Chy5G101650 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy5G101650
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH05: 15707480 .. 15722051 (-)
RNA-Seq ExpressionChy5G101650
SyntenyChy5G101650
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AAATACGTTCGAAAGGTAACTGAACTATTTTTTTTTGTTAGATTTTTAAAAAAATAATTATATGGTATTTAGAATTAAAAAAAAAATATATATATAGTCGAGTAACTCCTAAACCTATTTGTAAACAAAAATTTTAAAACTTATTAACTAAAGGTAAAGTAATTTTCATTAGAAAAAAAGAAGTTGGGCAGGACTAAAAGGCCGACGTTGATCCAAAACGCCGAAACTTCGTGCACTTATAGGTAACGATATGCGGAAGGAAGAGAGCAATGATTTTCTTTTTTCGTATTTTGAAAAATAGCCACGAAGAAAAGCAAGAGGAAGCCCATTTTTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCCATCTTCTTCCCGACGCATCCATAGCCGCCGCGCCGCTGCCACTTTCGCCACCAGCTCCGCCACATCGCCGTCGTCGCTGCTACTGACGCTTCCGCGTCTGGTGGCGCTTTACAACTTTCCACCTTCAAATACAATATAATCTCTAAAGGCCAGTTTTCTTCACCCTTTGGATTATTCCCTCTCGATTACTTTTAATACCACGATATCACTCTTCGTTCCTCGTTTCTTATCTCATTCTTTCACTCATTACTACTTGTTTTTCATACTCTGATAAACGCTGTGCTTTGATTGTATTTTGCGTCTCTCTCTCACAGTCTATGGATAATTTCATTGGATTTTATTTTTATTTTCATTTTTATTTTTATGTCTTTTTTGAGCTGTTGAAGAATCCGCTTTTTGATAGAGATAGCTCGATTTTTTTAATTTTTTGTTTTTATGGTGTTTATGTTTTTGTGGAAGAAATTTTTAAGTCACTGAAGGTTGTTTTGGGATTTCGCTTTTGCAGGTTTTAGACTTCCAATGGCAAGGGCCCCAGCTCACTCAGGTGGCCGGACCGAGGTTCGTATAGTTATCGCTGGGGACCGTGGTACTGGAAAGTCGAGCTTGATCGTTACTGCTGCGGCGGACAATTTTCCAGTGAATGTCCCCCCGGTATTGCCGCCGACGAGGCTGCCTGAAGACTTTTACCCGGATCGTGTTCCCACCACAATCATCGATACTTCATCACGGTATTGGTTGCTATGTTTGTTTTGTTTGTTTTCATTCTGTCCTGATACTGAGACAATAGACTAAGAGAATGTGCTATTGTAGCCATTAATACTGCCTTTTAGGGTTATGGTTTTGAGATAACTAGTGCCAACTTTAATAAATAATAATAGGAGAATTCTGCTACCTACGGCGATATATCTGTATATCCCTTTCTTCCCTTGCTGCTTCTATATTTAAGCATGGCTACTTGTTTTTAGTGGGTGAAAATTAAATAGAAAAGAGAGTCCAGAGAATTGGCACCTTGTTCACTCTACATTCTGCTTTGCTGCCTGCTACTATATTTAAGCACGGCTACTGCTTCTGCCCATTCTCTTGTTGCTGGTTGGAGCACCATTTTCTAATTTTTAGCTTTCTAGATTGCTAGTCTACCGTCCTATCAATGTGTTTTATATGCTTCTTTAATGCAAATTACCCCCCCAAATTCCAATTGGAAAATAAAGCTGAGTATTTCTCGCTAATGTAATCTTCCACAAGGTATTCAAGGGCATTTTTTAAGTTTCTAAGGTTCCTCTTTTTGTTCGCTTGTTTTTCTTTGTCCCAGCACTGAGGATAGTGCAAAAGTTGCTGAGGAACTTAAGCGAGCTGATGCAGTGGTGTTAACTTATGCTTGTGATCAGCCTAACACCCTTGATCGGCTGAGTACTTTTTGGCTTCCAAAACTTCGTCAACTGGAGGTCAGTTAACTTTTACTCCCTCCTTTTACCTTGGTGGATGGAAAATGACACGGTAATAAAATCGCTGATCTTGGTGCTAACCTAACAAGTTTATCTTGATAAGTTTCTTCAATTTGAAAATTAAAGGGTCTCTTTCTCAAGATAAGCTCAGTGTTTTATAAGTTATGTTGGTTATTTTATTGATGTTGATTATAATGGTTTAAACAAGCAGGTGAGGGTTCCCGTCATAGTAGTGGGCTGTAAGCTGGATTTGAGAGATGAGGATCAGCAGGTGAGCTTGGAGCAGGTTATGTCCCCAATAATGCAGCAGTTTCGAGAAATTGAAACATGCATCGAGTGTTCAGCTTTTAAACATATCCAGGTATTCATCTTTCTATGAAATTATTTGCATTCTCAGTAAAAAAAGGAAACAAATTTATTTATTGCTCCCTTACTCATGAGTATATGAAGAAAAGGACCCCTCAAACCGTTCTGCATTATTTTCTGGTTTCACATCCAACTTCATTTATTGGTTCACTTAAATCTGCCGAGTAGTGCTTATTTGAAAATGTTGTCATCTATATCTCATAGATGTACGTTCACTTCTCATTTTTGCTTAGTTCACTGTTAAGGCTTTAGAACAACATGTTCTCAAAATTGTATTATTCCATTTGCAGATTCCTGAGGTCTTTTACTACGCCCAGAAAGCTGTACTTCACCCAACAGGTCCACTTTTTGATCAAGAAACTCAAACTCTAAAGCCTAGGTGTGTACGAGCATTGAAACGGATATTTATTCTTTGTGATCACGATAAAGACGGTGCTTTGAGCGATGCGGAGCTGAATGATTTTCAGGTCTTCCTTTAACCATAGTCTACAATTTTTTTGGCAAACACCTCATAAATTTTTTATCTTTGTCCGTAATAACTGACTTGACTCTATGGAGCTTTCTTATTATTGTTATTTTTCTCTCTCTTTTCTTTCAGGTCAAATGTTTCAACGCTCCTTTACAACCTTCTGAAATTGTTGGGGTTAAGAGGGTTGTGCAAGAAAAACTTCCTGAAGGAGTGAATGATCGTGGACTCACTTTGACAGGGTTCCTCTTTCTTCATGCTTTATTTATAGAGAAGGGGCGTTTGGAGACAACATGGACTGTACTCAGGAAGTTTGGGTACGATAATGATATCAAGCTTTCGGATGAACTTATCCCAACTTTAGGAAAGAGAGCTCCAGATCAGGTAATGAAAATAATATTGCAGCAGTCCTCTCAATTTCTGTAGAACACGCCAACTGCATCACACACTCTGATGATGACTTTCAAAATTATTCTTAACATAATATATATTCAGTTTTTACATTTTGTATACTGTTGGATATTTGTTTTCTCCAAGACTTTTCTCGAAATAGTTTTCTTTCACTTTCATGGAGCAGGCTTTAAATTAATATTGTAGATGTGGTAAATGCTTAGAGTGGAAGCCATTGACTTTTCCTGGATTGGTTGGGATGTGAAAATTTTCAATTTCAAGTGGAGTGATTTTCTTTAACTAGGTTTAGGGAGGATTTCTTGTTCTCCTTTTGTTTTACATTTATCATTTTGTGGTATGATATAATATTATAAAGAATATTAGGATTTAGTTATTTGTCTCTCATCAGGTGTTAATGATTTTGTAAGACAATATACTGCATTTTGTAATTTTTTTTCCTAAAGTGTTCCATATTATTCTAATTCTAGTTCAAAATTTCTTATCCAATGGCTGTTCTTTCTGTAGAGTGTGGAGCTGACAAATGAAGCACTCGAGTTTCTAAGGGGAATATTTGAGCTCTATGATGGTGATGGTGTATGTCATAGTTTACAACTTTCCAAATTATAAATTCTTAGTTTCTTTGTTGGTTTCTCAACCAATAGTTTGTTTGTTTCCTTTTGTATTTTAAAATTGTTTAGTATAATCGAGCTTATAGATCTGTTTTCGTAGCCAAGTAATCCATGCCTTTTCTTTACACTCCAGGATGGTGCCTTGCGTCCCCGTGATCTTGAAGAACTATTTTCTACAGCACCCGAGAGGTATTGGCTTTACAGTATTTGGTAGTTTCCTGTCATTTGGGGGATTATGGTTCAAACTTGTATAAACAAGATAACATCCTCGTGCATTGAGCGAGAAAATAATCTGTCATATTTTCTCTCATTTATTTGTTTTTTTGAAATATGCTTTTTTTTAAAAAATTTATAAAGTTGTTCATGAACTTTCAGGTATGTGTCTAAAAGTGTTGGATAGGTTCTGAGCTTTCATATTAATGTCATTTTGGTCCCTAAATGTTAAGAAATGTTGAAAAGGTCCTTAAACTTTCAATTTAGTGTTGTTTAGTGCTGGACTTAATATTCTTAGACCTACTAAACACTAAATTGCAAGTTCAGAATTCTATGCACTGTGCATTGTCCTTTTAGAATCTTATTGGTGAGAGTGCTGCAACATTTCTAAATGGCCTCTTCACATACCCCCTGGTTTTTACTCTTAGTTCTGCAACATTCTCATGGAAATTCTATCAAGATTTTTGAATGCCCCTGAATTCTTTTAGTTTGCATTTATGTTTTGTGGCTTTATTTTTATCCGTATGCCTTTGTAGAAATCTTGTCAAGATTTAAAATTTGAGTTTAGAGTATTTATGAGTCTACGACAGAAAGGATATATTTTTCACATAGATTTTATTTAGTATAGCTGGGCCCCTACTTATAAGTGGGTTCCCTTTTTGTGGGCTTGGTTTTTTTTTTGTATGCAGTGTACTTATATTCTTTCATTTCTACTCTATGAAAGTTGTTATATCAATATTGTGCTACTTGCTTGGGTTATATTTTGTTCTGTTCCTAAATAAATCTGAACTTTGTTGATACTGTAATACTTTTTTTCCCCTTGTTTTCATTCTTCCATGTGTCAAATTAATGCTCCAGATCTCATGATGTTTCAATTTTCAAATACATTAAAGCAACTACAATATAACATCGACCCTTTGCCTAGTTATAACTCAATTCTGTTGTGAAGATTTCTCATATTTTACTTGTGGTTGTTTAGATCCTACGTCTATCTTTACAAAATAGGTTTTGAAATTTTCTCCAACATTTGTTGTTAAACTGATTTGGCAACCATTATACCTTTCAACATAATTTATTGTTATTATTGTTATTATTTAATAAAACAACCACCTTCTTTGAGAAAGAAAATGAAAGAATACAA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mRNA sequence

