Chy4G079470 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview


Name	Chy4G079470
Type	gene
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	Unknown protein
Location	chrH04: 18817395 .. 18822207 (-)
RNA-Seq Expression	Chy4G079470
Synteny	Chy4G079470

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

GTACTTTCTGTGCAATAGCTTCCTTCCCAGTCAAATTAAAACAAAACCCACTTCAAAAAACCTCTGAATTTGCCATTAATGGAGGATTACCTAATGGAGAATTACCTTCAAAATCCGATCACAATCGCCACCGCCAGTCCCCATTAAGTTACGCCGTCAAGATCTTCCTAGTGGCGGTGATGGTGAAAGCCTATAATTACACCCACGTCCTCCCTCAAAAACTCCACTGGCTCTTCCTCTGTTTCCACATCTACTTCCTCCTCGAGCTCAGCCTCGCCGCTGCCGCTTCCATCGTCGCCTGCGGCGGCCCTCTCGAACTTCTCCCTCTCTTCCACCAACCTTACTTCTCCACCTCCCTTCAAGACTTCTGGGGTCGGCGATGGAACCTCGTCGTCACTGGAATCCTCCGCCCCGCCGTCTTCCGCCCTGCAGCCTCTGCTGCCTCGAAACTTTTCGGTTCCAGGTGTGGCCCCCTCGCCGGAGTTACGGCGACGTTCCTTGTATCGGCCGTGATGCATGAGCTGATGTTCTTCTATATGTCTCGTCAATGGCCGCCGCCGACGTGGGAAGTGTCGGCGTTCTTCGTTTTCCACGGCGGATGTCTGGTGGCGGAGATGTTGGTGAAGAGACTATGGATTCAGACGTGGAGGATGGCTCCGCTGCCGTGGATAGTGTCGGTCCCGGTGACGGTGGGATTTTTCTTCTGGAGTTGCTTTTGGCTGTTCTTTCCGCCGTTTATTAACAGTTGCAAGGCTGACGTAAGGGTGGTTGAAGAGTACGCGCTGTTTGGTGCATTTGTTAAAAATAATATTCCAATTAATTTATGGCCAAATTTGAACAATAATATTATTTCTTTTAATTATGTTCAAAATATTTAAATATTTTATCAATAATTTTGGAAGTTAGAAAATGAATACACTTATTATTATTATTTTTTTTGGATTAGTATCTATTAATTGATTTGATTTCTGTGGAATCTTATATTATTAATTTATAATTTGCTAACGTGATGTGTGGTCTATTCATATTTGTAGCCAACTACTTTCCCTTACATAGTACTAAACAATAATATCATTGTTTCTATCATTAAATACCAATCCTTTTAATACAACTATTTTTTAAATTTGTACTTAAAAAACAATTTTTTTAGAGTTCAATTATAACTTTAGTCTATAGCTTTTGAGAGATTTGTGTTTATTTTGCATTTGAATTCTTAATAGTTTAAAAAGTGAGGATTTATAATTTTATATCTACTAAACCTTCAAACTTTCCTTAATATGGTTCATAATTTTTAATGTTGTATTTAATCGGGAAGGATTTAGCAACCATATCATCAATTAAGGTTGATGACACCATTTTTGTAAATATGTGTGGATCTTCCATAACTTTAGGACGCCCATTGTGAAATACAAAAGAGAGGAGAAATTGATCAAACCACGTTATGACAACACATTAGAATTTGAATTGAGCTGTTATATATAAATTTGAATGGTATGTTTAATGAAACACTAAATTTTTTGTTGTCCAGTAGTAACCATGAATTGAAGATTGAATCGACCGAATATTTATTAATAAAAAATATATGGATGCATTTGAAGTAACATCCATCTTTCTCATCGTGTGGAATCATAATTTGTCAAACAACAAATTTCTTATTTGTTTTGGTTAAAAAATACTTTTGGTCTTTATACTTTCACGACGGAAGTAATGCTTTTATTTCTAAACGTTAGGAAATGATTTTGGATGCGTATTTTCAAGTTTGTTGTAATGTAATTTAATCTTTGTACTTTCAAATTCATAACAATTTAGTTTCTAACATAAAAATTCATCAAAATTAGATGTCAATTTTTATTATTTCATGATTTCATGATGTAAACTATAAATTTTGTAAAAATATTAAGTCTTTAATTAGTTTATATATCAACTTGTTTAGGTAAAAAGTCTATTATATTTTAACATCAATTTCTACAATAGGAACAAAAATTGTTACAAACTTTATAATATAAAGACTTTAAAGACTAACTTGTTATATAAAAAAAATAAACAGACTGAATAATTACAAATCAAAGTTTTCAAAGAATAAATTATTACTCTTATGAACATTTAGGGACGAAAAGTGATTTTTATTTGAATCTTTTATTTGATGTGAGTGATGAAAAAGGGATAAAAAAATATGAGTTGTACCGCCCTTCAATAATTAACACGAAATGAAAATTGTACAAATTTATTAAATATATCCAAATGAAAGTTTAAAAAGTGAGTTGATACATAATTTTATTTCACACAAAATTAGATGTTTGGAGAGAAAAAAAATACACAAAGTAATTCAAAGATCAAATAAACACATACCAAAAGTTGTAATATATTATACTATATATATATATATATATATATATTATTTTTGTTGTTATCCATCAAAGTATAATTTTTAAGGTGAGGAAGCCATATATATATATATGATTCCAGACATTTTGGAAGATGACACTATATGGGCCCTTCTATATATATTGGACAAAGATATCCAAATTTGTGTGGGACTCTTGATTTGTTAGAAGTCTCTTTTTTATGAAAAAATTAATTTTCCTTTTTTAAAAAATAAATTTCAAGATAAAACAAAAGTAAGATCTCATACTCAGTGTATTTAAAAATCGTTTTGAACCTCTATATATGTGTGTGTATTTAAGGCATGCGAAAGATTATGGCTAAACTCCATACAAATTAAAGTTAGAGGTTTGAATTGTTAAAAAGAAAGATTGTGTGTATGTATTTTAGTAAAGAGAAGTACCCACCCAACAAATTGTCATTATATATTCAGACACAATTTTTCTTTTTCTATTTTTATTTTGAATTGAAATACTTAAATATTAATTGAAATCCAACTCTGTTAGACAAAATCACTCTTGAATTTGCATCCACAATGTAAGGAAAAATAGAAAAGGACAAAATTATATTAAATTATGTTTGTGCATTAATTATTAATTATTAATTATGCATGAAAGGACAAAAACCTATTCATGGAATTAATTACTCCGCCATCGACTCTCTCCCTCCCCTTTCTTCCTTCTTCTTTCCCTGACTGTCTCCTACGTCGCTTCATCCACCTTCCTCCACACTACTTGTGTGTTGTGGATTTTCATTAATGTTGAAGTACATTTGGAGAACTCTTTGCTTTACTTGGATTTTTTTCACTCTTGGGTAAGTTGTGTAGGCCAAAGTGAATTAAATTAATAATTATTGATAAAATTGTTAATTTAATTTTGTTTATAACTTGGTAACCTTTTCTAAAATAGGATATCTTTTAATCAAATTACTTGGTGGCATTTGCGTATTATATTGATACATTGAGATATCTCTATACATACCAGGTCAAAATACTAATTAATCCATTTAAGAATGAGCTTCTAATCATTTATAGTTCATACCACTTCATGAATTTAATCTAATAAAATAAATTCATACTTTAATTATAGTTATAATTGTTTAAATACATCTAAACACGTTGAAAGTATAATAATCTAAGAAGTCTCCATGCCCTCCATTTAATGTCTCCTACTGTATTATTTAGAACAATTCCCTCGAAACCCATTGGAAAAAGTTATGACTTTTCCAATAGAAACAAATTTTTTTTTAATAATTAGAATTTGTATATATATTATTAGATATTCTTCCCATTGTCGCAATCAATATAAAGAATCCATTTAAATCTTCAACAAAGAAATACACACAAACCTCATTCCTTTGAGTTTCTCCATTAATGGCGGCCGAAATTCGAGTTTTCCTTCAAACTCTCTTCTTAGTTTCTTCATCTCTCTCTTTCTGTTTCTCAATTAGAAACTCAATCCCAAATGGCTTCCTCAAATTCCTCTTAATTCTCCCCTTCTTCTCCCTCTTTCTCTACATTCCTCTCCAATTCCAAACCATCCATTTACAAGGCTCCATCGGCTTCTTCATCGGTTGGCTCGCAAGTTTCAAGCTCCTCCTCTTTGCCTTCGGTAAAGGTCCTCTCTGTTCCGCTGCCGCCTCCTCCTCCCTCCGCCGCTTCCTCGCCATCGGCTCCCTCCCAATCGAAATCCCCCAGGACACCAACCGCTCCCATCCTAATCCTATTCTTCCCCCCAGCTACTTTATAAAATTAGGGCTCCTAATTCTCACATTTGTCGCCATCTATTTCAAAAACTACTTACATCCAGCCCTATATCTGATCGTCTTCTGTTTCGTAATTTACTTCCTCCTCGAAATTCTCATCGGTGGCGCCGCCGCCTTCGTGAAGGCGACGCTCGGAGTCGAGTTATTGCCGTATTTCGACGAGCCTTATCTCTCCGTTTCGTTACAGGATTTTTGGGGGAAGCGATGGAATTTATTGACTTCTAGAATCCTCCGCCTCGCCGTTTACGATCCATGCCGGAAACTCACTGTTGGCATCGTGGGGAAAAAACCGTCGGCGATGGTGGCGCTGATGGCAACATTCGCAGTCTCCGGTTTGATGCACGAACTCATCTATTTCTACATGGGAAGATTGGCGCCAACGTGGGAGGTGACTTGCTTCTTTTTATTACATGGAGTTAGTCTTGCAGCGGAGATGGCGATGAAGTCAGCGGTGAGGGATAGGCTCAGGGTGCCGAGAATTATATCGACGGGGTTTACATGGTGGTTTGTGATGACGACAAGTTCTTGGCTTTTTTTACCGCAGTTTTTTAGGTTAAAACCGGATGTTAGAATGATGGAAGAACACGCAGCTTTGGGCGCGTTTGTGAAGAGCGTGACGGTACAGCTCATCACACCGTTTAAATTTTCTTTTTCTGATATCGTATGA

