Chy2G039440 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TATTAAATTATTTACAAAGCATGAGTTTCAAGTTTAGAAAAGAGTTATGAGAAAGCATGATTGAGTTAAAGTTTTAAAGCATTCAAATTAAGAAATATTTTTTAAAACATGAGATTTATGAGAATGTGTTTGAATGCTAAGCTTCTACAAATATTTAAGCAAAGAGATTATTTAAAGCAAAGCTAGATTTTAGACTTGTTAATGCAAGAGTTTTTCATAATCGTGTTAACTTAAGTAAGTTAAAGTTTTAGCATGAGATTTCTGAATATACTTAAGTCTATACTGAGATGTCTTGATCTGATAGCAAACATACGAAGGAGATTGTCTGGTGCACAGAGGTCGTGTAATAAGCGTATCCAATAGATGTCTAGAGTTTCCATCATATAGACTATGTAAGAGATGAGAGCCTCTACGGAGGCCTAGATTTCTCACCTCATGATAACTATAGCGAGATAGGATTCTACTAAAGCCTAGAGTTTCGTCTAGCAAGTTTTGTATCAAGGGATAGGGCTTCCATGCCTAGAGTTTTGTCCCGTAGATTCAAAGAGTTCAAGGTATAGCAAGATAGAAAGAAAATAGAAAGTTAAAAGCTGAGTTTGAAAAGAAAGTTGCTTTGCTAAGTTTATGCTTATTATTTTGTTCAAAATTTTCATTATCATGGTTTGTTTTAAAAATTGTCATTAACAGGGCTTTATAGCTCATCCTTTCAATGTTTAATTCCCTTACAGGTAGAGATCATGGTTCTGGCGCCTGTTAAAGCTTCGACCACTCTGCTAGAAGTTTAACGAGGTTTTGTACAGCCCATTCCATCCAATATGCATGATAAATTGTAATTAAGCTAAGAGTGGACTTAGTTGTCGTTGTCTATATTAGACTAGTATAATAGTTTGATTTGAGTTTTGTAATATTTTTGTCTTGTTGGGACTCTTAACTTAGTTTTTTCTATATAAGACTGTTTAACAGGTTGTCAATTGGTTGGGTAAACCTGAAGATGTTTACAAATACTCTAATTTATTAATTTCAAGTTATACATTTTCTTCCGCACTTTATGTCCAAGTTATTTGAAAAAGGATAGATAAGAGCTACAGATTAAGCAGGATCGACAAGTGTTGTTAGAAGAAGAACGATGTTAGTTGACTTAACGCCACATCCTGAGCCTATTGAGGAGGTGCTCCGAGATGGGGTGTGACAGTCCCCATCGGCATCGTCAACCAATTCAAGAAATTACGTTAAACTTAATCTTGAACCTATGATTTTTTTCAGCAAGTGGGGTCACACCAAGTAACACTTGGCAAAGGTGTAACCAATCATATGGCTCTGGTCAGTAACGGGCTCGCCATCAACATGTAATTCCATCAAAACTTCCATATCCTATAATGTGATTGCGCATTCTCCAATCGACATGTGAAATGTATGTGTCTTTAGTCTCCATCTCTTAACAAGTACAGTGATGAGATGCCAGTCGAACTTGATGAACCCCAATCTGACAATCCTATAAAATCCCAAAGCATGAAACAGTGGAAGTATGCTATGGTGGAGTAGGATAGTACAATAAACAATTGCCTCACATCGTCTATAGTTCATCTCGGGTGTAGTTCGATCATCTCATATAGTTGTTGATCAGTGCATGTTTTGACCCTATAAAACGTCAAGATTGATTGGTCCTGGGTTTAATGTCATTATGTACATGAAAGTAATTTATTTGTTTATTAATTAAACATTAAAGACAGATGTTGTAGCATTAAGAACAGAAGAAAATAAAAGTCCATTTTAATTAAATATAAATTATCTACAATTTATACTATAAACTAAATAAAATGTTTTTTTCTAGGTAACAATGATAAATACACTAAATATTTGAACATTTACAATGTAGAAATCTTGATACAAAAAACTGTAATTATCAGGTATTTGTCTCTGTAACAAAAGACACTTTTGTCAATTGTGACCAATCCACATTTGAGCTCCTTTGAGGACCCCATTCATGCACTCTGGTAGATTTTTCATCATCCACCTGTACTGAAATCCTTCTTTGTGTGCTTTCATGAGTCCATTGCTCTAACAAAATATAGTAAAAAAAACTCATACAAATTTTGTTAATTCCCAACATGTCTAAGTTGCTTTTTCGAATTTTCGGATATGAATTGACACTAAATCCTAAACTTTAGAATTTCCTAAGCCTTCCAATGAAACACATAGATGAGTTGTATTTTAGGTTAGTTAAAGACTACGATTAATTTAATAAAGTAGCTCAAAGAAGAGTTAATTAGGAGTTTACTAAGTTATGATAATAGCCTAAGTGTCATCATTAGTCTGTTAGCATTGGTATGTCATTTTAAGAGTATCATGGTTGGTGGAAGAAGGAAAGCTTGAAAAATAGACAAAGTGTCAAGCTGGCGACCAAACAAGGAATGAGGCCTGTAGCATGATGCTAGGTGTTTGGAAGCTAGTATGGACAACCAAGTGATGAGAAAACCTCTAAGGACAAAAGGTGAGGCTGCCAAGGAACCAACTTAGGTAAGGGAAGTCTTGTTGGGCGTTTAGGATGGCATACTTGGCTAGGCGAGGAAGCTTGCTAGGCAAGCTACATCATGCGGCCAAGGACATGAAGGGCCACACAAGGAAAGGGATGTGTAATACCTGTATCTTCTTGCCCATTTGCTTGTTAAGTGTTGAGGTTAAGCAAAGAGTTTGCCCAAAAGTCTTGGTCTAAGTCAAGTGACTGGGGACAGCATCCCAGAGTTATCAAGCAAAACAAGTACCCAAAAGTAGAATCTCGAAAAAGAAGTGGTAAGCTCAGTCCTTTTCAGTTGAGTGAAAAGATAAAGAGCTCTAAATTGAGAAATCTCGAGCAACTTTGTGAAGTCTTGGGGGAGATGGAAAGTAGAGAGTAAATCTCGAAGCTAAGGTAAGAGCATCTCGGTGCTCTCCAGCCAAGATGAAAGACAGAAAGGTTTGGAGATGTGTTCTCGAACCGTCTCGACCAAATGAATCGTGTTCTACTGAAACTAGAAATAGAAAAGGAAAATATTAGGGTTCTCGGACATGATTTCAGGTATGTCCGATCGGGAAGAAATAAAATAGTGATTTGAAAAAAAAATAAAAGAAAAATTGCAGAAGTAGAGAAAAAGACAATGGAAAGAAGAAGAAGAAAAAATGCAGAAAATGAGAAAAAAGGCGATGAAAAGAAAGAATATTGTTGAAGATCATAAAGAAGAGAGAATAGAGAATGATGCAGAAAAAATCAGGAAAAAGAGGAAATCGAAATTGAAAAATCATTATAAACTAGTAAGCGCAAATATGAAATTCTGAAAAAATAATCAGCCTTAATGGGCTTTTCTTAAATTGTTCTATGAGCGTAAATATTTTACTGTTTTGTTCCATTTATGAAAATTAACCTGTATTACACTATTTCTTTTACAATTTCATCATTTTTTTAAAATTAATTATGGACAATTTGAATTCTTTAAGACCATGTAAATCTAATAGGAACAAAAGAACTTCTTCTTTTAAAAAAAAATATTTTTTTTTACTTGTTAAATTTTTGTGCATCTATCAAATACTAACACAAAACTATAACTATAAACACCACACTAACACAAAACTATTAAATAAATACACATATCAAATACTAGGTACAAACTGTAGTATAATACACCTATTAAAACACTAAAACTAAAAAAAAAAACTCATAAATGATATCACAGTATTAAAACAAATCTACCAACAAATATAAAAACATCGTAATGTCACGTATTAATGGATATCACAGTATTAACACAAGAAAAAATACATATTATTTGACGTTTAATAAAAGTCAAAAAATCTGAAAATTGGCCTACTTCTGCCTTTTCATAAAAAAATTTAACGCTTTATCTTTGAAATCACCCATTTCTTGACGTTTTTTTTTAAACGTCAAAAAAGAAAAACAACAACTATCAAGAAAGACCTTTTTTGTGGAGTAACATATAAATAACAAAATACAACTTCTAGAATCAAATACTAATATGATTGATTTAGTAAGTTAAGAAAAGAAACTTGCAAATTGAAGAAAGATTCTACCGTTCAAAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTATTAATCCAAAACAGCGGAACTGCAAAAAGAAAAATAACATGAGAATATATATTGTTATATATTTACCAAAGAATTTAGTTGAACGAAAATATACCTCTTTCATAGTTCTTTTTTTCCAAACAGCTACAAAATCTAAGATATAATAGTATGAGAATCTAGTTAAATTTTTTATAATTAATTTTAAAAATATGAATTTAACAAATATATTTAAAATTTGACCCACAAATATTTCAAGACGAAGAGTGGAAAACGAGGGAATGGAGGCTTAGAAATAGAGAGGTAGAAGTTGATTTTTGGATTATGAAAACGAAGGAAGGGAAGTGATTTTCATAGGGGTACCGGGAGCAATATGAGGAAAAGGATTTTCGAAGGGACACCGATGGCAATATGAGGAGAAGGATTTTCAAATGAATATCGAGAGGTAAGAAAAGAGAGTGATTTTCGGCATTTAGGGTTTAAACCCTAAAAGGGTGAGTCTTCGTCTTACCCCTTATCGAAAAGACAACACGACGTCCGGCATGCAGCCTCTGCAGTAGGGATATGCATGCCCTTTACAATCAAGCTTTGGAAAGGTAAGCGGGAGGAAGGTCGAGTGCATTCAATGCTCTACCTTATTTATTTTTCAAATAATGAGGGAGTGTTCAGAACTCGCCCTGATCTTAAGATTTTTTTTAATTTTTAAATTAAGAGGGTAAGTCTTATCTAAGACTTATCCTTCTAAATAGCATTATTTTTTCAATTAGTTTCAAACCAACAATATTTTGCTAAAAAGTTTGAAAAACAACAATAATAAAATAAAAGATTGATCATTTAACTTTATAGACCTAAAATTGTAGGTCTATAAAGTTAAATGATCAATCAAGTGGAACAAGTTAAACATAACAACACAAAAG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TATTAAACTTGTTAATGCAAGAGTTTTTCATAATCTGAAGTGGTAAGAATTTGTTAGTTGGATTATTATTTAATTAGTGAGTTGCAACTTAAAGTAATAGTTAGAAGGTCACAGGGTCACGGTAGGAGCTGATTAATGATGTCGGACTGACTTTTTTTAAAAGCAAACAAATCTACGGAAATCAGATTTCTCACATAATCACATTTCCATACATTTATTCTCAGCCGAAAGCCCATTACTAAGATTTACCATTTTTTTTAACAATAAATTGAAAGAAAGACATTCCCCCAATTCCACCAAAATCAAAATCAAACTCAAAATCCTCTAAACCCTTCATTTCCATCAATTTTTCTCCCAAAATCCAACAACCCCATCTCCAAATCTATGTTCCCAATTCAATTCTCTCTCTCAAAACCCTTTTCATTTTCTGAATCGATCTTCTCCCTCACAAGTTCTTAAAACCCCTCATTTCACTGTTTGGAGTTGCATGATGATGATGATGTCTAGCTATGGCGCTGGATTCTCCTTCCTTTTTCTGCTTTTTCTCGCCGTTTTGGCTACTGGGAATGAACTAAGTTTCACTCAATCTAATGGGTCTGTCGCCGAGATGGTGCCACTCATTGAGGAAGGGAAAATGAATATGATGGAGATGAATGAGACTAGAAGGAGACTAGGGAGCTTCCAAATTTGTGCTCCTTGCACTTGCTGTGGTGGAGCTAAGGGTCTGTGTTTGCCTTCTCCTTGTTGCTATGCCATCAATTGCAACATCCCTAATAGGCCATTTGGTTTTTGCTCATTCACTCCCAAATCATGAAACACGAGGGAGAACTCGTCAACACACATTCATGATTCAACCGAAGAGGGTGTAATGGGAGGCTTAACTGATTTGAGTTTTGAATTTATTGCAATAGTTCTTGCCATATTTATTATCAAGTGGACCTGCTGGTTTGAAGTGTAGAATTAACCCAGCCTTTTCTAATTTCTTTCTGTC