Chy5G098310 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy5G098310
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH05: 11230982 .. 11240130 (+)
RNA-Seq ExpressionChy5G098310
SyntenyChy5G098310
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTGATTACTGAATTATTGGGAAGAAGGGAAGGAGGAGGCAAAAACAGAGTTGGCAATCAATCAGTGATGTGGAAACTTGAAGGTATGCGTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTTCTTTGCTATTATTTAATGCCAAATGGGCTCCGTTTTAAGCCACAATGTCACATGAGATCTCAATCATTTATGATAATGTTAATGTGGAAATAAAAGAGAATTAGGATGCCTCCAAAAAAACTAATGATTGTTTTATGTCAAATATCTTTCTACTCTCTTTTTCACTTTCTTTTTATTTATTTTAAAGGACAAGTAAACCACTTTTTTTACCAATGATTTCCCAAGCTCTATCAATTATAACTTTTTTAATCTATCGTCGATGAGTAACAAAACTTAAATACAAATTAAATGAAATCAAACAATGTTGGAAGTTTAAGATAAGTGTTGTAAACGAGAAAATTACATAGTAATGTACTTGACTACCTTAAAAAGCAAAACTAAATAAATATATACAATCCTTTTTCCTCAATTTAATTTTGCCCAAAATGGGTCAAATGTTAACTTAATTCCATGATTATTAGAGTCAAAAGGAAGTGAAAACAATCAATACCTTAGATTTCTAAAAACTGAAACTTATAAGATAGTTAAATTAGTGAGTATATCTCCAACTATTCTCGTCAAAAGTTGATGGTTTAATCTCTAATTTTTAAAATTGTTGAATAAAATTGGTGATGGAATGAATCTTATCTATGACTCACGAATTACGAACTAAAATTTTACTATAACGTTGTTTTTTTTTCTAATATTGATGAATTTTGTATTCTATATGTATGTTTTATATTCATTGACGCTCTATTTTAAAGATCATTCAAATTCAATTTAAATACAGTACAAGACTTGCCAAAATATTTAAGTGTAATTTGACCGAATTGATAGAATTCAAGGTTTTGATCAATAGAAGACTAATAGTTGAATTATTTTGAAGCATTTCATAGATTTGAGTAAAACGGTTAAATATTAAAACATGTAGGAACCAAAAAGAGATTATGTTGAAAGTAATTAGCAATTGAAAACTAATGGTGTGGACTAGAGATGTTAGAAGTTACTTAATTGTTGGGACCAAAACTACTTGTGAGAGACTTGGGACCAAAGGGATATTTATGAAACCTTAGTTATGCAAGTAATTGGATATTTAACATTTTAACCTAACTAACATCAAGTATTTCACTTTTTTCAAGAGGACCACATTTGCAGTTGTCTCTCTCTCTCTTTCTAGGGCCTATTTTGCATAATTTATGGATCAACTTCAACAAAATTGTGGATAGTAAACCTCAAGCAAAGATGGACTAGTCAAGATATTGATCAAACCCAAATTTATATGGGATATTTTCTCTAAATTAATGGAGAATTGTATTTGAATCTATTCATGATCTCTAGGGTGTTTTTAGCTTGGTTACTTGAGCATTTTGATCAATTAAAACTCGCGTTACAAATGTTTTTAAATTTAAAATAAAATATTTTTAAACATTTGAAAAACCACAAGTGTAATGAACCAAACTTTTAAACTAAACTAAGGTAATTACTAAAAAGGTAAATTAACAAACGACAATTTCTTGAAGAGAGAAAAACTAAATTCTTGTAAAATATATCAACAAATGTTCGAAAGACATAAAATTTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAAAATACTGTGAAAACATGACATGCGGGTTCTAACACTTTTTAAAGGAAGAAAGATAAACAAATGAGACAAAACCTTAAATAAAATTACTAAAATCAAAATACAGAAAAAACTTAAAAAATAGATGCAGAAACAAAATGAGCCCCCCATATGGCATGCCACAGGTCCTTCCTGTCGCTCATTAGCTTTCCAAATCATCTACCTTTGCTTGAAATATTAAACATAGAAAATAGTGAGTATATAAAATATTCCCAGTAAGGGACCCACTACTGGAACCACTAGGTCATCTGTTAACTTCTTGTTAAGAACATAATAATAATGTCGTGTGTCTAATAGAGCACACCTGGGCGATGAGTGAGATCGTACGAACACTCCTAATTGTGCGAGTGATCTCATAGGAACACCCTTAATTATGCGAGTGATTTCGTAGTAACATCCCTAATCGTTCGAGTAATTGTAGATACACACTCCTGATAACTTGTAAAAATACAAGTTATTGTAGCATTTTATGTAAAATAATAAAGTCTAATCGCATGAGAATAGAAGAAAACAAAGAAAAAAGTAGGTAAATTAATTAATCTGTGAATAACATTATACAAAAGAACCATATCCCTGTTTTACTGTGTTTTAGTGCTCTTATCGCACAATTTTAGGCAACAAAAAAAAAGTGAAGCTCGGCAATATAACATTTATGGGAGGAAACGTGTTCAGCTACGTGAAAACAAGCAAGCAAGCTAGGCGATATGAGGCACTAGTAAACAAATTTGGTTGACACAAAAGTCAGAAAAATGACAAAAGGACGTCTACGGGACACTAATACAACTTTTCATAGAATTAATGACACGTAGGATGTCCTGTCAACATCACTCCTCGCCTATAAATAGAGCCTCTCACTTTAGAACAAGAAACCCTTCCTTCTCAAGCCTAAAATCTAAAAAAGAAAAAAAAAAGAACTAACTTATTCTTTTGTTTTAAATTCAATTGAAATAAGAACTCATATGTTGTCGTCTCTCACCTAAAGTAAATAAGAAGTAAAGTTTCATCAAAATCTGAGAGTAAATAAATAAGTGGCAATAAGAGTTATAGTTGAGGAGAGAAACGGACTCATAGAGTACCTATGATTTCTCACTCAACGCCTAATGCAAATAAATAATTTAATTAATAAAAGTTGTTGCAAGAAAAAGAAAGGAACTAAGAATTTTTGAAACAACGGCCATTTCGCAAAAAAAAAAAATAAGATTTTCTGGAAATGAACAATGGTATTTTGAGACTTAAGCTTGTTGCATTTGAAATCTAGAAATATTTTCAGTTTAGAGTAGGTGAAGGAGAGAAGAAAGGCTAGATTGCGAGATAGATTATAAAAGCATTCAGAAAGGTTTAGCAATGTGTACAAAAGAAATCATGTTTAGAATATTGAGATGATGTTTGAGGACAAGTATTATTTTAAATTTGGGGGTGTGATAACTTGTAAAAATACAAGTTATTATAGTCTTGTATGTAAAAAATGAAGTATAATTGAATGAGAATAGAAAAAACAAGGGAAAAATTAGGCAAATTAATTAACCTGTGAACAACATTATACAAAAGAACCCTTTCCTTGTTTTACTGCATTTTAGTGCTCTTATTGCAAGATTTTAGGCAAAAGAAGTGAAGCTCGATGATATAATATTTACGCTAGGAAACGCGTTCAGCTACGCGGAAACAAGCAAGCAAACTAGGCAATATGATGCACTAGCAAACATATTTGGTTGGCGCGAAAGTTAGAAAAAAAGACATAAGGACATCTGTGCAGCGCTAATACAACTTTTCATAGCATTAATGACGCATGGGATGTTCTGTCAACATCACTCCTCGCCTATAAATAGAGTCTCTCACTTTAATTATGCATAAATTGGTCGGAGAGAAAGTTCCTTACATCGTTTGTCTTCTCTTTTCCTCTAAGTTTTAGGTGAGAGCCTTGAACAAAACAGAGAGAGAGAGTCACCCTTTCATCTTCCCTCTCATTGATAAGCAAAAGTCAAAACCAAAGAGTATGAGCAATCATACTCTTAGGCGTAAAACTTTCTTATGTATTTCGTTTTGTACTTTTATTGTACTGTTTTGTTAGATGTACCTCATGACCGAGAGGCCTAAAGTTATTTTATTTAAAGCAACGCATTTCTTCCTCCTATCTCCCATTTTTCTGTTACTTTTCATTTTCAATTTGTTTGGTTAACTTACTAGCAATGAAATGTGTTTTTAATACTTTAAGAATCATAGTGTTTGAGTTATGAGTTTTGTTGAGTTAAACGCATATGTCAAAGCATTGTATATTCGAGAGAAAGAACAATGAGGTTGATTGTAATCACCTGACAAGTGAGAACACACACTGACGAGAAGATTGTAGTGATACAATCTTGTCGCTAAGTTTCTCCTTCACATACATTGCATAAATTATAACTTAACTTTGTGTATTTGGATCTCGAAAGGCGAGCAAGTATGGCAATGGCGCTGAGAGGTTGTTTGCCCTAATTCGTAGTTAATATATGCTTTACATCGCCTTGAATTATTAAAGCACAATTCCTTGCGTTTAAATAATTAAACTATTCCTTCCTCACCATGCCTAAACACGAGTTCAATTTCCATTTTCATCATCTTGCCATACTCACCATGCAGCACCAAGCACCTTATTGTAAATACTTAGGATAAAAGTATATTGTTCATAACTTTACTGTATAGTTTATACTGCATGATTTTGCTGCACGATAAGATAATTAGGAGCTTATATTCCCTGCATTTGACTCTGGACTTACCAAGAAACCTCTTTTTGCTTACACTTGGACGATAGAGAGAATAACTTGTAAGACATGCATATCTTTATCAAATTAAAAACGCATGGATAGGAATGCATCTTTTAACGCATAACCCTATTTAGTCGCCTAATAGTCGCTCGCTTAGAGCTTAGCATGATAAGTCCACGATAGAAACTTATGCATAGAATATACCAAGCAACTCCTAAACATGTCAATGATACGTAGGTACACCCCTAATCATGCGAATGATCCCATCGGTGTTGAGTTTTATATCCTAAAACTCGTAAATAGTAAGTGTTGGATCGGTATGGCAACCCTAGAGAGGGTGAATAGGGTTTAATTAAACTTCTTAACAAATAAAAAATAAATTCAACTAATTAGATAATTTTTAAATTAAATAAAGAATCTTTGTAAATTTTGTTAAATAACAAGATTGATAAAAAGATATGAATAGGAGTATGCAATCAAACTTAACCAACAAGAATATGTAACTAAA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mRNA sequence

