Chy3G049940 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCTACACTCGAAATCGAAGCTAGGGAGTATGTTTGCTTTTTCATTCATCACTTGGCCATTTCTCAGTGCAATCTGTGTCTCATAGTACCCAGAAATTTCGATGATCGAAGGGAAAAACGAATTACTTTATGTGCTAATTCTGAGCTGCTTCTATTTTATTTTTACTTATCTATTTTGGTTTTTCGTTTATTAGGTTTTCAAACTGCCGGCTATACGCTATAGTACATTTCATTAGTTTTCCATTGTTCTCTGTTCATATTTGTAGCTGCTTTCTTTATTTAGTTTATATCTAAAGATCGCAGAACATTGGCATTCTCTGGTTTGCTAACCACTTTGAATGCATTTGCGATGATTTACTGTTAAAAGTTATATTTACTCAACTTTCCGTTGGGTGTGATCTCTAAGCAGCAATTCACATATGACTTTGGGCTCAACTATTGATCACAATGCTTTTCATTCAGTGTCATCAAGATCGTTCTTCAGTTTTGTAAAGAAAATTCATTGCACCAAACGTTCCAGACGCTACAGAACGAGTGTCAGGTTTCTTTGAATACTGTAGACAGCATTGAAACTTTTGTTGCTGATATAAACTCTGGACGGTGGGATGCTATATTGCCTCAAGTATCTCAACTTAAGCTTCCAAGAAATAAATTGGAGGACTTGTATGAACAGGTAAAGTTAAACAAACTAATATTTTATACTTTAGGACAAAATGGTGCATTTTGCTTTTGGAAGAAAATTTGTACTCGATGAATGGCAGAAAGATTTTACGGTACAGATAATTTGACTATCCTTAAGCATGTAGTCCCCTAGTGAGTTGGGGTTGGAAACATAGATGGAGGGGTTGACAAATGGCTTTGTGGCAACATTATAGATGAGCATGGGATTCTAGAAATGTCTGGAACTCAAAATTTGAAGAAAGAGGACTCTATGGTAGCATTTATTTAATCACATTTTACTTTTATAAGAAACCCGTATATATAGTAGCATTTTGAATATTAAGTTCATCTGGGTTTGGGATAACATCATCTGCTATACTATTCAACAAGTTCTCTTGTTGGCACAATTAAGATTTATCTTCTATTTGATTGTTTTTATTAATTATTTTTGTAAGAAACAAAGACGATTCACTTTTGGCAAGAGCTTGTGAGTCTTCACTCTTCTTTTTGCTGGTACATTATTTATTCTTTTTATCAAAATGAAGGTTGGAGAAGTCAACCAACTACCAAGAGAAACTTTCCTTGGAAGTGTCGAAAGGGAAATTCCCAACATACTAATATCTTTGTTTGGACTGCTTGTTTTCATTGCCTCAATAGGTCAGAAAGGTTAGAGCCTTAAGTCCTTCCTGTTTTCCTCTTTGTTTTTAGAAAAAGTTTATTTCATCGGATTTCGATAATACATTCACAGCGTGAATTCTATTCTGTTTTCCTTGTACATTGCCTGTTTTATAGCTCTCCTCCTTAATTTGAAACAAGAACACCGTCGACGGCAAAATGTACAAAAAAAATAAAATTACGAAGAAGGAGATTATTGCCAGGATTGATGAGATTGCTGCTCGAGTCGGATGGCCTCCTTAACATCGGTCTCATTGAGGAGAGGTTTAATTTAAAAAGGAACCTTGAGGAGGTGATTTAGAAAGGATAATGTGAGTTGGTATCGAAAGTGTAAAATCAAGTGGGCCAGGGTAGGAGATTGTAGCTCGGGTTTCTTCCATAGAATGGCTAATGGAAGAAGGAAGAAGAATCATATTGGTCATTTAGTTTTAGACAATGGGGTTTGTACTAGAGATAGGATGGAAATTGAGGAGGAGATCTTAAATTCTTTGTCTAATTTCTATAGTCCTGCCCCCCCTCCTCCTCCCGCTCTTTTGCTCGTTAGGCTTCTTTACTACACTCATTGTATATCTCTCTTGTACTTTGAGTTATATTCTTAATAAAGAAGTTTGTCTCTGTTTAAAAAAAAAATCTCTATAGTCCTGGGGTGTTGATTAAGTCGTTTGTGGAGGGCATAAACTGGAGTCCTATATCAACAAGGGAGGATGAGGAATTAGTGGCTCCTTCTCGTTAGAGGTAAATGAAAATGTTGTTTTTAGTTATGATGGTAACAAGTCTCTTGGCGCAGATGTGTTCTGTAAGGAGAATTAGGATCTTATCAGAGGAGACTTGGAGTGGGTTCAAGGAATTCTTCATAAGAAGGATTTTGAACAGCTTGTTGATTGAAACCTTAATATGCTTGATTCCTAAAAAGGAAAACGCGAATAGGGTGAAGGAGTTTCGACCTATTAGCCTCATTACTTGCGTCTACAAGATAAGCTCTTGCTAATCGTTTAAGGAAAGTGCTCTCGTCGACAATTTCTAATTCTCAGGGGGCCTTTTTGATTGGAAGGCAGTTTCTAGACCAAGCTTTGATAGCTAATGAAGCTATTGAGGAGTATAAATGAAGCTATTGAGGAGTATAGATTGAAGAATTTGGAGGGGTTCTGTTAAAACTTGACTTTGAGAAAGCGTACGTCCACGTGGATTGGGATTTTTTAGAAGACTTTGGTTATAAATGGAGAATGTGGGTGTGGGGGGGTGTTCAAAATGTTAAGTATTTCATTCTCATCGATGAGCCCAAAAGGGTCGGTTCAAGCTTCTAAGGGTCTAAGACAAGGGGATCCACTGTTCCCGTTTCTGTTTTTACTTGTGGTGGATGTCTTAAGTCGGATGACAACAAAGGGGTCGAGGGAAACATTATTGAGCCTTTTAAGATTGGTAGAGATGGAGTGGTCTTATTGCACCTTCAATTTGCTGATGATCCAATGTTATTTTGTTTCAGAAAAGAGGAGTCTTTCCACACTCTCAATCATATGGTTGAGTTCTTTGAAGAGATGTTGGGGCTGAAAATCAATAGAAGCTGCACTATTTATGGTATTAATTCTGATCAAGCTAAGATTTAGAGGCAGGCTGAGGTTTTTGATTGTGAGGTGGGTTCTTTCCCATCTTCTTACCTTGGGCTTCCTTTAGGGGGTAATTTGAGATTTGTGTCCTTTTGGAACCCAACATGTGACAAAATTTGCAAGAGATTGGAAGTGTGGAAGAAAGGGTTCTTCTTGAAAGCTGGCAGATTAACTTTGATTAAATCCGTATTAAGTGGTATTTTGGTGTATTATCTTTTGTGGTTTAAGTCCCCTAGCTTGGTGTGTAAGAGTATTGAAAAGTACACGAGAGATTTCCCGTGGGAGGGGGTAGGGAGGGTCATGGCTCCCATCTGGTTAATTGGGAGTTGGTGGGGTAACCCATGAGTCAGGGGGGATTAGGGATTGGTAACCTTAGAATCCGTAACATAGCTTTGTTGGCAAAGTGGCTTTGGTGCTTCTATCTTGAATCTGATTCTCTTTGGCATAGGATTATTGTGAGCAAGCATGGTCCCCATTCTTTTGAATGGACGGCGTTAGGTGTTAAAGGCACTTTCTGAAATCCTTGGAAGGATATTTCTTTAGAGCTCCCTTCTTTTTCTCGATTTTCTTGCTGTTTAGTGGGGGATGGTAAGGACACTTACTTTTGGGAGGACCAGTGGGTGGGGGAGAAGGGAATTCCCTTTGTTTGATTTTTTTGCATCTATTTCATTTATCCTCTTCCAAAAATTGTACTATCTTGGACCTTTTGGTGAGATGTGAGAATTCCATGTCTTTCTCTTTCGAGTTTCGTTGTAATTTGACCAATAGGGAAACAATAGAGGTGGCTTCTCTTCTTTTCTTGCTTGAGGGGTGCTCTGGGAGAAGGGATGTTTGTGTTTGGAATCCTAATCCTAGTTGGGTTTCTCCTGTAAGTCTATGTTTAGTCTGTTGTTGGATCCTGCCCCCCTTAAAGCGTCGATTTTTGATTTGGTGTGGAGGAAAAAGGTTCCTAAGAAAGTTAGGTTCTTTATCTAACAAGTCTTGCTTGGTGAAGTTAATACTGTTGATAGGCTTGTTAGGAGAACTTCGCTTGTCGGGCCTTTTTGTTGCATGTTGTATTAGAAGGTCGAGGAAGATCTTGATATTGCTTGTTGGGATTGCCAGTTTGCAAGGGCCGTGTGGTGCTCCTTCCTTCAGGAGTTCGGTGTTAGCTTTGCTGGTTTGCAGAGTGTCAGAGCGACGATCTAGGAGTTCCTCCTCCATCCGCTTTTCAAAGATAAAAGGGGTTTTTTATGGCTTGTAGGGATGTGTGCAGTTATTTGGGACATATAGCGTGAGAGGAATGATAGGGTGTTCAGGAGTAAAGAGAGGGGTCTTACTGAGATCTGGTACTTGGTTAGATTTCATGTGTCTCTTTGGGCTTCAATTTCGAAGAACTTTTGTAACTATTCCATAGGCAATATTTTACTTAGTTGGTCCCCTTTTTTTGTAAGTGGGGTGGTTTTGGTGAGCAAGTTTTTTTTGTATGTCCTTGTATTCTTTCATTTTTTTTTCAATGAAAGTTGTTTTCATAAAAATTGCGAAGACAAGTGTCAGAGGAAAGAGTTTCAGCTAGTTAATAGACAAGAAGAAAAGAACGAAATCTCGAATTCCACATTCTGAAATCACTAGTATATTGCCTCCTTTCCTCCATTTCACAACCTTTTTCTTCATAAGCTTGGTGATAAAGTCTTTTTTTTTTTTTTGATAAGAAACGGAGATAAAGTCTTAAACACTTTAAACTTTGGTTAGAATTGTAGATTATGTACATTTAATGTTTGATTGCACTTCTCTTAAGAAAGTTCATCAGTTTTGAAAATCTTGACGCATCTCATGATTTGAAACTTTCTTGTAATTCTGTTTTCAGATTGTATTAGAAATGATTGAGCTTCGTGAATTGGATACGGCTCGTGCTATTCTAAGGCAAACTCAAGTGATGGGTGTCATGAAGCAAGAGCAACCTGAAAGATACCTGCGACTTGAGCATTTATTAGTCCGAACATACTTTGATCCGAACGAGGTAAGGGCTAGTTAATAAATCTGAAAACTTTTTTTTTTCATGCAGGTTACTAGT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MSTLEIEARDVIKIVLQFCKENSLHQTFQTLQNECQVSLNTVDSIETFVADINSGRWDAILPQVSQLKLPRNKLEDLYEQIVLEMIELRELDTARAILRQTQVMGVMKQEQPERYLRLEHLLVRTYFDPNEAYQDSTKEKRRAQIAQALAAEVTVVAPSRLMALIGQALKWQQHQGLLPPGTQFDLFRGTAAMKQDVEDVYPTTLSHTIKFGTKSHAECARFSPDGQFLVSCSVDGFIEVWDYISGKLKKDLQYQADETFMMHDDPVLCVDFSRDSEMIASGSQDGKIKVWRIRTGQCLRRLERAHSQGVTSVVFSRDGTQLLSTSFDTTARIHGLKSGKLLKEFRGHSSYVNDAVFTNDGARVITASSDCTVKVWDVKTTDSLHTFKPPPPLRGGDASVNSVHIFPKNADHIVVCNKTSSIYIMTLQGQVVKSFSSGKREGGDFVAACLSPKGEWIYCIGEDRNMYCFSHQSGKLEHLMKVHEKDVIGVSHHPHRNLVATYIFWMDFGIILNDDNPCMESYDGVACACPSVLSKDKVKLRNVSFIACGMIITRSEQHGILQAYSMTVRNYGKKVANFGQTEYDVGRVENLSDGLAFKKLDDLKNSINPRIRLSSNECYVSRRG* Homology
