Chy2G029210 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy2G029210
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH02: 3970450 .. 3976071 (-)
RNA-Seq ExpressionChy2G029210
SyntenyChy2G029210
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGTTGTTCTCTTGTTATTTCCCATGTCTTTTCTTCTGGCGGAGATCCAAGTTCAGGTTCGTCTCATATAAAATTCCAGATGTAGTTGTCTGTTTTGTCCACCGTCTTCATTTTGATTGGGGTCGGTGTTTACGGTGCGGAATAACATCTTTCATAAATAACAGGGTTTTTACCAGATGATCTAGGTCTCTTCCGATTGTATTACTAGTCTGAATGGACTCTTTAATACAAGACAAGCGGGGGATTTCAATATCAATGCGAGGAGAAAACGATATCTCGGATTTAATCCAACCGTGAGTGGTTTTTGGCAGTTTCCTTATGTAATTTCATCAAAGGAAGGTTGATTTGATTAGAGTATTGTTATGGATGTATAAGATATCAGGCGGAACCGTCCCTATTTTATTAGGGAGGCGGTTTCTGATCGATCTTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCAACTACGTTAATGAAAAAAAAAGTTTTTTGGGTTTTGAGGAGGGATCGCACGGGGATTGCCCGGGATTCCTTCTCTTTGGTGTGTGCCGTTTCCTCTCTCTCTCTCTCTTATCTCTGTGCATATTATTATGCGTTGCTGCCCACAGTTGCTTGCATCCTCAGGGATTGCTCGCTCGATCGTTCTTGCTCAACACGTGCTCGTTCTTGCTCAATTTTTTTGATCTCAAATGAAATCGTTGGCGAACATGTCACAAAGGTAAAAACAGTAAAACAACAGCGTTGGTAAGTAGAATAATATATTAACTCTGATTAGTCTTCTATAAATTAGCCGGTATATAATCTCTATTCGTTAATTAGCATGATCTCATTAGTATTCGTGCGCTTTTATATAGTGTAGTTCTATCTGATATCTTGGCTACATGGGTAATTTTACTGAGATTTGTTGCCTTCAGGTATTAATAACAACTATATCTTCTAGGGCCAAAACCAAAATTTCTTGCTCTCACAATTGCCAGTCATGTTAATTTTTAATCAAATTCCTAATGGAACATTTTCTTTCGGTTAATTTGCAATTTTGCTTTAGATTTTGGAACCCCTAAAACGTGGACAACAAAGTAAAGAGAACAAAGAAACATACAAGTGAGACCGGTGTTAATTGCTATAATTTTAATAACAAGAATGAAAAACCAAAGGGTTATCAGATGGTGTTGGATACTGGTTTTGTGTAGGTTCTGTTCAAAATCTAATCAAACGAGTTGTGCATGGCTTTGGATAGTTTTTGCGTTCAGATTTTTACCGTGTACACACAAGGAAAATTGTTAAGTTCTCCAGAATCCTATTTCTCGCTTTTCATTTACGTGGTATATATATATATATTGTTCATTTTGTCCCCAGTGAGTTGTGTTTGTGAACGTTAAAATATGGTACTTTATGTATATGTTGTTGTCCAAGCATGAATTTGTATGTAGTCTGTATTTTGTTACAACTATATTGTAAAGCACATAGAAAGGACGGATGAAGAACTTGTATTGGAATGGGTCGCCTGGCTTGCACTTTGCCGTTGCTGAGCTGTTTGATCTGCGGATAGCTGTAAAGTTTTGGAGTGTGAATGCAATCGTTCTTTCTTGGTAACTTCAATTTTTGGATTGTCATTTAATTAAGCAGTTAAGCTTTGAAGCTGTGTTCGAACTCTTCTTCTGAGTAATGTTCTTTTTTTCAATCTATTTAAAATATATATATAATGTCAAAATTTGTTTGTTTCAGATTGATGTATGTAAAGATGTTTTTGGGTATAGTAGTTTTCTTAGCCAAATGAGCTATGTTCAGATGGAGATTGTTTTCAAATGTATATGGAGTTCATACAACCTCGATAAATACCTTCTTGCATTTAACTCTTTAGTATTAAGCTTAGCATGTGAGTGGTCAGCTGTGTTTGTGTATAGAGGGAGGTCATTCAATTTCGATAGAGTTCATTTCATGTAGGAGGAAGTGATTTTTCCATTTGTTGAATAAAAAGATCTCTGACCCGTTCATAATATATTAGTGTTGTGTTTGTAATTCATATCATTTGGTGAAAGATGTTCCTGCAAGGTTTTATGGACTTTTTACGTAATCACTTGTTCTTTAGGATACAAAGATTAACGAGTGAGATTTTGGTATTAGTGGGAGATGCTTCTTAATTATGTCAGAATTTGTCTTATTTGGTAGGAGATGGCGATGCTATATGTTTAAGGTTTCTAATCTTGCACTTCAGTTTGATGTCAAATCTTATGTCCATTTCAAGGTTTGAAGATAAGTGAGAGGAGATCTTACTCTTTTGGGAGCACCATATCATTGAATGTCTAGTGATTTAGATTTTGTACCCAGTCTTCAAGACGGTTACAATAGTAGTTGAATGTTATTGGGTTTGTAGGTTTTTGCAAGTTGGATTTTCAAACCGCTCTAGGTCTTTATGGTTTTGTGAAACTTATTCATGTATTCAAGATTTTACTAGCGTAACCTTGTAATATTAAACTGTTTTCAATTGAGTTCAAGATGGGAGGTCTATTTGTTTAATATTTCCATCATAATACTCTTTTTTATAACATTTTTAATGTTTGAAAGTAGCTGGGAACTTTATATTATTTGGTGAAAGATGATCCTCCCAGGTTTTAAAAAGCTTATATCATTTGGTGCTCCAAAGTTTAAAAGTCTTTTAATCCAACCATGAATGATCTAGGATTTGAAGATCGTTGGGCACTAGTCTCTTAAATTTCTGACAACTCCTAAGGTGTTTGAAATTCAATGGAGATGTCGTTAATAATTATCAAGCAGGCGCATATCGTTGGGCACAAGTTTTTTGAGTTTGGCAACTCCTAAGGTGTTTGAAGTTCAATGGAGATATTGTTAATAATTCTCATCGAGGCTCATATCATTTGGTGAAAAAACAATCCTGCCAGGTTTGAAGATTAGACGGGTGATGGCTTTTGAAATTTTGTTAAGTTTATACATTTTTGTCGAACACCTCCTTACATGTAGGTGTCTGGTATAACTATGAGATATCATTTTATTACAGAGTATTATATTTTTCAAGGATCGGTGGATGCTGTTATTGATTATTGTAAGAGAGTTCATATCATTTTCAGTAGGAGATATATTGATATTTGTTTTTGACTTCTAACCTTGGCTGGTGATCGAGATTTTGTAACCAATTCTTAAGGTTGTTTGTTAACATTCCTTTGGTTTCTGTACAAAATTTTCTAATTCCTTTGTGCATAACCATGTAAAATTGAGTTCAATGTGTGATTTTCCCAGTGCGTTCGAATAATTGTTGAAGGGTATGTTCAGTTCCAATCTCTTGGTAAGAGACGTTGCCTTTTCTTTCTCTGTCTCGTAAAAAAAGTTTCTAACTTTTTGATGTCTTATTTGATGTGGGTAGGAATTCCATAAGACTGTTGACAACTATATCTTGTTTGGAGCATATTTTATGGTTTGGGGACACTACTGTACAACAATCTCCAATTCCTATAGAGGCTCATATAATTTACCGGGCGATTGTTTTTAAATGTTAAAGAGGTAACTAACTTCATTGGAATAAATTATCTTATGTAGATAGTGAACTTATTAAAGATCGTAGAAGATCTCCGTTTCCTAGGAATCCTTTGATGATGAATAACTTCTATTCTATCATATACAGAAATCCAGAATAACGAGCCAGAAAAGATGCATGCCAAAAACATACATGTTCATTAGCATGTTTCCTTGGTTACGCTACTGTTACTATCTATGTATACTTGGAAAAAAAAAAAAACCTCTGTTAAAAATTACAAAAATATGATCACATTCTGAGAGATATTCTTCTCTTTTGATTGGCATTGTTTATTCCTTTTCCTTTCTTTCTGTTTCTTACAAATGGGGAATAAGATCTATTGAGCAAGAAAATTTTGTTTTCTAGGCTCCTCTTGGATGTAAATTAAATAATAACCATACACAAGCACAAATCTTAAACAAGTTTCAAGCTTCTTTTCATGTATGAGCTTGTGAGCTTGCCTTTTAGCACAAGTTCCTCCGCTGTGAGGTTAGCTCATACAAATAAAATCCTTGATCATATACAAAGATTAATATATCTATATGCATAGTCTTTTTCATTGTAGAAGTAGATACGTTTAAATAGTTGGTAGCCTTTTTTATTTAACAAACATTTTGTGTGCATCTATTTGAATGAGATAGAAAAGTTTCAACTCTGTCTCCTTTGTAGGCGATCGGTTGTGCTCACTAACTGGTAGTTGAAATGTTTCCAAATAGTGTTTTAATATTTGTTTGTTATAGATAAATAGCATGCACAATAATGTAAAATAGAATAGAAGTCTTCCTCAATAATGTAAAGCAGATGTAGATAAGCTTGGTCAAAAAATACATATAGCTTCGAGATTGGAATTGACCACAGGGTTTATATATTTTTTGATAGACAGAAGAAAGACAACGAATGTGTAGATATTTGAAGAAAATAGATCAACAAGGATTATTCGTTTGTTAGGGGGGCCAGCTAGCATCTAGTTGGCTCCGCTGTTGGTTGTTGATATGTGGGTTTCCTCTTATTAATATGGATTATTAAAGATGTGTTTACCTAATTTCAACTTCCCTGCATTCAGTTTAATTCTATTTAATACCCAACAAATCAAAATCCTCTCTCAACCACCAAAAAAAAAAAGTCAGTCGATGTCATTAATTTGTTATTAAGTAATGACCCAAAGAAACTAACTAAATAAATAGAAAGGTGAAACTATGACATTAATCTAAATTTAAGATTTTAAGTGGATGAAATTAAAAGTTTATGATATAACGTGACAAGGTGCGCATTTTCAATGTGTCATTGTCTTGTTGTGTTTAGGAAAAGATGTCCAAGAAAAAAAAAGATAAAGGAGACAAAATATACATGCAAAACTAAGTTTAGTAGCCTGGTTTTTTTCCCATGAAATATATGTAGTTTTGTCTGTTATTGGAAAAAGATAGTTGTTGTTTTCACATAGTCAGATTATTAGTAGGGGAGTCGGTTGAAGCCTCAGCTGGGGAGGCAGAGTTCGGAATAAAGGTAACTGAAAGAGGAAGTACATCTTTCATGAGTTGCAACAATAGGATCAATAGGAAATGCTCTTTCATATTTATCAGTTCCCATGCGTAATGAGTCACTTCAATAGTCAGTAGGGCCGGCGGAAGCAAGGGAAGAAGTACCTGTTTCAGCAAAGGCAGAAACAGAAAAGGGAGCTGAAGGACGAGTCCGAGGTTGAAGTTAGGTTAGTCTGTCTACTCAACCCACTCAAACTGTGTAAAAATGTAAATAGTCTAAATATACTTGATGAGTAATATGGTTTCATCCTCAACTTTGACATACTGAATCAGCTTGGACAATTAAGTATGGTTGAGAAAAAATCTTTAGATGTTGTATAACGTTGTTCAATAAAAATGTTAAATCGTAAAGTTGTACAAGTATTTTTTAAAATTATTATCAATATTATTATTAGTTTTGTGTAATGTAAATGAATGGGCCGCATGGTGCATACAATAATCATTATATATATATATTCCGTATGCATTGTGAACGCGGGAAAATTGATAATTCTATTTGTTGAATAAAGAATGGGGGAAACTGTAATGACACTTGAGAAAGA

mRNA sequence

