Chy4G071470 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy4G071470
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH04: 3796694 .. 3803288 (-)
RNA-Seq ExpressionChy4G071470
SyntenyChy4G071470
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TCATTTAATAAAGCCATATTCAAAAACCTTTGTGAGGGCCAACTGATCTCTTCTTCTCATCTTTTGATCAAATAATATAAGACCAAATTCATTAATCCTTAAATTAATTTTGTGATTGTTTTTATAAGTAATAAAGTTGAATTTAGAGTGTGAGATATTATTTAAAAGCTGGATTAGTAGACCAGAGATGGAGAACATGTTGTTTTGTTTTGCTTTTATATTTTAAAAGTTTAAATTTAAGCCCATAAGTTTAAAAAACAAACAATTAAATTAGTAGTAAATCCCATAAAGTGACATGGGAACTACTTGATTTGATGCAATCACGAGCGTTGGTCTGTTGTTGATGAAAATCCCATTTGTTCTTCTTCTTTTCTTTCTTTTATATTCTTTTTCCTATTTTATTAGATTAAAAGAACAATATGTATATTCTATGTTTGTTCACTGAACTATATATTAATAATTAATTAAAGGTTCATATACTCATAATCTTAACTACTCTGTCCTTTCTACATCTTTTGAAATCTTATTCTTTTCCCTTTTTAATCTATTTGTTTTTTGCCCATATTCCTTCCAATTTCTCTCTTAAATATAATCCTGTTTATTCTTAAAACGGGATGCAATCATGTTAAAAGAGAATGCATTAATTTCAGGATTATTAACACTAATACTGAATCAATGATTATGACTTCAATTGCCTTTCTTATCACACCCATTTGATATTTATTCAACAACATATCTCATTCATTGTATTAGTTAATTATATTAATTCTAAGGCATTGGGCATGCCCTTTAATTTAAATTACATTTAATTGAGACTAAGAAATTATGAAACTAATAAACATTTAGGCATATCTTTGAAATATAAATGAAAATTGGAACATAAAGTGGTATAGAGACCCGTAAAAGAAATTACAACCTAGACATCATGGCCATGTTTTTCTATGTCACGACCACACCAATTATTCATGTTTCAACTAATTTCATGAAAAAAATCTTAAAAATTTGAAATATCTATAAAAAGTATAAGACGATCATTATTTTTCAAAATAAATAACAAATTCTTGAGGTAATTTTTAATTTAACGAGAAAGGAAGTTATACATTGTTCTACACGTTGTCTTGGAATCTTATAAACAAAAAATCATTAATTTCAACTTTCAGTTCATGCATATAATATAATAAAATAAAATATAATATATAAGATGTCTAAGTTAATGCACATGAATGCTTGCTATGAATATACATACAAAAATGAGATAAATTTGAACATATATGAAATTAGAAATTTGAAAATAGGAGACTAATATGTTTAGAGAGAGAGAGAAAATCTTGGGAAGAGAACAAAGGAAATCTCTTGCATGAATGTCGAAGTAACATTGAGAGATTGGAAAGGCCAATGAATTAAATAAGAAGAAAAAAATAATAATAAAACCAAAACAAGAATTTAAATAATCCATGCAATTTGGATATTAAAATTTCAATTTTACATGATGATGGATGTGTCCATATAAGATATATTGATATCACAAATAATTCTATAAAATAAAATTTTTAAAAAAGTTATTTAAATTAATAATTGAGTTATTATTAGACATCAAAATTGATAATGCAAACTCATGCTAGTTAGGTTATTCTCAATTGATAGTTAATATGGAATAGTTGTGGTTGAAGTCTCTAGGTGTGTTTTTGATAAATTGTTAATGTGTTTAGATAATGCAAATATATACATATTCTATTACCATATAGTGATGGGTACAAAATATAGTTTCCATATGACCAAAGATCTCCTAAAAAAATAATCTATGAAAATTCTATTTATTTAGTAGTTTTAAATCTGATTTAACAGGCAATAATGACGAAATCTAGAAGAAGAAAAAACAGAGAGAAAGGAATTAAATAAAATAAAAGAACAAAAAACATTTGTTGAAAGGAAGTTAACACATCAATGGAAGATATGGGATTTAAAAATAACAATAAGTTAAAAATAGGGTAATGATTCTAAATGAAAAACTATTAATATTGGCAAAATTTCATTGTATTAAATTATTAATATTAATTAATGGAAGATAAAGTCCAATAAACAATGACATTTCGTTACATTTTTATAAATACTTTACTTCACGCAATTTTTCCTTAAAATTAAAAATATATGTTATGATCATGAAAAGTTATTTTAAAACAGTTTATTTTTTTTAAAAAAAAAAGTATAAAACAAAAAAAATTATCAAAACGTGTTTTCATTTTTTTTAAAATCATGATTATCAAACATAGTTTTTATTTCAATTTTAAGCAAAACAATAAAAAAGAATTATCAAACATGCTTTTCTTTGTTGGTATTTTTATTATTAGAGACCAGAAAAATTAGGGAGAAATTATAAAAAAATAGCAAATTTGACAAAAACAATAGTTTGATTTTTGCTTTAAAAGAAAAAAGGAAAACTAAAAAACTAAGAACAGATTTAAAAAAACCAAGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTTAATTCATTTGTTTCGAGATTATTTTGATTTTTTGGTAATCTATTTGGTATAAAAAAATCTATAATTGTTTAATTATTTATTTCAAAAACAAAAAATATTCAACAATTTTTTAAATTTAATAATTTTCTTTTTCAAGGTTCTCTTTTAGTTATTTATATTTTAAATTTAGGTTAATTGTTTATAAGTTTAGACAGCAATATCTTGAAAAGATATCAACTTTTTTCTTTTTTAGGAAGAGAAAACCAAAAACCAAAAACCAAAATATATATTATAAAAATTTAAAATATATTTTAAGTTTGTTTTTGTTTAGATTCTATTTTGATATTTAAATTTATGATCAATAATATAAGATTCACTTAAACTAAACTAAAAGAGAATTAATCATTGTGTATAGTTGCTTAGTGTTATAATAATTCTATTGAGTGTTCAATTTACAAGGGTTAGTAGTTTATTATTGAGAATTTTTGTTAGGCATCAGAAGTCCAATTACGACATTTTTATTGAAACTCAAACCCTAAACCATACATCCATTAATGTTTTTCATTGTGAAAACTTTTAAATGTTATGAAATAAAAGTTTTGTTGTAGTCTTTTATATATTTTAGAGACAACATCTATTTATATTTATAGAAGGTTTTATATTGATTTGAAAACTAACCTTTTCAATTTCATAAAATTCAACTATATTATAATTTCATACTACTTTATTATATAAATTAAAACTATAATATATAACATGTATTCTACGTGTTTGGATTACTAAATTTTTTAGAAGTACTAATAACATAGAAGAGAGAAAAAAATGAGAATTTTAAACTTGACCTCGAAATTTATAGTACAAATATACGCTCATTTTGGAGATGTGTATTGTCTAATTGCAACTCTTTATTAATATTGGATGAATATATATACTATGAGTTTGCGTCTTTACTACGAGAAGGGACCACATTTATATGTTTCCACAAACTTTATGATTTGTATTAAAAATATTTCTAAAGTTTTAAAAGTTAAAAAATACTCTCAAGCTTCTAAAATGAGTTTAAAAATATCATTGATGTTAAATTTTGAATGTAAAACATTAAAATTTTGTTTTAAAAATATAATTGAACTTTCAAAAGTTTAAAAGATATTTTAATGATTAGAACCCAAAAACCTATCATTACTATATAAACAAAAACCAAAAATTGCTAATATATATCATCGTCAACCTCTTATGTTCTATATTTTTCTCTCATTCTTTTCCTCCATACCTTTTTACTTCCATTTTGGAACTATTTCACTTGTTTATCTAAAATAAATAAATGATTAAAAGTGCACACTTTAATTAAGATATATAAACTATAATAAAAAGAATGATAATAAATATACAAATAATTTTAGACATACATATTTTAACAAATTTGTATGATATTTTAACAAAATTGTACAATAGCAATGGTGTGTTAATAACTAGTCGAATACTTTTTGTTATTTGACTATTTATCTTATATTTTAAGAGAATATTTTTATTTTGTGAATTTTTGTAGAATTTTATGTTTTAACAGTTTTTTTTAATTTTAATAGTTAAGAAAATTGGTGTAACCTAAAAATTGGAAAATTAAGAGAATTATAAGAATATTTATATAAAAAAAATGATGATATCAATAAAATTTGTTTGGAAAATTAACTTCTAGTGTTATTAATTATTAATTAGAGAATTATTGTAAATTTTAAAATAATTGAAAAATATTTACAAAATATAGTAAAATTTCAAAACTAGTCTATCCGTGGTAGACTAATTTTGCAATTTTGTTATATTTGAAAATGCCTCTTATTAATTTATATTTTGGAGAAGAGGACACGACCCACAAAACAATTAAAATAACACATTAATGTGATGTTTGTCAAATACACTTCTAAAATTTAGAATAGAAAATGAATTTGGTTTTGAAATGAAATATCATATTATTTAATATGATATCCTCCAAATTAAACAAGTTTCGTGAAATTGAGAATTGATTTAATAATGTTAATGTAGCATTTCTCTAAATAAAAAAAAAAAAAAAGAATTTGCTATGTTATAGAGATTTAGAAAAAAATGCAATGATAATTTATAATATACCACAATGAATCATTTTCTACAATTAGATTTTTGAAAAAGAACATTATAACTATAAGTTATGAAATTCAACACTATGAAGGGATGAAGGGATGAAGGGATGAAGGGATGAAGGGATGAAGGGATGAGAGATAGTTAGTTAAAAATAGTCTTCATTATTCTAAAAATAGGGTCAATTATAAGTGTTCACATTTAGAAAGTCTTAAATTATTTTGCATGAGATGTTTTCCTCTCTATCTAACTTTCCATTTAACACTATTGCCATTGACCCATTAAACTATTTTTATAATTAAATAGTTAATATTTAAAGACAAAAGCATAAATGTCTTCATCAATAAATCTATACGTAGATGTTTGCGTTAAGCTCATACTCAATTTTTTTTATAGAAATACGGAACAAGTTGC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mRNA sequence

