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Chy4G075020 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGACCATTGACGGGGCGGTGCAGAATCAGCCTCAGCAGCAACAGCCTCTTCCGGCGCAGCAGGTGGTTTTCGCGGAAAGGCTAAATCAGGCAGTTCAGCAACAGTTGAACCTGGAGGCTCTGAAGAATCGAGCTACTACTCTCTTTAAAGCCATCTCTCGGATCCTTGAAGATTTTGATGTCTATGGTCGCACCAATACCACACCTAAATGGTCTACTTTCATCTTTTGCCTAGTTTTCTCTTGTGATATTTTCCAAATATGCTTGAATTTTTATGTTCGTCATTGGCGATTGATAGCACGTTAGTGTTAGAAAGTATTTTTTTTCTCTATCTCCTGGATTTACATGTACTGATTATTTTATAGATATCAAAGCTTCTTAATATCTTTCTATCTATCTTTCTATTTATATTTCGATATTCTCCTCTACTGGCCGACTGTATAGTTGATTTTTACGCCAGGCAAGACATACTGGGGCAGTATTCTATGGTGAATCTCGAGCTTTTCAACATTGTTGACGAAATCAAGAAAGTTTCGAAGGCTTTCGTTGTACATCCAAAGAATGTTAATGCAGAGAACTCTACAAGTATGTCCCTGCATCCCTTCCAAGTATTTGCTGAAGTAAAAGGAACAAATGCTTAGTTTTTGTTTTGTACGCTTGAACAATCATTCATTTATTTGTAAATTTTGATTTCAACTAATTTTTCTTTCTTTCTTTTTTCTTTTTGTGAGCCCAGTACTACCAGTTATGTTGTCCTCAAAACTATTGCCTGAGATGGAGGTAGATGACAATTCGAAACGAGAGCAGTTGCTTCTTGGGATGCACAACATGCCAGTATCTACACAGATTGAGAAATTAAAGGTACTAGAAGTTTGTTAAATAATTATAGGTGGTAGAACTCCCCGTGTTCTAAAGAAATTCATTAAATTACATACTTTCTTATGTATCTGGCATTTAGGTTTACTTTTCTTACAGACTAGAATTGAAATGATTGGAGCAGCCTGTGAAAGTGCTGAAAAAATATTAGCTGAAACTCGAAAAGCATATTGCTTCGGAATGCGTCAAGGGCCAGCAATAGCTCCAACCTTAGATAAGGCTCAAGCTGCAAAAATTCAGGAGCAAGAAAATTTACTCCGAGCTGCTGTTAACTTTGGGGAAGGTGATATTTTTTTACTTTTATAGTTATTGGTTAGTATCTTAGTTTTAATTAGTTGTAGTTCTTATATTGTTTAGTACTGCATCATGGCTCGTAAGTCACTCATGATCGACATTTACCAAAAAAAGCAATATTATATTTAGACTTCTTGCCAACTTGTCACATATCTATGAATTACTGATTTGTATATTTATTTCTTCATTCATGATATACTTTATCAATTTTTTTGTGCATAATTGAATATGAACATTCTGACTTGTGTAACAGCCATTTTCCTCTCTTTTCATTGTTGTATGAATCAGACACAATAACTTGCTTTTTGGGAGAGTTGATTTAAATGACTAAATTGTTTGAAAATTTGTGAAAGAGTTGCTGAGGGAGAAAGGAGAAGTGGAATGTTGTAGAATGGGAGTGATGCGACTTTGTAAAATGACCATATGAATTATGGAGGATGCATATATGGCGAAAAATCCTCTGTTCCTTCGGTCAATGAGGCTGTAGGAATCCTAGCTCAGTTGGATCCCCTAAACCAATTGATCTATCATCCTTCTTCATCCTTCCCAAACACTTGAAGGCCCCGAACTACGTAGCAAGCCCACACTACGAGGCTTGGCAAACTGATTTAATTCTTGCAAAGGATGTGGGTATAAGGTGTTAAAAGTAATATCTGAAAAAGAGGAACCATTATGGATTGACCTAATGGTAAATAGGGGACGTGACTTTGATAAAGGGTTGAGAGGTCACAGGTTTAATCCCTGACAGTCATCTAGCTAGAATTTAATATCCTATGAGTTTTCTCGACATCCAAATGTTGTAGGGTTAAATCAATTGTTTTGTGAGATTAGTCAAGGTGTGCATAAGCTGATCTAAACACTTACAAATTTCAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGGAAAAGAGGGTTGTCAACTGGTAATCTTTTCTATTTGAAGGGGCTTGTTTCCATTTTAAAAATAACAAGTAGCCTTTTCTATTAAATTCCAAGATCTAATCTTCTCCTTCAAATATCTCTCTTACAAAAATTCTCAACACACAATAGAATGCAAGATCTTCAATCATTTCCTCCGTACCTTTTCATATTTCTCTCTTTTGTGCTCTTTAGAGCAAAGGCCAAAAGGGAGATGTTCTTTGTTGTCAAGCTTCGAGCCTAATGTTATAGTGCAAAGTGGTTTGAGCTACAAACATTTCAGTTGTGTGATTGTATCTTGGAGGAGACATGTTAGACAATATCTGGTGCCTTGAAGGAATACATAGTCTCTTGAAAGACACCGAGATAAATGCACCTCAACGTAATTGTTTCTCAATATTTACTCCAATTTCTAGGTTATTTGTAAACCATTAGTTCGTAAGTTACGCTGTTGGGCTTTGGCAAGACAAAAGGCTCATCAGATCCTTCGTTAGATTCCATATTTCTCTCTCAGTTTCAGGTACAAAAGTCTTTTGTATTGACACTAGAGCATTATTTTACGCAACTGAAGGCCCTTCCTTTAGTGGCCTACCTTTATGTAGGATTATTCTTTTTGGATCCTGGTAAATTCTTTCATTTTTTTTCTCGAATGTTGTTTTCTCATTATAAAGAAAAATAAAATAAGATAAAAGAGAAGTCCTTGATGCGATGCATATGATTTATAACATTATTTTTTGGTTTGCTTGGATCTATTTTTAAAACTTGGCTCAAACTTGAAGTTTCATTTGCTTCTATATTTTTCCTCTCCCAATTTTTTCCTGAAGTGCAGTAGTCATGCCTTGTAAATGAATCTTATATGAACATGCAGGATTAAGATTACCTGGTGAGCAACGACAAATTACGCCAACACTTCCGATGCATTTGATAGATGTGCTGAATGCAGGTGATGGAGTGCAGAGTTTTAACGAAACGTCCGGTAACATTCATTTGTTTTTTCAAACATAAATGGTTTATAGATTAATTTACTAAATTGCACTAACTTGTAATTGTTTAACAAAATCTCTTTCAGGTATGTATGCAAAGAGTACTCCTTTAACGTCAAATAATATTAGTAGTCAAGGAGCAGTGATCCAGGTTAGATGATGTCCTTGCTCCTTGAAATGGTTTCTTAACGATTTATTTGCATCTTCTTGAGTTATAGAATGTAAACTAAGTTCTCCAAGGGGAAGCAACTTTTGCCTAACAGATTTTGTTTCATTCGAGGTTCTGTTATGTACGTGATTGAATTATCTTGTATCAGTTGGTTCCTAATTTTATTAGGATTTCTTTGGTTATGACTTATGAGTTGTATCTACCATTCATCCTTCCTTGAAAGATGACGTTAGATAGTATAGTACTGTTAGGAATAAAAAATTTGAACATTTTCTTGCCGACTGTCTCCTTTTCTCACAATTCTTTCTTTTCCCTGCTCTTCCTATGATTATTTGCATTATTATTGGTGTTGAACACGGGCACTTGGATTGTTTGGTTTGCACATTTAGATATAATAAGAACTCTACAGGTTATTTTTGAGGCTAATGTATGGATCAAAATTAATAGGGTAATGATAGAACACCAAGTAGTGTGTTCTATTATTTTATTAAACAGCCAAACTTTTACAGAAAACAGTACTAACACAGCCTTGAAAACAAAGAACAACACAAGAACCAATATAGAAATAAACAAGTTCAACATAAAACATCAAAACAGAAAAGTACTTCACAATGATGGAAATAACTTGCAACAGACTACAGAAACTGAATACTTTCTGCATTCCCTGCTCTCCAGGAAATTACAGCCCTCCACTTCCAGAAACTGATTAACCATCCCCATCTTTCCTTCCATCTCTCCCTTTTAACCTCCCCCATGTAACTAACTGTGGTCTCTACTAAGGTGGTTTCCACTTCCTCCACTTCCATCACCTGTGCACGTGCCATTCCATTTGTCTTCCTTCTGCCATATTGTATTACAATTGGTGGTCTATCATGATTCTCCCTCTCCAAAGACACCTTGTCCTCAAGTTGGAAATGAGGAAACTGTCGTGCAAAATCATCAGAATTCTCCCATGTAGCCTCATGAGGTGGTATTCTTTTCCAACTAATAAGCACTTCCCACTCCTTTGTTGCTGGATTTTTACGATAGCCAAAAATATCTGCTGGTAGTAATTCTTGAATTGTAGGAACATCATCAATCCCATACAATTCGGCAAACTCCCTCCAAACCTTGACATTCTATCAAGAAACCTTGATCAGATGGTGTCCATGTCTTCATCATGTGTTTCAAACTCACTCTAGTCTTTGTCAAACTCAGGTCACCCCTTATAACAATCTTCTTTTCATTTTGTATGAAAGTTAAAGTGAGTTTCTACCAATCCACTTAAGTTACCCCCAACGTGTGCTATTTAGCATTCCAAGGATGACATCCACTCCTCCCAACTCTAATGGTAGGAAATTATCAACAAGTTTCCAATCACCCAATGCTATTTCCACTTGACTACATATGCCCTTTCCCTTTTCTTTCACAGCAGTACCCAACCCCATAGTGAGAAATTTCCTCCGAGGGCAATTTCAACAGAGCCACTAATTTTTCAGAAATAAAGTTATGCATTGCACCGCAATCTATCAAAACCACCACTGACATCCTTGAATTACTCCTTTTATTTTTATCGTGCCCTGATTTGTTAATCCCACCACCGAATTTAATGACAATTCTATCACCGGTTCTTTTCTTTTCAATATCAAGTTCAATAGCTTTTACCTTAGGTTCCTCTGTATAGTCATCCTCTTCCACTACCAATTCCTTCCCGTTTTCTTGAACAACTAACACTCTGAGTTCCTTCTGATCCTTCACCTTACATCTATGGCCTGCATAA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MATIDGAVQNQPQQQQPLPAQQVVFAERLNQAVQQQLNLEALKNRATTLFKAISRILEDFDVYGRTNTTPKWQDILGQYSMVNLELFNIVDEIKKVSKAFVVHPKNVNAENSTILPVMLSSKLLPEMEVDDNSKREQLLLGMHNMPVSTQIEKLKTRIEMIGAACESAEKILAETRKAYCFGMRQGPAIAPTLDKAQAAKIQEQENLLRAAVNFGEGLRLPGEQRQITPTLPMHLIDVLNAGDGVQSFNETSGMYAKSTPLTSNNISSQGAVIQPPGSQLVGRSAASPSGATSATSFDNSTSPMPYANSPRSSANVMNTPSPQQQTQQQQQQQLQQVQQRKLMLPQHQHLLAQQQMRQSSMQGIGQIHGQHQMQFSQPLAHQQFQGRQMSSGHVQHGITQSQLGQGNQMNRHLHQFSGAANSSLFNVAQTTPTSQMIPNISATMSSQPLMSRMQHGLSGTNLQRNHASQILSDQNKINAANCENGLRRANRIDLVNVMNGGWRRNQLKIERLRKMSCINLLLWRFACCLLGYSASNTTKLY* Homology
