Chy2G038500 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGATTTGATGCAAGTGAAAATAGAATGATGATAGAAAATTATAAAAAATAAAAAATATGAAATATCAAAATTACTTAAAATATTTTTTGTATAAGATATTTGGGAAAATTCTAATGGAAATTTTATGTTTGTTGACGTGAAAGTTGAAAACTTAATTAAATTAGAATGAATAAAATGGTTAAAAATACACACACATATATACTTAAATAAGTATATACACACATAGATATATGTATACATACATATATAAATATATATGCATATAAGTTTAGAAAAATGGAGAAAGAAAGAATGGTCCACAAATTTATTATTGAGAAAAAAAAGAAACAATCGACAATTTTCAAGAACTTGTCTTCCCAGATTTTGAGTCTTCTGTATCGGCTTTTAATTGAGTCCTTTACTGGTTTTGATGTTGTATCACTTTGGATTAGTTGGAACCTTTGTTGTTTGGACTGTGCTTTGACATTTGATTGTATTATTGTTTATTTGTTAGTTTTCATGGGATATGATGAGGGTGCTAAGATGCTCGGGCGCTCCTCTTGATCCTTAGGTTTTGCTTTGTTGGTATCATTTTGTACATTGAGCATTAGTCTCCTTTCATTACCTTAATGAAGAGGCTTGTTTCTTGTTTTTTTTAAAAAGAGAACTTGTCTTCCCTACTAAAGTAGACATCATTCAAATCATTAATCACTCATGAAATCGGACAACTGTACAAGCTTTCTTCTATAATCCTATAATCCTATAATCCTATAATCCTATAATCTCAATAATCTCAATTTCATTGACATTTTCTTTGACAATTAGAAATCTCGAAATTTTGAAGTTCCATCAAAATGAGGGAAAAATGAAATTCCCCTAAGGAAATTTCAAGAACTTTGAAATCTTGATTCGTTCAAAATTTTACACCAAGATGTGCGTCACATTGGATGTAGTAGGAATAGGGTATTATTGTCAAATCCTTAATTTATTAGGATTATGATTAGGATTAGTTTTTTTAATTTATTAGGATTAGAATTACTTTCTTTTATTATTTAGGATTAGGATTAAGTTTCTTTTATTAATTAGGATTAGTTTGCCTTTTGCTATAAATAGAGTATTGTCTTCTTGTAATCACAACTTTTAAACATTAATAAAATTCTCTCATTTAGTATATACCAATTGGTATCTAAGCTCCAAGAAATGTGGACCTGATGGCGGGAAGGAGGCCACTGGCAGTGACCCTGTGACAACCTTCAAAGAGGTAGAGAAAACAATCGTCCTATCATCAATATAGCCTATTCCTCTCTGCTTCCCTATCTTTCAAGGAAGAACAGAAAATACCCTCACATTCAAGATACTAATTAACTTTCCCTCTCACAACCTTTTTATTTATTTATACTAACAAACGTAACTAACTCCCTTCCCATTATTATTCTTATCACATGCTTCTCACGTGCTCTTGATTACTTCTTTCTTTCCTCTTCTGCTGTGCTGATACAATATCGGAGGTCTATCAGAATTTAATGTGGCCACGAATTGAAAAAAATCAACCAAGAATCACCAATTATCCCCAACAAAGACAGTATCTAAACGTGCAACAACAAATTCCTCCTAGACATGTCTAAAATTTTCCATCCAAGAACGACCAAGAAGACAAGTTTGCCAAAAAAGATACCACAAAAACAACATGCCAACAATTGAGAAAAATGAGCCGAGTAAAGAAGATGAGGAAGAAATCAACTCAAAGAAGCAGGAATTTTATAGTATAAACCGCAAAGAAGAAGAAATTGCTTGTGGGAATAAAAACGACAAAAGCATTTTCAATTTAGAGATTGTGCAACCTAATTTGAAAGAGAAAATGACGTCGCAGTTGAGGAAAAATTGGGGAATAATGCATCCAAAATTTCAAACACAGAAGAAAACATGATCAGAACTCTAAGCATTGAAGTGAAAGTTGTTGTCAACAAAAAAAGAGGAGCAACGGAATTACCTACTTTGGACGAAGAAGATGAAGTCGGCAACGTTGCAGTGGAAATCAAATCAATCTAAATTGATGTTTTTGCACAAACAAATGAAGGAACAATTTTCTATGGAGATGAAGATGAATTTCGAGTTACACTAAATGTCCACAGCCCTCCTAAATGGACATTATTGATGGTGGATGTTTCAAGATGCCTCCATTCGACTGGCTTACATTTTTTTTTTTACTTTCATTTTCGTTTTGAAACTCAAGGACAAGTTTTTTTGGGGAGGAATAGAAATGATGTAGTAGGAATAGGGTATTATAGTCAAATCCTTAATTTATTTGGATTAGGTTTAGGATTAGTTTCTTTGGTTTATTAGGAGGATTAAAATTAGTTTCTCTTATTATTTTGGATTATGATTAAGTTTCTTTTATTAATTAAGATTAGGATTAGGATTATGATTAGTTTGCTTTTGCTTTAAATAGAGTACTTGTCTTCTTTTATTCACAACTTTTAAACATTAATAAAATTCTCTCATTTTGTATACACTATATACATGATTACAATATGATGATATGCTATGATGTTTATCAAACCCTGTAGTTACTTATATCTAGTTAATTGTTACGTCTTGTAGTTGAAGTCTTCAACTTCTTGTAAAATTCCTTTCCAATTTTCTGTTTGTTTTCGTAGAATTTTTGGTCCTTTCTCATGCATTATATCCCTTATAGTATAATCCTTTTCTATGTAACAATGAGATGACATTATCACATCAATTATTGACATCGTGTTTTCGTAATTTAGTTAACTCTTTGTTTATTTGTCCATTATGTTTGATGAGAAGGAAATGACTAAAAGCACGTGAGAGATCATAAGATTTATATAAAGGCCATCCAATTGGTCCAACACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGTTATGAAAAAATAAATCTTATTTTAATGAAAGTCTGGTTTCCGTTTTAAATAAAAAAAGGGAAAAAAAAAAACAGCCGTAATGTATATGAAAGATTTCTGACAAAAGTAAACCCTTTTGGTCATGTTTTCATTTTCTACTTAACTTTTTAAAGATTACACTTTTGGTCAAGTTTTCATTTTCTGACAAAATTAATTTGAGGAATGTTTCTGTAAATTCTTTCGCTGTCATAGGGCTTTTATCACTTCAACTGCTTGACATTTTTCTTTTCCTGATCCCCCTGGCTGATTTGGTATTTTAGTATTTCTAGGGAGGAATCCCTTAGGTCTACCGGAAATATCACTTGCGAGCTATGGATGAGGCTTGGTTCTGCAGAAGGGCATCATTCCTTTGCATGTATTCATGAAATAGGGTCTCCATTGATGATGTGGAGGAGGAGGAAAATTGGTTAGGGTTGCTGTGATGGGGATGGAGTGGAGCTGGCTATTGTGGCCTGCCAGTATATTGTCTTGGACGATAGCCGGATGCATTGCCTTTTTAGTTTACTGGGTCACTCTGTCCGTGTTGGACATTTTTCTCCTAACCCCCCAACTAAAATTGAGGTGATCTCTCCATCTCGATTGTATGTGTAAAAGGAGGAATCTACTTCAGCCACTTGTTGTACTAGTTGAACTGAGCTCCCTGCAGCATTGACTTGTGATAAGGCCATAGATTGAAGAAGCCTGTTCATCTCAGTAACTTATCCTTGCAACGCGACCATCACATTCCTATCTACTCCCTCATTTATTCTTCCTCTATCTCATTTACTTTCCCTACCGTCATTTCGTGATCCAAATCCATCATCTCTCCATTCTTAACTATTGTTGGCCATAATGTCCAACATTGTTTTAATTTGGTTATAGGATGATCTGAGCATCCCTCCTGTGAATACATTATTAACAGATTGCTGTGTGTCTCTACTTAGCCTAAAATGGAATTGTTCCATCAAGATGCATCCCAGGATGTTGTGGTGAGGGCATCCCTTGATCATTCTCTTGAATCGTTTCCACGCTTCAATCAAATTTTCATTATCTCTCAGTTCGAAGGTCATCAGGTCCTACTTTGTTTTTTGTATTCTCAATGGGTGGGAAGAAGTTCTTCATGAATTTTTTAATCAAGTTGTCCCATGTTGTAACTTTACCTTCCTCTAAAGAGTTAGCCCATTGCTTAGCTTCATCGCGTAATGTGAGTGAGAATAAAGCTAAGCATAGTTCGCCTCACGATATGCCTGACATATTAAATGATGAGCATATAGGGTAGACGTTTCTTATGTGCTTATGAGGATCTTCACGTGGATGTCCTCCAAATTGTTCATCGTTCTAGATCATCTGAAGCATTACTTGTATGATTTTGAACCTTGAGTTTGATCCAAATATCGGATAAACGATGACTAGATTAAGATCATAGAGGTTCGACGATGCATATGATTTGATGGGACGATCCAGATCGTGAGCTAAGTACAACAGATTTTGTTCTGAGACATTCTGGTTGGTAGGGTTATTGCTGTTTTGGTTATCCATGTTTGTTCAATGTTGCCTTTGCCTTTGTCAAAAGTTGCTTCGAAATGTTCGTTCAATCTCAGGGTTAAGTTGGAATTCTGGTTGTTCGCCTGCACTCATAAACTTGTTCACAAGCTTTTCAACTAAAGCACGCAATTAAGCTTTTGCATAATTTAACGCACAATTAAGTTGAATAGGAAAAACTTTGAAATTCCCTTACAATGGTGGTTTTTGTGGTGTATGATGGACTTAGTAGTTTTGCATTTGTATAGTGAAATCGCAATACGTAACGAAGCAGGTTCATCATACTTAAGATGCTCACCATATCTTTATGTATTGTGTGATTAATTCTATGTGATAGGTCATGGGTCATAATCATAGCATGCAAAATGCTCAGTATTCACCTCTTCATCATGTAATAGCTAAGTCCTCGTTGAGTACAAGTTTTCCTACTGCTCGTCCAAGTGCAAGCGAACAGTAGGTTTACTTGAGTGATCCAAGATCGAACACAGGGAATTGTTTCCAGATATTAGTTCTAGAGTCTACTTTTCGTTTAGGCATTATGACAATTAAGTTAAAAGAA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AGTAGCCACAATATTTGATGATAACAATGACTGTCCCAATGTTAAAGTCTTGGTGGATTTGCTTACGGGAGGAGATTTTAGTATACCTATTTCGGTAAAGGGCGGGATAGAGACTTTAAATCAAGCATTAGGTAACATTACTGAATGGCCTCGTCGACTTGTTTCTGTGATTCATGACAAACTAGAGCATTCAACCCCGAAGGATGTTGTGTATTCTTCAAAGTACACAAATGTTAATGGAGCTATTAAGCTCTTATATGGACATGCCGTGAACAGTATGAAGGATGTAGATATGGTTCGCATCCCAATGAACGAGCTAATATTTGGTAAAAACAAATTCGTTTATTTAGCTCGTGAGGATTTGCTCCATTACTGCGGCATGGTAGAAATAGGTTATATGTGCATACTAGCATACATTAGATATCTTTGAGATGAATGTGACTGTGGAAGAAAGTTTTTTGTTATCGACCAAGCAAAAATCACGTCACATATCAAGGATCGTGATCTCCGATCTAGAAATTTAGCCAACCAGTTAGAAGCGGCTACCTTGGAACAAATAGTTCTAATTCTGTATAATACTGGTTTTCATTGGATGTTGCATGTCATCGATCTTCGAGAGAATTGTGTTTATGTCTTGGACACTCTTCGAAGTAAAGTTAACGAAGACATTCATGGAGTCATAAATATAGGATTAAAAACATGGCAAGCAAAGCATGATTTACAACATTATCGGTCAACTCCAAATTGGAAACCTATAAAGTGCCCTCGTCAATTGGATTTTGTAGGGTGTGGGTATTATGTCCAAAAGTATACACACGAAATAGTGCATAATTTTAGCACTCCAATCACTAGCCTTGCATTTAATAACGCGAGCATAGATGTCGGTTCCAAACTAACAGTAAAGATTTCTTTTGGTCATTGTAAAACTACCCTTTCTTGGCGGAGCCCCCCTACATATGATTTATGGATCT SSHNI***Q*LSQC*SLGGFAYGRRF*YTYFGKGRDRDFKSSIR*HY*MASSTCFCDS*QTRAFNPEGCCVFFKVHKC*WSY*ALIWTCREQYEGCRYGSHPNERANIW*KQIRLFSS*GFAPLLRHGRNRLYVHTSIH*ISLR*M*LWKKVFCYRPSKNHVTYQGS*SPI*KFSQPVRSGYLGTNSSNSV*YWFSLDVACHRSSRELCLCLGHSSK*S*RRHSWSHKYRIKNMASKA*FTTLSVNSKLETYKVPSSIGFCRVWVLCPKVYTRNSA*F*HSNH*PCI**REHRCRFQTNSKDFFWSL*NYPFLAEPPYI*FMDX Homology
