Chy2G037980 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy2G037980
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionZinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
LocationchrH02: 13251568 .. 13268997 (+)
RNA-Seq ExpressionChy2G037980
SyntenyChy2G037980
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAAAATGTAGTTGGACAATGTTGTAGACATCTCTTTCATGAGTATAGTAGTACTCGAAGTGGCAGTGGACCAGGATGTACTAGTACTAGCACACAAACTGTCTCGGGCTTGGATGTGATTATTGATTTTCATCCAAATGAAAACGTGGGTGAAGATTTTGTCTATGACACCATTGTTGAGGAATTTGAAAGTGATGCGACTACTACATCTTTCAAGCAGGAGTCATCAGATATTGATATCTATTTGTTGGAAGCCAATGTTAGGAACGAAGGTGATTTTGACATACTATAGTAGTGGAATACGAACAGTGATCGACTTGAGGTTCTTAGTCAATGGCTAAAGATATTTTGGCTATTTTAGTTTCTACTATAGCGTCTGAGTCGATTTTTAGTACCGAAGGACGTATTGTTGATTCATCACATTGCTCATTGGCTCCTAAAACAGTGGATGCTTTCATATGTACTCAAAATTGGCTAAATTTTGATCCAACAGATTTTCAAGTTCAACATGAATTGGAAGAGGCTTCAACATTTGAAGAAGGTATTATACAAATTTTTTAATGATGTGTATTTTATAATTGTAATGTGTAATTTTACTGACCTCTTGAAATTTTCATGATGTTGTCTTTCTCTTCTTATTCTTGATTTTGATTATATAGGGTTCTAGGTGGTTATGGATAATGAAAAAGAACTTGAAGACCTTCCAGATTTTGCAAAGTTGTCAATTATCGATTACTAACTAATGTTAGCCAATACTTATAATATTTGTTTGTATTTGTTGTTAACATTTGTGCAATTCATTTTTGTTTAAGTTGTTTTTTGTGCTAATTGATACATTTAGTATTTTGCACCTTTTTGACATTTAATTGAAGGATTATATTATGCTTCTCTATAAGTAATGTTTGATAATACGAAATGCAATCAGATCAAAGAAGGCACTTTTAATAGTCATATTAACTTCGTTTTCTTAATTATATGCAATGAAAGGAATAAAAGTGGAAGGTTATTTTTGGGACAAGAAAATATTAAAAGTTAGATTACCCTAACTTAAAGTTAAAAGTTAAATTGTAAAATTTAATTTCTTGCATTCAATTGACAGTGTATTACAAATTTAAAATAGTAATTTTTAACAAAATTTAACAAATTAGCAATTATTTATAGAATTATATATTTTTCGCTTTACCCTCATTTTTAGTTACTTTTTTGAAAAATAATGAAATTTTTTCATTTGGAAAAAAAAACGTTAAATAGAGAGGGGCATTAAGAAAAGAATACATGATTTTTTGTATTTTGCAAAGGCATAAAAAGCAAAAAGTGGGAGAAAAAATAAGGTAAATTTATATAAATAAAAGAGAATTTAACTACTATAGCCACATTAGGTTGTCAAATTTTTCATAAATGCCCGAATGGGTTTCAATTTTACACAAATGTAGAGACCAAAAGACCAAACTAACCAGCTTTATTATTAATAAAATATTAAAAAATAGAAAATTGAAATAAGGAAAGTGGACCAAGATTTGCATTTATTAGATATCCTATATAAATATGGTATATGATTAATTATATTATTGTAATATTATAATCAAAATTAACCCATAATTTTTTTTGGTGATTTTGTTAAAAAAAAATTCCTTCATTCGATCTCTCTCTTTGTCTATTATTTCTTATTTCGTTCATCTCCTTCAAATTTTTCCGGTGAGTAAGGGTTTATGGTTATATACAAAATTATTTAGAGTACATGAAAAATATATAGTATATTACGTAGTTCATGCTTCAAAACTTTTTTAGGGTATATGAAAAATATATAGCATATCATGTAGTTCATGCTTCAAAACAATTTTAGGGTATATGAAATATATATAGTATATTATAAAAGATATATTGTATATTATGTAAGTATATGAAAAATATAAAATGTGGAAACGGAAATGTGAAAAAAATAGTTTAAGGAGATTTCTCTAACTGTGTTGTGGATAAAATTGAATAAAGTCAATTTGTAGAAATTATTTAATTTAATAGTATTTTATTAGATTCAACTTTATACCATATTAAAATTATTTCTCCGATATCTATATTAAATGAAAATATAAATCTAAATTATATTTGTTACATTAATTATAAAAGATAAAATAGATAATAAATATGATATAATATAGTTATGGTATTATATTATATTTTTTTTTTAAATCAAATTTATTTATAATTGCTGTGAAGGTTAAAATGGTCTTAAAAAAACACGAAATCTTAATTAAGAAAATAAATGAAATTTTGAGACATCTGTGTAAAATCATCTCTAAAGTAGGTGATTTTTTAAATATTTCTAAATAAAAGAAAAGTTTTAAATATTTATGACCCGTATAACAATTTAAGAAAAGCATATGAAGTCAATTGTTTTTCAATAAATTTCATATTTATCCTTATTGGATTTTGATTGCTGTGGGACAATTTTTCAGTTCTTTTTCTTCTTTTTCTTTGCGATTTATTTTTCTCTTGTTCATGTTATTACTTCTCCTTCTTCATATTTTCACTTCTTGTTTGCAATTTCTTAATTTCTTCTTCCAGAATTTATTCCTTCTTCTTCATTTATCATCTTCTTTTTTTCTTCTTGGTATAAGATTTGAATGATATTAGTGCATAATCTAATTAAACGATCATGTACCAATATTTAACCGATCAATTGTCTATCCTAGATAGACAAAGATAGACCATTATCACTAATAGATCGTTTAGATTTGGTACAAGATCGTTTAAACTGGTATAAGGTTACAAGATCACGTTTAGGCTGGATACAAGGATATAAGATCGTATAGACTTGGTACAAGATCTGACTTGGTCATTTCCATTCCAACTTGTGGTAGGTCGGAGCTGGTTTGGCTGGAAAACTGACTCTAATCGATCGTTGATCACCCCTATTAAAGAGTGTCTATTGCCATGTGTCACTCGCTACATCCCATCTACCTTACCAAATGTCTTTGAAGATACCAACCCTTAGTGCCCAATAATACACCTCATGCTTGCCAAATTGCCTATAAATAGTGACATTTAGTGGATTTTGTAAGTCACACAATATTGGTTTTGAAGTGCATGTCTAAAGCCACATATTATTGTATATAGAGTGTTTTTATGTAAAAATAAGAAAAAGAGTATTTGTAACCTTGTTTTTATGAAATGAAGCAAATTAGAAAGAGTGAAAGGTGAAATTGTTCCTAAAGGAATAAATGAAATATAGATAACAATATATAAGAAAAATTTACATAAATGTAATAAAACCCAAAAATACATACCGCTCATGTAACAAAAAACAAAAGTCCATGAAGTCGGTTAAATATTTTCATAATTTTCAGATTTGTTCTTGAATATTGTGAACAATTCGTCACTTCTCTTTCTTCTTCTTCCTTCTTTGTGATTTCTTCTCTTTCAGATTTTTTCATCTCGTCTTCCAGATTTTTTTTCTTCTATTTTTAAACGATTTATTCTTTTGTTTAAATCTGCTATTTCTTCTTCATCATTTTTGACAAGATTCTTTGAAGCTATTTTACGATTGTTTCAATATTCATCTTCATCTTCCTCATAATCGAGAATATCAAGATCGTTTAAATATCATTTTTAATTATCAACATGATCATTTACCATTATTCAACACAATCGTTTACCATAGTCAACAAAATTCTTTAAATTTGAAGACTTTTTCCCATCATTTAAAACGAACTACACAATCGTGTTGACATGATCTAAACGATCGCTTACCATAATCAACATGATCGTTTAACATAGTTAACATGATCGTTTAGTATAGTTAACACAATTTTTTAGCATGGTGAACACGATCATTAGATTTGAAATTTTTAATGATCATTTATCATAATCAACACGATCAACACGATTGTTTGCCATGATCAACATAACCGTTTAGCATGGTTAACACGATCGTTTAAATTTAAAGTATTTTTCCATCATTAAGAAGGACTACACAATCGTATATCATGACCTAAACGATCGTAGATCATTCATTTAGACTGTAGTACACGATTGTTTAGAAAAATATTGCTTGCGAGCGCATGTGACCAATTAATCGCGTGTTGATTGAATTTTTTTTTTTTGTATTTTCCATTGTGAGTCTGCTGCCTTTTTCTGTTTTCAAAATTTTTCTATACATTGTAAATATTTAACCAGTTTGTTATATTTTTTTTAAAAAAAAAAACCATATTAAAAAGGTATGGTTTGTTTGCAAATATTTTTATTGATAGAATGCTTAATAGTGTATATTTGTAAATATTTTGAGCAATTTTATCATTTAAAATAATATCCCTACTACAAAACCATGTCTTATAATAAAAAAATAAAAAATAAAAAAAATAAAAAAATAAAAAAATAAAAAACTTTCCTTTTCTTAACAACAAAAAAAGGAGAATAGTGGAATGAAGGGAAATATAAGGATGGATTCCCTGACCCGTCGGCTCTTCCATGGGAAATCCCCACGAAAATGGAGATGGATCCTTGTGAGTTGATTCGTTGATGGGAAATCCTTGCTCTATCCGCTATCCTCTCCCTTTAAATGCACGAAGTTGGTCAGGAATGGGGAATTCCTCTGTCTCTATCCTCCTCCTTTGCAAATCCTACTTCTCCTTTTAATATACTACATACCTACTACATGTCAATTTGAAGTACATAACCAAAGTACTATATGTGATTTTAAAAAAAAAAAACAAATATTATGAAAATGTTTATTAAAATTTATAAGAAAAAGTCATTTGGTTGATAATTCTGTGTTTGATGGATGAATATTACTAAGGATAACAGATTGTTTTGTAATAAAAAAAAACCGGTAAAACAAATATCTTTATGAAAAATTGCATCAGATAACAAAAAAATAATATATCTTTTTTTCATATTGCAAATATGACAAATAATTAGATATATGAGAGGGATATCAGAGGGTTATCCGCTTTTAAATTTGCTAATTTTGCAATTTAGAAAATGTAGTGACATTGACCCTATTATCATAAAAAAAATTTTGTTATTTTTACAACCTCTATTTGTATTATCTGATATAATTTATTTGATGGCATGTTTTCACTTAAAAGTTTGCCAATAATTTTTTCATGGGACGTTTATAAAAATAACAAAATAAATTAAAATATTTACAAGTTATAACATAATTCTAAATTCTATCGATGATAGTCACTGATAGGTTCCTATCACTAGTGACTATAAATGTCTATTATTGATAGAATTGGAAAATTTAACTATATGTTGTAAATATTTTGTCAAATTTGGTATTTTTAACAAATTTTCAGTTTTTATTATTAATTTTTCTAGAAAGACACGTTTTTCGTTTTTAAGGAAAATTGTAAAAACCACACTTAAATATGGTAACAGTTGAAATACTTTCAATTATAAAAAATGAACCTTTAAATTTCTAAAAATGTCTAAATTAAACTTTCAATTTTTCATTAATTACAAAAATTGAATTCATAAATAATAAAATTGAACTCTTAAACTTATATAAATGCTACAATTTATACAAGCACCCATATGTTTGAAGGTCGAATTACTTTTTAACTTGAAGGGCTCCATTTTAATTTAAAAGTATAATTGCAAAACCATGTTATACTCTTTCGTAATTTAAACGTTTTTTTTCTAATTAATTGACAACTAAAACCATTCATTTTCTCTTCATATATTATTTCAAAATGAAGGTATTTAAGCTAGTTTATTTTTAAAATTGTAAATATTCATTCAATTAACTAATTGGTTCCTCTACATTACAATGCTTTGTGGAAAAAAAAAAAAAATTTGTCATTCACATTTGTCTCATTGTTCTCACTCAAATTGCTAAATAATGGAGAGAGAGACTTCAAGATCTGATCCAAAAACTTCAATCCTTTTTTCCACTAAAAAATAAGATTGCTTGGAATCTCAACCTCATAAATAAATTAATTACACTAAAGAAGGAAAAAAAATGCTAAATTTTATTAGAATTAACATCCATCTTGTTAAAATGTATAGATAAACCCTCAAATAGTTGAAGATTAATACATTAGAATCTTCAACCTTTCTACATATTATTGTACTAAAAAGTAGTATTAAAATATTATTATTCGTATGGGATATATATTGCTATTCAAAAGTCTACCTTTTTGTTCTCATTTTTATTTAACTTTTTAATTCAGCCCCAATAAAAATAACATATTAAAACTTTTAAAATAAGTAGATTGAATTGTGTATAACAATTCCTAAAAGTTTACAAATATAATAGCTAGTTACAAATATAATATCTAGTTAGTACAGCTAATAGAGTTCAAAAGAACGAGATCTAAATTTTCATATGTATAAAAAAAGTAATTAATTACTATATTTACAATTGTTAATTTAAAAGAGTAACTAACGTTTTATCTGCTAAAAACTATGATTAAATTAGCGATGAAATTCCGAGATGAAGATCCACATGAACAACCCTTCTTCCATTTCATCAAATTTATTTCTGGGTTTGAGATAAAAGAGAGAAAGGATCTCTCATTAACCTAAAAGAAAAAGAAAAACTAACATTCCAAAGACATGAAATCTAGAGAGAGAGAATTAAAGTAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAGGTTTCAGGACAGACGGAGAGTTGGTTGTTCAAGTAGACGGCGCCGTTTTTGGAAGCTGAGAGAAGTGACCGGCGCCGGAGCCTTCCTGACCGGCTGGATTCTTTGACCGCTGAAGAACGGTGACGGTGGAGGCGGTGGCAGCAGCATTTGCAGTAGCTTGAGATGGCTGATGGGGTTGGCCGGAAACAGCACCGGCAACTCCGATAGAGAAGTCCAAGATCTGAGACGGATCCTCGGTGGAGATGAAGTCCGGAGGGAGAACTTGAGAGAGCTGACGTTGGTGTCGCGGCCGGGGCATAGTTAGAGAGAGAAAAAGAGAGAATTTTAGAGGGAGAAAGTGAGAGAGCGCATGAAGATGGTTTGGATTTTGACGAATTTAAGAAGCAGCCACTCCATACGATCAAATCCGTTCACGCGCGCGCGTCACTTCACTCTCCATTTCCAATTTTCTCTTTCTTTTTCTCTTTTCTGTTTCCATTGCTTTTCAAATATCTAATGAAAACATGGTTGAATAGATGAGATATAAAGTTAATTACTGTCTCAAAACTAAATTCATCTTCCCATCTCTACTCGTAATTATTAAAATTCAAAGAATGTTTGTACAATTATTTTTTATAATTTCATTGTTTACATTTTATTAATTTTTCTCGTAAGTTTTCTGTTTTCCAAATTTTCCTTAATTTAACTATAGTTAGTTTTTTTTTTTTTTTTATAAAGTAACCTTTGAAATTTTAGTTAATTTTTCCTTTTTTTTAAAAGTAAAAAAAAAGATAGTTGAATTTTTTTTCTTTTTTTAATTTTAAAAAGTTGATTTGGATTTTAAAAATATTGGTACGTATATAATTATTTTTTAGATCATAAAAAGTATAGAAATTTGTGGTTTACCAAACAACTATCGAACAAGAATAGATTCATTGTCAGGTTTAGGGTTTAGATGAAGACTCAGATTAAATTTTTACATGTGAATGAGTGACCAAACTGCAGTTTAGTTTTTTCTTTTCTTTTCTTCTTTATTTTTTAAGAACAAAACTGCATGTTAGTTGACTCCATTAAGGTCGTCTGGTAAATAAAAATAGGAAAAAAGTGGATGGAGTGTACAAGTGGTTTATTGTCATGTTTAACAATTGTAGATTGAAAATCATTGGTGTTTTAGGTGTTTAAGGGTATTCATGTTTTCAAATTTTGTGTTTATATAGTACTTAGGATGTTCAACAAAACCCATCAAACTAAATTGATTGTCAAACAAATAGAATTTAATCTGTTTGATTGAATTTTATATAATAATGAAACCAAATTATGGGGTTTAGTTGGACATTACTTTTCAAAACTTAACTGAAACCGAACGGAACCAAATTAATTAAAGAGAGTGTTGTGAGACAAACATACTATATAATACTTCGTAATCCTTCACTATATGTGTTTCTCAATATTACAATGTGTTATTGAGGTTAGTTGGCTTATTTTATTATAGACAAAATTGGAGCTTAATTTCTAATATAGCTAATATCTAATATTTATTAATAAAGATATGTAGTTAACTTGGAGATTTGGTGGTTATGCGTTTATTAATAAATATATAATTAATATTTATTAATAAAGACATTCTGTTGGTTGGGATTGTTTCCATATATCCAAGTTTGTTATTAATAAATATTAACCATATTTATTAATAAATTGATGGACTTGGATGTTGTTTTGTTACGACATTTTTTACCTAAAAAATATTAGTTTGTGGCCGTGTGATATTGTTATGGTTGAAGACAAAGTGTGGCAAATGTGCAACTAAGTTATGTGTTGAAAGAAAAAGGGTTTTCTCGAAAAGCATTTGCGGTGATATATTTAGATTTGTGGAAGTGTCAGTGCTCCTTCAAGAACCTATGGGTTACAATACTGCATATTGAAGATAAGAGATTAACAAGCAATTCAAGATTGCTTAACGAAGACATTGCAAGTGGTCATTGATTAAGAGAGAATGATCCTATTAATGTTACGACAATTGTTTTCACACAATTCTTAGTTCTGATGTTTGTGAGTCAGTCCATGGTCAGCACATTGATTTATGTTTAAAGTTCAGCACATTGGTTCATGTGTAGAGTGTTGTACCCTATGTCATAACACTGTAATGGTCAATTACTACACGAGCAATATAATCCTCTTATCATGGGTCTAAGGCCCCCCAGATGTAGATGTTGTGTCATTGAACTAGGTTACCAAAGTTTGATGCGTTCTCTATACTTTTATGTGCTTCCGTAGTTGTTCTTTCTGTTATTAACTCTCGGTACAACAAACAATACAAGAATAACTATAGTGTGTGTTTTCTCACAATGCAATCAGTTGATTTCAGTTTCATAATTATATTGTAGGATATAATTCCAACTTATCAGCCATACAAGACTATCGCGTTTCGAGGGAGGTGATTAGGAGGAGTAAACAATGGGATGAAGTTTACCATATAAGAAAGGTTGTCATAGTACAAACAATTTTAAGTTCAAGTTTGTCGTTCTCAAGAGAATATCCTAATCGATTAGGACTTTACTATCTTCGGAAAGGTGTCACATTACAAGCATTTACAAGTTTACTCTATGAAAAGGTGTCATAGTACAAGTAATTTCAAGTTCGAGCTTGTCGTGTGATTAGGACATCCTTCCAAGAATGCAGTGAAGTTTCTCCCTGTTCTTTATAATTCTAGGAGTCATTTGAACATAGGTTGCAAAGTTTGTCATCGAGCTAAACATGTTTGCAGTAATTTTTCTTTAAGTCAAAGTAAATCAACTCGGATATTTGAATAGCTTGATTGTGGTTTATGGGGTCCGTATGATTAACCATCATTTTGTGGTGCTCGTTATTTTCTACATTAATGGATTATTATTCTCCAGTTGAATGGGTTTATTTGTATGGGTTTATTTGTAGATTGATCAAAAATAAGTTTTTCATATGTTTATGTCCTTTATTGCCATGATTGATCAACAATTTTCTCAAAAGGTGGAAATTGTTCAGAGTGAGAATGGAATTAATTTTAACTGCATGAAAAATTATTTTCCAAACCTCTTGTGTGGGTACACAGCAGCAACAAAATGGAAGGGTGGAATGCAAACGTAAATATATTTTGAATAATGTTGCTTGTGCTTTAAGATTTTAGGGAGAATTACCAATTTTATTTTTGGGATGAATGTGTTTTAGCTGCTCATCTACTAAATTCGACACCATCAAATGTTTTCAACAAAACTCCATGTGAGATTATTTTTGGTTGTGCTCTCTCATTTAGTGACTAACAAACTATTGGATGCTTAGCTTTCAAACATAATCAACAAGCTAAAGGTGACAAGTTTGCTAGTTGAAGTCATAAATGTGTTTTTATGTGGGAAGGGTTTAAATTTTATTTGATCTTGAGATAAAAGAGTTTTATCGGTTAATTAATTACCATGGTACTAGGGCATGCAGGTTGGATTAGGAAGTCCTGTGGTCAAACCTCTGCATTATTGTTCCCCTAATTGAAATTGATATTCTTTTGTTGAGTATTTCACATTTTTCAAGCCCACAAGTGAAGGGGAGTGTTATTGATATGAAATTAAAATTTATTTCTCCCACTACTAACTTAAATATTTTGGTCAATTGACGATTTAAGAACTATCAACCATGGTAGCTTCTCAACCTCTTGTTCTTCCCTCACTCCTAATGGTTAGTTTAGTCATCCCCTCAATCTTAAGTTTTGAACATCTCGCTCGCCACCACTTGATTGCAAACAACATATTAAGTTTCGCCATCATTTTTGCTCGACCCTGTTTATTACTTCTTTTTCAAGACGTGAATCCACAAAATCAAATTGAATTATGTGGTTTGGTTGGGTTTAGTTATATATGTATTTAAATTTATTTTTTTTATTTAGATCAATTTGGCCCCTAAATGGAACCATCAAATACCCTTATTTGGTAGAAAAATTCATAAATGGTTATATAATTTTAGCCATTGTTTTAAATGTAATAGTACTATGGACATAAACCATAAAACTAATTCAACCTACCCACTAAATATTAAGTATACTATTATTGATTAAGTTATAAACATGTTTTATGTTCAATTTTTGTATAATCATTATTTTTTTCATTATTGTATAACTTATAATTATATTCATTATATAATATATACACATTAGTTTTTTAAAATATAATTGAGTTCATAACATGAAGCATTGTTTTTCTTTTGTTTTTATCTTTCTTTAAATATTTTTTTACTTTAAATTTTAAATTTTAAAATTCAAATTATGGATACACCGAACCCATAAAATGTTCCTTTTTATAATTTATATTTTTTGGATCACAAAATTAAAAAAAAAAAATTATAACACTCCTAATTTAGAAGGGAGAACATGAAAGTATGATTAAAAAAGATTTAAAAGAAATGAACGTCACTACCAATATCAATAAAATACACATTCATTTCAATGGTTGAATCATAGAAAGTTCAAAGTTAAGTGTGCTAAGCTTTGAAAAATCCTATTTTAGGTGACCTTAAAATTTTCTTATAAAGCATCTTGAAATGAACCATGTTGGTTTGTGAGAGTAACTTGGAAATGTTAGTGTTATTAATTACTAAATCTTAATTAAAATCCTAAACCTGGGACACTACAAAAATTTTGAGAAACAAAATTTATATCGTCAAACAAGAAATTAATATATATATCTAAAAACAAAATAGAATCTAGATTTAGAACCAAATAAAACCTTCAACTTTATTATATGAAGTTTTGTGTTTATTTTCTAATATATAGATAAGATAAATTTGAAATCTAAGACTGAAATAAAATAAGTTTGGGATGTAAATAAAGTTAATGTAATTGAAAAAGTTGTTAAAAAAAGCTAAAATAATTAATGTCGGTATTTTAAATTTTGTGGTTAGTGTTATATGAATAAAGGATGTGACAAAGATTCCATAAGTATTTTTGTTCTATTTATATTTTGATTTTTAAATTTAATCTCCCTATTTTTACACCAATTTTAGAAACTGTGGTTCATTTTCTTGTTCTCATCATTCATTGCATCATGGAAAGTTACACCAATCACTTTTGACCTATAATAACTACTTCCAAACTTATCTTCATCCTCCTCTCTTAATTAGAAAAAGTAAAAATAAATAATTAGATAAATAATTGTTTTTAAGATTAAGAAAATTTGAACTCGAGACTTCTGGTTCACATATACATATAAGTGTCAATTGAACTAAGCTCATATTAGTATTATATACAAATTTAAATATATTTCAATTGTAATGTTTATATAGTATCCATATTTTAAATTTTAAATTAAAAAATGAATTATATAAAATATAGATAATAATATTTAAAAATATAATCATGTTATAAACTTAAAAACATAATATATGTACTGTGTGGTGTATTATAATTTAACACATAAATTAATATTAGTGGTTGACAAACTATTTTCATACTATGAACTATACTATGGTACCAAACACATTTTAAACAATTTTTAAATTTGAATCCAATCTAATCTTCTATCAAACATTTATTTGAGATAAAATTATATTTTCAACAAACCCTTGAGTTTATAAACAATCCATTAGTTACGTAACGCCTTGAATTTATAAAGAAAATATGAATGAATCAAAATCACATCTACATCATAGGGATGATGGGAATATGAAAGTAAGGTCAATAAAGACTTAAAATAATGTGTCATTTGCATATCCAATCCTATTTCGAGTTTACTCTCGTTTCATCATATTCTGATAATTAACTAATATACATTTTATACACACTTTAAATTTGTAATTGAAACTGAGTCATAAACTAATCTGCATGGTATTCATACATTTACATTTAGGGTGCAATAGTAATATGAAGGTATGAGATTAACTAATATACATTTACATCAAAGGTGTAATTGTAATGATTTTTTAACTTCGTGACTTCTAATTATAATATTATAATATCTTCTTGATTTTTCTACATCATTTTCTATTCAAATTTATCTTTTTTATTACATTCAGTTTTATCCTATAATTTTTTTCGATTTTTAACATATTTTCTTATCTTATAATAGTTTTATAGCCTTTCTTTTCTCATTTTGGTTCACTTTCGACTAATTCCTTTTTCAATTTTTATATACATTTTCGATTGGTACTTACATTTTTATCAATGTTTTGTCTAATTTTTTTCATACATTTTTATTTCATTTATGTTATTACTATTTATACAATTTACATAGTTCATGCATTTTTTTAACAATATTTTAACAAAAGAAAATTGTAAAAATATTCTATGCTCAATAATTTCAATCTTAATTAATCTCAAAGTTTACACAAATTTAAATTTGAATGATGGAGAAATTAACCGTACAATATTTTACTAACCACAATTGAGCTTATTAATCCATTTTTATTCGATATTTTATCAAATGTATACCATACATATATGCTTTGTAATTTATTGAAAGCACGTGAAAATACTTTGTTTTACAAAAATTAATTAAATCTTACCTAAAGGTAAAATAATTTTAATTCCTCACTCATTTTTGAAGTTTAACATTGGACCACTTTGATAAGTTTTGAAAATAAAACTTTAAATTAAGAATTTGATACAATCTGACATGTTTATAGGTAAAATTATTCTATGTTGACCTCTAGACTGAAATGTTTGTTCATCATAGTTTTTATAATTTTGGATGTAGTTCATGTATAGCCTACAGACTAATGATGCCAATTGTACATGTTGCTAACTAAAGTGTGGACTATGTATGTGAATTAATAATTTATCACATTAGGTTATTTTATTAAATTAAGCCTATTATGTAATCTATTTAATTAAGGTCCAAGATTCCTAATTGAGTATGGATTAAATGGGTAGAAGCCTATTACTAGATTGATTAGGATTTAATTGGGATCCTGATCGAACTAGTATATAAAGAGACTTAGGGTTATGGTCCCCGAGATACTAAGACAATAAGCACTCAGTCTTTCTTGTATCTCATCGAGAGAAAGATCTCACTAAGGGCATTCACGGTTTTTCTCACTAAGGGCATTCACGGTTTTGGTTGAGGAAGATAATAACTATTTTATAGCCATTTGGCAACGATTATTTTATAGCCATCATCAATGGAATCAAATATGTAACTTATTTTTGATAATTTGGCATGAATGATCTTGGGTTAATCTATTATATAGATTTAAAGTAAATATGCCAACAAGTGGTATCAGAGCATGAATTTCATGTTGAATTGTTGGAATATGTTTGTTTTTTATTGATTTCTTGATCCAAGATTTGATTAATCATATTTTGGTTTTAAGTTTAATTGTTCTTGATTCAAGATTTGATTAAACATATTGTGGTTTTAAAGTTTAATGATTCTTGATTTAAGATTTGATTAAACATATTGTGGTTTTTTCAAAGTTTAATGTTTTCTTATTTAAGATTTGATTAATCATATTGTGGTTTCAAAGTTTAATATTTCAAATTTATTAATCATATTGTGGTTTCAAGTTTAATTGTTATTGATTCAAGATTTGATTAATCATATCGTGGTTTTAAATTTAATTGTTCTTGATTCAAGATTTGGTCAATTATATCGTGGTTTTAAGTTTAATTTCTCTTGATTCAAGATTTGGTTAATCATATTATGGTTTAAGTCTAATTGTTTTAGCTTCAAGATTTGATTAATCATGTTGTGAATTTAAGTTTAATTGATAATGTTGTAGATTTAAGATTTGATTCACCATGTTGTGAATTCATGTTTAATTTGATTCAGATTAATTGATCATCTTGTGGATTAAACTTGAATGATATTTTTTTGCAATATTCACATGTTTATGTTATATTAATTGTATTTTAATGTATTCAATTATTGGATGAATTTTGGTAAAGATTATTTGGTGTTCTTCCTCCATTATGTTTTTTTTTACAATAATAAAATTATTATTATTGTGTCTTATTTTTTAGATTGAATTGGTCAAAATAACATGTTGCCAAAGCAGCCTATGTTATCTACATTAGTTTAATTCTAGACTAGGATATGCATATTCATTGATTTATACGAATAATTATCAGCCCAAAGGAAGATAATTATTTGGCCAAATTATGAGTATGTGTGTGGTAATCAGTAGGTGACAATTATAAGGATTGCTCATGTGAAAAATAGTCGGTCCAAAGAAAAGCTAATTTTTTTACAGAGTTTACTGTCAGTACGTACTTTGATTACTACGTTGAGAGTACCGTTTACACAGTTGATGTTTCTACCCAAAGGTTGGACATCAATGTTGGCTAGGTATCTTGTAAAAGGGGCCCACCATATATGTGAAATTATTTTGTCATATTTTATTTTATGACAACCATTAATTGTGAGTATATAATTTATTTGTTTGCTCTTTGTTTAGTTGGTCTTGCTCAAATATCTGAAAATCTGTGTTCGATCCCTAAGTTGAATGGATTGAATTTCAAAATTTGACAGAAAAGCCTAAAGATACTTCTCGAGTGTATGAATCTGGACCTTGCATTAAGGACCGATAAATCTGCTTCTAATAAGAAACAGTCAAATTGCATGTGTCTCGTGATTATTAGGCACTCCATTCAAGAGTCTTTTTGGGGTTCTATCACTAAAAGTGAAAATGTCAAAAAATTTCTTGCCGAAATTGAAAAATATTTTGCTAAAATTGAAAAAGAGGAAGCAAGTAGTCTTTTGACTACTTTAACTTCCATGAGGTATAAGGGCAATGGAAATATAAGGGAGTACAATATGCTAATCTCACTGGTAAATTAAAGGCACTTGATATCGAGATAAATAAAAATTTACTTGTACATCTGGTACTTATCTCTCTTCCTGCACAATTCACTCAGTTTAAGATAAGTTATAATACTCAAAAGGATAAATGAAGTATTAATGAGCTTATCTCACAATGTGTGCAACAAGAAGATACGATTAAGAGAGAAGGGATAAAAAGTGCTCACTTGGCAACTAACTTTCATAGTAAGAAGTATGATTAATTATTCTTCTTTACTGGAATTCCTATGAGGTGAGGCACTAAAGACTGCAGTATATATCCTCAATAGGGTACCTACTAAAGCAGTAGTAAAACCCCTTATGAGTTGTGGATAGGAAAGAAGCCTAGAATTAGGCATCTTCACGTCTGGGGTTGTCTAGCTGAGGCTAGGCCTTACAGGCCTAACGAAAGAAAATTGGACCCAAGAACTATTAGTTGCTATTTTGAGCATTCTTGGGGTTTCAAGTTTTATGATCCCACTTCGAGGTCATTTTTTTAGATTGAAAATGTCAGATTTCTTGAGAATGTTGAGTTTGAGGGGAAGATAACATAAAGAAAGTTATCTTTGAAGAAGAATTAGGGCATAGATGATGTTCAGACTCTAATTCTTGACTTGACTATGAAACCAATTATAGAATAAGACAACAATGAAGTTCCTATTGAATCTGAAGTTCAAACTCAACAACCTCAAGAAGTGTCATTAAGGAGGTCCACGAGAGAAAAGAGCAGTGCAATTTCATATGATTATATTGTGTTTCTTCAAGAACATCAGGATAATATGGGCATAATGGAAGATGATCCAATAAACTTCCAACAAGCTCTACAAAGTTCTAACACTCAAAAGTGGATAAATACTATGGAAGAGGAAACAAAATCCATGTAATTAGACAATGACATTTGGGACTTGTCGAATTGCCATCAAGAGTGAAACTCATAGGTTGTAAATTGATATTTAAAACCAAAAGGGATTCACAAGGCAAAAACGAAAGATATAAAGCCCATCTTGTTGCAAAGGGTATTACTCAAAAGGAAGGCATTGATTACAAAGAGACTTTCTCTCCAATTTTGTCGAAAGACTCTTCTTGGTAGCTCACTTTGATTTAGAGCTACACCAGATGGATGTGAAAATTGTGTTTCTTAATGGAAACATTGATGAGACAATTCATATGGTACAACCAGAAAACTTTGTATCTAATAATTCAAAGTCTATGGTGTGCAAATTGAAGAAATCCATCTATAGTCTCAAACAAATCTCTCATCAATTGTATCACAAATTTCATGAAGTAATTACCTCTTGGTTTTGAGGTCAATATAATGAAAAATTGTGTATATCACAAGTTCAATGGGAGTAAATCTATTTTCTTAGTGTTATATGTTGATGACATACTCATAGCAAGTAATGATGTAGGTTTATTGCATGACACTAAGAGATTTCTCAAAAGAAATTTTGAGATGAAGGATCTTGGTGATGCTTCTTTTGTATTAGAAATTGAAATATTGTGAGATTGCTCTCAAGGTATTTTGAGATTATCACAAAAAAACTACATTGAATTTTTTTTAGTAGATTTGGCGTGAAAGATTATGCACTAGGAGATACCCCCGTTGCTAAAGTTGATAAATTTTATTTAGGTCAATGCTCCAAGACCACACTCGAGAATAATGAGATGCAGAAGGTTCCCTATGCATCGGCTATTGGAAGCCTAATGTATGTTTAAATTTGAACGCATCTAGATATTGCGTTCATAATTGAAGTGTTAGGCAGATATTTGAGCATCCTGAGGATGGATCATTAGAGAGCAGCCAAACGGGTTATGAGGTATTTACAAAGAACAAAAGATTATATGCTTACTTATATTTTCGAAATCATTAGTATTCTGATTCCGATTATGTTGGATGCCATTATATACACTTTGTGATCCATTTTAGGTTATAACTTCATGTTGGTTGAAGGAGTTATATTTGGAAAAGTGTTAAACAAACACTTATGACTTCTTGTGAAGAATATAGCATGTTATGAGGCATCTAGTCAATGGAATGTGGTTGTGAAATT

