Chy4G072880 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACAGGGAATCGACTCAACGATGACAGGGAATCGACTCAACGGTTCAAACGGGACTCTTGGCTTGGCAGAAGGTTCGCAACTCATGGCTTGGAGATGGTAGGGCATGACTCACGTCTCTGTAGAAAGGGGATTAGCTCACGACTTGATAGAAAGGGGCGCAACTCACGGCTCGGGCAGAGGGCGCACGGCTGGTGATAGGGGATCAACTCAATGAAAGGATGCGGCTGGGCGACTTGGTCTAAGCAACGTGAGACTGAAGCTTGCTCGTTCATGTAGGGGCTTAGATCGCGGACGCCACGGCTTGAACAAAGCAGGCGACTTGCGAGAGGAGACGACATTACAAAGCAAGGTTAGAATGATGTTACATTTAGATAATCATAGAAATTATAAGGCTAAGAATGAGTAATAAGAAGGAATTTAAAGAAAGCCTAAGTAGAAGTGAATATTCAAATGTTCACACGAAAAATGGTTGAAGAGAGTTCATTTATATTGTTGATAAAAATAGAAGTTATAAAACCTTTTAAACTTATATGAATTATTCTACAAATTTAATCATTGAAATAAAGAGATAGATTTTTCATGTTTTAACTTGTTTCTCTTAAAATCTTTGTAGATTAAGAAGGGTTGTGAGAATGTAATTAAAAGATAATAAATAATTAATTTTTTTATTTTATTTTTAATATTTAATCATTAATAAGAATCTTTAACTTTAGCGTGTGATAAGTAATATTTTTTATTTTATTTTTAATAATTAATAATAATTAAATAATTTTAACCTTAATATGTCATAAGTAATGAATTTTATTTGTTTTAAAAAAAGACTCATTGCAATGTATACATGAATGCTTTTTTTTTTTTTAAATCACCAATCTACCCTGAAATATGCAATAACAATTTTTATGTTTAAAAAAATAAATGCTACGACTATTTGTAAATTTAAAACTAAAATGTTTTAAGAAACACATTATTAATTAATTTTAAGACTTGATAATCAATAAGAATATAAAATATTAACATGAGTAAGAATGAACATAATTGAAATTAGAGAATTATCATTTGGACAAAATGATGCCAAATTATTCTCCATGTTAGGGAGTAAGACAAGATAAGATAAGATAGATAATATAAATTGGTACAAAAGTAATACTAAAAATGTATGTGTTTTGTAATAATTTTCTTTACAAATAAAAACTTTTTTATACAACAAATTTATATTATAAAACTAACAAAAAAAAATGACATTTTTTAAAGATGAGTTTCAACTTAATACATAAATATATTGTTTAAAAAAAATTGAGTATAAGATGGAGATATACCTGAATCAAAGTCATTTGATACAATTCTTCTTTGCTTGGCAATAGAGCTCTTAGAAATATGTGAAACTATTTATAGGGATGGAAGAGAAAAATTTGCCCTATTAAAGAGAAAATTCTAGAGGATTTAGAATGTGAACATGTTTCATCCATTACTTATAGACATAATTATAATAATAATAACAATAAGTATTTTCAATTGATTTCAATGGTTGGTGGAGAATGTATCAATTAATTTGTAATCTTTTTATTTCCTTATTATTGAGTCATAGAGTTGATCAATATTGATTGAAACCGGCCCACTTTCAATATGTAACCTACACGATATGTTTGATTATGGATATTATTGAAATTTTTAACATGTAGAAGGGACAAAGAAGACAAAATTTATTTTTCTGGATCTCCATTTAATACAGTAAAGATACAATCTAAAAGTGTTTTCAAGAGATTTTTCTATATATTATATATTATAGATTTGAATGGGTAGATATGTCTAATCTCCAATTTTACCATTATATTATGTTCACATGTTTTTATCTATTTAAAATTCTGTATATAATAAAATATCAACAAAAGAAATTGAAAATTAAAGTAGATAGCGACATTTTTTCTAAAACATGGTTTATTAATTTACTAATTAATAGTTAAAGTAGATCAAGATCGACCATAGATATATGTATGTTGATTTGTTTAAGTAAAGGTTAGAGTCGTTTTCAATTTTATTTATTTATTTATTGTATCATTCAAGTACTATATTACCTTAAATTTCATATTTTATAGATAGAAATAAAAATATTCTTCCACTTGTTGGATAAAATAATGTATATACATAAAGAAAGAAAGTGAAAAAAGAAAAAGAATATTGAAAGATAAAAAATAAATTTATTTATCTAGATTAAATTCATTGTTATAAACTTCTAACTAGATGAAAACCATTCAATTAAGAATGAAAAAAACCATTCAATTAAGATGATGTTTCATGTATAAAGTTCACATTTATGAAAGTTAAATTTGTAGTTTTTTCAATTTAAATGAGATGCGTTCGATATTGGTAATATAACAACTAAATTGAGATAAATTGACAAATATTATTTTAATTTTTGTATCTACTTGATCTTATTTTGTATTTTAAAAAGTTATTAAGTTGCTATCATAACAACTTGGTTCTTCACTTGTAGTATCTCATTCAAAATCAAAGAGTTCTTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTATCTTGAGTTAAGTTGGAAGCAAATATTCAAGAGTTTTATTACCAAACTCATGTAGTTTGTTTGCAATTTTATGTAAGTTGGTTGAAATCTCATAACCAATATCTCAAATTACACTGATCTAGTTCAATAATTCAACTATTTTATTTCTTGATTTGGTTACGTTTGAATCACACAACTAGTAGTCTAAATTACACCGTAATAAATCACATGATACATGAACTAGACTGTGTTTCATCAACCTACCCTAAAAAAATGTCAAAATATCATGGACAAGATGAAAATATTATAAAATATGGCATGTGCATGCAGCGCAAGCCTTTGCCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAATATTAGTCTAGTTTTTTGTTTTATAAAAAGCTAAAGGCCACCCTGGTTTTGCAATTTTTCAAATATTCCATTTCTAAAAGTCTAAAAAGTCTAAAAATTCTTAATTTATTATTATTATTATTGCGAATGCATTCGACGTGCGTAGTAAACAATTAATATAAGAATAAAAGAATCTCATGATATCAGATTTTCACTACAAGAATAAGTTAACTCAATGCATTTTAAAAATTAGAAATATATGAAAGTATTTGTCCCCATCATTATATTATCAAATATTCACTAGTTTATATTGTTGTTTAATTTGGAAAAAAAGTTATTGAGTTTTTTATTTCTATATTTATGCATAAGCACAATAGTACCCATGATGGTAGGGCATGTAGAGCCTTCCAAATAGAGATTAATTCAATGGAAATAAATTAATGAAATATTAAACTAATAATTCGGTCATCTGATTTTAACTATTTGTTTGTATTCTAGACACAATTTAAACTCAATAAATTTGATCAATTTGGGAATCGCAGGCAGTGAGAATTAAGAATGGGCACCAAACCCAAAATCCATCCATTTTTATCATCTTTTTTCCTCTTCCTTTTGGTTTCCTCTCATCACTGTTTTGCAGTACAAAATGAAGAAGAAGAAGAAGGAATAATAAAAAGAAGAGATTTCCCAAAGGATTTCTTTTTTGGAACAGCTACTTCTTCTTATCAGGCACAACTCATTCATTTCTTATTAATTAATTTTTCTATTTTTGGATCTCTTTTATTTGTTTATTTATTCTTAATTTTGTTGATGGGAACAGGTTGAAGGAGCTTATCTTGAAGATGGAAAGGGATTGAGTAATTGGGATGTTTTTTCCCATCTTCCAGGTTCAACCCCACCTTCTAATTTCTCATTCCCATTCCAAACCTATTTCCCTAATTTTGGAAATTTTGCAGGAAGAATTAGGAACAGCGACACCGGAGATGTTGCCGACGATCACTACCATCGATTTTTGGTACTTTATTTTTTTATAATTGGTTGGAGAGTGATTATAATGATTAAAATCACTACTACCGTTTAGAAGGAAAAAGTGTTTATATCATTTAAAATCGATTTTTTTTAATGAAAAAAGTGTTGGGATTGAAGTGAATTTTGGTTTGTTTGAATTTGGCAGGAAGATATTGAGTTAATGCATTCTATGGGAATGAATTCTTACCGATTTTCCATTTCTTGGACCCGAATTTTGCCTAGTAAGTTCCCTTTTTCTTCATTGAAATTATTTGTTAAATAACCACTTTTCAAATATGTTTCAATTTAATGCTTTTAATACCTAATAAATTCTTTAATTTTTAGTTTTGTATTTACTAGTTTCTTGACATTTTGTAGAGAATCTACATTGATTCAGTTGTAACACAGTTTAAAAGTTTATATGTTTGCGTGATAATTTTTTTAACTACATTTGAAGAATAATGCGCTTACAAAAGTTAAATTGGGGTTTAAAATTAATACGATCATTAGTTCAAAATACAAATCGGTAAAATATATCATGTTTACATATATAAATTGATATTTTTCTTTTTCAATTTTGAAGGGTTGTTAATCTAAACTTTTAATTTTGTGGTTGGTAATTCAGTGATGTTTCTTATAAATTAAAAAAGAAAATTGTTCAATGGATGAATGACCTATCATATAACAAATTGAAAAGTAAGGGAGAGCCTATTTATTACACAATTGAAGGGTGAAGGCATATTAGACATTTTTTTTTTTAGTTTAGGAGCCTAATATAAGTACAAAATTAAAAGTTCAAATGAAGTTTGTGGTGAAACTCGTCATTTAAGCATATTTAATGCTTAATGAAAAATCGAGAAATTAGTTTCTATCTATTAAGCTTATTTTTCATTTGGGTCTATATACAATATAGTTTTTGAAATTAGCAATTTAATTTACGTACTTTGCGAAATTGAATATAATCATTAAGGTGTTTTATTCACATCTTTTTAATTTTTAAGACATAAATTGGCTTGTATTTTATTTATTTGTGACCTAAAGTACTTTAACCATTGGAAGGCAAAGATGGTGCCTCAAGTACTCTGTTCATATGTTAGATTTAATTTTTTTATTA