Chy4G076230 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy4G076230
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionZinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
LocationchrH04: 12466307 .. 12502007 (+)
RNA-Seq ExpressionChy4G076230
SyntenyChy4G076230
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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Homology
[Close]
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           I+ +V  +  S L+ ++ +       +    GI +            L+  L  K  LI 
Sbjct: 424 IKAIVLAVKSSPLQWEELMKCASECDLDKSKGISYDVSTRWNSTYLMLRDALYYKPALIR 483

Query: 123 *KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNF 182
            K   P     + P   +W     L   LK F+D+T  +SG+ Y+T N  +     +++ 
Sbjct: 484 LKTSDPRRYDAICPKAEEWKMALTLFKCLKKFFDLTELLSGTQYSTANLFYKGFCEIKDL 543

Query: 183 IR---LNASSANALLVEILGEQ*S*FTFVDFLV*EIFC--------LLFEY--------* 242
           I    ++       +   + E+   +  V  +   + C        +L E+         
Sbjct: 544 IDQWCVHEKFVIRRMAVAMSEKFEKYWKVSNIALAVACFLDPRYKKILIEFYMKKFHGDS 603

Query: 243 YRINM-KYVQQ*TSL**LS*YSKWELGC*Y*F*SK*KCW*RFCLAMIVEEFEGDATTTPL 302
           Y++++  +V+    L     YS            K K      +   + E E D     L
Sbjct: 604 YKVHVDDFVRVIRKL--YQFYSSCSPSA-----PKTKTTTNDSMDDTLMENEDDEFQNYL 663

Query: 303 EQ-------GSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLSRMAIDILAISVSTV 354
            +        S+E+D Y  E        F IL WW      + +L+++A D+LAI VSTV
Sbjct: 664 HELKDYDQVESNELDKYMSEPLLKHSGQFDILSWWRGRVAEYPILTQIARDVLAIQVSTV 723

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75HY5 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0583200 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 3.8e-11
Identity = 98/409 (23.96%), Postives = 159/409 (38.88%), Query Frame = 0 

Query: 2   TLTVDN-------ASLNDTNLLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCI 61
           T+T+DN        S N  N L      ++  G+ F V C AHILN +  D     ++ I
Sbjct: 343 TITLDNDPSSHDIYSANMINYLSNKKDNIMIKGQLFVVRCYAHILNTVAQDVIASVHSVI 402

Query: 62  DRIRYVVRFIS------------ALKLKK*LVRVICVLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSL 121
             IR  ++FI             AL+L+    + +C+ +  Q    +   L LL +L   
Sbjct: 403 YHIRESIKFIKASSVHEDKFAEIALQLEIPSAKTLCLDVTTQWNTTY---LMLLAALDYQ 462

Query: 122 LIN*KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMV 181
            +   ++     ++ +P   DW  V      L + YD    I  +   T N  FH    +
Sbjct: 463 QVFASLETCDGDYNEAPSTEDWKKVEAACSYLSLLYDSAHNIMAAPNPTSNIFFHEAWKL 522

Query: 182 QNFIRLNASSANALL---VEILGEQ*S*FTFVDFLV*EIFCLLFEY*YRINMKYVQQ*TS 241
           Q+ +    +  + +     +I+ E+   +     LV  I  ++     R  MK V+   S
Sbjct: 523 QSELSNAIAHEDPIFRSTAKIMHERFDKYWKDCNLVLAIAVVMDP---RFKMKLVEFSYS 582

Query: 242 L**LS*YSKW---------ELGC*Y*F*SK*KCW*RFCLAMIVEEFEGDATTTP------ 301
                  +K+         EL   Y    +                +  A  TP      
Sbjct: 583 KIHSVEAAKYVKVVDDAIHELYSEYATQGE--------ANRDAHVTDNSAAVTPPNGDEL 642

Query: 302 ------------LEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLSRMAIDILA 358
                        +   SE++ Y  E+      DF IL WW +++ +F  LS+MA D+LA
Sbjct: 643 LDFDIYLSEIATSQPSISELEQYLEEALMPRIQDFEILEWWKLNTIKFPTLSKMARDVLA 702

