Chy3G055780 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy3G055780
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH03: 8544087 .. 8550562 (-)
RNA-Seq ExpressionChy3G055780
SyntenyChy3G055780
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATTTTTCATATTGCTGGACTTGGCGGAATTGATAAATCCGTGTTTCCCCGTGTTCTTTTACTGTTACTTTCTTTGATTAGGTAACTGAATCTTCTTCCTCATCATCATCATCATCCTCTAATTTGAAAATTTTCCATCTGGTTGATGTCTTTGTTCTTGGTTGGTGTGGTTTGTAGAACCCCATGCTATATTCTTTGATTTAGACTGTCTGTGTGGATTTACAAACTTCATCTTTATCTTGTTTTTGGCTTTGGAACTTTCAATTTGTTAACCCTAAACTCGAATAGCCTTTGAAGTTAATGATAATTTATTCAAAGTAATTTTTAAATCACATGAAATTCGACCCCCAAACTTCCAAAATCATGTCACAGAAATGTCTACACCTATATATATTTGTGTGTGTGCGCTATATCCCTGAGTGTTCTCCATCTACGATTATACTTAATAATCTAGCAACCCAATCAAATTGGTAAGTAAAGTACTTAGATATAGAATTTTCCAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAGAAGAAGAAGCTACAACTGGTCATAAATCCTTTAATGAAAAACTCAGCACGTGAAGGAATTAGTTTCATGACCAAATTCTATTTGATGAATTTAACCTGCACTTAATGATTTGTTCTCAAGAACCAATATGATTACATACTTTGATTCTTTGGTTTTTAGGAGCTACAAGTGTAACAATTTTGCCACCATAGGAAGACTTTTATGCTCTAGATTCAATATTTGTGCAGAGTAATTGAAACGTTTTCCTTATTCAAGAACTCACTCTCTTCCATTAAACTAGCCAACTATTTTTTTTCCAGATATGTCTTTGAGATCTTTCTGTTCTTCATAAGATGAGGAGGGTCCTGCCAAAGACAGCTTCTATATAATGTATAGCGATTCAGTATCATTTGATTGTTTTTACCTTTACAAAGTTCAGGTGTGATATTATTTTCTTGCCCCCCTCTTCTATGGTCCTTGGATTTGTTTTCCTGATCTTTTGTTAAAAACATGATATTACACCTAGATATTCTTGTTTATCCCATCTTCAATTTTTTTATCCACATGGTAACAAACTTGAAACGTTGATAGCGAAATTTGGGGTTTGGACGCCTCTTCATCTGTACTTGAGTTGCTTTATTACTGGAAGGTTTGAATTGCATTCATATTTTAAAGATTCAGGAAGATAAACATAATTGTATTGATTATGTTTTTGAGGAATAAGTGAAAATGTCCTTGCATTAAGTTCATTGTCTTTTTGGCTTGGTTTGTCAAACAGCCACTTGACCCACACAATTGTTGTTTTAATAGTTTACTGCTTAGCCTTTGGGATATAGCATAATGGTATCAGCAGACTTATAGCATGGTTGAGCCCATTTCCATGAGGTATTCTGTGGTTCAGTTTTGGTTTTCAGTTTATGTTTTCTACTAGCATGCATTATCATGAAAAGAGACTTCTCTATGCTTACAGAAGCATGAACTTTAGAAAATGTTAGGAACAATTATGATTCTTTTAGGTTAGCCATTTAAGAAAATCTCATTGAACTTCAAATATCTTGTTGTAATCTTAATTTGCCTCTGCAAAAGAAGTTTTAGGGGCTGCTTGGCCCACGGAAAGGAAAGGAAAGAAAAGGAAAATGTTCCCCCCCCCCCCTTTCCCTTTATATGCCTTCTCTCTCATTTCCTAACCCATCTCAACCCCCTATATTCCTTCTCTTTCTTTACACTTAACCCTTCTCATTCCTTCTTCCTCTTCTCTTTCCTTTTCCCCTTTTCACCCTATCTCTTCTTCATCCGGCCACCTCCATTCCCTCTCCATTTTCTTTACTGTTTGTTAGCTGTATCTCTCCACATTTTTCTCCATTTTTTTTTCTGTTTTCGTCACCGATTTCTTCACAGAGTCCCCTTTGGCTGCCGATCCACTATGAATCTCAAATCCTAAACCCTTTTGGCCGCCGATCTCCTTCATCTTAACCCCCTTCGGGCACGAACTTCCACTGTCCACCATTCAAGGGTACATATTCCATCATTTATCTTCCTCCTTTTTTTTAGTATCGTTTCGGTACTGGTTTCTCTTCTCTTTTGGTCTCCACCTTCCACCATTGGTATGACTTTCGTCGAATGGCCCCATTTCAAAAATGTTTGGGACCTCCGTACCCCTCCTGTGGGTTGGTTTTTGGTTGACCGACCGTTTTGGTTTCGTGCATGGCTTGTCTTCTAGACTTGCCACTTGGATCTATTACTCATCTTTCGTCTTCCCCTTTCCGCTCGGATCACGCCATTGCCGCTTCGATTCCCCTCTTACGATGAGTAACGGATACTACTTCGATTGTGGCCTTGGTGATTTTGAGCAAGGTAGGGATTGAGGTAACGATTTCTTCCTTCTTTTTAAATGCCGATGATGAGGAAATGGAAATTATTCATGTTTGATTTCAGATTCGTTGTTACTTCTGTCTTATTGATGTGTTCTGTTAACCGATTGTTTCATTTTTTTAACTTAGTTTGAAAAAAAATTCATCTGTTGAATGAAACTTCCCTTAGATGTGTTGTTGAACTTCTCGGTGCTCTGTCATATACAAATAGCCGTGTTTTTTTTTTAATTTAGTTGCATTTGTTTCCTTCATTCGACCATGTTGAAGTATGACGAGTCTTTGTTTCCATATTTTTTCATCTGTTGAAGGAGGTTGAACTTCTCGACCTGTTGTGTTTTCTGTTTGTGTGCATTATATATATACTTCCCATGTTTAATTTTTTGTTGTTGAAGACCGATCTCATGTCCTATACTATGCTTTGATGGTCACAGATGCCTACTGTTTTCTTCTTCTTGCTCTCTGACCTATGTTGTCTCTCTCTGACTTCTTTGACCATAATATTGATTCATTTGTGTTGTCTACTCCATTTTTGACATTAACAATAGTTGTACTTATTTGGTATGGTCTTTAATGGAGCATTGACTTGTGATTTTTACTCCTCCGTACATACCTTGTGTGTAGTTGGCATGTGTGGTATCATGTTTTCCCTTTTGCATATTCATGTCACCACGTTTGATCATCGTGCTACATTCCACTTCTTCACTTGTGTTTGACTTTGTGTGCGTGTCATGCCTTTCATATCACCTCATTTGATGACATTACATACGTGACGATTATTTCACATACGTATGAAGTTTGATTTCCTGATATCGAACGAACTTCCTTCCTCTGAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCGGTTTATATTTTTGTTTATATTTTTTGGGTGCACGTAACTTTTAACAGTTTGTTATTTGTCATACCTACGCAATGGTAGGTTTAAAGTCAAAGGTATACGACCACGTCCTTTTCCATATTTTGGTTTATAGCTTCTTACCATTTCCTTCACCGTTAGCAGGTTCTCCCTTCATAGTAGCTAAAAAATGGGTCTAATCGAAATCGTCGCTGTTGTCTCTGCCTTCACAATCACCCAACGACAGATGCTAATGATATTGGAGGCACTGTTGAATGACCACAAGAAGATAACTCAAATACCAGCCGTCACTAGAAATAGGATTAGGCACCTAGCGTACTTTCGAATGATACACGCGTCTGACCTTGTGTGTCAGCAAAGTACACGGATGGACAAACGATGTTTCACAATTTTGTGCCATCTACTATGAACAAGGGCCGGTTTAGAATCGACGGAAGTGGTCGACGTTGAGGAGATGGTCGCTATCTTCCTTCATGTGCTGGTGCACGATGTGAAGAACCGCCAGATTCAAAGGGAGTTCATACGGTCCGATGAGACAGTCTCACGACATTTCAACATTGTCTTGATGGTCGTGCTTCGTCTGCATGACGAGTTATTGGCTCAACCATAACCTGTGACGAGCATATGCACAGATGTGAGGTTAGGGCTAAAATAACCTACGGTTTTTTTTACTTGGAACTTGTCCAAACTCTAAACCGTCGTTCGATATTCGTTGTAGAATTGCCTAGGGGCATTAGACGGCACGTACATCAAAGTTAACGTGTCCGCAGCTGATCGACCAAGGTATCGAACCCCAAAGGGCGAAGTGGCAACGAATGTCCTTGGCGTTTGCTTCAAATGGGGACTTTGTTTTCGTCTTAGCTGGCTGGGAAGGATCCGTAGTGGACTCGTGTTCCCCACTTAACAGTCTGAAGGTTCCAAAGGGTGATATCATATGTTTCCACTAACCCACGCTAAATAAGTTTGAAATCTGTTTTTTTTTTCCTTTAATTAACGGCTTAACACTATGCAACCTCATATCTCTAGGGTTTTACTACATGTGTGACGTGGGATACCCAAATGCAGAGGGTTTTCTGGCGCCGTATAGAGGGCAACGATATCATCTACAAGAGTGACGTGGTGTTGGAAACGCTCTAACAACACTGAAGGAGTTCTTCAACATTTAACATTCTTCTGCACGGAATGTCATTGCAAGAGCATTCGGGCTGTTGAAGGGTCGATGGGCAATACTACAAGGAAAGTCCCACTACTCGATTCAAGTCCAATGGCGGACTATTATGGCTTGTTGTCTCCTCCATAATTTAATAAATCGGGAGATGACGAACGATAACATATTGGATGACGAAGACGAGGGTGACTTGACACACACAACTTCTAGTGGTGACGAAATCAACTACATTGACGTCTCAAATGAATGGACTCAATGGAGGGATGTCTTTGCAGAGTCGATGTTCAACGAATGGCAGTTGTGTAACGACGAGTTGTCGTACGTCTTTGGGAAAGACTGCGCGACAAGGGCCCGTGCAGAGATGTTAGAGGACATCGGGTCCAACGTGCCAGGACCCAGCAACGGTGTCTCCGCAAAGGATGGCCTCGAGACGAAGTTCCCAGCTATGTGCAGCCCGAGGATGAACCTCTCGTTGGACGACATGATGATCGGACGATCTGGTAGGTCCAGTGACTGTAGGTCGGGTTCTAGCGATCAAAAAAGAAAGTGTGACATGCAGACGCTCAAGACTTACGACCTTATTCGGGATGCCATGGACATTGCGAATGATCAGCTTAGGGCCATTGCGGAAAGACCAAATAGAGCTAGCCAGAAAGAAGATGTGATGATGTAGGAGGTCATTACGCATATGCAGTCTATTTCGGGCCTTAGTATGGAAGACATCAGTAAATGCGTGATGATAGTGATGGAGAAGGTGTTGCGAATGAAAAACTTCATCAGGATGCCCGATCCGATGAAGGCCGCATACTGTAGGGTCCTCCTCCGCAATAACCCATGACTATGGTGCTCTGTTTCCTTCGCAAGACATGTATTTTTTTTTCTTCATCGTATTCATGTTTTTGTTTTCCTAATTTGCCTTACCCGTTTGTACGTTGTAATGGACATTAACTATTTATTATAGTTTCTTTCCCAATATTGCATGATGAGTAATCAATTAATTTATGGAGAGGTCAGCAAATGCATAGTACTGGACGGTCGAAAATGTCATCGTTCTCTAAATAGGTAATGACACGTGATTTACGATAGAAATGTCACTTTTCGATTAAAAAAAAAATTGGTGCATGTTTAATAAACAAAAATTCGATTTGTACAAAAGAACGGAAATTGAAATTTTCAATTTGAACAAAAAAACAAAAAATGAAAATACCTGAAGAAAATATTTGGGTCATAATCTTTCCCACATAATCCTTCCCCAAACAAGGATTATAAACAATCCTCCCAAATAAGGATTATAATAATTCTTTCCTTTTCATAATCTTCTTTTTTTTTTATTCCTTTCCCCTATATTCCTTTCCTTTTCCGAAACACCCCGATGTTTTAAAAGGGAAGTTTGTCCCTTTGGAAATTAGTTCATAGCCAAATACATTTACCTGGTTTATTAGGTAATGTATTCTTTTTAAGGCAAAAATGTAACAGGAAAGGGATACTAGCGGAAGTGGGAGCACCCCACATACCTAAGAAACGGAGACACACAATATGCATGCTCACACAAGTTAAGGAAGCATGGCAGCCTTCTAGCAAATCAGGTTGCCTTAAAACTCAGAAATATATTCACTACTTTTATGATTTTTTTTTTCCTTCAATGACGATGGAGAGGGAACAGATATATAAGGGCAACCATTTTAATGTGTTTTAGTACTGTCATAAAGGTGGATTTAGTACTGAGTACTTTGTACCTTTGTATTTAGGATGAATACATTTTTATAAATAACAGAATTTAAGTATCGTTGCCGTATTTTGTTTGTAAGTTAGGAAAGGCTTATATACATTATTTTTCTATCAACTATTGCAATTTCTTCATATATTTTTTATACTACATTCTTTGATATTTTTGAAATTTTACACATTTATACAAAGGTTTCGTTGATCATCATGGATCAAATGCCACAAGTTCTTGTATCCCTGCTAAGATCTATCCACCTCATTAG

