Chy4G073930 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy4G073930
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionRibosomal protein L34
LocationchrH04: 7955565 .. 7997122 (-)
RNA-Seq ExpressionChy4G073930
SyntenyChy4G073930
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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TTCCAGCCCTCTAAACACTCTGTGATCATTCTCTCTCCATAAATCCCAAAGCAAATTGCACTTTATTACTTCTTTGGTGTGTTTGGCCTTCAACTTCCCTACATAGAGATTTTAGAGATATGATCGAGGAGTTCCTCCATCTACGTTCTTGAAGGGGAGTTTATTATGGCAAGCCAGGGTTTGTTTTGTATTGTTGGGACTGGGAGGACGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGATGAGAAACTGAAGAATTTTCAGAAAGGTTGATAAAGAGTATTTTCTGTTTGTGATTATTCGATTGATTGGAGCTCCTTCTTGTATGATTCTTCCTTTTGTCGGTTTTTTATTGCCCTTGTATTCTATTATTATTTTTCAATAAAACTGTCTTTTATCCAAAACAAAGTAAAAGGTGGTGTGTTATGCTAATATGGTTTTGATGATAATATACTTTGGAGACATTTCATTGCCACCTTGATTTAGGGTTTTCTTTGGGCAACTCTGGTGTTCCCTCTAGTAAGTTTGTGAGGAGACTTGTGGAAAATGCCCTTCCTTGCTTTCTTTTTTCCTTTTCTTTCAATTGCTTTCATTAAAGAAAATGAAGGAATACAAGGGTGTACAAAAAACCAAGCCCTCAAAAACCTCTTGAGAAAGGGTTTCCAACTAAATAAGATATTTCCTTTTTTGTGGCTTGCTGGGTGTGTGTGCTGTGTTTTGGTATATTTTGGGGGGAGAAGAATGATCGGGTGTTTAAAGGTAGGGAAAGGGACCCTTGTGAGGTTTAGTTCTTAACTAGGTTTCATGTGTCCCTTTGGGCTTCGGTTTCAAAGACCTTTTGTAACTATTTTCTTGGTAACATTTTACTTAGTTGAAACCTCTTCTTTAGTTGGGGTGTTTCGGTTGAAACCTCTTCTTTAGTTGGGGTGTTTCGGTGGACTTGTTTTCTTGTATGCCCTTGTATTCTTTCATTTTTTCTCAATGAATGTTGGTGAGGTTCCATACCTCATTGGGTCCCCCTATCCGCATCTCTAAAAACTTTGGTATTTCTCTCTCCCAAAGATCTCTCAACGAAGCACACACCCTGCAAACCACAAAAAACACCCTTTCTCTTTGGAAGGCGGATGGAGGAGAAACTCCTTGGTCATCAAACAAACATTCCTCTGCCGAGCAAGCACAACATTGAACTCTTGAAGGAAACAATTCCACTTAGACAACACAAACTGAGAAGGTGGTCCAGGCTTTCCTTCCCCTTCGAATACAGAATACAACAGAAAAGGCCCCATTAACTAAGGCATCCTTCTCACCAACCTATCCAACATGTTAACGCGGCCGAGCAACACTTGTCAAGAAAAGAATTTAGTTTTCTTTGGAATCTTAATTCTCCTTAAAACATCAAAGACTAACTCCCAAGCAGGATAGAAATCCTATAAAATCCTAAAGAAGACTTACAAGAGAAAACCTTCAAAGGATTAGGGCTCCAAACACGAGTAGCTTGTCTCCATGCAATAAGTTGAAACCCTCAATTAAAGTAAGAAGTGAGGTCATCTTCATCATTTCTCTATTGCAGAAAGAGTGTCAAAAACCAAAGGATAAAGACACATAACTCCCTAGCCAAATCAAAAATTTAGATACCTAAAGAATTTTGAAGGACAAATGATATAACCAAGGAAACGCAGAAAAGAGTTGCCTTTTCTTCGCCCAATGATCTTCTAAAAAATATGTTTCCTTCCTTTCCCCCCACAACACAAAAACCAGATGGGAAAAGGAAGGGAACTCAAGTGTGCCTTTAGCTCCTTTCGCCAACCGTTCAAAGGGGTTTGGACCATTTTTACTCAATATTTTGTGGTATATCTAACCGGAGGGAAATTGGAGAATCTTTATCCACATTTGAAGAACAGCTGTTTTTGTAGTGAAGTAATGATAGGATTGGGAGTAGGGAAAATATGGCAATTAGGAGGGTGATTTATTGGGTGTTTCTGATAGAACACTGATATAGTGTTTCTATTTTATAGATACCTTCAAAGAATTACAATATAAAAGAACAAACAAGTAAAAGAACCCTAACCCTCTGCCCTTCCTCTCTTTCAAGGAATGTTGCAGCCCTAATTCTTCACCAAATTCTTCATACCCTTCTTCCCTCCCCAACTTCCTATTTATAACCAACTAACTACCAACAAATCTAATTATCCTTTTACCCCTTCCCTATACTAATCTAGGTATCTAACATTACCCGGGCCTTCAAAAACACCTTGTACTCAAGGTGTGCTTACAAATATGATCACAAAAAATTGATCCACCCCCCCTTTTTTTTTCTTTAATTACAATCTATTCCCAGTGATATGCTCTTCAAGTTAGAGAAAAATTTCCTTCTCAGTTTCTCAGGTACTCTGGCTTCAAAAAGGTTCATTGACTTCAGCACATAGCCCAAAATATTCTTCTTTCAGCCCACATGACAGCCCAATATTTCTGAACCTTCCTTTTCCCAAACACGTTATCATACTCAACCCTTTTATCACCACCAAGTATTTAATTGTGAAACTTTCCTTCTCCAATGGGTTAGGCCCATAATCAATTAAGCCCATATAAAACAGGATCATTCCGCTGCTTGTTTCATTTTCGGAGCTCCCCTCTTTGCACGTCTTTCTTCTCTTCCATTTTTGGAACTCACCACCCCCATCATTTACATAATAATGGGCCCTCACTCTTTGATTTATAAAAACTTGAAGCCCACTTGAAGTAGTAAAAAGCCCAAAATTTTAGGGTTTGTTTTGCTTGCCCTTATCTCTCTCTATCATTTTCTTCCACGTCATTGGCATCTTCACGCGTACTACTTCTTCACGTGATTCATCCATATTAGACATCATCTCCCCGGACCACCGTAACGAACCACTTGCTGACGTTTTCTTTCCCCTCCGCATCCAGAAAACTGTCGTCACCTTCTTTTCCCCTCGCAACCCAACAACTTCCGGCGGCTTCATCCACCATCGTAACCAGCCATTTTCTCTTTCCTCAAGCAACAATTTCTTTTTCACTCGAGTCTTTGATTCGGATCCTTTCGGTGATTCTCGCCTACCTTCCGCGATTGTTTCCTGTTTCTTTGCTAAGAAGCATTCGCCGACATCATCTTCCCTTGCTGAACGAAAACGAGATAACAACTTCTGCTCTGATTCCAACCTGTTCTTGAATGTATCGCATCCCTCTGGTGATCGATAATCATCTAATGTGTTTCCAACAGAACCATTTACGCTGAATACTGGCAACTCGAGCTTGTTTTGATCGATTTCTTTTCCTTCAATTTCTATTTTGAATTTGTTTCGATTACTCACCTTCTCTGCAATTTCTATTTTCTCTATTTGTACTTCGTTCTCGGTTCTTCTTGTCGATGTCTTTCCTCCGTCGACTGTCTTTATCACCGATATTTGTGGTTGCTTTTCGGCTTGATCCTCTAACTTCTCTGTAATCTTCTTGCTCGAATGGCTGATTGAATCTTCTATGTCGCTCGTCGTATCTTCTATTTCGCTCGTTGTCCTAGATTTCTCATGAATCATGTTTTCAAAATATTTCATTATTGAATCTTTTTTGGTATCTCTCCTTTTCCTTCCTTCCTTCTCCATCATTTCAAGTACAACCCCCATCTGTTCAACCTTCTCTGCCAAGGATCTCAAAGTTTCTTCGATCACCGGTATCTTGCTTACCTCTTTTTTTATCCCAAGCATCTCCTCTTCGTAAATCTCTAATCGTTCTTCGATACTTTGCACCATTTTGATAGTCTGTCTTTTCAAGATGAACGTACTCCAATCGATCTTTCCAGGATGAACGTGCTCTGATACCAATTTGATAGAACACTGATATAGTGTTTCTATTTTATAGATACCTTCAAAGAATTACAATATAAAAGAACAAACAAGTAAAAGAACCCTAACCCTCTGCCCTTCCTCTCTTTCAAGGAGTGTTGCAGCCCTAATTCTTCACCAAATTCTTCATACCCTTCTTCCCTCCCCAACTTCCTATTTATAACCAACTAACTACCAACAAATCTAATTACCCTTTTACCCCTTCCCTATACTAATCTAGGTATCTAACAGTTTCTCATGGAGATGTATCAATAAATGAAAGTAGGCAAAATGTGGGAGACTAGTTGGAGGTATATGGGTAAGATTAGTATAGTTTTAGTAAGGGATTAGGGATAATTAAGGACCTTGGGCGGTGTGAAGAATTTGGGTAGTGTCCTTTGTTGGACTTTGGGAGAGAGATAGCCCTCTCAAAAAGGGTATTATATTTTAATTTCTTTACCAATTGCAATATAGTTATTGCTAGTGTTTATTAGGGATTGGTAATGGGCTCTGTTGCTTGAATTTCTGAGAACTGTTTCTGAAAAAAAATTGCCAGTGTAGTTTGTTCATATTGTATCTATTTTCTATTTTAGAAAGCTGTTTGAAGAGTGAGTTTTTATCTTCTCGTCTTTATTCATTCTCTCATGATGCCAACTTAAAAATACATCATATAAAGATTAGTTTATAAGGGGAGAATCAAGTTAAAGAGCTGGGTACAACAGCTGTGCTTATTTTTAGTATGTACTTATTATTATTTTTTTTGTCTGTTCCTATCAAATTGTAATAAGAGCGCATTTGTTCTAGGAGCATCAATTTTGTCCATAGCTTTGGATCTAGAGGTGCTCAATTGTGTGTTAGAGAAGTTGTTGCATGATATTGAGGGCATGGAGGGAGTTGGATGATATCAAATGCAAAAGAGTTTAAGGTTTTAATCAACGAAGCATGGGCGTTGTACAGTGAAAAAGAACAAAAATGAATGACAACTATCAAGGTAATGAAAGAAAACGGCAGTAAGAAAAAGTCCATTGGATCAAAGATTAACCACAACTTTGTTTAGAAACTATCAAATCATAAGTGCTATTGAATTGTGGCTTGAAGGTGTCAGTATGAGCCGAGAACACATAAAATAACTGAAGGGTAGACCAATAGACGAGGCAAAAGAGAAGG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mRNA sequence