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P03010 (Putative AC9 transposase OS=Zea mays OX=4577 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 1.6e-09
Identity = 39/85 (45.88%), Postives = 52/85 (61.18%), Query Frame = 0 

Query: 269 SSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLSRMAIDILAISVSTVASKSTFSTGE 328
           S+E+D Y  E        F IL WW      + +L+++A D+LAI VSTVAS+S FS G 
Sbjct: 636 SNELDKYMSEPLLKHSGQFDILSWWRGRVAEYPILTQIARDVLAIQVSTVASESAFSAGG 695

Query: 329 CVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWL 354
            VVD     L S+IVEAL+CT+ W+
Sbjct: 696 RVVDPYRNRLGSEIVEALICTKDWV 720

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AVI0 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os03g0733400 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 3.0e-08
Identity = 45/101 (44.55%), Postives = 60/101 (59.41%), Query Frame = 0 

Query: 260 ATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLSRMAIDILAISVSTVA 319
           AT+ P +   SE++ Y  ES      +F IL WW +++ +F  LSRMA DILAI +S V+
Sbjct: 609 ATSQPTK---SELEQYLDESLTPRIQEFDILNWWKLNTLKFPTLSRMARDILAIPMSMVS 668

Query: 320 S-KSTFS--TGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDP 358
           S  S FS  TG  ++D    SL  +IVEALVC + WL   P
Sbjct: 669 SGNSIFSAGTGTRMLDDYRSSLRPEIVEALVCAKDWLQYLP 706

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9FJG3 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0239150 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 7.3e-07
Identity = 42/101 (41.58%), Postives = 59/101 (58.42%), Query Frame = 0 

Query: 260 ATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLSRMAIDILAISVSTVA 319
           AT+ P +   SE++ Y  ES      +F IL WW +++ ++  LS+MA DILAI +S V+
Sbjct: 609 ATSQPTK---SELEQYLDESLTPRIQEFDILNWWKLNTLKYPTLSKMARDILAIPMSMVS 668

Query: 320 S-KSTFS--TGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDP 358
           S  S FS  TG  ++D    S   +IVEALVC + WL   P
Sbjct: 669 SGNSIFSAGTGTRMLDDYRSSSRPEIVEALVCAKDWLQYLP 706

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CXI1 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G004160 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 369.8 bits (948), Expect = 1.4e-98
Identity = 242/448 (54.02%), Postives = 269/448 (60.04%), Query Frame = 0 

Query: 1   MTLTVDNASLNDT---NLLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCIDRI 60
           MTLTVDNAS NDT    LLKR NKGLLFGG+F HV CCAHILNLIVTDAFKEHN+CIDRI
Sbjct: 164 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 223

Query: 61  RYVVRFISA-----LKLKK--*LVRVIC----VLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSLLIN* 120
           RY VRFI +     LK KK   L ++ C     L  P         L+  +  +      
Sbjct: 224 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 283

Query: 121 KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNFI 180
           + +  SYRHDMSP K DWT  RML   LKVFYDVTLKISGSLYTT N VFH IT+VQN I
Sbjct: 284 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 343

Query: 181 RLNASSANALLVEILGEQ*S*F--------------------------TFVDFLV*EIF- 240
           RLNA SANALLV +     + F                           FV F +   F 
Sbjct: 344 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNFFG 403

Query: 241 --------------CLLFEY*YRINMKYVQQ-*TSL**LS*YSKWELGC*Y*F*SK*KCW 300
                         C    + Y       +Q  +S    S  +   L     F S     
Sbjct: 404 PEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVG 463

Query: 301 *RFCLAMIVEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLS 360
             F    IVEEFE D +TTP EQGSSEIDIY LE+N  TE DF IL WW M+SDRFEVL 
Sbjct: 464 EDFVYDTIVEEFEDD-STTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLG 523

Query: 361 RMAIDILAISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDPIDLQVQH 393
           +MA DILAI VSTVAS+S FSTG  VVDSS CSLA K VEAL+CTQ+WL+SDPI LQ QH
Sbjct: 524 QMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNSDPIHLQFQH 583

