Chy4G074980 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATATATATGACAATATCCTTCCGTACCACAACCGTTCCTTTTAGGATAAAATAAAATTAGATTATAGCAATTCCCATTTCCAATCCTCAACCACAGTTCTTCTGGGCTCTCTATCAGCTTCTCCATTTTTCCATTTATCTCCAAATTCCTTATGTCTCTCTCGCCTCTATCCAAACCCAAATCCCTAACCCTAACCCTAAATCTCCTCCCTCCTCACCTCTTCCGCCGTCCTTTCTCCTCCCCTTCCGATCACGATCTCACCGACCTCCCTGAATCTCCTTCTTCTTCTGATCCCCTTCTTCGCAACCTTGAGGACGCTATTCAACGCATCCTCGTTCACCGATCTGCCCCGATTGGCTTTCCTTCGTTCTCGGTGCTTCCTATCGGGTTCCTCTGCCTTCTAATTCCCATTTACCTCTCATTGCCAACGTTCTTCGTAACTTAGCTAACCCTCTCTCTCCTGAATAATCCTTGTCTACCACTACCATCTGTGGCTGGCTCTCTTCTCATTACTTCATTCAAGGTATTCCTCTTCTTTCGTATTTCGTTTTCATTTTATCTCTACTCTCTTTCTCTCTTTAAATTATTTATTTAGGAAATAAAATACCCTTTCATCGTAGGTACGCATCTTCCTTCTCTTGATCCGGTGGTTGACACCACGTTGACTGAATGTGATGCTTCCCTTGACCACGAGGAAGGATGAGAATCCGATTTGGGTGTGTTCCTATTAGTTCTCATACTAAACTAGTTTCTGCCGCTAAAGTGAAGTCTGAATTATATTTTCTTTTGCCTTGCAATTTATTAAATTTGTATATTGAGAGACTTTTAATAAAAAAAATTAACTTGATAGCTCCTTTATTGTGGTTAATTTCTACAAATTAACACTCTTCAGATTGTCAAATTCTCTACTTTCCTCTACTCTCACTTCATATTGTAACGAGAAGCACACTTCGGTTTGTAGCTTGCTTGGTGTTGTTTGAAATCTTGTATAATTTTTGGAAGATCATTCCTTTTTAGCTCTGTTAGGTTCATCTACTCGCCTCGAGGCTGTTACCTTTCTCTTTTGATATTAACCTTGTTTCTTAAAAACAAGACTGTAGATTTTGGGCGTCTATTGTAAAGAGCGTTCTTTATGTTGGAAGAATTGAGGGTGGGGGATTAGAAATGCCATGAAAACCCGTAACTGGTAATGTTCTCGAGTGGGCGAGTTAGGGATATTTGCATCCTTGAACTGGTGCAAAGTGTCATGATTATGAAAGTAAATTGCCATTGAATCTGTTGGGCATCCCATGAGTTTGATTAGTAGTGAGTGTGGATGGATTTTAATCTTTCGAGTTATTATTTGTTGATCATTTGAGAACTAAATAACATTTTCTTGTAAAAAATACAAGATCCTAGAGATAATGAAAGTAATACAAATGATGGCATTTTCTTCTACTACTCTTTGCAGCTCGCCTTGCCTTGTAAACCTCATGTATAGAAGAAGACAACTGAATAACAAGCTAAGCAGAATGGCCGAGTAAGGGGTAGAAGCTTGTACAGATGTGAACTGGTCGGTGAGTGCTATTTATAAAATGGCCCTTCGTCGATCATTTAGAAGCTTCTGCTCTTAAACGTTGTTAAATGTTTTTCCTTTTTAGTAACTTATTTCTTTCAACTTTTTGCATATGTATTTTGTTCTCTTGTTCTATTTTAAATACTTCTTTCTTTCAACTTTAAGCATTCTGAAACATGATTCTCCTCCCTCCGACCCCATGCCTCATAGGAGGGCACTATTCTCGTTTGAGAAGCTGTTGACTTGTGAATAGGACATTAAACCACATATGTTGCAGTTCAAGCAAGTTAGCCTATTTAGATCCAAATATAATAATTTGTCTCGCCTAGTTCGTTTTGGATGGCTACATGATATCTTCATCTGTATTGCAAATTAAAGTTCAATCTGTGATCTAAACCGTCTCTTGATTATTCTTTTCAAAAGCAAGTATCGAGGTGATAGCTTAGAATGGAAGAAAAGTTTGAAGATATACATTTTATAATTTGGAAGAGATGCAATTATTTGTATGTGAATGAAGCGAAGGTAAAGTCTTGTAAAGACTATTAGGGAGAATCTTGTGAGTATAGACGAGGAAGGTGCAACTGGGGAACTTTTCTTATTTTGACATTTGGTAATGTGTCTTGGAGATTCTTCTAGGGGTACGTTGTCCTATAGCTTAGATGTTGCATTATTTATGCTTCCCGAAGGTAGAGACAGATTGTCAGGAGATGTTATGAAAAAGATGGAGTGACTAAATGACCGTAAAATGGCTGAATTCTAATTCTAAACACAATTATATAGGATTATTTTGGTAAGAGGTTTTTTAAAAATAGAACAAAGCTTGAAAATATTTACATTGTATAGAATAATTTTAAAAAAAGAAAAAAACTCACGAGTCCACAAATAAGTCATACACTTACCAAATCTAAACAATCTTGTAACAATGACTACTTAAATCTAAACAATCTTGTACCTTTGTATTCAACCTATATGTAATCTATACAATCTTGTATCCTTTTACCTACGATTTTGTATCAAATCAAAATGATCTATTAGTGATAGTGGTTAGTGTTCTATCTGGGATAGACAACTAATCATTTAGATTCTGCACCAACATCATTTAAATATTGTTCTAAGAAGAAAAAAAAGAAGATGAGAAATGAAGAAGTAAGAAATTTGGAAGATGAAATGAAGAAATTGATAAATATTTACATAAATAACCATAATATTGTAAGATGAAGAAGTACTAATATGAATAAATTAATAATACGAAGAAGAGAATAATAAATCGCAAAAAAGAAAGAAGAAAAAGAAGTGAAAAATCGTCAGCATTATTCAAGAACAAATATGAAATTTATGAAAAAATCATGGACTTTTTATTTTGTTACACGAATCGAAAATATTTTAATGTTTTGTTATATTTATGAAAATTAACCTTTTGGTAATTCGTTTGTTTTTAAAAACTTAATATTTAAATAATAAGCATATTTGGTGACTAGTCTACTTTTTTTTATTTTTTAATCAGAAACTTGCTTTTAAAATTATAAAGGAAAATTGAAAATGAAAAAAAAATGGAGCTTTAAAAATGTGTATTTTGTTTTTAAAAATATAAAACAATATTGATTTTCGTTTTTATTGAACAAAAGATTAAAAAACAAGAAAAAACAAAAACAAAAAATTTGAAAGAGTTATAAGATGGAGTCTACTGTAGGCATCAACCATGAGGTGGGAAGTGTCATGGTATTCCTCTTTATTATATTATTTATTATTTGTTAATAGTATTTATTATTTGTCATTCATTTTTTTTTTCGTATTCTTCCTCTATTGTTATCATCGTGTTTACTTTCCCAATCAAAATAAAATCAGCTTGTATTTTAAACACAAATTATAGTAACTATTATAATTCATTTATTATAATAATCAATTTATTATCTCAAACCTAAAAGAATAAGGATGTATTTAGATTATCTTTGAAAGTATTTAAATTTGAAAAAAAAAATATTTCAAAAAAATTTGAGATGTTTGGTAACTTTTCAAAATGTATTTTTAAATAATCAGATTGAAAAATAATCCAATTTAAAGAAAACACTCATCACCTTGAGAAAATAGGTTTACAACCTCATGCAGATGATTTGAATATATTCTTAAAGATGATATGTAGAGAACTTGGACATTTTAGTTGTTTTCATTAATTGTTTATTTTGCTATTAATGACAATGAGAGTGTTGTTTATTATATTTCGTTTGTTTTTTGTTTTAGTTTAATTTTTATTCTGTCAAGTTTATATTTTGTGTGAATTTATTGTATTTGAATTTATTATTTAATAAAATTTGTTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTTTCTCCCTTACTCTTTAGTCTTCAAAGTTTTCAAACTCATCAAAGGAAAACATAGCTTGCCCTACTCCAATTCGCCATCCTTACAAATATGAGGCATAAAAGTCGAATCATGGAAGAACATGATAAAAACATGGATAAAATGAGACAAGATATTAATAATTTTGGGAAACAAGTTTAAAAAATACTAGAATTGCTTTTAGCAGGAAAAGGAAAAGTCGTCGTAGAAACAGCACAATCACGCAATCCAGTTCAAGACACCAATGATCCCATTTATCCTCCAGGATTTACGCCATGCCACATGAATGTTCCATAGTCTCAAACCACTCAATACTATGTTGCTATGAATCCGTTTTTTGTTGTTCCACCTCTTGTCCCAGATATAGAACAATTGGAAGCTCAGGCTAAAATTCAAGACATGGGACAGAATGAGAACACTCCGGGTAAGCAAAAATTAGATGTTTTGGAAGAAATGTTGCGAGCAATTGAAGGGACTGACATTTATGAAAATATAGATGCAACACAATTGTGTTTAGTGCCACACTTGATCATTCCAACAAAGTTTAAAGTTCCCGAATTTGACAAATATGATAGATTATTGTGTCCAATGAGTCATCTTATAATGTATTGTAGAAAGATGGCAGCGCACATTGGTAATGATAAATTGTTGATCCACTGCTTTCAGGATAGTTTGACTGGTCCAGCTACTCGATGGTATATTTAATTAGATAATGTACACATTCATGTTTGAAAGGATTTAGTTGATGCATTTCTAAAGCAATACAAACATAATATTGATATGGCTCCAGATCGTTTAGACCTACAGTGAATAGAGAAGAAGAGTTCAAAAAGCTTTAAAGAATATGCTCAACGATGGAGAGATATGGCCGCAGAGGTTTAACCACTGTTAATAGACAAAGAAATGGCATATATGTTTATGAATACTTTGCAGGCTCTGTTCTATGATCGAATGATTCGTAATGTTATAACCAATTTTTCTGACATTATTGTTATTGGTGAAAGAATTGAATATGGGAAAGCACGGGAGGTTAGAAGAGGCTTCGATTGAGTATGGGGGATTAAAGAAAGAAACAACATCTAAGAAGAAA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ATATATATGACAATATCCTTCCGTACCACAACCGTTCCTTTTAGGATAAAATAAAATTAGATTATAGCAATTCCCATTTCCAATCCTCAACCACAGTTCTTCTGGGCTCTCTATCAGCTTCTCCATTTTTCCATTTATCTCCAAATTCCTTATGTCTCTCTCGCCTCTATCCAAACCCAAATCCCTAACCCTAACCCTAAATCTCCTCCCTCCTCACCTCTTCCGCCGTCCTTTCTCCTCCCCTTCCGATCACGATCTCACCGACCTCCCTGAATCTCCTTCTTCTTCTGATCCCCTTCTTCGCAACCTTGAGGACGCTATTCAACGCATCCTCGTTCACCGATCTGCCCCGATTGGCTTTCCTTCGTTCTCGGTGCTTCCTATCGGGTTCCTCTGCCTTCTAATTCCCATTTACCTCTCATTGCCAACGTTCTTCGTAACTTAGCTAACCCTCTCTCTCCTGAATAATCCTTGTCTACCACTACCATCTGTGGCTGGCTCTCTTCTCATTACTTCATTCAAGGTACGCATCTTCCTTCTCTTGATCCGGTGGTTGACACCACGTTGACTGAATGTGATGCTTCCCTTGACCACGAGGAAGGATGAGAATCCGATTTGGGTATCCTAGAGATAATGAAAGTAATACAAATGATGGCATTTTCTTCTACTACTCTTTGCAGCTCGCCTTGCCTTGTAAACCTCATGTATAGAAGAAGACAACTGAATAACAAGCTAAGCAGAATGGCCGAGTAAGGGGTAGAAGCTTGTACAGATGTGAACTGGTCGGTGAGTGCTATTTATAAAATGGCCCTTCGTCGATCATTTAGAAGCTTCTGCTCTTAAACGTTGTTAAATGTTTTTCCTTTTTAGTAACTTATTTCTTTCAACTTTTTGCATATGTATTTTGTTCTCTTGTTGATACCAAGATAACTATTTATCACACAATTAGTAGGTTT