ATGGCGTCCAAACTTCTTATTCGTACGGGAAGTTCTTTGATGAATCAATTACGATTAAGCTCAGCGCATCAGAATAACAGGATTTGGAGTAGCCAAGCTCTGTCCCATGGCCATGGCGTTGAAGTTACTCCGATGCTTTTTCCTTCAGTTTCTAAGCACCAGACTGCTCATCCTTTGCAGCAGAATGACACCGAATCGTTGAGGCAGCTCCAATCGGAAGGCATTTTCTTTCCTTTTGGGCTTCCGTCGCTCCGGTTCTTTTTGCCTGACGGAGATGCTTCTTCAACACAAGAACCGATGCTCTTATTTCCTAAAAGGACATTTCAACCTAGCACCATCCGGCGAAAAAGGAATCATGGGTTTTTTGCTCG

Coding sequence (CDS)

ATGGCGTCCAAACTTCTTATTCGTACGGGAAGTTCTTTGATGAATCAATTACGATTAAGCTCAGCGCATCAGAATAACAGGATTTGGAGTAGCCAAGCTCTGTCCCATGGCCATGGCGTTGAAGTTACTCCGATGCTTTTTCCTTCAGTTTCTAAGCACCAGACTGCTCATCCTTTGCAGCAGAATGACACCGAATCGTTGAGGCAGCTCCAATCGGAAGGCATTTTCTTTCCTTTTGGGCTTCCGTCGCTCCGGTTCTTTTTGCCTGACGGAGATGCTTCTTCAACACAAGAACCGATGCTCTTATTTCCTAAAAGGACATTTCAACCTAGCACCATCCGGCGAAAAAGGAATCATGGGTTTTTTGCTCG

Protein sequence

MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQQNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHGFFAX
Homology
[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LIB6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G847215 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 245.7 bits (626), Expect = 9.9e-62
Identity = 121/123 (98.37%), Postives = 122/123 (99.19%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 60
           MASKLLIRTGSSLMN+LRLSSAHQNNRIW SQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ
Sbjct: 77  MASKLLIRTGSSLMNRLRLSSAHQNNRIWGSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 136

Query: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120
           QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG
Sbjct: 137 QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 196

Query: 121 FFA 124
           FFA
Sbjct: 197 FFA 199

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BHV7 (uncharacterized protein LOC103490028 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490028 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 240.7 bits (613), Expect = 3.2e-60
Identity = 118/123 (95.93%), Postives = 120/123 (97.56%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 60
           MASKLLIRTG+S MN+LRLSSAHQNNRIW SQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQ AHPLQ
Sbjct: 1   MASKLLIRTGNSFMNRLRLSSAHQNNRIWGSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQIAHPLQ 60

Query: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120
           QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG
Sbjct: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120

Query: 121 FFA 124
           FFA
Sbjct: 121 FFA 123

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GTQ0 (uncharacterized protein LOC111457406 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457406 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 228.4 bits (581), Expect = 1.6e-56
Identity = 112/123 (91.06%), Postives = 118/123 (95.93%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 60
           MASKLLIRTG+SLMN+LRLSS HQNN IWSSQ+LS GHGV+VTPMLFPSVSKHQTAH LQ
Sbjct: 1   MASKLLIRTGNSLMNRLRLSSTHQNNWIWSSQSLSQGHGVDVTPMLFPSVSKHQTAHHLQ 60

Query: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120
           QNDTESLR+L+SEGIFFPFGLPSLRFFLPDGD SSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG
Sbjct: 61  QNDTESLRKLESEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDTSSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120

Query: 121 FFA 124
           FFA
Sbjct: 121 FFA 123

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GTJ1 (uncharacterized protein LOC111457406 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457406 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 228.4 bits (581), Expect = 1.6e-56
Identity = 112/123 (91.06%), Postives = 118/123 (95.93%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 60
           MASKLLIRTG+SLMN+LRLSS HQNN IWSSQ+LS GHGV+VTPMLFPSVSKHQTAH LQ
Sbjct: 1   MASKLLIRTGNSLMNRLRLSSTHQNNWIWSSQSLSQGHGVDVTPMLFPSVSKHQTAHHLQ 60

Query: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120
           QNDTESLR+L+SEGIFFPFGLPSLRFFLPDGD SSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG
Sbjct: 61  QNDTESLRKLESEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDTSSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120

Query: 121 FFA 124
           FFA
Sbjct: 121 FFA 123

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IXD9 (uncharacterized protein LOC111480019 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480019 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 224.2 bits (570), Expect = 3.1e-55
Identity = 111/123 (90.24%), Postives = 117/123 (95.12%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 60
           MASKLLIRTG+SLMN+LRLSS  QNN IWSSQ+LS GHGV+VTPMLFPSVSKHQTAH LQ
Sbjct: 1   MASKLLIRTGNSLMNRLRLSSTLQNNWIWSSQSLSQGHGVDVTPMLFPSVSKHQTAHHLQ 60

Query: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120
           QNDTESLR+L+SEGIFFPFGLPSLRFFLPDGD SSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG
Sbjct: 61  QNDTESLRKLESEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDTSSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120

