Chy4G071210 (gene) Cucumber (hystrix) v1
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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGCCACCATCTCCGTCCATTAGTTAGTGTCAGGTAATGGTTGCAAGGGATTGTTTGTACAAATGGGCTTTGTCCTTTAGCATATAGCGGTTTGGTGCTGCTGCCAAAGCTTGGAGGTAGAATCCAAGTACAATTTAGGAGTCATGTTTTACCTTTTATGGAAGAATAATTAAATAGGCAGAAATTTTAGGAATAGTTAATTTGGTGTATAGCAAGATTTTAATAGACAAAGTCTATCAACAAGTATTAAGGGTAAGTATAAGTTCGTTGAAGTTGATTTTCTAACAAAATCGACTATGATTAGTTTAGTAATGTTCAAGCTGATCCCAACCATGAAAGAGTGAAAAATCAACTAACTGTTGGGTTTTGCTTGAGTTTGGTAATTTTTTAAGTTTTGAGTTTGGTTTTAATTTAGTTTCTGGATTTGAAAATGTACAATTTTATCATTAACTTCGATTCTAAGTTTTGTTTCAATTTGGTTTCTGAATTTCAAACCTTGATTTTTCGTTAAATACTTATTTTTCACTGTTAGGATTAATGTATATTGATTGATTTAAAAAAATTATAAGTAATTGAGTTTCACTAATTTTCTTCATCAACGAAAATTAGTTTTTAAACTTAAAATTAAGCATGAATGCGAGAAAGCTTGCATTTAAGAAAAAAGTAAGGTTGAAAAATATATTGAAATTTGGGACCAAAATAAAACAAAACTCTAAATTTAGGAGTAAAAGTTCAATGAAAGCTAAGAACTTATTTGAAACCAAACATAATAAATAAATAAATAAATTGGTAACATTTTGAAAACCAAGCATAACCCAAACCTAAAATCTAGGCCAAAAAGGGTTTTCCCCTAAAATTTGTAATTACATTTATTTTAAATCATAAATTTGAAAATCATTTTATGAGCTCACATTTTCAGAGTGGAATTATAAAAAAAAAAATGATCTATTTATTTAATATTGAAAAAGATAACTAATTCTCAAGTCTCATAACCATTAGTGTCATGCCTACATCCGTCATAACACATTTGCTCCGTTCTAAGTAGAAGCATTTGTTCGAATGTCCCTCCCAACTCACATTTGTTGAATGAGCTAGATCATTTTGAATCTCAATTTTCTCACTTCTTTGCCACTCAACCGCCTGAGGGTCGCTAACCCCTTTTACCCCTTTTGATATCTGTCTTGATTTCAAAATCACTATATGTTTTTTAAGTATTTAATTTTAAAATCGTGATATCTTCTAAAATTGCAAAAAGAATTAAGATATAATGATGTATGCAAGGTCGAGTCACAAAGACATTAAAAAAACGAGAGCCACGTCATCCAAATTAAAATACATTAAATATGTTCGTTCTAAAAGAAAGTAAGAGGTTAATTTTCTATGATTTAGAAACGGTGTCATTAATCATGATGAGATTTGAGAATGATCATCGGATCAAAAGAATTGCATCTTTTATTCATTAAAAAAAAAAATACTATAAAACTATACAATAATGAATAATGATAGTGTTTGGATGTGGGAATAAATAAAGAAGGAAAGGTTGATCAGTCATCAGCCACGATTTGGCGCCAGAATAGGCAGCCGTACAAATTACTCATTACCAATCCATCTTAACGACTTCTCTTTCGGTAATTAGAGAGATTGAAATTATTGAATTAGCTGTCAAAATCGTTTTTGCTTGCGACAGAAAGAGGAAGGGCTCTGTCGCCGGCGAGGCTCTGCTGTCTTTCTTTCACCTTTCGATCTTCTCCGATAGAGGGAAAGAGGATATGTTATCGGTTGGAATTGAAGACGAAGAGAAATGGCTGGCCGAAGGAATCGCCGGAATTCAACACAATGCCTTCTACATGCATCAAGCCATGGTATCTCCAACCCTTTTTTTTTTTCAAATTCAAACCTTCAATTCTATCGAAAAAAACAAACCCTAATCTCTCCGTTGTTATTGACGTTTATCATCTCAGGATGCGAACAGTCTCAGAGAAGGACTTAAATACTCGGCTCAGATGCTTTCAGAACTTCGAACTTCGAAGCTTTCACCACACAGATATTACGAACTCTGTAAATTTCTCTTTACCAATAAATCAATCCTTTGTGTAACGACTGGATCGATTCCTTGAAATGTGATTTGATATATGTATATTTTTATTTTTACGGCGTCTTAGATATGCGAGCCTTTGACGAATTGAGGATGTTGGAGATATTTTTTAAGGACGAAAGCAGGCATGGTGTAACGGTCGTCGATCTTTATGAACTTGTGCAACACGCCGGGAATATATTGCCCAGACTGTGAGTGAACATTGACTAGCGTCCTTAGGGCGTCACATTTAAGCTAATTAGTAATGCGTTATCATCTTCCTTAAACATTTGATGGCTTCCTTGTTCTGGATAGAAATGTTTTTTTTTGCCATGTCCTATCTGATCAGTGGATTTTTCATTTTTGTTTTTCCTTTCTGCATCTAGGTATCTCCTTTGTACGGTTGGGTCAGTGTATATGAAAGCTAAGGAGGTCCCTGCAAAGGAGGTCCTCAAAGATCTCGTGGAAATGTGCCGTGGAGTTCAACATCCAATACGTGGTCTCTTTCTCAGACACTATCTAGCTCAAGTCAGTAGGGACATATTGCTAGATATTAATTCTGAGGGCGAAGGGTAATATGATTGCTTAGTCTGAGCTGTTTACCCTTTCATTTTGAAGGCAGATGTGCATTCTCGAATCCGATTACTTTACTTCACATTTTTACATCTAATTTTTTACATAAACGGTTTTGATAGAAAACAGCAACAGATGAAAATTTAATTGATAGAAACTAGTTTAAAATGTGAACGTGTGTTTTAAAAACTTTTAGCTATTACAAGCTGTTAGAAATTAAAACATAATTTTCAGATGGATTGCATGAAATACAAATGCTCTCTTCTCTCTCCTGCCCCTCTCCACCCATCAAACCATAATCGCTCCTCCACCATGCCCACCACCACCGGTCCGCCACCTTCACCCCTCTACCTCATTTGATCTACTTATTTTATCTATATATATAGATCAGAAGATTTTCACCTTACAACCCAATGGAACTTGTGACGGTCAACATGTGAAAATAACGGAGAAAGGGAAAACTTCATCACAATTCATTTGCATCTCTTGGAAAGCTCTCTCATGGTTGCTCTTCTCCTTCCATACATTACACTATGAACCTTGCAATTACAAGTTCTTAGAAAAGTTATTGGATAATGGAGCAACCCTCTGGCTGGAAAAATTACACAATACTATATTGAATTCACTCTCCTCTACCACACGTGACGTCGGACAAAACTGTTTATTCCATCGGAGGAAACTAAGCAAGGATGGTTCTCCTTTTACTCCCTTCTCGTTGACTATATGACTGGCCCTTTGATAGACCACCAATTGTAATACAATATAGCAGAAGAAAGACAAGTGGAATTGCACGTGCACAGGTGATGGAAGTGCAGGAAGTGGAAACCACCTTAGCGGGACCACAGTTAGTTACGTGGGGGGGGGGGGATTAAAAGGGAGAGATGGAAGGAAAGATGGGATGATTAATCAGTTTCTGGAAGTGGAGGGCTGTAATTTCCTGGAGACCAGGGAATGTAGAAAGTGTTCAGTTTCTGTAATCTGTAGCAAGTTATTTTCATTATCGTGAAGTACTTTTCTGTTTTGATTTTTTATGTTGAACTCGGTTAATTTCTGTATTAGTTCTTGTGTTCTTTGTTTTCAAGGTTGTGTTAGTACTGTTTTCGGTAAAAGTTTGGTTGTTTAATAAAATAATAAAATACACTACTTGGTGTTCTATCACCCTTCCCCACCTCCCATTAAAGTACATACATACAAGGTTGCAGTACTATCTTTCCCCAACAAGCCACCCAAACATGAAGTGGTTAAGCCAATCCCCAAAATATTTGATCAAAGCTCTCCCCCACACTCTGATTGGAAATCAATGGTTGTGACTCCTCCAAAATTCTTGGTCGAAAATTAGTGAAACTATACAGTCTACAATTTCATCACGGTGTACAATCAATCCCTTCCTTGATGACAAGGCCCTTAACATGTTTATGACGCCACTGTTGCCAAATCCTTATACAACCTTGAAGATTGGACATTGTTTGGAAATTTCAATCTTCGATTCTTGGATGCAACTCTCACCTCTTCATATCTTTTCCATCAAACAACATCTTATGGAAGTCGGATTGGTGTATTTGACCCACCACCATTCTTATGGAATGAGCAGATTTTCAAGTTCATAGGCAACCATTGTGGGGTATATGTTGAATGCGCTAATCAAACTGATAGAGGGTTAAATTTCCTAGCTGTTAGGTTGAAGATTCGATCAAACTCTTATCGCCTTATACCCACTCGTTTGTTACTACTAGTGGAGCTTGCTAGATTGGAAATAACAGTGAGTATTCGTGGGGTCAATGTTATGACCACCATAAATAGATTGGCGACGGTGGTAGCAGAAACACATGCGGTGGTGAAGGAGTCCACCTTGCTAGCGGCAACATCTATGGGAAAATCAGCAATTACAAATGGGGATTCACATGATAAAAAGGGAAAAATCCTATCGTTTCCTTAAAAATACAGTCGACTTGCCCAAATTCCCACGATTTTCGGGAACTTGACCAGCCCTCTCTCTCCAAAAGACGATTTTGCCACTTACTCGTTGGAAGATTTTGTTTTTCGATTAAACTCAGCAGAATCCAATCTCCCTTTACTATCTTACCCCCTGTCTCTACCGATTTGTATAGCCTGATACAACATCTTATCCCATCGACACAACCTTCAACTAGTGACATCCCATCAACATCAACAACCATCCTATCAGTCTTTGAGATATGGCTTCTATACTTTTGCAACACGGCTTGTGTGTCATGGCCATCCCCTCTCTTCCCTTGTCTTTGAGATGGTTCTAAGGTTGCTAAATGAAGATCATCTCATGGAATGTTCATGGCTTGAATTCCTGGAAGAAACGTGCCCTGGTTAAG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MRHHLRPLVSVRKRKGSVAGEALLSFFHLSIFSDRGKEDMLSVGIEDEEKWLAEGIAGIQHNAFYMHQAMDANSLREGLKYSAQMLSELRTSKLSPHRYYELYMRAFDELRMLEIFFKDESRHGVTVVDLYELVQHAGNILPRLYLLCTVGSVYMKAKEVPAKEVLKDLVEMCRGVQHPIRGLFLRHYLAQVSRDILLDINSEGEGDADTVMEAVEFVLQNFTEMNKLWVRIQLQGPARLREKQEKERSELRDLVGKNLHVLSQIEGVNLEMYKQTVLPRVLEQVVNCKDELAQYYLMECIIQVFPDEYHLQTLETLLGVCPQLQATVDIRMVLSQLMDRLSNYAVSNADVIPEFLHVEAFAKLSNAIGKVIEAQVDMPIVGAITLYVSLLTFTLRVHPDRLDYVDQILGACVKKLSSQPKLEDARATKQIVMLLSAPLEKYNGIVTALTLSNYPRVMDHLDNATNKVMAMVIIQSIMKNNSCISTADKVDVLFELIKGLIKDLEELSVDELDEEDFKEEQNSVARLLHMLHNDDPGEMLKIICIVKKHILCGGPNRLPFTVPPLIFSALNLIRQLQNQDGDVVGEEQHEVGDEAEEMHATPKKIFQILNQLIEALSSVPAPELALRLYLECAEAANDCDLEHVAYEFFTQAFIIYEEDIADSKAQVTAIHLIIGTLQRMNVFGVENRDTLTHKATGYSAKLLKKPDQCRAVYACSHLFWVDDPEGIKDGERVLLCLKRALRIANAAQQMANVTRGSSGPVTLFVEILNKYLYYFEKGNQQITNAAIQGLIELITTELQTDSPSANPATAPDAFFTSTLRYIQFQKQKGGVMGERYDSIKLEGMEWGALYHL* Homology
BLAST of Chy4G071210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4I0P8 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VPS35B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1272.3 bits (3291), Expect = 0.0e+00 Identity = 638/798 (79.95%), Postives = 721/798 (90.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7X659 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VPS35A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1118.2 bits (2891), Expect = 0.0e+00 Identity = 556/802 (69.33%), Postives = 679/802 (84.66%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8R7K9 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35C OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VPS35C PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1047.3 bits (2707), Expect = 9.1e-305 Identity = 526/803 (65.50%), Postives = 656/803 (81.69%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2HJG5 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Bos taurus OX=9913 GN=VPS35 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 607.4 bits (1565), Expect = 2.4e-172 Identity = 352/812 (43.35%), Postives = 509/812 (62.68%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9EQH3 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Vps35 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 606.7 bits (1563), Expect = 4.1e-172 Identity = 351/812 (43.23%), Postives = 509/812 (62.68%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CSM2 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503864 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1555.4 bits (4026), Expect = 0.0e+00 Identity = 794/802 (99.00%), Postives = 799/802 (99.63%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LE86 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G873280 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1555.0 bits (4025), Expect = 0.0e+00 Identity = 794/802 (99.00%), Postives = 797/802 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BQM1 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004898 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1489.9 bits (3856), Expect = 0.0e+00 Identity = 764/802 (95.26%), Postives = 781/802 (97.