mRNA sequence

ATGAAAAATGTAGTTGGACAATGTTGTAGACATCTCTTTCATGAGTATAGTAGTACTCGAAGTGGCAGTGGACCAGGATGTACTAGTACTAGCACACAAACTGTCTCGGGCTTGGATGTGATTATTGATTTTCATCCAAATGAAAACGTGGGTGAAGATTTTGTCTATGACACCATTGTTGAGGAATTTGAAAGTGATGCGACTACTACATCTTTCAAGCAGGAGTCATCAGATATTGATATCTATTTGTTGGAAGCCAATGTTAGGAACGAAGGTGATTTTGACATACTATAGTAGTGGAATACGAACAGTGATCGACTTGAGGTTCTTAGTCAATGGCTAAAGATATTTTGGCTATTTTAGTTTCTACTATAGCGTCTGAGTCGATTTTTAGTACCGAAGGACGTATTGTTGATTCATCACATTGCTCATTGGCTCCTAAAACAGTGGATGCTTTCATATGTACTCAAAATTGGCTAAATTTTGATCCAACAGATTTTCAAGTTCAACATGAATTGGAAGAGGCTTCAACATTTGAAGAAGGTATTATACAAATTTTTTAATGATGTGTATTTTATAATTGTAATGTGTAATTTTACTGACCTCTTGAAATTTTCATGATGGTTCTAGGTGGTTATGGATAATGAAAAAGAACTTGAAGACCTTCCAGATTTTGCAAAGTTGTCAATTATCGATTACTAACTAATTTTTAAATATTTATGACCCAGAGAATTAAAGTAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAGTGACCGGCGCCGGAGCCTTCCTGACCGTCAATGGAATGTGGTTGTGAAATT

Coding sequence (CDS)

ATGAAAAATGTAGTTGGACAATGTTGTAGACATCTCTTTCATGAGTATAGTAGTACTCGAAGTGGCAGTGGACCAGGATGTACTAGTACTAGCACACAAACTGTCTCGGGCTTGGATGTGATTATTGATTTTCATCCAAATGAAAACGTGGGTGAAGATTTTGTCTATGACACCATTGTTGAGGAATTTGAAAGTGATGCGACTACTACATCTTTCAAGCAGGAGTCATCAGATATTGATATCTATTTGTTGGAAGCCAATGTTAGGAACGAAGGTGATTTTGACATACTATAGTAGTGGAATACGAACAGTGATCGACTTGAGGTTCTTAGTCAATGGCTAAAGATATTTTGGCTATTTTAGTTTCTACTATAGCGTCTGAGTCGATTTTTAGTACCGAAGGACGTATTGTTGATTCATCACATTGCTCATTGGCTCCTAAAACAGTGGATGCTTTCATATGTACTCAAAATTGGCTAAATTTTGATCCAACAGATTTTCAAGTTCAACATGAATTGGAAGAGGCTTCAACATTTGAAGAAGGTATTATACAAATTTTTTAATGATGTGTATTTTATAATTGTAATGTGTAATTTTACTGACCTCTTGAAATTTTCATGATGGTTCTAGGTGGTTATGGATAATGAAAAAGAACTTGAAGACCTTCCAGATTTTGCAAAGTTGTCAATTATCGATTACTAACTAATTTTTAAATATTTATGACCCAGAGAATTAAAGTAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAGTGACCGGCGCCGGAGCCTTCCTGACCGTCAATGGAATGTGGTTGTGAAATT

Protein sequence

MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTSTSTQTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYDTIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLKIFWLF*FLL*RLSRFLVPKDVLLIHHIAHWLLKQWMLSYVLKIG*ILIQQIFKFNMNWKRLQHLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLPDFAKLSIIDY*LIFKYL*PRELK*KRKKKKK*PAPEPS*PSMECGCEI
Homology
[Close]
BLAST of Chy2G037980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SGU9 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold1204G00520 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 185.7 bits (470), Expect = 2.6e-43
Identity = 119/241 (49.38%), Postives = 140/241 (58.09%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTS---TSTQTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYD 60
           M NVV QCCRHLFHEYS+TRSGS  GC+S   TSTQTVSGLD  IDF  NENVGEDFVYD
Sbjct: 278 MGNVVEQCCRHLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVGEDFVYD 337

Query: 61  TIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLKIF 120
           TIVEEFE D +TT F+Q SS+IDIYLLEANVR EGDFDIL  W  NSDR EVL Q     
Sbjct: 338 TIVEEFEDD-STTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLGQ----- 397

Query: 121 WLF*FLL*RLSRFLVPKDVLLIHHIAHW-----LLKQWMLSYVLKIG*ILIQQIFKFNMN 180
                    ++R ++   V  +   + +     ++     S  LK     ++ +     N
Sbjct: 398 ---------MARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLALK----TVEALIICTQN 457

