Chy4G087960 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATCAAACAATTCTCCCCTCCTCCTCGTCGTCGTCCTGCCACAACATCTCCCTCGTCTCACAGGTAACCCCTCCTCTCTCCCCCACCACTGGAATCCATGAGTACTATTTTACTCGACTTTGGCCAACTTAAAAGTCGACATGAATAACAAGCCCAATGATTTTCAATATTAATAATGAATTAATGATGAACATATATGACCTCGTGTTTGCAAACTCTAATACTATGTTAATGTTAAGCTTGAAAATTTAGAATACTCAACAAGTGAAAATCGATATTAATGGTTAGAATAACAATGTATAAGTTGTTGTTTGCACACTTATGGCCTATTAAACCACTGTTTTTGCTTTTGCTTTGTTTAAAAGTAAATTTAATATTATATCTATATAAATATTTATGTATGGTCTTAACAGGAAGATTATAGTAATGAGGAAGACTACAAACAAGATGCAAAGATAGAGTCAAGTGAAGATCAGAGTCTCAACAGTCTCAAATTTTCAGGTTCAATAATAGAATCAAACTTTTGAAAATTAATGGTCATATTTAAGCTTTTGGGAAACCCAATGAGTTACATATATAATATATGTATATATAATTGATGGGTATTGATAAGAATTCTTGTGTGTGTAGTGGGAAGAAAATTGAACAAATCTACAAGTTGCAAAAGCTTGGGGGAGTTGGAGCTTGAAGAAGTGAAAGGGTTTATGGATTTAGGGTTTGAATTTAAGAGAGAAAGTTTGAGCCCTCAAATGGTGAATTTGGTTCCTGGTTTGCAAAGGCTCAGAACTCAAATAAACAAACAAAATCTTGAAGAAGACGACGATGGTGACGGTGACCACGACAAAGAAAATGATGATGATGATAAAATTAAGAAGAGAGAGATAGCAAGACCATATCTTTCAGAGGCATGGATAATAAGAAGACCAAATTCTCCTCTTTTAGATCTAAGAATGCCTAAGGTTTCTTCAACCTCTGACATGAAGAAACACCTCAGATCTTGGGCTAAAACTGTTGCTTTTGAAATTCAATAAAAATATTTTGACTTAATTATTTAAACTTTTTTTACTTTAATTTAATTGAAACAATATTTTTTTATATAAACAACATGAATTCCAAACATATAATTATAGAAACAAGCCAGCCTTAATCTCTAGTTCGAATGCTTTTGGCACATTTTTCTTGAATTAAACCATTAAAATGAATATTCGACTCATCCATTCTTATTCCTTGAATTATGTTTAAATTGATTCACCTAGAAACTTTATATTTTCATTTTTAAATTTTAGTCCTTATGTTCTTGAACCAAACTTTAAATCTAATCCTTCAAAATTTATAGTAAAGATGTTGAAATTAAAACCGAATAATAATTTAAAAGGGGAACAAAAATTTTAAATGGAACTAAAATGATATTTTATTTATTTATTATTTAAGTTTGTATTTGAATATAAATAAAAAGAGAAAACGAAAGGAAAATTATAGAGTGTTGTAAGACAAGCGAATAATGAATGAATGAGAAAAAGCCAATAAGCAAGTGGAGTTCATAAGAATGTGAAGATTCCCAATGTCAATTTAAATTTTGTCACATTATGATGAAGTGCAATTTTTCCTTTGCTTCTAAAAATGGGTCACACTATTTTCAAATTAATACTAAACTATAGGAAATATTTTCAAAGTAAAATATGAAGAAAAATTAAATGAAGGGTAAATATATTTTTTTTTTATTCTTATTTTTTAAAACTTCTCTAAATTATACAGATATATTACAAAATTTCATTAAAGAATCTTACAAATTAAAATTAAAATTAAAATGCTTCCCTTACCAAGGGAAATTTTGGGTGGTTGCTTCAATCAAAATGGGCTTGTTTAATTGGGAAGCCCAAACCTTTGGAGCAATGGGCCTCGTTGTATTTTAATTTTTTATTTATTTTTTGTTAATTGATATGCAAATTTGGATAAGTTATTAATGATTAATTTGTTATTCGAAAAATACAAATGACACCTAAGAAAACTTTTTAATATATGTCATTTTCAATTTTATAAAATAGATATTTTAATTTATTTGAAATATATGAGATTGGTTTTCCTTTAAGCATACGTTTCCTTTTGGAAAAAAACAATCATCATAAAGTTTTCTTTTTCTAATTCATTGTCCAAAAGATTTAGAAAAAAAACAAAACATAAAACATAAAAGTATAAGATATCGAGAATCTCATGTGTCAAATATAAGAGAATAACTTACAAGATATTTATCCAAGTTTTGAGACCATACTATTCGTTTATCCAATACATACAAACATATATTATTTTTATTATTGAACTTACGATATCTTATTTTGATTATTTAACTTTTAAATTTATAATATTTTAGTTTATAAAAGTTTAGAAGTATAATCATTTTGGTTGATAATTTTGTTTTTAAGATTATTATTTAATGACGTTGTGTTTGTTATGCTTGTTAGCATGTTAATGCAAGCATGCATGATTTTAAGCCACATAAATTTAAAGACAAACTTTAGGTAGGTAAAAAAAAAATGTATATATTAAATTATCAAAAATAGATATTACAAAAATTTACGACAAAAATGGCACGAAAATAAAACAGAATACAAAATTAGATTAAATAAAATCAAACAAGTTTAAAAGTTTAAAATAAAAAATATATATATAAAAAGGAAAATAGAAAGTCAATATTAATAAAAGACTCCCAGTGAAAGTTATGGAATTATTGAACCTCACATGAAAATGCTACAAATAAATGGTTATATAGGTATTACACATAAAATAATAAATAAGTAATTAAAAAAAAAAACAATTATGATCTCTGAATTTATTTGAAATAATTTTATATTTTGTGAGATGTTGAATGTGTTTTAATAATTAAATAAGGAAAAAATCTCAAAAAATGACACCAAATTGGATAATTTCAAAGGGATACTGTTTGCAATCTCAATCACAATTTTCAATTACTTTATTATATTTTTAAAAAAAAACTAATTTCAATTATTGATGTAATCTCTCTCAATAAATTAACAAATAAATAAAATGGGGAAATTGTTAATAATTTGACTTTTTTAACAAAATAGAAATAAACTAATATTAGAAATGCATAACTTTTAAGCATTTCTTTTAGAAAATTAGAAAATATCTTCTATTGTATAAATAATTATTACGTTATTTAGATTAAAAAAGATTGTTTGGTTTTGAAAGTGATTGTGTTCATTATAAATATGTTTTCGATAACATAATATCACTTCAAATTTTCTCTTAATTGGAGCTTCCAAATTAACCCATTTTAAAAATCATAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGTTATTAAGATTATATTTGTTAATCTAAATTTATTTTAGATTCTAACCTAAATCAACTTTATATTATGTAATATTTTATGAAATGTTATCAAAGAAATATTTATATTTAAAAGTAATATTTTCTTAAAATTATTTTTTAACGTTATTTTCTTTGTTTTCCTCTTCAACACTATTTAAATACTTAGAGGTCGATTAGGATTAGATGTTGGTTATCATATTCTAGATTATACTAGTTTGTATTTGGATGTATATTATTTTAGTACCGTATATAATATATGGATCCCACGACTTTACAAGATTCATATATTTCAAATTTAAAAAAAACCACAAACAAGTAATTCTTGTAAATAAGAATGTGAATTATGAGTTCAATATGGGTGTGCAAGAGATTCCTATCCAGTCTATTCTTAAAATGGCATTTTTTTTCTTTAAGAAAAAACAATATACAATGGCTCCTATTTTCTTTTTCTCCTAATTTCTCTTTTCTAATTGAAAAAAAAAATGTTTGTCTTTTTTGTTTGAAACAAAGGTCGAGACAACGTGGATGTCGATATCATATTATGTGACTAGGTAGCAAAAAAAATTCTTTTTGTTAATATTAGAGATTGATTAAAAACACAAGTATAAGAAAGAAGTTGAAAATCCAAGAGTTACCTCACTCACTAAAGAAAATGACTTGAAGTATAGTAGTTTGCTATTTTTCCTTCTAGAATTATAATAAAATTAATCTTCCAAATCTTTAAAATAATTAAACAAAAATTATCTCTAATCTATTCAATTCCATTTTTTAACTGTTTATTTAAATTGATAGTTACAAATATAGGAATTATATTTAAAAAAAAAAAAAGAATATAACAACATTTTAAAAAATTACAAATATAGCAAAATTACATTTTTAGACCTATTTCATACAATTCAATTTATTTTTACATTTTTGTTATTTATGTTTCTAATGAAGTAATTTAAAATGTTAATTAATAATGAGAAGCAACATAAAAGTTATCAAACGTTTATACCTTTAATATACTTTTGTATCTCATCTTCCAATATTAAAAAGTAAATTATATTATGTGTAAATACAACACTCTTGGAGATCATCATTATTATTATTATATAGCAATTAAATAAAACTCTACAAAAATAAAAATAAAAATAATACGTTTGAAATGCATGTGGCAACCGAACTTTGTATTATTATTTATTAATACTTTGTCAAGTTCCTATTGACTTAGTTAGGCAGTGCCCCAATAAATATATACATGTGTGTGTGTGTGTGTAGCTTAGAAAAAAAGTAAAATGATGTGTTTATAATAATTTAATTAAATCAATCTTACACGTCTAAGTCTCAACTCAAATCTTTAATTATTGTGTTACCAAATTGATGATAAAAATAAGATAAACTAAGAATATATTATGACCAAAATGAAATTATATACAAAAAATTTCAATAGGTGTAAACTTGAAAAAGTAAATTAAAAGAACGGGGCCCAAGGCTGGGTGCTCGCGTGATGGCAAAAGAGTGTTTGTGTGGTCAAAGAAAGTGGCGTCTAATGGGATGGCCGATGGGAGACTTCCATTTCATACCTTTTATATTCTCCCATGAATATCCATTTCACATGCCTACAAATTTTCAATTTCTTTTACTTTAATTTCCTTTTT