Chy3G058300 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAATTAGCTCAGTTAGAGGCATTGTGTGAAAGACTTTATAATTCTCAAGACTCTGTGGAGCGAGCCCACGCTGAAAACACTCTGAAATGCTTCTCCATGAATACTGATTACATTTCCCAGTGTCAATACATTCTCGACCATGCATTGACTCCTTATGCATTGATGCTTGCGAGTTCAAGTTTGTTGAAACAAGTCACCGATCATAGCCTAGCTCTGCAGCTCCGTTTAGACATTCGTATTTTTCGAGTCTCTTGACAGCAACTTATTTATTTTTATCGGCATGCTATATTTGATTTCTAAATGGTAGTCATGAATGTTACTTGTAGGAGGCTATCTTATTAACTACTTAGCCACTAGAGGGCCTGATTTGCAGCCTTTTGTCAGTGCATCTTTAATTCAGCTACTATGCCGACTCACAAAGTTCGGATGGTTTGACGATGACCGATTTCGAGACATTGTTAAAGAATCTACAAACTTCCTGGGACAGGTGAAGTGATCTTTAATAAAATCTACGTCATAGTTCATATCTAGAGCGGGCATTGTGTCCACTTCCCTTTTCTCACCAGCACAAGCAAAAAATCCATTAATTTATAATCTGATTGGCTGTTGTAGTGGGAGAATGTCTCATCCGGCTTAAATTTAAGGAAAATTTTCTGATCAATAAGAAAAAAAAGTCTCTGATATATGTCATAATTGTAATTAGGCTTGGATATTAATTTCCGTTATGATTATTTATGAGTTATTAATTGTTTTTGTTAGCTGGCATTACTGTTAATGCAAGTCTCATGCAATGCAACCACGTAGCAGAGCAACTAGCAAATATTTTCTTTTATCTACATTCAACATTTAGGTTAAACGAGTTTCCTGTTAAATCACAATTATTAAACCAGAATCAGTATGAAAAGTATGCTGTGACAATACTACTTGTACAAAAATGAGATAAAGGGGTTCTGTTTGATTAGCATCCAGTTCCCCGTCAAAAATTTGTTCTAGAGATTGAATAAAGTTGTTAAACTGAAGTTCGTCGTCATTCCATGGTAAATTTATACACGGCCCATTTGATATGTTTTTAATATTCTTGTACTGGTGAAAAATATTCTTGTAGTTGCTCATATATATTTCTTAAAATTATATTGTTTATATTATCATTTTTGGCTAGTCCTTATATTTTTTAAATTATCATTTTTGGCTAGCCCTCCACATGATGTCTTTTTGTTTGGGAGACTGGCTTATAAATCTCCTCTTTGCATGCAGGCAACATCAGAACACTATGCCATCGGTTTGAAGATATTGAACCAACTTGTATCCGAGATGAATCAGGTTGGCTTTCTAATCGCTACCCTTGTTTATGTGATAATGACGATTCCATTTGGGAAAATGGAAAGTTAAATGATGATGTTTCTTTAGCAGTTATTTTTCTTGAAATTACTAAGGGGGCGTTTGTTGCGCAGAATTGAGTAGTGTTAGTTGGTAATTATTATAGGAAAGTAATTGAAGAGTTGACAAGAATAACGAGGTGAAAAATGTGAGTTCACATCAATGACGAGATAATAAACTTTTTTAATCATTGGTGAACCAAACGGTGGGTGAGTTTTTTTACCCATCCAACCCAACCCAACTTGGGGCAACCACCCCCTAAATTGTATCATAGATTCATAATGAATATTTTGTTGACGAGAGTAGTTATCTGTGGAGGGTTCATCATTATTCCCAGTTAGATAGTTCTTTGGTGTTAAAATCATAAGAAGGAATCTACCACATGCCAGTGTACTATTATAATCTCTTGTGGGTTATTTGATTGGAATGAACAGGTATATATGATCTTTCACGGAAAAATTTGTACTCAACAATATTCTTCCAATTTGGGAGGACTATTTCCTTACTTTCTAAAGATTACTGCTCTTGATGGGCTTCTCTAAATGATGATGAAATTTCCACTTCCGTACTTATGCAGGGAACAGTCTTAAACTAAAGTACCTCAAAGTTTCCCATATACTTTGAGATAGATTTGACGTGGGTCAATCCCTTTGAGTCAGTCCACTTCTTCTCCCGAAATCCTCTCTTTAAGCCTCCACTCAATGCTTGCTGTTAACGAAGCATTCTATCCAAGAAATTCACCAGAATTTGACCAAAGCTGTCAAACTAGCTCATCACATCATACGATATTAAGTTTCAAGATTGGATTTTGAGTTATACGTTAGATTGTTTGTTTTCCCTTTGCAAATTTTAGTGATGGGCTTTCTGTAGGTAGTGTCTCCTAGATTCTTGGAATATTTTAAATGGTTTGCAGGTTCTTTTCTTACTGGCAGGAGATTTATTCTACCTTTCCTGTTTTCGACTTAATAGATTTCAGGAGTAGAGAAGTGAACTTGAATTCTTGAAGAACTTAGATGATAGTTTGGACAGTATGGATAAGAAACAGCAGGAGCAATTTATGATCGTTATTACTTTTAGTGACATCTTTCATGCATTAACGCTAGAAGGGAGTCAACTGCTAATGGCAATTCTTGAATTGTGGATAAACGTGTTTGTTCTTAGACCTTTGGTTTGTTATGGTTAGGCTGTAGATGGTAGGTGTGATAGGTTAAAAGAAAGTTAGATTTTATTTTTATTTATCTCCATTTTTTGTGATGTGTCAATTGAATTAATTGATTGATTACTTGTGTTTGTTTGATTTATATATGTATTGATGTTGGTTGAATGAGTTGACTGTTTATTATGCTTGGCTGCTAGCTGTGTACATGGAAGTGTGTATGTTGTCATGAAGGTTTGTTTTGAGCTGAGATTTTCCAAAATTCTTTCCTTGAGTTAGTTGTATGTGGAATAGAAAAATTCCACGAATCTTTTATATGATATATGTGTGCGTTTATCTATATATAGATTTATTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGTCTCTACCCCTGCCTTTTGTGTGTATCTTCTCTTTGGAGCATATATATACACAAACATACTCGTTTCTTATAAAAAGTTGCTACTTTGTCTACCATCACTATATCTAATTGAGAAACCAAACTGTCATGAAGATACATGAAAAAATAGAAGTGGGCAATACCAGAAAAAAAGGCGGCCAATGCGGCTGCTACTACTACTAACGGTGTCTATACAAAGGACCCGAATTTAAAAAATCACAAAAAAGAGCTCCAATCAGCACATTTATGTAGTTTTTTAATTTATGTTATTTATCATTCAAGGATATGAATATGTTTCATTCTACTGCCTTCTTTTGGTGTGAAACTAAGCATCCTTTTGGCCACTATAACTTATCTTATTTAACATAGAGATCTTTGCAAGGTTTGATCTTGTATTCTTTCTCCCATTTGTTGTGGGACCTTTGGGGAGAGGGAAACAATAGTGTTTTAAGGGTGTGGAGAGAGACCCAACTGAGGTTTGGTCTTTGTTGAGGTTTCATGTTTCTCTTTGGGCTTCGGTTTCAATGGCCGTTTGTCATTGTGTTCTAGACAATATCTTACCTAGTTGGAAACTCTTTTCTTTAGTGGGGTTTTTCTGGGTTTGTTTGTTTGTATGCTCTTGTATTCTTTCATTCTTTCTCAATGAAAGTTGTCATTTCTATATAAGAAAAAAAAAACCTTAGAGACCGATGTTGTAATTCACCCAAAGGTCTTTGAAGTTTTTCCTGCTCTATATCATTTATCAATGAAATTATTTCTACATCCAGAAAAAAGTCATTCAATGTTTTGTTTGATTTTTCTTGATAATTTTGCTCCTTGTTGAAGACAAGTGCAAAAATTTCTGACTTTTTTGTATGCAGTATTAACTTTAGCTTCCATTTAGGTGTCTAATTCTTTATATTTCTTCATCTGAGTCATTGTATTTCTATTAAATTCGTTTCTTATTTAAAAAAAATAATAATTAAGTATTTCTATGCTCCCAGACTTTGTTTTTGTTAACTAGTTTTTTAGATAGGATCTTTTGAGCCTCTTCTGAGCTTTGTTATTTCATTTATTCGAAATAAAATGTAGGGTTTTATTTAAAAAATGCCCTTGTGCGTAGGAACTAGCAAATGGCCTAGAGTAATTAGACTTTTTACTACTTATTGCTAGGATAGGAACATTTCTATATCGATCATTTTCCTACATGGTTTTGAGTTCACTCTAGATCATATTTGTGAGGATTAGAAACTAAACTTTTACTTGTTGATTGTAGGTGAAGACATTTTCAGAAGATTTTAGACAGTGGTTATGTTCAAATACTTGTTGGAGGAAAGCATGTTTATTGGCTTTTTGGGGGCTTTCGTGTACTTAGTTTTTAAATTTAAATTTTTATATTTATGGTGGTGTAATGTCACACACACGGACTCTCCCTCCCTCCTTGGTCTTCATAGAGGATCACTCATCTTCCATATCTTGTAGGTTGTAATGATTGACATTCAATTAATAAAAATTCTCATTTTGTATGTAACAGCAAGTTTGCATTCAGAATCAGTATACCTACTTTGCTGCTCATGTTATGTAGTTTTAATTGGTTGCCTGCAATAATGTGGATTTATTATTATTTTTTTCATCTTTTCAAGCACCTTTAAGTTGAATTTCATGTTGTGTATTATTATGCGCTTCAACTTGTTCTTTTATTGACTTGTTGAATTTTTAGCCTAATCAAGGATTCCCTTCAACAAATCATCGGAGAGTGGCTTGTGCCTTCAGGGACCAAGCGTTGTTCCAAATCTTCCAAATATCTTTAACATCCTTATGTCAGTTGAAGAACGATGGTAATGTGCTAATCTTGCTGAGTTGTCAACATGACTAAACCAATATTTTTTTTTAATTTTTTAACCTTTCTATCTTAGAAATTTAGCTCGTTAGATGATGGATTTTATTTTATGTGACTTACAGTAGCTGGTCGTTTGCAAGAATTAGCACTTTCTCTGTCACTTAAGTGTTTATCTTTTGATTTTGTTGGGACCTCAATTGATGAAAGCTCAGAAGAGTTTGGGACTGTTCAGGTATTTCATTTAGTTA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BLAST of Chy3G058300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZLT0 (Exportin-7 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=XPO7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 548.5 bits (1412), Expect = 1.1e-154 Identity = 308/698 (44.13%), Postives = 446/698 (63.90%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9EPK7 (Exportin-7 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Xpo7 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 545.8 bits (1405), Expect = 6.9e-154 Identity = 307/698 (43.98%), Postives = 445/698 (63.75%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R9G4 (Exportin-7 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=XPO7 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 545.0 bits (1403), Expect = 1.2e-153 Identity = 307/698 (43.98%), Postives = 445/698 (63.75%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9UIA9 (Exportin-7 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO7 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 544.7 bits (1402), Expect = 1.5e-153 Identity = 307/698 (43.98%), Postives = 445/698 (63.75%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q704U0 (Exportin-7-A OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=xpo7-a PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 541.2 bits (1393), Expect = 1.7e-152 Identity = 300/701 (42.80%), Postives = 442/701 (63.05%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BC36 (exportin-7 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488430 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1347.8 bits (3487), Expect = 0.0e+00 Identity = 679/681 (99.71%), Postives = 680/681 (99.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KH87 (Importin N-terminal domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G400800 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1344.3 bits (3478), Expect = 0.0e+00 Identity = 680/682 (99.71%), Postives = 680/682 (99.