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DAN8 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold237G001750 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 368.6 bits (945), Expect = 3.2e-98
Identity = 243/448 (54.24%), Postives = 269/448 (60.04%), Query Frame = 0 

Query: 1   MTLTVDNASLNDT---NLLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCIDRI 60
           MTLTVDNAS NDT    LLKR NKGLLFGG+F HV CCAHILNLIVTDAFKEHN+CIDRI
Sbjct: 215 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 274

Query: 61  RYVVRFISA-----LKLKK--*LVRVIC----VLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSLLIN* 120
           RY VRFI +     LK KK   L ++ C     L  P         L+  +  +      
Sbjct: 275 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 334

Query: 121 KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNFI 180
           + +  SYRHDMSP K DWT  RML   LKVFYDVTLKISGSLYTT N VFH IT+VQN I
Sbjct: 335 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 394

Query: 181 RLNASSANALLVEILGEQ*S*F--------------------------TFVDFL------ 240
           RLNA SANALLV +     + F                           FV F       
Sbjct: 395 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKIFFG 454

Query: 241 ---------V*EIFCLLFEY*YRINMKYVQQ-*TSL**LS*YSKWELGC*Y*F*SK*KCW 300
                    V E  C    + Y       +Q  +S    S  +   L     F S     
Sbjct: 455 PEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVG 514

Query: 301 *RFCLAMIVEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLS 360
             F    IVEEFE D +TTP EQGSSEIDIY LE+N  TE DF IL WW M+SDRFEVL 
Sbjct: 515 EDFVYDTIVEEFEDD-STTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLG 574

Query: 361 RMAIDILAISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDPIDLQVQH 393
           +MA DILAI VSTVAS+S FSTG  VVDSS CSLA K VEAL+CTQ+WL+SDPI LQ QH
Sbjct: 575 QMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNSDPIHLQFQH 634

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DIL8 (Putative transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold605G00350 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 368.6 bits (945), Expect = 3.2e-98
Identity = 243/448 (54.24%), Postives = 269/448 (60.04%), Query Frame = 0 

Query: 1   MTLTVDNASLNDT---NLLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCIDRI 60
           MTLTVDNAS NDT    LLKR NKGLLFGG+F HV CCAHILNLIVTDAFKEHN+CIDRI
Sbjct: 97  MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 156

Query: 61  RYVVRFISA-----LKLKK--*LVRVIC----VLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSLLIN* 120
           RY VRFI +     LK KK   L ++ C     L  P         L+  +  +      
Sbjct: 157 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 216

Query: 121 KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNFI 180
           + +  SYRHDMSP K DWT  RML   LKVFYDVTLKISGSLYTT N VFH IT+VQN I
Sbjct: 217 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 276

Query: 181 RLNASSANALLVEILGEQ*S*F--------------------------TFVDFL------ 240
           RLNA SANALLV +     + F                           FV F       
Sbjct: 277 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKIFFG 336

Query: 241 ---------V*EIFCLLFEY*YRINMKYVQQ-*TSL**LS*YSKWELGC*Y*F*SK*KCW 300
                    V E  C    + Y       +Q  +S    S  +   L     F S     
Sbjct: 337 PEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVG 396

Query: 301 *RFCLAMIVEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLS 360
             F    IVEEFE D +TTP EQGSSEIDIY LE+N  TE DF IL WW M+SDRFEVL 
Sbjct: 397 EDFVYDTIVEEFEDD-STTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLG 456

Query: 361 RMAIDILAISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDPIDLQVQH 393
           +MA DILAI VSTVAS+S FSTG  VVDSS CSLA K VEAL+CTQ+WL+SDPI LQ QH
Sbjct: 457 QMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNSDPIHLQFQH 516

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BX83 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold863G001050 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 368.2 bits (944), Expect = 4.2e-98
Identity = 241/448 (53.79%), Postives = 268/448 (59.82%), Query Frame = 0 

Query: 1   MTLTVDNASLNDT---NLLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCIDRI 60
           MTLTVDNAS NDT    LLKR NKGLLFGG+F HV CCAHILNLIVTDAFKEHN+CIDRI
Sbjct: 280 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 339

