Chy2G039830 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTTAAAAATAGCAAAATAAATTAAAATATTTACAAGCTATAGCAAAATTTTGGATTCTATCACTGATAGTCTTTTATCATTATAGCATATCAATGACTATCAGTGATAGAATTTGCTATAGGTTGTAAGTATTTTGTAAAATCTACTATTTTTAAAAATTTCCGTTTGAAATTTTTATTAATTTAATATTTTTTAAATTAATAAAATCTCATTATTCTCTCATACTTCATTTTTCTACTCCAAAAAGGAAATAGAATTATAAATATCTAGAAGAAAATAATTTTCTTTAATCACATAATCAAGAAAAAAATGAATGTTTTTGCTCTCTGCAAAAAGAAAATAGTTTCTCTCTAAATATTTTTTCCATCTCAATTGGTTCCCAGAAAGCAATCTTATTCTAGAGGATAGAAAGGTCTCCGACGTGGTGTCCAAATTTAGAGATTTACTTTTTAGATTTATAGACATAAACAAGTAAGTTTTTCTTTCTCTAATCTATAATTAGAAAGCATGCTTAGTTTTTAAGTCTTAGTAAGAAAACTAGTTTCTTAATTATTTTTGCCAAATGTACTAGTATTTTGAGATTCCCAAATTAAATTGAGGAATGGTTCTATAGAATCTTCCGCTGCCATAGTGTTTTTATCCCTTCAATTGGTATCAGAGCCATATCAAATTTTAATTGAAAATTTTAAATTTTGCATTGGTTAGGTGAGATTTTTGCATAATGAATGTGGTTTGCAAAATAGATATTTTCGATTTTGGCACCTTAGATTACAATTTTTCATTAATTTGATTGATGTAAGAGCCTGTTGTTTTGAACATTTTAGTTCTGTAATCGAGTTTGTAAGTTCGTGTTGTTCGATGGCAAGTGTTGCAGTAGCGTTTAAAAAAAAAGTAAATTGAAAACATATATCCTTTTGTGCTTGTGTAAAGGTTCATGAATGGGTTTCTGGTCCAGTGGTTGTTTATCCACCATTATGCATATAATTTAAAATTCTACCTTAGGATTATAATTATCATGCATCATTCTTAAATATAAGCGTTATATTTTAGTTGCATGATTTTCTAAGCATGTTCATGCATTTTTATATATTATAAGTGTTATAGTGTATGGTTTTAATGCATGATTTTTTAATTTCATGAGTTCTTTAAAGTATGTTGATATTTTAAATATATGAAATTGGATAAGTATGATGCATGACATTACTTAGTTAAATATAATTTGTTATATTTAAATTAATGTCTTGTGTACGCTTGATTGATTTTCATGTATTTATTTTAATATAAGTGTTATATTAATCAAAATGAAAATCAATTTGCATTGAGCATATTACATTCATAAATTAATATAATTGTTATATTAATGTAATGTTATGTATGTTGTGTGGTTTATTTTTTTAATTAAAATTTGTTTTAATTAATTAAACCATAGTATGAATATTATAGAACTAACTAATTAATTTTATAATAGATATAAAATTTGATCATTAGAAACCATCAACCTATAATAAAGAGTTGAATGCAAACATAGGATCTTAGGATTAATTTGATTTAATTTTAAATTATTTAAAATTAAATAGACCTAAGATTACATTAATTCTAATAGGATTAGAATTATGTCTTCTTTTAGTTTAATGAAACTAAGTAGGACAAATAGGATTTAAGGTTATAAGAGAACTCCACCGGTAAAGTTCTGTCTAAGGCTGGAGGTACTTAAGTTGACGGTTTACGAAACACCTCCTACTTGGGAATTGAACTGGAATCGTTATTGAATTAATCTTATTCCTATCAGCATAAGATGCCACTAGGTAAATTAAATGGTTTAATATACCAAGAAACTTTAAGAGTAAATAGGATGTAAGGTTATAAGGGAACTCCACCTGTAAAGTTCTGTCTAAGGTTGGGGTTACTTAAGTTGACGGTTTATGGAACACCTCCTACCTGGGCATTGACCCGGAACTGGTGTTGAATTAACCTTATTTCTGTTAAGCATGAGATGTCACTAGGTAAATTAAATGGTTTAACATACCTAGAAACTTTAGAGTAAAGTTTTATTATAAGAGTTATAATAAGAATAGACTTAGATAGATTCATTTAACCGGAATTTAGCTAAGCACAACAAACTCTAAATTAATATAACATTTTAGTGGGAGAAAAATGATATATATGATATATCAATTTTTAGCTCTGACGTTCCTAAGAGTTCACACGTGAGATCCATACTCGGCTTCGTGTCGCCCTGGGAGCAACCTCCCTTCGAAGAGTGTTTGTATGGGTCAATAACAAGGTGAATAGGAGAAATGTTCATAGTCAGTTGAAGAAGGACATGTGTCAACGCAGCCTACGGTCTCCTCCATTTGGTTGCATCATGAGATTTCTATGATCCGCCTACGTGTCGTCCTTGAGCGACCATCCCTTCGAAGGGTCTGATTATAAAAGTCGAAACAACGCAAACTCCAGAAATGGATAAGGTTTCTTAGATTAATCTTCAACAGTTGTCTTTCCTTTCGGTAGCCTGTTGAAGCGTACCTTTAAGATCTAAAAATGGTAGGGTCACACTTATGGGATGAATTAAGTTAGTTATGAATCCTTGACCGAACAACGATAGCTAAGAACTAGAGGAATATGAGTTATTCTGGTATTAGTTATTAGCTGAAATTTTCTCAATTCAGGAGAGGAGTAGCTGATCACCCTTCGGTGGCTGTTGCCCTGAACTTATGAAGTATCGTTGCAAAAATTAAATGATTTGTTTGATTAAGGTTCTTTGATTTCTTGTTTTAGCTAAATTGATTGGATTATTTTGTGTAGTGGGTTAAGACAAACATAACTAATACGGTCAATGATTGTTCGTGTATAAATACCCATTATTATTGCTCATTTTATTAGAATAATGAGGTTAAAACGCATAAGAAGATGATGAGAACGCGTAACTTGTGTTAAAAACGCATAAGTACTTGAAATATACTTTACATAAGTGTTATGTTTGTTTCACGCAATTTTAATGTCTAAACATAGGTCATTGAATAAAGAAAGAAACTAGTGAATTGCAGGAAATAGTTCGTGCAAGAAGTACAACCAGGAACTCATCTGATGATTAACATCTCTAGGCAAGGAACAAAGTTATCACACGAAGAAGGGTCACTAGAAGACAAGCGGTAGTTGGAGGTGATGTGACGTGCGATAGACACCTTTCGGCAGATGTCGCTGATAAGTTTATAAGATAGAGTTGTCCCTTCCAATTGCTGTCTATATAAAGCCATATCTTTCAACCTACAAAAAAGATGCCTGAATGGACACAAGCCTTCAAGAGTGGCAGAAAGGAATAGCATTTCCGCCGTCTGTAAATGTTTCTTCTTCTCCAATCAGTTGTAAAAGCGAAAGCTTAGCTCTTGAGAAGGGAAGAATCCATACTTTCGTTGTCCCTTAACTTGTAATAATTTTTCACTCTCTTTTCTCCCCATTTTTGCACTTCTTTGTAATATAAGTTGTTCATATTGTACAATGACCTAAGACCTACATTCTTTACATATATTACACATTTATACCTTTTCAAACCATCATTTTTGTACTTTCCATTTGTCAAAGTGTTATTAGTTGTTTAAGTCAGCGATAAGTTCTTGATAAGGAATCTAGCTTATAATTCTTATCGCATTAGTTAAGCTATATTCATTGCTTGGCCAGTGTCAATCCCTAACTACTCGAGAGGGAAAGTAACAAGGATAAGGCTAATGCGGCAAGGAGGAAGTTGGCAACAACCTCCACCTTGGCAAGATAACTTCCAACATTTGTATCCCGAAAGGCGAACAAGTGTGAACATTAGGCGCGGAGTGGTTGCTGTTCTTAATCGCAAAATTCTATAAGTGTTATAATTGAATACTTCTAGATATATCTCACCTAATCAGACTTAGTGATGTAGATCTAGAAAGGAGACTATGTGTGACGTTCAATGACTCTAAGAGGAGCACGCCTTAATCATAAGATGATAAGTTAAGTTGCATCAAAATCTTGCAATGCTTAATCGCCCAATGGCGTGTAGACCTTCCTTCACCCTTTCTCGCATCCAAGTTAGTTTGCATACTATTCCATTTCGCATCCATTCACTCCCCTTTACAGATTCTTTAGGTGTACATAAGTAGTTTTACACCTAGTTCTGATTATTTTATACCTTATTAGTTAATTCTTATACCGTCCAACTAATGAGTAATTCCCTAGAACTAACGTCTATCAACAATTCCCAGTGTTCGACCCTGGATCACCCATGTAAACCTACTGTTTTCCTTGCACTTGGACAAGCAGTAGGAAAACTTGTACTTAATGAGGGCTTAAGAATTATGCGATGATGAGGTACATAGTGAGCATTTCGCATTCTATGATCATGACCCATGACTCATGACTCATCGCCTAGAATCAAAGCATGCTATACAGAGAGTTACGGTGAGCGCATTATTCGCGATGACCTGACTCGATGATGTATTGCACTTATGTTACACGCACACAAAATTAGTAAGTCCAAAATGACAAACCACGTGTCTTCTTCAATCATTCAACTGCTTAAAAATTAAATATTAACCGGTGAAAATTATGCGACGTGGAAGTCAAGCCTGAATATGATTTTGGTTAATGATGATCTACACTTTGTCTTAATAGAGGAATGTCCTCATTTCCTTGCTCAAAATGCATATCAGAATGTCAGGGATGCATATAACCAATGGGCAAAGGCCAATGACAAGGCCTACGTCTATCTCTTGTCCAGTATATCTGACATACTAAGAAAGAAATATGAGACCACGGTCACTGCACGTCAGATCATGGACTACCTCTAAGAGATGTTTAAGAAGAATAAAAAAGAAGGTAAATATGATTTACTTGTCTTAGAAACATGTTTAGTGAAAAATGACCAAAATGCCTAGATACTTCATTAATGAGCCACTGACCACGTTTTCTCTTCTTTAAAGGAAACTAGTTTCTTTAAGCAGCTCGAGGAGGATGAGATGA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TGTTAGAGAGGTAAAACTTTATGGTCCCATTTATTTACGATGGATGTATCCATTTGAAAGGTTCATGAAGGTTATAAAAAATGATGTGAGGAATCGGCATCATCCAGAAGGTTGTATTGTTGGAGGTTATATATTAGAAGAAGCTGTTGAATTTTTTTCAGAATTTTTATGTGGAGTAGATCCCATTAGACTTGGTCGTAAAAAATTAAGAGACAATTCAGACAATTCAGAACTTGGTAGACCATTATCAAGGGGAGTTACTAACATTATCAAGTGGAGTTACTAATTTTTATGAACATTTTGCATTTTACACTTACCTAACTGAACTTTATTTTTTTTCTCAGACTGATTCTTATACAGTGGAGCTAGCAACTGATGAGGACTTAACACGCTTGGATTGGACGAGATCGAAGTAGGTTTGGACAATGCAAATACAAATAAATTGGAACAAGTTGAAGCACCAAAGAATGAGAAAAGGAAAACAAGAGGCTAACATTGATGCATGATGTTACACGAATTAAGAGTACAGGGGAGAAAACAATCGTTGACTACATTGAAAATGGAGTACCGATTGGCGAGAATGGGCATAAGCTACAATATTTCATTGGATCTTGCGTGCATCATCATATCCTAATTACACATGCATCGTGGAAGCTAGTGTTGATTGAGTTGAAAGAAAAAGTATATAATATGGTTGAGGTATGTAATAATTCTTTCTCACTTTGAAATCATGCAAATGTTACACACACTTATTGTATATTATGAGTTGTACTATGTTGTGACTATCCTGCAGCTATGGTGGCCAATCATGCATATATTGATACTTAGTGCATATAGGTTCTTTTTTCTTACGCATTGTTTGGTTTATCTAGGGAGCATTTGTAGTTGATGGTTGAAGTAAGAATTCCATTAAGAAAAGGGCTGGAGTTGCATTTCGTCATTTCAAGAGTTAGTTGATGACACAATATATTATCCCTTTTGTGGATAAACCGCAACTCTTGATAGATCTACCTTCATTGCATTCTCATATAATTGATACACATATTTGGCAAGAGTTTGTCAAGTCAAGACTGTCTCCAGAGTTTCATGTGTTAATCTTTTGTCTTGTAATCAAATGAATCATAATAGAAACCACGTTTGTTTTTTTAATCTTTTTACATAAAATTTGTATAGAAAGTGAGAAGGGAACAACAATATAAAGAAGAGCAAATATAGTCATAATATGTCAAGACGAGGCTATGCGAATCTTGCGAATGATATGGTAATGAAGAATGTTATAGTATTTTACAAATATTTTTAAATTTAACTATGGTGCGCTTAGTGATATGCAGAAAAAGGGTTCTTCTGATGAACAAGATTTTGGATGAGCTAATATGTGAAAAAAAGCTCGAACAAAAAAAAATGGAGAATACATGAATGAAGGTTTACAACAAATTGTCGATCAAATAGTAAGATTCTCAATGTTACATTTGCACCAAATCACATGAATTTACTATTTACATATTACTAATCATGTTTAACTCTTTTTAGGATGAGATTTTGAATAACAATGCAGATCCACTCTCCAAGAAAGATGAATCACCTAACGATGCATTAACTCAAGCTTTGGGTACTCAAGAATATGGTGACTGAGTACATGGTGTGGGTGGTTTCATTACACCTACTGTTTATTTTCATAAACCAAAACCAAGAAAGTAAAAAAATGTGGATTCAACTCAACAAATCATTGATGAAAAAGAAATACTCTTCAAACACATTCGAGAATGGGAAGAGAAAGTTCAAAGCCGACATCCGAGCATGGTAGTTGCTCGAAGAGTAAAGTCCAAAAGAAGGTAAAATATTTGTTTCTAAAGTAATATTAATTGTTTATCAAAGTGACGTTATCATTTACTTGTGCTATGAAAATTTGGATGGTTTTAGAAGAAATTTTTAGAAAAGGAGGAAGTGAAAGTGGAGGAAGTGATTCCTACTAGGCCATGGATATCAAAGAATGAGGTAAATGTGAAGGTGGATTATAAACAAACAATTTTACATGTATGAGTTCTTGACTTGTTACTTAATTGTGTTAGGTAAATGCAAGGCCGATGACAAAGGAGGTGGAAGTTACTAGTCAACCATCCAATCTACCCATACAATTGAAGTATATACTGAGATATGCTGAAAGGGTAATGATTGATGGGTCTAGTTTTTCCTTTCAACTACCTCCTGAGCTATTTGGTATACCTCGAAAGAGTTATGCCTTGCGAGAAGATGTCATTGATTTTTGCAACATGCAAAAAGTGAAGACTTTGTTAATGGTGGCTTATATCACGTAAGTAAATTAATGTTACTTGTTTATGATATATATATGCACACCTTTTAATTAGTAATAAGTTGATGTGTGCAAAATTTATTATAAGTACTTATACTCACTCATTATTGACTTGAAAAAGGTTTCGAAGTATGTTTTCGTAGATCCATTTCTTATTTTAGTTGGTCATAGTATTAGAAAGATTAGAGCTCGAAACCTTTGTAGTAGATTAATGACCTCGGAACAAGATCAATTAGTTATTGCTCCTTATAATCTCGGGTAAGTATAATTTTTATCACCTCAAACTTACATTAGTAGCAAAATACTAATTACTTGCACATATGTTTCATTTAGTGTCACTGGTCATTAATAGTCATTAATGCATATGATGATGTGGTGGACCTTCTTGATTCGTTGAGGACAAGCTCCCGAGAGGACATAAAAAATATAACGAATATGTAAGCTAACTCTGTTTATGTTTCTTTTTGTTTTTTTTTTTATCGCTAGCAACATTAGTTCATTTTGATTTATACTATACTTTGAGAAATGTAGGACATTGACGATTTTTTAATCTCAAAACAATTTGAAAAAGACTAGAAAAACAACATTTTGGAATGCGGTAAAGGTAAATATATTTATAAATAGTTTACAATTTAATTTAGCACATAATATAATATACCTTATTATTTGGTTTTGTGTTGTAGTGTCCTCTAGAAGTAAGTACTGTTGAATGTGGATATTATGTCATGAGATACATGCCCGAAATCATGAGTAAAGACACAAGTATTATTACTGATTTGGTAACGTTTTTAAACTACTTACATTGTAACATTATAAATAGTATAATATGACTATTTTTTTTATTTTTAACAAAGTGTCGACTCGACTTTTTATGTTTTATAGATTAATACTAGAAGTTCGTACTCACACTTGAATTGGATGAAGTACGAGTGGAGTGTTTTGAATTTTTAGCTCGATACATATGATAGACACACCTAGATATGATTTTGTTAATTTTGTGAATGGCTAACATATGAAAATGACCATAACTTTTTTTGTGTAAATTTTTTTGTTTATGGTCATTACGCTTACATACACGAGGCAATAGATGTAAGAGGATAGACTTTAGTTTTGGTATACCACGCATGTTTTTGATTATATAAGATAACTATTATTGTTGTTGATTTTGGAATAGGCCACATATAGAAAATTTCAGTTGACTATATTGGATTGGAATTATGTAATTGTTGATGACATTGCTAAGATTAATGAAATTATTGATGATTTACTCATTATACTACATTATGTAATTTTTTTTTTGTTGTGTAACTACTGGCTGGAGAGTTTATTTTGTTGATGGATACTGTTTATTGAAACAAATATACGTAATGCAGGAAACAGAAAATGAAAAATTTTGTATATTAAATATATTAATAAATGGTATATATGATGTTAAATACATGTATAGTATACTATCTTATTTGAATCAAATATATAATTTTTACTTGACAGCTTTTTAGTGTCAAATATACTATCTTACTTGACGGGTAAATAGTGTCAAGTATATTATCTTACTTGACATGTGAATAGTGTCAAGTATACAATCTTACTTGACGTGCAAAAGCCGTCAAATATGAGATTTTACTTGGCACGTAAAAGGTGTCATGTATACGACCTTACTTGACACGTAATAAACATCAACTACAATAGATTACTTGACACTAATACAATGTTAAGTAAATGTATGCTTGACGGTTTTTTATTGTCAAGTAATGTGACTATACTTAATAGTCGATTACTTGACACTTTTAAAAACATCAAGTATACGTTTACTTGA TTTTTAAAAATACTCCAAGATTAGCATATTATAAGTATGGATAAATCATGGAAGTCAAAGAGTAGATTATGTAAAGAGTTTGAGTTGGGTGTAGAGAACTTCATCAGATTTGAATTTTCCAATACAAATAATACTTCTATACGTTGTCTTTGTTTAAATGTCCTCTAGAAGTAAGTACTGTTGAATGTGGATATTATGTCATGAGATACATGCCCGAAATCATGAGTAAAGACACAAGTATTATTACTGATTTGATTAATACTAGAAGTTCGTACTCACACTTGAATTGGATGAAGTACGAGTGGAGTGTTTTGAATTTTTAGCTCGATCAAGTATACGTTTACTTGA TTTTTAAAAATACTCCAAGATTAGCATATTATAAGTATGGATAAATCATGGAAGTCAAAGAGTAGATTATGTAAAGAGTTTGAGTTGGGTGTAGAGAACTTCATCAGATTTGAATTTTCCAATACAAATAATACTTCTATACGTTGTCTTTGTTTAAATGTCCTCTAGAAGTAAGTACTGTTGAATGTGGATATTATGTCATGAGATACATGCCCGAAATCATGAGTAAAGACACAAGTATTATTACTGATTTGATTAATACTAGAAGTTCGTACTCACACTTGAATTGGATGAAGTACGAGTGGAGTGTTTTGAATTTTTAGCTCGATCAAGTATACGTTTACTTGA FLKILQD*HIISMDKSWKSKSRLCKEFELGVENFIRFEFSNTNNTSIRCLCLNVL*K*VLLNVDIMS*DTCPKS*VKTQVLLLI*LILEVRTHT*IG*STSGVF*IFSSIKYTFT* Homology