mRNA sequence

GTACTTTCTGTGCAATAGCTTCCTTCCCAGTCAAATTAAAACAAAACCCACTTCAAAAAACCTCTGAATTTGCCATTAATGGAGGATTACCTAATGGAGAATTACCTTCAAAATCCGATCACAATCGCCACCGCCAGTCCCCATTAAGTTACGCCGTCAAGATCTTCCTAGTGGCGGTGATGGTGAAAGCCTATAATTACACCCACGTCCTCCCTCAAAAACTCCACTGGCTCTTCCTCTGTTTCCACATCTACTTCCTCCTCGAGCTCAGCCTCGCCGCTGCCGCTTCCATCGTCGCCTGCGGCGGCCCTCTCGAACTTCTCCCTCTCTTCCACCAACCTTACTTCTCCACCTCCCTTCAAGACTTCTGGGGTCGGCGATGGAACCTCGTCGTCACTGGAATCCTCCGCCCCGCCGTCTTCCGCCCTGCAGCCTCTGCTGCCTCGAAACTTTTCGGTTCCAGGTGTGGCCCCCTCGCCGGAGTTACGGCGACGTTCCTTGTATCGGCCGTGATGCATGAGCTGATGTTCTTCTATATGTCTCGTCAATGGCCGCCGCCGACGTGGGAAGTGTCGGCGTTCTTCGTTTTCCACGGCGGATGTCTGGTGGCGGAGATGTTGGTGAAGAGACTATGGATTCAGACGTGGAGGATGGCTCCGCTGCCGTGGATAGTGTCGGTCCCGGTGACGGTGGGATTTTTCTTCTGGAGTTGCTTTTGGCTGTTCTTTCCGCCGTTTATTAACAGTTGCAAGGCTGACGTAAGGGTGGTTGAAGAGTACGCGCTGTTTGCCCTATATCTGATCGTCTTCTGTTTCGTAATTTACTTCCTCCTCGAAATTCTCATCGGTGGCGCCGCCGCCTTCGTGAAGGCGACGCTCGGAGTCGAGTTATTGCCGTATTTCGACGAGCCTTATCTCTCCGTTTCGTTACAGGATTTTTGGGGGAAGCGATGGAATTTATTGACTTCTAGAATCCTCCGCCTCGCCGTTTACGATCCATGCCGGAAACTCACTGTTGGCATCGTGGGGAAAAAACCGTCGGCGATGGTGGCGCTGATGGCAACATTCGCAGTCTCCGGTTTGATGCACGAACTCATCTATTTCTACATGGGAAGATTGGCGCCAACGTGGGAGGTGACTTGCTTCTTTTTATTACATGGAGTTAGTCTTGCAGCGGAGATGGCGATGAAGTCAGCGGTGAGGGATAGGCTCAGGGTGCCGAGAATTATATCGACGGGGTTTACATGGTGGTTTGTGATGACGACAAGTTCTTGGCTTTTTTTACCGCAGTTTTTTAGGTTAAAACCGGATGTTAGAATGATGGAAGAACACGCAGCTTTGGGCGCGTTTGTGAAGAGCGTGACGGTACAGCTCATCACACCGTTTAAATTTTCTTTTTCTGATATCGTATGA

