
Chy2G024120 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TACCTTCGACGGGGACTCTGTTTCTATCTTCTTTATAATTTAGTCTTTCCTAACCAATCAGAAATTAGAATTTCAAATCATATCTTTCACAGTTATTGTTTGGAATTCATAAATCCTAAAGTACCAAAAAAATATATATAATATTTTATTGGAAAACTTTTTTTTCTTCTTTCCATTTGTATTGTCACGTTTTAAAGAAATCTAAAATATTTGTAAAACATTCTTTCCTCAATTTTCTTTTTCTTTATTTAACTTCTTAACCTCCTTTTTATTTAATTTTTAAAATACAATAATGTATTTAAGCTAACAAGAAGGTTTCAGGATTCAAATTATCCATCCTAATTTATACTAAAAATACTTTAGAAAAGATTAATAGTCATTGAAGAATTTAGCTTATTTTTATGTCGTTATATGCGGACGAGTGGCAAATTCAAACTCAAGTAAAATATATGGTATTAAGACATAGGTTACTATTTCAAAAACCAACGATGATTTAGGCTTTGTTCGATAACTATTTTGTTTTGTTTTTAAAATTTATGTCTCTCTTTAATGATTCGTGTCTTTTTCTAATACAATAATTGAGTTTTTAGTTAAATTTCAAAAATAAAAATAACATATTCAAAATTACTTTTTTATTTAGTTCTTTGAATATGTGTTAGAGTACTTTTCTAATACATATTTAATCCTACAGGTTGAATGTATTTATAAGAGGAAAAAACACTTAAAAGGGGAGGATAATGAACTGAACACATGTGAATGAAGTTATGGTAGGCATCATATATTGTTCTTCTTCTCCCTCCTTTTCCTAAGTCAGACAATTATTGTTAGTCGTAAATTAGATAAGTGATTCTATTTCGTGGGTTTACGTTTGTCCATAAACTAAATTATTGTTATATTACTATTGGTAGATTAACATTAATTAATCACGTATTCAAAATAAAATATAGTTTTTCAAAGAAAACCCACAATAACGTTTGAAGAGTAAAAAGATATTGTTGGAAGAAACTGCATAACATAAGTATGTTTTCTTTTCATGTTCAATATACTATGTTCAATATAACATTTAGCTCTTACCTAAGATAACAAATTATTTTTAATTAATTTAAAGAGAGAGAGATTAGAATTACATGAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGCGTCATGTTATTATATATATTATGGAGGAAATTGAAAAGGTCTCAATTAAGGGAGATTAATTTAATTAATGAATTTGAATTAAGGATATATAAATATAAAGGTTGTGATTTTGCTGTCAATGTCCCATAAACAGAAACTAAATAATGGTTTACAGTTAATACTGACTTCTCCAAAGAAACTTATGCATTGGAAACTATGGTCTTACTGATTTCAATATTAAGATTTTATCAAACATGACAAATAATCCCTTTCCCTACTTACATTAATTTTAAACAATTAACTCCCTTTCTTCTTACAAATTTCACATCGTTCTCTGTCTCTCTTTTCATCTTCACAATCTTCAACTTAACATTTTACAACAAACCTAAGCCGAAGATTTTCATTTGAACTTATGAATAGAATATCTACACATGTGTCCTATGAACTACGAAAAGTTAGGGTTCTATACAAACTAATTAATTACATAGTTACATAGTAATTCAATGAAACAAAAATTAAATGAATCCATGATTTAAAAATCAAATTATAGAAACAAAGTGAATTTGTAAAATGAATAATAAACATTATGAACAAAGAAAGAAACTTTGAATACAACGGCAGTCGACATTAGGGTTAATGGAGGGCAGCTAGCAAAACCAAAATTAGGTCATTCTATTGGCTTCGGAGACAAGTTAGTGAAAATCAATGTCCAATTCTTCGTTTCATTTTAATTACAATTAATAAGGATTATAAATAAAACTACGTCATAAATTATATGTTTAACAATGATTTTCAAAATTAAAAAATCATTTTAAAATACACCTTTTAGGGCATACTTTATAGTTATTATAAATTTTTTTAATCATTTTTAAAATGACTCTAAATTAAAAACAAAGTATTTTTAATAGAGCCGATCATTTTAATAATGGACAAAAGATTTTTTTTTATTAATTTCTTAAATATAGTAAAATATCATTATATATGGTTATTCATTATCGATAGATGGTGAAATTTTATTATATTTAGATTTTTTATCGTATTTAAAAATGATAACTTTTAATAATTTAAAAGTAATTTTTACCATATGAAAAAAGAATATTAAATTAATTAATTAAAAGTGTGTTTTAGAGTACTTTGAACTTGACAACATCATTTACAAACATACAATTATTTGGTATGTTTGGAAGTGATAGTTAGGTATTGATTTTGAAAAAACAGATTTAAAATTGATTTTCATTCCTTGGGTTGGTTCCTAAAGTTAATTTATAGATACTCGATTGGTAATTGTATTTTTATTTGAGAATTTAATTGTTTAACTAAATAATTATGGTAAAGTTGTATTTCTATTCATTTTATTGTTAAGTTATTACATACATGGTTGATATGGTGTTTATAAACATATATATATATATAGAAAGAAAATTAAGTCCTTTCCACTACTTAGATAACTACTTTGAGAGTGACTTACTAGGAATCACCTAACAAAAATCAATTTGAATTTGAATGATTATATATATATATATATTTGGACACTTTTTACTATAAATTTTGAGCAGGTCACATATTATGTTTTCATAGTGGAAAATTATTGTATTAAATAACTTTTCTTTTAACTATGATTTTTGTTCTCTAGTGAATATTTTATTTTTAAAATTCTTAAAACTTTTTATTCCTTGTATTTTATTTTCTCTGTTTATCAAAACTTATTTTCACTCCTTTTAGAAAACGCATCTTTCAAAAAAGAAAAAAAAAAGCTCTGGCTTCAAGGTATCTCATTTCAAGAAATAATTTAAAAAATCATTGGGTTGATTTCATATTTTTAATTAAATAAATTTAACTTAGGATGATTTGTATTATTTTGTTCTTGCAGTAAATTAAAAATTTCCGGTGTTTTTAAGAATCGAATATAAGGGAATTCGAAATAGTAATCTAAAGCATATTGTAAAATTTGCAAAACATTTATAGAAATACAATTGGCTGAGTACTTTATTTTCTAATTTCTTATTTTTCTCCACACACACACACACAAAAAAAAAAGAACCCTAATTTAAATTTACCTACAAAATCATATATTCCCCCTAAGAGCATCAAATAAGGTTAGGAATTTAAAAAGTAAAAAGTAAAAATGAGGAAATTTCTTAAGAAACTTATAATATTAAAAAACAATGAAAATACTACACTTTTAAATTAAAATTATAAAGTACGAATATTTTCAAAAATAAAATATCAAACTAAAATATATCAATATTTTATAAATTTTATTATATTTTGTAAATATTTTTAATTATTATAATGATACTCAATTGAGTTAGTATTAAGAATGAGAGAATGTTTTTCTTAGTCTATTCAAATTATAATTTTACTTTGGATTAACTTAAATATTAAATTATTCTAAATTCATTTTGGATGACCGAAAGAGAAGAAGATTATGTGGATTGGATGGAAATTGGAATATGAAAAGGGAGAAAGAATGGATAATTCCAATCTAAATCTAAGAATAAAAATCTTAGATATCATGTGAAGAACTTTGCTGACTTCAAAATACTCAATAAAATTTTGATAGTTAGCTTTATGCTTAATTACAAAGCATCGTCATGTTCATCAACAATACACATACTATTTTATTAACAATGAAAATAAAAAACATGAATTGAGATAAAAACGTTTATTTAATATGACATGAATTGCAAAAATGAAAAATGAAAAAAAAAATCACATATATAAGAAATAATGATAACAAGATCGATTATATCTATCTATTTAGAAAAAACAATAAAATTAAAACTTGAGTTAGAGATTTTTTTTTAAAATTTGAATGAAAGAATTTAATTAAAAGGAAGATATAGAGATAGAGTGGAATACCCACTGTCTTGATGGGAAAAAAAGGCATGATTGAAGAGAAATAAAGTAACATCAAATAATAGGGCTTAATATTATTTATTTCAAAGCACAAATAATATATATATAGTACTACATATAACAATTCAATAATAATAATCTCCACATTATCAATATATATATATATATATATATATATCCCATCATTAATTCTACATTTATTTCCTTTAAACTTTTGTACAACCATTTTTCTAGAACAAATGAATCAATAAAACACCCACTCCACTTATTAGAAAGTGGGATTTGGTTAATTAGGGTTTGAAATTTTGCTAAATGAAAGATAAGATTCTTCATTTTTGAAATATTGAACAGTTTCTATTAGGGTTTTAAAATTAAACTGAGATATTAAAATTTAATTTAATTTAATTGGTATGTAATCAATAGCATTTGACCTTAAGAGATATATATGTATCTTATCTAAATGAAATTGCATGATTGCATCTAAACTAGCCAATCAAATTACTTTAATTAGACGTGCAATTCTCTTAAGAAAAAATTGACTTGCACACTTTTTTTTTCATAGTACATAATAATAATAACAATCATAATGAATAGAGTTGCACATGTAGAAAAATTGAAAATTTCATATCAAATAATTAGCATGCATATTCACACTAGATGATGTTGATGTGGATAAAAAGTGTTATAATTAAAAACAATATAATACTGTACTTTGGGTGATTATATATATATAAGGAATAATTGGTTTGAAAAGAATAAGAGTGTAAATATTAATAATAATGGCTCACAGGTTGGCAAAGAGCAATGCTTTTAACTATATTGTATATATGTAGATAGATTGAAATTGACTAGCTCCAATTTTTATTCAAGCCATTCATTTCATATACTTCTTTTTTTTAGGTTAAATCATCTTCTGCCTTTCAGAAGAATATTGCTATTCAATTTTATAAAAAAAATAAAGCAAATAGTTTAGTTCGTAAAGGAAGGTGGAGGATT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BLAST of Chy2G024120 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Chy2G024120 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Chy2G024120 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EIU2 (uncharacterized protein LOC111433729 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111433729 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 288.1 bits (736), Expect = 4.8e-74 Identity = 149/259 (57.53%), Postives = 194/259 (74.90%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G024120 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KTB7 (uncharacterized protein LOC111497439 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497439 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 