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ATGACAGGGAATCGACTCAACGATGACAGGGAATCGACTCAACGGTTCAAACGGGACTCTTGGCTTGGCAGAAGGTTCGCAACTCATGGCTTGGAGATGGTTGAAGGAGCTTATCTTGAAGATGGAAAGGGATTGAGTAATTGGGATGTTTTTTCCCATCTTCCAGGAAGAATTAGGAACAGCGACACCGGAGATGTTGCCGACGATCACTACCATCGATTTTTGGAAGATATTGAGTTAATGCATTCTATGGGAATGAATTCTTACCGATTTTCCATTTCTTGGACCCGAATTTTGCCTAAAGGAAGATTTGGTAAAGTCAACCGAAGAGGAATTGCCTTCTACAACAAAATCATTGATAATTTGTTGTTAAAAGGCATAGAGCCATTTGTGACAATTCATCATCATGATCTTCCTGTTGAACTCGACAAAAGATATGGAAGTTGGATGAGCACTCAAATGCAGGAAGATTTTGTGTATTTTGCAAAAATTTGTTTCGAGGAGTTTGGTGATAGAGTGAAGTATTGGATAACCATAAACGAACCAAATGTGATAACATTAATGGGTTACACAAGAGGAGTTTACCCACCGGGCCATTGCTCGCCACCCTTTGGAAATTGCTCTACTGGAAATGCTGATATTGAGCCTCTCATTGTCATGCACAACATGTTACTTGCCCATGCCAAGGCTGTTCATCTTTATCGCACTAATTTTCAAGAAAAACAAGGTGGATCGATAGGAATAGTGGCATACTGCCACATGTATGAACCACTAACAGACCATGAATATGACATAAAAGCCGCCCAGAGAGCCTTAATTTTCATCTTTGCTTGGGTGTATGATCCAATAGTATACGGAGATTATCCTAAAGAAATGCGAGAAATTTTAGGAAGTCAACTTCCAAGCTTTTCAGACGTAGAGAAAGATATCATAAGAGGAAGTTTGGACTTCATTTGTGTCAACCACTATACTACATTTTATACAAAAGATTGTCTTCATTCTGCCTGCTCTGGTGGTGGAAATCATCCTGTAACAGGATATCTTAATACGACGGCATATCGAGATGGTGTTTCCATTGGAGATCCAACAGGAATAGACGTATTCTTTGTTGTTCCAAGAGGCCTGGGAAAAGTCATTAACTACATCAAGGAAAGGTACCCCAATAAGCCCATCTTTGTCACAGAAAATGGATATTCTTCACCACAATCGGAAGGTAACGAAACTGGAGACTTAATAAAGGATACAAAACGTGTCAATTACCACAAAAACTACCTCGCTTCCTTGACTAAAGCAATGAGGGATGGTGCTGATGTGAGAGGGTATTTTGTATGGTCCTTAATCGACAATTTTGAATGGGCCGACGGGTTCTTCAGAATGTTTAAGTATAGACTGATCATGATACGGACTCCTGTGGTCTTTCTTTCTCTCTTTAAAAGAGTAAAGACTCGAAGGTCACAATTAAGAATGGGAACCAAAATCAAAATCGTTGCTTTTTTCCTTCTCCTGATTTCCTCTCGTCAGGGTTTTGCACAAAATGAAGAAGAAGAAATCAATAGATCTGATTTTCCAAAGGATTTCGTTTTTGGAACATCCACTTCTTCTTATCAGATTGAAGGAGGTTATCTGGAAGATGGGAAGGGATTTAGCAATTGGGATGTTTTTTCTCATATTCCAGGAAAAATTAAGAACAACGACACGGGAGATGGGCGGACGATCACTATCACCGGTTTCGGGTACTCTCAGTAG MTGNRLNDDRESTQRFKRDSWLGRRFATHGLEMVEGAYLEDGKGLSNWDVFSHLPGRIRNSDTGDVADDHYHRFLEDIELMHSMGMNSYRFSISWTRILPKGRFGKVNRRGIAFYNKIIDNLLLKGIEPFVTIHHHDLPVELDKRYGSWMSTQMQEDFVYFAKICFEEFGDRVKYWITINEPNVITLMGYTRGVYPPGHCSPPFGNCSTGNADIEPLIVMHNMLLAHAKAVHLYRTNFQEKQGGSIGIVAYCHMYEPLTDHEYDIKAAQRALIFIFAWVYDPIVYGDYPKEMREILGSQLPSFSDVEKDIIRGSLDFICVNHYTTFYTKDCLHSACSGGGNHPVTGYLNTTAYRDGVSIGDPTGIDVFFVVPRGLGKVINYIKERYPNKPIFVTENGYSSPQSEGNETGDLIKDTKRVNYHKNYLASLTKAMRDGADVRGYFVWSLIDNFEWADGFFRMFKYRLIMIRTPVVFLSLFKRVKTRRSQLRMGTKIKIVAFFLLLISSRQGFAQNEEEEINRSDFPKDFVFGTSTSSYQIEGGYLEDGKGFSNWDVFSHIPGKIKNNDTGDGRTITITGFGYSQ* Homology