ATGGTGATTACTGAATTATTGGGAAGAAGGGAAGGAGGAGGCAAAAACAGAGTTGGCAATCAATCAGTGATGTGGAAACTTGAAGTCAGATATCTTTCTTCTTTTTTAAACCAAAAAATTGGTTTGATTTGGTTCTTGAAAGGACTAGAAACCGACAAAACCGATCCGCCAATAATCCCTGTTATCTTGAACCGTTTTCCTCAATTCTCCCTTCAAAATTTTTCTTCTCTCCTACAAAACCCTCCCGCCCACGCCTCCAACAAACGCCACCGCCCTGCGCATCCCCTAAACCGCACCCTAGCCTTTGCCTCTTTAGCAAACTACCGCCACCTAGCCTCTTTTTCAGATTGCTCAATAACCGGAAAGTGAAAGCGGGGGAGAAATTTGATTTCAAGTTCTCCAACTTCAAGGCAGTCCAAG

Coding sequence (CDS)

ATGGTGATTACTGAATTATTGGGAAGAAGGGAAGGAGGAGGCAAAAACAGAGTTGGCAATCAATCAGTGATGTGGAAACTTGAAGTCAGATATCTTTCTTCTTTTTTAAACCAAAAAATTGGTTTGATTTGGTTCTTGAAAGGACTAGAAACCGACAAAACCGATCCGCCAATAATCCCTGTTATCTTGAACCGTTTTCCTCAATTCTCCCTTCAAAATTTTTCTTCTCTCCTACAAAACCCTCCCGCCCACGCCTCCAACAAACGCCACCGCCCTGCGCATCCCCTAAACCGCACCCTAGCCTTTGCCTCTTTAGCAAACTACCGCCACCTAGCCTCTTTTTCAGATTGCTCAATAACCGGAAAGTGAAAGCGGGGGAGAAATTTGATTTCAAGTTCTCCAACTTCAAGGCAGTCCAAG

Protein sequence

MVITELLGRREGGGKNRVGNQSVMWKLEVRYLSSFLNQKIGLIWFLKGLETDKTDPPIIPVILNRFPQFSLQNFSSLLQNPPAHASNKRHRPAHPLNRTLAFASLANYRHLASFSDCSITGK*KRGRNLISSSPTSRQSK
Homology
[Close]
BLAST of Chy5G098310 vs. NCBI nr
Match: KAE8651706.1 (hypothetical protein Csa_006442, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 166 bits (420), Expect = 6.60e-50
Identity = 79/92 (85.87%), Postives = 86/92 (93.48%), Query Frame = 0 

Query: 1  MVITELLGRREGGGKNRVGNQSVMWKLEVRYLSSFLNQKIGLIWFLKGLETDKTDPPIIP 60
          M+ITELLGRREGGGKNRVGNQS+MWK EVRYLSSFLNQK+GL+WFL GL++DKTDPPIIP
Sbjct: 1  MLITELLGRREGGGKNRVGNQSMMWKHEVRYLSSFLNQKVGLVWFLNGLQSDKTDPPIIP 60

Query: 61 VILNRFPQFSLQNFSSLLQNPPAHASNKRHRP 92
          VILNRFPQ SL+ FSSLLQNPPAHASNKR  P
Sbjct: 61 VILNRFPQLSLRIFSSLLQNPPAHASNKRPPP 92

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy5G098310 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy5G098310 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy5G098310 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8651706.16.60e-5085.87hypothetical protein Csa_006442, partial [Cucumis sativus][more]
BLAST of Chy5G098310 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy5G098310.1Chy5G098310.1mRNA