
Chy5G099870 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCAAGAAGAGGTTATGCAAATCTTGCCGAGGATATGGTAATTATGAATGTTATAGTATTTTACAGATATTCTTAAATTTAACTATGGTATGCTTAATGATATGCAGAAAAAGGATCATTCTAATGAACATGATTTTGGAAGAGCTAATATGTGGAAAAAAGCTCGAACAAAAAAAAAATGGAGGGTACATGAACGAAGATGTACAAAATGTTGCCAATCAAATAGTAAGATTCTCAATGTTACATGTGCATCAAAATCACATGAATAATATTTTACATATTACTGATCAAATTTTACTCCTTTTAGGATGAGATTTTGAATAGCAATGCAGATCCACTCTCTAAGAAATATGAATCACCTAATGATACATTGACTCAAGCTTTGGGTACTCCAGAATATGGTGGTCGAGTACGTGGTGTGGGTGGTTTCATTACACCACTGTTTATTTTCACACAGCCAAACCAAGAAAGTCAAAAAAGGTGGATACAACCCAACAAATTATTGATGAAAATGAAGCACTTCGTCAACGCATTCGAGAGCTGGAAGAAAAAGTTCAAAACATTCCAACATCCGAGCATGGTAGTTGCTCCAGGAATAAAGTCCAGAAGAAGGTAAAAATTTTGTTTCTAAAGTAAAGTTACAATATTAATTGTTTATCAAAGTGAAGTTATCATTAATTTGTGCTTTGACATTTTGGATGGTTTTAGGAGATAGTTTTAAAGAAGATGGCTAATGATACACATTTAGAAAACATGGTAAAAGTGAAGAAAGAGATTGCTACTAGTGTACCACCGATATCACTTACATTAAAGAAGAAGGTGGTAAAAGAGGAGGAAGTGGAAGAGGAGGAACTGATTGCTACTAAGCCACAGATATCAAAGAATGAGGTAAATGTGAAGGTGGATTGTAAACAAATAATTTTACGTATATAAGTTCTTAGATTGTTACTTAATTGTGTTAGGTAAAAGCTTCAAGGTCGATGACAAAAGATGTGGAAGTTACTTGTGCACCATCCAATCTACCAATTCAATTGAAATATATTCTCCGATATGTTGAAAGGGTAATGGTTGATGGGTCTAGTTTTTCCTTTCAACTACCTTTTGAGTTATTTGGTATATGCCGAAAGAGTTACGTCTTGCGAGAAGATGTCATTGATTTTTCCAACATGCAAAAAGTGAACTTTATCAATGGTTGCTTATATCACGTAAGTAAATGTTATATCTTTATGATATATGTACTCACACTTTTTAATTAGTAATAAGTTCATGTGTGCAATTGATTTATTGTAGGTACTTACACTCACTCATTATTGATTTAAAGAAGGTTTCAAAGTACATTTTTGTAGATCCATCTCTTATTTCAACTGGCCATAGTACTCGAGAAATTAGAGCTCGAAACCTTTGTAGTAGATTAATGACTTCTAAACAAGATCAATTAGTTATTGCTCCTTATAATCCCGGGTAAGTATAATTTTTATCAATTCAAACTTCCTTAGTAGCAAGATACTAATTACTTGCATATATATTTCATTTAGTGATCACTGGTCATTAGTAGTCATTAATGCATATGATGATGTGGTGTACCATCCTGACTCATTGAGAACAAGTTCCCAAGAAGATATCAAGTACATAACGAATATGTAAGCTAACTCCATTTATGTTTTCTTTTCTCCCTAAAAAAATCTATTTAATTTTGAATTATACTATACATTGGAAAATGTAGGGCCTTGACAATTTTTCAATCTCAGAAGAATTTGAAAAAGACAAGAAAAACAACATTTTGGAAAACGGTAAAGGTAAATATATTTATAAAATAATTTTTATTTTAATCTAGCACATAATATAATATATATATATATGCATTGTTAATTGGTTGTGTTACAGTATCCTTTACAAGTAGGTACTGTTGAATGTGGATATTATGTCATGAGATACATGCAAGAAATTGTGACTAAGGACACAAACATTATCACTGATGCGGTATGTTTTTAAACTATTTACATTGTAACGTTATAGATAGTATAATATGACTAACTCAAATATTTTACAAAGTGTATTCTACTTTTTATGTTTTATAGATTGGTACGAGAAGCCCATACACACAGCTTGAATTGGATGAAGTACGAGAGGAGTGGGCTGAATTTTTAGCTCGGTACATATGATAGACACTGTAACGCCCTAAAGAAAAGAAAAAAAAAACGGGTAATAATGAAAATAATAAGATTTTATTATTAATTATTAAATATTTTTATTTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAATTTCCCTTTTTCTTCTTCTTCTTCGCGTGCCCCCCCTCTCCATTTTTCTTTTTCTTTCTTCTTCCCCTTCTCTTTGCCCTAGCCGCCAACCACCACAGCAGCCAGCCACACCGCACCACCGCCCAGCCGCATCGCGCCCGCCGCCCAGCCCCGTCGCGACGCCGCCGTCCGTCCGCGAAGGATTTCAGCCGAAACCAGCCGAAACACCCCCCTCCTCAGATCTGTCCGCCGTTCCTCCTTCCGTCGCCGCCTGCCTCCGTCTCGGCATTTCCGACGAAGCCCAGCAGCCGCGCATCTCTCAGCCAGCCGCGACGCCCCGTCCGCCAGCCGAAACTGCCCCCTTCCTCAGATCCGTTCTTCGCGCGCCGGGCCTTCCTAGGTTCTGAAGTCCGACGAACCAGTCGCCACTGCCCTCCTTGCGCAAAGCCGATCCATTTAGCTACGATCGGAGCTCTGCCGCTGCATCTGCTGTCGACATCAGTCGACCGATAGCCACTGCCGCTGTAAGTTGTGGGTTATGTAATGTTGTCCTAGCTAGCATAAGTTGTAAGGTTGATTATTTGTTTGGTTGTTGTTTGATTAAGGTGGTACTCGAATTTCTAAGCTTCGGAGCAAGCCTCATTGGAAGTGTTGTTCATTCAATTTGGGTAAGTTGTGAAACATCACATTGGGTTGATTTAAACGAATGATGCGTTAGAGAAAGATATTGAGTATTTATCTTAATGTTTAGGTTCGTCTGCACAGACCTTGCGCGGTTAAGAAGTTTACCTAACGCCAAGGTAAGGGACTTTCTACTGGACTCAATAACAAGAATTAAGATATATTGACTATATGGACTGAAATGTTATGTCTGGACTGAGTAGTGATGACGGTTATACTGTGTGTTTGGGTGTGGACTGAAAGTTTAATGCATATTGTGCTTGACTGAATGAAATTTATATATGTATGTATGGATTGACGTGGACTTGTTGTCTAGCGTATGTTGTGACTGCTTGGCTATTTATGTGGCTGACTGATGTAGTGATATGTTTCGACTGTCCTTGAGTGAAATTTGGATAATATGGTTGTTTGAGGTTATAGGGGGAGCTTATGTGATAAGAAAATTTGACTGTATTGAGGATGATTTTAAAGAGGTTTAGAATGGACTGAGGGGATAAATTATTAGTTTCCTAGTGGATAGTTACCCTGCGGGTGTCCTTCGGGATCATCCCCTTTATGTGCATCCTTCAGGAGCACTAGACTGATATGTGCATCCTACGGGATCGCAAGACTGTGACTGTGCAGGGTACACCATAGGATGCTAATAATTTATTTTCCCATAACGGGACCAGTAGTGGGTCTCTTACTGAGTATATTAATACTCACCCTTTTTATGTTTAACTTTTCAAGCAAAGGTAACACGAGGGGCAGACCGACGAGGGACAAGAAGGACTCGTGAATTGCCATAGGGGACTGTCTTTAAACTGCTTCCGCTGACGGTTTGAAAATATTTTGATTGAACTAAGTCTACAAATAGTTAAATTTTTGTAAACAGCATTTGAAATTTTGTATTTTTGAAATAGGGCCCGATTAAAATTTCCCTTCGTTTTCTTACGGTTTCAACTGAATATTGCTATGTCTTTTGTCAACAAACGGTTTTGTGTCAAATTGACGACTTAGACGGTCAGTCCGAAAAGTTTGGGTCGTCACAGACACACCTAGATATGATATTGTTAATTTTGTAAATGGCTAAGATATGGGAATGCTCGTAACCTTTTTTGTGGAAACGTTTTGTTCATAGCCATTATGAGGACAAAAGATATATGGGGATAGACTTCAATTTTGATTATATGAGACAACTATTATCATTTAATATTTTGGAATATGACACATATAGGAAATTTTAGTTGGCTATATTGGATTGGAATTGTGTAATTGTTAATGACATTGTTGAGAAGAATGAAATTATTGTTGGTTTACATATTATACTAAACTTTTTGTCCTTTTTTTTGTTGTGTAACTATTGGTTGGAGAGTTTATTTTGTTTATGGATATGTCTTATTGAAACAAATGTATGTAATGCAGGAAATGAAAAATGAAAAATGAAAATTGTAGTATATTTAATATATTAATAAACGGTATACATGACGTTAAATACATGTCACGTATACTATCTTATTTGAGTCAAATATATCATTTTGCTTGATGGATATATAGTGTCAACTATAGAATTTTACTTGATATGTACATAATGTCAAATATACTATCTCACTTGACAGGTAAATAGAGTCAAGTATATATCTTACTCGACGTGTAAATAGTGTCAGGTATACTATCTCACGTGACAGGTAAATAGAGTCAAGTATCTATATTACTTGACGTGTAAATATTGTCAAGTATATGATCTTACTTGACGTTAAAAAATCGTCAAACACAATCTCTTACTTGGAACGTAAACAACGTCAAATATACTATCTTACTTGACACAAAAATGACGTCAAGCAATAGAGTATTTGACGTTTTTTTGAGTGTCAAGTAATAGGACTATACTTGACATTAGATTACTTGACACTTTTTAAAGTGTCAAGTGAGCGTCAAGTATAGATTTACTTGACACTGTATTAACGTCAAGTAATTCAATTTTTGTAGTAGTGGCAACGACTCAAAGAACAAATGATGCATTCGTAAGGGGAGTAGA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Match: A0A5D3D5Z2 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold418G00230 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 252.7 bits (644), Expect = 3.0e-63 Identity = 159/285 (55.79%), Postives = 190/285 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G099870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DH49 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold195G001150 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 252.7 bits (644), Expect = 3.0e-63 Identity = 159/285 (55.79%), Postives = 190/285 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G099870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BSE4 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold264G00030 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 252.7 bits (644), Expect = 3.0e-63 Identity = 159/285 (55.79%), Postives = 190/285 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G099870 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BT71 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold49G00560 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 251.1 bits (640), Expect = 8.6e-63 Identity = 155/278 (55.76%), Postives = 189/278 (67.99%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G099870 vs. NCBI nr
Match: TYK01269.1 (transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 249 bits (636), Expect = 7.06e-74 Identity = 155/279 (55.56%), Postives = 187/279 (67.03%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G099870 vs. NCBI nr
Match: TYK08650.1 (transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 248 bits (632), Expect = 1.25e-73 Identity = 161/290 (55.52%), Postives = 189/290 (65.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G099870 vs. NCBI nr
Match: KAA0033885.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold43059G00700 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 244 bits (624), Expect = 8.76e-73 Identity = 153/279 (54.84%), Postives = 186/279 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G099870 vs. NCBI nr
Match: TYK22869.1 (hypothetical protein E5676_scaffold334G00040 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 252 bits (644), Expect = 8.48e-70 Identity = 160/285 (56.14%), Postives = 191/285 (67.02%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G099870 vs. NCBI nr
Match: TYK01009.1 (transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 250 bits (639), Expect = 3.23e-69 Identity = 159/285 (55.79%), Postives = 190/285 (66.67%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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