ATATATATGACAATATCCTTCCGTACCACAACCGTTCCTTTTAGGATAAAATAAAATTAGATTATAGCAATTCCCATTTCCAATCCTCAACCACAGTTCTTCTGGGCTCTCTATCAGCTTCTCCATTTTTCCATTTATCTCCAAATTCCTTATGTCTCTCTCGCCTCTATCCAAACCCAAATCCCTAACCCTAACCCTAAATCTCCTCCCTCCTCACCTCTTCCGCCGTCCTTTCTCCTCCCCTTCCGATCACGATCTCACCGACCTCCCTGAATCTCCTTCTTCTTCTGATCCCCTTCTTCGCAACCTTGAGGACGCTATTCAACGCATCCTCGTTCACCGATCTGCCCCGATTGGCTTTCCTTCGTTCTCGGTGCTTCCTATCGGGTTCCTCTGCCTTCTAATTCCCATTTACCTCTCATTGCCAACGTTCTTCGTAACTTAGCTAACCCTCTCTCTCCTGAATAATCCTTGTCTACCACTACCATCTGTGGCTGGCTCTCTTCTCATTACTTCATTCAAGGTACGCATCTTCCTTCTCTTGATCCGGTGGTTGACACCACGTTGACTGAATGTGATGCTTCCCTTGACCACGAGGAAGGATGAGAATCCGATTTGGGTATCCTAGAGATAATGAAAGTAATACAAATGATGGCATTTTCTTCTACTACTCTTTGCAGCTCGCCTTGCCTTGTAAACCTCATGTATAGAAGAAGACAACTGAATAACAAGCTAAGCAGAATGGCCGAGTAAGGGGTAGAAGCTTGTACAGATGTGAACTGGTCGGTGAGTGCTATTTATAAAATGGCCCTTCGTCGATCATTTAGAAGCTTCTGCTCTTAAACGTTGTTAAATGTTTTTCCTTTTTAGTAACTTATTTCTTTCAACTTTTTGCATATGTATTTTGTTCTCTTGTTGATACCAAGATAACTATTTATCACACAATTAGTAGGTTT IYMTISFRTTTVPFRIK*N*IIAIPISNPQPQFFWALYQLLHFSIYLQIPYVSLASIQTQIPNPNPKSPPSSPLPPSFLLPFRSRSHRPP*ISFFF*SPSSQP*GRYSTHPRSPICPDWLSFVLGASYRVPLPSNSHLPLIANVLRNLANPLSPE*SLSTTTICGWLSSHYFIQGTHLPSLDPVVDTTLTECDASLDHEEG*ESDLGILEIMKVIQMMAFSSTTLCSSPCLVNLMYRRRQLNNKLSRMAE*GVEACTDVNWSVSAIYKMALRRSFRSFCS*TLLNVFPF**LISFNFLHMYFVLLLIPR*LFITQLVGX Homology
BLAST of Chy4G074980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9L9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G419630 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 156.4 bits (394), Expect = 2.0e-34 Identity = 75/85 (88.24%), Postives = 76/85 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CC43 (uncharacterized protein LOC103499150 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499150 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 147.9 bits (372), Expect = 7.2e-32 Identity = 72/85 (84.71%), Postives = 74/85 (87.06%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VD84 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold606G00450 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 147.9 bits (372), Expect = 7.2e-32 Identity = 72/85 (84.71%), Postives = 74/85 (87.06%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GVG9 (uncharacterized protein LOC111457911 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457911 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 127.5 bits (319), Expect = 1.0e-25 Identity = 62/86 (72.09%), Postives = 68/86 (79.07%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J031 (uncharacterized protein LOC111480015 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480015 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 125.9 bits (315), Expect = 2.9e-25 Identity = 61/85 (71.76%), Postives = 68/85 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. NCBI nr
Match: XP_004135962.1 (uncharacterized protein LOC101214133 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 154 bits (388), Expect = 2.39e-42 Identity = 75/85 (88.24%), Postives = 76/85 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. NCBI nr