BLAST of Chy3G049940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W117 (Suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SMU1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 896.3 bits (2315), Expect = 1.9e-259 Identity = 432/499 (86.57%), Postives = 473/499 (94.79%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZME8 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=SMU1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 691.8 bits (1784), Expect = 7.1e-198 Identity = 334/501 (66.67%), Postives = 410/501 (81.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2TBS9 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Bos taurus OX=9913 GN=SMU1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 2.1e-197 Identity = 332/501 (66.27%), Postives = 410/501 (81.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q76B40 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Cricetulus griseus OX=10029 GN=SMU1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 2.1e-197 Identity = 332/501 (66.27%), Postives = 410/501 (81.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2TAY7 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMU1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 2.1e-197 Identity = 332/501 (66.27%), Postives = 410/501 (81.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3I2 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485374 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1006.9 bits (2602), Expect = 3.7e-290 Identity = 499/502 (99.40%), Postives = 500/502 (99.60%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DGD4 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1002.7 bits (2591), Expect = 6.9e-289 Identity = 495/502 (98.61%), Postives = 500/502 (99.60%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HHA4 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463533 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1001.5 bits (2588), Expect = 1.5e-288 Identity = 495/502 (98.61%), Postives = 500/502 (99.60%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JTQ7 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487429 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1001.1 bits (2587), Expect = 2.0e-288 Identity = 495/502 (98.61%), Postives = 500/502 (99.60%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FGH2 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445274 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 994.6 bits (2570), Expect = 1.9e-286 Identity = 493/502 (98.21%), Postives = 497/502 (99.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. NCBI nr
