCCGATGGCCCGTATCATGTACAAACCTTGCACGAACCTATTGGCGTGGCAGGTCAGATCATTCCATGGAACTTTCCTCTGGTCATGTTTGCTTGGAAAGTCGGCCCGGCATTAGCATGCGGGAATACTATTGTTCTGAAGACAGCTGAGCAAACACCTTTGTCTGCTCTATTGGTGGCTAAGCTATTCCATGAGGCTGGACTTCCTGATGGCGTTTTGAATATTGTTTCTGGTTATGGACCTACTGCTGGTGCTGCTCTTGCTAGTCATATGGAAGTTGATAAACTTGCTTTTACTGGATCAACCGAAACAGGGAAGGTTGTACTTGAATTAGCATCAAAAAGCAATCTGAAGCCAGTAACGTTGGAGCTTGGTGGAAAATCCCCTTTCATTGTATGTGAGGATGCTGATGTAGACAAGGCTGTGGAAATGGCACATTTTGCTCTGTTCTTCAACCAGGGACAATGTTGCTGTGCTGGTTCTCGTACTTTCGTTCATGAAAAAGTACACGATGAGTTTGTAGAAAAAGCAAGAAACCGAGCTGCGAACCGTGTTGTTGGTGATCCTTTCTTAGGTGGAATCGAGCAAGGTCCTCAGGTTGATGCCGAACAATTCAAGAAGATATTGAAATATATAAAATATGGGATTGAAGGTGGAGCCACTCTTGAAGCAGGAGGAGATAGGTTTGGTTCCAAGGGTTACTATGTCCAACCAACAGTTTTCTCAAACGTCAAGGATGACATGAAAATTGCAGAGGATGAGATTTTTGGTCCAGTACAAACAATCCTAAAATACAAAGAGATTGATGAGGTGATAAGGAGGGCAAATGCTAGTCGTTATGGACTGGCTGCTGGTGTGTTTACTCAAAACATCAACACTGCCAATCGGTTGACACGCTCGCTGAGAGTCGGGTCAGTATGGATCAATTGCTTTGATATATTTGATGCTGCAGTTCCTTTTGGTGGGTACAAGATGAGTGGACATGGGAGAGAAAAGGGAATTTACAGCCTTAGCAATTACCTGCAAGTAAAGGCTGTGGTCACTTCTTTGGAAAACCCTGCTTGGCTTTGA

Protein sequence

STSSGLATSTIISKEFRSSVVKEGGR*GRGRGVVRKSKHGRCSLFTEGGLEVIQQL*GPLSCSCSNV*LLHYWKV*IRRDEGFHE*KQIG*PFEWVRICTHL*RQRWRLDARWGCPMGDVC*FMQTFEDHERV*CHWIREKGF*WKNNC*I*YCICC*RSYHSICESEL*PVID*WTVCGFSLRKNVSYFGSKNWGSHC*SC*R*C*RY*YCSFCCTQGV**RALA*NDCL*KVKDNFEVC*FG*KAC*RSCSTRNMG*WKNI*TIVKN*NPDVRTSLSILWWMGG*DPRTHSSCRWPVSCTNLARTYWRGRSDHSMELSSGHVCLESRPGISMREYYCSEDS*ANTFVCSIGG*AIP*GWTS*WRFEYCFWLWTYCWCCSC*SYGS**TCFYWINRNREGCT*ISIKKQSEASNVGAWWKIPFHCM*GC*CRQGCGNGTFCSVLQPGTMLLCWFSYFRS*KSTR*VCRKSKKPSCEPCCW*SFLRWNRARSSG*CRTIQEDIEIYKIWD*RWSHS*SRRR*VWFQGLLCPTNSFLKRQG*HENCRG*DFWSSTNNPKIQRD**GDKEGKC*SLWTGCWCVYSKHQHCQSVDTLAESRVSMDQLL*YI*CCSSFWWVQDEWTWERKGNLQP*QLPASKGCGHFFGKPCLALX
Homology
BLAST of Chy5G102430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A3Q0F024 (aldehyde dehydrogenase family 2 member B7, mitochondrial-like isoform X2 OS=Vigna radiata var. radiata OX=3916 GN=LOC106771087 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 2.4e-05
Identity = 24/41 (58.54%), Postives = 31/41 (75.61%), Query Frame = 0

Query: 565 GDKEGKC*SLWTGCWCVYSKHQHCQSVDTLAESRVSMDQLL 606
           GDK+G+C SLW GCW +YS+++HCQ +D    S  SMDQLL
Sbjct: 436 GDKKGQCNSLWPGCWSLYSEYRHCQYLDAGIASWNSMDQLL 476

BLAST of Chy5G102430 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A3Q0F1K6 (aldehyde dehydrogenase family 2 member B7, mitochondrial-like isoform X4 OS=Vigna radiata var. radiata OX=3916 GN=LOC106771087 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 2.4e-05
Identity = 24/41 (58.54%), Postives = 31/41 (75.61%), Query Frame = 0

Query: 565 GDKEGKC*SLWTGCWCVYSKHQHCQSVDTLAESRVSMDQLL 606
           GDK+G+C SLW GCW +YS+++HCQ +D    S  SMDQLL
Sbjct: 390 GDKKGQCNSLWPGCWSLYSEYRHCQYLDAGIASWNSMDQLL 430

BLAST of Chy5G102430 vs. NCBI nr
Match: XP_022637348.1 (aldehyde dehydrogenase family 2 member B7, mitochondrial-like isoform X2 [Vigna radiata var. radiata])

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 2.63e-05
Identity = 25/47 (53.19%), Postives = 33/47 (70.21%), Query Frame = 0

Query: 559 IQRD**GDKEGKC*SLWTGCWCVYSKHQHCQSVDTLAESRVSMDQLL 605
           +Q    GDK+G+C SLW GCW +YS+++HCQ +D    S  SMDQLL
Sbjct: 430 VQGSRGGDKKGQCNSLWPGCWSLYSEYRHCQYLDAGIASWNSMDQLL 476

BLAST of Chy5G102430 vs. NCBI nr
Match: XP_022637351.1 (aldehyde dehydrogenase family 2 member B7, mitochondrial-like isoform X4 [Vigna radiata var. radiata])

HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 4.14e-05
Identity = 24/41 (58.54%), Postives = 31/41 (75.61%), Query Frame = 0

Query: 565 GDKEGKC*SLWTGCWCVYSKHQHCQSVDTLAESRVSMDQLL 605
           GDK+G+C SLW GCW +YS+++HCQ +D    S  SMDQLL
Sbjct: 390 GDKKGQCNSLWPGCWSLYSEYRHCQYLDAGIASWNSMDQLL 430

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A3Q0F0242.4e-0558.54aldehyde dehydrogenase family 2 member B7, mitochondrial-like isoform X2 OS=Vign... [more]
A0A3Q0F1K62.4e-0558.54aldehyde dehydrogenase family 2 member B7, mitochondrial-like isoform X4 OS=Vign... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022637348.12.63e-0553.19aldehyde dehydrogenase family 2 member B7, mitochondrial-like isoform X2 [Vigna ... [more]
XP_022637351.14.14e-0558.54aldehyde dehydrogenase family 2 member B7, mitochondrial-like isoform X4 [Vigna ... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy5G102430.1Chy5G102430.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0016491 oxidoreductase activity