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ATGGATCAAACAATTCTCCCCTCCTCCTCGTCGTCGTCCTGCCACAACATCTCCCTCGTCTCACAGTCTTGTGATGCATCACTTTTGTTGGAGACGGTGGTGGGAGTGGAATCAGAGAAAGATTCAAGCAGAAGTTTTGGAATGAGAAATTTCAAATATGTAAATAAGATCAAAGCAGCTGTTGAAAAAGAGTGCCCTCTCACTGTTTCTTGTGCTGACATCGTTGCTCTCTCTGCTAGAGATGGCATAGTTATGTTAAAAGGGCCTCGTATAGATTTGAAAACGGGGAGAAAAGACAGCAAAATGAGTTATTCAACTATGGTTGAGGAGTTGGTTCCACAACACAATGCATCTCTTGTAAATGTTCTCTCTCGCTTTAACTCCATTGGTATTGATACTGAAGCAACAGTCGCCCTTTTAGGAGCCCACTCAGTCGGTCGAGTTCACTGCGTAAACTTAGTCGAAAGACTATATCCAACGGTCGATCCCACCATCGATCCAGAATATGCCAAATACCTTAAGATGCGATGTCCAACACCAAATCCTGATCCAAACGGAGTATTGTATTCAAGAAACGATCGTGAAACTACGATGATTCTCGATAACATAGATGGGTTTGAAGAACAGAGTTTGATATCGATGATGTTGAATTTCTCTTCAATATTCTCATCAATTACCTTCACATTACTTCTATTTTCCATTTCCAATACTGTCATTGTCGATTTCACTGCCACCGTCGCCGCCGCCGTCGAATTTGACTTCGGCACTGTTGAACTCAGTAGTTTAAAGCTACTCGGCGATGCCCACTTGAACAACGGGAGCGTGAGGCTAACTCGGGACCTCGCGGTCCCAAATTCAGGCTCCGGCAGAGTCCTTTACGCTAAACCCATCAGATTCCGGCAGCCGGGGATTAATTACCTCGCTAGTTTCTCCACATTTTTCTCCTTCTCTATTACTAATCTCAACCCGTCGTCGATCGGCGGTGGTTTGGCGTTTGTTATATCCCCGGACCCTGAAACGCTCGGCGGCGCTGGTGGGTTGTTGGGGTTGGCTGACGAGAGGGGATTGGGATTCGTGGCGGTGGAATTCGATACATTAATGGACGTGGAATTTAAGGACATTAATGGAAACCATGTGGGATTGGATCTGAACGAAATGGTTTCGTTAGAGGTTGAAGATCTTCAGGGAATTGGAGTCGATCTTAAAAGCGGCGATACGGTGAATGCGTGGATTAAATACGACGGGTGGGCTCGGATCTTCGAAGTATTTGTTTCTTATTCGAATTTGAAACCGACAGAACCTCTAATGTCGTTCAATCTCGACCTTGATCCATATTTGAACGATTTTATGTACGTTGGATTTTCCGGTTCGACACAGGGGAGTACTGAAGTTCACAGTATGGACTGGTGGAGCTTTGCGTCGTCGTTTGACTCGGATTCATCACCTGGGTCGGTTCCGCCGCCGCCAACGACGACGCTGATGAACCCAACGGCGAATGTCGTTCGTTCACCGCCACCGTCGCAACCGCCATCCGGTTCAGATTCCGTCACGCAAAAGAACTCCAAGTCCACGTCCTGCCACAATGGGCTCTGCAAACAAGGCGCTGGCGCGGTGGTCGGTGTTGTGACGGCGGGGGCATTTGTTCTAGCATTATTCGCCGGCGCGTTAATTTGGTCGGTTAGGTTTTGTATTGGAGGAATGGGCCTAGATATCATTGGGTTTTTTCTCAAGCCCAATATGGGAAACTTGGGCCTATTGCGAAGTATCGCAAACCCTCTCTACATTACGCTCTAA MDQTILPSSSSSSCHNISLVSQSCDASLLLETVVGVESEKDSSRSFGMRNFKYVNKIKAAVEKECPLTVSCADIVALSARDGIVMLKGPRIDLKTGRKDSKMSYSTMVEELVPQHNASLVNVLSRFNSIGIDTEATVALLGAHSVGRVHCVNLVERLYPTVDPTIDPEYAKYLKMRCPTPNPDPNGVLYSRNDRETTMILDNIDGFEEQSLISMMLNFSSIFSSITFTLLLFSISNTVIVDFTATVAAAVEFDFGTVELSSLKLLGDAHLNNGSVRLTRDLAVPNSGSGRVLYAKPIRFRQPGINYLASFSTFFSFSITNLNPSSIGGGLAFVISPDPETLGGAGGLLGLADERGLGFVAVEFDTLMDVEFKDINGNHVGLDLNEMVSLEVEDLQGIGVDLKSGDTVNAWIKYDGWARIFEVFVSYSNLKPTEPLMSFNLDLDPYLNDFMYVGFSGSTQGSTEVHSMDWWSFASSFDSDSSPGSVPPPPTTTLMNPTANVVRSPPPSQPPSGSDSVTQKNSKSTSCHNGLCKQGAGAVVGVVTAGAFVLALFAGALIWSVRFCIGGMGLDIIGFFLKPNMGNLGLLRSIANPLYITL* Homology