TATTAAACTTGTTAATGCAAGAGTTTTTCATAATCTGAAGTGGTAAGAATTTGTTAGTTGGATTATTATTTAATTAGTGAGTTGCAACTTAAAGTAATAGTTAGAAGGTCACAGGGTCACGGTAGGAGCTGATTAATGATGTCGGACTGACTTTTTTTAAAAGCAAACAAATCTACGGAAATCAGATTTCTCACATAATCACATTTCCATACATTTATTCTCAGCCGAAAGCCCATTACTAAGATTTACCATTTTTTTTAACAATAAATTGAAAGAAAGACATTCCCCCAATTCCACCAAAATCAAAATCAAACTCAAAATCCTCTAAACCCTTCATTTCCATCAATTTTTCTCCCAAAATCCAACAACCCCATCTCCAAATCTATGTTCCCAATTCAATTCTCTCTCTCAAAACCCTTTTCATTTTCTGAATCGATCTTCTCCCTCACAAGTTCTTAAAACCCCTCATTTCACTGTTTGGAGTTGCATGATGATGATGATGTCTAGCTATGGCGCTGGATTCTCCTTCCTTTTTCTGCTTTTTCTCGCCGTTTTGGCTACTGGGAATGAACTAAGTTTCACTCAATCTAATGGGTCTGTCGCCGAGATGGTGCCACTCATTGAGGAAGGGAAAATGAATATGATGGAGATGAATGAGACTAGAAGGAGACTAGGGAGCTTCCAAATTTGTGCTCCTTGCACTTGCTGTGGTGGAGCTAAGGGTCTGTGTTTGCCTTCTCCTTGTTGCTATGCCATCAATTGCAACATCCCTAATAGGCCATTTGGTTTTTGCTCATTCACTCCCAAATCATGAAACACGAGGGAGAACTCGTCAACACACATTCATGATTCAACCGAAGAGGGTGTAATGGGAGGCTTAACTGATTTGAGTTTTGAATTTATTGCAATAGTTCTTGCCATATTTATTATCAAGTGGACCTGCTGGTTTGAAGTGTAGAATTAACCCAGCCTTTTCTAATTTCTTTCTGTC Y*TC*CKSFS*SEVVRIC*LDYYLISELQLKVIVRRSQGHGRS*LMMSD*LFLKANKSTEIRFLT*SHFHTFILSRKPITKIYHFF*Q*IERKTFPQFHQNQNQTQNPLNPSFPSIFLPKSNNPISKSMFPIQFSLSKPFSFSESIFSLTSS*NPSFHCLELHDDDDV*LWRWILLPFSAFSRRFGYWE*TKFHSI*WVCRRDGATH*GRENEYDGDE*D*KETRELPNLCSLHLLWWS*GSVFAFSLLLCHQLQHP**AIWFLLIHSQIMKHEGELVNTHS*FNRRGCNGRLN*FEF*IYCNSSCHIYYQVDLLV*SVELTQPFLISFCX Homology
BLAST of Chy2G039440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A484KFC2 (Uncharacterized protein OS=Cuscuta campestris OX=132261 GN=CCAM_LOCUS2362 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 3.9e-04 Identity = 34/72 (47.22%), Postives = 43/72 (59.72%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G039440 vs. NCBI nr
Match: VFQ60586.1 (unnamed protein product [Cuscuta campestris]) HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 2.14e-06 Identity = 34/72 (47.22%), Postives = 43/72 (59.72%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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