Chy5G097590 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAATCGGAGGATGAGCTCGACATGCACGATGCTCATGACGACGACGACGACTCTGTTGACAATGAGGAGGACTTCTACAGTGGCGGCGACGACGATGCTGCTGGAATTGACAGCGACGATGCTGATGTCGGTGATTATGAGTTTGTTGATAATGATTCCGATGATTCCGACGACATGGTCTCCTATCGCCACCAGGTTCTTATTGTTCCATCTTTATTTTTTATTTTCTGTGTGTTCGCCATGGGCATTCAGACTTTGTGGTTTTGCGAATGCTGGTGTTTGTTGATTGCTCTATTCTACTCTATACCAATCTCAATTTCCGATTCTTTTTTGATTTCTTTGTTTTTCTTACCAAATATGAGTATAAAATTGGGATTGTTTTGCCTCTTTTTACGAATGCACAGCTAGAGAACTTTTTTTATCACTCTGTTGATAACGGCACCTCATTAGTCATGATAAATTTTATCATTCTCTTCATACGGGTTTGTTTCATTTTCTTGGTTTGATTGGGTAGTCAAGTGAAATTAAACACTTGGAGTTTGTTACTTTTAGTTTTATACCATGAAATGTGATACTTTTTCGGGAAGAACTACAGTGTTCCATGCCGATGTTGAGGTCGAAGCATAATGGCTGGTTTGTTGTGGAGCGTAGCAGCTGAGCCTGTTGGCAGTGGCTTATCTAACTTAAAATAGTATGAACAACAAGAGATAACCAAGACCAAGAGCGTAGTTTTCTTTTTGCCACGCAATGATTACTTTGTGATCTAAGCTTTTGGAAGCTTTTGGAAGCTTTCCTTCTCTACAGGACTTGTTCTGGATTAGATTGGCTGGTAATCTGGTGGTTTAGTTGTAGGGCAAAGATTCAGGAACTGTTGGAGAGTTTTGTGGACCAATGCTTGTGGTGCTCTCCTCTAAAACATTTGCTAGTAGCAAAGAGAGAGAAAATAAATAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAGAAATGAGGTTGGGTGAGTAGACAGGAGAGAGTGGCTTTGAGAAGTTATTGTTACCATATTTCCTCAAAGAGAGTGGGTTATTTCCTTTATCATAATATTTGAATCAAAAGGCTTCAGCACCCAGTGGAGAAGATGAATCCATGCAATATTTTTTCATCCAATTTCTCCAATATAGTAAATGACAATTTGTAAGGACTCTGTTTGATTAACAGCAATATTTCCACCCTTACAATGGCTAAAACAGAGGCAGCACTCTGTAATCTTTATTTATATATAGCCAAAAACAGTACAGCAATCATAAGGATTCAAAATAACACCCAGAAAAACAATAAAAACAAACCCAGCTTCTTTTTTAGGGTAGCTGGATATTTCCCTGGCTAAGCAGCCGACAAGACTAATAAAAAAATAGACCTACCTCCCTCAACCCTAAAAGACCTATTTATATAGGCCCTTCCCATAACTTTCTCTTTCCTGAACCTGGGCCCCACACGCCCACACGCACGATCTCTTCCCATCATTCTTTCATCATTTTATTTGTTCATTTACTTTCCTGCCCCTCCTTTTATATGTGTGAATGATTGGTGGTCTTACACAATTCTCGTGGGAAGTTTATAGCCTCAAGGGGTCTTTGGAAAGGTGATCCTTAAATGTTTCATTCTTATCATGGATTGTCTTATAGGGTGTTAAATATAGCAGAAAGTGATGGATTGATTACAGAGAAAGTGATGGATTGATTAAAGATTTTGTTGTGGTAAAGATTGCTCCTTAATGATTATGCATCTTCAATTTGCAGTTGATACCATGTTCTCATCCCCAAAGTTACACACCTTGACAATCTATCACATCCATTAGCTCTTAGAAAGAACTTTGAGCCTCACTATTAATTGTCTAACCCTAGAATTTTAGGGAATCAACATGGATCTTTGATCGATCTTCACTCTAGACAACAAGTATGCTAATTGGGGTGTTTTGCCTGCGACCTATTTGGGCTTGCTTGTAAATGGTCGGCCTAAAACTTCCTTCTTCTGGGCTCCAATTGTTGGGAAGGTGGAAAAAAACGAATCGCCTTATCAGAACATTCCTTCATAGGTTGGCCAACCTGTCCTTATCCAAGCCAGCATTGTCCAACCTTCCTAACATATTTCTTGTAACTTTTCCCCATCCCTTCCAAGTAATTGACATCAATTGAAGGATTGCTTTGTAGTTTTTACCACTCTTTGGAAGGGAAACAAAGAGAAACTGGGTTCTCACCTTCTTAATTAAGATAAAATTTGAAGATTCCTCTCATTGAAAGTGAGATGGAGGTGGCTAGGGGGTCATAAGAAAGATCAGCTTTTTATTTGGACTCTCAAAATAGGAGTTGCCATTTCTAAATTGTGAAATAGTGAAACATCACCATTCCACAATTTAGAGATTGTCATATTAAACCAAGTTATGAAGGACGAAGGTTCTGAGGAAGTTTCATTTAGCTCCAAGTTTGAATTTCTCCTTCCTTCGAACTCCATCCCAAGCACTCAAAGAAACCCTTATAAGTTGTCTGAAAGGCTGTTCAAACATCTTCATCAGAGGCTAATATCAACTCATCGGAAATGCAAAGCAATGTCAGATTTTGGGAAGTCCTCTCTTCAACTTCCGGCTATTGGCAGTTCTGTTAGTAAACATATGGCAGAAGACAAATGGAGATCAGAGAATTCCAAAAGACGTTCAAAATTAGAACCACCAAGCAGGAGAGACTTAGTTTTCCCTCCAAAGGAGACTTCTTTTAGTTTTATTCCATTTGAAAAGTCACTTAAAGGAGTCTAGTGGTCACATATTTGCAGCAATAAAGATAATAATAATGTTTTTTTCTATGAACAAGAGTGCCAACAAGACATTAATCACCATGAAGGTCAATAATAAAATTCAGATGGGAGTTGCATTTACCGCCAGAAAACGAAGAGATGCTATTAAAGAAGAGAGAAAAAGGTGTAGAAGACAGCTGATATTAATTTAGTGGGTCCCAGTCATCCTCCAACATCTCCTATTTTTGAAAATATAGCAAGCAAAAAGACAAGAAAAGGAGAGCAAAGGTCACCCAACTCTAAAAATAATAATAAAAAACAGTTGTATCTTTCCTACTGATAACAGCGTCGCCAGGTCAGAATTCTATATCCAATCTCTTACGGTTTCTCTTCTCTCAGTTCATCAGAAGTTGACACTCTTGCTTCTTCTCTAATTACTGTGTCACCAAGCAAGTCAATCATCAAAGAAAAAAGATCTTCTACTCCCTTGTCAGCTTGTTTTAATAAAGCTAAAAAGATCTAGAGTTCTTCTTGAAGCATTTTATAAGGAAAAAGACTTCCTTCAACAATGTTTGGACTGCTCTTTCAATTCTGAGTCTCTTGGAGTTTGTTCATTCAAGGCTCAAGAGAAGCATTCCCAGGGTCATCAATCTCTCAAGTCTTTGTTCACTGATGTAAATCCAGATCTTTGGAAGTTTCCAGCTCTCTAATCCAAGCTACTGGTTGCAATACCAGACGAGGTACATTGAACTCTTATCATAAGTGCGAGCAAAATCCAAGCAAGGTGCAATATGGGATTGCTAATCCAGAGGAAGTTGGCAGTCTTGATGCTCAAGAAGCTCTTGACTCAGATGTTGAATCAGTCCCATCAAGAGTACATTGAACTCTCATCATGAGTGTGAGTTGATGAGAGTAAAATCCAAGCAAGGTGCAATATGGGATTGCTAATCTAGAGGAAGCTGGCAGTCTTGATGCTTAAAAAGCTCTTGGCTCAGATGTTGAATCAGTTCCAAGTGTACGTAGGGAGGAATTAGAAGAGATTATTGCAGGGGAAGGGGTTGAAGATTATGAGATTTTGGAGATCATAATCAACGATGTTTGTGAGTTGTTTGTGGAGGAAGGTTTAGAAGAAGAACAACCTTCTCTCCAGAAATTCAGAGAAGAAATCCCAAAGCACTTGCATGACACATTGAAGCTTGTGGTATATCTTTCATTTGAGTTCTTTGAACTTTTTCTCCAGCATTGTAAGTAGTCTTTGATGTGATAGTGCATTGAAAGTCCTTTTGGAATTCAAGGGAGCTAGAAGTTAAAAAAAAATGGTAGTTGGGAAGCAGATAAAGAAGATTATTCCGGTTTTGGTTTATCTACTAATATCAAAAAGTAAAGTTTTGTTCCAGATTCTTCAATTCCTTGTGGTGATCTCTTGTTCTTTTGATGCTTATGAACCATTTGTAAAAATATTTCTGGATCACATTTGAATATGGACTGTTTGATCATAGAGAAATGGTGTATTTGATTCGAAGTTATTTCTTTAACAGAGTTCATTTTGGAGCCTTGATCTTTTGGAGGTAATTAAGTTTGGCAAGACGATTTCCAGCAGTCAGTATGACTCGAAAGAAGAAGATGTTTAATTGTTTTACTTAAAGTAGTTTGCTGGAACTTTTGTTTCAATAAATCTTGAAGGTTAAAGAAGTGAGTGAATTTCAAATTCTTTTAAGGCTTTAGTCACACTGGAAAGAAAGGGGTTATAATTGATCAAAGATAGTGGCCAATGGCTCCCTTGGGAATTTTTTGAGTTATTTCCTTCCTCTGAATAAAAAGCTGTGCAAACTTTATGGGATTTCAGAAGTCAGAAGTCTACGTCTAATCATTAATCTACGTTGGAAAATGGTTTTTGGACACTGTTTTTCTCCTTCAATCTGCACTTGTGCCCTACCGCTAGTGACTCTTTACAGCACCTGGTTTTGATTGCTTTTTCTTAACTGGTTTGCATTGTCGTCAGAATTGTGCTTGGTAAGATTCTAGAGATTTTTCAGAGCAAGCTTCTAATGAAACTCCTCTTGATCACGTCCGATCAAGTAGGATCAACTTTGTTACGATAGTGATGATTCCCAAAGGTTAATGAAAGTTACAATGAAAACGAATTGAGGGTGCCTCAATTCGAAGAACAAAAGACTCTCCTCTGCTTTCCTCTCTTTC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MESEDELDMHDAHDDDDDSVDNEEDFYSGGDDDAAGIDSDDADVGDYEFVDNDSDDSDDMVSYRHQQNYIILAEADIQQCQEEDITRVSTVLSISKVAASILLRYYNWSVSKVHDEWFADEEKVRRSVGLLQKPVLRHSNELELPCGICFEIYPRDKIQSAACGHPFCNACWTGYISTSINDGPGCLMLRCPDPSCGAAVDQDMINLLVSDDEKKKYFRYFIRSYVEDNRKTKWCPAPGCDYAVDFIVGSGSYDVTCRCSYSFCWNCTEEAHRPVDCVTVARWILKNSAESENMNWILANSKPCPKCKRPIEKNQGCMHLTCTPPCKFEFCWLCLGPWSDHGERTGGFYACNRYETAKQEGVYDDAEKRREMAKNSLERYTHYYERWATNQS Homology
BLAST of Chy5G097590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W468 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 619.4 bits (1596), Expect = 2.8e-176 Identity = 280/375 (74.67%), Postives = 330/375 (88.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84RR0 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 595.5 bits (1534), Expect = 4.3e-169 Identity = 277/392 (70.66%), Postives = 332/392 (84.69%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L829 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 566.6 bits (1459), Expect = 2.2e-160 Identity = 264/391 (67.52%), Postives = 320/391 (81.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0C8K8 (Putative E3 ubiquitin-protein ligase ARI6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI6 PE=5 SV=1) HSP 1 Score: 528.5 bits (1360), Expect = 6.5e-149 Identity = 253/392 (64.54%), Postives = 314/392 (80.10%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SKC2 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 432.6 bits (1111), Expect = 4.9e-120 Identity = 204/387 (52.71%), Postives = 278/387 (71.83%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Y9 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485827 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 821.6 bits (2121), Expect = 1.4e-234 Identity = 387/392 (98.72%), Postives = 391/392 (99.