ATGGTTGTTCTCTTGTTATTTCCCATGTCTTTTCTTCTGGCGGAGATCCAAGTTCAGCACATAGAAAGGACGGATGAAGAACTTGTATTGGAATGGGTCGCCTGGCTTGCACTTTGCCGTTGCTGAGCTGTTTGATCTGCGGATAGCTGTAAAGTTTTGGAGTGTGAATGCAATCATTGATGTATGTAAAGATGTTTTTGGGTATAGTAGTTTTCTTAGCCAAATGAGCTATGTTCAGATGGAGATTGTTTTCAAATGTATATGGAGTTCATACAACCTCGATAAATACCTTCTTGCATTTAACTCTTTAGTATTAAGCTTAGCATGTTTTTGCAAGTTGGATTTTCAAACCGCTCTAGGTCTTTATGGTTTTGTGAAACTTATTCATGTATTCAAGTGTTTTCAATTGAGTTCAAGATGGGAGATTTTTAATGTTTGAAAGTAGCTGGGAACTTTATATTATTTGGTGAAAGATGATCCTCCCAGGTGTTTGAAGTTCAATGGAGATATTGTTAATAATTCTCATCGAGGCTCATATCATTTGGTGAAAAAACAATCCTGCCAGTTCCAATCTCTTGATAGTGAACTTATTAAAGATCGTAGAAGATCTCCGTTTCCTAGGAATCCTTTGATGATGATTCCCTGCATTCATCAGATTATTAGTAGGGGAGTCGGTTGAAGCCTCAGCTGGGGAGGCAGAGTTCGGAATAAAGGGCCGGCGGAAGCAAGGGAAGAAGTACCTGTTTCAGCAAAGGCAGAAACAGAAAAGGGAGCTGAAGGACGAGTCCGAGGTTGAAGTTAGAATGGGGGAAACTGTAATGACACTTGAGAAAGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTTGTTCTCTTGTTATTTCCCATGTCTTTTCTTCTGGCGGAGATCCAAGTTCAGCACATAGAAAGGACGGATGAAGAACTTGTATTGGAATGGGTCGCCTGGCTTGCACTTTGCCGTTGCTGAGCTGTTTGATCTGCGGATAGCTGTAAAGTTTTGGAGTGTGAATGCAATCATTGATGTATGTAAAGATGTTTTTGGGTATAGTAGTTTTCTTAGCCAAATGAGCTATGTTCAGATGGAGATTGTTTTCAAATGTATATGGAGTTCATACAACCTCGATAAATACCTTCTTGCATTTAACTCTTTAGTATTAAGCTTAGCATGTTTTTGCAAGTTGGATTTTCAAACCGCTCTAGGTCTTTATGGTTTTGTGAAACTTATTCATGTATTCAAGTGTTTTCAATTGAGTTCAAGATGGGAGATTTTTAATGTTTGAAAGTAGCTGGGAACTTTATATTATTTGGTGAAAGATGATCCTCCCAGGTGTTTGAAGTTCAATGGAGATATTGTTAATAATTCTCATCGAGGCTCATATCATTTGGTGAAAAAACAATCCTGCCAGTTCCAATCTCTTGATAGTGAACTTATTAAAGATCGTAGAAGATCTCCGTTTCCTAGGAATCCTTTGATGATGATTCCCTGCATTCATCAGATTATTAGTAGGGGAGTCGGTTGAAGCCTCAGCTGGGGAGGCAGAGTTCGGAATAAAGGGCCGGCGGAAGCAAGGGAAGAAGTACCTGTTTCAGCAAAGGCAGAAACAGAAAAGGGAGCTGAAGGACGAGTCCGAGGTTGAAGTTAGAATGGGGGAAACTGTAATGACACTTGAGAAAGA

Protein sequence

MVVLLLFPMSFLLAEIQVQHIERTDEELVLEWVAWLALCRC*AV*SADSCKVLECECNH*CM*RCFWV**FS*PNELCSDGDCFQMYMEFIQPR*IPSCI*LFSIKLSMFLQVGFSNRSRSLWFCETYSCIQVFSIEFKMGDF*CLKVAGNFILFGER*SSQVFEVQWRYC**FSSRLISFGEKTILPVPIS***TY*RS*KISVS*ESFDDDSLHSSDY**GSRLKPQLGRQSSE*RAGGSKGRSTCFSKGRNRKGS*RTSPRLKLEWGKL**HLRKX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 251..253
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 191..241
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 201..226

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy2G029210.1Chy2G029210.1mRNA