Query: 61  RYVVRFISA-----LKLKK--*LVRVIC----VLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSLLIN* 120
           RY VRFI +     LK KK   L ++ C     L  P         L+  +  +      
Sbjct: 340 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 399

Query: 121 KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNFI 180
           + +  SYRHDMSP K DWT  RML   LKVFYDVTLKISGSLYTT N VFH IT+VQN I
Sbjct: 400 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 459

Query: 181 RLNASSANALLVEILGEQ*S*F--------------------------TFVDFLV*EIF- 240
           RLNA SANALLV +     + F                           FV F +   F 
Sbjct: 460 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNFFG 519

Query: 241 --------------CLLFEY*YRINMKYVQQ-*TSL**LS*YSKWELGC*Y*F*SK*KCW 300
                         C    + Y       +Q  +S    S  +   L     F S     
Sbjct: 520 PEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVG 579

Query: 301 *RFCLAMIVEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLS 360
             F    IVEEFE D +TTP EQGSSEIDIY LE+N  TE DF IL WW M+SDRFEVL 
Sbjct: 580 EDFVYDTIVEEFEDD-STTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLG 639

Query: 361 RMAIDILAISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDPIDLQVQH 393
           +MA DILAI VSTV S+S FSTG  VVDSS CSLA K VEAL+CTQ+WL+SDPI LQ QH
Sbjct: 640 QMARDILAIPVSTVVSESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNSDPIHLQFQH 699

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CR68 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold84G001050 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 367.9 bits (943), Expect = 5.5e-98
Identity = 243/448 (54.24%), Postives = 268/448 (59.82%), Query Frame = 0 

Query: 1   MTLTVDNASLNDT---NLLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCIDRI 60
           MTLTVDNAS NDT    LLKR NKGLLFGG+F HV CCAHILNLIVTDAFKEHN+CIDRI
Sbjct: 280 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 339

Query: 61  RYVVRFISA-----LKLKK--*LVRVIC----VLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSLLIN* 120
           RY VRFI +     LK KK   L ++ C     L  P         L+  +  +      
Sbjct: 340 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 399

Query: 121 KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNFI 180
           + +  SYRHDMSP K DWT  RML   LKVFYDVTLKISGSLYTT N VFH IT+VQN I
Sbjct: 400 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 459

Query: 181 RLNASSANALLVEILGEQ*S*F--------------------------TFVDFL------ 240
           RLNA SANALLV +     + F                           FV F       
Sbjct: 460 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKIFFG 519

Query: 241 ---------V*EIFCLLFEY*YRINMKYVQQ-*TSL**LS*YSKWELGC*Y*F*SK*KCW 300
                    V E  C    + Y       +Q  +S    S  +   L     F S     
Sbjct: 520 PEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVG 579

Query: 301 *RFCLAMIVEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLS 360
             F    IVEEFE D +TTP EQGSSEIDIY LE+N  TE DF IL WW M+SDRFEVL 
Sbjct: 580 EDFVYDTIVEEFEDD-STTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLG 639

Query: 361 RMAIDILAISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDPIDLQVQH 393
            MA DILAI VSTVAS+S FSTG  VVDSS CSLA K VEAL+CTQ+WL+SDPI LQ QH
Sbjct: 640 HMARDILAILVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNSDPIHLQFQH 699

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. NCBI nr
Match: TYK23433.1 (putative transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 370 bits (950), Expect = 2.00e-120
Identity = 242/448 (54.02%), Postives = 269/448 (60.04%), Query Frame = 0 

Query: 1   MTLTVDNASLNDTN---LLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCIDRI 60
           MTLTVDNAS NDT    LLKR NKGLLFGG+F HV CCAHILNLIVTDAFKEHN+CIDRI
Sbjct: 97  MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 156

Query: 61  RYVVRFISA-----LKLKK*--LVRVIC----VLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSLLIN* 120
           RY VRFI +     LK KK   L ++ C     L  P         L+  +  +      
Sbjct: 157 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 216

