Chy1G012160 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAACTTCGAGTGAGAGATGGATCGATAGACTTCAATTATCCTCTTTGTTTTGGCCTCCCCCAGATGATGATCAGCAAAGGAAGGTACAGAAGTTTTCATGTTTTACATATAAATCAATTTTTGGGATTGTACTTTTTCGCAAATTATGACATTGTTTTTCATATAGTCCAAGTTGATTAGTCTGTTTGTGTGTCAGCCTGAAGTTGTATTTATCATTCTTCTGAAAGCTGCTGAATCATAGCTCTTAAATAATGTTCTATTGGTTTCCTTGATTTTTTCTTCGTTGATAACGTTGTATGATGTGTTTTAGATTTTTAATCCTTTATCATGTGGAGAATTGCTTAAATTGCTCACAGAATTAGAATATGCTTCAAATTTGCCAAAATGATAGTGCTCTATCTGCTTTTCTCATTGGAACGAATTCTCCATTAGCTTCAGAGGTTCTCCTCCCTTTTGTATATTTAGTTTAATTAATGAAATGTTGTACTTGTAGGCTATTTCCTTTAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAGAAGAAGTAGCAAGCAAGCAATTCATATAGTTTTAGTTAGCTACTATCAAAACTAAACACGATAAAGGATTATATACGTGTGAACTTATGCTGGAAAATGTTTAATCTATGTATATCATACGTAATGGATGCATGAATAGATCTTAATTAGATATTCACACATATAGTGTTTTGAGGTCCCTAAATGTCGATATATGTATGTATGTGATGTGCTCAATTTGGGAGACTTAGAAAACAGAGTTTGCGTTTTATGAAGGATTTCAGTACAAGGGACTTAATATTTTTGCTTAATTTTCATTTGTGACTGTCGGCCACATGCTTCTAACTACCTACTAACTTTGCTTGTAACGGGTTCACCTAAAGAGTAGATTATTAAAGGGGCTGCCCTCTTACCATGTGTGTGTTTTAAATTAAAAAAATGGAAGCAAAAACTTTTTCATTGATCTAATGCCAAAAGGCAAGTAACCCCAAAGGGGAAAGAAATACATAACAAACATAGAAACAATAGAAAAGAAAATATAATGGAAATATAAAAGCGTTCCAATTAAGACAAATATCCTGAATTCATGTGTATCAGATAGAATAGACCACCGCAGGTGAAGATGATATTGAAAAATACTATATGAATGGCCTTAGTGGCCTTTAGGGCCTTCTTTTCTTGTGTAAATGCTGGGCTGTGGTGATATCAAATGCAAAATAATCTAGACACCTTAGTTTAATAGTGTGGCATTGAACGTAAGGGATTTGACCTATAGCTTCTAAGTGTTATGCCAAGCCTTAGGAAAGTTGAACCTAATTATGTTCTTTAGAAATTAAAAATTAAAAGTAGATTGAGAAAAAGTTTTGTGTTTTTTTAAATGGATTTAACATGTTTTAGTACCAAATGGGAATAAATTTTGATCTATGAGGCCTCTTATCGTGCAAACTTCGAAAAAAATGGATCTAGTTAAAGACAGCTAGTGAGTGGGGCAAGGGAGACTTTGCATAGTATGGGAAAGGAAGGGGAAAGGAGGTGAAGGCATTGTGGAATTTTGTGGTTGAACTGCTTGGGAGTAGAGGTTCCCAACTCTTTAGTATTAGGCTGTTGTTGTGGTCTTTTGTTATTTTTTCTTGGTGCATTTAAAAAGTCAGAGCCGCTTTCTTGAGCCTTATTTTGTATCTATTATTTGAAACATGAGGAAATTTCTGCCTTGCAATTGCTTTGGGAGATTCTTGCTTCTTTGAAGGTTGGCTCTTGTAAAGATTCTAAACTTGGACTCTTGGTGCATCAAAACTGTTTTTGTTGAAGTCTTAGACTCGGCATTTAGCTTAGGATCTCCTATGCAAAAAGACTTATACTGAGCTCTTTGAAAATCAAAGAGCTCCAAAAGTGATGTAGCCTAAGTAACCTCAAGGAGAAATCCTTCCAGAACCAAGATTGTAGATCTTTTATTAGAATGAATAATATGTTTCATACAAGAGGAGAAGACTCTTATTTATAGAGTTCTATTACAATTGGGGTAAAAAGGGAATTAACCTAGAATATTATGTAATTACCCAATTAACCCTTAGTCTTCTTACATAAAAAAGAGTTAATATTTTTGTTTGAATTATGCCAAATGGAAGTCTTAACTCTTGTTAGAAATAGTGGCTTGGGTCATGTTGAAAGCACAAGGGCAGTTTAGATTTACTTTGCCCTAATTTTTTATTATTTTAGTTAGGCTCGTGTTGCCTATAAATATTTTCCCCTTTGTACCTTTATTATCATAAGAAAATAATAAGAGATATCGGCATCGTGGTTTTTCTTCTTGTACTAGGGTTTCTGTGTAAATTTGTGTTCGTTCTACAGCTCTACTTTTAATATGGTATCAAAGCGGGATATCGAAGAGACCCTAGACAATCAAGCACTTAATGGAACCCTAGCAGAAGGGACAACCATCGACATCAATGCAGTCGTCGCCACCGTAGTTGGCATCTTCAGAACCCATCGGCCAGCCTTCCTGCCCAGCCACAATCGTCTGGCAACCAGCAGCCTTCAGCTGCACAAGTCCCACACTCGCAGCCAACTTGGATTCCCTCATACGCGTTGCCAGACATTCATGCACTGCTGCCCACGGCTACACCTTCACTATATGCACCACCACACACACTGTTGCATACGCTACTGCACGTGCCACCGTTAGGACTTGCCTAGCCGCCGACCTTGGTTCAGTCTTCTACTGCTGGTGTGATTGTGCCGCCTCCTGCTAGGTTAGTTGCAAACCCTAGTGGTTGTCCCGAGGTTGGAAATCCAGCCGAGTCGACCTTTGAGGTAGGTGAGTCCTAGCGCAGTCAAGGGCCCATGAGCAGGGTTCATCTCTCAGTATTGCTCAACATCAGCAGGACATGCTACACAACAAATTGTAGCGATTGAAGCAATGCTAGGGGCTCCGTTCAACAACCGTTTGACCTCACCGATGTACTCTGAAAATCCGATAATCTTGCTCCTTGCTTTGGCCTCTTTTTAGATGTTAAATCTAGTGGCACAATCTATAGGATATTTTCTAGAGGAGAAATTGAATGGTCAAAACTATTCTTCGTAGTCCTAGTCTATTAAAATGATCCTTGAAGGGTGCCACAAGTTTGGTTTCTTGACAGGGGAGATACCTCGTCCTACATCGGGAGACCTTTAGGAACAATACTAGAAATGGGACGACTCTCTTATTTGGTTCACATTTATCAACAATATGGATGCACATATTGGCAAGCTCTTACGGTATGCTGCAACCACTAAGGACATTTGGGATACGACTTAACAATTGTATTCCAAGTGTCAGAATGCCTCTCATTTATACACTCTGCAAAAACAAGTTCATGACTGCAAACAGGGGACAATGGATGTGACATGCTTCTGTAACAGACTTTCCCTGATCTAGCAGGAAATGGACCTATGCAGATTACTCCAGGATTGAGGAGGTTGACAGGATATATGTTTTTCTTGCAGGTCTCAACCCTAGATTCGATATTGTTTGCGGACATATACTGGGCCAGAGACCTATACCCTTCCTGATGGAGGTTTGTTATGAGGCTCACCTTGAGTAGGATCGTACCAGTGCTATGAGTAGTCTAACAAACCAATCTCGGTCTGTAAACACTGCAAGAAACAGTGGCATACCAAGGAGCAATGTTGGGAACTACATGGTCGTCTCCCAGGAGGTAAGAAATGCCCCTCCAGTGACAAATAGAACACAGGACGAGCTTATGTGAGTGCCTCTGCTAGCCCTTCTCAGCTATCTGGGGATCCCAGTCCGACTACACTAGGAGCTATTGCCTAGTCAGGTATACCTTAGTCCTTCAATCTTATTAGTGGTGATGAGAAGAATCCCTGAATTCTGGACTTTGGCGCCACTGATCATTTGATAGGATCCTCAAAACATTTTGTGTTCTATATTCCATGTGCTGGTAATGAGAAGATACGAATAGCAGATGGTTCCTTGGTTCCCATTGCCGGGATGGGGCTGATTTTTCCTTTTGAAGGATTGACTTTACATAATGTGTTACACGTGCCCCGAATTTTCTATAATCTACTGTGTATAAGCAAGCTTACTCATGAATTAAAATGCAAAGTGATATTCTTACCTGATTCTGTTTCATTTTAGGACTTGAGCTCGGGGAGGATGATTGGCACTGCCCAACACAGTAGAGAACTCTACCTGCTTGATGATGACGCTTTCTCTAGTAGGGATCTTTAGGACTAGTCTTTTATCTTCGTATCTTACTACTTTAGAAAAAGGCTCTATGTTGTGGCATTTCCGTTTAGACCACCCCAACTTCAATATATGAAATACTCATTTCCTCATCTTTTTGCTAAAGTTGATATTTCTACCTTGTCTTGTGATGTGTATTCGGGCTAAACAGCATCGAGTCTCCTTTCCCTCACAACTATATAGCCAACCCAACCTTTCACTCGTGTCCATAGTGATGTTGGGGGACAGTCCAAGGTCACTACCTCCTCTGGCAAACGGTGGTTTGTTATCTTCATTGTTGACCACACCCGCCTTACTTGGGTTTTCATTATGTTCGACAAATCCAAAGTCACCTCCACATTATGGAACTTCTATCACACCGTAGAAATGCAATTCAATGCAAAAATTGCAATCCTCCGCAGTTATAATGGTTGCTAGTTTCAAAACCACACCCTTCATGAGTTTTTGTCCTCTAAGGGAATTGTCCACTAGAGTTACTGTGCTTACACTCCTCATCAAAATTGGGTTGCTGAGAGAAAGAACCGTCACCTTTTGGAAGTTTTCCGTTCATTTATGTTGTCTACTTTCCTTCCTTCTTATCTATTCTGCAATGTTGTTCTCATTGCAGCTCATCTCATCAACCAAATGCCTTCTCGTATCCTACACCTCCAAACCCCCTTAGAATTTTCTCAAAGAATTATATCCCTCTACTCGTCTCATTTCTGATGTCCCCCTTCAGGTGTTCGGATGCATAAC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ATGGCAACTTCGAGTGAGAGATGGATCGATAGACTTCAATTATCCTCTTTGTTTTGGCCTCCCCCAGATGATGATCAGCAAAGGAAGGTTCAGTGTTCTGCATATGTTGAGTACTTGGGTCAGTTTACATCAGAACGATTCTCAGAGGACATTGCTGAGCTGATTCGGATCCGTTTCCAATCGAAGGAAAAACGCCTGTTTGATGATGTTTTAGCTTTGTTTGTTCTTCATCATCCGGAGAATGGGCATGCTATTATTCTTCCAATAATTTCTTGTATATTTGATGGCGCCCTGGAATATAACAGAAATGATCCTCCATTTGCCTCTTTTATATCCTTATTCTGCCCTGGCATTGAGAACGACTATTCTGAACAATGGGCCCTTGCATGTGGGGAGATTCTGCGGATCTTGACTCATTACAATCGTCCGATAAACAAGATGGAACGAAAAAATGGTGAAACAGAAAGAAGCAGTAGTGGCAGCCTTGCCACGACAAGTGACACCGATGATAGGGAACTTGTTGGAGTGCCTCAGCAACAAGAGAGGAAACCTGTACGACCTTTGTCCCCCTGGATTACTGATATATTGCTTGCTGCACCATTGGGCATCAGAAGTGACTATTTCCGCTGGTGCAGTGGTGTAATGGGTAAATATGCTGCTGGAGAACTCAGGCCACCCACATCAGCTTCTTCTCGTGGATCTGGAAAACACCTCAGCTTATTCCATCAACCAAGGTGGGCCGTTGCAAATGGTGCTGGAGTCATATTAAGTGTTTGTGATGAAGAAGTTGCTCGGTATGAGACTGCAACTCTTACGGCAGCTGCTGTTCCTGCGCTTCTTCTTCCTCCCCACAACAGCTTTGGATGA MATSSERWIDRLQLSSLFWPPPDDDQQRKVQCSAYVEYLGQFTSERFSEDIAELIRIRFQSKEKRLFDDVLALFVLHHPENGHAIILPIISCIFDGALEYNRNDPPFASFISLFCPGIENDYSEQWALACGEILRILTHYNRPINKMERKNGETERSSSGSLATTSDTDDRELVGVPQQQERKPVRPLSPWITDILLAAPLGIRSDYFRWCSGVMGKYAAGELRPPTSASSRGSGKHLSLFHQPRWAVANGAGVILSVCDEEVARYETATLTAAAVPALLLPPHNSFG* Homology
BLAST of Chy1G012160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SQI2 (Protein GIGANTEA OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GI PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 423.3 bits (1087), Expect = 2.2e-117 Identity = 208/283 (73.50%), Postives = 231/283 (81.63%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9AWL7 (Protein GIGANTEA OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=GI PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 393.7 bits (1010), Expect = 1.8e-108 Identity = 198/288 (68.75%), Postives = 232/288 (80.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CG99 (protein GIGANTEA-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500402 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 551.6 bits (1420), Expect = 2.0e-153 Identity = 273/284 (96.13%), Postives = 275/284 (96.83%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IPZ2 (protein GIGANTEA-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477137 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 520.0 bits (1338), Expect = 6.3e-144 Identity = 255/284 (89.79%), Postives = 262/284 (92.25%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F5V5 (protein GIGANTEA-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442632 