BLAST of Chy4G072880 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XSK0 (Beta-glucosidase 18 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU18 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 512.3 bits (1318), Expect = 7.2e-144 Identity = 234/437 (53.55%), Postives = 300/437 (68.65%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XSK2 (Beta-glucosidase 16 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU16 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 501.1 bits (1289), Expect = 1.7e-140 Identity = 227/425 (53.41%), Postives = 302/425 (71.06%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XPY7 (Probable inactive beta-glucosidase 14 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU14 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 1.8e-139 Identity = 236/457 (51.64%), Postives = 304/457 (66.52%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80689 (Beta-glucosidase 45 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BGLU45 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 483.4 bits (1243), Expect = 3.6e-135 Identity = 227/451 (50.33%), Postives = 313/451 (69.40%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SVS1 (Beta-glucosidase 47 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BGLU47 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 476.1 bits (1224), Expect = 5.7e-133 Identity = 231/473 (48.84%), Postives = 308/473 (65.12%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LD30 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G852490 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 879.4 bits (2271), Expect = 8.3e-252 Identity = 417/457 (91.25%), Postives = 424/457 (92.78%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZ78 (beta-glucosidase 18-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495056 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 849.7 bits (2194), Expect = 7.0e-243 Identity = 393/428 (91.82%), Postives = 410/428 (95.79%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L4S1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G638400 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 765.4 bits (1975), Expect = 1.7e-217 Identity = 342/427 (80.09%), Postives = 386/427 (90.40%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BVA7 (beta-glucosidase 18-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493887 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 759.6 bits (1960), Expect = 9.5e-216 Identity = 344/432 (79.63%), Postives = 384/432 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FBJ3 (beta-glucosidase 18-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442578 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 755.4 bits (1949), Expect = 1.8e-214 Identity = 337/427 (78.92%), Postives = 383/427 (89.70%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. NCBI nr