Query: 121 KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNFI 180
           + +  SYRHDMSP K DWT  RML   LKVFYDVTLKISGSLYTT N VFH IT+VQN I
Sbjct: 217 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 276

Query: 181 RLNASSANALLVEILGEQ*S*FT--------------------------FVDFLV*EIF- 240
           RLNA SANALLV +     + F                           FV F +   F 
Sbjct: 277 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKIFFG 336

Query: 241 --------------CLLFEY*YRINMKYVQQ*-TSL**LS*YSKWELGC*Y*F*SK*KCW 300
                         C    + Y       +Q  +S    S  +   L     F S     
Sbjct: 337 PEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVG 396

Query: 301 *RFCLAMIVEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLS 360
             F    IVEEFE D+TT P EQGSSEIDIY LE+N  TE DF IL WW M+SDRFEVL 
Sbjct: 397 EDFVYDTIVEEFEDDSTT-PFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLG 456

Query: 361 RMAIDILAISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDPIDLQVQH 392
           +MA DILAI VSTVAS+S FSTG  VVDSS CSLA K VEAL+CTQ+WL+SDPI LQ QH
Sbjct: 457 QMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNSDPIHLQFQH 516

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. NCBI nr
Match: TYK16593.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 371 bits (953), Expect = 5.04e-120
Identity = 242/448 (54.02%), Postives = 269/448 (60.04%), Query Frame = 0 

Query: 1   MTLTVDNASLNDTN---LLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCIDRI 60
           MTLTVDNAS NDT    LLKR NKGLLFGG+F HV CCAHILNLIVTDAFKEHN+CIDRI
Sbjct: 164 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 223

Query: 61  RYVVRFISA-----LKLKK*--LVRVIC----VLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSLLIN* 120
           RY VRFI +     LK KK   L ++ C     L  P         L+  +  +      
Sbjct: 224 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 283

Query: 121 KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNFI 180
           + +  SYRHDMSP K DWT  RML   LKVFYDVTLKISGSLYTT N VFH IT+VQN I
Sbjct: 284 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 343

Query: 181 RLNASSANALLVEILGEQ*S*FT--------------------------FVDFLV*EIF- 240
           RLNA SANALLV +     + F                           FV F +   F 
Sbjct: 344 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNFFG 403

Query: 241 --------------CLLFEY*YRINMKYVQQ*-TSL**LS*YSKWELGC*Y*F*SK*KCW 300
                         C    + Y       +Q  +S    S  +   L     F S     
Sbjct: 404 PEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVG 463

Query: 301 *RFCLAMIVEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLS 360
             F    IVEEFE D+TT P EQGSSEIDIY LE+N  TE DF IL WW M+SDRFEVL 
Sbjct: 464 EDFVYDTIVEEFEDDSTT-PFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLG 523

Query: 361 RMAIDILAISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDPIDLQVQH 392
           +MA DILAI VSTVAS+S FSTG  VVDSS CSLA K VEAL+CTQ+WL+SDPI LQ QH
Sbjct: 524 QMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNSDPIHLQFQH 583

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. NCBI nr
Match: TYK28895.1 (putative transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 366 bits (940), Expect = 3.11e-119
Identity = 240/448 (53.57%), Postives = 267/448 (59.60%), Query Frame = 0 

Query: 1   MTLTVDNASLNDTN---LLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCIDRI 60
           MTLTVDNAS NDT    LLKR NKGLLFGG+F HV CCAHILNLIVTDAFKEHN+CIDRI
Sbjct: 73  MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 132

Query: 61  RYVVRFISA-----LKLKK*--LVRVIC----VLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSLLIN* 120
           RY VRFI +     LK KK   L ++ C     L  P         L+  +  +      
Sbjct: 133 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 192

Query: 121 KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNFI 180
           + +  SYRHDMSP K DWT  RML   LKVFYDVTLKISGSLYTT N VFH IT+VQN I
Sbjct: 193 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 252

Query: 181 RLNASSANALLVEILGEQ*S*FT--------------------------FVDFLV*EIF- 240
           RLNA SANALLV +     + F                           FV F +   F 
Sbjct: 253 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNFFG 312