BLAST of Chy4G075020 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4V3C1 (Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MED8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 484.6 bits (1246), Expect = 1.5e-135 Identity = 297/492 (60.37%), Postives = 366/492 (74.39%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CN44 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 870.9 bits (2249), Expect = 2.7e-249 Identity = 468/474 (98.73%), Postives = 469/474 (98.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPL4 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 866.3 bits (2237), Expect = 6.7e-248 Identity = 468/475 (98.53%), Postives = 469/475 (98.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VLA2 (Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold238G001760 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 798.9 bits (2062), Expect = 1.3e-227 Identity = 431/438 (98.40%), Postives = 433/438 (98.86%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GVL6 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457835 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 770.0 bits (1987), Expect = 6.6e-219 Identity = 425/481 (88.36%), Postives = 446/481 (92.72%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IWU9 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 768.1 bits (1982), Expect = 2.5e-218 Identity = 422/483 (87.37%), Postives = 445/483 (92.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. NCBI nr
Match: XP_004144418.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 882 bits (2278), Expect = 0.0 Identity = 474/474 (100.00%), Postives = 474/474 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. NCBI nr
Match: XP_011651696.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8650872.1 hypothetical protein Csa_001556 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 877 bits (2266), Expect = 0.0 Identity = 474/475 (99.79%), Postives = 474/475 (99.79%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. NCBI nr
Match: XP_008465098.1 (PREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 869 bits (2246), Expect = 8.52e-315 Identity = 468/474 (98.73%), Postives = 469/474 (98.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. NCBI nr
Match: XP_008465097.1 (PREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 865 bits (2234), Expect = 6.28e-313 Identity = 468/475 (98.53%), Postives = 469/475 (98.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. NCBI nr
Match: XP_038907034.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 809 bits (2090), Expect = 5.79e-291 Identity = 443/476 (93.07%), Postives = 456/476 (95.80%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G075020 vs. TAIR 10
Match: AT2G03070.1 (mediator subunit 8 ) HSP 1 Score: 484.6 bits (1246), Expect = 1.1e-136 Identity = 297/492 (60.37%), Postives = 366/492 (74.39%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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