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 518.5 bits (1334), Expect = 1.8e-143 Identity = 254/284 (89.44%), Postives = 262/284 (92.25%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FBN3 (protein GIGANTEA-like isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442632 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 518.5 bits (1334), Expect = 1.8e-143 Identity = 254/284 (89.44%), Postives = 262/284 (92.25%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CQ08 (protein GIGANTEA-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013518 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 514.6 bits (1324), Expect = 2.7e-142 Identity = 252/284 (88.73%), Postives = 263/284 (92.61%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. NCBI nr
Match: XP_011659108.1 (protein GIGANTEA isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8646179.1 hypothetical protein Csa_016390 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 558 bits (1439), Expect = 3.33e-188 Identity = 276/287 (96.17%), Postives = 277/287 (96.52%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. NCBI nr
Match: XP_008461912.1 (PREDICTED: protein GIGANTEA-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 551 bits (1421), Expect = 1.63e-185 Identity = 273/287 (95.12%), Postives = 276/287 (96.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. NCBI nr
Match: XP_038898097.1 (protein GIGANTEA-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 540 bits (1390), Expect = 8.82e-181 Identity = 270/295 (91.53%), Postives = 274/295 (92.88%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. NCBI nr
Match: XP_038898094.1 (protein GIGANTEA-like isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038898096.1 protein GIGANTEA-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 540 bits (1390), Expect = 1.74e-180 Identity = 270/295 (91.53%), Postives = 274/295 (92.88%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. NCBI nr
Match: XP_022976904.1 (protein GIGANTEA-like isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 520 bits (1339), Expect = 2.63e-173 Identity = 255/287 (88.85%), Postives = 263/287 (91.64%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G012160 vs. TAIR 10
Match: AT1G22770.1 (gigantea protein (GI) ) HSP 1 Score: 423.3 bits (1087), Expect = 1.5e-118 Identity = 208/283 (73.50%), Postives = 231/283 (81.63%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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