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J4Z2 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481301 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1472.6 bits (3811), Expect = 0.0e+00 Identity = 751/802 (93.64%), Postives = 778/802 (97.01%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FTJ5 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446704 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1471.4 bits (3808), Expect = 0.0e+00 Identity = 749/802 (93.39%), Postives = 778/802 (97.01%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. NCBI nr
Match: XP_008466470.1 (PREDICTED: vacuolar protein sorting-associated protein 35B isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1550 bits (4014), Expect = 0.0 Identity = 794/802 (99.00%), Postives = 799/802 (99.63%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. NCBI nr
Match: XP_011652456.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 35B isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN60048.1 hypothetical protein Csa_001380 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1550 bits (4013), Expect = 0.0 Identity = 794/802 (99.00%), Postives = 797/802 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. NCBI nr
Match: XP_038898001.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 35B-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1512 bits (3914), Expect = 0.0 Identity = 774/802 (96.51%), Postives = 790/802 (98.50%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. NCBI nr
Match: XP_022131851.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 35B-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1485 bits (3844), Expect = 0.0 Identity = 764/802 (95.26%), Postives = 781/802 (97.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. NCBI nr
Match: KAG6608605.1 (Vacuolar protein sorting-associated protein 35B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1469 bits (3804), Expect = 0.0 Identity = 751/802 (93.64%), Postives = 778/802 (97.01%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. TAIR 10
Match: AT1G75850.1 (VPS35 homolog B ) HSP 1 Score: 1272.3 bits (3291), Expect = 0.0e+00 Identity = 638/798 (79.95%), Postives = 721/798 (90.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. TAIR 10
Match: AT2G17790.1 (VPS35 homolog A ) HSP 1 Score: 1118.2 bits (2891), Expect = 0.0e+00 Identity = 556/802 (69.33%), Postives = 679/802 (84.66%), Query Frame = 0
BLAST of Chy4G071210 vs. TAIR 10
Match: AT3G51310.1 (VPS35 homolog C ) HSP 1 Score: 1047.3 bits (2707), Expect = 6.5e-306 Identity = 526/803 (65.50%), Postives = 656/803 (81.69%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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