Match: KAE8646378.1 (hypothetical protein Csa_015587 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 154 bits (388), Expect = 5.63e-42 Identity = 75/85 (88.24%), Postives = 76/85 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. NCBI nr
Match: XP_008460271.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499150 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008460272.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499150 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008460273.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499150 isoform X1 [Cucumis melo] >KAA0065598.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold90G00420 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK07168.1 uncharacterized protein E5676_scaffold606G00450 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 145 bits (366), Expect = 4.61e-39 Identity = 72/85 (84.71%), Postives = 74/85 (87.06%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. NCBI nr
Match: KAG7018211.1 (hypothetical protein SDJN02_20079, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 125 bits (314), Expect = 3.09e-31 Identity = 69/110 (62.73%), Postives = 75/110 (68.18%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. NCBI nr
Match: XP_022956127.1 (uncharacterized protein LOC111457911 isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 125 bits (314), Expect = 3.09e-31 Identity = 69/110 (62.73%), Postives = 75/110 (68.18%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. TAIR 10
Match: AT1G16840.4 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G78890.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 5.3e-11 Identity = 39/84 (46.43%), Postives = 48/84 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. TAIR 10
Match: AT1G16840.3 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G78890.1); Has 71 Blast hits to 71 proteins in 12 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 71; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 5.3e-11 Identity = 39/84 (46.43%), Postives = 48/84 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. TAIR 10
Match: AT1G16840.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G78890.1); Has 71 Blast hits to 71 proteins in 12 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 71; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 5.3e-11 Identity = 39/84 (46.43%), Postives = 48/84 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. TAIR 10
Match: AT1G16840.2 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G78890.1); Has 71 Blast hits to 71 proteins in 12 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 71; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 7.7e-10 Identity = 34/62 (54.84%), Postives = 42/62 (67.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G074980 vs. TAIR 10
Match: AT1G78890.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G16840.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 1.7e-09 Identity = 38/85 (44.71%), Postives = 50/85 (58.82%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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