Query: 181 WKRLQHLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLPDFAKLSIID 234
           W              +D   +       +  KF   F VVM+NEKELEDLPDF KLSI D
Sbjct: 458 WLN------------SDPIHLQFQPELKEASKFEEGFRVVMENEKELEDLPDFDKLSITD 487

[Close]
BLAST of Chy2G037980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T9L0 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold36G002130 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 179.9 bits (455), Expect = 1.5e-41
Identity = 118/236 (50.00%), Postives = 137/236 (58.05%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTS---TSTQTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYD 60
           M NVV QCCR LFHEYS+TRSGS  GC+S   TSTQTVSGLD  IDF  NENVGEDFVYD
Sbjct: 512 MGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVGEDFVYD 571

Query: 61  TIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLKIF 120
           TIVEEFE D +TT F+Q SS+IDIYLLEANVR EGDFDIL  W  NSDR EVL       
Sbjct: 572 TIVEEFEDD-STTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLGH----- 631

Query: 121 WLF*FLL*RLSRFLVPKDVLLIHHIAHWLLKQWMLSYVLKIG*ILIQQIFKFNMNWKRLQ 180
                         + +D+L I      L+          IG   +    + ++  K ++
Sbjct: 632 --------------MARDILAI------LVSTVASESAFSIG-GRVADSSRCSLAPKTVE 691

Query: 181 HLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLPDFAKLSIIDY 234
            L        +D   +       +  KF   F VVM+NEKELEDLPDF KLSI DY
Sbjct: 692 ALICTQNWLNSDPIHLQFQHELEEASKFEEGFRVVMENEKELEDLPDFDKLSITDY 720

[Close]
BLAST of Chy2G037980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CXI1 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G004160 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 179.5 bits (454), Expect = 1.9e-41
Identity = 117/236 (49.58%), Postives = 137/236 (58.05%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTS---TSTQTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYD 60
           M NVV QCCR LFHEYS+TRSGS  GC+S   TSTQTVSGLD  IDF  NENVGEDFVYD
Sbjct: 410 MGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVGEDFVYD 469

Query: 61  TIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLKIF 120
           TIVEEFE D +TT F+Q SS+IDIYLLEANVR EGDFDIL  W  NSDR EVL Q     
Sbjct: 470 TIVEEFEDD-STTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLGQ----- 529

Query: 121 WLF*FLL*RLSRFLVPKDVLLIHHIAHWLLKQWMLSYVLKIG*ILIQQIFKFNMNWKRLQ 180
                         + +D+L I       +           G  ++    + ++  K ++
Sbjct: 530 --------------MARDILAIP------VSTVASESAFSTGGRVVDS-SRCSLAPKTVE 589

Query: 181 HLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLPDFAKLSIIDY 234
            L        +D   +       +  KF   F VVM+NEKELEDLPDF KLSI DY
Sbjct: 590 ALICTQNWLNSDPIHLQFQHELEEASKFEEGFRVVMENEKELEDLPDFDKLSITDY 618

[Close]
BLAST of Chy2G037980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CR68 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold84G001050 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 179.5 bits (454), Expect = 1.9e-41
Identity = 117/236 (49.58%), Postives = 137/236 (58.05%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTS---TSTQTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYD 60
           M NVV QCCR LFHEYS+TRSGS  GC+S   TSTQTVSGLD  IDF  NENVGEDFVYD
Sbjct: 526 MGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVGEDFVYD 585

Query: 61  TIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLKIF 120
           TIVEEFE D +TT F+Q SS+IDIYLLEANVR EGDFDIL  W  NSDR EVL       
Sbjct: 586 TIVEEFEDD-STTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLGH----- 645

Query: 121 WLF*FLL*RLSRFLVPKDVLLIHHIAHWLLKQWMLSYVLKIG*ILIQQIFKFNMNWKRLQ 180
                         + +D+L I      L+           G  ++    + ++  K ++
Sbjct: 646 --------------MARDILAI------LVSTVASESAFSTGGRVVDS-SRCSLAPKTVE 705

Query: 181 HLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLPDFAKLSIIDY 234
            L        +D   +       +  KF   F VVM+NEKELEDLPDF KLSI DY
Sbjct: 706 ALICTQNWLNSDPIHLQFQHELEEASKFEEGFRVVMENEKELEDLPDFDKLSITDY 734

[Close]
BLAST of Chy2G037980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DAN8 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold237G001750 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 179.5 bits (454), Expect = 1.9e-41
Identity = 117/236 (49.58%), Postives = 137/236 (58.05%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTS---TSTQTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYD 60
           M NVV QCCR LFHEYS+TRSGS  GC+S   TSTQTVSGLD  IDF  NENVGEDFVYD
Sbjct: 461 MGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVGEDFVYD 520

Query: 61  TIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLKIF 120
           TIVEEFE D +TT F+Q SS+IDIYLLEANVR EGDFDIL  W  NSDR EVL Q     
Sbjct: 521 TIVEEFEDD-STTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLGQ----- 580

Query: 121 WLF*FLL*RLSRFLVPKDVLLIHHIAHWLLKQWMLSYVLKIG*ILIQQIFKFNMNWKRLQ 180
                         + +D+L I       +           G  ++    + ++  K ++
Sbjct: 581 --------------MARDILAIP------VSTVASESAFSTGGRVVDS-SRCSLAPKTVE 640

Query: 181 HLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLPDFAKLSIIDY 234
            L        +D   +       +  KF   F VVM+NEKELEDLPDF KLSI DY
Sbjct: 641 ALICTQNWLNSDPIHLQFQHELEEASKFEEGFRVVMENEKELEDLPDFDKLSITDY 669

[Close]
BLAST of Chy2G037980 vs. NCBI nr
Match: KAA0057608.1 (transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 182 bits (461), Expect = 3.70e-53
Identity = 117/236 (49.58%), Postives = 137/236 (58.05%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTSTST---QTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYD 60
           M NVV QCCR LFHEYS+TRSGS  GC+STST   QTVSGLD  IDF  NENVGEDFVYD
Sbjct: 1   MGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVGEDFVYD 60

Query: 61  TIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLKIF 120
           TIVEEFE D+TT  F+Q SS+IDIYLLEANVR EGDFDIL  W  NSDR EVL Q     
Sbjct: 61  TIVEEFEDDSTTP-FEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLGQ----- 120

Query: 121 WLF*FLL*RLSRFLVPKDVLLIHHIAHWLLKQWMLSYVLKIG*ILIQQIFKFNMNWKRLQ 180
                         + +D+L I       +           G  ++    + ++  K ++
Sbjct: 121 --------------MARDILAIP------VSTVASESAFSTGGRVVDSS-RCSLAPKTME 180

Query: 181 HLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLPDFAKLSIIDY 233
            L        +D   +       +  KF   F VVM+NEKELEDLP F KLSIIDY
Sbjct: 181 ALICTQNWLNSDPIHLQFQHELEEASKFEEGFRVVMENEKELEDLPGFDKLSIIDY 209