BLAST of Chy4G087960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LFH9 (L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LECRK81 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 394.8 bits (1013), Expect = 1.7e-108 Identity = 206/320 (64.38%), Postives = 245/320 (76.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LYX1 (L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LECRK82 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 6.5e-100 Identity = 204/355 (57.46%), Postives = 249/355 (70.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q42580 (Peroxidase 21 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PER21 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 281.2 bits (718), Expect = 2.8e-74 Identity = 141/185 (76.22%), Postives = 158/185 (85.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FHG4 (Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LECRKS7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 218.8 bits (556), Expect = 1.7e-55 Identity = 117/237 (49.37%), Postives = 156/237 (65.82%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SB81 (Peroxidase 42 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PER42 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 207.2 bits (526), Expect = 5.1e-52 Identity = 100/181 (55.25%), Postives = 130/181 (71.82%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LDF8 (Lectin receptor kinase-like protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G736960 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 649.4 bits (1674), Expect = 1.4e-182 Identity = 338/345 (97.97%), Postives = 341/345 (98.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DNE5 (L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold352G002430 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 645.2 bits (1663), Expect = 2.7e-181 Identity = 335/345 (97.10%), Postives = 339/345 (98.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B5R3 (L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486472 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 645.2 bits (1663), Expect = 2.7e-181 Identity = 335/345 (97.10%), Postives = 339/345 (98.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F5E8 (L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442313 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 592.4 bits (1526), Expect = 2.1e-165 Identity = 303/344 (88.08%), Postives = 321/344 (93.31%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7T9 (L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482056 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 587.8 bits (1514), Expect = 5.1e-164 Identity = 300/344 (87.21%), Postives = 320/344 (93.02%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. NCBI nr