287.3 bits (734), Expect = 8.2e-74 Identity = 150/259 (57.92%), Postives = 194/259 (74.90%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G024120 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CMZ4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold255G009020 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 261.9 bits (668), Expect = 3.7e-66 Identity = 136/178 (76.40%), Postives = 154/178 (86.52%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G024120 vs. NCBI nr
Match: XP_004134647.2 (uncharacterized protein LOC101211314 [Cucumis sativus] >KGN49397.1 hypothetical protein Csa_004246 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 470 bits (1210), Expect = 7.83e-165 Identity = 242/261 (92.72%), Postives = 253/261 (96.93%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G024120 vs. NCBI nr
Match: XP_038882985.1 (uncharacterized protein LOC120074072 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 312 bits (800), Expect = 1.34e-102 Identity = 162/259 (62.55%), Postives = 203/259 (78.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G024120 vs. NCBI nr
Match: KAG7026464.1 (hypothetical protein SDJN02_10464, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 290 bits (742), Expect = 7.66e-94 Identity = 151/259 (58.30%), Postives = 196/259 (75.68%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G024120 vs. NCBI nr
Match: XP_022146501.1 (uncharacterized protein LOC111015701 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 288 bits (737), Expect = 4.53e-93 Identity = 155/264 (58.71%), Postives = 199/264 (75.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G024120 vs. NCBI nr
Match: KAG6594466.1 (hypothetical protein SDJN03_11019, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 288 bits (736), Expect = 6.20e-93 Identity = 150/259 (57.92%), Postives = 195/259 (75.29%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G024120 vs. TAIR 10
Match: AT2G34530.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: flower; EXPRESSED DURING: petal differentiation and expansion stage; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G34540.2); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 3.1e-25 Identity = 65/199 (32.66%), Postives = 114/199 (57.29%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G024120 vs. TAIR 10
Match: AT2G34530.2 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: flower; EXPRESSED DURING: petal differentiation and expansion stage; Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 1.5e-19 Identity = 50/140 (35.71%), Postives = 86/140 (61.43%), Query Frame = 0
BLAST of Chy2G024120 vs. TAIR 10
Match: AT2G34540.2 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G34530.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 7.9e-05 Identity = 49/151 (32.45%), Postives = 78/151 (51.66%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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