Chy5G092000 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATGTGTGAACTTTCATCCTTACCTATGGATGTTGTAATTTTATGTACTAATTTGAACCATTAAAATTATTGATTTAAATGTTGTCACTTTTTTGTTTTTAGAGAATTATATATTGGAGACAAAAGTAAATAAAATAAATTGATGAATAATTCTCTAGTTTTAGGCTTTTGAAGGAAATGTTATGAGCCAAAGTGAGGTGGGAATCACAAAGGTTGGTAAAGGACAATGGTCTCTTCAATCAAGAAAATACTTGAAAATACTATTTCATTTTCGTTCAATAGTTTTACCCTCTACGAACGGTCGTGTTCGAATTTAATAGAGTGTAAATTGATCCATGAGCCATTAACAAGCCCCGTCGTGATTTGGAAATTTGATTGGTGAGCAAATTGGCTATGCAATAACTCGGTTAAGATAACAAGTTTTAACAATCAATTATTGTATATTGTTGTTAATTTATAGGTGTTTGTTCATTGTTTCCTTTCTTGAAAAAAATAAATTCAAATCGAAATTTACTCGATTGTGAATCTTGAACTACTTTTCAAGTTTAAGACAAATTTGTGATTTTAACAATACAACTTTAGTTTATTTTGTATTAAATTGAAATTTTGGTTCTATATTTAGGAGAAAGTCAATATTCACTCCTTGTAGGTTTAAAAGTTATAATATAGTGTTATCATGGGTTGATCAAATCTCATAAATAGTCTTTATAGTTTGATAGATCCCTCAACAAGAACTATATGAAATGAATGGTCCAACGGATGAATGACCAAAAGATATGGTAGAAAATGAAATTTGTCACACTTATTGGAACTGGGGATTATGACTATCTATCTACATTACATCGTGGATAAACTATTGAAATTGAATTTGTGCATGCAGATTGACCTTTCCACTTCTTTGCTCTTCTCTTAATCTTCATCTTATACCAACAAATCTCTACTCCTACTCTAAGTATCGTAGTCTCTACTCCAACACTCACTCTTAGTCTCTTGTTTCTTTTATCTTGTTGCTCATTTTTGTTATTTAATTTGTTGTTGGTTCTCACCTTATGCACTCACTTTTTATATTAAAGGGAACACGACTATGAGACTAAAAGCAGTGAGTGAGGGTAGTGAAAGACAAAAAGTAACATCGTAACAAATGTACACAATTAAAATAAAATAGAAAATATAACTTTGGTTTTAAAATGAAAATTGTCATTCCTTTTGAAATCAACGTGTTTGACTCTTTGTTGTCATCATATTCTCGTGAAGTTACCAAAATACCATTCCAAACACACAAATTTGTCTCTCCCCTCCATCAGTTTCCTATTTCTCCTTATCTTATATACACCTCTCTCGCTCTAGCTTCAACTATCCTAGTATTTTATGTCGCTCACTTTTGATCATCTATCTCTTTTGCCCATCAATATCTACTACGTTATTACATCCCTACGTCTAATGGTTCGATCAACGTTATGATTGGGCAATGATGAAACCTCTTCAACATATTTTGATGCTGACATTCAATAAAGAAAAAAGTGAAAATGAAGAATGGACGATACAATTGGATGAAAGAAATTCGATAGCGATGAGAGGAAAGAGAAAAAAGAAAAACAAGGGTGATTTTGTAACTTTTGCAAGTGATGATGTAAGCGATAGGACAAAATTCTTAAGTTTTAAAAGTGAGACATTAACTAATTTGAGGTTTGGAACCGAGTATAATATACAATTATTCTCGTTGAATGAAATGTTAATTGAAAAAAGAAAATTCAAAATACATGAATTGAGAAAAGCAAGAACGAGAGCAAAAGCAAGTGTCGAACCATCAATAGCAAAAAAGGAGAGTACGTATCGAGACAAGTGAGAGTCAACCGTAAAGATCGAATGTCGAAGGGCACCACATCTTCATATTGCAATTTCAACAAGCGATATCACAAGTATAACGTAAAAAAACTTAATTTTCTAAAAAGTAGGCCGTTTATATACTTTATTTGGTCTTTTGGAATGGAGCACACACATAAATTCCCTTTTAAAATATCAAAACAAAACATTACTTATTTTTAAAAGTATATTTTTTAACCTTACGTTATCATCATCACATCTGCGTTAAATTACAAAATGAAAATTGTAACTAGGATCTCCCTCTCGCTTCACACCTCTTACTCCTTAGATTCCTTTCCTCTCTATTCATTTTCTTCTTGCAACTCATTTTTCACCTTCGTATTCTTTCTCATCACCACTCTTAATATTAAAAGAAATTTAGTTATGAGTTTAAAAGCAACTGAGAGAGGATAAAAAGAGTCAAAATCCAAGAGCAACACTACAAGGTCGTTATAGGTAATTTTTGCGACATAATCAAAATGTTGTAAAAAGAACTTTTAAAAGTAGAATAAGTTCCTTTTTCAGCATAATTGGTTGTAATTGAATCTACTATCTCATGTCAATACCATCGAGTCAAGTTACTTTAGTCGAATCGTGAACCACAATTTTGAGTGAGGAGTACAATTATCCCATTCCAATTCCATTGGTTTCATTAGGATTTTGGAGCCTATTTTCGTTAGGGATGCATGACCTAAATTCCTCACCTCTCGCTTATTCTGTCCCTCGATCCTTTGCCCATCGCCTTTCATCTAAACCAAATAGAAAAACCGCAAAAAAATCAATCTTGGCTCCGGTCAGTTCCCCGTTTCAATCGCATTCGTCCTTCAGTTTTATTAATTATTCCAAAAATTAAAGATGACGATCGCTTGATATCGTTTTTTCTGTAGATCCAAGGGGGCAGGATTCCGATCCGATCTTCATAATTGTATGTAAATGTATAACTATGGGCATTTATGTTTTTCATGATCGTGATTTTCTGGTTCTGCTGCTTAGAATCGATGATTTTGTTTTCTATTCTCTAGAGAATCTTTATTTCTGAAAGTAGTTCTACGCTTGTGTTTTTGAAGGCTGGGGGCAAAGGTTAAAGATCGTCTTTTCCTGTTTGCCTTCCTCGTCTGTGTATTCCTCAACTTGATGATGCAGGGAAAGGAGGGGGTTGATCGCAGTGTCTTGTGAGTCCTGTCCTTTCCTAACATTGCAGAATTACTGCATTAGAAGACTGATCTAGGCAACTGCTATACATTGGAGATTGGAATAAGGTTCTTGCTCAGACACCCAAACTACAGTTTTTTGTTGCCCGGTTCTTTGCCTTTTAATTTTTTTGAGTGGGTTGATTAGAATCCTCGAGGACAATTCTTCTTGTTTATTATATAGTTGAATCTTTTGGTCAGTCTTCATATGTTCGGGCAATTGCCATATTATTTTGAGTAAATTTACAATGAAGGGTTTTTCTTTAGAGGAAACAACGACTGCATTGATGTGATGAGATTACAAAAGGGGTTCCTATCAGTGGATTACAAAAAATTCCCCAATTGGTCATTAGTTAAACTGTAGTTACAAAAAGGGGTGATCAATTTACACCAACTAAGAGATAAGAGAGTTATAGAAGCATTGTAGTCTTGTTCCTTATCTGTAAAGACGAGTTCTGCTCAAGCCAAGTAGACCAAAAGAAAGCTCAAACCAAATTTACAAATGAAGTTTGAAATATACTTTCTACTTTAGTTAATTTTTATGATATTGAAGTATCATAATTCATAGATCAGTCATCTGTGAGTGCACCAATGACAATACTGATAATCTAAGTTCCTGAAGCATATCTAATTTATGTTGATAAGTTTATTGCTCTTCTTTCCTTGGCCCTTTGTAGTTTTTTTCCTGATGGTTTTTGGAGCTAGATATTATTTGAGGTTGTAGAATTTTGGTTAATTGATGTAAGCACTTCATCTGCTTGAACATTTGGCTTTTTGTTCGACACTCATCTGTTTCACGCACGGTACACTCTTTAACGTGTTAAGTAACCAATGAAAAACATAAATGAAATTAACTAAATTTTGAGCGAGAAGTCATCATCTATTACAGGCCGGAGATCACCTTGGGCGATTTCTAAACATGGACGCCAAAGAGGCTGCTCTTACTGGAAACCCACGGCGTCCTTCTAACTGTTGCAATCCTGTAAAACAGCTTGGACCTATCTCCCTAGAACATGTGCTCCTAGCATTACGCGAGTCCAAGGAGGAGAGGGATCTTCGGATCCGTAGTCTGTTTAATTTCTTTGATGCTGCCAACCTTGGACATCTTGACTATGCTCAGATAGAAGCTGGATTGTTGGCTCTACAAATACCTGCCGAGTACAAGTATGCTAAGGATCTCTTGAAGGTCTGTGATGCGAATAGAGATGGCAGGGTAGACTACAATGAATTTCGCCGCTACATGGATGATAAGGAACTAGAGCTCTACCGAATTTTTCAAGCGATTGATGTTGAACACAATGGATGTATTCTTCCAGAAGAGTTATGGGATGCTCTTGTTAAGGCTGGTATACTATACCCTTCCCTGCCTCGTTTCTATTTCAGCCAGTCCTTTCTGGTTAATCACATTTTATTTAGAATACTCGTTACTACAGTTTCATATTATTTTATCAACACATTTTATAAGACTTAAAATTAGTTTGTATACTTTTGAACTTTCCATGAATAGTTTTATTAAACATTTTTTTTTTAATGAAAATTAGAACACCAAAATCAGTCTTCAGATACAGTATGTGGCTAGCTATATGCTTCTTATGTTGTATGCCATTCTCAAGAATTTGTCAATGTCTGTTATACCATAGTGCAATTTCAGTTTGAATTCCAATTCCTTATGGACTGTTAGTTTTTGATAATGACTGATTGATTGATTCTTAATACGTAACCACACTTATTTTTTAAATTTACTTTGGTTAATGAAACACAATACGTGAACTATTTTATTTTAAATGATGGGCAATATGGTGCATGAATTGAACTGTATCTCCACCAATACCTTGTTTGGTTATTAGTAAATTCGATTTCTTAATCTATTTGGAATTAATTTCATTATTTAATTCACGCCATTTAAATTTATTTTCTTTTCATTTTATTTGGTTCATTA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MMCELSSLPMDVAFEGNVMSQSEVGITKAGDHLGRFLNMDAKEAALTGNPRRPSNCCNPVKQLGPISLEHVLLALRESKEERDLRIRSLFNFFDAANLGHLDYAQIEAGLLALQIPAEYKYAKDLLKVCDANRDGRVDYNEFRRYMDDKELELYRIFQAIDVEHNGCILPEELWDALVKAGIEIDDEELARFVEHVDKDNNGIITFEEWRDFLLFYPHEATIENIYHHWERVCLVDIGEQAVIPEGISKYVHPFRYFIAGGIAGAASRTATAPLDRLKVALQVQTTQAWIIPAIKKIWKEDRLLGFFRGNGLNVVKVAPESAIKFYTYEMLKSMIANGEDKHDIGTAGRLFSGGIAGAVAQTAIYPLDLLKTRLQTFSCEGEKVPRLGKLTKDIWVHEGPRVFYKGLVPSLLGIIPYAGIDLAAYETLKDVSKTYILQDSDPGPLTQLACGTISGALGATCVYPLQVIRTRMQAQSSNKGAAYQGMSDVFRQTLKNEGYSGFYKGLLPNLLKVVPAANANLLIENSRFRPLLIFSSSPFSPKPHLSRRIRHCIRASSNGAVAATDQPETTSYGRQYFPLAAVVGQDAIKTALLLGAIDREIGGIAISGKRGTAKTVMARGLHAVLPPIEVAVGSISNADPSCPEEWEDGLADRVEYDSAGNIKTLIVKTPFIQIPLGVTEDRLIGSVDVEESVKTGTTVFQPGLLAEAHRGVLYVDEINLLDEGISNLLLNVLTEGVNIVEREGISFRHPCKPLLIATYNPEEGAVRDHLLDRIALNLSADLPMSFEDRVAAVGIATQFQEQSKEVLKMVEDEIEVAKTQIILSREYLKDVTIGREQLKYLVLEAIRGGCQGHRAELYAARVAKCLAALEGREKVYADDLKKAVELVILPRSTINENPPDQQNQQPPPPPPPPQNQESGEEENEEEEEQEEDDDKENEQQEQLPEEFIFDAEGGLVDEKLLFFAQQAQRRRGKAGRAKNVIFSEDRGRYIKPMLPKGPVRRLAVDATLRAAAPYQKLRKAKDVQNNRKVYVEKSDMRAKRMARKAGALVIFVVDASGSMALNRMQNAKGAALKLLAESYTSRDQVSIIPFRGDCAEVLLPPSRSIAMARKRLERLPCGGGSPLAHGLTTAVRVGLNAEKSGDVGRVMIVAITDGRANISLKKSTDPEAAAAADAPKPSAQELKDEILEVAGKIYKSGMSLLVIDTENKFVSTGFAKEIARVAQGCPNLEQSYNCQIILHNIPFFAGKYYYLPNASDAVISAATKDALSALKSSKPNDGEIDDWISNMVIQTISYAKYN* Homology
BLAST of Chy5G092000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O24133 (Magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=CHLD PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1155.6 bits (2988), Expect = 0.0e+00 Identity = 628/756 (83.07%), Postives = 677/756 (89.55%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22437 (Magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic OS=Pisum sativum OX=3888 GN=CHLD PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1134.4 bits (2933), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/759 (81.16%), Postives = 674/759 (88.80%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SJE1 (Magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CHLD PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 1121.3 bits (2899), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/749 (81.04%), Postives = 664/749 (88.65%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8AMB8 (Magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=CHLD PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1120.5 bits (2897), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/751 (80.83%), Postives = 665/751 (88.55%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6ATS0 (Magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CHLD PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1120.5 bits (2897), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/751 (80.83%), Postives = 665/751 (88.55%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KIA3 (Mg-protoporphyrin IX chelatase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G434320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1345.5 bits (3481), Expect = 0.0e+00 Identity = 721/752 (95.88%), Postives = 724/752 (96.28%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BN86 (Mg-protoporphyrin IX chelatase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491485 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1338.6 bits (3463), Expect = 0.0e+00 Identity = 718/752 (95.48%), Postives = 722/752 (96.01%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V3D2 (Mg-protoporphyrin IX chelatase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold212G001600 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1307.7 bits (3383), Expect = 0.0e+00 Identity = 717/805 (89.07%), Postives = 721/805 (89.57%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JEN7 (Mg-protoporphyrin IX