Match: KAG6580596.1 (L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 845 bits (2182), Expect = 8.80e-297 Identity = 449/571 (78.63%), Postives = 483/571 (84.59%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. NCBI nr
Match: XP_004137813.1 (L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 643 bits (1658), Expect = 1.12e-221 Identity = 338/345 (97.97%), Postives = 341/345 (98.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. NCBI nr
Match: XP_008442670.1 (PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1 [Cucumis melo] >KAA0044022.1 L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK25118.1 L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 639 bits (1647), Expect = 5.17e-220 Identity = 335/345 (97.10%), Postives = 339/345 (98.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. NCBI nr
Match: KAE8651038.1 (hypothetical protein Csa_000825 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 643 bits (1658), Expect = 2.65e-219 Identity = 338/345 (97.97%), Postives = 341/345 (98.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. NCBI nr
Match: XP_038905607.1 (L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 626 bits (1614), Expect = 9.78e-214 Identity = 327/356 (91.85%), Postives = 338/356 (94.94%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. TAIR 10
Match: AT3G53380.1 (Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 394.8 bits (1013), Expect = 1.2e-109 Identity = 206/320 (64.38%), Postives = 245/320 (76.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. TAIR 10
Match: AT5G03140.1 (Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 4.6e-101 Identity = 204/355 (57.46%), Postives = 249/355 (70.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. TAIR 10
Match: AT2G37130.1 (Peroxidase superfamily protein ) HSP 1 Score: 281.2 bits (718), Expect = 2.0e-75 Identity = 141/185 (76.22%), Postives = 158/185 (85.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. TAIR 10
Match: AT2G37130.2 (Peroxidase superfamily protein ) HSP 1 Score: 281.2 bits (718), Expect = 2.0e-75 Identity = 141/185 (76.22%), Postives = 158/185 (85.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G087960 vs. TAIR 10
Match: AT5G55830.1 (Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 218.8 bits (556), Expect = 1.2e-56 Identity = 117/237 (49.37%), Postives = 156/237 (65.82%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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