Chy5G100060 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy5G100060
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH05: 14273977 .. 14278248 (-)
RNA-Seq ExpressionChy5G100060
SyntenyChy5G100060
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GTCGAAATCTAGGAGGGTGTCTTTGAACTTGAGGAGCTTTTCTCTAATTTTCCTTGCTTCTCTTGTCGGGTACAATTCAGAAGACTCTCGGAAGACTCGTTGTCTTTTTTCTTATTAGGGTAAATATATCGAAATGGTACTTGAATTAGGTAATTCTCAATTTCATTCCTACTTTTTAAAAATTCTGTTTTTAGTTCTTCTTATTATTAAAATGTCATTTTGATTACTATATTTTGAAGTTTATTTAATTTTGATCTATATATACTTTCAATTGTCTAATTTTTATCCACGCAATTTCAATAAATCTAAAGTTTAGTTTATATACATATTTAAGGTTGCTTTTGTAAGAACCCTTTTATTAATTAATTTTGAAAACATATTCCTATGTAAATTAATTTTAATAGGCTAAAATTAAGATTTATTAAAATTATATGTTTTAAATTTGAATAAACACCCAAAGTCTAGTGAGCAAAATGGTAATTTAACTTTTTTTTTTCCAAAAAAGGAAACTACTTAAATTTTTTATAGCCGTACATTTCATTTTTCAAAGAATAAAAATTGAACGTCACATTAACAATCTCAATTTCTTCCACACACAATTCAATGATACATAATTTTTCTCTCTCACACACAAATTTTAGTGTAAGGAATAAATTGAGAATTATGTAAAGGATGAGCAAGAACCATTTTATATATTTAGCCTTCTTGGCTTATTTATTTGTTTTTTGAAAAAAAAAAAAAAAGAATTAATTCTTCTCCTAATATTGGAGGGTTTCGGCAGTGTAACGATGAACCAAAACGTTTACTTTGAGGGAGTTTTTTTAGTTAGTTCGTCAATGGCGACGGCAATGACTAATTTGATTCCGGCGGTGACGTTTGTAATAGCAACAATTGTCGGGTAAGTTTAATATTGGTAAAAATATATTCTATAACACCTTATAAACTTTTGAGTTGAGCTATATATTATGATTATTTAATGGTATGAAAAATTTATAGGATGGAGAATTTGAAGATGGGAAGCTTGAGAAGCATGGCAAAGATTGGTGGGACAGTGATTTGCGTGAGTGGAGCCATGTGCATGGCTCTTCTGAGAGGACCAAAGCTTCTCAATTCAACACAAGATTTTGGGTTGAAATCTACAATATTTGGTGTGGAAAGTGGAGGCCAAACTGCTTGGTTATTGGGTTCCTTGTGTCTCTTTGGCAGTTGCTGTTGCTGGTCAATTTGGTTGATTTTGCAGGTATAAATTCTCAATTCATTGTGTTAAATTAAAATTAGAAAAAAAAATTAGGGTTTGTTCTCAAATTCTAAATATAGTAAAATAAATCAAAATATTTTAAAATATAGTAAAATATCACTGTATATTTATTTGTGATAGACCACATTATACTACTATGTGTATCTATCATGACCCATATATGATAGACACATGTAGTAGTCTACCGTTAATAAATCGTGATATTGTTTTATGTTCTTGTAAATAGTACTTTCAACAGTTTTATCATTTAAAATAACTTTTTTAAAAATTATAAATTAACCATACGTTTTTTTACTTTATAGATACATATGAGATGATATTTAGATTGATGGAGCCAATGGAACCATGCATATTCTTTTGGCATATAATAGCAATATTGATACTAATGGTGGTGTTTGTTTTGTTAATTTACTTTTGAAGAAAATGAGGTTGGCTTTGTGGGACTATTTTGGAGAAGATTCCTTATAAAAAGAAAAAGTGAGCTTGCTTGTTTTATATTTTTGTTTTTGCAAGGGACCCCCCCTTTTTTTTTCTCTTTTAAGTACTTGTTTTAGTTTTGTAAATAGTTAGAGGCTTGGTTGAGATTTCTTTTCCCAAAACAATTTTGTTTTAGGTTTTAGGAGCAACAGTGAATAAAACAAGACTAATCTAATTAAATCGGTTAGTCGATAATAGTTCTTGGAACTACAATCTTGTTGGTTAGGTTTTGTTTGTTTGACCAAAATGAAGTTTTAAAAGAAAATCAAGCTTATTATAATCACTACTTTTACTTTCCTTCTTTTCTTTGGATAAGACTAATTTAAACACGTACGAGAGAGGTAGATTACAAAACAAAGAAATTAATTAAAAATATCTCGAAAAAATAGTAATAATTGTAATTATCAATTGAAACAGGTACCCGCTTCAGTCAGCTATCCAGACAACTTATCTTTATCGGCATGGATGTGTTTGATGGGTACAATTCAATCCATCATGCTTACTCTATTGGTTGAACCAATCAATCTACAAACTTGGAAAATACATTCAACTATTGAACTTATTTGTTATCTTTTCTCGGTAGGTATTTTCTTTTCATTTTCTATTTTTAATGTATGATAAATTGGCTTTGTTCTATAATTATTTTTCTAAATTATGTTTGTTGCATTTTTTCTCTCTCTCAATCTCTTATAGTTTTTTTTTAATTACAAAATATAATAAAATTTCAAACATTATTATAGACTTTTATTAGTGTTTATGATCCGTGCATTTGTGTATAATTACTTGTTATCGATAGAATTTGAAATTTCTTAAATAATTTTAGTAGTTTTGTAATTTACAACTTTTTCTATATTTTTTAATAAATAAATGGGTCGATTAATTCTTATACAATCAAATTCCAAAAGCAAAAATAACTTATATTAAAAACTATCCTTTTAAGTTTTCAATTCTTTGCTTTGGTTTTTAAAAACATTGGTAAAATATAGATATTAAAACTATAAATCAAATACTTATTAAACTAGAATTAAAAATACTTCCTTTTTAGTTTGTAAACTTAGGCCCATGCTTTTCAAACACTATTCGTGAGTAGATAAGAAAACGAAAAAATCACCGGATGAAAATAGTTTTACAAAAGTATAAACTTTTAAAAACCAAATGCAGAAACAAATTTGAATGTGTTTTCAAGGAAGGAAAAATGTTTAACCAAAAGTGGTAAGGAAACGAGCATAGTTTCAAAAAATAAAAAATGGTTATCAAACGTAGCGAGCTAAAGTTGAACGATAGAGTTTTGATTGGTGTAAAAAAAATTGGTTGGTAGGGAATTGTTGGGTCAGGTGTTGCCTTCTTTGTTCAAGCTTGGTGTGTTTCAAAGAGAGGACCTGTCTTCTCAGCAATGTTCAACCCTCTCTGCACCATTGTTACAACCATTTTGGCTGCCATTGTTCTTCATGAGGAAATATTTACTGGAAGGTATATTCTATATTCCTCTTTTCTATACTGTTTGATTCTGTCTCTCTCCTATATTATTTCAACAGTTCAAAAGTATCATTATTCTAGTGGTCACACCTCCAATGATTTTTGCTAACCCTACCTCTATTCATTTTCTTTTCAAATTTTTCATTATTCAAGTCCTATTAATTTGATAACTATTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTTTACTATAATTTTCACCACTCTTAAATATATATACTTGATGTTTATAAAAATATTTTCATTTAATTTTTAAATTTTGGATTAAGACAAATTTTTTTTTAAAAAAAATAGATAACAAAGACAGAACAATTATAGATAGCTTAATTTTCAAAATAAAAGATAAGACCTCATTTAATTTGAAAATCATTTTATTATTTTTTTAAAGCAAGCTTATAAATATTGTTATCGTATAAGTTTCTTCGTTTTAGTTATTTAATTTCTATCAATATTTTAAAAAATCAAGTTAAAATTTAAAAATTGAAGAAGTAGTTTTAAATGGCAAAAATGTTAAAAACATTTTCAAATATAGAAAAATGATATTTGTGGCTATATTAGCAATTACTTTAGTTATTTTTATATTTGAAAACAATCCTTATTAAAAAAGTCTTTTTAAATAGAAATTTGACTCTTGGGGTTGCACAAATTTCTTTATGGAAAGGCAAAACAAACATTTCAAAGCATTCATTTTTTTTTTCTTTTCCTCTCTTTAATATACACACATGACCCTTTATTCTTCAATAGCCTTTTATGTTAAAAATGAAAATTTTCAATATATAAAGCTATTGGTAAAGTTTCCTCGTCTTTTTTTCCCCTCATAAGTTTAATTTCTTTATTATTATTGGAACAAATTAATTTACAGCTTGTTGGGGGGTGTGGCTGTGATTATTGGATTGTACATTGTTCTTTGGGGAAAAGCAAAAGATTATGTGGAGGTTGAAGCCAAATTAGAAAAGCCAAGTCTTGATAACAAAGAAGAGGTTTGTGAATCACTTGAGAGAAGCACTGATCAAATTGATTTGGAGGAACCACTTTTGTCTAAAGAATAA