Match: XP_004138672.1 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 [Cucumis sativus] >KGN63274.2 hypothetical protein Csa_022473 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1006 bits (2602), Expect = 0.0 Identity = 501/502 (99.80%), Postives = 501/502 (99.80%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. NCBI nr
Match: XP_008441151.1 (PREDICTED: suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1003 bits (2592), Expect = 0.0 Identity = 499/502 (99.40%), Postives = 500/502 (99.60%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. NCBI nr
Match: XP_038886288.1 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1001 bits (2587), Expect = 0.0 Identity = 497/502 (99.00%), Postives = 499/502 (99.40%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. NCBI nr
Match: XP_022152482.1 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 998 bits (2581), Expect = 0.0 Identity = 495/502 (98.61%), Postives = 500/502 (99.60%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. NCBI nr
Match: KAG7033424.1 (Suppressor of mec-8 and unc-52 protein-like 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 998 bits (2581), Expect = 0.0 Identity = 496/502 (98.80%), Postives = 500/502 (99.60%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. TAIR 10
Match: AT1G73720.1 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 896.3 bits (2315), Expect = 1.3e-260 Identity = 432/499 (86.57%), Postives = 473/499 (94.79%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. TAIR 10
Match: AT4G02730.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 109.4 bits (272), Expect = 1.1e-23 Identity = 78/292 (26.71%), Postives = 133/292 (45.55%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. TAIR 10
Match: AT3G49660.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 6.9e-23 Identity = 60/185 (32.43%), Postives = 94/185 (50.81%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. TAIR 10
Match: AT5G25150.1 (TBP-associated factor 5 ) HSP 1 Score: 89.4 bits (220), Expect = 1.1e-17 Identity = 54/188 (28.72%), Postives = 89/188 (47.34%), Query Frame = 0
BLAST of Chy3G049940 vs. TAIR 10
Match: AT2G21390.1 (Coatomer, alpha subunit ) HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 7.4e-17 Identity = 57/170 (33.53%), Postives = 82/170 (48.24%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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