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4U8 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485827 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 821.6 bits (2121), Expect = 1.4e-234 Identity = 387/392 (98.72%), Postives = 391/392 (99.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HPL6 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465486 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 780.8 bits (2015), Expect = 2.7e-222 Identity = 370/393 (94.15%), Postives = 379/393 (96.44%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CRR9 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014168 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 780.0 bits (2013), Expect = 4.6e-222 Identity = 369/392 (94.13%), Postives = 380/392 (96.94%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FIK3 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444256 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 779.6 bits (2012), Expect = 6.0e-222 Identity = 368/392 (93.88%), Postives = 378/392 (96.43%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. NCBI nr
Match: XP_031736775.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 isoform X4 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 813 bits (2099), Expect = 4.38e-295 Identity = 389/392 (99.23%), Postives = 390/392 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. NCBI nr
Match: KAE8651733.1 (hypothetical protein Csa_006252 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 813 bits (2099), Expect = 2.23e-294 Identity = 389/392 (99.23%), Postives = 390/392 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. NCBI nr
Match: XP_008441770.1 (PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 812 bits (2098), Expect = 2.27e-294 Identity = 387/392 (98.72%), Postives = 391/392 (99.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. NCBI nr
Match: XP_031736774.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 813 bits (2099), Expect = 2.40e-294 Identity = 389/392 (99.23%), Postives = 390/392 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. NCBI nr
Match: XP_004138892.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 813 bits (2099), Expect = 4.31e-294 Identity = 389/392 (99.23%), Postives = 390/392 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. TAIR 10
Match: AT1G65430.1 (IBR domain-containing protein ) HSP 1 Score: 619.4 bits (1596), Expect = 2.0e-177 Identity = 280/375 (74.67%), Postives = 330/375 (88.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. TAIR 10
Match: AT2G31510.1 (IBR domain-containing protein ) HSP 1 Score: 595.5 bits (1534), Expect = 3.1e-170 Identity = 277/392 (70.66%), Postives = 332/392 (84.69%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. TAIR 10
Match: AT1G05890.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 566.6 bits (1459), Expect = 1.5e-161 Identity = 264/391 (67.52%), Postives = 320/391 (81.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. TAIR 10
Match: AT1G05890.2 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 546.2 bits (1406), Expect = 2.1e-155 Identity = 264/433 (60.97%), Postives = 320/433 (73.90%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G097590 vs. TAIR 10
Match: AT2G31780.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 432.6 bits (1111), Expect = 3.5e-121 Identity = 204/387 (52.71%), Postives = 278/387 (71.83%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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