Query: 241 --------------CLLFEY*YRINMKYVQQ*-TSL**LS*YSKWELGC*Y*F*SK*KCW 300
                         C    + Y       +Q  +S    S  +   L     F S     
Sbjct: 313 PEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVG 372

Query: 301 *RFCLAMIVEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLS 360
             F    IVEEFE D+ T P EQGSSEIDIY LE+N  TE DF IL WW M+SDRFEVL 
Sbjct: 373 EDFVYDTIVEEFEDDSIT-PFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLG 432

Query: 361 RMAIDILAISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDPIDLQVQH 392
           +MA DILAI VSTVAS+S FSTG  VVDSS CSLA K VEAL+CTQ+WL+SDPI LQ QH
Sbjct: 433 QMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNSDPIHLQFQH 492

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. NCBI nr
Match: KAA0036689.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK03663.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 367 bits (943), Expect = 4.89e-119
Identity = 230/407 (56.51%), Postives = 258/407 (63.39%), Query Frame = 0 

Query: 1   MTLTVDNASLNDT---NLLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCIDRI 60
           MTLTVDNAS NDT    LLKR NKGLLFGGKF HV CCAHILNLIVTDAFKEHN+CIDRI
Sbjct: 164 MTLTVDNASSNDTVVAYLLKRFNKGLLFGGKFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 223

Query: 61  RYVVRFISAL----------KLKK*LVRVICVLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSLLIN*K 120
           RY VRFI++L          +LKK   +    L  P         L+  +  +      +
Sbjct: 224 RYAVRFITSLARFLKFKKCIELKKIACKSYVCLDVPTRWNSTCMMLEAAVKFEKAFDRLE 283

Query: 121 MKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNFIR 180
            +  SYRHDMSP + DWT  RML   LKVFYDVTLKISGSLYTT N VFH IT+VQN IR
Sbjct: 284 DEDASYRHDMSPNREDWTNARMLIQFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCIR 343

Query: 181 LNASSANALLVEILGEQ*S*FT--FVDFLV*EIFCLLFEY*YRINMKYVQQ*TSL**LS* 240
           LNA SANALLV +       F   + +     +   LF           Q  +S    S 
Sbjct: 344 LNAGSANALLVGMANNMKPKFEKYWGNNEKNNLLLRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTST 403

Query: 241 YSKWELGC*Y*F*SK*KCW*RFCLAMIVEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEV 300
            +   L     F S       F    IV EFE D+TT P EQGSS+IDIY LE+N  T+ 
Sbjct: 404 QTVSGLDTNIDFDSNENVGEDFVYDTIVGEFEDDSTT-PFEQGSSKIDIYLLEANVRTKG 463

Query: 301 DFVIL*WWNMSSDRFEVLSRMAIDILAISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEA 360
           DF IL WW M+SDRFEVL  MA DILAI V TVAS+S FSTG  VVDSS CSLA   VEA
Sbjct: 464 DFDILQWWKMNSDRFEVLGHMARDILAIPVYTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPNTVEA 523

Query: 361 LVCTQSWLDSDPIDLQVQHELEEASKFEEGFRVVMDNENELEDLQDF 392
           L+CTQ+WL+SDPI LQ QHELEEASKFEEGF VVM+NE ELEDL DF
Sbjct: 524 LICTQNWLNSDPIHLQFQHELEEASKFEEGFWVVMENEKELEDLPDF 569

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. NCBI nr
Match: TYK20578.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 370 bits (950), Expect = 5.93e-119
Identity = 242/448 (54.02%), Postives = 269/448 (60.04%), Query Frame = 0 

Query: 1   MTLTVDNASLNDTN---LLKRSNKGLLFGGKFFHVHCCAHILNLIVTDAFKEHNNCIDRI 60
           MTLTVDNAS NDT    LLKR NKGLLFGG+F HV CCAHILNLIVTDAFKEHN+CIDRI
Sbjct: 215 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 274

Query: 61  RYVVRFISA-----LKLKK*--LVRVIC----VLMFPQDGIPHI*CLKLLLSLKSLLIN* 120
           RY VRFI +     LK KK   L ++ C     L  P         L+  +  +      
Sbjct: 275 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 334