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DVF4 (exportin-7 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488430 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1343.2 bits (3475), Expect = 0.0e+00 Identity = 679/682 (99.56%), Postives = 680/682 (99.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DVF5 (exportin-7 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488430 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1337.0 bits (3459), Expect = 0.0e+00 Identity = 678/682 (99.41%), Postives = 679/682 (99.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VH53 (Exportin-7 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold82G001070 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1333.5 bits (3450), Expect = 0.0e+00 Identity = 679/707 (96.04%), Postives = 680/707 (96.18%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. NCBI nr
Match: XP_011657452.1 (exportin-7 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1339 bits (3465), Expect = 0.0 Identity = 680/681 (99.85%), Postives = 680/681 (99.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. NCBI nr
Match: XP_008445379.1 (PREDICTED: exportin-7 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1338 bits (3462), Expect = 0.0 Identity = 679/681 (99.71%), Postives = 680/681 (99.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. NCBI nr
Match: XP_011657449.1 (exportin-7 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031743868.1 exportin-7 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031743869.1 exportin-7 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1334 bits (3453), Expect = 0.0 Identity = 680/682 (99.71%), Postives = 680/682 (99.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. NCBI nr
Match: XP_008445377.1 (PREDICTED: exportin-7 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_016899966.1 PREDICTED: exportin-7 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1333 bits (3450), Expect = 0.0 Identity = 679/682 (99.56%), Postives = 680/682 (99.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. NCBI nr
Match: XP_038886029.1 (exportin-7 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1330 bits (3442), Expect = 0.0 Identity = 673/681 (98.83%), Postives = 678/681 (99.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. TAIR 10
Match: AT5G06120.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1146.7 bits (2965), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/679 (82.33%), Postives = 628/679 (92.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. TAIR 10
Match: AT5G06120.4 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1146.7 bits (2965), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/679 (82.33%), Postives = 628/679 (92.49%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. TAIR 10
Match: AT5G06120.3 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1142.1 bits (2953), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/680 (82.21%), Postives = 628/680 (92.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G058300 vs. TAIR 10
Match: AT5G06120.2 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1142.1 bits (2953), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/680 (82.21%), Postives = 628/680 (92.35%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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