Chy2G028930 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGGTTTGTAAAATACTTCATATGAATGCAGGAGTTGGAGACAAAAGCTATGCCAAAAACTCCTTACTTCAGGTCTTCTTATCTTTTCCACTTTTAATCGTAAACTCATTTCAATTACCTTTTTCACTCCTTTTAAAAAAGAAAAGCAAAAAAATAAAAAATATATATATATGTTATGTGTTCTTCAATTTCATCTTCATCATCATTATAAATCTCAAACAACTTGGTTATATAAAGTTTGGCATGATTCTGTTGGGTGTTTTCTTTTTCTTTTCCTTGATGCTAGTGCATAATGCTTCAATTCTCTTTCATTTATTTTATTTTATTTACATATATATCAAGACATTATCAGTGAAGTTTTATTTTGTTTCTGATTTTTGTGACAAAATGATGATTATAGCGAAAAGCAATGTCGATAGCATGGCCAATCATAAAGGAAGCCATTGAAGAATATTTGCGCACTGAAAATATTTCAATTACCAGTTTAAGCATTGCAGATTTGGGATGTTCTTCCGGACCAAACACTCTTACTATTCTCTCCAATTTAATCAAACAGTTTCATGAAATCATTCAACTTCACGGTAACAAACCAATCCAATACCAAATCTTCTTCAACGATCTTCCTTCAAACGATTTCAATTCCGTTTTTGGATCATTGTCAAATTTCTTGGAAGATTTGAACAACCAAATTGGAACTGATTTTGGAACATGTTTCTTCAATGGAGTCCCTGGTTCTTTTTATGGCAGACTCTTTCTTAACAATAGTTTGCATTTTGTCCATTCTTCTTACACTCTTCACTGGCTCTCTCAGGTGATTCTAATTTTTCAAAATCTTATTCTCTATAAAAGAAACTCATACGATCATTTGTGTTATATTTACTAATAAGTTTTCGTATTATATGCATATATGTATACAGGTACCTGAAGGAATGGAGATGATAAACAAAGGGAACATATTCATAAATAGCACAAGTCCAAAGAATGTGATTGAAGGGTATTATAAGCAATTTCAAAAGGATTTCTCACTGTTTTTGAAATGTCGTGGAGAAGAAATAGTAAACCGTGGACGAATGGTTTGTACTATATTGGCAAGAACAGATGAAGATCCATCAAATCAAGATTATTTTTATGCTTTTACACTTCTGAATTTAGCTATCAATAACATGGTTGCTGAGGTGAGAATTCAAAACCCTTCTATTGTGGGACAAAAAGATGTATTTTTTTCCCCAAAATTTTATCTTTGTTGTGTTACAATTTACAGGGGATTATGGAAAAGGAGAAAGTTGATAGATTCAATATCCCAAACTTCATGCCAAGTCCAAAGGAAATAAAAGAAGAGGTTTTAATAGAAGGAAGTTTCATCATCAATGAACTTAAAGTTTCAAAAATTGATTGGAATTTCTACAATACCGAATTGGAAGGAACAAAGCATATGTTTGTGGATAGCAGTTACAATATTGCAAAATGCATTAGAGCTGTGACTGAATCACTTATGGTTCCCCACTTTGGAGAAGCTATTGTTGAAGAATTGTTTTATAGGTACAGTAAAATAGTGAAGGATGAGATGTCCAAGAAAAGGATTGAGTTCACAAACGTGAATATTTCCCTTACTAGAATCTAAAATAATGGGAGAAAAAAAAGGAATCAAAAGATGATATAGTAGCTTTGTGTTTATTTGGTTCTATGAAGAAGGAATTGTTATATAAATATATATATATATATATATTAGTGTTTCTGTTGTTTTTTTTCTCAATAAAGTAAACTGTTCACATGTCCACATGTTGTTGGCATATTTGTATTATTTCATCCAGTATTTTATTTTATTCTCTTTTCTTCTTTTTATTCCATGATAATGATTTTTGGCGTAATTGATATTATTCATGGAGGTTGATTTCATATATGATAAAATGTATCAAAATATTTACGAATATAACAAAATTTTATTGTTTATTTAATCACTAATGAACATAAATATAGTAGGTGAATTGTCAAAAATAGCAAATTTGACAAAATATTTACAGGTTGTAGCAAAATTTCAGATTCTATCAATAACAAATATTTGATAGCTGATGATATTGTTCCATCAGTGACATTGATAATTAGTGATAGAAGGATCATATCACTGGCTATTATTGCTAGAATAAAAAAAATTGCTATAATTTATAAACATTTTAATTTATTTTATTATTTTTAAAAATGATCCTAATCTTTATTGTTGTTTATGGTCGATAGATGATGATATTTTATTATATCTATAATTATTTTAAGAGTTAGTCAGAAACAATTTCCTTACCTATAATTAGTTAGCAATTTATTATATTCAAAAATCATAAATATTTTATTTTACCTATAATTAGTTAGCATTGAAGTTTTATTTTTGTTTATGATTTTTGTGACATGACTATTATAGCGAAAAGCAATGTCGATAGCGTGGCCAATCATAAAGGAAGCCATTGAAGATTATTTGTGCACTGAAAATATTCCAATTACCAGTTTAAGCATTGCAGATTTGGGATGTTCTTCCGGACCAAACACTCTTACCATTCTCTCCAATTTAATCAAACAGTTCCATGAAATCATTCAACTTCACGATCACAAACCAATCCAATACCAAATCTTCTTCAACGATCTTGCTTCAAACGATTTCAATTCCAATTTTAGATCGTTGTCAAATTTCATGGAAGATTTGAAGAATCAAATTGGAACTGATTTTGGAACATGTTTCTTTAATGGAGTTCCTGGTTCTTTTTATGATAGACTTTTTCCTAACAAAAGTTTGCATCTTGTTCATTCTTCTTACGCTCTGATAAACAAAGGGAATATATTCATAAATAGTACAAGTCCAAAGAATGTGATTGAAGGGTATTATAAGCAATTTCAAAAGGATTTCTCATTGTTTTTGAAATGTCGTGGAGAAGAAATAGTAACCGGACGAATGGTTGTTACTTTATTAGCAAGAACAGATGAATCTCCACCAAACAAAGATTTTTGTCACACTTTGACCCTTTTGAATTTAGCTATCATTAACATGGTTAAGGAGGTGAAATTATTGTTGTGTGTATATTTCTTTTCTTTTTTTGGTTAATTAGTGTCCAAATGCAATTCAATATAATTTTCTCTATGTTTATGGTGGTGAATCATAAACAGGGGATGATGAGAGAAGAGAAAGTTGATAGATTCAATGTCCCAAACTTCATGCCAAGTCTGAAAACAGAGGTTTTAAAAGAAGGAATCTTCATCGTCAACCGTGTCATAGTCACACGAATTGATTGGAACTCTTATAATGATGAATTTGATGAATCAAATGTGTATGTTGATAGCAGTTATTGTTTCGCAAAAAGTATAAAATCTTTGTTTGAACCCCTTATGATTCCTCATTTTGGAGAAGCCATTGTGGAAGAATTATTTCACAGGTTTAGAAAAATAGTTAAGGATAAAATGTCCAAAAAAAAGTGTGAGTATACAAACTTAACTATTTCCCTTACTAAAAAATAAAATGAAGATTGGAAATTAGGTAGAGATGATATTATTGTGTGATTGTTCTTATGTAAGACAATTAGCTTGTAAGAACTTTGATCTATGCTATGTTAATGCAATTGAAATATGAGTATTTGTTATTATCCGGTTGTATTCATATATATTATACGTAAATAGAGAGATGTGTAGAAATGTTTTCAAGGATGAGGTGGACTAATCAATCCAATTGCTTTTTCCTCTCTTCTTTGACATTTTTCAAAAGGAAATGGATGAGTTGGTCTTTGACTTCAACTTGAGGCTGGCTAATATGTCATCTATTAACTATAAAGGAAAGTAATTTTGGGATAATAATCAAGTGAATATATATATAATTAATATTTAAGAAAAATTGTAAATATCAATTACTTCACTCTTAATCATATTTTGAAAAATGAGAATAATAACAAAAAGATTATAATATCACTAAGTTCCTACGAGGATATAGAGAATAATAATGTCAAAGAGATCATATTCATCCATAAACTAGCATAAGTTTAAAGAGTGTGGTTTGATGCTTATTATAACTCATTTGAAAAGGATTTTTCAATGTTTCTTTTCTAAACTATGAAAACTGAACATAAGATTTTAACGTTAGTTGAAAGAATAAGAGAGGTTCGTCCATCCAAATTTGGAGAAGGTTATTATAGTTGGAAGTTTTTGGCCTTATCATAGTAGCTTGAGGTAATATACATGCAATTAATTTATTTTCGTATATTTTGTGTTTATTTTGTTTTAAACTTTTAATAATCAACCTATTTAATTGATTAGGGGAAAATAAAAAAACAATTACATATAAACACTTTTGATCAAATCTTTTGCTAATCTCTAATAGTATGTTACTAATTAAATACATTTATTTATAAAGGGAAAGAGGCTGCAGATTTATTTAATGGTTCATGACCAATCTCATGTTACATGCCACCGCCAAAGGAAGTGGTAGCAGTCGGGTGCTAAAGGAAGAAAAGGCTTCATCCTTAATCCATCGGTTCAAAGATTCCGATCATCGAGTATTAATTTAAATAATTATGTTAACAAAACTGAATCAAATGATCGAAAATGAACCAGATAAATGAAATGGAATGAAAGTTGAAGAGTAAAAGTTATGGAATGGGTACTTCTGCAAAGAGTAAACATGGGTTAGGTGTCACCTCAAATTTCCCCAATGAGAAGGGGCAGTTGAATGAACAAATGATTCCATAATTCAGTTTCAATGTATTTTTTAAAAATTTGAAAATGTCAGACTGTTGTTAATACAAAATATTAATAATTTTTGTCCAAAACTAACTTAAGAATGTTTTTTTAACATTTTTTTAAAAAGTTTAAAATTCAATTATTAAAGTAATTATAGAAAAATTATTCTGAATAGCAAGACCATCAAATATTTTCAAATATATATAGAAAAATGGAAAATTAAATTACAAAAATTAATGTTTTTTTTTTTTGTCATTTTACTGTATTTTTAAATGGGGCAATTA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Homology
BLAST of Chy2G028930 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Chy2G028930 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4ZDG8 (S-adenosyl-L-methionine:benzoic acid/salicylic acid carboxyl methyltransferase 3 OS=Petunia hybrida OX=4102 GN=BSMT3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 352.1 bits (902), Expect = 2.5e-95 Identity = 183/366 (50.00%), Postives = 248/366 (67.76%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84UB5 (S-adenosyl-L-methionine:benzoic acid/salicylic acid carboxyl methyltransferase 1 OS=Petunia hybrida OX=4102 GN=BSMT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 350.9 bits (899), Expect = 5.6e-95 Identity = 183/366 (50.00%), Postives = 248/366 (67.76%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SPV4 (Salicylate carboxymethyltransferase OS=Clarkia breweri OX=36903 GN=SAMT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 346.3 bits (887), Expect = 1.4e-93 Identity = 180/378 (47.62%), Postives = 250/378 (66.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A061FDP1 (Probable jasmonic acid carboxyl methyltransferase 1 OS=Theobroma cacao OX=3641 GN=TCM_034089 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 308.9 bits (790), Expect = 2.5e-82 Identity = 164/366 (44.81%), Postives = 238/366 (65.03%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T044 (Salicylate carboxymethyltransferase-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold18G00050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 976.5 bits (2523), Expect = 1.0e-280 Identity = 535/996 (53.71%), Postives = 614/996 (61.65%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KH21 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G503870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 721.8 bits (1862), Expect = 4.5e-204 Identity = 348/362 (96.13%), Postives = 356/362 (98.34%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B1E5 (salicylate carboxymethyltransferase-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485070 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 670.6 bits (1729), Expect = 1.2e-188 Identity = 322/363 (88.71%), Postives = 344/363 (94.77%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B1F0 (uncharacterized protein LOC103485074 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485074 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 664.5 bits (1713), Expect = 8.5e-187 Identity = 395/1012 (39.03%), Postives = 542/1012 (53.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DT42 (salicylate carboxymethyltransferase-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485070 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 661.8 bits (1706), Expect = 5.5e-186 Identity = 320/363 (88.15%), Postives = 342/363 (94.21%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. NCBI nr
Match: KAA0036208.1 (salicylate carboxymethyltransferase-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 971 bits (2509), Expect = 0.0 Identity = 535/996 (53.71%), Postives = 614/996 (61.65%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. NCBI nr
Match: KAG4952112.1 (hypothetical protein JHK85_045979 [Glycine max]) HSP 1 Score: 759 bits (1959), Expect = 5.94e-253 Identity = 457/1166 (39.19%), Postives = 656/1166 (56.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. NCBI nr
Match: XP_004143587.1 (salicylate carboxymethyltransferase [Cucumis sativus] >KGN48853.1 hypothetical protein Csa_003614 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 714 bits (1844), Expect = 7.37e-247 Identity = 348/362 (96.13%), Postives = 356/362 (98.34%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. NCBI nr
Match: XP_008440749.1 (PREDICTED: salicylate carboxymethyltransferase-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 663 bits (1711), Expect = 7.79e-227 Identity = 322/363 (88.71%), Postives = 344/363 (94.77%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. NCBI nr
Match: XP_016899167.1 (PREDICTED: salicylate carboxymethyltransferase-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 654 bits (1688), Expect = 2.06e-223 Identity = 320/363 (88.15%), Postives = 342/363 (94.21%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. TAIR 10
Match: AT1G19640.1 (jasmonic acid carboxyl methyltransferase ) HSP 1 Score: 280.0 bits (715), Expect = 8.7e-75 Identity = 163/384 (42.45%), Postives = 225/384 (58.59%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. TAIR 10
Match: AT3G11480.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 256.5 bits (654), Expect = 1.0e-67 Identity = 141/340 (41.47%), Postives = 210/340 (61.76%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. TAIR 10
Match: AT5G04370.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 254.6 bits (649), Expect = 3.9e-67 Identity = 150/367 (40.87%), Postives = 216/367 (58.86%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. TAIR 10
Match: AT5G04370.2 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 254.6 bits (649), Expect = 3.9e-67 Identity = 150/367 (40.87%), Postives = 216/367 (58.86%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G028930 vs. TAIR 10
Match: AT5G66430.1 (S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 253.4 bits (646), Expect = 8.7e-67 Identity = 140/366 (38.25%), Postives = 219/366 (59.84%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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