TCATTTAATAAAGCCATATTCAAAAACCTTTGTGAGGGCCAACTGATCTCTTCTTCTCATCTTTTGCCAAATTCTTCAGCGGCTTGTTGGAGCAAGATTTGGAAAGGAGGATGGTCGAGAAATTTGATGGGGACAATGTGTCTGGTTCGGTGTTGACCAACGTAGACAACAAAATGGCCTTTGGGGACGTCGAAAGGGAGACCAGGTTGGTCGTAATGGAGCTTATTTCTGCCTAAGCTGGAGCAGCGTTTGAGTAGGTGTTTCAGCACCGCCGTTTGTGGGCTTTTGGTGGTCTTTGTGATCGCCAT

Coding sequence (CDS)

TCATTTAATAAAGCCATATTCAAAAACCTTTGTGAGGGCCAACTGATCTCTTCTTCTCATCTTTTGCCAAATTCTTCAGCGGCTTGTTGGAGCAAGATTTGGAAAGGAGGATGGTCGAGAAATTTGATGGGGACAATGTGTCTGGTTCGGTGTTGACCAACGTAGACAACAAAATGGCCTTTGGGGACGTCGAAAGGGAGACCAGGTTGGTCGTAATGGAGCTTATTTCTGCCTAAGCTGGAGCAGCGTTTGAGTAGGTGTTTCAGCACCGCCGTTTGTGGGCTTTTGGTGGTCTTTGTGATCGCCAT

Protein sequence

SFNKAIFKNLCEGQLISSSHLLPNSSAACWSKIWKGGWSRNLMGTMCLVRC*PT*TTKWPLGTSKGRPGWS*WSLFLPKLEQRLSRCFSTAVCGLLVVFVIAX
Homology
[Close]
BLAST of Chy4G071470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A9B275 (Uncharacterized protein OS=Arundo donax OX=35708 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 3.4e-07
Identity = 37/83 (44.58%), Postives = 46/83 (55.42%), Query Frame = 0 

Query: 12  EGQLISSSHLLPNSSAACWSKIWKGGWSRNLMGTMCLVRC*PT*TTKWPLGTSKGRPGWS 71
           +G+++  S   PNSS+A  S  W  G SR   GTM  +R  PT T KWPLGTS G P   
Sbjct: 44  QGKVMPMSWRKPNSSSALRSSSWNSGASRQATGTMYRLRPAPTYTAKWPLGTSPGGPA-- 103

Query: 72  *WSLFLPKLEQRLSRC-FSTAVC 94
             S  LP+ ++ L R  FS A C
Sbjct: 104 --SSLLPRPDEHLLRIFFSCAPC 122

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy4G071470 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy4G071470 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A9B2753.4e-0744.58Uncharacterized protein OS=Arundo donax OX=35708 PE=4 SV=1[more]
BLAST of Chy4G071470 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy4G071470 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy4G071470.1Chy4G071470.1mRNA