BLAST of Chy2G038500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U2C7 (DUF4216 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold133G00670 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 1.3e-09 Identity = 33/51 (64.71%), Postives = 41/51 (80.39%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G038500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V7U5 (DUF4216 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold468G001730 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 1.9e-08 Identity = 40/75 (53.33%), Postives = 50/75 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G038500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C8X3 (Gag protease polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1737G00800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 3.1e-06 Identity = 29/42 (69.05%), Postives = 34/42 (80.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G038500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CWP3 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G00660 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 4.0e-06 Identity = 29/45 (64.44%), Postives = 36/45 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G038500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VFM4 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold38G002650 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 1.0e-04 Identity = 27/45 (60.00%), Postives = 36/45 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G038500 vs. NCBI nr
Match: KAA0047815.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold133G00670 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 73.6 bits (179), Expect = 2.25e-10 Identity = 33/51 (64.71%), Postives = 41/51 (80.39%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G038500 vs. NCBI nr
Match: KAA0063057.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold468G001730 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 1.81e-09 Identity = 40/75 (53.33%), Postives = 50/75 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G038500 vs. NCBI nr
Match: TYK07790.1 (gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 1.94e-07 Identity = 29/42 (69.05%), Postives = 34/42 (80.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G038500 vs. NCBI nr
Match: TYK16293.1 (transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 1.92e-06 Identity = 29/45 (64.44%), Postives = 36/45 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G038500 vs. NCBI nr
Match: KAA0067182.1 (transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 5.98e-05 Identity = 27/45 (60.00%), Postives = 36/45 (80.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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