[Close]
BLAST of Chy2G037980 vs. NCBI nr
Match: KAA0048472.1 (transposase [Cucumis melo var. makuwa] >TYK28268.1 transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 181 bits (459), Expect = 7.40e-53
Identity = 122/250 (48.80%), Postives = 137/250 (54.80%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTSTST---QTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYD 60
           M+NVV QCCR LFHEYS+TRSGS  GC+STST   QTVS LD  IDF  NENVGEDFVYD
Sbjct: 1   MENVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSSLDANIDFDSNENVGEDFVYD 60

Query: 61  TIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLK-I 120
           TIVEEFE D+TT  F+Q SS+IDIYLLEANVR EGDFDIL  W  NSDR EVL Q  + I
Sbjct: 61  TIVEEFEDDSTTP-FEQRSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLGQMARDI 120

Query: 121 FWLF*FLL*RLSRF-------------LVPKDVLLIHHIAHWLLKQWMLSYVLKIG*ILI 180
             +    +   S F             L PK V  +    +WL                 
Sbjct: 121 LAIPVSTVASESAFSTGGRVIDSSRCSLAPKTVEALICTQNWL----------------- 180

Query: 181 QQIFKFNMNWKRLQHLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLP 233
                 N N   LQ   ++                  +  KF   F VVM+NEKELEDLP
Sbjct: 181 ------NSNPIHLQFQHEL-----------------EEASKFEEGFRVVMENEKELEDLP 209

[Close]
BLAST of Chy2G037980 vs. NCBI nr
Match: KAA0025368.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 189 bits (479), Expect = 1.04e-52
Identity = 119/241 (49.38%), Postives = 140/241 (58.09%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTSTST---QTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYD 60
           M NVV QCCRHLFHEYS+TRSGS  GC+STST   QTVSGLD  IDF  NENVGEDFVYD
Sbjct: 278 MGNVVEQCCRHLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVGEDFVYD 337

Query: 61  TIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLKIF 120
           TIVEEFE D+TT  F+Q SS+IDIYLLEANVR EGDFDIL  W  NSDR EVL Q     
Sbjct: 338 TIVEEFEDDSTTP-FEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLGQ----- 397

Query: 121 WLF*FLL*RLSRFLVPKDVLLIHHIAHW-----LLKQWMLSYVLKIG*ILIQQIFKFNMN 180
                    ++R ++   V  +   + +     ++     S  LK     ++ +     N
Sbjct: 398 ---------MARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLALKT----VEALIICTQN 457

Query: 181 WKRLQHLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLPDFAKLSIID 233
           W              +D   +       +  KF   F VVM+NEKELEDLPDF KLSI D
Sbjct: 458 WLN------------SDPIHLQFQPELKEASKFEEGFRVVMENEKELEDLPDFDKLSITD 487

[Close]
BLAST of Chy2G037980 vs. NCBI nr
Match: TYK20303.1 (transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 177 bits (449), Expect = 2.37e-51
Identity = 115/236 (48.73%), Postives = 136/236 (57.63%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTSTST---QTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYD 60
           M NVV QCCR LFHEYS+TRSGS  GC+STST   QTV GLD  IDF  NENVGEDFVYD
Sbjct: 1   MGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVLGLDANIDFDSNENVGEDFVYD 60

Query: 61  TIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLKIF 120
           TIVE+FE D+TT SF+Q SS+IDIYLLEANVR EGDFDIL  W  NSDR EVL       
Sbjct: 61  TIVEKFEDDSTT-SFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLGH----- 120

Query: 121 WLF*FLL*RLSRFLVPKDVLLIHHIAHWLLKQWMLSYVLKIG*ILIQQIFKFNMNWKRLQ 180
                         + +D+L I       +          IG  ++    + ++  K ++
Sbjct: 121 --------------MARDILAIP------VSTVASESAFSIGGRVVDSS-RCSLAPKTVE 180

Query: 181 HLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLPDFAKLSIIDY 233
            L        +D   +       +  KF   F VVM+NEKELEDL DF KLSI DY
Sbjct: 181 ALICTQNWLNSDPIHLQFQHELEEASKFEEGFQVVMENEKELEDLSDFDKLSITDY 209

[Close]
BLAST of Chy2G037980 vs. NCBI nr
Match: KAA0040954.1 (transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 177 bits (449), Expect = 2.37e-51
Identity = 116/239 (48.54%), Postives = 132/239 (55.23%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKNVVGQCCRHLFHEYSSTRSGSGPGCTSTST---QTVSGLDVIIDFHPNENVGEDFVYD 60
           M NVV QCCR LFHEYS+TRSGS  GC+STST   QTV GLD  IDF  NENVGEDFVYD
Sbjct: 1   MGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVLGLDANIDFDSNENVGEDFVYD 60

Query: 61  TIVEEFESDATTTSFKQESSDIDIYLLEANVRNEGDFDIL**WNTNSDRLEVLSQWLKIF 120
           TIVE+FE D+TT SF+Q SS+IDIYLLEANVR EGDFDIL  W  NSDR EVL    +  
Sbjct: 61  TIVEKFEDDSTT-SFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKMNSDRFEVLGHMAR-- 120

Query: 121 WLF*FLL*RLSRFLVPKDVLLIHH---IAHWLLKQWMLSYVLKIG*ILIQQIFKFNMNWK 180
                         +P  ++       I   ++     S   K    LI        NW 
Sbjct: 121 ----------DILAIPVSIVASESAFSIGGRVVDSSRCSLAPKTVEALIC-----TQNWL 180

Query: 181 RLQHLKKVLYKFFNDVYFIIVMCNFTDLLKFS*WF*VVMDNEKELEDLPDFAKLSIIDY 233
                        +D   +       +  KF   F VVM+NEKELEDL DF KLSI DY
Sbjct: 181 N------------SDPIHLQFQHELEEASKFEEGFQVVMENEKELEDLSDFDKLSITDY 209

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy2G037980 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy2G037980 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7SGU92.6e-4349.38Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like OS=Cucumis melo var... [more]
A0A5A7T9L01.5e-4150.00Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var... [more]
A0A5D3CXI11.9e-4149.58Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var... [more]
A0A5D3CR681.9e-4149.58Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var... [more]
A0A5D3DAN81.9e-4149.58Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var... [more]
BLAST of Chy2G037980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0057608.13.70e-5349.58transposase [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0048472.17.40e-5348.80transposase [Cucumis melo var. makuwa] >TYK28268.1 transposase [Cucumis melo var... [more]
KAA0025368.11.04e-5249.38zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Cucumis melo var. ... [more]
TYK20303.12.37e-5148.73transposase [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0040954.12.37e-5148.54transposase [Cucumis melo var. makuwa][more]
BLAST of Chy2G037980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 240..259

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy2G037980.1Chy2G037980.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0046983 protein dimerization activity