AAATACAACAAACTATTCAACAGACCAGACGACTTAATGTTGCTAACACAAATCGAGAACGCATTCGACGTAGACGACGATGACAAGGCGATGATGTTGTAGAGGGAGATCAAGAAAAT

Coding sequence (CDS)

AAATACAACAAACTATTCAACAGACCAGACGACTTAATGTTGCTAACACAAATCGAGAACGCATTCGACGTAGACGACGATGACAAGGCGATGATGTTGTAGAGGGAGATCAAGAAAAT

Protein sequence

KYNKLFNRPDDLMLLTQIENAFDVDDDDKAMML*REIKKX
Homology
BLAST of Chy5G101650 vs. NCBI nr
Match: KAA0039295.1 (serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 4.54e-04
Identity = 21/32 (65.62%), Postives = 28/32 (87.50%), Query Frame = 0

Query: 1   KYNKLFNRPDDLMLLTQIENAFDVDDDDKAMM 32
           + N LF+RP+DLMLLT IE+AFDV+DDD+ +M
Sbjct: 428 RVNILFSRPNDLMLLTPIEDAFDVNDDDRTIM 459

BLAST of Chy5G101650 vs. NCBI nr
Match: TYK00479.1 (serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 4.55e-04
Identity = 21/32 (65.62%), Postives = 28/32 (87.50%), Query Frame = 0

Query: 1   KYNKLFNRPDDLMLLTQIENAFDVDDDDKAMM 32
           + N LF+RP+DLMLLT IE+AFDV+DDD+ +M
Sbjct: 379 RVNILFSRPNDLMLLTPIEDAFDVNDDDRTIM 410

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0039295.14.54e-0465.63serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumi... [more]
TYK00479.14.55e-0465.63serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein isoform X1 [Cucumi... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy5G101650.1Chy5G101650.1mRNA