chelatase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483736 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1270.0 bits (3285), Expect = 0.0e+00 Identity = 685/764 (89.66%), Postives = 711/764 (93.06%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FTN0 (Mg-protoporphyrin IX chelatase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448694 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1268.1 bits (3280), Expect = 0.0e+00 Identity = 684/762 (89.76%), Postives = 709/762 (93.04%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. NCBI nr
Match: XP_011657628.1 (magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1340 bits (3468), Expect = 0.0 Identity = 721/752 (95.88%), Postives = 724/752 (96.28%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. NCBI nr
Match: KGN48112.1 (hypothetical protein Csa_003045 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1340 bits (3468), Expect = 0.0 Identity = 721/752 (95.88%), Postives = 724/752 (96.28%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. NCBI nr
Match: XP_008449685.1 (PREDICTED: magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1333 bits (3450), Expect = 0.0 Identity = 718/752 (95.48%), Postives = 722/752 (96.01%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. NCBI nr
Match: KAA0061780.1 (magnesium-chelatase subunit ChlD [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1302 bits (3370), Expect = 0.0 Identity = 717/805 (89.07%), Postives = 721/805 (89.57%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. NCBI nr
Match: XP_038902929.1 (magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1281 bits (3314), Expect = 0.0 Identity = 702/780 (90.00%), Postives = 725/780 (92.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. TAIR 10
Match: AT1G08520.1 (ALBINA 1 ) HSP 1 Score: 1121.3 bits (2899), Expect = 0.0e+00 Identity = 607/749 (81.04%), Postives = 664/749 (88.65%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. TAIR 10
Match: AT5G51050.1 (Mitochondrial substrate carrier family protein ) HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 5.7e-213 Identity = 365/472 (77.33%), Postives = 407/472 (86.23%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. TAIR 10
Match: AT5G07320.1 (Mitochondrial substrate carrier family protein ) HSP 1 Score: 721.5 bits (1861), Expect = 1.2e-207 Identity = 353/466 (75.75%), Postives = 400/466 (85.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. TAIR 10
Match: AT5G61810.1 (Mitochondrial substrate carrier family protein ) HSP 1 Score: 653.3 bits (1684), Expect = 4.1e-187 Identity = 322/467 (68.95%), Postives = 376/467 (80.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy5G092000 vs. TAIR 10
Match: AT5G61810.2 (Mitochondrial substrate carrier family protein ) HSP 1 Score: 469.2 bits (1206), Expect = 1.1e-131 Identity = 231/332 (69.58%), Postives = 267/332 (80.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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