Query: 121 KMKMPSYRHDMSPYK*DWTTVRMLTWVLKVFYDVTLKISGSLYTTLN*VFHHITMVQNFI 180
           + +  SYRHDMSP K DWT  RML   LKVFYDVTLKISGSLYTT N VFH IT+VQN I
Sbjct: 335 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 394

Query: 181 RLNASSANALLVEILGEQ*S*FT--------------------------FVDFLV*EIF- 240
           RLNA SANALLV +     + F                           FV F +   F 
Sbjct: 395 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKIFFG 454

Query: 241 --------------CLLFEY*YRINMKYVQQ*-TSL**LS*YSKWELGC*Y*F*SK*KCW 300
                         C    + Y       +Q  +S    S  +   L     F S     
Sbjct: 455 PEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVG 514

Query: 301 *RFCLAMIVEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLS 360
             F    IVEEFE D+TT P EQGSSEIDIY LE+N  TE DF IL WW M+SDRFEVL 
Sbjct: 515 EDFVYDTIVEEFEDDSTT-PFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLG 574

Query: 361 RMAIDILAISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWLDSDPIDLQVQH 392
           +MA DILAI VSTVAS+S FSTG  VVDSS CSLA K VEAL+CTQ+WL+SDPI LQ QH
Sbjct: 575 QMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNSDPIHLQFQH 634

[Close]
BLAST of Chy4G076230 vs. TAIR 10
Match: AT3G42170.1 (BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain )

HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 9.8e-07
Identity = 33/101 (32.67%), Postives = 50/101 (49.50%), Query Frame = 0 

Query: 253 VEEFEGDATTTPLEQGSSEIDIY*LESNGVTEVDFVIL*WWNMSSDRFEVLSRMAIDILA 312
           + +F+     T  +   SE+D Y  E+      +F +L WW  +  ++  LS+MA DIL+
Sbjct: 574 LSDFDTYIMETTGQNLKSELDQYLDETLLPRVQEFDVLDWWKQNKLKYPTLSKMARDILS 633

Query: 313 ISVSTVASKSTFSTGECVVDSSCCSLASKIVEALVCTQSWL 354
           I VS  A    F      +D    SL  + VEAL+C + WL
Sbjct: 634 IPVSAAAFDYVFDMEPREMDEYKTSLRPETVEALICAREWL 674

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
P087703.5e-1726.08Putative AC transposase OS=Zea mays OX=4577 PE=2 SV=2[more]
Q75HY53.8e-1123.96Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3 OS=Oryza sativa subsp. j... [more]
P030101.6e-0945.88Putative AC9 transposase OS=Zea mays OX=4577 PE=4 SV=1[more]
Q6AVI03.0e-0844.55Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 OS=Oryza sativa subsp. j... [more]
B9FJG37.3e-0741.58Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 1 OS=Oryza sativa subsp. j... [more]
BLAST of Chy4G076230 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3CXI11.4e-9854.02Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var... [more]
A0A5D3DAN83.2e-9854.24Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var... [more]
A0A5D3DIL83.2e-9854.24Putative transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold605... [more]
A0A5D3BX834.2e-9853.79Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var... [more]
A0A5D3CR685.5e-9854.24Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var... [more]
BLAST of Chy4G076230 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
TYK23433.12.00e-12054.02putative transposase [Cucumis melo var. makuwa][more]
TYK16593.15.04e-12054.02zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. ... [more]
TYK28895.13.11e-11953.57putative transposase [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0036689.14.89e-11956.51zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. ... [more]
TYK20578.15.93e-11954.02zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. ... [more]
BLAST of Chy4G076230 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT3G42170.19.8e-0732.67BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR008906HAT, C-terminal dimerisation domainPFAMPF05699Dimer_Tnp_hATcoord: 254..333
e-value: 1.3E-16
score: 60.2
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR23272BED FINGER-RELATEDcoord: 17..333
IPR012337Ribonuclease H-like superfamilySUPERFAMILY53098Ribonuclease H-likecoord: 3..336

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy4G076230.1Chy4G076230.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0046983 protein dimerization activity