Chy4G075540 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy4G075540
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH04: 10932489 .. 10946840 (-)
RNA-Seq ExpressionChy4G075540
SyntenyChy4G075540
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GTAAGATCTTTTTTTTTTTTTTCACGTTTTAAAAATGTCAAATGTTATTAAATATAGGAGAATTTTTGAAAATAGTAGATTTTACAAAATATTTACAACCTATAGCAAATTCTATTACTGATAGTCATTTATATGTTATAATGATAGAAGACTATCAGTGATAGAATCCAAAAAGTTTTTATAGCTTGTAAATATTTTGTAAAATCTACTATTTTTAAAAATGCCCCATATATATAGAAAAAAAATATTCTTCTAATACTATTTATTCAAAAGCCCTAGAGCCCCTTTGGAAAACACACGTGAGTTCCCTCTCCAGCCGAAATCCTTCTACTTCGAAAACATTGTGTTTGATGTAACTCGCATTAGAAGTTTGGGAGAGAAGAAGGTGGTGATGTACAATGAAGACAGAGTACCTATTGGTGAGAATGGAGCGAAGTTGAAGTCTTTCATAGAATCTGCAACACATTATCATGTCCCTATCACATATACATCTTGGAAAAGTGTGCCTGCAGAACTGAAAGATAAGATATTTAGTACGGTTGAGGTATATATAATTTCAATGTGTTTATATTGACAATGTTCCTGATGTACGTACACTTTATTAATTACTTTTAAATATTTAGGCCACATTTGTCATTGATCTAAGATCTAGGAAAAACGTTCTCCAAACTGCAGGCATTTCATTTCGTCAGTTTAAGAGCGGGCTAACAACGAAATACATTATGCCACATAAGGATGAACTGCAACTCCTACAAGTTCTACCAGAAAAGTATTTATTTATTGATCAAAATCACTGGGAAGAATTTGTAAGGTCAAGATTATGTGAAACTTTTCAGGTATGAACAATGTTTATTGATCAAAATCATTAGGAACAATATTTGTTACTTCCTCACTAAAAAATACATTTGAAAATAGGAAACAAGACAATTGCAACAAGATCGATGATCTAAGAACAAGTACAACTATCAAATTTCGAGGAAAGGTTATGCTAATCTTATTGAGGAAATGGTAAGAATTAATTTATGCTCTCACAATTATTAAGTTTATCAAACTTTATTAAATGTTATACCAATCTTATTATGGAATTGGAATGTAGAAAAAGGAAGGTTCAAATGAAGCTAATTTCGATCGAGCCAACATGTGGAAGAAAGCTCGAGTTAACAAACAAGAGGAGTATGATAACGATGATGTTCAACAAGTTGTCCATAAAATAGTAAGACTTTTTGTAGATTACACATTTGAATTAACCATACATAAGCATTTCTATAACTTAGATTGGTTTTGTTACCGTTTTAGGATGAGATCTCAATGAATACATATTCATCGTTCTAGAAAGGACACTTTTCTAATGATGTCTTAACCCAAGCATTGGGTACAAAAGAGCATCTGGTCGTGTCCGTGGGGTCGGTGGGTATGTTACTCCTACAACTTACTTTCATTTAGTAAAAAATTCATCAAAATGTGAGGAGGATATTATACTTGAGATTAAAGAACTTTGAAGGCGTGCTAGCGAATTAGAAGCACATATTCACTTAAATTTGTCTACATCATTATATGGACAAGGGAGCTGTTCGAAGCCAAATTTCTTAGAGGGGATTGAGTCGAAAAAAATATCAAAGAGAAGAGTAAGTTGATGGACAAAAATAAGAGGACATATGTGGAATCAATGGACAAACCGAAAGAGAATAAATCTAAAGAAAAGGAGGTGGAGGAGATCAATATAAATAACAACGAAGTAGAATTGGACATCTTTAAGGTATGTGATCCACTAATAAACTCAAATTATGTGTAATATTTATATCTAACTGAATGTGGATGTTGTTCTTGAATTAGGAGAGAGCCGTAATAAAAATGCCTAAGAAAATAGAAGTTGTTTGTGAGTCGACGTCGATTTTGCCAATAGCTTTGAAGTCTATTCTTATATACGCTGAGAAGATAATGGAGAAAGATTCTAGCATCACTATTCCACTAATTGTTGACATTTTTGGTATCAGTCGAAATAGTTCTGTGCTCCAAGAGGACATCATTGACCTTTGTAACATAAAAGAAGTCAAAACGTTTACATTGGAGGCCTATATGACGTAAGTCAATTTCATTTGTTTGCATCTAAATTTTTGTATCTCATTTACGAGTTTATAATATTTTGTAGGTACTTGTATTCATATGTTTTTGGTTCAAGGAAAATGTGCAGTACATCTTTGTAGATCTGTCCCTCACTTCTTCTAGACATAACTCACAAGAATCTCGAGTTCGAAACTTGTGCAGTAGATTGATGATCTCAGAAGCTAACCAAATAGTTCTTGCTCCTTTTAATCTTGGGTAAGTTAAGTTATTTTATTAGTTGCATTGCAAAAAACTAGTACTTATATTTTTGTATAATTATAGGTTATTGGGCACTGCTTGCCATAAATGCATACAACGATACAATATTCTACCTTGACTCACTAAGGACAACATCAAAATCAACTACAAGATATGTGACCGACACGTAAGTTAATCTTCTATATCATTTAGTATTGATTCTAATGCGTGTACAATATTTAAAATGTGTGTAATCTTATCTTGGCAAAACAGAGCAAGAGCGATGTTTCAGTCACAAAAGAACATTAAAAAAAGCCGGAAACAAACTTTATGGCGAACAATAAAGGCAAGTATAAACATTTAAAGTCATTGTATTTTGTAGACTACTAGCAATTAGGATTACTTCGTTATTCTAATTTGTTGTTTTTATATAGTGTCCTCTACAAGTCGAGAGCACCGAATGTGGATACTATGTCATGAGGTTTATAAGAGAAATTGTGACTAAGGGAAGTATTGTTGTATCAGATGTGGTATATGTTATATATCAAACTATTTCTTTTGTGACTTAATTGGTTTGTTTGGATTGTGAGTTAATTCATTTAATTTATTTTGCATGTTTATAGATTGATACACGAAGATCATACTCACAAGCTGAGTTAGATGAGGTGTGGGTTGAGTTAGCTGACTTTTTGGGTTCGTATATATGATTGTGACTAATTTGTGATTCTGAAGTAGGAAATTTTTTGTTGTGGCTGCTTATCTGAAACTTTATGTATAAATAATATAGGTGATTCTTTTGAATTGTTCATATGGAAGGGGGGTATACTTTTGATTAGATTTATTATAGCTAAATAGTTTTTCGATAAGTTAGTTAATTAGGATGTTGAGTTGAATTCATGAGAATCTAATGGAATTATTTATATTGTTTTTGTAAATGTTATGGAATATTTATATATGTGTAAAGTTTTGGAAATGATTATACATATATGGTGAAAGGTTTTATTTATATATGTTCGAGTTTTGAAACTATATTTGATGAATACCATTGGTCATATATATTTATGAAACTATTGCTGGACAACTATACAAGACTATGGGAGGACAATACAGAAACAAAAATATAATTGAATTACAATTTTTTAAAAAAAATTGAAACATGCTTGACGTTTTTTAAATGTCATAAAAAAGTATATTCTTGACGGTTTTAAAATGTCATAAACAAGTGCATTCTTGACGGTTTTAAAATGTCATAAATAAGTGCATTCTTGACGGTTTTTCAATATCATAAACAATGAATTTCTTGACGGTTATTAAATGTCATGAACACTCATACTCTTGATGTCATAAACACTCATATTCTTGATAGTTTTTAAATGTCATGAACATTCTTACTCTTGACAGTTTTGAACTGTCATGAACATTCATATTATTTGACGATTTTTAACTGTCATAAAATTTGTATATTTGACGTTTATAAAACCTCAACGTTCACTATTCTTGACGTTTTTTTCAACCGTCAAGAACTTTCGCTTTCTTGATGCTGGCTTCAATGACGGTTTTAAAATCGTCAAGAATAATGATTCTTGACAGTTTAAAAATGTCAAGAGAGCCTGTTTTTGTAGTAGTAATTATACAAACATTTTATTTATCTAATAAAGTAAAGTATTTATTTTATTTGACATTTATTTGCATTAACTCACAAAACCAATAAACTAACATCCAAGGTTATCTTTTGTAACCTAAACATGTATGTGGAGGCATACAAGTGGATCATGTTTAAGTGATAACCTAAATCGACTGTAGTAGATGGATAAGGCTGGATACCTTATCCTGGTGACACTATGAATACGACTTGCTTTATAGTGGTTACAATTGTTCTAAAGTGCTACAAATGATTTGATCCTAATCATTCATGTCAAGACATTAGAGCAGGGGTATTCTATACAAAGATTTTGTATAAGATCAGACCATGAAATGAATAGTCTCTCTTATTAACACAGTTACTAGTTGAGACTACATTTCACCAGGATGACCATAGGTGACTTGACCTAAATGCTGAGTGAGTTGTGAACTTCTGCCTATGAAGGCAGTTCCTTGATTTGCATAGGTGAGGGCATATGTCACCGACTCAATAGGCCTACCATTTCAGGGATTCGTCTGATTAGGGAGCTGAAAACATAACCACATAAGAAGGAATTCACTCCTCTATAGATAGAATAAGTAGAGATAGAAGTTTAAAGGAAGACTTTAATAATTTGAAACTTCAAATCAAGTGGAACTTGATATCTAAGCTTCATTTATTCAGGGGGAGCCTGAAGTTATATAAGGATAAGTGGTTCAAAGAAGACGTTGATACGAGTTTAAGGGGAGCATGCAAACATTCTTCATTAGATTCAAACTACAAATTCAGGGAAAGCCTGATTATTTTAGTAAATAAAATTACAAAAAGAGTACCACTCTAAGAGAGTGTCTTCTAGATTATTAAAGTGTAATACTCATTCGAATTATCATCAATTTGAAAAAAAAGTATAATCGTTGTAAGTTTCTTTCCATTTAATATATGTATAATGATATGATAAGAAAATTATTTAGAAGCATATTATTAGTAGATCTATAGTTTCATTTTGATATTAAAATTATGTTATATGCATATTACTACATTATTTAGGGTTTTACATGTTGGTATTGGATCTATGATT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TAATCCATATTCATTAACTATCAGTCATTCCACTAAAGACCAATAGTTGCACTCTTCTTACTGTAGATATATTTTTGTGTCCATTAGATATAACTAGGCCAAAAATCACGATTTTGTCCCTGTAGTTACATCTAACTCCTTAAGTACCACCAATTCTTTTAATGAACAATAATTATAGTCTCACTATAACTGAACTCCTCTTGGACCAAGAGAGGGTGTGGCGTCACATTGTTCAAGCCCTGGAATTAGCCCTTAAGAGAGCAATTTCTCACTACAAGAAAAACCCTCTACTACGACAGTTATTTATATCACAAAATGGAGAGAGAAAAAAAAGCTGGCACAAAAGGGAAAAAAAAGCGTTTTTGGCGGGAAAATGTGGAATTTTCGGATAATACTTTTTGCGACAATTATTTGATGTCATAGAATAGAAATAAAATAATAATAAAATAATAAATTTAATATATGAAAAAAAATTAATTTTTAATTCGGATTAAATTATTCACGCCTGTCTCTTCACTCCACCGCCATTCCATTCGCGCCCGTTTCTTCACTCCACCGCCCCGTTTTGCCCCCATCTCCGAACTCTTTGAAGGTCCTCTCCGAATGAGGACTAGTTTCGTCACCTCCACTGTCCCCTCGTGCCTGTCTCCTCACTCCAACGTCGTCGGAACCTCCTCTACTGGACGACGAAACGTTCTCTGCCCTATTCCTTTCAATCTGGCCTTGCCCGTAATCTTCAATCCGCCGCATTCTCTTCAACATTCAATCCGCAGCCGTCACCTCCTCTACCGGTAAGTCGTCTGTTCCTTTTTTATTTCTCTCTCTCTTTGTGAACTTGTTCTCTGTCACTCTTTCCCTCAACTCCATGGGTCGTCTGTAAGGTGTGCAATTTTTAATTTTGGAATTCCATATTTTGGGCAAACAATATTTAAGACTTGAAGCTGAAAGAGAGCACTATTTGCGAATGAGAACGAGTGAAATGGGTTTTCTCAGGTTTTTCTTGTCCGGTTCTTGCCTATTATGATAATGGGTGAAATGAGTTTTTCTTATTTGTTTGTTTTCTTTATGATTTTGTTATAGCTGTGGATTTCATTTTCTGGGTTGCTTATGAAGTTGTGTAATTTTTTGTTTTGTAATTTTTACAATTTAGTTGGTTTAATTAATCTGAGATGGGGGTAGGGTAAGGGTAACGTTTATTATGCAATGTTATTGGGAATAAACTTTATATATATATATATATATATATATATATAATGATAAAAGCCATTATTCTATAGATCAAATGAAAAAGTACAATATTTGAAGCCAGAACAGAAAACAGAGGCAAAGCTATCTACCAAAAAGGGGTCTTACAGTTGAGAATGAGAAACAAAGATTTTTTTTTTCAATATGTTAAATGAGGAGGTGGATTTTTTTTTTCTACTTTTCTTCCAATTCTCAACTTGATGAACTTCGAGGAGTGTGAGGAATTTTGGGTGGATTAAAAACCTGAACAATATCGCTCAAGTAGTTGGTATTGAAATTTAGGGGATCATTGGAGTTACGAAGTATTGTTTAGGATACTTTTAAGACTAAGTTGAAAACCAACTGTTAAGACTTAGATTGATGTTGATTATGATACTTTCTTGGTAGAGTAGTTGATGGAAATATTGTGAAGTCTAATATGTTTCATGTCATATAGTACCCTACTGAGTAGTGACCCCCTCTCTTGTTCTGAGAATTTTAGTATTGAGTTGTGAACCCCTCTCTTAAAACACGCTAAATTCAGTGACCCCCTCTCTTAAAACATGCTAATTTCAATGTTGAAGTTTCTGCAAAGACTAATAAATTAAAAGCGCGAACTATTGTCATGTAGGCATGCTTTCATAGGCATGCTATGGGCATTGGTTCTCAACTCTCAAGGCTGAAGCCCATAGCGGAGAGAAAATGGGGGGAGCGCGGGGCAGTAGTGTATTAGTTAGATAGAAAATGGGGGCATTGGCTCTCAACTCTCAACTTTCAACTCTCACGCTTGGTTTTTTTTTTTTCTGTGAGTTGATTAGCTATTTTGGAAATATACTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGCTGGTTTTTCTTACCACAATCGTTTCAAATTCAGCTATCTATATAGTACTATTTTGTTTTTTTGATATCATTAATTGGGATAGAAAATTTCTGAATGCTATCAAATAAATTATTGCTGGACAACAATACTTTTCAACATGCTGTACATTTGATTGGCATTTGAGCTTTTTAAGGGTGGTATATTTGAGTATTTTGAGGATTATGTACGGTTTTGAAAGTTTGAGTTTTAAAAGTTGTTGTCCAATATCTCTTTTGTAATCAGGTTTATTTAGAGGCCAATTTAGAAGATTGAATTTTTATACATCTACACAATGGACAAGTCATGGATGACGGAAAATAGGATGTCAAGAGAATATGATTTAGGAGTCGAAAGGTTCATTCAATTTGGTTTGAGTCATGTCAAAGGTTCTAATTCAATTAGATGTCCATGTTTGAATTGCGGCAATCGTTTACTTAAGGATGTCTCAACAGTTCGGTATCATTTGTATGCCAATGGAATTGACAAAAGTTACAAGGTATGGTTTTGGCATGGTGAAGATTTGAACTCAGATAACGTTTCCAACATGATGGAAAATACGGTGGATGAAAATGATGAAAACACTGATTTATTTAATACAGTTAATATGGTTCAATCCGTCAAGAACAATCTTGTAATGCATCCAATACCTTTGATACTATGTTTGATGACGCGAAGAAACACTTATACCCAGGATGTAAGAAATTCATAAAGTTGTCAGCCCCCGTGAGATTGTATAACCTGAAGGTTAGGTATGGTTGAAGTAACACTAGCTTCTCTGAATTATTGTCCATATTAAGTGATCTATTACTTGAAAACAACAAAATTCCATGTTCCTTATACGAAGCGAAGAAAACACTAGGTGCCTTAGGACAAGTTACCAAAAAATTGATGCATGTCCTAATGATTGTTGTTTGTACATAAAAGAATACGAAAACATGACCAAGTGCCCTAAGTGTGGTTTGTCAAGGTGGAATATTGCTAAGAACTCAAAAAAGAAAAAAAGTGGTGTGGCTGCAAAGCAGATGTGGTACTTTCCAATAGTTCCAAGATTTATAAGAATGTTCAAGAGATTTGAAAATGCTAAGAACTTGCGTTGGCATGCGATGGATAGAAAAGTTGATGGTATTTTGAGACACCCGACTGACACTCCATCATGGAGGTTGATTGACCATATGTGGTCAACCTCTAGGTTAGAACCGAGAAATCTCCGTTTGGGTTTGTCCATTGATGGAATTAACCCATTTGGAGATCTATCGACGACCTACAGTTGTTGGCCTGTTATTACACTGCCATGGCTGTGTATGAGAAGAAAATATTTGATGTTGACAATGTTAATATCAGGTCCAAAGCAATCGGGATACGATATCAATAAGTACTTAGCACCCTTAATTGATGACCTACAAATGTTGTGGGAAGATGGAGTTTGTTGTTTCGATGACGCTAGAGAATGTTGGCGGATCCTTACTAAAACCCACAATATCCTTGTATCACAAAGATTACAACTAGTGTTAGTATAAATTGATACATGAAATAGCAACGCAATAAGCCACTCAATTACCTTGTCATTCCCATTAAGAACAAGATGTCATGGCCACATTAAATGTGAACCCACTTCCTGCAATATTTTGGTGACTTCTTCCTTTGTCGGGATGGGAATTGCACATTCACCATCGAGGACAACATCTACCGACACCTTTATGTTGTCACCGTCACCTTCAGCATCAAATATTGTCCTGTGGCAATGATATTATCTTCTGTTTCAAACGCCAGCATACACGGGGTTCCAACCTACGTAGAAGTATGTGTTAAATATGTGCACGTACACTTGGTAAAAAAAGTGTCCACTTAGTAAAGTATTTGTGAAACTAACCTTCAAGTAATTTGATCTATCTTCCACATTCTCTTCTTTCTTCACTTCGGCCATGTCATCTGCCGCTTTCTCTGGTACTGGATCAGAGGGTACGTATTCAACCTCATCACTTGAATCCCCTTTGATTGATGGTGTTCCTTTCAAACACATACTCGGTTGTTCTTCTTCATCTCCTTTGCCACCCTCATCTTTTTTCATTATTTCTAGCTCCGCTTCTAACTCCATAATTCTTTTCACCATTTCGTCCCGCTCCTCATACACTGTCTTTTCCTAATTACTTTGTTTAGATTTTGATTCCATCGGGGTATGGAAATACTTTTTCTTCGTGATGTACTTCCCCACGACTTGGACTATGCCTGGATGATCTTTCCCACCCAATGCTT

mRNA sequence

GTAAGATTGTGTTTGATGTAACTCGCATTAGAAGTTTGGGAGAGAAGAAGGTGGTGATGTACAATGAAGACAGAGTACCTATTGGTGAGAATGGAGCGAAGTTGAAGTCTTTCATAGAATCTGCAACACATTATCATGTCCCTATCACATATACATCTTGGAAAAGTGTGCCTGCAGAACTGAAAGATAAGATATTTAGTACGGTTGAGGCCACATTTGTCATTGATCTAAGATCTAGGAAAAACGTTCTCCAAACTGCAGGCATTTCATTTCGTCAGTTTAAGAGCGGGCTAACAACGAAATACATTATGCCACATAAGGATGAACTGCAACTCCTACAAGTTCTACCAGAAAAGTATTTATTTATTGATCAAAATCACTGGGAAGAATTTGTAAGGTCAAGATTATGTGAAACTTTTCAGGAAACAAGACAATTGCAACAAGATCGATGATCTAAGAACAAGTACAACTATCAAATTTCGAGGAAAGGTTATGCTAATCTTATTGAGGAAATGAAAATAGAAGTTGTTTGTGATTCTTGCTCCTTTTAATCTTGGGTAAGTTAACGTCAAGAACTTTCGCTTTCTTGATGCTGGCTTCAATGACGTTGTGAACTTCTCCAATGCTT

Coding sequence (CDS)

GTAAGATTGTGTTTGATGTAACTCGCATTAGAAGTTTGGGAGAGAAGAAGGTGGTGATGTACAATGAAGACAGAGTACCTATTGGTGAGAATGGAGCGAAGTTGAAGTCTTTCATAGAATCTGCAACACATTATCATGTCCCTATCACATATACATCTTGGAAAAGTGTGCCTGCAGAACTGAAAGATAAGATATTTAGTACGGTTGAGGCCACATTTGTCATTGATCTAAGATCTAGGAAAAACGTTCTCCAAACTGCAGGCATTTCATTTCGTCAGTTTAAGAGCGGGCTAACAACGAAATACATTATGCCACATAAGGATGAACTGCAACTCCTACAAGTTCTACCAGAAAAGTATTTATTTATTGATCAAAATCACTGGGAAGAATTTGTAAGGTCAAGATTATGTGAAACTTTTCAGGAAACAAGACAATTGCAACAAGATCGATGATCTAAGAACAAGTACAACTATCAAATTTCGAGGAAAGGTTATGCTAATCTTATTGAGGAAATGAAAATAGAAGTTGTTTGTGATTCTTGCTCCTTTTAATCTTGGGTAAGTTAACGTCAAGAACTTTCGCTTTCTTGATGCTGGCTTCAATGACGTTGTGAACTTCTCCAATGCTT

Protein sequence

VRLCLM*LALEVWERRRW*CTMKTEYLLVRMERS*SLS*NLQHIIMSLSHIHLGKVCLQN*KIRYLVRLRPHLSLI*DLGKTFSKLQAFHFVSLRAG*QRNTLCHIRMNCNSYKFYQKSIYLLIKITGKNL*GQDYVKLFRKQDNCNKIDDLRTSTTIKFRGKVMLILLRK*K*KLFVILAPFNLG*VNVKNFRFLDAGFNDVVNFSNAX
Homology
[Close]
BLAST of Chy4G075540 vs. NCBI nr
Match: KAE8646994.1 (hypothetical protein Csa_016979, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 7.67e-05
Identity = 28/37 (75.68%), Postives = 30/37 (81.08%), Query Frame = 0 

Query: 135 DYVKLFRKQDNCNKIDDLRTSTTIKFRGKVMLILLRK 171
           D VKLFRK+D  NKIDDLRTS TI FRG+VM IL RK
Sbjct: 157 DCVKLFRKKDFSNKIDDLRTSITIGFRGRVMPILSRK 193

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy4G075540 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy4G075540 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy4G075540 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8646994.17.67e-0575.68hypothetical protein Csa_016979, partial [Cucumis sativus][more]
BLAST of Chy4G075540 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy4G075540.1Chy4G075540.1mRNA