Match: XP_011652391.1 (beta-glucosidase 18 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN60041.2 hypothetical protein Csa_002103 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 875 bits (2261), Expect = 0.0 Identity = 412/441 (93.42%), Postives = 421/441 (95.46%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. NCBI nr
Match: XP_011652390.1 (beta-glucosidase 18 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 864 bits (2233), Expect = 8.33e-312 Identity = 413/464 (89.01%), Postives = 422/464 (90.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. NCBI nr
Match: XP_008454703.2 (PREDICTED: beta-glucosidase 18-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 847 bits (2187), Expect = 8.18e-306 Identity = 392/424 (92.45%), Postives = 409/424 (96.46%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. NCBI nr
Match: XP_038896554.1 (beta-glucosidase 18-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 807 bits (2085), Expect = 1.35e-287 Identity = 367/423 (86.76%), Postives = 400/423 (94.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. NCBI nr
Match: XP_038898509.1 (beta-glucosidase 18-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 772 bits (1994), Expect = 5.99e-276 Identity = 348/436 (79.82%), Postives = 392/436 (89.91%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. TAIR 10
Match: AT1G61810.3 (beta-glucosidase 45 ) HSP 1 Score: 484.6 bits (1246), Expect = 1.1e-136 Identity = 220/425 (51.76%), Postives = 302/425 (71.06%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. TAIR 10
Match: AT1G61810.1 (beta-glucosidase 45 ) HSP 1 Score: 483.4 bits (1243), Expect = 2.5e-136 Identity = 227/451 (50.33%), Postives = 313/451 (69.40%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. TAIR 10
Match: AT4G21760.1 (beta-glucosidase 47 ) HSP 1 Score: 476.1 bits (1224), Expect = 4.1e-134 Identity = 231/473 (48.84%), Postives = 308/473 (65.12%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. TAIR 10
Match: AT1G61820.1 (beta glucosidase 46 ) HSP 1 Score: 474.2 bits (1219), Expect = 1.5e-133 Identity = 216/425 (50.82%), Postives = 294/425 (69.18%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G072880 vs. TAIR 10
Match: AT1G26560.1 (beta glucosidase 40 ) HSP 1 Score: 417.2 bits (1071), Expect = 2.2e-116 Identity = 200/436 (45.87%), Postives = 277/436 (63.53%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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