Query: 121 FFA 124
           FFA
Sbjct: 121 FFA 123

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. NCBI nr
Match: XP_004141160.2 (uncharacterized protein LOC101210601 [Cucumis sativus] >XP_031738493.1 uncharacterized protein LOC101210601 [Cucumis sativus] >KGN59796.1 hypothetical protein Csa_001175 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 246 bits (628), Expect = 1.14e-80
Identity = 121/123 (98.37%), Postives = 122/123 (99.19%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 60
           MASKLLIRTGSSLMN+LRLSSAHQNNRIW SQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ
Sbjct: 77  MASKLLIRTGSSLMNRLRLSSAHQNNRIWGSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 136

Query: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120
           QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG
Sbjct: 137 QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 196

Query: 121 FFA 123
           FFA
Sbjct: 197 FFA 199

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. NCBI nr
Match: XP_008447614.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490028 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 241 bits (615), Expect = 8.62e-80
Identity = 118/123 (95.93%), Postives = 120/123 (97.56%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 60
           MASKLLIRTG+S MN+LRLSSAHQNNRIW SQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQ AHPLQ
Sbjct: 1   MASKLLIRTGNSFMNRLRLSSAHQNNRIWGSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQIAHPLQ 60

Query: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120
           QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG
Sbjct: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120

Query: 121 FFA 123
           FFA
Sbjct: 121 FFA 123

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. NCBI nr
Match: KAG7018271.1 (hypothetical protein SDJN02_20139, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 229 bits (583), Expect = 4.10e-75
Identity = 112/123 (91.06%), Postives = 118/123 (95.93%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 60
           MASKLLIRTG+SLMN+LRLSS HQNN IWSSQ+LS GHGV+VTPMLFPSVSKHQTAH LQ
Sbjct: 1   MASKLLIRTGNSLMNRLRLSSTHQNNWIWSSQSLSQGHGVDVTPMLFPSVSKHQTAHHLQ 60

Query: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120
           QNDTESLR+L+SEGIFFPFGLPSLRFFLPDGD SSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG
Sbjct: 61  QNDTESLRKLESEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDTSSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120

Query: 121 FFA 123
           FFA
Sbjct: 121 FFA 123

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. NCBI nr
Match: XP_022955352.1 (uncharacterized protein LOC111457406 isoform X2 [Cucurbita moschata] >XP_022955353.1 uncharacterized protein LOC111457406 isoform X2 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 229 bits (583), Expect = 6.52e-75
Identity = 112/123 (91.06%), Postives = 118/123 (95.93%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 60
           MASKLLIRTG+SLMN+LRLSS HQNN IWSSQ+LS GHGV+VTPMLFPSVSKHQTAH LQ
Sbjct: 1   MASKLLIRTGNSLMNRLRLSSTHQNNWIWSSQSLSQGHGVDVTPMLFPSVSKHQTAHHLQ 60

Query: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120
           QNDTESLR+L+SEGIFFPFGLPSLRFFLPDGD SSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG
Sbjct: 61  QNDTESLRKLESEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDTSSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120

Query: 121 FFA 123
           FFA
Sbjct: 121 FFA 123

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. NCBI nr
Match: XP_022955351.1 (uncharacterized protein LOC111457406 isoform X1 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 229 bits (583), Expect = 8.80e-75
Identity = 112/123 (91.06%), Postives = 118/123 (95.93%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQLRLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQ 60
           MASKLLIRTG+SLMN+LRLSS HQNN IWSSQ+LS GHGV+VTPMLFPSVSKHQTAH LQ
Sbjct: 1   MASKLLIRTGNSLMNRLRLSSTHQNNWIWSSQSLSQGHGVDVTPMLFPSVSKHQTAHHLQ 60

Query: 61  QNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120
           QNDTESLR+L+SEGIFFPFGLPSLRFFLPDGD SSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG
Sbjct: 61  QNDTESLRKLESEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDTSSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKRNHG 120

Query: 121 FFA 123
           FFA
Sbjct: 121 FFA 123

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. TAIR 10
Match: AT3G13882.1 (Ribosomal protein L34 )

HSP 1 Score: 119.8 bits (299), Expect = 1.6e-27
Identity = 69/126 (54.76%), Postives = 87/126 (69.05%), Query Frame = 0 

