Chy4G080510 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGAGTATATGCATGCCTCCTAATTTCCCTCTTATTAATTCTTCAAACTGTTTGGATTTCATCCCTTTCTAATGCTTCCAATAATTCTTTTCAATATGAATCTCTTTCCAACCCTCCTCTTCAAACCCATCATCTTCGTCAACAACTACTTTTGGGTGAGATTATATTGATTCAAAACCTCTTTATCTTTTGTTTTTGTTTCTATTTATTGGTTTCTAAGTTTTGTTTACGAGTACACTTCAATTATTTAAATTAATCTTAGGAGAAACTTGTTGTGTTTGTTTTGAAATATATAGATAGAGTACTCCTCAATATCCTAACGAGATTAATATTTTGTTTTAGTTAAAATATCATTTTGATTATGTATTTTAAATTTATTTTTAATATATATGTAACAATATTGGTTCATCAACTTTTAAGATTAATATCAAGTTTTTAAAAAAATGATCTTTATTAATATTTTCTTTATAAATCAATCAAATATATGTGCATAACGTGTCTTTTCCATTACAGTTATTATTGAACTAATTTTGATAAGATTTCTAGAAAATAAAATGATAAAAAATCGATAATTAAAAATACATGAGGTCATGTACCCATACAAATAACGTATGGAATTTGATATTATTCTTTATTTCATCATACATTTCTTAACTTTGATCCTAACTTTATCATAATTTTCTTTTCCATTGTTGAGTGAAAAACAATTTTTTATAGAGGTTTAAAATGTAGGTTTTCATTCAAAAACCCTTTTTTTAGAAAAAAGTGAAAATTAAAGTAAAATTATTTCAAACATTTACTTTTGTTTTTTAAGATATGGAATTGATAAACGATGAGGAATGGTTAATTATTTGTTGTCTTTTGGTTTGGAGTGAAAGGAGGGGGTGGCAAAGAAGAGAATAATAAGACGGCGGAGAGTTGGACTGTTTCAAAGGCTAAAGGGGGCGGAAGGTCCGGCGCCGGCGGGGCAGGAGCCAACAACCACCGGCCGGGAAAGGCGAAGAACGCAGCTTCCACTTTGATGAACTCAAATAATAACATAATAATAATTACCACTCTCCTCCTCTCTTCCTTTTTATACTTGTTTTAAATCTTCTTTTTTCATTTATTTCCATATGGAATAATATCAAAACCCTATTTATATATACATACACACACATACATCTTTTTGTTTGAGTAAATTTTTGTTATCAACTACCTTGATTTATACATATACACATACACACATATAGATCTTGTTCTAATACAATAATTGGACTAACGAGATTTGAGAACAAATTCCATGTTATCAATACACTCGAATCTTAACAAAATGTACTAAGATTTGGTTTTATCAATAAATTTGATTCCATGTTTGGAGCATTAATTAATTGTCTCTTTAATTTATATCTCCGATTCTATTGTCTAATATAAATTTTGACTGATAATTGATAATTGAGTCTACTACTGAGAAAAGTTTGTAAAAAATGTACTCTATATCCCTAATAAAAAAATTTATATTTGTAATTTCTTTAAAATTATTGGTATGTTAAACATATTTCTACATTAAAAAGGAATACCTAATTTAAATTGTACAAGAAATTTTTATTTATAAATTTATATATTGGTCATGGTATATAATTAAGGAAATTAATTCCTTGTTCAATTAAGTACTTATAAATCCCACGCTTGTGTTGTTTGAAGATGTAGTTTTGAATTTGATATTATAAGCTTATTTCTCTTTAGGGTTTGTTTTATTGTTGATCATTTGGAGCAATTCTCAACCGTTTTCTAAGAAACACACTTGGGGAAGGCTACTTATATTATATCTACTGAATTATCTTTGTTTTTATGTTTTTTTTAATGATTAATTTTGATTATTGTTTTATTCATTTCAAATATTCTTATGTAGAGTGATTTGTAGAAGGTTTAAAATGTGAGTTAATGCGTGGTAAAGGCACTAGAACCTCCATATATATATATATGATCTCTTACCATATATGATATTATATATGTACCAGATATAAGTTTTCTTATAGTTTTAAGAATTCATTCGACTTACTAGGTCAAAATGGTTTCTTTTTTTGGTTTGGAGAGTTAATATATTGGTGCTAGCTAGTAAGTTGATGTTTGAAGGGTAAATTTGTAATAATGTTGAAAATTCCACTTTAAAAAAGCGATAGAATTCACAAAATAAATAACAGCTACTCATTCCCTCCCTATCAATTGGTTTTAAGATAAAATTTCATAGTATCAAATATGAAAAATAAAATATGAAGTTATTTGATAAATATAACACTAACTTTGGGTCAAATGAATTCTAATTTTGGTTTGGATCTACTCCTAATTGAGTATCCTCTCTCCTTTGGTTTGTAGGGTAAAAAGTTGATATATAATAAGTTTGTTTTAAATAAATTCTCTTAACTCTATATTTTAACATCTTTTGGTTGAGATGTTGAATAAGATTGGAGGGATATGAATTTGCTTTGAATGTTTCTCAAAAACAGGAAGATAAAAGAACTTTCCTTTTATATATAATTAAAGGGGCAAAAGGGAGGTTTTAGGAATGAGCTAAGACATAAACATGATAAATAAATAATTATACATATACAAAGTCATATATATAGCGAAGAATGAACAACCAAGCTCAATGAAATGTACACATGTGACGTAGGTTTGAATACTCGAAGATGAACGTGTCTCATGGAATGTTTTAATTGTTCTCAAAATAAAATTGTCTCAACACTTTGCTACTCTTGTTCTCTCGAATTTTGAATTTGCTTCAAACCAACTTATATTTTAGATTGAATCCTCAACTTCAATTGAACGTCTCGAGGTTTTCAAAGATGTACTCTTTTATCTTCTAAAAAAAAGTTAAAATGTAATAAAGAAGAAATGACAAAAGAAAATTTTGATAACGATGAGAATTTGTTACTCTATTGAACATCCTTTGTGCAATCACTTTTAACTATATGTCAACTTTAGATACTAGCAACTAGTACTTTTGACCAAAACTCCGATGAAGACCATCTAAGGTGAACAACTCCACTAGTAGACATTCTTTGACAACCAACGTTAACATTCTTTGACAACCAACGTTAACATTCACCTTAAGGGACCATACCTCTAATGAGATCTTCAATAACAACTCTATATTTTAACATGTAAAACAGTCCTTACAAATTATATGGTGCATTGATATGTTGTTTCATACATTTTTTTTTAGGCCACGGTTCTACTTTGTCTCCATTAAGTCTAGGTGTTTTGATCTCATTCATTCATATTCTTTGAAGGTATGTTGAAACGTGTTTAGTTTTAGTTTTATTATTTGCATTTATTTAATTTTAATTTTTTAAAACTTTATGCATTTAACTCCACTTTAATGCAATTGTGGTTTTCTCATGTTACTTGTAAAGTCAATCTAGTTTTAAAAATATATATATAGATAACAAATACAAGAGCTCCAAAGAGAGAAAAATATTAATTTATATCTTTAAATTTTAAAAGTTATATCAATAATATTAACAATTATATATCAAATTTAAATCCTAAATATTGTATGATTATGTTTATATTGTATTTTTCTTAGATAAACATCAGGTAAAAAATTAGGATCTCCTTTAAAAATCATCTATGAACAAATTTTGAACTATATTTGGATGTAAAATGATATAATTATTAAATTTAATTTTAAATAGATACAATTATTAAATTAAAGTTTTAAATGAAAAAACTTGTAAGGTTTAGATTATAGAAGTATAAATGTGATTTTGTAAGCATATTTATATCACGTTGTTAAAACTACAAATAATAAAAATGAAGATTCGCATAAAATAATAAAAATGATGAACAAAATTGTGTGGTAGAGGCAATTAAAGAAAAGATATTAAAATGTGGATAGTATCAAAACATTAATAAACGTCAAAGTTTGAACATATCCAATTTAAATGTCACTACCACCTAATAAATATCTTATTTTCCAATTCCCAATCCACTTCTTGACATTGATATCCATTCCTTTCTTGATTGTTACAACTTACATCCCCTTCTTTCAAATTAAAATCACAAATAATTAAAGCTTCTCTTTTTTAGAAAAAAAAAACTGTATTTTTTATAAATATTTTTCATCTTAAAATATTATAATTTTTAGTCGAATTTTTAAAAATCATTAATAATAATAAAAATATTGTGTATAATCATAACTTTCAAAAATCATAAACTAAAGACATGACCTAAATCTAATTCATTTAATCCACTCTTTTCTATTTCAAGTATCTTCTACCAGATATCTTGTTTTTATTTGTGATTATAAAGTCCTTACAAGATATATTTTTAATGCAACTTGGTTTGATATTTTTAGCTAAAAATAAATATTAAAATACCTATAATAATTCCTGAGATATTCGTTTGAATTTATTACTTTAGAAAATAATTTTCTATTTTTTTTATTTCTGGATCTCATCTAACTTTTCAATGCACGTTTTTTTAAATTGTTTGGTTTATATTTGAACTTTTTTTTCTATAATTCTCCGGTGTGAATGTGAAATGTAAATATAAATAAATATTAAAAAAATTATCAAAATATTTCACAAAATATTTACACAATAAATTTTGTCTTTCAATTATTTTTTTCTATAAAATATAAATAGGTGTTCATTTTTTTTTTGTTTTTGAAAAACTTCAAATTTTGATAAATTTTAAAGGCAGGACTTATCCCATTTTAATTTGATACATTATTTGTAATTATTTCTTTGTAACATACACTTAGTTGCTATTAAAATATTGTTTTTTAGCTTTGGCATTTTTAAATTACTTCAAAGAGAGAGACAGAAAAAAGTACAGTATCCTAATTTTTTAGATTAAATTGAAATACTGTTTTGATCCGCCATTCTATGTTTTTAATAAATTTTGAAATTACTTCTCCAAGTTGTTTTTCTGTTTTAGAAATTCGAAGGTTTTAGGCAAAGAATAAGCTCTCTAGTTTAACTACAATAGCTTTGTGTTTGAAACGTA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MGVYACLLISLLLILQTVWISSLSNASNNSFQYESLSNPPLQTHHLRQQLLLGGGGKEENNKTAESWTVSKAKGGGRSGAGGAGANNHRPGKAKNAASTLMNSNNNIIIITTLLLSSFLYLPRFYFVSIKSRCFDLIHSYSLKINIRKELTAVNMTD* Homology
BLAST of Chy4G080510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LCI5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G710765 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 206.8 bits (525), Expect = 6.5e-50 Identity = 117/124 (94.35%), Postives = 118/124 (95.16%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G080510 vs. NCBI nr
Match: KGN58897.2 (hypothetical protein Csa_001334 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 210 bits (535), Expect = 2.39e-67 Identity = 117/122 (95.90%), Postives = 117/122 (95.90%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G080510 vs. NCBI nr
Match: KAG6581619.1 (hypothetical protein SDJN03_21621, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 2.62e-19 Identity = 64/108 (59.26%), Postives = 71/108 (65.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G080510 vs. NCBI nr
Match: KAG6606846.1 (hypothetical protein SDJN03_00188, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 2.56e-06 Identity = 48/115 (41.74%), Postives = 59/115 (51.30%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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