mRNA sequence

GTCGAAATCTAGGAGGGTGTCTTTGAACTTGAGGAGCTTTTCTCTAATTTTCCTTGCTTCTCTTGTCGGTGTAACGATGAACCAAAACGTTTACTTTGAGGGAGTTTTTTTAGTTAGTTCGTCAATGGCGACGGCAATGACTAATTTGATTCCGGCGGTGACGTTTGTAATAGCAACAATTGTCGGGATGGAGAATTTGAAGATGGGAAGCTTGAGAAGCATGGCAAAGATTGGTGGGACAGTGATTTGCGTGAGTGGAGCCATGTGCATGGCTCTTCTGAGAGGACCAAAGCTTCTCAATTCAACACAAGATTTTGGGTTGAAATCTACAATATTTGGTGTGGAAAGTGGAGGCCAAACTGCTTGGTTATTGGGTTCCTTGTGTCTCTTTGGCAGTTGCTGTTGCTGGTCAATTTGGTTGATTTTGCAGGTACCCGCTTCAGTCAGCTATCCAGACAACTTATCTTTATCGGCATGGATGTGTTTGATGGGTACAATTCAATCCATCATGCTTACTCTATTGGTTGAACCAATCAATCTACAAACTTGGAAAATACATTCAACTATTGAACTTATTTGTTATCTTTTCTCGGGAATTGTTGGGTCAGGTGTTGCCTTCTTTGTTCAAGCTTGGTGTGTTTCAAAGAGAGGACCTGTCTTCTCAGCAATGTTCAACCCTCTCTGCACCATTGTTACAACCATTTTGGCTGCCATTGTTCTTCATGAGGAAATATTTACTGGAAGCTTGTTGGGGGGTGTGGCTGTGATTATTGGATTGTACATTGTTCTTTGGGGAAAAGCAAAAGATTATGTGGAGGTTGAAGCCAAATTAGAAAAGCCAAGTCTTGATAACAAAGAAGAGGTTTGTGAATCACTTGAGAGAAGCACTGATCAAATTGATTTGGAGGAACCACTTTTGTCTAAAGAATAA

Coding sequence (CDS)

GTCGAAATCTAGGAGGGTGTCTTTGAACTTGAGGAGCTTTTCTCTAATTTTCCTTGCTTCTCTTGTCGGTGTAACGATGAACCAAAACGTTTACTTTGAGGGAGTTTTTTTAGTTAGTTCGTCAATGGCGACGGCAATGACTAATTTGATTCCGGCGGTGACGTTTGTAATAGCAACAATTGTCGGGATGGAGAATTTGAAGATGGGAAGCTTGAGAAGCATGGCAAAGATTGGTGGGACAGTGATTTGCGTGAGTGGAGCCATGTGCATGGCTCTTCTGAGAGGACCAAAGCTTCTCAATTCAACACAAGATTTTGGGTTGAAATCTACAATATTTGGTGTGGAAAGTGGAGGCCAAACTGCTTGGTTATTGGGTTCCTTGTGTCTCTTTGGCAGTTGCTGTTGCTGGTCAATTTGGTTGATTTTGCAGGTACCCGCTTCAGTCAGCTATCCAGACAACTTATCTTTATCGGCATGGATGTGTTTGATGGGTACAATTCAATCCATCATGCTTACTCTATTGGTTGAACCAATCAATCTACAAACTTGGAAAATACATTCAACTATTGAACTTATTTGTTATCTTTTCTCGGGAATTGTTGGGTCAGGTGTTGCCTTCTTTGTTCAAGCTTGGTGTGTTTCAAAGAGAGGACCTGTCTTCTCAGCAATGTTCAACCCTCTCTGCACCATTGTTACAACCATTTTGGCTGCCATTGTTCTTCATGAGGAAATATTTACTGGAAGCTTGTTGGGGGGTGTGGCTGTGATTATTGGATTGTACATTGTTCTTTGGGGAAAAGCAAAAGATTATGTGGAGGTTGAAGCCAAATTAGAAAAGCCAAGTCTTGATAACAAAGAAGAGGTTTGTGAATCACTTGAGAGAAGCACTGATCAAATTGATTTGGAGGAACCACTTTTGTCTAAAGAATAA

Protein sequence

VEI*EGVFELEELFSNFPCFSCRCNDEPKRLL*GSFFS*FVNGDGND*FDSGGDVCNSNNCRDGEFEDGKLEKHGKDWWDSDLREWSHVHGSSERTKASQFNTRFWVEIYNIWCGKWRPNCLVIGFLVSLWQLLLLVNLVDFAGTRFSQLSRQLIFIGMDVFDGYNSIHHAYSIG*TNQSTNLENTFNY*TYLLSFLGNCWVRCCLLCSSLVCFKERTCLLSNVQPSLHHCYNHFGCHCSS*GNIYWKLVGGCGCDYWIVHCSLGKSKRLCGG*SQIRKAKS**QRRGL*IT*EKH*SN*FGGTTFV*RIX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy5G100060.1Chy5G100060.1mRNA