Chy5G101220 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy5G101220
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH05: 15282516 .. 15285406 (-)
RNA-Seq ExpressionChy5G101220
SyntenyChy5G101220
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGCCTCTTCCTATCTTTGTTGGAGTCATAGGTAAAACAGAAAGAAAAATGAAAAAACAAACAAAAAAAAAACCTAATTTTAGTTTGTATTGATATAATCTAATTTTGTTTTTAGTTCAAATTTTCTCTCTTCATTTTATGCGTTTTAAAAGGGCTAATACTATTTTTTTTTTTACTTTTCAAGAAATATGATTTCAGTATTGTTCGTCATTTCTCCAATGTAAGTTCACTCGATAAATTCTCTTTTCGTTTTGTAACGATTTTGTTCATTTCACTTAGCCCGTCTTGGTGAGATTGTTTTTTTCCTTCAATCTTTGGTTAAATTTTTATAGTTGAATGTTTGTTTAATTAAAATCTCTATACTTTCAAATCTAATTTTAGTTATATGATACTTTCTAGTCTCTATTTGGCTTTTCTTTTTTTGTTTTGTTTATTTTTCTTAATTAGTGTTTTCATTATAAAATTTGAAACTATATTCTTATATTATATTCAAATGCATGAAAAAATGTTGTAGTTATTTAACCCAATTTAGATAAGAATCAATTTTGAGGAACTCACTCACCCTAAAGAAAGTTTACCTCTAAAAGCATAGTTTTAATAAACTTAGATTCCTATTTGTTCTTTGAAATTTGAAAAAAGCAATAGACTACAAATATCTCAAACAGTTTTTTACAAGTGAGAAAAAAAAAGTATTGAAGTTTTCCAATTTTCCATTTTAGTTTTCGAATTTCGAGTTTGATGTACTGTTACTCCCTAGATTTAAAGTTTGATCAATAAGTTAATGGATATTAATGTGATGAATTTTGTGGAGAAAAACATTTTGGAGAGTGTTGAAGAAAAGATCAACAGAAGAGTTTGATAGTCTTCCATATGTTTCGACATTCCTCACAGCTTCTTTATGGGCTTATTATGGTCTCATTAAGCCTGATGGCTTTCTCATTGTTACTGTCAACATCTTTGGACTTTCCCTACAAATCTGTTACCTCAGCATCTTCCTTCTCTTTTCACCTCCACACATGAAAGTATGTTGTAACTCGTTGACACCATACCCGTTTCTCATCGTTGCCCTACTTTCATAACTTCCGATTTGGTTTTCGACATCCTTGAACATGACTTTTAACCATTTCCATCTCGAACTCACAACACTTGACTGCTAGCTGAATTGCATCTAATATTTTTTACGATACAATCAAATAAAAAACATATTTTTCAAAAAAGAAAGACACGTTTGATTGCCACGTGTGGCGGCTGGACTGCAAAAAAATGGATACAATAGTATAACCCAACTACTAGGTAAACGTCAAAACTAAATATACATTTTAAGAACTCATGAACCAAACATATAACATACGAATTTAGAACAACATGTGTGTATCCAATGTTCGACCTCTTTTTCGTTTTTGAGATTTTAAGAATATGAAAACATTTGATCTTTGAGTTTTCAAAAGGTATTCATTTTTTTTCTTGAATTACAAAGGTGTATATTGATTTTTTGTTAACGTTGTTGTCTCGTAATATGTTTTTGTATATATTTTTTGTAGGTTAGAACAACAACTTTAGTGGCAATTTTTGACGTTGGATTCGTGAGAGGAACAATATTGATATCGTATTTCATGTTACATGGAAACTCTCGAATCAATGTGATTGGACTCATTTGTGCTGCTCTTAACATTATAAATTGCAGTTCACCTCTAGGAATAGTGGTTAGTATATAATTCTTTCCAAATTAAACTCTACCAAAGTTAATTAATGTCTCATTTGATAACTATTTGCATTATTTCGATCTCAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTGAAAATCCAAATATTATTAATAATGAAAATGAAAATATAATGCAGAGGAAAGTGGTGAGAAGTAAAAGTGTGGAGTATATGCCATTCCTTCTGACTTTGTGCATATTTTTAAACTCAGTTTGGACTTTCTATGCTCTTCTCGTCAAAGATCCCTTCATTGGAGTAAGTTTTCTTTTTCTCTCATAATTATATACATGTGTAATATATATATATATATATATATATATATATATATACATACGTGTTTGTGTTTGTGTCTGATAACCCTAGCTACATTAGTTTTGTTGCGGTGTTCGTATCGATATTTAGTATATTGTTAATTGTTAATCTAGTATGCGTTAAAATGATCCTTGTATTTAATGTTTGATGATAACCTATTATTCTTCATAGTACGTTTCATTAATCTTTGTGTATATGCTAGCTAAATCTGAAGTTTAATGACGACGATATAACAACGAAAGTTGTTTCTTATAAGTTTTTATAGGGTATTGTAATTAGTAGCACTTAGACTAATAATGAACTGTATAATACTAACAAAATCAATAAGTTCGTTGATGTCTAATCAACGCTAAGAGATGTTGAACCCTCAAGTTTACAAATATATATATATATATCAATACACTGATAAGTAACTTAATCCCGACTTCAAACAAAACTATCTTTTATTGGTTGTGTTTTTTTTTCTTGGGATATTGTATTGTAATTGAGATTGGATTATATTAATTAGTTGTTTGATTGGTTGCTTTCTAGCTTTGTTTTGAAATAAATATATTAATTTAAACTTAAGTCTCAATTACATTAAAAATTGATATCCTTTTCCCTTTTGATAATATATTTGTGTTGAATTGCATATGTAATTAATAATGCCATATAATGACTTTCTTTTGTAGGTACCAAATTTTATTGGATTCCTTCTAGGATTGATGCAATTGGTAATCTATGTCATTTACATGAATGGACCTCAACCTTCCCACATCCCCATCTCATACAACAAAGAGAACACTTCTTTGTTACATGAGCATCTTCTTCCACCACCTTCCGAAACCACGTCGTCTTCAAAAACTGACCAACCCTAA