Coding sequence (CDS)

GTACTTTCTGTGCAATAGCTTCCTTCCCAGTCAAATTAAAACAAAACCCACTTCAAAAAACCTCTGAATTTGCCATTAATGGAGGATTACCTAATGGAGAATTACCTTCAAAATCCGATCACAATCGCCACCGCCAGTCCCCATTAAGTTACGCCGTCAAGATCTTCCTAGTGGCGGTGATGGTGAAAGCCTATAATTACACCCACGTCCTCCCTCAAAAACTCCACTGGCTCTTCCTCTGTTTCCACATCTACTTCCTCCTCGAGCTCAGCCTCGCCGCTGCCGCTTCCATCGTCGCCTGCGGCGGCCCTCTCGAACTTCTCCCTCTCTTCCACCAACCTTACTTCTCCACCTCCCTTCAAGACTTCTGGGGTCGGCGATGGAACCTCGTCGTCACTGGAATCCTCCGCCCCGCCGTCTTCCGCCCTGCAGCCTCTGCTGCCTCGAAACTTTTCGGTTCCAGGTGTGGCCCCCTCGCCGGAGTTACGGCGACGTTCCTTGTATCGGCCGTGATGCATGAGCTGATGTTCTTCTATATGTCTCGTCAATGGCCGCCGCCGACGTGGGAAGTGTCGGCGTTCTTCGTTTTCCACGGCGGATGTCTGGTGGCGGAGATGTTGGTGAAGAGACTATGGATTCAGACGTGGAGGATGGCTCCGCTGCCGTGGATAGTGTCGGTCCCGGTGACGGTGGGATTTTTCTTCTGGAGTTGCTTTTGGCTGTTCTTTCCGCCGTTTATTAACAGTTGCAAGGCTGACGTAAGGGTGGTTGAAGAGTACGCGCTGTTTGCCCTATATCTGATCGTCTTCTGTTTCGTAATTTACTTCCTCCTCGAAATTCTCATCGGTGGCGCCGCCGCCTTCGTGAAGGCGACGCTCGGAGTCGAGTTATTGCCGTATTTCGACGAGCCTTATCTCTCCGTTTCGTTACAGGATTTTTGGGGGAAGCGATGGAATTTATTGACTTCTAGAATCCTCCGCCTCGCCGTTTACGATCCATGCCGGAAACTCACTGTTGGCATCGTGGGGAAAAAACCGTCGGCGATGGTGGCGCTGATGGCAACATTCGCAGTCTCCGGTTTGATGCACGAACTCATCTATTTCTACATGGGAAGATTGGCGCCAACGTGGGAGGTGACTTGCTTCTTTTTATTACATGGAGTTAGTCTTGCAGCGGAGATGGCGATGAAGTCAGCGGTGAGGGATAGGCTCAGGGTGCCGAGAATTATATCGACGGGGTTTACATGGTGGTTTGTGATGACGACAAGTTCTTGGCTTTTTTTACCGCAGTTTTTTAGGTTAAAACCGGATGTTAGAATGATGGAAGAACACGCAGCTTTGGGCGCGTTTGTGAAGAGCGTGACGGTACAGCTCATCACACCGTTTAAATTTTCTTTTTCTGATATCGTATGA

Protein sequence

VLSVQ*LPSQSN*NKTHFKKPLNLPLMEDYLMENYLQNPITIATASPH*VTPSRSS*WR*W*KPIITPTSSLKNSTGSSSVSTSTSSSSSASPLPLPSSPAAALSNFSLSSTNLTSPPPFKTSGVGDGTSSSLESSAPPSSALQPLLPRNFSVPGVAPSPELRRRSLYRP*CMS*CSSICLVNGRRRRGKCRRSSFSTADVWWRRCW*RDYGFRRGGWLRCRG*CRSR*RWDFSSGVAFGCSFRRLLTVARLT*GWLKSTRCLPYI*SSSVS*FTSSSKFSSVAPPPS*RRRSESSYCRISTSLISPFRYRIFGGSDGIY*LLESSASPFTIHAGNSLLASWGKNRRRWWR*WQHSQSPV*CTNSSISTWEDWRQRGR*LASFYYMELVLQRRWR*SQR*GIGSGCRELYRRGLHGGL**RQVLGFFYRSFLG*NRMLE*WKNTQLWARL*RA*RYSSSHRLNFLFLISYX

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Chy4G079470 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Chy4G079470 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Chy4G079470 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Chy4G079470 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 65..89
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 109..140

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy4G079470.1	Chy4G079470.1	mRNA