BLAST of Chy2G039830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TUX7 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold230G00410 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 8.5e-07 Identity = 28/40 (70.00%), Postives = 32/40 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G039830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BVS7 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold298G00870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 8.5e-07 Identity = 28/40 (70.00%), Postives = 32/40 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G039830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U2S8 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold648G002090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 5.5e-06 Identity = 27/40 (67.50%), Postives = 31/40 (77.50%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G039830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UL63 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1154G00070 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 7.2e-06 Identity = 26/37 (70.27%), Postives = 30/37 (81.08%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G039830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CRI9 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold299G001560 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 7.2e-06 Identity = 27/40 (67.50%), Postives = 30/40 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G039830 vs. NCBI nr
Match: XP_031745762.1 (uncharacterized protein LOC116406207 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 76.3 bits (186), Expect = 2.60e-13 Identity = 35/40 (87.50%), Postives = 36/40 (90.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G039830 vs. NCBI nr
Match: XP_031739988.1 (uncharacterized protein LOC116403337 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 3.74e-09 Identity = 28/40 (70.00%), Postives = 34/40 (85.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G039830 vs. NCBI nr
Match: XP_031742381.1 (uncharacterized protein LOC116404332 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 4.60e-09 Identity = 28/40 (70.00%), Postives = 33/40 (82.50%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G039830 vs. NCBI nr
Match: XP_031739753.1 (uncharacterized protein LOC116403284 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 4.99e-09 Identity = 28/40 (70.00%), Postives = 33/40 (82.50%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G039830 vs. NCBI nr
Match: XP_031737559.1 (uncharacterized protein LOC101205266 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 5.28e-09 Identity = 28/40 (70.00%), Postives = 33/40 (82.50%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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