mRNA sequence

ATGGAGCCTCTTCCTATCTTTGTTGGAGTCATAGAAATATGATTTCAGTATTGTTCGTCATTTCTCCAATAAAAACATTTTGGAGAGTGTTGAAGAAAAGATCAACAGAAGAGTTTGATAGTCTTCCATATGTTTCGACATTCCTCACAGCTTCTTTATGGGCTTATTATGGTCTCATTAAGCCTGATGGCTTTCTCATTGTTACTGTCAACATCTTTGGACTTTCCCTACAAATCTGTTACCTCAGCATCTTCCTTCTCTTTTCACCTCCACACATGAAAGTTAGAACAACAACTTTAGTGGCAATTTTTGACGTTGGATTCGTGAGAGGAACAATATTGATATCGTATTTCATGTTACATGGAAACTCTCGAATCAATGTGATTGGACTCATTTGTGCTGCTCTTAACATTATAAATTGCAGTTCACCTCTAGGAATAGTGAGGAAAGTGGTGAGAAGTAAAAGTGTGGAGTATATGCCATTCCTTCTGACTTTGTGCATATTTTTAAACTCAGTTTGGACTTTCTATGCTCTTCTCGTCAAAGATCCCTTCATTGGAGTACCAAATTTTATTGGATTCCTTCTAGGATTGATGCAATTGGTAATCTATGTCATTTACATGAATGGACCTCAACCTTCCCACATCCCCATCTCATACAACAAAGAGAACACTTCTTTGTTACATGAGCATCTTCTTCCACCACCTTCCGAAACCACGTCGTCTTCAAAAACTGACCAACCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGCCTCTTCCTATCTTTGTTGGAGTCATAGAAATATGATTTCAGTATTGTTCGTCATTTCTCCAATAAAAACATTTTGGAGAGTGTTGAAGAAAAGATCAACAGAAGAGTTTGATAGTCTTCCATATGTTTCGACATTCCTCACAGCTTCTTTATGGGCTTATTATGGTCTCATTAAGCCTGATGGCTTTCTCATTGTTACTGTCAACATCTTTGGACTTTCCCTACAAATCTGTTACCTCAGCATCTTCCTTCTCTTTTCACCTCCACACATGAAAGTTAGAACAACAACTTTAGTGGCAATTTTTGACGTTGGATTCGTGAGAGGAACAATATTGATATCGTATTTCATGTTACATGGAAACTCTCGAATCAATGTGATTGGACTCATTTGTGCTGCTCTTAACATTATAAATTGCAGTTCACCTCTAGGAATAGTGAGGAAAGTGGTGAGAAGTAAAAGTGTGGAGTATATGCCATTCCTTCTGACTTTGTGCATATTTTTAAACTCAGTTTGGACTTTCTATGCTCTTCTCGTCAAAGATCCCTTCATTGGAGTACCAAATTTTATTGGATTCCTTCTAGGATTGATGCAATTGGTAATCTATGTCATTTACATGAATGGACCTCAACCTTCCCACATCCCCATCTCATACAACAAAGAGAACACTTCTTTGTTACATGAGCATCTTCTTCCACCACCTTCCGAAACCACGTCGTCTTCAAAAACTGACCAACCCTAA

Protein sequence

MEPLPIFVGVIEI*FQYCSSFLQ*KHFGEC*RKDQQKSLIVFHMFRHSSQLLYGLIMVSLSLMAFSLLLSTSLDFPYKSVTSASSFSFHLHT*KLEQQL*WQFLTLDS*EEQY*YRISCYMETLESM*LDSFVLLLTL*IAVHL*E**GKW*EVKVWSICHSF*LCAYF*TQFGLSMLFSSKIPSLEYQILLDSF*D*CNW*SMSFT*MDLNLPTSPSHTTKRTLLCYMSIFFHHLPKPRRLQKLTNPX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy5G101220.1Chy5G101220.1mRNA