mRNA sequence

ATTTTTCATATTGCTGGACTTGGCGGAATTGATAAATCCGTGTTTCCCCGTGTTCTTTTACTGTTACTTTCTTTGATTAGGAAAGGGATACTAGCGGAAGTGGGAGCACCCCACATACCTAAGAAACGGAGACACACAATATGCATGCTCACACAAGTTAAGGAAGCATGGCAGCCTTCTAGCAAATCAGGTTTCGTTGATCATCATGGATCAAATGCCACAAGTTCTTGTATCCCTGCTAAGATCTATCCACCTCATTAG

Coding sequence (CDS)

ATTTTTCATATTGCTGGACTTGGCGGAATTGATAAATCCGTGTTTCCCCGTGTTCTTTTACTGTTACTTTCTTTGATTAGGAAAGGGATACTAGCGGAAGTGGGAGCACCCCACATACCTAAGAAACGGAGACACACAATATGCATGCTCACACAAGTTAAGGAAGCATGGCAGCCTTCTAGCAAATCAGGTTTCGTTGATCATCATGGATCAAATGCCACAAGTTCTTGTATCCCTGCTAAGATCTATCCACCTCATTAG

Protein sequence

IFHIAGLGGIDKSVFPRVLLLLLSLIRKGILAEVGAPHIPKKRRHTICMLTQVKEAWQPSSKSGFVDHHGSNATSSCIPAKIYPPH*
Homology
[Close]
BLAST of Chy3G055780 vs. NCBI nr
Match: KGN47517.1 (hypothetical protein Csa_019062 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 47.4 bits (111), Expect = 3.67e-04
Identity = 24/27 (88.89%), Postives = 24/27 (88.89%), Query Frame = 0 

Query: 1   IFHIAGLGGIDKSVFPRVLLLLLSLIR 27
           IF IAGLGGIDKSVFPRVLLLLL  IR
Sbjct: 96  IFRIAGLGGIDKSVFPRVLLLLLFFIR 122

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy3G055780 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy3G055780 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy3G055780 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN47517.13.67e-0488.89hypothetical protein Csa_019062 [Cucumis sativus][more]
BLAST of Chy3G055780 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy3G055780.1Chy3G055780.1mRNA