Query: 1   MASKLLIRTGSSLMNQL---RLSSAHQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAH 60
           MA+K LIR+G+SLMN+      ++  QNN   S Q ++   G E+ P  FPS+S  Q++ 
Sbjct: 1   MAAKTLIRSGASLMNRFLTKPTTNIVQNNLRSSFQYIA-PQGQEIPPYFFPSLSNLQSSL 60

Query: 61  PLQQNDTESLRQLQSEGIFFPFGLPSLRFFLPDGDASSTQEPMLLFPKRTFQPSTIRRKR 120
             + NDT SL++L   G  +P GLPSL FFLP+ D SS  EP+LLFPKRTFQPSTIRRKR
Sbjct: 61  ISRPNDTASLQELNERGFLYPSGLPSLEFFLPEVDPSS--EPLLLFPKRTFQPSTIRRKR 120

Query: 121 NHGFFA 124
           NHGFFA
Sbjct: 121 NHGFFA 123

[Close]
BLAST of Chy4G073930 vs. TAIR 10
Match: AT3G13882.2 (Ribosomal protein L34 )

HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 8.6e-18
Identity = 58/146 (39.73%), Postives = 71/146 (48.63%), Query Frame = 0 

Query: 23  HQNNRIWSSQALSHGHGVEVTPMLFPSVSKHQTAHPLQQNDTESLRQLQSEGIFFPFGLP 82
           +QNN   S Q ++   G E+ P  FPS+S  Q++   + NDT SL++L   G  +P GLP
Sbjct: 33  NQNNLRSSFQYIA-PQGQEIPPYFFPSLSNLQSSLISRPNDTASLQELNERGFLYPSGLP 92

Query: 83  SLRFFLP--------DGDASS-------------------------------------TQ 124
           SL FFLP        D   SS                                     + 
Sbjct: 93  SLEFFLPEVYAMQSLDARESSALYCSLALRLLVSAKLYIFAARWYLSNVFVFGNVVDPSS 152

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy4G073930 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy4G073930 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LIB69.9e-6298.37Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G847215 PE=3 SV=1[more]
A0A1S3BHV73.2e-6095.93uncharacterized protein LOC103490028 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490028 PE=... [more]
A0A6J1GTQ01.6e-5691.06uncharacterized protein LOC111457406 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN... [more]
A0A6J1GTJ11.6e-5691.06uncharacterized protein LOC111457406 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN... [more]
A0A6J1IXD93.1e-5590.24uncharacterized protein LOC111480019 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=L... [more]
BLAST of Chy4G073930 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_004141160.21.14e-8098.37uncharacterized protein LOC101210601 [Cucumis sativus] >XP_031738493.1 uncharact... [more]
XP_008447614.18.62e-8095.93PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490028 [Cucumis melo][more]
KAG7018271.14.10e-7591.06hypothetical protein SDJN02_20139, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
XP_022955352.16.52e-7591.06uncharacterized protein LOC111457406 isoform X2 [Cucurbita moschata] >XP_0229553... [more]
XP_022955351.18.80e-7591.06uncharacterized protein LOC111457406 isoform X1 [Cucurbita moschata][more]
BLAST of Chy4G073930 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT3G13882.11.6e-2754.76Ribosomal protein L34 [more]
AT3G13882.28.6e-1839.73Ribosomal protein L34 [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR000271Ribosomal protein L34PFAMPF00468Ribosomal_L34coord: 105..123
e-value: 2.6E-6
score: 27.3
IPR000271Ribosomal protein L34PANTHERPTHR14503MITOCHONDRIAL RIBOSOMAL PROTEIN 34 FAMILY MEMBERcoord: 1..123
NoneNo IPR availableGENE3D1.10.287.3980coord: 103..123
e-value: 4.2E-6
score: 28.5
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR14503:SF8RIBOSOMAL PROTEIN L34coord: 1..123

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy4G073930.1Chy4G073930.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006412 translation
cellular_component GO:0005762 mitochondrial large ribosomal subunit
cellular_component GO:0005840 ribosome
molecular_function GO:0003735 structural constituent of ribosome