Chy1G018340 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy1G018340
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH01: 23811761 .. 23815784 (-)
RNA-Seq ExpressionChy1G018340
SyntenyChy1G018340
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCACTAACAAATATATTAGCTTATGATGAAAATTGGTCATTTATGGTATGTTTGATAACCAATTTAGTTTTTAAAATTATTTTTATAAAAAAATTAATGTAGCGTTGAGTAACTGATTCACTTTTTTTATTTTTAATTAAGCAAGAAACTTATTTTTAAAATCGTAAAGGAAAAGGTCGAAAAGAATGAAAAATGAAACTTTAAAAAAATACATTTTGTTTTTAAAAAACAGAAAACAAGATTAGTGTAACCAAAATGTTCTATGGTTTTTGTTTTTAATAAACAAAAGAAACAATTAAAAAAAATTAAAATGAGTTCTTGATCTCCATCTTCAATTATATTATTTTTGTATTCACACACACACACATATAGTTCATATGTTTACATTTTTGTACATTTTTCAAGGTAGTAATATACGTTTGGCTTATTGTTAGGTAACTGCAAGAGGTTGGTTATCTCTCTCTAAGTTACATTCCCAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTCGCTCAAGGTCTCTTTTCCTCTTTTAAGTAAAGTGATCTAACCTAAATTAGGAGATATGACCTGAAAGCACCAAAAATTTGTTATCTGATCTCTCTTAATTAGGATTGTCGTTTTATGATTTGACGTTCTTATTTGATCATTTTGTAGGTAAGAGATATAATCAATGGTAGAATACGGTGTCGATACCAAATTAAAGCTTAGCTGGGTGTAGATAAAGTTAATATATTCATCAACCAGAGTCAAGGAGCAAGTGCAAAAGAGGCTTAAATAGCCTCTGCCTTGCAGAACCGCAACGCCTCATAGAACAGCACTAGTAAAGCATGCAGTAGCTGCCTTTTCGGTATGAAAGGAACACAGTTTCCTGACACGATTACACTACTCTATAAATAATCCGTCCATCACCTAAGTCAAGCTCTCTCCAATTTCAGTCGGCCATAACTCATTCTCTCTCAATTTTTTGAGTTTTTTTTGTTGGTTCATGTTCCTTATTTCTTCCACATTGTTTGAAATGTCGAGAATGAGCCTTAATGTACCTGTTTCTAGTTTGGATTGTTAAGAATTTTTCCTAGCTATTTTATGTATTTGTGAGTTTGGAACCAAATTGTCTTTCAATTGTACATTCAATTATGTTTTTATTTGAATATGTATCATGACATCGTACGATTGGTGATTTCTTGATTACAACTTGTGATGAACCAACAACTTGTATAACTAGGTTGTGTGCTTTATTCACTTGAAGCAATAGTTGCTTTGCAATCAATCCAACCATAAAACTGAATTATATTGCAGGAATATTTAGTTAGGTGCTTGAAAACTAAATATATACTACTCAATCTAACTTGCCCTAAATGATCTTAATGCAATTGATATGAAATTGAATATGCATGCGTCTCATTGATTCAATTAGTGTTTGATAAGTTAATTAAGTCAAGTCAATTGGCTTGGTTAGGTGAAATCAAACTTTAGGATTTGGTAATGGCATGCATTTTGAAATGTGGTTGATTTTCATAAATTGAAGATTAAATTTTGAATCAAAATGTGGTTGATTTTCATAAATTGAAGATTAAATTTTGGATCAACTTTTTGCATGCATATGGTAACACCTATTGTCTATTTGTAAACTTTATCCCAACAAAAACGATCAACAAAGTCTTCATCGCTTAATGCATACATTTTCTTCTCTTTTATTTTCTCTCATTACCCATTGTCTTAAAAAATTATGAACCAAATTATTTGCGTGGTTTGTTTATAACATGTATCATCAAACTCAATATGATATTAAAAGAAGAAAGTAAATAAGTGTACTAAAAACATGGGTTGTGTTCATTCTTTGGTTGGGCACCATTTTTTTAGGAGTGTTCACGGTTCGGTTTGAAGATAAAATCGTACTGAACTACAAAATGCAAAAAAAAAATCTCATATGAAATCGATCCCAACTGCTCATCTGTGTCAAATCGGATCGAAATTGAATCGCTTATGCATAAATATTATAATCGAAATCTTTTAGAAATATTATACATAAATAAAAGTTCTACAAAAGTTACAAACATAAATTAAATTAATTTGTTTGAAAGTTAATCAAAATAATTCTTACAAAGTTACATTTATACCCTATCTTAAGTCATACTTATATATTTAATTATTCATACATATATATATTTAATAAATTGGTTTAGTTAGGTTTTAGAATTGGTTCAATTTTTAAAACTGAATCAAACCACGTACGAATCGATTCAATTTAAGACAAATCGAATTGAACTACATGCATTCGGTCGGTTCAATTTTGGTTCGGAGACGGTTCGGTTTTCAACACCCCTTCCATTTTTCACAACTGTCCTCTTCCAAGTTCCATATCGGTCACTCAAACCTTAACTCTCACCGATCACCTTTCACTAAACAGGATCAAAATTTCATAACTGCAAGGCAAACCTCGACTAACCCCTCTATACTATGGCAGAATCCGAAGTCCGTATTATGCCTTAGAATTACGAGGTTCGTATCCCCATCACTCAATTGTTGGCCCGCTGTTGAAATGTTTGTATTTTTCTTCCCATTCTGATTTATGTGTTCGTATGTTTTCTACTTTAGTGTGATAATAATGGTGTTAGAATAGAACTAGGGTTTAGCTTCCGTAGTTCCGTGGCATACGTTTTGGTTTGGATGCCGAGAAAGTGTATGGAAAACTGGAAGTTAAGGATTCGGGTATTTTTTTAAAAATATTTTTTAGCTTCAATCATATCAATCGAGTTGCATTTCTTCTCGTGATCTTCGACAATAAACTTATGAAAGTTCAACTTCTGCACATTGATTTTGTTTATTTTTTGTCGTCCTCTGTTTCTTGTCTTTGCCAAAACGAGCCAGAACAATTTTCCTTTTCCATCCTCCTGTTTGTTTATGGAATTATTTGTCGTATCCTTCTATTTTTTGTTTATGTGAAGACTTAATTGGATGATGTGAAATATAATTGTCAACTTTAATGCAATTCCGATGTTTTATTTCCTGTTTTTATTTTTCCTTTTTATCCTTTATTCCTATATTTTTCAATCATTTTAAGATATGTATGTACATGCACTACCTTTTTCTTTTTAAAAGTTGATTTTCCTTTGAGATAGAAAAAGAGACAAACAAAAGAAAAGGCATCTCACAAAGTGGTAGGTTAAAATTTGGAGTATGATGGGGTGCTAAGTGTCATGAACATGCTTGTCCAAGGCAGTATTGTTTGATCATGACTTTTGAATTTAGTATGGCTGACTTGCTCACTTAGTTAGAGCAAGTGCTCTACAATCGCCCATCCCATATTCGAAAAGTTGCAATTGTGACACTAAGCAATCTAGGTGAGATATCCAAGTGCATCTCTTCATCCTCTTCATCCTCCAAATTGTCTAGTTGTTTATTTAATTTCCAACTTACTTAATTTCTATTAGATATTCACACAAAGAAGAAATAATTTAAATAGTAGCCAAATCTGTTTAACACATTAAAATGAAGTCAATATTATTTTAGATGTAAGGTTGGCTGAATTGATCTAAATGTAGATCCTTATTTTTTATTAGAACCAAACAACCATATTTAAATTCAATATTTTCGTTGCACTATTTTTCAAGTCATCTAAATGTTTTTAAAGGTTTGAGAAAACTTAGATGCTCTCTTTTATCCAGTAGAGTACATAATTTCTTGACATTATTGTCCAAAAGAAATTTTTTATTATTGCTATTTGTGATTGTATTTCCAACAAGATGAAGGACTCAATTGGGTAGTGTAAATAATTAACTAAACTTTATTGAAATCATCTCGTTCCTTTTTATCCTTTTATTCTTATTTTTTTTCAGTCACTTTCGGGTCATGTGTGAATGCACTACCTTCTCTTTTTCTAAAGTTAATTTACCTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAACATCTAACAAAGAGGTAATAAAACATTATTATTTGTGTGCATAGACCAAGACATTATTTGCTTTTTCTTCTTTTGCCAGGTTTTCCCCCTCTCTATAGCTGTTAATTAA

mRNA sequence

ATGTCACTAACAAATATATTAGCTTATGATGAAAATTGGTCATTTATGTGTGATAATAATGGTGTTAGAATAGAACTAGGGTTTAGCTTCCGTAGTTCCGTGGCATACGTTTTGGTTTGGATGCCGAGAAAGTGTATGGAAAACTGGAAGTTAAGGATTCGGTCACTTTCGGGTCATGTTTTCCCCCTCTCTATAGCTGTTAATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCACTAACAAATATATTAGCTTATGATGAAAATTGGTCATTTATGTGTGATAATAATGGTGTTAGAATAGAACTAGGGTTTAGCTTCCGTAGTTCCGTGGCATACGTTTTGGTTTGGATGCCGAGAAAGTGTATGGAAAACTGGAAGTTAAGGATTCGGTCACTTTCGGGTCATGTTTTCCCCCTCTCTATAGCTGTTAATTAA

Protein sequence

MSLTNILAYDENWSFMCDNNGVRIELGFSFRSSVAYVLVWMPRKCMENWKLRIRSLSGHVFPLSIAVN*
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy1G018340.1Chy1G018340.1mRNA