Chy3G052350 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy3G052350
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH03: 2532509 .. 2545784 (-)
RNA-Seq ExpressionChy3G052350
SyntenyChy3G052350
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CAAAAAACTTTAATACCACTCAAAATGAGGCCACCCAGTAGTTAGATTTGAATTTTTGAGTTCTTTGACATTGTTCTAAATTGGGTCCTTTCTTCGTAGGCTATAGCGCTGACCCTTTCAACGTTTTGGGACGAAAATAAAAACTGACTCTCGGACATATTTTTTTCGGCCTTTATGGACAAAAAACTTTAATACCACTCAGAATGAGGCCACCCAGTAGTTATATGTGAATTTTCGAGACCTTCTACATCGTTCTAAACTGGGTGCTTTCTTCGTAGGCTATAGCATTGACCCTTTTTTCAACGTTTTGGGACGAAAATAAAAACTGATTCTCGGACATATTTTTTTCTGCCTTTGTGGGCAAAAAACTTTAATACTACTCAAAATGAGGACACCCAGTAGTTAGATGTAAATTTTCGAGACCTTCGACATCGTTCTAAATTGGGTCCTTTCTTCGTAGGCTATAGCCTTAGCCCTTTTTTCAACGTTTTGGGACGAAAATAAAAACTAACACTCGGGCATATATTTTAGGCCTTTATGGAAAAAAACTTTAATACCACTCAAAATGAGGCCACCCAGTAGTTGGATGTGAGTTTTCGAGACCTTTGACATCGTTCTAAATTGGGTCCTTCAATTTTTTCGTAGGCTATAGTATTGGCCGTTTTTTCAACGTTTTGGAACGAAAATAAAAACTGACTCTTTGGTATATTTTTTTCGGCCTTATGGGCAAAAAACATTAATAGCACTGAAAATGAGGCCACCCAGTAGTTAGATATAAATTTTTGAGACCTTCGACATCGTTCTAAATTGGATTGTTTAATTTCTTCGTAGACTATAGCATTTGCTGTTTTTTCAACGTTTTGGGGCGAAAGTAAAAACTGACTCTCAGACATTTTTTTTTTGGCCTTTATGGGCAAAAAACTTTCATACCACTCAAAATGAGGTCACCCATTAGTTAGATGTGAATTTTCGAGACCTTCGACATCGTTCTAAATTGGGTCATTTAATTTCTTCATAGCTTATAGCATTGGCCCTTTTTTCAACGTTTTGTGACGAAAATAAAAAACTTGACTCTCGGGCATTTTTTTTTCGGCCTTTATGGGCAAAACACTTTAATACCACTCAAAATGAGGCCACCCAGTAGTTAAATGTGAATTTTCGAGACCTTCGACATCGTTCTAAATTGGGTTTTTTAAATTCTTCGTAATCTAGAGCATTCCATTTTTTCAACGTTTTGGGACGAAAATAAAAATCGACTCTCGGGCATATTTTTTTCGACCTTTATGGGCAAAAAACTTTAATACTAGTCATAATGAGGTCACTCAGTAGTTAGATGTGAATTTTCGTGACCTTCGACATAGAACCGATTGAAGGGTTGATCAAAGGTTAACTAAGCTTTCAACCGATCAAATAAAATTCATATATATAGTTAATTTTTGCTGTTCCTAATTTATATTTTAAAATTTTAAATATACCATTTGGTTAAAAACTCCAACATTATATAATGCTATACTCCTAGTTTGATATTAGTGTCGTATTGTTCATGAGGATGGGTTTAGAAGGGAGCAAATTAAAACACACTGCAGGTGGAATTGGAATTATTCTAAGTGTTTTCTAGAACGATTCTTTTAGTCAATATGATTTGTTAAAAGCAATGGAGGAAATAAAAAGTGTTTGAATAATTACCCTACACACTGACATTTATGTTTCTTCCACAGTTATTTCACATAGCTTGAATCCATATATTCTTTGCAGTCCAAAGACTTTTCCTTTCGCTAGTGATGCCTTTTCATTCCACTATAAAAAGATCAAATCCTCATCCCTTCCTCTCTAAACTAAACTAAACCACACCAACACTCTCACTTCTAAATTATTCATCTATCTATCTAATTACTTCCTTCTAAGAAATGGGAGGCCACAAGCACAAGAAATCTCATTCATCTTTTTCTTTCTTTAGTTTTTTCAAATCCAAATGGAGCAGAAAAGGAGACCACTATGATGACCACAGTGGCTCATGGCTAGACGAGAAGTCGAGATCGGGCAAGGTGTTGCCAAGTGATGAGGACAAAGCTCATCATTGGGTTGCTGAACCCGGTATTGATCGAAAGGCCAAAGATTACATTGATAGGATCTATCGAAACCGTGTTTTCGAATTCGAGCGTCAAACCGTCACTATACCTACCAATGTGTAAATAATGTGTAAATAATTTTTTGCATAGAGTATTAGTTCATTAAACTTAGCTTCGTTTAATTATATGATACCCTAGAAGAAAACTTTATATCAACACTCAAGTAATGTGATGTTGAATCCAGTATTGAAAGAGTGTAGTAAAATGTCTTCGTAAAAGTTGTATAATATGACTTTGTTCTTTATCCTAAAAATAAAGGCACAACTTTTCCTTCTTTTTTCTCAATGCTAATTATGATCTCTAAATTATCTTATTTGTATTCTTTACAATTTTTAATCAGTTCAGTACTCAACCAATGACTAACTTTTAGTGACTATTGGTCACAAACCAAACTTTATAGCATAGTTTTTTTTCGGATTGAATACTTGTACGTTGACTAATTGTATTACTTATTGGCAGTGTATATTTGCACCAAGAATTTTGCGTCTAACACGTATCACTTGACCATGAAACTTAATTGTAAATTTCAATAAATAACCCAAAAATGAACATTATTATCCAACGTTGTTTTTGAATCGTTATCGAACAGTTGAAAACTCATAAGAAGCTGTAGCAACATTAGGGCCTAATTTAGAGCAATTTATTTTGGCTTAAAAAGGCAATTATATTGTATATAGTGATAAGATAACAGTATTAATGATAGACATAAAATGGTATACATCAATTATAAACATGTACATGATGAATGATAGAAGACGTAAAAATAACATACCAAACATATAACAATGATTGTTAATAGAACCAATCAACAATAAAACTAATCTGACATACTATTGGTCTATTGCTAATACAAAAATAAAAAATTACTTTTATAAAATAAACGAAATGAGGTGTTTGGGGCGAGCAATGACTTATAATAGTTTGAGGATTATAATAGTCAAGAAACCACTATTTAGAAATTAATAATTTAATTGAAAAAAAAATATATATATAATTCTCTTTCTACGTTTGGGGTACAGGCTATTATCTCAGTGTTGCTTCCTGAGAAAAGGAGAAAAGAAGCGAGAACAAATATTGTCATGATACTAGGATTAGGAAAATCCTAATCCTTTTATTACACGGCCAAACGTGGAGTGGGCACTCCTCTATAATCCGGCAAATAGTCCCAAATAGCTTATTAATTAGAGATATTTATCAATAATGTATAAACTAATTAGAATGGTTTTATTTGATTGACCAAAAATAAAGTTGTTTCTTAATGATAAAAGTATGTATCAAACACGACTCATATTTTTGCAGACTACTTGTTTATTTGACATATTAATAAATATGACAACCAACCATTCAATCTATTATACAAGAGTATTCTAAAGAAAATTGGTTATAATTATTCTTCCCAAAGTTGGATGGAATCATTTTTGCAAATTTTTCTATTTTCAAAATAGTAGATTTAGCTTAAATACATAATTATAAGGGCCGCGGACACCATCTTCTCGCCGTGCTTATCTCCAGCTTTTACAGAATTAAGCAACTAAAAACATAATTATAAGGATTGCGGACACCAGTTCCCCCCGGCCTCCCAACCTACAATGACACGAAAATTAATTTAGATATATATCACCAATAAGAAATTAAAGAACTTAAAAGTTGAAAAATACGTACCTCAATGGAATCAGAGTCCTCTCTGTGCCCGAGTGAGTTCTTCAATCATCTTCCTTATTTCATCCATATGTTGGACATTTTCTTCGTGTTTTCAATTACTTTCTTGTATTGCTCGCTCATTCATGTTTGTCACTTCCTCAAGACGAGCTTTTAGCTCGATAACCTCCTTGGCGTGCATCTCTCACTCGTATAATGTAGACGAAGATCTGCCAGCAGTGTTTCAGGACTTTGGCCTGGGGCCCCAACCAAGACCTTTGAGTAGACCAATCGTCTACCCAAAACTGCCTCGCATATCTCGTCCCTAAAGAGTGGTTGAGAACCCTTTGGGTGGGGTGAGACTGGAGTTCTAGCATTTGATTCTGCAAGAAATTTTTTTATTAACTAAGTCAAAGTTGTAAATTAAATGTACAAAATAAGGCACAAGTACCACAGAAACTTACATGAGCATCCGCAGTTGCTTGCGAAACGAACTGACTACCTCGAGTGTGCGTTTCCTTAAACAACTCCACACAGTCGAATTGATGACCTCGTTGTTCAGCGAGCTCGTGTTGTCATTTTAGAAACAACTTGGAGTCGTTGTTGTGGTTGTAGGGCTGCTTCGCTTTAGCAGTCCTGTTAATCGTTGATTGCTCCTATATACAAATAATCAAAATGCTACATACAAAATAAAAACAAAAAATGAACTACCGTTTAAGAAAATTAAAAGTTCTTAATCACCTGAAACTGTCGAGTAAGGTAGTGATCGCAGAGGAAATGTGAATCTTGCATACAAATCTTCAATCTGGGGGATGGGTTGGCACATGCCTATTCAGGATCATTGAACTTCTTAAAATGACGATAGTTATTCCCTTGAACTCCTTTCAGATGGTGAGCATTTGATGTTCAACAAACTGAGCACATGTTGGATCTATAAAATCCAGCACAAACCACTACTACAAAAGAAAAGTACACACGTATTAGGATTCTATATATATTTAGGTAACATATATGTTTGGGTAATTTAAAAACTTACCTGTAAACCGCACTTCACAAACTTGATGTACTCTGGAGTAATGTCAATCCACTTAAGCAAGCAAATTGGAAAAACATCCCGCGTTAACACGGCGATGGTACAGCTGAAGCGAATGGCATGTGGCGAGATCGGCGTATCTTGTCCTAGAGCGATAGATATGGGGATCTTCTCATTTTCCTGCACGTATCTATCCAATT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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

CAAAAAACTTTAGAGAAATGAAGATAAAGATCCTCTTGGCTGCAACACATATGTGAGAAGATAAAGATGAATTCTCTCGGCTGCAACACATGGAAGAAGATGAAGATGAATCCTCATCCTTTCGATCGCAACACATGGGAGAATATGAAGATCCTCTTGGCAGAACCCTATGTATTTATGTCAACAGACAACTTCCTCTTCATACATGATGGGACACGACTGTGAATCTTCTCGTCATTGTTTTCTTTATGAAATGGTTTTGCCTTCAAAGTTTTCATCTCTCTTTCATGTTGATCGATTGTCATCTTTAGACGATCAAAAGTAGATGTTGAAGGTCGATCTTTCCTCGACGTGTAGATACTTAGCCTTTTGAAAGTTGAAGTTCTAGTGAAAGAGACGTTGGACATTGGTTTTCTCCTTCTTTCGTGGCCATATTCAATATTTGAAAAACTGAAGATTGAGCAGTTGAAGGCTTGATAGATCAAAAACGAAAGTCCT

Protein sequence

QKTLEK*R*RSSWLQHICEKIKMNSLGCNTWKKMKMNPHPFDRNTWENMKILLAEPYVFMSTDNFLFIHDGTRL*IFSSLFSL*NGFAFKVFISLSC*SIVIFRRSKVDVEGRSFLDV*ILSLLKVEVLVKETLDIGFLLLSWPYSIFEKLKIEQLKA**IKNESP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy3G052350.1Chy3G052350.1mRNA